1TI1A

Crystal structure of a mutant dsba
Total Genus 63
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
63
sequence length
186
structure length
186
Chain Sequence
YEDGKQYTTLEKPVAGAPQVLEFFSFFCPHAYQFEEVLHISDNVKKKLPEGVKMTKYHVNFMGGDLGKDLTQAWAVAMALGVEDKVTVPLFEGVQKTQTIRSASDIRDVFINAGIKGEEYDAAWNSFVVKSLVAQQEKAAADVQLRGVPAMFVNGKYQLNPQGMDTSNMDVFVQQYADTVKYLSEK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Intriguing conformation changes associated with the trans/cis isomerization of a prolyl residue in the active site of the DsbA C33A mutant.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Thiol:disulfide interchange protein dsbA
molecule tags Oxidoreductase
source organism Escherichia coli
total genus 63
structure length 186
sequence length 186
ec nomenclature
pdb deposition date 2004-06-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01323 DSBA DSBA-like thioredoxin domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1ti1A00
4ULXA 3VWUA 1TDIA 3D5JA 2L6CA 2VCWA 2H75A 2VLTA 3LYPA 4LMWA 4V2LA 1NW2A 2VM1A 4ZBDA 3TGZA 2ZNMA 2YWIA 5ECKB 2O85A 3U6VA 3IOSA 2B5YA 3QFAC 2M46A 2JADA 4XHMA 5KN0A 1QXHA 1GLPA 4F9ZA 3HZ8A 3H79A 4IW9A 3RHCA 1YKAA 5A4VA 5B7CA 3Q18A 4MZBA 3HJMA 4TR1A 4TXOA 3MWHA 4Q5NA 5H5SA 17GSA 1TOFA 2LQQA 6GSXA 2DJ1A 3IC4A 1ABAA 1MEKA 3IA1A 1VGLA 2C0GA 1UN2A 5HQPA 4ZIJA 4IN0A 1ML6A 3QR6A 3WGEA 3AY8A 4TW5A 3GFKA 2N5BA 2V6OA 4IGJA 4YH2A 4MJCA 3DGQA 5AISA 2H70A 4ECJA 3V1WA 5IMFA 4HQZA 3DRNA 3W6GA 1OC8A 2AHEA 1GULA 4L5OA 4DSSA 5D9TA 2K6VA 1BYEA 3TJGA 2DBCA 3ZVJD 1AC1A 5IQYA 4EC0A 3RDWA 3DD3A 3GUSA 3VLNA 3LG6A 1GSEA 2R6KA 4J56E 4OMVA 2E2GA 1G7EA 5J4UA 1S3AA 2GZYA 2IJYA 4MH2A 2EIOA 3WT2A 3C8EA 2DIYA 2P5RA 3KMNA 4KW6A 5D9WA 2AYTA 2YWOA 2GLRA 2REMA 4PQIA 5ECQB 2LS5A 2PGTA 5G5EA 5FT3A 1Y25A 4E8EA 2HT9A 1TK5B 3GV1A 4K2DA 3VWVA 5ECSA 1PX6A 2C3NA 3RAZA 1GRXA 5DJMA 3KTBA 3PGTA 3VWXA 3ZL5A 2HZEA 1XCCA 5CNWA 4EE0A 1G0TA 5JCGA 2HYXA 3ZFBA 4IJ3A 4ZBBA 2B1KA 4ILFA 3C1RA 4ECIA 4XTSA 2GZPA 2AV4A 4NWYA 3TB2A 2CX3A 3CMIA 4MA9A 1B4QA 1OKTA 1MD3A 2LRTA 2XBQA 4KCAA 3EVIA 1EEJA 1SD9A 4Q5RA 1CQHA 5L71A 1AIUA 1XZOA 2HSYA 2OKAA 3HY2A 3IK7A 1IYIA 4BVYA 3W8SA 2L4CA 2WRTA 2DC5A 4K7NA 1T4ZA 3IAM2 4EKZA 2RIIA 4MF5A 2TIRA 19GSA 1ZCPA 1M99A 1SK1A 4WEYA 4I97A 3H8QA 3J7Yb 3WYWA 4TR3A 5IMAA 1BX9A 1TXXA 2FWHA 5IPHA 3H1NA 5ECNB 2CVKA 2OBKA 4RUVA 1AW9A 3KH9A 5ENUA 2LEGA 2H1BA 1USBA 5E4WA 4HQSA 5E59A 3ME8A 3ZMLA 1DUGA 3QOUA 2QC7A 4BVXA 4J57E 1B9XC 5FWGA 4P3YB 3ZFLA 3U5RE 1SL1B 4YAPA 1TI1A 3F4SA 3IAS2 2G0FA 3DIEA 2HXKA 2B1LA 1SKSB 3P8WA 1O85A 5AIVA 3M9JA 1OE7A 4JEDA 3KH7A 1TK0B 2OE3A 1WRYA 2EC4A 3G7YA 1XW9A 3UMAA 4NHZA 4IQ1A 1GSFA 3EWLA 2ZUPA 4ECCA 1SL2B 1G7OA 2P31A 1NHOA 3CXGA 5DDLA 1M9BA 1Z7PA 4RI6A 5ECMB 1V2AA 3GSSA 1EGRA 2CQ9A 2F8AA 4XS4B 3VURA 3TUEA 3A2VA 3M1GA 1EV9A 4FO5A 1MDKA 3BCKA 3F4TA 2L5OA 6GSSA 4JRRA 5DQSA 2ES7A 2ON5A 1NSWA 4AJ6A 2DIZA 2R4VA 5AGYA 2KOKA 3C7MA 2LJRA 5FHIA 1T8EB 2P0GA 1B9YC 1GLQA 1OKDA 3BJ5A 2GT5A 4FH8A 2PVOC 3EINA 2GSRA 3GSTA 2GQKA 3MNGA 2VUPA 3LFLA 5JCWA 1JZRA 1S3DA 4YQMA 2X99A 2O7KA 3UJ1A 1SD8A 1V40A 2A4VA 1QK8A 2H01A 2EIRA 2ON7A 2GZZA 2PBJA 2PERA 3R2QA 3GA4A 1PN9A 3QPMA 1HYUA 2H0GA 3RBTA 4ZL8A 5A5KA 2FWGA 3NIVA 1YEPA 4LL1B 4TOPA 1K0AA 3L9UA 1VRSD 3L78A 4G19A 3G7IA 1DSBA 1A8LA 2VOCA 3F3QA 3TRXA 4NXIA 4MCUA 1VF4A 1XWAA 3ZIVA 1A0FA 3F0IA 2N5AA 3M3MA 1TI3A 5CRDA 4DSRA 4FYCA 3TJJA 4GQCA 1K0NA 1A0RP 1WJKA 2VLVA 3GH6A 2PWJA 1DE1A 1X9MB 1X5EA 2YV9A 5AIXA 4XS6A 4G9HA 4K0GA 18GSA 2WS2A 3GN3A 2KHPA 3KZQA 2KP1A 2HRFA 3UVHA 4TKYA 1T4YA 5IMZA 4ML1A 1V9WA 1H75A 2FNOA 2B5EA 2GGTA 11GSA 5DVBA 2YCDA 3TKSC 1PD21 1A2MA 2HNLA 3UBKA 3GL5A 5JWQB 3IR4A 4HUAA 5HFGA 5DAKB 2F51A 3J7Yk 1SL0B 4TR4A 5KEJA 3TKSE 2FUG2 3FY7A 2DJ2A 3TJBA 1O73A 4DEJA 2EIQA 6GSTA 2DJKA 1SJIA 3WGDA 2CZ2A 2GS3A 1EEMA 1QQ2A 1FHEA 4KB3A 2MMZA 4F0CA 1PKZA 4V2MA 3TCOA 5IMVA 2H66A 5CYYA 2VCQA 4MF6A 3L9VA 4TVEA 3FKFA 3ME7A 2I9HA 2IFQB 1QFNA 2H71A 1PKWA 1I5GA 4OD7A 2GSTA 2OBIA 4PXOA 2QSIA 1K0BA 3FW2A 3P2AA 4DSQA 3ERGA 1B48A 1EGOA 4ZL9A 3ZIJA 2VCTA 4ZBAA 4OCEA 5ECIB 2LQOA 1WPIA 3LYKA 3APSA 4MF7A 4ZXGA 2ZCTA 5HFKA 2H76A 2IN3A 4FIWA 1GH2A 6GSUA 2YZUA 1SKWB 4N30A 3IPZA 4NV5A 1Q98A 1M0UA 4X43A 3HVVA 1FVKA 1GUHA 2C80A 3GIXA 2YOIA 2NDOA 5ECOB 4I2TA 4TN8A 1H4OA 3GRXA 3ZTLA 2XPDA 2H6ZA 3A5WA 3ZYWA 1OC3A 3LWAA 3LJRA 5IO0A 2H72A 3GYKA 2JACA 1HQOA 3I43A 3HZ4A 2FWFA 4K7IA 3WT1A 2DLXA 4ML6A 4H86A 3PINA 1FO5A 2H73A 2VO4A 5CAXA 1PA3A 4F82A 1VF2A 3GX0A 1ON4A 2H19A 1JHBA 3IDVA 4MDCA 4MP4A 4RQRA 2K8VA 1X0RA 2L4QA 2H1DA 1NM3A 4XS4A 3FYGA 4O32A 1SYXA 1AQXA 4BWSA 3A3TA 1OE8A 4HI7A 1PRXA 4MH3A 1XBSA 5ELAA 4AJ7A 5A4WA 4GXZA 2MMOA 1YF0A 3QDNA 3F8UA 4EUYA 13GSA 5INYA 4OCFA 2DSAA 1XOBA 2AUVA 1BQ7A 1RQMA 4OFMA 1ERTA 2HSHA 5IIZA 4ACSA 2CV4A 1O81A 4HZ4A 2YZHA 3F63A 2HI7A 1F3BA 4HJMA 2IL3A 3D21A 1EZKA 3FR6A 4POLA 2PPTA 3KMOA 4GSNA 10GSA 3LXTA 2L6DA 2X8GA 1XPVA 5J9BA 2TRXA 1HNAA 5J3RA 1B4PA 5G5FA 4QQ7A 5F07A 4JR4A 1K3OA 4KGIA 1DBYA 1YY7A 2CA8A 2CZ3A 2OADA 3C73A 2G2QA 5GSTA 4PQHA 2KP2A 3GX8A 4ZB9A 4G2EA 4KSOA 5ECPB 1UA5A 3M9KA 1TKDB 3K8NA 1A2JA 1U6TA 3I9V2 4EF0A 2XBIA 1TJDA 3DVWA 1XFLA 4D73B 1YDKA 2M80A 1HNCA 3CSJA 3OR5A 1AQVA 4ZILA 5ELGA 1N8JA 1Z6MA 1TK8B 1F6MC 3QAGA 3PR8A 5HR2A 4L5LA 3IBHA 3DXBA 1O6JA 4I5QA 4ZB8A 4OO4A 2E2MA 2LNSA 3KIJA 2I81A 1S3CA 1K0CA 3MSZA 1OC9B 3D4MA 1MDIA 1JZOA 2CAQA 5G2ZA 1ILOA 1WMJA 2H8LA 3WD6A 3FR3A 3HYPA 4KCEA 1PQNA 20GSA 2I4AA 2NTOA 2PMTA 4NAXA 3G7JA 3DKSA 6GSVA 2LV3A 4IS0A 2FD3A 1BAYA 1F2EA 1SK0A 3HJOA 3ERWA 4GRFA 16GSA 4F03A 2E0QA 3FR9A 2VM2A 2WJUA 1A24A 14GSA 4N10A 4XCSA 2LJAA 2IMIA 5DAKA 1ERVA 4GLTA 4WBRD 1E6BA 5CRHA 2FGXA 2VCVA 3LSZA 1WOUA 2K8SA 3CRUA 1WWJA 2JL4A 1JLVA 4TR0A 1TRSA 3JCML 3TKQA 4JU5A 5J41A 1VF3A 1YEXA 5CRGA 2H1AA 4N0ZA 4EVMA 1THXA 2VIMA 1F37A 4FYBA 2IFQA 4MZWA 4PNFA 2YN1A 1SJ6A 3FZ5A 2N5FA 2J23A 5H5RA 1GL8A 4MK3A 3TKRA 5DQYA 1PX7A 2CVDA 3M0FA 4L0WA 2YNXA 3VFIA 2VL3A 3KXOA 4F2IA 3HVXA 2CX4A 3SBCA 1A2LA 2PU9C 1W4VA 1KTEA 2OA7A 1MD4A 2QKEA 2H6XA 2A2RA 1QUWA 4BL7A 5HR1A 2C0EA 3LGCA 1W89A 4YQUA 2C3TA 2YJ7A 4GCIA 5GSSA 1A8YA 2JSYA 2NBSA 3KP8A 2WB9A 3C1SA 3FK8A 4V1Ag 2JZSA 3HD5A 2R2JA 1TU8A 4MJEA 3CTGA 3KJYA 1YJ6A 3RPNA 4MPFA 3GKMA 1M2BA 1LBKA 1K3LA 4MJAA 1V98A 4K9ZA 2F3MA 1TRUA 5HR3A 1GP1A 3S9FA 1SJZA 2IPAA 4OWYA 1T3BA 4PNGA 4E8HA 2XHFA 3L9SA 5C04A 4MLYA 4ZL7A 1PMTA 2JSZA 4HEA2 2NVLA 3ZRDA 5D8IA 2GDRA 1GSUA 4QL7A 5D96A 2DMMA 2OE1A 1GNWA 1K3YA 2O89A 3FZ4A 4PUFC 4Q5QA 1SU9A 4L8EA 3VI7A 5GZZB 3DWVA 2V41A 3QAWA 3Q74A 3A2WA 4CHSA 1EP8A 1GTAA 1RW1A 1TRWA 4WBJA 2DMLA 3TKSA 3GH9A 1RK4A 3ERFA 1O8WA 3CRTA 3H4KA 1NHYA 1ZOFA 1AUCA 3F6DA 2YP6A 3I6AA 3KCMA 4BA7A 2PUKC 1YKCA 4BPYA 5GAND 4NV2A 5HFIA 5GAPD 3EMXA 2O8VB 1JZWA 1ZGNA 4KDUA 4K0NA 1EP7A 3E9JB 4OO5A 2MZCA 5CP1A 4GTUA 1Q4JA 2GQLA 1J0FA 4AF2A 5B6NA 2QGVA 5LD0A 1M7TA 3KD0A 4ZB6A 4HOJA 2LUSA 4KDYA 2FCHA 3TKPA 4JE1A 1LU4A 2X8CA 2HZFA 4PX1A 5IM9A 3D4TA 2C0FA 1ZYEA 3WGXA 1XXUA 4PQ1A 3Q19A 4HU9A 4G10A 3TJFA 4XRDA 2HE3A 4HS1A 3G9BA 4KA0A 1THOA 2R3XA 2FWEA 1GSYA 2LKUA 2CT6A 3L0HA 3HA9A 1ERWA 3RHBA 1CQGA 4K1FA 12GSA 2WULA 4ID0A 3FHKA 4RQXA 4MPGA 4KX4A 2DJ0A 2Z9SA 4N11A 4WXTA 1XWCA 2OE0A 4QL9A 4D73A 1R5AA 1SKRB 3I69A 3SWLA 2B7JA 4GWRA 2IIYA 3IXRA 3CYNA 1EWXA 1ZMAA 5CRWA 2BMXA 2VD1A 2YJHA 1KBNA 2CVBA 3FZ9A 2YPMA 4XS1A 2FLSA 4OFTA 3DYRA 1M2DA 3CBUA 1OVNA 1GSQA 3EYTA 3ZLPA 4LA1A 4POBA 1R4WA 3QD9A 5ECRB 1ZYQB 5IMDA 5A4UA 4I6XA 2YWNA 1OC9A 3HJPA 3UOMA 2VCXA 1JFUA 1HNBA 2L59A 2MMNA 3EE2A 3IV4A 4POKA 4IKHA 2JZRA 3D6IA 3W8JA 5EL8A 1UVZA 2AB6A 2B5XA 3F6FA 4KNDA 4WR5A 4GF0A 3GTUB 2RM6A 3ZREA 1F3AA 1T00A 2D2ZA 3GKXA 4N0VA 3TDGA 2K18A 2H6YA 1KEBA 5B8AA 5EPFA 2XPEA 4EXJA 3A2XA 2CAIA 4K8MA 3E3EA 4X0XA 4JR6A 2VL2C 4MMMA 1PL2A 5DCHA 3ED3A 1MTCA 2HRNA 4L0UA 2C0DA 3EURA 3LEFA 5KN1A 4TXVA 3BBYA 4OFNA 2AAWA 3HVSA 4IP6A 3BD2A 2LSTA 1FG4A 3LORA 3Q6OA 4GSTA 1N2AA 3P90A 5EY6A 2AJQB 3IK9A 3H93A 4IBPA 2X8HA 4IJIA 1FB6A 2I3YA 1K0OA 1TW9A 1SENA 5DALB 4EO3A 1JLWA 2RUFA 2YV7A 3KEBA 3ZMKA 4HZ2A 1GTUA 1J9BA 1M9AA 3TJKA 1Z9HA 2F8FA 3LXZA 5B6MA 3KGKA 5B8BA 3M8NA 4HDEA 2GQMA 2VD0A 3GHAA 4KAEA 3N9JA 5G31A 3QAVA 1R5PA 1BEDA 2BTOT 2F9SA 2R37A 5D73A 2V6KA 5ECLB 2GTUA 2GT6A 1V57A 5LNKe 3KTLA 1OYJA 4KSMA 4YAVA 2FHEA 2NPBA 3TOTA 4POMA 4I2UA 4NMUA 1FW1A 1ERUA 2VLUA 4XIHA 2OJLA 1FAAA 3UBLA 1XVQA 5DJLA 3F3RA 3QFBC 5D9VA 5LCZA 3KP9A 2VL9A 3HXSA 6GSWA 1Y6EA 3GNJA 5CO3A 5JWOB 1BG5A 2GVPA 5ECHB 3MAKA 1IYHA 3VK9A 3VI5A 2IMEA 3DVXA 3FZAA 4GQFA 4ECBA 2DJ3A 3F4RA 4MZCA 5J9CA 1I9DA 1AAZA 1GTIA 3LQ7A 3IE3A 1MDJA 1YQ1A 4PGTA 1FB0A 1LJRA 4Q5FA 2WZ9A 4KH7A 2ALBA 1K0DA 1PSQA 2H74A 4K6XA 5ID2B 1UC7A 1TP9A 4WETA 3D0ZA 1WP0A 2BJXA 1XIYA 2FA4A 2C8UA 2IMKA 5AN1A 4CW9A 2XC2A 1HD2A 1V58A 3BCIA 1QGVA 1WIKA 1GSSA 2VAFA 3GKNA 5D9XA 1M2AA 1G6WA 2MMAA 1TTZA 1XWBA 4EL1A 3IHQA 2JZTA 2GSQA 2E7PA 2IMFA 4K7OA 2I1UA 2PVQA 2V2GA 3EU4A 4Z7XA 3CSHA 4AGSA 5ABRA 2C3QA 4NHWA 1GUMA 1T7PB 3E0UA 3HKRA 4IVFA 5EVOA 4KE3A 3O3TA 4IQAA 2L57A 1ST9A 3GKKA 1B8XA 3US3A 2C1YA 2YWMA 4TR1B 4TXOB 2PN8A 3QCPA 4I8BA 2DJJA 1O7UA 5COHA 1X5CA 5J5NA 1KNGA 2B7KA 3KM6A 3UEMA 4X1UA 2IMDA 2KUCA 5IOWA 1GNEA 2P5QA 3UL3A 2V1MA 4LMVA 1F9MA 1X9SB 4AJ8A 3FRCA 1A23A 1WE0A 3C71A 1U3IA 4O92A 1EOGA 1Z7RA 5G1LA 1J08A 4JZQA 1TRVA 2HFDA 5F06A 2WFCA 1R7HA 3VPQA 1FOVA 5HR0A 5G1KA 3UIWA 1XW6A 2M72A 2C4JA 2V32A 4MABA 3APQA 4DSSB 1GSDA 1JZDA 1PL1A 1QMVA 3BOAA 1DE2A 4IELA 4IP1A 2B6MA 4IHUA 8GSSA 3MDKA 5F0GA 1PGTA 1C72A 2TRCP 1ZZYA 3GTUA 2B3SA 4RI7A 5IPGA 2WDUA 3EU3A 5DBQA 1YZXA 3DMLA 1T1VA 3EC3A 1ACVA 4MJBA 3ZVJA 1SK2A 2VCZA 2LNTA 5CREA 4ISDA 4YQVA 5G30A 5DCGA 1XWKA 3D22A 1OAZA 4V1Ap 3APOA 3ZITA 3PH9A 3HCZA 2HLSA 4O5RA 4LLRA 1XW5A 2A2SA 3NOFA 3HDCA 2J9HA 1GTBA 3EMPA 1GWCA 5H5QA 2OACA 2LJKA 9GSSA 3ZZXA 2HZEB 4WR4A 2R5GA 3FEUA 5DALA 1FVJA 4PUAA 4HU7A 4CDOA 5F8BA 3L4NA 3O76A 3TRQA 3CTFA 3F9UA 4FYUA 1U88A 2WGRA 3IRAA 3GURA 1EOHA 1BJXA 3TRPA 2FY6A 2LTKA 4KUNA 3ISOA 1XVWA 5IO2A 1K0MA 1Z5YE 2MBSA 2MBTA 2FA8A 6GSYA 4EDYA 3UAPA 1Z6NA 5KN2A 2H0IA 2H0HA 1X9WB 3DEXA 2LRNA 4J2FA 2RUEA 1AXDA 2RM5A 3QMXA 4JBBA 2H1GA 2RLIA 4BWQA 4XRAA 1X5DA 1YF1A 5D93A 2JU5A 3GL3A 1ZL9A 4TRXA 3GMFA 1U87A 1GUKA 5JWRB 1URMA 7GSSA 4WF5A 4O7HA 4NPBA 1SYRA 5KN3A 1E2YA 2WCIA 2O87A 5JCUA 1XWGA 1XOAA 4V2NA 4KDXA 5ID2A 2K9FA 3P7XA 3RPPA 1EV4A 1Z3EA 5C00A 5IOXA 22GSA 2GSSA 3UARA 2KLXA 3O6TA 2MYGA 5F05A 1AQWA 2L5LA 4HJ2A 2IWTA 3VPTA 3HHVA 3UVTA 3CSIA 3VWWA 3NZNA 2H30A 4LL4B 1U3AA 1O8XA 4EDZA 2VL2A 1G6YA 4WKWA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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