1TUUA

Acetate kinase crystallized with atpgs
Total Genus 135
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
135
sequence length
399
structure length
399
Chain Sequence
MKVLVINAGSSSLKYQLIDMTNESALAVGLCERIGIDNSIITQKKFDGKKLEKLTDLPTHKDALEEVVKALTDDEFGVIKDMGEINAVGHRVVHGGEKFTTSALYDEGVEKAIKDCFELAPLHNPPNMMGISACAEIMPGTPMVIVFDTAFHQTMPPYAYMYALPYDLYEKHGVRKYGFHGTSHKYVAERAALMLGKPAEETKIITCHLGNGSSITAVEGGKSVETSMGFTPLEGLAMGTRCGSIDPAIVPFLMEKEGLTTREIDTLMNKKSGVLGVSGLSNDFRDLDEAASKGNRKAELALEIFAYKVKKFIGEYSAVLNGADAVVFTAGIGENSASIRKRILTGLDGIGIKIDDEKNKIRGQEIDISTPDAKVRVFVIPTNEELAIARETKEIVETE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transferase
source organism Methanosarcina thermophila
publication title Structural and kinetic analyses of arginine residues in the active site of the acetate kinase from Methanosarcina thermophila.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Acetate kinase
total genus 135
structure length 399
sequence length 399
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.2.1: Acetate kinase.
pdb deposition date 2004-06-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00871 Acetate_kinase Acetokinase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1tuuA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1tuuA02
1NGJA 1T6DA 2Q0UA 3VESA 4MLHA 1XUPO 5FPNA 2FSNA 3GL1A 2ITMA 3B8AX 3I33A 4L3QA 4MO5A 4BRCA 2WUSA 3VGMA 4FWMA 2QWRA 4GY2B 3U4LA 4WQ5A 4K41A 4WQ5C 4EIAA 1K8KA 4FO0A 2YI1A 4H0OA 3DXKB 4BRIA 4CZIA 5TKYA 4K42A 1WOQA 3MCPA 3WQTA 5KPZA 3J8AA 3QBWA 1ATSA 4E1JA 3IMXA 3MMVA 1SZ2A 2CH6A 3UKUB 4BGAA 2Q36A 3FFKB 1NBWA 2A41A 2IVPA 3UB5A 4BRQA 1NGFA 3LDQA 1NLVA 2BTFA 2P9IA 1DGKN 1TYQB 4JD2B 5AQZA 3OHRA 3CERA 2QW9A 4FWOA 3D2EA 4EHTA 5AQVA 4BR4A 3EN9A 3WUHA 4XH4A 1HKGA 4IWVA 3U8XA 3AY9A 4RCHA 1JCFA 1KAXA 1SQKA 3WXKA 3L6QA 5BRHA 1KAZA 2A42A 4RWTA 4CD1A 4DHYA 4FPBA 2W41A 3DXKA 5AQFA 4M7YA 4ISFA 4BRGA 4BRMA 3VEOA 3BF1A 3UKUA 4EFHA 4BR2A 4B1UB 3HI0A 1HJOA 1ZC6A 5BRFA 4M63C 4XH5A 1KXPA 1BDGA 4BC5A 4BREA 1TYQA 1P8ZA 2E20A 4DQ8A 3VEXA 3VF6A 1RDWX 3CIPA 3FZKA 3CHWA 4H03B 2W40A 3O6WA 1NGDA 1T44A 2Q31A 4BR0A 3A5OC 3H6EA 4CBUA 2VYPA 3HBTA 3U9ZA 2E1ZA 4AM6A 3MDQA 2D0PA 2CGJA 5EY4A 4BQLA 3H3NO 3QFPA 4J8FA 2QWLA 3RSEA 5AQOA 2A6AA 3VF2A 4BRPA 3IDHA 4FWRA 4DCHA 3A8YA 4BR9A 3CJAA 3LM9A 4FWLA 1U2VA 3WEEB 1G99A 3SJHA 3FR0A 2E2PA 3SMSA 1E4GT 4YDUA 1V4TA 3LDLA 4LC9B 3O1BA 3WXJA 1HUXA 4WQ4C 1GLFO 3BF3A 4BRKA 4QS9A 5LY3A 1HPMA 1NGBA 1S3XA 3SLCA 3ZEUB 5E26A 1NGAA 4H5RA 3CJ9A 3R6MA 4O5FA 3EZWA 3CJ1A 4BG8A 5AQJA 3O8MA 1RFQA 5AZIB 3DXMA 3TPQA 4Z94A 4KBOA 3QFUA 1NGIA 4CD3A 3DJCA 4FL9A 1GLDG 4EAHD 1MDUB 3FZFA 4IJNA 1R59O 4MLEA 1TUUA 3ZETA 2NLXA 2IVOA 4QS8A 2P9PA 4BC4A 3HSCA 1MA9B 4CZGA 2V7ZA 1MWKA 4QS7A 4FWSA 3IFRA 1C0GA 5BR9A 4NB4A 5E84A 2D4WA 3M3ZA 2Q97A 2HF3A 3L4IA 4Y0WA 4A61A 3LM2A 1BA0A 1LCUA 1YUWA 3A5NC 1OKJA 3ZEUA 3CJCA 3FE1A 3SK3A 1SAZA 2P9KB 3MN6A 4B1WB 2ZGZA 3UE5A 1BOTO 5JLFA 3JS6A 4CZHA 3G25A 2QWPA 3VENA 2A40A 2E2QA 2UYTA 2E2OA 3GOIA 3H1QA 2H3GX 3L0QA 1JCGA 2P9UB 2Q2RA 3W3DA 4MO4A 4I6MB 1QHAA 3KZBA 5JICA 3EO3A 5ADXA 3GBTA 3O1WA 2NZTA 3MN7A 1EQYA 4IO8A 3TU5A 1V4SA 4HTLA 5AQQA 5AQSA 2FXUA 4RTFD 1DEJA 4JHDB 2YHXA 4JAXA 5F0XA 5AZJB 1GLBG 4B1ZA 3EL2A 5ADXH 3UKRB 2VCPA 4JD2A 5AQUA 4CZKA 2P9KA 5KQDA 5AR0A 4NO7A 3SMPA 4K43A 3R9PA 4FWKA 4H5VA 4FPAA 4FWQA 2QWOA 1BA1A 3QB0A 2E2NA 4PKGA 4HWIA 2DPNA 4XH1A 5AQLA 5AQYA 2GUPA 5FPDA 4CBWA 1D4XA 1C0FA 5EXWA 4BR5A 2YHYA 5AQIA 3VEYA 2D1KA 3VGLA 3D2FB 4A2BA 3BEXA 4I6MA 4CJ7A 4BRNA 3HM8A 2FLOA 3VOVA 4FWPA 2FF6A 1MWMA 5BPLA 3HZ6A 4IXCA 4ISEA 4JN4A 5AQMA 5AQKA 2I7NA 5AQNA 4JHDA 2P9NB 2CGKA 1IG8A 3O08A 1LOTB 3HTVA 5BPNA 4H5NA 5AZJA 4BROA 5AFUA 3UKRA 4BGBA 2ASPA 4YDUC 3U9DA 2PBDA 3GDQA 4BRAA 3ZX3A 5AQPA 4B9QA 1X3MA 3FZLA 4WYBA 4BG9A 1YXQA 3FZHA 4FOEA 5AFUH 2ZF5O 1NGHA 2BUPA 3MN9A 3DAWA 1BU6O 1K8KB 4B1YB 1HKCA 2Q1NA 3FLCO 3H3OB 5F1XA 1QQNA 3CETA 3W0LA 4JNEA 3QICA 3GG4A 1GLLO 3CJ7A 1Y64A 4CZFA 1QQMA 2P9IB 2CGLA 3H46O 2E8AA 4IZ9A 3O5BA 3AAQA 1NWKA 5AQXA 1T6CA 1QZ6A 4H0YB 3WEEA 2J4RA 3WXLA 3VGKA 4IJAA 3AAPA 5LJVA 1NGGA 3LDPA 3ULEB 4B1VA 5KPRA 3VF4A 4PL8A 5FPEA 4EHUA 3D7EO 5B8HA 1GLCG 1U6ZA 2QWQA 3KHYA 1CZAN 1HKBA 4XEIA 3CQYA 1X9JA 2CH5A 4H0XB 2A5XA 5F2RA 5AZIA 2ASOA 2HF4A 4H5WA 4H5TA 4FSVA 3CI5A 3VETA 1X3NA 4BRHA 1NMDA 2F9WA 2YJFA 4CZEA 1ESVA 3VPZA 2GELA 1RGIA 2KHOA 3ENHA 5AQHA 5BPMA 3C0BA 4CBXA 3C7NB 1WUAA 3ENOA 2IIRA 1H1VA 1Z6RA 2AP1A 4H0TB 5ELZA 4BC2A 5BN8A 4O8KA 4CZJA 3WT0A 3GE1A 1NGEA 4K25A 4AM7A 3EKSA 3ZX0A 2GEMA 1GLAG 1Z05A 4H0PA 3ULEA 3VERA 2GTDA 5EOYA 4BVPA 2IVNA 2YHWA 3ATUA 3FZMA 4ISGA 1ATRA 2V51B 3ATVA 3A5MC 2ZGYA 2I7PA 3MK6A 2P9SB 3BUZB 2NRHA 3QMLA 4BRFA 2QWMA 4FWNA 1E4FT 2E88A 3F9MA 2V52B 3KVGA 1GLJO 3H45C 3O4WA 2ZWHA 1YAGA 3RSEB 3LDOA 5JMVA 2V7YA 2F9TA 1BWFO 1ZXOA 5AQWA 1QZ5A 3CJBA 4BC3A 4DB3A 3JXUA 3MN5A 4F9OA 1U2VB 5EX5A 1ATNA 2P9UA 3C7NA 1XQSC 2YJEA 5CE3A 3A0IX 1JCEA 5AQGA 1KAYA 5AQTA 1TUYA 3EKUA 1BO5O 3IUCA 3DWLA 1ZBSA 1GLEG 2OANA 5BN9A 2HMPA 1YVNA 2P9LB 3QDKA 2FSKA 4BRDA 3M6GA 2D0OA 4H0VB 2AA4A 1HX1A 4M7XA 4C23A 4BVOA 5AQRA 2Q0RA 4CZMA 3VEWA 2P9SA 5BREA 1HLUA 4A62A 4FOIA 3VEZA 2QM1A 1NM1A 3DXMB 5BRDA 4B1XB 1S22A 3ZX2A 4BRLA 5I9EB 5FPMA 2FSJA 3FGUA 4PKIA 3P4IA 1BG3A 5JLHA 5LJWA 2GWKA 2E1YA 1NGCA 1QQOA 4CZLA 1XC3A 2A3ZA 2EWSA 5KQ8A 2GWJA 3LL3A 1DKGD 3ZETB 2P9PB 3QBXA 3M1FA 3R8EA 3CQXA 3D2FA 4BR7A 2YCHA 1BUPA 3O80A 4PL7A 1IJJA 3ID8A 2FF3B 1J6ZA 5KPTA 2VWBA 3H1VX 4WQ4A 3I8BA 4A2AA 3S41A 3WXIA 2P9NA 4PKHA 4CI6A 5EVZA 2QXLA 3WQUA 4GNIA 2P9LA 2QWNA 3A5LC 3D2EB 3AARA 3LDNA 3BP8A 2PAVA 3VEVA 2ASMA 4BQZA 1Q18A 2HOEA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1VQ8N 1T6DA 2Q0UA 4MLHA 4AHSA 5LL6Z 2FSNA 3GL1A 4I9LA 3B8AX 3I33A 4E89A 4BRCA 1LWEA 4OGEA 3Q7BA 4K41A 4EIAA 1K8KA 4W5NA 4H0OA 5TKYA 3N4QA 3PLAA 4E1JA 1NK7A 2OTJN 3IMXA 3SBTA 4DV4K 1NBWA 2RKIA 1NGFA 3NMUA 3E66A 1DGKN 3SYZA 1GOAA 1L3SA 5AQVA 4DTNA 4DSJA 2OPSA 1KAXA 1RT7A 1TK5A 3KTQA 4BE2A 3L6QA 2W6KA 1C1BA 1N34K 3AVLA 1KAZA 3CM6A 2A42A 1EXQA 5C2DA 4ICLA 4FW1A 4O5BA 4BRMA 3BF1A 4GW6A 3HI0A 3NAEA 3SCXA 1C6VA 3LPUA 1RT6A 4M63C 1C0UA 1GOCA 2E20A 4CFBA 1YTUA 3MECA 4CF9A 4DQ8A 4CCHA 1QSSA 3OY9A 2E6LA 3CIPA 3FZKA 3VMFB 1VSIA 3CHWA 4CHQA 3SQ1A 3I56N 3WNEA 1T7PA 4DLGA 2VYPA 1EP4A 3BY5A 1SL1A 1VSLA 2YHAA 2CGJA 4BQLA 3U3YA 2YNIA 4DV1K 3H3NO 1VHXA 4KB1A 3O9RA 2A6AA 1S6PA 4KTWA 2OYQA 4H4OA 3IDHA 3QNNA 3WNGA 5DMRA 1SKRA 2DFHA 4KHQA 2YKNA 5HROA 3LM9A 1U47A 4I2PA 3K9KA 2GV9A 4JK9A 3FR0A 2E2PA 4KH6A 1E4GT 2D0BA 5T7BA 4M3ZA 1WAJA 4K0KK 4WQ4C 3BF3A 4QS9A 4GV6A 4OKKA 3BZCA 4ILHA 1FXXA 5HRSA 1P90A 2XRIA 1YJ9N 5E26A 2ATQA 1NGAA 5HL7L 3CJ9A 3ZT1A 4AILC 1NKCA 4O5FA 3I0RA 4BG8A 1I39A 1VSDA 1IO2A 5KTQA 3OBWA 1ZBHA 4LSNA 4OGCA 3ULDA 4IOXA 5A2QO 1RT5A 4FL9A 4B9NA 4PUOA 1TKDA 4BACA 2IVOA 4CF2A 2FBTA 1MA9B 2OPQA 1VQON 3ZSQA 1KD1O 3AVGA 3VQ7A 4H8KA 1VSHA 3M3ZA 3VQ4A 2WTUA 2PZSA 2ITGA 3KD5E 4FLTA 1LCUA 4CEOA 4M3XA 1YUWA 3A5NC 1SUQA 2Y1IA 4C8NA 3SK3A 4CEQA 1SAZA 4Y1DA 1U48A 3SV4A 4CZHA 4JI7K 4N76A 1O13A 3PV8A 1UWBA 4GV9A 3VENA 4JEPA 4OX9K 4DR7K 2UYTA 3F9KA 1FK9A 3J7YP 4IO9L 4CJFA 4OLBA 1JCGA 3RMCA 3GBTA 1JXEA 3O1WA 4ELTA 1EQYA 4Z4FA 5AQSA 4OPKA 1DEJA 4CEDA 4DV5K 2YHXA 4DFMA 1QVFM 4B1ZA 5AQUA 2HHVA 2ZE2A 4CZKA 3SAGA 1KC8O 3NVKA 3QEWA 1NNEA 1JKHA 4DTUA 4CHZA 2QWOA 4CFAA 4HWIA 5AQLA 5FPDA 5GAEP 4YOTA 1VQ7N 1I94K 2HNYA 2YHYA 1RTDA 4BRNA 1NK0A 3ZSZA 3HM8A 4FZZA 2FLOA 2O8CB 4FWPA 2FF6A 3HM9A 4KHNA 4X66K 5AQMA 4WFNL 1W7AA 4YY3K 4F4KA 3HTVA 5KRSA 5AZJA 1BQMA 3THXA 4CGGA 3CFPA 3V6DA 1K8AO 5C25A 3LZJA 2VGNA 4WFAL 4B9TA 3HXMA 1JLEA 3R1XA 3ZX3A 3AGKA 1RDBA 4R5PA 4X64K 4JI3K 4YOYA 3KK1A 4WYBA 4BG9A 1YXQA 3FZHA 1S72N 1A5WA 3V1RA 1NGHA 3VQEA 1NK6A 3RR8A 3QERA 1BU6O 2ZQBA 4DTXA 2Q1NA 4DR5K 5LMUK 1QQNA 4KH5A 3CETA 3OYKA 2O4GA 4FJJA 1K73O 4C1NI 4A5AA 1X9WA 4CZFA 4JKAA 2O8EB 1NKBA 2W6LA 1KRPA 1T03A 1S1TA 3AAQA 5AQXA 1O1WA 4DKWA 3WEEA 1HPZA 1RTJA 4CJ3A 2HBJA 1NGGA 3AVBA 4B1VA 4F3TA 1K6YA 2QEXN 4CHNA 1TKXA 3ZYYX 4EP4A 2JWLA 3DRRA 3KWGA 1GLCG 1LWCA 3AVKA 1X9SA 3C6AA 1IBKK 4DTRA 3HK2A 2HF4A 1RT4A 3OVNA 1U45A 3HRGA 4FSVA 1OVYA 4CEFA 1DTQA 1NMDA 2F9WA 3K5NA 4CZEA 5AQHA 3ENHA 3PUFA 4IFEA 3B6PA 4NCAA 1HQUA 3ALYA 3LALA 3ENOA 4H0TB 4YOXA 1VQNN 4O8KA 4CECA 3GE1A 4MDBA 1HRHA 2GEMA 3LAKA 4DSEA 3DOLA 2YHWA 4NCGA 3FZMA 2V51B 4DTJA 3RR7A 2Z1GA 1YVUA 3QMLA 4JKGA 4BRFA 5CZ1A 2QWMA 4FWNA 5M1KA 3VQDA 4K8ZA 3H45C 4DUZK 3MWTA 3TAQA 1YAGA 3RWUA 3DRPA 3LDOA 2NRZA 2V7YA 4AHCA 4X65K 3V81A 4PWDA 4BC3A 3RRHA 3L8BA 1X9MA 1Q81O 3JXUA 3MN5A 5C15A 1U2VB 1NG9A 1ATNA 2P9UA 1WSGA 1XQSC 2YJEA 3A0IX 2HHWA 4DQSA 5AQGA 3I55N 1KAYA 1E3MA 3WNFA 5AQTA 4DR4K 4JI8K 1S1VA 1BGXT 1GLEG 3K59A 1TVRA 4CFCA 1YVNA 1J54A 2FSKA 3DM2A 3SUOA 3M6GA 4H0VB 2XO7A 4BVOA 2NRRA 3HPHA 2OCEA 5BREA 3OBYA 4E19A 3DXMB 5GIPA 3JAMO 5I9EB 2JLEA 5FPMA 4PKIA 5LJWA 1QQCA 2E1YA 1NGCA 3HSTB 1QQOA 4CZLA 3CFOA 3J7AP 3HO1A 3L4QA 3LL3A 4CFDA 5JVHL 4BR7A 3DLBA 1SS6A 3O80A 1IJJA 3ID8A 3I8BA 3ZSVA 3CMAN 4G9ZA 4AH9A 5HRPA 1BI4B 1W2BM 1TAQA 2P9NA 4LH5A 3JYTA 2P9LA 3TSPA 3D2EB 3Q7CA 1ZBFA 1TGOA 3LP1A 4BQZA 3EE8A 4BDZA 4PQUA 1ASVA 3G10A 1NGJA 3AO1A 3VESA 3LP2A 4ZTFA 4HTUA 1ITGA 1REVA 3VQPA 2ITMA 2O8FA 3VTHA 1OH6A 4FWMA 3U4LA 1K9MO 5TKWA 2E5LK 1OH5A 3DLLL 4FO0A 2OPRA 4BRIA 3K2PA 4CZIA 4K42A 1WOQA 1CXUA 3TANA 3J8AA 3QBWA 4F3OA 2CH6A 4CF0A 3UKUB 1S5JA 1XHXA 2Q36A 3FFKB 4B8CA 3L2RA 4GVEA 2ZJQL 2P9IA 3HOTA 1TYQB 4OVLA 3MXJA 3QLHA 4JD2B 4BWMA 5AQZA 3VA3A 1FW6A 4FLYA 2HHSA 1YITN 4KB0A 3AY9A 5CZ2A 1ZBUA 3M8RA 2X6NA 1EWRA 4RWTA 5KRTA 4CD1A 5J2QA 1TAUA 1Y97A 4O0JA 1RTHA 2GBZA 1NK9A 4CGHA 4DWIA 2YNFA 2D0CA 3DOKA 3MEGA 4GKKK 3CG7A 4CJEA 4EFHA 4B1UB 1XMQK 3PIPL 1VQPN 5CHIA 1HJOA 1ZC6A 4XH5A 4OO1J 4FM1A 1DLOA 3E01A 3NVMA 3CC2N 4OKEA 1RDWX 3DLHA 4H03B 4B3SK 1T44A 4DV6K 4FVMA 4YOWA 4BR0A 3HP6A 3NH1A 3TAEA 5DM7L 2BANA 3ZT0A 4WF9L 4CBUA 1D5AA 3SBGA 4NCBA 3LAMA 2NRTA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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