1TRSA

The high-resolution three-dimensional solution structures of the oxidized and reduced states of human thioredoxin
Total Genus 20
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
20
sequence length
105
structure length
105
Chain Sequence
b'MVKQIESKTAFQEALDAAGDKLVVVDFSATWCGPCKMIKPFFHSLSEKYSNVIFLEVDVDDAQDVASEAEVKATPTFQFFKKGQKVGEFSGANKEKLEATINELV'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title The high-resolution three-dimensional solution structures of the oxidized and reduced states of human thioredoxin.
pubmed doi rcsb
molecule keywords THIOREDOXIN
source organism Homo sapiens
molecule tags Electron transport
total genus 20
structure length 105
sequence length 105
ec nomenclature
pdb deposition date 1994-05-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1trsA00
8GSSA 3L9UA 4QQ7A 3IR4A 1GSEA 5HQPA 2PUKC 2X99A 3C1SA 3TKSE 2LEGA 2FGXA 5CNWA 1XBSA 3TKSC 1XPVA 4GLTA 3TGZA 4F0CA 3GYKA 1SKWB 3ERGA 2CVBA 1AAZA 3RHBA 1GWCA 1SD9A 1X5CA 1J08A 1XZOA 4KSMA 3TKSA 1HYUA 2IL3A 3SWLA 4J56E 1T00A 4WBRD 4LMVA 3GKMA 2H01A 3BJ5A 2LNSA 2MYGA 1SKSB 2M80A 5F06A 3VWVA 2IMEA 4F03A 2C0FA 1J9BA 3ZTLA 1SK0A 1M2DA 3KMNA 2RUEA 1EZKA 2VM2A 2H0IA 2R3XA 1T1VA 1GL8A 2JL4A 3VWXA 1AC1A 2LQOA 3ERWA 1V2AA 2C8UA 1YKAA 5ECQB 3W8SA 4GQFA 1OAZA 3LJRA 1GH2A 1JLVA 1F6MC 1SU9A 4ZB8A 9GSSA 4KE3A 4FYUA 3WGEA 4DEJA 2GSQA 3O6TA 3K8NA 2GT6A 1TK5B 3V1WA 2GSRA 2OJLA 3IHQA 1THOA 3HVVA 4K9ZA 2YV9A 5ABRA 3ZZXA 1TW9A 3DYRA 5IMZA 1Z7PA 5IM9A 1PKWA 1TI1A 5AN1A 1GRXA 1M99A 5IMFA 2WZ9A 4XTSA 11GSA 2FNOA 3P2AA 3P7XA 1H75A 2KOKA 5DALB 2I81A 5JWRB 3TJFA 3KH7A 3L9VA 1F9MA 1SENA 3NIVA 4IN0A 2YZUA 3TJGA 5F0GA 2CAQA 3U6VA 3CSIA 5KEJA 4L5LA 1PX7A 4MJEA 4ULXA 2O87A 2GSSA 1V58A 3UAPA 3A5WA 2RM6A 4GXZA 4HJMA 2H74A 4HEA2 4RQXA 2OKAA 4KDYA 2Z9SA 2GZZA 1NSWA 2WCIA 1SYXA 1GP1A 2F51A 5JCGA 2GZYA 3HY2A 1SL2B 2DJ3A 1JHBA 2HNLA 2VO4A 2LSTA 3MAKA 2XBQA 4IQAA 4PX1A 1MDJA 2NVLA 3DVXA 4NHWA 4HZ4A 4PQHA 1SD8A 1XWGA 5D9VA 4WKWA 3CMIA 2J23A 3H4KA 1A23A 3PH9A 5ECMB 3VI5A 2X8CA 3L78A 1O81A 3TRPA 1EGRA 3CSHA 4E8HA 4OFNA 2QC7A 3C7MA 1YKCA 4I2TA 3QCPA 20GSA 1TU7A 2H8LA 4I6XA 2FWHA 1DSBA 2ZUPA 2C0EA 1GLPA 3D5JA 4YQUA 3O76A 1GUHA 2VCXA 4ECJA 3KIJA 1TRVA 3Q74A 2B5XA 3M8NA 4GQCA 4KH7A 1TK0B 4MDCA 3TJJA 3KH9A 3HJMA 1K0CA 2R37A 4DSSA 1GSDA 1M2BA 4GTUA 2CZ3A 3SBCA 2CVKA 1QK8A 3I43A 2WGRA 1YQ1A 1U3AA 1F3AA 1N8JA 2TRXA 3MDKA 4MH3A 4Q5RA 5D73A 2VM1A 2LJKA 2WB9A 1K3LA 4IW9A 2K18A 3W6GA 2C0DA 1G7EA 2L6DA 1UC7A 3L9SA 3ZLPA 4BPYA 3APOA 1YDKA 2PMTA 1THXA 4D73A 1F2EA 2BMXA 1TU8A 12GSA 2FCHA 3QD9A 3BOAA 3IDVA 3HYPA 4Z7XA 2XHFA 5LD0A 1DE2A 2HI7A 5ECKB 2E0QA 1M9AA 1V98A 2VCZA 4MJCA 2XC2A 4V1Ag 4CW9A 1ERTA 1A2MA 1YJ6A 5CRWA 3ZIVA 1PRXA 4I8BA 2HRNA 2VCTA 1IYIA 2JACA 2VAFA 4RI7A 1TXXA 1GTAA 1R5PA 1O6JA 3LFLA 3L0HA 2OA7A 1HNCA 1ZL9A 5D96A 4L0UA 1G6YA 4BVYA 3CRUA 1TKDB 5DAKB 3J7Yb 2HSHA 4ZB6A 2IMIA 5CYYA 5D93A 5GAPD 2KLXA 2DIYA 2QKEA 3HVSA 5HR1A 2C80A 2ON5A 3ZIJA 2VCQA 1GLQA 3IXRA 1FB0A 4FO5A 1A8YA 2K8SA 4ZBBA 3FZ4A 1AIUA 4ZIJA 3G7JA 1E2YA 1E6BA 5FT3A 4X1UA 3L4NA 4MJBA 1KNGA 2NBSA 1XCCA 3TRXA 2JSYA 2NPBA 3J7Yk 4X0XA 1PSQA 1W89A 3E0UA 5G5FA 2C0GA 1HQOA 4K7IA 5ID2B 3UVTA 3GV1A 4KCEA 4QL9A 3KTLA 2PVQA 1MDIA 4O32A 4IHUA 5IPGA 2OE1A 3IPZA 4NPBA 5DQYA 3EURA 3UVHA 1UN2A 1KTEA 4YQMA 4GCIA 1BQ7A 2R2JA 1EOGA 2H6YA 2REMA 3KEBA 4EXJA 2H30A 5DQSA 13GSA 2VL3A 1XVQA 2DJKA 1O73A 1SL0B 1SJIA 2GZPA 2H1AA 1BG5A 3KJYA 4I97A 4EO3A 3FK8A 2MMNA 4KGIA 4XS1A 3EYTA 1R4WA 5G31A 3DEXA 3WD6A 2HXKA 1QMVA 6GSVA 3CBUA 4V2MA 1ZCPA 1Y6EA 3WT2A 1MEKA 3WT1A 1JZWA 1EEJA 1M7TA 4FIWA 1S3CA 3P8WA 4ECIA 3TRQA 5ENUA 4LLRA 4ML1A 4EVMA 3Q6OA 5DDLA 2IFQB 1TDIA 3PINA 1ZYQB 5DJLA 2HFDA 4ISDA 1FW1A 2R6KA 3GKKA 2MMOA 2FWFA 4BWSA 3UL3A 1RQMA 4L8EA 2B1LA 3HKRA 2H70A 3VPTA 2MMAA 3IAS2 4MZCA 5CO3A 3IC4A 5G1KA 3E3EA 1AXDA 2C3QA 1LU4A 2WRTA 4OCEA 2X8HA 6GSWA 5DVBA 1G7OA 3GX0A 1OC3A 4NV2A 2H76A 3M3MA 3QAGA 1XFLA 1VF1A 3HJPA 1SKRB 2PPTA 4N10A 1QXHA 4TR0A 1PMTA 3UJ1A 1GNWA 2A2RA 1U3IA 3G7IA 5HR3A 1F3BA 2HYXA 2KUCA 6GSYA 2E2MA 2DMLA 5HFGA 4TR1B 4JBBA 4MZBA 1OC9A 1WOUA 5J9BA 3GX8A 3GURA 2E2GA 4MABA 1YZXA 3FW2A 1W4VA 1AQXA 2WFCA 3QAVA 4KDXA 4WR4A 3VK9A 1O8XA 2L59A 17GSA 5C04A 4TXOA 1XWBA 3BCKA 2V2GA 4EKZA 3ZVJD 4IVFA 3FR6A 2DJ2A 3EU4A 2F8FA 1R5AA 2I4AA 2AV4A 1Z9HA 2CX4A 1AW9A 3TCOA 4XIHA 3A3TA 2O8VB 4Q5QA 2B6MA 3FRCA 4MF5A 3TKQA 3RAZA 3IE3A 2AAWA 4HOJA 4ZXGA 1TTZA 5ECHB 3UEMA 4KUNA 1FAAA 1XVWA 2WDUA 5FHIA 4TKYA 2FD3A 3HZ4A 1BYEA 1UVZA 1XWCA 3VI7A 3DMLA 1GSSA 4GF0A 1ML6A 5HFKA 1CQGA 3D21A 16GSA 5GSTA 2DLXA 4OFMA 3F4SA 4K6XA 3TJKA 4I5QA 2GVPA 1X9SB 3QFBC 5E4WA 5DCHA 2C1YA 2OE3A 4KDUA 4TR3A 3A2XA 2ES7A 1I5GA 3LXZA 1WWJA 2YWIA 4DSQA 3HCZA 4BA7A 1JZOA 2YV7A 4V2LA 1X5DA 4HZ2A 3VFIA 1ERVA 4YH2A 1NM3A 5IMVA 2IMDA 5C00A 1N2AA 2XBIA 2YJ7A 2H6ZA 3DRNA 2LS5A 1AUCA 1QUWA 4WF4A 5KN3A 1V40A 5A4WA 4ZL7A 3FYGA 5IMAA 1X5EA 3Q19A 4EDZA 3IOSA 1ILOA 3LYKA 3LXTA 1GSQA 3E9JB 3DGQA 2IPAA 2VLVA 4AJ6A 2VCVA 3UBKA 1LJRA 1FVKA 1ON4A 4ECBA 3M1GA 1A2LA 3BD2A 3I9V2 1FOVA 2H1GA 2H72A 3ME7A 5IMDA 3F0IA 1PKZA 3H8QA 2DBCA 4N11A 1SYRA 3GTUB 1YY7A 3EU3A 3VWUA 3APSA 2DJ0A 5A4VA 1GNEA 2K9FA 2P5QA 1TRSA 2A4VA 5J3RA 3VLNA 19GSA 2CQ9A 3JCML 5HR0A 2RUFA 4GRFA 2AYTA 4FH8A 5CRDA 4KB3A 2GLRA 2JSZA 2DMMA 5AIXA 1T3BA 5IPHA 4IELA 4YAPA 2L5OA 3QPMA 4FYCA 4ACSA 2IMFA 2N5AA 2B5YA 2KHPA 4IGJA 4OWYA 3H1NA 2HRFA 6GSXA 2DC5A 2YPMA 2L57A 3BBYA 4V1Ap 2WJUA 4G9HA 4HI7A 2YZHA 2DIZA 1R26A 4POKA 4OO5A 1GSUA 2KP2A 4GWRA 5J5NA 3F6DA 2VUPA 1WIKA 4J57E 5DALA 1URMA 1MD4A 2J9HA 1ZGNA 1TK8B 5CRHA 1OC8A 1F37A 4JEDA 2IWTA 5F8BA 1A24A 1DUGA 1NW2A 2MBSA 4LA1A 2MMZA 4LL1B 5D9TA 1C72A 2B1KA 4XS4B 5DBQA 2DSAA 5IO2A 3LWAA 1B48A 3KP8A 4TW5A 2BJXA 2A2SA 2C3NA 2LUSA 3KM6A 1VF4A 3IBHA 5H5RA 4H86A 1K3OA 3A2VA 4MZWA 4WETA 1DE1A 5CRGA 2OACA 4POMA 2HZEB 1JFUA 1ERWA 2GTUA 4JU5A 2L4QA 3WGXA 6GSTA 5J9CA 1Q4JA 1Z7RA 4N0ZA 2AHEA 1TP9A 1PQNA 2XPDA 4WXTA 4RI6A 2YWMA 1B8XA 2EIRA 2LRTA 3CTFA 2JZRA 3ISOA 1ERUA 4JZQA 3F63A 4IJ3A 3UMAA 1UA5A 1K0BA 4MLYA 2X64A 2LQQA 4V2NA 3MWHA 4PUFC 3EE2A 3IV4A 1QFNA 1U6TA 2HLSA 1B9XC 2O7KA 5F05A 1BJXA 2LV3A 3ZFLA 1WP0A 2VCWA 1G6WA 2GQLA 3ZITA 2VD0A 5IIZA 4Q5FA 1RK4A 4PNGA 2I3YA 1PN9A 1KBNA 2PN8A 4EDYA 4KCAA 2V6KA 1M9BA 1WPIA 1YF0A 1YF1A 4DSRA 1S3AA 4EUYA 2B3SA 3WGDA 2FLSA 3M9JA 1U88A 3FEUA 5ID2A 3NZNA 1EV9A 2FUG2 4XCSA 1V57A 4XRAA 2VLUA 4PNFA 4P3YB 5HFIA 4GSSA 4OCFA 3U5RE 3FR9A 2GGTA 3S9FA 4XHMA 1XOAA 1V9WA 3D4MA 3C8EA 2GT5A 2LRCA 4TR4A 4G19A 3GHAA 1WJKA 1USBA 4MF7A 5G5EA 1EP8A 4IBPA 2B7KA 5AISA 1EP7A 1GUMA 2K6VA 4OMVA 4G2EA 1M2AA 4N0VA 2O85A 5IOWA 1BX9A 4O92A 4WR5A 4CHSA 1TJDA 2K8VA 4ZL9A 5CAXA 2G2QA 3EWLA 4BVXA 3QFAC 5H5SA 2FHEA 4ZL8A 2O89A 3HJOA 2ZCTA 3ZREA 4F9ZA 3ZL5A 4DVCA 4HU7A 5DAKA 1A2JA 5ECIB 2H1BA 2DJ1A 4ECCA 4TXOB 3CXGA 3DXBA 1XXUA 4AJ8A 3TOUA 3N5OA 4I2UA 1WE0A 1J0FA 2FWGA 1KEBA 1K0DA 2CT6A 4E8EA 3DKSA 4ID0A 3GUSA 2HE3A 2PERA 3CTGA 1OE8A 5ECSA 18GSA 1IYHA 2YCDA 3GSSA 4MA9A 5ECRB 3W8JA 4K7OA 5L71A 4LL4B 3R2QA 4MF6A 3HHVA 1ABAA 3QAWA 5IO0A 1SL1B 3IK9A 1GULA 1DBYA 7GSSA 1PD21 3DWVA 3KZQA 5KN0A 1B4QA 1EEMA 1RW1A 1T4YA 1JZRA 2P0GA 2NDOA 4PQ1A 1GUKA 5G2ZA 2B5EA 3I69A 1B4PA 4RUVA 1OKTA 2FWEA 2R4VA 4TXVA 4AF2A 2YWOA 3EINA 4IP6A 4X43A 2H71A 4MJAA 1LBKA 3O3TA 3LGCA 2C4JA 4K1FA 3ZVJA 3VWWA 3BCIA 4QL7A 1BEDA 3EC3A 4CDOA 3IA1A 2H1DA 1ST9A 3D6IA 4GSNA 4RQRA 5LCZA 3KCMA 1ZMAA 4IKHA 2EIOA 3FZ5A 1K3YA 3G9BA 1PGTA 4K0NA 2RIIA 4WBJA 3ZFBA 1GTBA 4XS6A 3IK7A 2GS3A 3KXOA 4L5OA 2YJHA 5ELGA 1O7UA 2YANA 3A2WA 3G7YA 3Q18A 1B9YC 2TIRA 6GSUA 1O8WA 1GSYA 3P90A 3TKPA 2GDRA 1EGOA 4TVEA 5EL8A 4F0BA 5LNKe 2IFQA 4NXIA 2JZTA 2LTKA 2V1MA 1FVJA 2L5LA 3FR3A 3ZMLA 5DCGA 5EVOA 1VRSD 3TB2A 3GL5A 4IQ1A 5CP1A 3CSJA 2YP6A 5DJMA 5D8IA 2M72A 5J41A 5G30A 5D9XA 1K0OA 3F3QA 3FZ9A 2WULA 3QR6A 2RLIA 3CRTA 5IQYA 3US3A 3I6AA 3VURA 4KNDA 1FO5A 4IP1A 1T4ZA 4F2IA 3KTBA 1HNAA 1TOFA 2LJAA 2P5RA 2WS2A 2N5BA 1HNBA 2TRCP 2AUVA 1YEXA 4OD7A 3QOUA 1GTUA 2VLTA 1OE7A 4HQZA 4DSSB 1VF2A 2H6XA 1K0AA 2V32A 4AGSA 4AJ7A 3RDWA 4TR1A 4PQIA 1XW6A 3GL3A 3M0FA 5ECOB 2PWJA 3F3RA 5JCWA 2IMKA 3ZRDA 5B8AA 1X9MB 1U87A 1XOBA 4ZBDA 5J4UA 1WMJA 5KN1A 1O85A 5EY6A 3ZYWA 3ED3A 4MK3A 1EV4A 1T7PB 3FZAA 3GIXA 1MDKA 5AIVA 3PR8A 4D73B 2AB6A 3KP9A 4J2FA 3C73A 1NHYA 3GH9A 2RM5A 1OVNA 4HS1A 3HXSA 1AQVA 3F4RA 3H79A 4O7HA 2ZNMA 2L4CA 4F82A 3ME8A 3KMOA 4LMWA 2QGVA 2OE0A 1VGLA 1MD3A 5IOXA 1CQHA 4ML6A 4NWYA 3ZMKA 4PXOA 2VOCA 3M9KA 3HA9A 2CA8A 3EMXA 3QMXA 1A0RP 4MPGA 1EOHA 1TRUA 5FWGA 2I1UA 5AGYA 5GSSA 3C71A 4K2DA 3TOTA 3GH6A 2OBKA 4JR4A 10GSA 1FB6A 1XWAA 2VD1A 4EC0A 2AJQB 4TN8A 2ALBA 1PA3A 3DVWA 4G10A 1VF3A 3TJBA 4Q5NA 4MPFA 3RBTA 2H66A 1GSFA 2QSIA 5GZZB 2FA4A 3C1RA 4MH2A 2JADA 3H93A 2E7PA 1NHOA 3LEFA 2CZ2A 2KP1A 1FHEA 4IJIA 1GTIA 2GSTA 2IJYA 1XW5A 5F07A 1SJZA 2H0HA 3RPPA 1JZDA 1FG4A 1PL1A 1ZZYA 5A4UA 2F3MA 3GMFA 4IS0A 2JZSA 4WEYA 3EVIA 5ECPB 3GNJA 2CX3A 1Z3EA 1PX6A 2LJRA 1ZYEA 3MNGA 3LSZA 3FKFA 3CYNA 3OR5A 2EC4A 5B6MA 4HJ2A 3GSTA 3RPNA 1AQWA 4NAXA 2LNTA 2VIMA 5G1LA 2H73A 3F4TA 3DD3A 3GTUA 1QGVA 3UARA 4NHZA 2YNXA 3TDGA 2P31A 3DIEA 2LKUA 4POLA 4JR6A 4NMUA 3KD0A 5B7CA 5JCUA 4PURA 4FYBA 4KX4A 4ILFA 4K0GA 1OKDA 2H19A 2VL2C 1M0UA 2I9HA 3LORA 5A5KA 3GA4A 2YWNA 3D22A 2OBIA 1SK1A 2YN1A 2OADA 1X0RA 2H0GA 4PUAA 2V41A 1XWKA 3F8UA 3UIWA 2PGTA 5COHA 1X9WB 2VL2A 1HD2A 3RHCA 1EWXA 5B6NA 1XIYA 4WF5A 1TI3A 2FA8A 3UOMA 4HUAA 2H75A 2PBJA 5JWQB 4TRXA 2IN3A 2EIQA 2V6OA 3QDNA 4MP4A 5H5QA 1BAYA 3F9UA 4EF0A 5HR2A 5ECLB 4HU9A 1Q98A 4HQSA 2XPEA 6GSSA 2D2ZA 1XW9A 3N9JA 3AY8A 3EMPA 4XS4A 4N30A 4ZBAA 14GSA 4EE0A 1Y25A 2X8GA 4KA0A 4ZILA 4BWQA 3GN3A 4BL7A 1YEPA 1Z6NA 3NOFA 2HT9A 1S3DA 2M46A 2CVDA 4KAEA 1SK2A 4L0WA 1Z6MA 5GAND 1ACVA 2FY6A 2MBTA 4POBA 5EPFA 1T8EB 3APQA 3VPQA 3TKRA 3UBLA 3FY7A 22GSA 2L6CA 2HZEA 4O5RA 2PVOC 1K0NA 2R5GA 4ZB9A 4MMMA 1SJ6A 2G0FA 4NV5A 1A0FA 3LG6A 5ECNB 3GRXA 4HDEA 3F6FA 3PGTA 2C3TA 3TUEA 1OC9B 2CAIA 2F8AA 2HZFA 3ERFA 4MCUA 4KSOA 3HVXA 4OFTA 2GQKA 5JWOB 3HDCA 4YAVA 2BTOT 2IIYA 1OYJA 4K8MA 4TOPA 5KN2A 1ZOFA 2N5FA 3KGKA 3LQ7A 1I9DA 1R7HA 5D9WA 2VL9A 2LRNA 5INYA 4K7NA 4PGTA 2ON7A 3HZ8A 4EL1A 2YOIA 1PL2A 2DJJA 2GQMA 2NTOA 1Z5YE 5E59A 4XRDA 3IRAA 1TRWA 4KW6A 4JE1A 1MTCA 4JRRA 3D4TA 1K0MA 1JLWA 5CREA 2MZCA 4GSTA 2CV4A 3HD5A 3GKNA 3MSZA 2PU9C 2JU5A 3GFKA 1A8LA 5IMCA 3IAM2 3WYWA 1QQ2A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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