1TP9A

Prx d (type ii) from populus tremula
Total Genus 47
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
47
sequence length
162
structure length
162
Chain Sequence
MAPIAVGDVLPDGKLAYFDEQDQLQEVSVHSLVAGKKVILFGVPGAFTPTCSLKHVPGFIEKAGELKSKGVTEILCISVNDPFVMKAWAKSYPENKHVKFLADGSATYTHALGLELDLQEKGLGTRSRRFALLVDDLKVKAANIEGGGEFTVSSAEDILKDL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure and solution NMR dynamics of a D (type II) peroxiredoxin glutaredoxin and thioredoxin dependent: a new insight into the peroxiredoxin oligomerism
pubmed doi rcsb
molecule keywords peroxiredoxin
molecule tags Oxidoreductase
source organism Populus trichocarpa
total genus 47
structure length 162
sequence length 162
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2004-06-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF08534 Redoxin Redoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1tp9A00
3JCML 4WF4A 2FLSA 4BL7A 3Q18A 3ED3A 2YWMA 4E8EA 3GMFA 5IPGA 5G30A 2C3QA 3KEBA 3KH9A 3KZQA 5ECHB 3LEFA 3RPPA 5IOXA 4IKHA 5D9VA 5HQPA 4WR4A 4AJ8A 1M9AA 4KCAA 4MA9A 4KNDA 2IMFA 3HVXA 3KMOA 5ECKB 5DALB 2VCQA 4WETA 3AY8A 3LWAA 4J2FA 3F0IA 3HJPA 3I43A 3UJ1A 2B3SA 2DIZA 1JZOA 5ELAA 2YZUA 4WBRD 2C3NA 1SKRB 1K0OA 1SD9A 3GKXA 1C72A 1M7TA 4Q5NA 19GSA 2P5RA 5A4UA 2C8UA 2HRNA 2A2RA 3CSJA 4Q5RA 1YQ1A 1V58A 2DJKA 1O73A 2GSQA 3CSHA 3DGQA 4LA1A 4MCUA 3ZYWA 1G0TA 1N8JA 1KTEA 1R7HA 5KN3A 1U3IA 3ZFBA 3TKSE 4NHZA 5F06A 5J9BA 1TKDB 4KGIA 4QQ7A 5H5QA 2CV4A 4IQ1A 4GLTA 3F4SA 5G31A 2PERA 2WULA 4E8HA 2WJUA 3EMPA 3DMLA 1WIKA 2YJ7A 3ME7A 2LRTA 1HD2A 5J5NA 1PX7A 2FWFA 4MH2A 2B7KA 2VLVA 2C1YA 2O85A 3M3MA 3O3TA 4RI6A 4TW5A 4MJBA 3L9SA 1F6MC 2FY6A 3TDGA 1ZGNA 4KX4A 1MDIA 2P0GA 3VLNA 1AXDA 2LUSA 1YEPA 4JE1A 1PQNA 1XVWA 3LYPA 4TR1A 1T7PB 2GZZA 2FNOA 3TOTA 5HFIA 1O85A 3IDVA 3E9JB 1NHYA 1OKTA 1S3CA 2E0QA 2VIMA 3DYRA 1BEDA 4WXTA 2MMZA 3TCOA 3O76A 3KMNA 3DEXA 4MJEA 3UIWA 1ZOFA 4AJ6A 4TOPA 1G6WA 2HZEB 3CXGA 1M2BA 1R26A 1EGRA 5CRDA 5ECQB 2GSSA 4IHUA 1G6YA 4ZILA 1V57A 5EY6A 5EVOA 1YDKA 2CVDA 3QD9A 1QUWA 2PGTA 3C73A 4ILFA 5JCGA 3GKNA 1A2JA 2L6CA 1DE2A 1GLQA 4O32A 1WOUA 5DQYA 3FZ9A 4PX1A 2QGVA 2CZ3A 3FR6A 4GCIA 5IMAA 2GGTA 4X1UA 3UEMA 2H70A 4GTUA 3PH9A 4V2LA 2XBQA 2FUG2 2GTUA 4EXJA 1FAAA 1K3OA 3RAZA 3W6GA 3TKQA 1R4WA 1GNWA 5ABRA 4HZ2A 2OA7A 4HZ4A 2PN8A 4IW9A 2FWGA 3L9UA 5G2ZA 2REMA 3KGKA 3FRCA 1ERWA 3F6FA 6GSVA 2CX3A 1TTZA 1XOBA 1PL1A 2DJJA 3LORA 4TN8A 2GZPA 4FIWA 5CO3A 3FEUA 2PWJA 5GSSA 1S3DA 1PMTA 1SJIA 4PUFC 4KCEA 1KNGA 4MPGA 4N30A 1YY7A 3IR4A 3VPTA 2F9SA 4YH2A 3QCPA 3LG6A 3DD3A 4DEJA 4IJIA 5GSTA 3N9JA 3P7XA 3KD0A 3IK7A 3SWLA 2LS5A 1A8YA 2C4JA 4XRAA 3W8JA 4DSRA 4I6XA 3TJGA 4IVFA 3GH9A 3RBTA 3CYNA 3FKFA 4K6XA 2N5FA 2CAQA 1WPIA 4K9ZA 3ZL5A 2WDUA 1SJ6A 3G9BA 1GNEA 5CRGA 1A0FA 3BCKA 4D73A 2A2SA 5B6NA 3LXZA 4PNFA 4GQCA 1BAYA 2R5GA 4ZB6A 3UAPA 1N2AA 3TKPA 3FHKA 1JZRA 2IMDA 1PA3A 2IWTA 4Q5QA 3E0UA 10GSA 3GV1A 2FCHA 4JBBA 2I3YA 5ID2A 1WE0A 4G2EA 1TU7A 16GSA 3DXBA 5E59A 3IC4A 4FYCA 1M9BA 3EWLA 3KJYA 3LGCA 3UMAA 1GLPA 2O89A 1E6BA 1A23A 2C80A 3GIXA 4HI7A 4I97A 2JSZA 3PINA 5IQYA 4DSSA 1RW1A 4ZXGA 1IYIA 3G7IA 2BMXA 4JEDA 1IYHA 3KXOA 5IIZA 2LNSA 1GSQA 1XW6A 3D4TA 1YF1A 2C0EA 5D9TA 3MSZA 4XIHA 4MLYA 5B8AA 5LNKe 1Q4JA 2ES7A 4EUYA 3WGDA 2H73A 1SKWB 2CX4A 2WGRA 4POKA 2DMLA 2F3MA 1PD21 5J9CA 4JRRA 3EMXA 3DIEA 1SJZA 2EIRA 3IAS2 1Z6MA 3IA1A 4MF7A 4ACSA 2TRXA 3QFBC 3H8QA 1ZCPA 3HZ4A 1HQOA 1T3BA 4RQXA 4IELA 2IN3A 5DBQA 2IMIA 2LQQA 1BX9A 1EWXA 1GP1A 1OC9A 3VFIA 3TKSA 2YWNA 1OC3A 1GRXA 1V98A 3K8NA 3C7MA 4YQVA 4KA0A 4ZBBA 3FYGA 2M46A 3BJ5A 2O7KA 1GSDA 5F07A 4XS4A 5JCWA 1OYJA 1URMA 4KDXA 1HYUA 1K0MA 2DJ2A 3LJRA 2B5EA 2M72A 2VLUA 3ME8A 3M9JA 1KBNA 2LV3A 2OE3A 2PVOC 5IMVA 1AQWA 3D21A 4HEA2 2PU9C 3P2AA 2H76A 3C1SA 4IS0A 1ERVA 1WRYA 3IOSA 3EC3A 2DSAA 2XC2A 5ECNB 4KSOA 4MF6A 4QL7A 2GDRA 1ZL9A 3US3A 3FZAA 2YNXA 2YV7A 1SYRA 2I4AA 3QAGA 1AUCA 4EKZA 4FYBA 4XHMA 3KP9A 3M9KA 3VI5A 2H66A 3HJOA 3ZZXA 4NWYA 2WS2A 1E2YA 5FHIA 1TOFA 3GRXA 2MMOA 1UA5A 1BJXA 1EZKA 1SD8A 1X5DA 2YANA 5JCUA 3GTUB 2IMKA 3F3RA 4D73B 1VRSD 1UVZA 2F8FA 1EOGA 2HI7A 4MZCA 2HT9A 1QMVA 2FWEA 2GSRA 5HR0A 1FO5A 2I81A 4BA7A 4Z7XA 4AJ7A 2AV4A 1DBYA 3GKKA 1XWKA 1GUMA 3HYPA 4NXIA 12GSA 3TOUA 1F3BA 3ZTLA 3TUEA 1A8LA 2L6DA 6GSUA 2AHEA 4K7OA 2CVBA 4WEYA 1QK8A 1S3AA 2JU5A 2VLTA 2H19A 3F8UA 4MF5A 2NDOA 3ZIVA 5DAKA 3IXRA 4TR3A 4DVCA 4RQRA 1GSYA 5F0GA 4ZL9A 4F2IA 1EV9A 4NV5A 4AF2A 2O87A 4KB3A 2LRCA 1XIYA 4TR4A 3D5JA 5COHA 1ERTA 14GSA 4ECBA 4OMVA 4FYUA 1B9YC 4CDOA 2H8LA 2AJQB 2YN1A 5KN2A 3VK9A 4MPFA 3I9V2 1FW1A 4JU5A 2FD3A 4ZBDA 1OAZA 1O6JA 3TRQA 4ZB8A 2BTOT 2XPDA 3IHQA 1FHEA 3HKRA 4JR4A 4JR6A 2R3XA 2ZUPA 4Q5FA 1J0FA 1SL0B 2MYGA 2K8SA 2F51A 1DSBA 2H1BA 4L5LA 2YV9A 5B7CA 1T4ZA 1F37A 1EEMA 2L57A 1OC9B 3ZIJA 1WP0A 1AQVA 1R5AA 1GSFA 2IFQB 3ZLPA 1O8WA 2VOCA 2H0IA 4OFMA 1YJ6A 1GTAA 1VGLA 2OKAA 1TK5B 4K1FA 3NZNA 1QXHA 4DSQA 4G19A 3L78A 4K7IA 6GSXA 4G9HA 1X9SB 2H30A 3N5OA 5HR3A 4IP6A 5CYYA 5CAXA 2OACA 1MDKA 2GT6A 3I69A 2C0GA 3A2XA 5ENUA 4EVMA 1X9MB 2KP1A 1GTBA 1SL2B 4ID0A 4I5QA 3S9FA 2GS3A 3CTGA 2LSTA 2H01A 3H79A 1XW5A 2GQLA 1F9MA 3GX0A 1ML6A 1TRWA 2MMAA 5DDLA 4ZIJA 3ZVJA 3UL3A 1VF2A 2NVLA 4TXOA 3KTBA 3ERGA 1CQHA 3WD6A 1V2AA 2JACA 1W89A 4GQFA 2FWHA 4KUNA 2H0GA 3CTFA 4HU9A 3KM6A 22GSA 3KIJA 4YQMA 2YP6A 5LCZA 4BPYA 1B9XC 1FVJA 1O7UA 1NW2A 1T1VA 3UARA 1SL1B 2K8VA 3C71A 3I6AA 3EYTA 5KN0A 1AIUA 4WF5A 2KOKA 3VPQA 1PSQA 5A5KA 4EDYA 3F9UA 2GVPA 3BBYA 3Q6OA 2YZHA 4V2NA 2VL2A 1U3AA 4IP1A 5EPFA 1CQGA 3ZMLA 1XOAA 3BOAA 1F3AA 1Q98A 5CRWA 4IGJA 4X0XA 2L5OA 4MJAA 3BD2A 4OO4A 3HVSA 3MAKA 2B5YA 4PQHA 3EURA 5CNWA 3V1WA 2PMTA 4F82A 3LQ7A 2ZNMA 1FVKA 2AUVA 1VF4A 1NHOA 2QSIA 3C1RA 4POLA 2HXKA 2JL4A 2LNTA 4EDZA 2VCXA 3FW2A 4GF0A 1VF1A 4HQSA 4F0BA 3A5WA 1XWBA 2B7JA 2A4VA 5D73A 3QAWA 2RIIA 4ML1A 2G2QA 4F0CA 1TU8A 2RUEA 2PBJA 4HQZA 5ELGA 3VWUA 1QGVA 3E3EA 1ON4A 2WZ9A 3GNJA 6GSTA 1TW9A 3GURA 4OO5A 4TKYA 5IPHA 4TXVA 4GSTA 1XVQA 1FB0A 4G10A 4JZQA 3KP8A 5ECRB 5AISA 3ERWA 1EV4A 4K2DA 5GAPD 3HCZA 1EEJA 3GUSA 1EOHA 3IRAA 2YJHA 4HDEA 1Z9HA 1ST9A 3TJFA 4ZBAA 4KE3A 3P8WA 3FZ5A 3QMXA 1HNAA 2AAWA 3J7Yb 1GSEA 1ZZYA 2VCVA 2L4QA 1K0NA 2HNLA 2IMEA 2LEGA 3VWWA 1B4PA 3UBKA 2V2GA 1LJRA 5AIVA 3CSIA 3TRXA 4ULXA 1X9WB 4TR1B 1GULA 5ECMB 5IMFA 1K0CA 4TRXA 3G7JA 3VI7A 5IOWA 4J56E 3APOA 4NMUA 4MJCA 5E4WA 2ALBA 2X8HA 3TJBA 1AAZA 3H93A 4AGSA 5EL8A 1ACVA 3FZ4A 3RHCA 1QFNA 2FA4A 3ZRDA 4TXOB 4I8BA 2CVKA 1HNBA 4WKWA 1PKZA 5C00A 3Q74A 1J9BA 4ECIA 3SBCA 5D9WA 2WCIA 1TRUA 3LSZA 5IO2A 5J4UA 3EINA 2DJ0A 2WB9A 5DCHA 3L4NA 2C0DA 1OE8A 3WYWA 3F3QA 2H75A 4L0WA 3MWHA 2RM6A 2HZFA 5G1LA 2RUFA 5IO0A 1V40A 3WT2A 4IJ3A 5G5FA 1SU9A 4ZL8A 5FWGA 5IMZA 2X64A 4WBJA 3FR9A 1B8XA 4N0VA 1TP9A 4L5OA 4KW6A 4NPBA 2R2JA 1QQ2A 6GSSA 3GL5A 2MBSA 2HLSA 4OWYA 2GZYA 3H1NA 4XS1A 2KHPA 1TI3A 1A0RP 5DQSA 5H5RA 4L0UA 3RPNA 1OKDA 4POBA 5ECIB 1XW9A 3L0HA 1EP7A 3GKMA 5A4WA 3UVTA 1H4OA 1PX6A 5D96A 1Z5YE 2VAFA 2M80A 4WR5A 1Z3EA 3PGTA 2OE0A 1GTUA 3QFAC 3LXTA 1H75A 2VD0A 1GSSA 4OD7A 2ON5A 2ON7A 3IV4A 4MMMA 1TRVA 2IIYA 4YAPA 1B48A 2LJRA 3HXSA 2HZEA 1JFUA 2V6OA 3GA4A 5DJLA 3GL3A 2OE1A 3G7YA 3D4MA 3H4KA 3KTLA 2VL9A 4J57E 4XCSA 1SYXA 2Z9SA 4F03A 1WMJA 4V1Ap 3D22A 5GZZB 4V2MA 5B8BA 2X8GA 3HA9A 5AGYA 3WGXA 1AQXA 2DIYA 1JZWA 2J23A 2K6VA 2YCDA 3GX8A 2VCZA 3A2WA 5ID2B 1JZDA 1XXUA 2TRCP 1YEXA 3ZFLA 4KSMA 3ERFA 2FHEA 4TVEA 3MNGA 1XZOA 1ABAA 1BG5A 3WGEA 3GN3A 1PN9A 4XS6A 2KLXA 4QL9A 2L5LA 1JHBA 3F4RA 4BVYA 1XFLA 1TK8B 2H71A 4FO5A 5CREA 4DSSB 3LYKA 1NM3A 5KEJA 5D9XA 1PL2A 4P3YB 1PGTA 2DJ1A 2JZSA 1PRXA 1SK0A 1YF0A 2LQOA 1FB6A 1U6TA 2V1MA 3TKRA 2IJYA 2H1AA 2LKUA 4XRDA 1Z7RA 1WWJA 5IMCA 3A3TA 2ZCTA 2JADA 3TKSC 3GYKA 4IBPA 4ECCA 2VUPA 1K3YA 1TJDA 4I2UA 2TIRA 5J3RA 4CHSA 4POMA 2V6KA 1G7OA 4K8MA 4OCFA 2P31A 2N5AA 2K18A 4MK3A 2H6XA 1XWCA 2GSTA 4O7HA 1U87A 5INYA 1T4YA 4N10A 3W8SA 2LRNA 5ECSA 2MZCA 4YQUA 4RUVA 1JLWA 4K0NA 5B6MA 3IAM2 2RM5A 1MD4A 2NPBA 2NBSA 18GSA 5DVBA 4MZBA 1EGOA 4F9ZA 4V1Ag 5JWOB 2R6KA 1G7EA 4KAEA 4PURA 3QR6A 3UOMA 3EVIA 1X5CA 4XS4B 2HSHA 3HD5A 4L8EA 2I9HA 3EE2A 1KEBA 3FK8A 6GSYA 1BQ7A 2KP2A 1WJKA 4LMVA 3D6IA 3A2VA 2VL3A 4GRFA 1MDJA 3U6VA 3TGZA 3VURA 1AW9A 4KDYA 3ZITA 2VO4A 1M2AA 1R5PA 1ZMAA 2VM1A 3OR5A 4ZL7A 2NTOA 4BVXA 4EE0A 5LD0A 4HOJA 5HFGA 3RHBA 3FR3A 4CW9A 3GSSA 3LFLA 1X0RA 3KH7A 2R4VA 13GSA 3WT1A 4NHWA 4I2TA 2VCTA 1AC1A 3DWVA 3GSTA 4MZWA 1XWGA 2KUCA 2DMMA 2H6ZA 1O81A 2B1KA 4MP4A 5AIXA 3IK9A 2GT5A 4EL1A 1W4VA 3U5RE 2O8VB 2L4CA 4HJMA 5DJMA 2HYXA 4BWSA 4RI7A 4OCEA 1OC8A 4MDCA 3M0FA 1MTCA 4KDUA 1M99A 1X5EA 2IL3A 2CAIA 3APQA 2OADA 2OBIA 4GXZA 5G5EA 5JWQB 4LLRA 2EIQA 2K9FA 4PUAA 4FH8A 3ZREA 3M8NA 2PUKC 1LBKA 3CMIA 3TRPA 3F4TA 3GH6A 2XHFA 1RK4A 1TDIA 2G0FA 3R2QA 4MABA 4HU7A 2YOIA 5HR2A 5DAKB 5HR1A 3L9VA 2R37A 5ECOB 2I1UA 2CQ9A 2DJ3A 1TXXA 4HS1A 2F8AA 4LL4B 6GSWA 4GSNA 2QC7A 4ECJA 1PKWA 3DVWA 2H6YA 4ISDA 3TJKA 2N5BA 1RQMA 5ECLB 3TB2A 5ECPB 5F05A 2J9HA 2V32A 3HVVA 4MH3A 3O6TA 4ML6A 4YAVA 2XBIA 5CRHA 3GHAA 4X43A 5L71A 1MD3A 2AYTA 2WRTA 4EC0A 3EU3A 3P90A 1EP8A 4O92A 5IM9A 4EO3A 2B5XA 1JLVA 3DRNA 2YPMA 1F2EA 4PQ1A 1XBSA 2DBCA 5JWRB 2DLXA 5KN1A 3C8EA 3QAVA 3CRTA 4XTSA 5CP1A 4K7NA 2L59A 3HJMA 2WFCA 3F63A 1K0AA 1YKCA 1B4QA 3GTUA 5DCGA 3RDWA 5G1KA 3IE3A 4PNGA 3NIVA 4PGTA 1Y25A 3D0ZA 5GAND 1OVNA 1GWCA 2HSYA 2E7PA 1SENA 3NOFA 2VCWA 3PR8A 3IBHA 4HJ2A 4NAXA 1BYEA 3FY7A 1A2LA 1Y6EA 1GTIA 1GSUA 1XPVA 2DC5A 1USBA 5C04A 1K0DA 2B1LA 3VWXA 1T00A 1GUHA 3QPMA 5D8IA 3VWVA 5DALA 2LJKA 2VD1A 5A4VA 1DUGA 2H1GA 2H74A 1Z6NA 4GSSA 1O8XA 5FT3A 1MEKA 3BCIA 2XPEA 2GLRA 3DVXA 5H5SA 5F8BA 2GQKA 2QKEA 2CZ2A 4N0ZA 3TJJA 3UVHA 2OJLA 2VL2C 1XWAA 2EIOA 4BWQA 2OBKA 2D2ZA 4GWRA 2JZTA 3KCMA 3HDCA 1TI1A 2PPTA 1I5GA 3J7Yk 1M2DA 3QDNA 1I9DA 1FOVA 1K0BA 1GL8A 1TK0B 2B6MA 1UC7A 4PQIA 2MBTA 1YZXA 9GSSA 2PVQA 2JSYA 2X8CA 1YKAA 1THXA 1GH2A 1SK2A 17GSA 2BJXA 1SKSB 2MMNA 2RLIA 2E2MA 3UBLA 2IFQA 1ILOA 2P5QA 1UN2A 1VF3A 1XCCA 2LTKA 1DE1A 1OE7A 3MDKA 2IPAA 2CT6A 1SK1A 4PXOA 4IQAA 1V9WA 4KH7A 1K3LA 3HZ8A 1LU4A 3M1GA 2H72A 8GSSA 3ISOA 1J08A 4NV2A 1T8EB 3DKSA 1A2MA 4N11A 1ZYEA 4OFTA 1NSWA 1FG4A 3Q19A 3ZVJD 7GSSA 1A24A 1ERUA 2HE3A 5IMDA 1M0UA 1U88A 1HNCA 4LMWA 2AB6A 4H86A 2LJAA 2VM2A 2EC4A 5J41A 2E2GA 2CA8A 4EF0A 1THOA 3F6DA 3CRUA 4IN0A 2FGXA 20GSA 2H0HA 3HY2A 2HFDA 2X99A 4ZB9A 4K0GA 1ZYQB 11GSA 1Z7PA 2H1DA 4O5RA 2JZRA 1TRSA 1GUKA 3EU4A 3QOUA 3HHVA 3APSA 2YWIA 2GQMA 2C3TA 4TR0A 3IPZA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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