1TUUA

Acetate kinase crystallized with atpgs
Total Genus 135
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
135
sequence length
399
structure length
399
Chain Sequence
MKVLVINAGSSSLKYQLIDMTNESALAVGLCERIGIDNSIITQKKFDGKKLEKLTDLPTHKDALEEVVKALTDDEFGVIKDMGEINAVGHRVVHGGEKFTTSALYDEGVEKAIKDCFELAPLHNPPNMMGISACAEIMPGTPMVIVFDTAFHQTMPPYAYMYALPYDLYEKHGVRKYGFHGTSHKYVAERAALMLGKPAEETKIITCHLGNGSSITAVEGGKSVETSMGFTPLEGLAMGTRCGSIDPAIVPFLMEKEGLTTREIDTLMNKKSGVLGVSGLSNDFRDLDEAASKGNRKAELALEIFAYKVKKFIGEYSAVLNGADAVVFTAGIGENSASIRKRILTGLDGIGIKIDDEKNKIRGQEIDISTPDAKVRVFVIPTNEELAIARETKEIVETE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural and kinetic analyses of arginine residues in the active site of the acetate kinase from Methanosarcina thermophila.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase
source organism Methanosarcina thermophila
molecule keywords Acetate kinase
total genus 135
structure length 399
sequence length 399
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.2.1: Acetate kinase.
pdb deposition date 2004-06-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00871 Acetate_kinase Acetokinase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1tuuA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1tuuA02
4H5VA 4BR7A 4EFHA 4BRIA 2AP1A 2P9PA 4BREA 3EKUA 2D0OA 3ID8A 3HZ6A 3U4LA 1V4SA 2FSNA 1Y64A 3QBXA 5AZJA 3ENOA 1BU6O 4HTLA 4AM7A 4MO5A 4BRQA 1TYQB 3SLCA 2WUSA 2QWOA 2QXLA 1YVNA 4BR5A 3MK6A 3O6WA 4BQLA 3QMLA 2F9TA 3FZHA 2F9WA 3H45C 1G99A 3ULEA 5JLFA 3SJHA 2UYTA 3B8AX 3IMXA 2OANA 3WXJA 3SMSA 1SQKA 1E4GT 3A0IX 1BG3A 5BN8A 1QQMA 1GLFO 4BG9A 2Q0UA 4GY2B 2YHWA 4QS9A 3WXKA 4FWRA 3CJCA 3G25A 3C7NA 3TPQA 2CGLA 4FPAA 4JHDA 2ITMA 2CH5A 4YDUA 1X3NA 4DCHA 5ELZA 4O8KA 1YUWA 1MA9B 3FE1A 4PL8A 2J4RA 3QB0A 1BWFO 3UKRB 3DJCA 4B1WB 5FPEA 5EOYA 3VEOA 4WYBA 4CZEA 1BDGA 2E2NA 3LDQA 4B1YB 4M63C 5AQHA 2P9LA 4EHUA 3WXIA 2Q36A 4CZLA 3F9MA 1XC3A 4H5TA 5LY3A 4BRKA 4CZGA 1C0GA 5E84A 4Z94A 3FZLA 4CZJA 3MN5A 3RSEA 2Q31A 3ZX2A 4PKIA 4BC4A 5ADXA 2IVNA 5AFUH 1NLVA 2ZGZA 1NGDA 4JD2B 3VF2A 3LDPA 1HLUA 3D2EA 3GBTA 5F1XA 4K41A 2IVOA 4HWIA 2GUPA 4B1XB 2P9UA 4M7YA 2CGKA 5JMVA 3C7NB 5JLHA 1YXQA 3DWLA 3IUCA 3DXMB 1T6CA 4I6MB 1CZAN 2FXUA 4BRCA 4FWOA 4BVPA 4CZKA 4FOEA 4QS7A 5AQGA 2E88A 4K25A 3GE1A 1MWMA 3HSCA 4K43A 3WQUA 2FF6A 2BTFA 4DQ8A 4BRLA 2HMPA 2P9SA 2PAVA 3CERA 2D4WA 1TYQA 3LL3A 5BR9A 3UE5A 3VF6A 3BUZB 1SAZA 2FF3B 2P9LB 3AAQA 1DKGD 2GEMA 4RWTA 1HUXA 3QDKA 5BRDA 5KQ8A 3VGMA 1HKBA 1U6ZA 2YJEA 3CJBA 5AQYA 3SMPA 4BRHA 4F9OA 1NGEA 3U9DA 3KHYA 3M1FA 4CD3A 4BRFA 4JNEA 3LM2A 1HPMA 4FWSA 4B1VA 1IG8A 3CJ9A 2D0PA 3BP8A 3ATVA 5KQDA 1HX1A 3A5NC 4H5NA 3D2EB 4B1UB 5JICA 2H3GX 3ZX0A 4H0YB 1GLEG 3OHRA 2ZWHA 1BA0A 1SZ2A 2ASOA 1HKCA 4IZ9A 4CBWA 1Z05A 2QWMA 3CQYA 2FLOA 3UKUB 4BGBA 1H1VA 5LJVA 5FPNA 3VETA 3L4IA 3CETA 4C23A 3UKRA 4CZIA 1WOQA 4NB4A 2QWLA 4H0PA 1GLAG 3A5OC 4MLHA 3H3OB 5FPDA 3CJAA 3EL2A 1ATSA 3J8AA 5AQZA 4B9QA 2P9SB 2HF3A 4WQ4C 3O80A 1P8ZA 1GLCG 3AARA 4XH4A 5AQLA 3VEYA 2YI1A 4ISFA 4DHYA 1NGCA 2E1ZA 3H1VX 3MCPA 2V51B 4IXCA 4BRMA 1EQYA 1ESVA 2QM1A 4FWKA 4BROA 3A5MC 4FL9A 3VGLA 4BC2A 1V4TA 4JD2A 1NGGA 1X3MA 2FSKA 2QWNA 4BGAA 1YAGA 2YCHA 3DXMA 2CGJA 4I6MA 4FWNA 2Q1NA 3MN7A 5BRHA 2A5XA 1Z6RA 4A2BA 1IJJA 4EAHD 5AQSA 4H0XB 1NGHA 1J6ZA 5I9EB 5AQFA 3P4IA 3GOIA 4FWQA 5AQWA 4IJNA 2HOEA 3EZWA 1ZBSA 3QFUA 3LM9A 1HJOA 5AZIB 4FWLA 1BO5O 5AQIA 4GNIA 3U8XA 1NM1A 4A2AA 3D2FB 3O08A 2E8AA 4BR4A 4H5WA 3KVGA 4FPBA 3ZEUB 4RCHA 4WQ5A 4BR0A 3CQXA 1NWKA 3R9PA 3IDHA 2NLXA 5AFUA 3U9ZA 2P9NB 3FZMA 3WQTA 4Y0WA 1QQOA 5B8HA 1GLDG 1QZ5A 4BC3A 2FSJA 3DAWA 3MMVA 3W0LA 2A41A 4AM6A 3LDLA 2A3ZA 3ENHA 3UKUA 3L0QA 4EIAA 4BR2A 1D4XA 1JCGA 3UB5A 5AQVA 5BREA 2YHXA 2A42A 1XQSC 1JCEA 3O1BA 5BN9A 1NBWA 3AY9A 3MDQA 2P9IA 4NO7A 4FWMA 1OKJA 1T44A 1ZC6A 2QWPA 3ZETA 4ISEA 3H1QA 4M7XA 4BRDA 3VESA 4O5FA 2P9KB 1QQNA 5AQUA 4H0TB 4BRNA 3I33A 5TKYA 4IJAA 3WT0A 3ATUA 3HM8A 1LCUA 4L3QA 4YDUC 3MN6A 1BA1A 5AQMA 4IO8A 2QW9A 2HF4A 3H6EA 4H03B 3CHWA 2ASPA 4BC5A 3L6QA 1S3XA 3HTVA 3VEZA 2DPNA 2A6AA 1MWKA 2W40A 3GG4A 3I8BA 4LC9B 1KAXA 5BPMA 4ISGA 1NMDA 1ATNA 4BQZA 3CIPA 2VWBA 1U2VB 1KXPA 3AAPA 5AZIA 2P9IB 3GDQA 2A40A 3HI0A 1NGFA 4K42A 3SK3A 3ZETB 5LJWA 1RDWX 3VEXA 3VPZA 3D2FA 1T6DA 4CBXA 1JCFA 2IIRA 4E1JA 1MDUB 4BRPA 4QS8A 1E4FT 3A8YA 3ZEUA 4PKGA 2NZTA 1R59O 4FO0A 4IWVA 2E2OA 2EWSA 2CH6A 2E2QA 5F0XA 2P9NA 3QICA 3JS6A 3VEWA 5KPRA 3EO3A 2ASMA 5AQTA 3W3DA 2W41A 3VOVA 2Q97A 2V7ZA 5AQJA 3QBWA 3BEXA 1LOTB 3C0BA 4JN4A 3R6MA 1K8KB 3FGUA 3TU5A 3VF4A 3O4WA 3ZX3A 2GTDA 2Q0RA 1QZ6A 1C0FA 1TUUA 3S41A 4CD1A 2P9KA 3R8EA 3H3NO 4CJ7A 2E1YA 2I7NA 3FLCO 2D1KA 2KHOA 2V52B 3KZBA 5BRFA 2PBDA 4J8FA 1HKGA 4A62A 3CJ7A 3M6GA 3DXKB 5AQPA 4FOIA 5AQOA 4BR9A 4XH1A 3QFPA 1GLJO 3FZFA 2P9PB 1GLLO 2QWQA 3MN9A 3EN9A 4RTFD 2VCPA 3WUHA 1NGBA 1NGIA 3FR0A 3JXUA 2E2PA 3CI5A 1NGAA 4BG8A 3WEEA 5AZJB 1BOTO 2BUPA 4BRAA 3GL1A 4CI6A 2NRHA 2GELA 4JAXA 4H5RA 1KAZA 5KPZA 4MO4A 1Q18A 3BF1A 2YHYA 5CE3A 1ZXOA 5AQKA 1RGIA 3ULEB 3FZKA 4XEIA 1RFQA 5ADXH 4H0VB 4WQ4A 4BRGA 1U2VA 3WXLA 3A5LC 2YJFA 4CZFA 4PL7A 5EXWA 1S22A 4MLEA 3D7EO 2GWKA 1XUPO 3O8MA 1QHAA 2ZGYA 4BVOA 1X9JA 1GLBG 4DB3A 5KPTA 3H46O 4XH5A 3VGKA 4JHDB 1ATRA 2V7YA 3HBTA 1NGJA 3O5BA 5AQNA 2ZF5O 3VERA 4CZHA 2E20A 3LDOA 5BPNA 5AQQA 3LDNA 5AQXA 1WUAA 5EVZA 5F2RA 3BF3A 3VENA 2I7PA 5EX5A 2IVPA 2GWJA 1TUYA 1DGKN 3FFKB 5EY4A 4A61A 3WEEB 1DEJA 2VYPA 4KBOA 2Q2RA 4CBUA 1K8KA 3VEVA 5FPMA 5AR0A 4H0OA 5E26A 1BUPA 4FWPA 2AA4A 4EHTA 3RSEB 3O1WA 5AQRA 4PKHA 3M3ZA 3CJ1A 3IFRA 5BPLA 4FSVA 4WQ5C 4CZMA 3EKSA 2QWRA 2P9UB 3DXKA 1KAYA 4B1ZA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4JLHA 3WNEA 4H5VA 4DR7K 5IT9O 1XC9A 2P9PA 3BZCA 1L3SA 3J7YP 3CFPA 1RT5A 3VQPA 4FJ9A 4CEQA 3L3VA 5J1EA 1V4SA 1NJWA 3QBXA 5AZJA 4JKGA 3HL8A 3SAGA 4FLWA 1X9WA 4LY7A 4BRQA 1TYQB 2WUSA 2QWOA 1YVNA 3MXIA 5C24A 3QMLA 4DLGA 3FZHA 2F9WA 3ULEA 1LAWA 4PY5A 4CHOA 1SQKA 3P1GA 1BG3A 1YITN 5BN8A 4LF8K 4BG9A 1NJIO 1N36K 2YHWA 4K0KK 4QS9A 3NDKA 2YKMA 4CF1A 3CJCA 1LWFA 3M8PA 4JHDA 1JL1A 3HVTA 3T3FA 4DCHA 3OBWA 3PIPL 5ELZA 5HLFA 3G0ZA 3MX5A 2VG6A 3V9ZA 4E19A 1NK0A 4B1WB 1EO1A 2IDOA 1BDGA 5BR8K 2E2NA 1JKHA 4B1YB 4CJFA 3AVIA 4Q5VA 1FK9A 2Q36A 1XC3A 2OPQA 3T19A 4YHHK 3KLIA 2O4IA 3RSEA 4KFBA 3I0SA 3ZX2A 4PKIA 4BC4A 3VA0A 2R7YA 2D0BA 4X66K 4IFYA 1KSPA 4KTWA 3L8BA 1QSYA 4HWIA 4C8LA 1QHTA 4GMJB 2P9UA 4M7YA 4DTMA 2CGKA 4F8RA 3P83D 5JLHA 2VQFK 1ASUA 1T6CA 2FXUA 4DTXA 3ZSOA 3EE9A 4BRCA 4HVJA 4I7FA 4ELUA 4FOEA 4IOAL 4JS4A 3HOTA 3L3UA 4AH9A 2PAVA 3WXMB 3OYJA 3UE5A 1WN7A 4GV3A 5KGWA 4E0DA 3NGZA 3OYMA 1U6ZA 4MDAA 3SMPA 3THVA 4F9OA 3U9DA 4CEOA 4DQRA 3M1FA 3ZT3A 4BRFA 1VAZA 1KCFA 4FWSA 5KQDA 3ATVA 4ICLA 2G8HA 4H0YB 4DUYK 1S1UA 5CYMA 4FCYA 2HHTA 3CXCM 1BA0A 2ASOA 4IZ9A 1S6PA 1Z05A 3G4SN 1KTQA 2FLOA 5GINA 1C0MA 4CF9A 4DQPA 2QK9A 3CETA 4C23A 4FJNA 5J2NA 4NB4A 2QWLA 1P90A 3O9SA 3RMCA 1U47A 1QE1A 3J8AA 4B9QA 1C1CA 1WSIA 1JXEA 2P9SB 3QEXA 2HF3A 4XH4A 5AQLA 3DLKA 4CJEA 1X1PA 3SUPA 3CM6A 5LMNK 1RDAA 4LH5A 4IXCA 5KRSA 2QM1A 1NJXA 4DFJA 3R3LA 3C94A 2QWNA 5HP1A 1NK8A 2CGJA 1FJGK 4I6MA 1N6QA 2KFZA 3MN7A 1HPZA 2A5XA 4H4MA 3CC4N 1IJJA 3M8QA 4H0XB 4E89A 4QOZB 1J6ZA 3QETA 5AQFA 4FJKA 1JLQA 5AQWA 2HOEA 4NXMK 4PQUA 3QFUA 3DRRA 1HJOA 4LF6K 1XNQK 5CZ1A 4FWLA 2YKNA 2WOMA 3T69A 1RT3A 4A2AA 4F2RA 4BR4A 3F5TA 2NRTA 4LH4A 1LWCA 1O1WA 4FW2A 3LWLA 1NKBA 4J2EA 1TL3A 4WQ5A 4DV5K 3IDHA 5AFUA 2VG7A 4OGCA 2D0AA 2P9NB 3WQTA 1VQNN 1J9AA 4EP4A 3MMVA 4AM6A 3LDLA 2A3ZA 5GAEP 4EIAA 2Q3SA 2VQEK 2GUIA 1CZ9A 4ELVA 2YHXA 2UXCK 2A42A 3N4QA 3AY9A 2HHUA 4NO7A 4DSFA 4FWMA 2YV0X 2BDPA 3QIOA 1OKJA 1T44A 3AA5X 2GV9A 2ZJQL 4BRNA 1EKEA 1RT4A 2ZE2A 5J2QA 4IOCL 3WT0A 3ATUA 3HM8A 3RTVA 4WFAL 2O8DA 3CFOA 1IKXA 1U45A 1K6YA 5AQMA 4YOWA 4CEZA 4JI1K 3DYAA 4CF2A 1S3XA 4F2SA 3NH1A 4DSJA 1JJ2M 1MWKA 3GG4A 3I8BA 1Q9YA 1VQ7N 3AVBA 2NUBA 3HOSA 1VSFA 2FBXA 1ATNA 1OH6A 4CHZA 3AAPA 1U2VB 1L3TA 4DUZK 4Z0UA 3GDQA 1NGFA 3ZETB 3CF5L 1TKXA 1RDWX 3VEXA 3VPZA 4CBXA 1VQ6N 2HBKA 1JLBA 4QS8A 3LPUA 4IEEA 1E4FT 4ID5A 2O8FA 3CCUN 4DTRA 3O3FA 4FO0A 1C6VA 3HXMA 2E2QA 1VRTA 2QXFA 3CCMN 3VEWA 5KPRA 3EO3A 3IAYA 4JI8K 2ASMA 4FK0A 1JLEA 4FJ5A 2W41A 1FXXA 1BQMA 1NOYA 2Q97A 3LALA 3QBWA 4H8KA 1NNEA 3BEXA 3CCVN 4JN4A 3PX6A 4F3OA 2YNIA 4MQ3A 1TUUA 3S41A 4A5AA 4LFBK 1Z25A 3R8EA 4CJ7A 2I7NA 4EZ9A 3CYMA 3CM5A 3D6RA 2PBDA 1QSLA 3AO5A 1VQ5N 4CJQA 4XH1A 4FJJA 3PUFA 2P9PB 2O8EB 1QVGM 2VGMA 4RTFD 3EN9A 2VCPA 4HUGA 4OGEA 3WUHA 3BY5A 3JXUA 3C6HA 2E2PA 1NGAA 5FROA 2YNGA 3TAMA 4FM0A 4BG8A 1JLCA 1RT2A 5AZJB 4BRAA 5AJ3K 2GELA 4H5RA 3P38A 4B9TA 3O4QA 3ULEB 3ZCMA 1WSHA 4LFAK 1RFQA 5HROA 4DS5A 4NLBA 4AF1A 3KD5E 4X64K 4Y1DA 3CCRN 4MFBA 2D0CA 2UXBK 5EXWA 4X62K 1XUPO 1GLBG 2RPIA 3ZSVA 4JHDB 4JKHA 1ZBUA 5C2FA 2ZF5O 3LZJA 3CCLN 2E20A 4JEPA 3LDNA 4N41A 4LSLA 3BF3A 5F2RA 2I7PA 1X9SA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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