The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
26
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sequence length |
106
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structure length |
106
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Chain Sequence |
b'AYRALMVLRMDPADAEHVAAAFAEHDTTELPLEIGVRRRVLFRFHDLYMHLIEADDDIMERLYQARSHPLFQEVNERVGQYLTPYAQDWEELKDSKAEVFYSWTAP'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Structural and functional analysis of tetracenomycin F2 cyclase from Streptomyces glaucescens. A type II polyketide cyclase.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Tetracenomycin polyketide synthesis protein tcmI
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| source organism |
Streptomyces glaucescens
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| molecule tags |
Unknown function
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| total genus |
26
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| structure length |
106
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| sequence length |
106
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| ec nomenclature |
ec
4.2.1.154: Tetracenomycin F2 cyclase. |
| pdb deposition date | 2004-06-25 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF04673 | Cyclase_polyket | Polyketide synthesis cyclase |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | 2-Layer Sandwich | Alpha-Beta Plaits | Dimeric alpha+beta barrel. |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1TUW A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1JLG B; 3WHI A; 3L09 A; 4UUW A; 4DV0 J; 1OY8 A; 2LU2 A; 3FBC A; 1SL2 A; 3JQJ A; 3G6E S; 2VBW A; 4P2S A; 5DQH A; 3KXD A; 4WBF A; 3BGF A; 5I42 B; 1IXK A; 3NMR A; 2W7A A; 1JLE B; 3I32 A; 1WC6 A; 3GON A; 4XPE A; 3GCW P; 2MLX A; 3ZNJ 1; 7AT1 B; 1D8Z A; 2HWI A; 2CZV C; 2JLE A; 3FBE A; 3RUB L; 1S6O A; 3PYF A; 1HBO A; 1FNO A; 2CQH A; 4OYI A; 2DIT A; 2OFG X; 1R43 A; 1RTI A; 4HH1 A; 3EE3 A; 5I4M A; 1PYS B; 1YJN S; 2L9N A; 2IM2 A; 3A12 A; 3TVZ A; 1VMB A; 3OJU A; 2IYG A; 4HDG A; 3PX0 A; 2XMU A; 4NCA A; 4Y65 A; 3EX7 B; 1E6V B; 3O44 A; 5C25 A; 1WC3 A; 1AZS B; 2W4D A; 2DGV A; 3OR2 B; 4IFY A; 4PG6 A; 5F8M A; 3I4H X; 2LCW A; 1SH0 A; 1SJR A; 1N36 F; 1WI8 A; 2L41 A; 2XBP A; 2Q66 A; 4RWW A; 3DXB A; 5U47 A; 1VQ4 S; 3ADA C; 4N41 A; 1OYD A; 1T7P A; 2HHU A; 4PYA A; 3SZ2 A; 4IH5 A; 3CDW A; 5KFI A; 4I6W A; 1RT4 A; 3KLG B; 3CJK A; 3ELH A; 3MPD A; 1Q79 A; 1RJJ A; 3RB3 A; 2DR6 A; 1VIS A; 2KYZ A; 1URN A; 1C2P A; 2H4Y B; 3T6J A; 3NGK A; 3LGN A; 5KG0 A; 5J2N A; 2OUG A; 1NBE B; 4F67 A; 2MMY A; 5AXN A; 3DDN A; 1F3F A; 2EVZ A; 2C2M B; 1IKV A; 2VPX B; 4IOB A; 1MWZ A; 4K2J A; 2P6S A; 4ZCK A; 2BJD A; 2E5I A; 2OEK A; 4Q7A A; 4O3N A; 2MQL A; 3BN7 A; 3T41 A; 4LT6 A; 1FFS B; 1B3T A; 3ET6 B; 1RAJ A; 1S9F A; 1RHM B; 3M2V A; 4DV7 F; 1UPP A; 4X65 J; 1RWV B; 1RT6 B; 2ZNZ A; 1VQ7 S; 1RLD A; 1UWB A; 4USK A; 2RNE A; 5JMN A; 3DRR A; 3RAX A; 2AW0 A; 1NJX A; 3GFZ A; 3W64 A; 4X64 J; 4A8Q A; 1LK7 A; 1CJK A; 3MMA B; 3AH6 A; 5GAD I; 1A6L A; 1C4C A; 3M8S A; 2VQF J; 1NZA A; 5C2C A; 4CLS A; 2RKI A; 2ROP A; 4DU7 A; 4QOT A; 2PI4 A; 4WFA Q; 4OJ1 A; 3JQM A; 4LF6 F; 4FS2 A; 3A3N B; 1LEO A; 4KGX B; 2X1G A; 4NLS A; 4P7V A; 3VGV A; 4C0H A; 4I2P B; 4CYU B; 2B43 A; 4JI1 J; 1KS2 A; 2WK4 A; 5KG1 A; 1HNW F; 1B64 A; 5K14 A; 3DOL A; 4MIW A; 3I0S B; 4QYZ K; 3MFH A; 1UFW A; 3VAM A; 3OVA A; 3VAL A; 3JAM U; 2JNJ A; 5A6W A; 3T1H F; 9ATC B; 4X66 J; 3QRR A; 2E66 A; 2HFV A; 3PFO A; 2G0J A; 4C0B A; 5EN1 A; 2QFI A; 4RLE A; 1HQ2 A; 2RHQ B; 3M7V A; 2ACY A; 4WYW A; 2WB4 A; 3DFE A; 3IP0 A; 4AYB D; 5FDL A; 4PWD B; 3UNG C; 2Q43 A; 2BM1 A; 1VRU A; 1WHY A; 4FXV A; 1RA7 A; 1VR6 A; 3K58 A; 5E5N A; 1HBU A; 3J7Y U; 2EFG A; 1N4L A; 2CXE A; 2QRR A; 3M8R A; 2LU1 A; 3F56 A; 4URQ U; 1RU2 A; 1UVN A; 2V8V A; 5C25 B; 2VBY A; 3SV4 A; 4ANC A; 4DG1 B; 1JLC A; 1TEL A; 4TVA B; 1BHN A; 1OJ4 A; 2RD5 C; 3SCL E; 3PYD A; 4G1P A; 4DQI A; 1RAA B; 3KLE B; 4DL6 A; 3QRP A; 2DNM A; 2HZC A; 2G0I A; 4RW7 A; 1YJ9 S; 2CPH A; 3W9I A; 2PA3 A; 3N28 A; 4UZB A; 5KT3 A; 2MHE A; 5ETO A; 2GAG C; 4CIO A; 3GWC A; 4ZK7 M; 1HPZ A; 2WHO A; 4ED2 A; 4UUX A; 2MLY A; 2VUG A; 2ZM6 J; 3V81 A; 4E98 A; 2MQQ A; 1F2G A; 4DL4 A; 3E3X A; 3BEG B; 3M8P A; 3T1Y F; 4DF4 A; 2FHK A; 1VQS A; 3CJK B; 1I1G A; 4J90 A; 1R6Y A; 1U2R A; 4ES3 A; 3U1L A; 4URG A; 2XCA A; 5F3T A; 3TJ8 A; 5J2N B; 2LQ9 A; 2GVZ B; 3B82 A; 2VPZ B; 2QC3 A; 4I67 A; 2Y8W A; 2ZVI A; 1IKV B; 2IJF A; 1JXL A; 3FK4 A; 3KLH A; 5F8H A; 1YJ7 A; 3VQT A; 5KFN A; 3T5L A; 2PA8 D; 1KOO A; 4IG0 A; 4F3O A; 3QBC A; 3M2V B; 3CO0 P; 1WG1 A; 2V9K A; 1ZM9 A; 2MST A; 2MQN A; 4LFC F; 2JJ4 D; 2QL5 B; 2YKQ A; 2UXC F; 1U6Z A; 3DRR B; 4OHX A; 1S1V A; 2DNR A; 4OFZ A; 3S01 A; 4QW8 A; 1CJK B; 1DTT A; 3KUH A; 4EYI B; 4JI0 J; 1C0U A; 2JSX A; 5DM7 Q; 1NM2 A; 5DDR C; 2GVD B; 3UQS A; 3IGV A; 4KFB A; 1NPR A; 1BWV A; 2UVU A; 2RKI B; 1HWJ A; 2B4V A; 3FBF A; 5FLX Y; 2AEM A; 2VON A; 1PJ6 A; 1PAE X; 2JVO A; 1KVI A; 3BBB A; 2ZBR A; 3IG1 B; 2LP4 A; 4DN9 A; 3QGG A; 3K5N A; 5LSL A; 1K9M T; 2YNH A; 3EJM A; 4ZVG A; 4XIU A; 2WCX A; 3EYZ A; 5J1E B; 2GJ2 A; 1XNR J; 2Y1L B; 4IO9 Q; 5AXM A; 2WVC A; 1F60 B; 3MF5 A; 4ITS A; 3TR5 A; 2ZBI A; 1BWE A; 1RTH A; 3MM7 B; 3CDU A; 2KYX A; 1N0U A; 2YNF B; 2GJF A; 3T9N A; 1IVZ A; 1HNI B; 1TL1 B; 3ZTO A; 1TR0 A; 3K5M A; 1FRH A; 1RHQ B; 1AA1 B; 3D68 A; 2FUG 9; 4ZVS B; 1P8G A; 1HBN B; 3E51 A; 2AMC B; 2GQC A; 3DI6 A; 3GG0 A; 5IT9 U; 1HWI A; 2B7B B; 5K9F A; 4QPX A; 4LBP A; 4KH1 B; 1M5S A; 2DRA A; 2DEI A; 2DT9 A; 4GVB A; 4RW6 A; 1J2V A; 2DXF A; 4CH7 A; 1PJ5 A; 4DL7 A; 3MEK A; 2KT3 A; 3K8W A; 2KJV A; 2GV1 A; 1HW8 A; 1Q5Y A; 1KHV A; 4IRC A; 5A6P A; 5RUB A; 1NK8 A; 5JVG Q; 2BAC A; 2DNZ A; 4F4A A; 2CPZ A; 2YQ0 A; 4NXN F; 1NU4 A; 1F5B A; 4NCB A; 1LWE A; 1NDP A; 4V1A k; 3ZO7 A; 2QYC A; 4IFV A; 1NDL A; 1RI7 A; 2DHX A; 4M5M A; 2AHO B; 3SDE A; 4UOH A; 2OD6 A; 2QJ3 A; 2ADB A; 1UEV A; 1WSR A; 4B3M J; 2ZVS A; 1FEE A; 3NAH A; 1U1Q A; 3BQ2 A; 2F4F A; 1RCX B; 3D0H E; 3IWL A; 1VC6 A; 2DGO A; 3Q22 A; 4DQP A; 3R5G A; 3C14 A; 4WII A; 3POT A; 1D8Y A; 1VI7 A; 1N32 F; 4AQY F; 2XWX A; 2BEF A; 2HHT A; 4ZCM A; 5AXL A; 1RWN B; 3RG6 A; 4ECT A; 5AE1 A; 4DV6 J; 3V6H A; 1U2C A; 4ZA1 A; 4DV0 F; 1ZZF A; 2VC1 A; 2R2S A; 3N5B A; 5EWF A; 3HT0 A; 2G13 A; 3N6M A; 2AJQ A; 1SUQ B; 3NKY A; 2V4J A; 4CLZ A; 4ID8 A; 2LMI A; 4O3P A; 1HHS A; 4V19 X; 4HTJ A; 5KG5 A; 1S1V B; 1YK9 A; 3LP0 A; 1NRK A; 2IA6 A; 2LKZ A; 3HDS A; 4AE5 A; 2OTJ S; 2PI5 A; 2ZBP A; 5EX3 A; 4R25 A; 5G4D A; 2NSC A; 1VQ9 S; 5KFO A; 1H0H B; 3TO8 A; 2VA2 A; 1MU2 B; 2IC3 A; 1FJG J; 2KB2 A; 3V2U C; 1NK9 A; 4O44 A; 5THW A; 1U1N A; 3LWM A; 2J6T A; 3K5L A; 1X5O A; 4LSL A; 5D4O A; 4N8O A; 3D67 A; 4PXC A; 4EEY A; 1RUS A; 3CJR A; 3JSM B; 2R7X A; 4PXD A; 2YNH B; 2E7W A; 1Z2Z A; 4YR2 A; 4K4Z A; 2B9Y A; 1UVJ A; 3OTO J; 3N01 A; 1CLF A; 2A18 A; 3OLA A; 1S9G A; 3NOC A; 3QYY A; 3HHL A; 4C6A A; 1TUG B; 3Q8S B; 4MFB A; 2YQ1 A; 2HLU A; 4N8N A; 2CQI A; 2WAQ D; 4ZP7 A; 2M0G B; 1C4A A; 4DR6 F; 1O5J A; 5DLF A; 4GC7 A; 3PW7 A; 3FFI B; 2IBK A; 5EDW A; 4DS4 A; 4M5I A; 4DX5 A; 1DRZ A; 3KG4 A; 2CNK B; 3PW0 A; 2J8A A; 4KY3 A; 4QBU A; 1J27 A; 4KSE B; 2VHG A; 1S1X A; 1OWX A; 3MOJ B; 3HZG A; 2WVE A; 4GKK J; 1V3R A; 2UVR A; 4ELT A; 3NP5 A; 4NPO A; 4K59 A; 2AJF E; 2KG1 A; 4IDK A; 3NCR A; 3KDO A; 2ZH2 A; 1JLF A; 1R0A A; 4ZPV R; 2DPJ A; 1VQY A; 2V2K A; 2W8L A; 2ZC3 A; 2EPI A; 1RWM B; 1GQE A; 1LWC A; 4M5J A; 1YBU A; 1JB0 C; 4X65 F; 3EWG A; 3OVS A; 2JEI A; 3NGR A; 3R97 A; 4IQX A; 4LF8 J; 1LWE B; 2RML A; 3NGS A; 4R5P A; 1FNX H; 2UUA J; 2HVH A; 1KEK A; 4X62 J; 1CPZ A; 4X64 F; 4IFV B; 2J6S A; 3GG1 A; 1X8D A; 4KC5 A; 4ECQ A; 3HPO A; 1TUV A; 1HIY A; 2VQF F; 3D5M A; 2YWW A; 5KFY A; 3MM9 A; 5M2R A; 1GXL A; 2FZK B; 1YGY A; 4FF4 A; 4ZP6 A; 3POT B; 3ISZ A; 1K73 T; 2GJI A; 1WEL A; 2HBR B; 1M1H A; 2DY9 A; 4Q2M A; 1AUD A; 3EGN A; 4J91 A; 3MUR P; 4LR9 A; 3D6F B; 3AQP A; 5HMY A; 1U6F A; 3W5Y A; 4JI1 F; 2YKP A; 1WKK A; 4TXS A; 3Q2T C; 3M6V A; 1D0E A; 1YKW A; 2BM0 A; 2HS0 A; 4ZJQ A; 3MD3 A; 5L1J A; 3WC2 A; 2COL A; 1NK0 A; 5F0U A; 2W7O A; 4QWE A; 2IAJ A; 3IBC B; 2JFK A; 2JHE A; 3BR8 A; 4X66 F; 4OZ5 A; 1XBW A; 3LA0 A; 4RBV A; 5L1K A; 7FDR A; 2QL9 B; 1NDK A; 1Q0N A; 2V4Q A; 5CH7 B; 2XMK A; 2EBE A; 3CE8 A; 2PE8 A; 1IR2 A; 2M70 A; 2IC3 B; 1EP4 A; 3LWL A; 3EGZ A; 2ZH4 A; 4AXI A; 5CAA A; 3PTW A; 3EUN A; 1X5T A; 1HD0 A; 2YTC A; 4LSL B; 1Q8K A; 5J2Q A; 2ZE2 A; 3M9O B; 2VJU A; 5M2U A; 2J0S D; 3OW2 R; 5D4N A; 2AYB A; 2FJE B; 2MGZ A; 2PO4 A; 5GAE I; 2CJB A; 2MPU A; 2P8I A; 4G3I A; 4HVZ A; 4WE1 A; 3MGJ A; 4C8L A; 4LRF A; 3OSP A; 1FXL A; 2DH8 A; 1SJF A; 1CJV A; 1KQG B; 3N9U C; 2P5V A; 4MFB B; 3BGR B; 2UUB J; 5HLF A; 1CS4 A; 1XC9 A; 5F41 A; 4H4O A; 2C42 A; 3QNW B; 3ILJ A; 1UEK A; 1S4E A; 2ZM6 F; 2Y1I A; 3CCT A; 2CWX A; 2NS1 B; 1WD6 A; 1YBA A; 2HQI A; 4U7C A; 4IH7 A; 1PIE A; 3AJ1 A; 4C2M A; 1S1X B; 4LRD A; 2O3D A; 3BGO P; 4YOE A; 3GFY A; 2DHG A; 5E41 A; 2PEH A; 3QPI A; 1YJR A; 4CO4 A; 2HQF A; 2XC9 A; 5A8K A; 5DG8 A; 2R8J A; 2HG4 A; 4HR2 A; 2P9G A; 3NXZ A; 4A8K A; 2KVQ E; 1WEY A; 4O0I A; 2CPY A; 4I4B A; 2CJQ A; 2H1Y A; 2DO4 A; 3DLG B; 2NZ4 A; 2R7T A; 1JLA A; 3OJS A; 2OJ3 A; 2N4D A; 3W60 A; 2HHP A; 2M88 A; 2YH1 A; 2N3L A; 3T9Z A; 2C3M A; 2Z30 B; 1RAG B; 4WTO B; 1U0H A; 3LP1 A; 4X4Q A; 4YQW A; 3CCJ S; 2ZKU A; 1TL5 A; 1O51 A; 2WON B; 2ZOF A; 1IBC B; 5HVH A; 2Y3Y A; 1UFL A; 4WP8 A; 1NSA A; 2EW9 A; 4M5H A; 3CMA S; 2VFR A; 4R5P B; 4F26 A; 2BR0 A; 3L7U A; 5CD4 H; 2IJN A; 3GJT B; 4N5S A; 2HHX A; 4JI0 F; 1YIJ S; 3UO0 A; 1CSJ A; 3G8Q A; 4WFN Q; 2ILY A; 1BC6 A; 5DQG A; 4NYZ A; 2RB7 A; 3MM9 B; 2VG7 B; 1RAI B; 4ECR A; 4W92 B; 4KHM A; 5C5J A; 1FT8 A; 4L72 B; 1A7G E; 3G4S S; 2DGT A; 3FEX B; 4RNN A; 2E9Z A; 2XS5 A; 3HF5 A; 3H98 A; 4PZV A; 3KG1 A; 4FPI A; 5H9F J; 4J9V A; 4I6Y A; 1IJE B; 3MEG A; 5DG9 A; 2KM8 B; 4TY9 A; 3G6V A; 2IDL A; 4NYP A; 1XNR F; 1LNQ A; 1WC1 A; 4LF9 J; 5GAG I; 3HHD A; 3BKF A; 3LAK A; 4RW9 B; 2OH2 A; 3C19 A; 1FX2 A; 4GVL A; 3BQ0 A; 3IRX A; 4Q2L A; 4B17 A; 4OI4 A; 2R7Q A; 1DLO B; 4H4K A; 3CCZ A; 5LM7 E; 4ED8 A; 5GMD A; 3CIZ A; 2YQ3 A; 1PJ7 A; 2R2U A; 1UZH A; 3OFF A; 1UVK A; 1MMN A; 3P3D A; 1NK6 A; 1IBK J; 5L46 A; 4F8R A; 2ALZ A; 2IVM A; 3QGI A; 4CLP A; 4YY3 J; 1WWH A; 3G71 S; 3C6U A; 3B4D A; 4JI8 J; 1EP4 B; 3LTO A; 3CCS S; 1YLX A; 5EWG A; 2ZUG A; 1S6Q A; 3CVK A; 4L3N A; 5E3A A; 1RTZ A; 1V5V A; 1AFJ A; 4JI2 J; 5LJ5 Y; 1SKU B; 3KLI A; 2C2N A; 3JB9 k; 3R2C J; 4ECS A; 4HEA 9; 3SSS A; 1FVS A; 2MGZ B; 2MDA A; 2PEB A; 4RUH A; 2XM3 A; 3IRW P; 2IY5 B; 3OXG A; 2HWT A; 3VHQ A; 4U8V A; 4DPX A; 2D3O R; 1CJV B; 1HQE B; 4B3S J; 1VOM A; 4ECY A; 1SKS A; 2MB0 B; 2XMV A; 3TX8 A; 3VR1 A; 1CS4 B; 2POK A; 1NME B; 1RAB B; 1QE1 A; 3Q8V A; 2QMX A; 4M1K A; 1IKX B; 3X3U A; 1EET A; 3OUY B; 2UP1 A; 4B3M F; 3KK1 A; 2RU9 A; 1RT2 A; 3AOB A; 4HAC B; 4HHU A; 5A8W B; 2YKO A; 3VGS A; 4OI6 A; 1WHV A; 2MKJ A; 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