1TUYA

Acetate kinase complexed with adp, alf3 and acetate
Total Genus 132
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
132
sequence length
399
structure length
399
Chain Sequence
MKVLVINAGSSSLKYQLIDMTNESALAVGLCERIGIDNSIITQKKFDGKKLEKLTDLPTHKDALEEVVKALTDDEFGVIKDMGEINAVGHRVVHGGEKFTTSALYDEGVEKAIKDCFELAPLHNPPNMMGISACAEIMPGTPMVIVFDTAFHQTMPPYAYMYALPYDLYEKHGVRKYGFHGTSHKYVAERAALMLGKPAEETKIITCHLGNGSSITAVEGGKSVETSMGFTPLEGLAMGTRCGSIDPAIVPFLMEKEGLTTREIDTLMNKKSGVLGVSGLSNDFRDLDEAASKGNRKAELALEIFAYKVKKFIGEYSAVLNGADAVVFTAGIGENSASIRKRILTGLDGIGIKIDDEKNKIRGQEIDISTPDAKVRVFVIPTNEELAIARETKEIVETE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Structural and Kinetic Analyses of Arginine Residues in the Active Site of the Acetate Kinase from Methanosarcina thermophila.
pubmed doi rcsb
source organism Methanosarcina thermophila
molecule tags Transferase
molecule keywords Acetate kinase
total genus 132
structure length 399
sequence length 399
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.2.1: Acetate kinase.
pdb deposition date 2004-06-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00871 Acetate_kinase Acetokinase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1tuyA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1tuyA02
3D2EA 4WQ5C 2I7PA 2QWQA 3TU5A 4A2BA 2E2NA 4H03B 4BR7A 4FSVA 1BA0A 2Q97A 5BPNA 4I6MB 3DAWA 3J8AA 2I7NA 3L4IA 4BRIA 3UKUA 3BUZB 2QM1A 1TUUA 1G99A 4I6MA 3QBWA 3MDQA 1SZ2A 4KBOA 1DGKN 1NGHA 4ISGA 4QS9A 5AQVA 2IVNA 1P8ZA 4BRHA 1SQKA 2NZTA 3CQYA 5AR0A 3S41A 4JNEA 3AAQA 4CZGA 3A0IX 4CBXA 5KPTA 3HBTA 3SMSA 5F1XA 5AQUA 1Z05A 3UKRB 4FWOA 2CGLA 3UB5A 3FFKB 3WEEA 3A8YA 3VGLA 3QBXA 2QWLA 2Q2RA 3VOVA 4XH5A 4PKIA 4EAHD 3C0BA 2YHWA 2YJFA 3CJAA 4K41A 3D2EB 4BRCA 5ADXH 1Q18A 3IDHA 4H0PA 4WYBA 3AARA 3O5BA 2E1ZA 5AQXA 5ELZA 3R9PA 4C23A 3BEXA 3A5OC 2GUPA 1OKJA 1E4FT 1KAXA 3TPQA 3WXIA 4MO5A 3WXKA 5AQRA 4EIAA 3WXLA 2IIRA 1YXQA 1HKCA 3DXKB 4ISEA 3HM8A 3M1FA 3D2FB 3GDQA 1NGDA 5LJVA 2Q0RA 1S3XA 4CZHA 4EHTA 2ZGZA 2P9UB 4BRQA 1WUAA 4H5TA 5F2RA 4CZIA 2BTFA 4PL7A 1BUPA 1NGCA 4JN4A 3I33A 4BRGA 4H0YB 3FZHA 3VF4A 1YUWA 4BRMA 2HMPA 2BUPA 5AQTA 1EQYA 3RSEB 2WUSA 4BVOA 3CHWA 4CI6A 4M7XA 1NGBA 2E8AA 3CI5A 3LDLA 2P9SA 1T6DA 2ZGYA 4CZFA 5AQIA 2CH6A 3DXMA 1HX1A 2QWMA 5AQKA 2GWKA 4RCHA 4H5NA 3QB0A 4ISFA 4QS7A 2AP1A 4CZKA 5FPEA 3VESA 3VETA 3MN6A 2QW9A 4HWIA 3CJ7A 1WOQA 2HF3A 2P9PA 4B9QA 4BC2A 3WEEB 3R8EA 3O4WA 2A41A 4BG9A 3EZWA 5ADXA 1NBWA 1MA9B 3ENOA 3MMVA 3IUCA 3KHYA 4BR2A 4J8FA 5AZIB 1JCEA 4BRKA 1BU6O 3CJBA 1SAZA 2P9LB 4WQ4C 3ZETA 3JXUA 4K25A 4FOEA 3ATUA 4XH4A 2YJEA 2FF6A 3W0LA 1NGAA 4CZEA 2D0OA 5BR9A 3WQUA 4BGBA 1GLBG 2E2QA 4CZMA 5E84A 2A5XA 1ZBSA 4DQ8A 1LCUA 4PKGA 2E88A 5BPLA 1DEJA 1HUXA 2YHYA 2PAVA 1QZ5A 4FWNA 1QQNA 4RTFD 1MWKA 2E20A 4F9OA 3SJHA 1KXPA 1E4GT 3QFUA 3MCPA 3LDNA 2A3ZA 1T44A 1ATRA 1CZAN 5AQOA 2Q1NA 2V7YA 5BRDA 3FZMA 2FXUA 1V4TA 4H5WA 1XC3A 4BG8A 1ESVA 1TUYA 1V4SA 3BF1A 3QFPA 4H5VA 3GOIA 4JHDA 4WQ4A 3H3NO 1ZXOA 4JD2A 2DPNA 3D7EO 4BC3A 1U2VB 4PKHA 3BP8A 5E26A 2V52B 4FPAA 3UKUB 4BR9A 4GY2B 1GLFO 1LOTB 4H0TB 3LL3A 3HZ6A 3ENHA 2EWSA 3W3DA 3BF3A 4JAXA 2HF4A 5KQDA 3L0QA 1TYQA 4YDUC 1NLVA 1DKGD 2W40A 3FE1A 5AZJB 3VGMA 2A40A 4IZ9A 4MLEA 4CJ7A 1H1VA 4H5RA 4B1VA 3VENA 4B1WB 5I9EB 3C7NB 2P9LA 1KAYA 3ZX2A 3VEXA 4FWSA 4BRNA 2A6AA 4BRPA 2H3GX 4IJNA 2ITMA 3HTVA 1NGGA 3H45C 4A62A 3ZEUB 3UE5A 5AQJA 1Z6RA 3VPZA 5AQGA 3KZBA 4QS8A 4FWPA 3HSCA 1HJOA 3IFRA 4K42A 3ZEUA 3O1WA 1QZ6A 1QQMA 3A5MC 3DXMB 4BROA 3ULEA 4BREA 3U4LA 5KQ8A 1IJJA 2GTDA 2V51B 3LM2A 4B1ZA 5KPRA 5AFUA 1TYQB 4XEIA 2FLOA 1HKGA 2FSNA 3SK3A 3LDQA 3C7NA 5BRFA 3O08A 4BR4A 3VERA 1HKBA 2VCPA 3CETA 4MLHA 5FPDA 1C0GA 3IMXA 3MN7A 3B8AX 1BG3A 4NO7A 3GE1A 5EX5A 2ASPA 4IJAA 3A5LC 2QXLA 3SMPA 3WQTA 1U2VA 1S22A 3LDOA 5BPMA 3GBTA 3RSEA 1NGEA 1YAGA 3VEOA 2P9IB 5BRHA 5JICA 1NM1A 2FSKA 4HTLA 3QDKA 1GLDG 3CJ9A 5AQWA 4FOIA 1GLLO 2IVPA 3I8BA 1K8KB 4CBUA 1ATNA 1NWKA 2Q36A 4BC4A 4BR5A 4EHUA 4BGAA 3HI0A 5CE3A 5LY3A 3GL1A 2F9WA 4Z94A 2F9TA 2ZWHA 2E2PA 2GELA 2CGJA 5EY4A 4BQLA 4K43A 3H1QA 3FZFA 2YHXA 4FWQA 1GLCG 5BREA 5BN9A 1J6ZA 3A5NC 4CZJA 3OHRA 2CH5A 4M63C 5B8HA 2QWOA 1BDGA 4MO4A 1BOTO 2V7ZA 1RDWX 3ZX0A 4LC9B 1QQOA 1NMDA 4B1XB 1HLUA 3CIPA 4BC5A 4CBWA 2UYTA 3H3OB 3VGKA 2P9PB 3CERA 4NB4A 3CQXA 4H0VB 3DXKA 4FWKA 4CZLA 5JLFA 2QWNA 2VYPA 2A42A 4L3QA 3EL2A 4BR0A 3O8MA 2D4WA 3U8XA 5EOYA 2J4RA 4BRAA 5JLHA 5FPNA 3VEZA 2HOEA 4EFHA 5AZIA 3QMLA 5BN8A 3VF2A 3DJCA 2P9KB 5AQFA 2P9IA 3M6GA 2E1YA 1JCFA 1NGJA 3VF6A 2FSJA 4JD2B 2VWBA 4FWMA 3JS6A 4B1YB 3H1VX 1D4XA 1GLJO 3VEWA 3MN9A 2ZF5O 5FPMA 4CD1A 4O8KA 1YVNA 1MWMA 4RWTA 2AA4A 4IWVA 4FPBA 5EVZA 4M7YA 4BRLA 4WQ5A 3AAPA 5AQHA 2FF3B 5F0XA 1R59O 1IG8A 2GWJA 4FL9A 4PL8A 1BO5O 3UKRA 3FLCO 3U9DA 5EXWA 1RGIA 3CJCA 3H6EA 3EN9A 2E2OA 2W41A 2ASMA 4BQZA 1KAZA 4BVPA 1HPMA 2PBDA 2QWRA 3U9ZA 5AFUH 5TKYA 2ASOA 2P9SB 2D0PA 4IXCA 3DWLA 3O6WA 1XUPO 4JHDB 2NLXA 3R6MA 1X9JA 3FZLA 4FWLA 4IO8A 1BWFO 3F9MA 3WUHA 3SLCA 2Q0UA 5LJWA 4A2AA 4YDUA 3D2FA 4DHYA 2KHOA 3O1BA 4DCHA 2QWPA 5AQPA 1K8KA 3WXJA 3EO3A 3P4IA 4H0OA 1GLEG 1JCGA 1RFQA 5JMVA 2P9UA 3LM9A 4O5FA 1QHAA 2GEMA 3ZX3A 3L6QA 3O80A 5AQQA 4H0XB 4BRFA 2Q31A 1GLAG 3LDPA 5AQSA 4BRDA 3G25A 2YCHA 5AQNA 3ZETB 2IVOA 3ATVA 5AQZA 2OANA 2P9KA 5AQLA 4E1JA 4DB3A 4AM7A 1MDUB 3AY9A 1NGFA 4CD3A 2CGKA 1X3MA 1C0FA 2NRHA 3FZKA 3ID8A 4A61A 2D1KA 1NGIA 1ATSA 4Y0WA 3H46O 3WT0A 4GNIA 3M3ZA 3MK6A 4B1UB 5AZJA 3EKSA 1Y64A 3KVGA 4XH1A 1T6CA 1BA1A 2P9NB 3ULEB 3CJ1A 4AM6A 3FGUA 3FR0A 2P9NA 1X3NA 4FWRA 3VEYA 5KPZA 3GG4A 3MN5A 4FO0A 3VEVA 1XQSC 3EKUA 1U6ZA 5AQYA 3QICA 1ZC6A 2YI1A 5AQMA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5HL7L 4H03B 4BR7A 3HYFA 1BA0A 3CCVN 4I6MB 4ID1A 4A59A 1TKXA 4DR5K 1C0TA 4E7HA 1G99A 3AVMA 4CEZA 5KGXA 3KWGA 4J2DA 1DGKN 3PSFA 4FK2A 3OYGA 1IKYA 2W6KA 4DTMA 4I9QA 3TSUA 1SQKA 4JKAA 5IWAK 3S41A 3BGRA 4KI4A 1VAZA 3SBTA 4DR3K 3KJVA 3A0IX 3HBTA 2ZQBA 1Z05A 3ASMA 4FWOA 2CGLA 4JKGB 3FFKB 3WEEA 3CFPA 3A8YA 4DU4A 2NRRA 3RRGA 3QBXA 1T05A 3VOVA 2HHXA 2YHWA 2YJFA 4F2SA 2QI2A 4BRCA 3VQ8A 1Q18A 3IDHA 4WYBA 2XRIA 5KRTA 4WFAL 5C24A 3A5OC 2GUPA 1LV5A 1KAXA 4MO5A 4FJLA 1LWCA 4KV8A 4OGCA 2IIRA 3L2WA 3DLHA 4DLGA 3HM8A 3K58A 1S3XA 2ZJQL 4FM0A 4EHTA 2GV9A 4BRQA 4OPHA 3NVMA 1CLQA 2QK9A 2NRXA 4JN4A 4AF1A 3I33A 4KPYA 1YUWA 1IBLK 1FKOA 1NJIO 1X9MA 4YOUA 3RSEB 4DKWA 2E8AA 2BANA 1Q8IA 3ZYYX 3CCSN 4JI0K 3BZKA 2P9SA 2ZGYA 3MX5A 3P83D 3DXMA 4H8KA 2GWKA 5GAGP 3R3LA 3LAKA 5FPEA 1D9FA 1N32K 3U6FA 4NLCA 3DLLL 2HNDA 5CZ2A 3MN6A 4H4OA 3CJ7A 4E7JA 4CF1A 4DTNA 2D5RA 5GAHP 3EZWA 3IRXA 5K14A 4FJ5A 1TL3A 1NBWA 3MMVA 4BR2A 3QESA 3MECA 5AZIB 1KCFA 3SBGA 1Q86O 4KHNA 4O55A 4DSIA 4WQ4C 4IO9L 3V9WA 3JXUA 4K25A 3DLRA 5DMRA 2YJEA 1RT6A 3NF9A 4CK1A 4FM2A 4FXDA 5HOOA 5BR9A 1BI4B 3VTHA 5EU7A 2XY5A 2PYLA 3PV8A 3WQUA 3SQ1A 3EE8A 4JS4A 5E84A 2A5XA 3DOLA 2G8HA 1LCUA 4PKGA 4KFBA 3PSIA 4FWNA 4BWJA 1T7PA 1QQNA 1WSGA 3HL8A 3DRPA 3THYA 3CM5A 2D0CA 3ZT2A 4CEEA 1KXPA 3QFUA 3LAMA 3V9SA 4DS5A 1XC9A 2Q1NA 3J81O 4KTWA 1V4TA 3CPWM 3AA4A 1ESVA 4U7BA 3GOIA 4LF5K 1QVFM 1U2VB 3KWIA 2V52B 2OTJN 4FPAA 3ENHA 3G4SN 2F4VK 3DLEA 3OS2A 3G71N 3HM9A 4CHPA 4JAXA 3KIOA 3FE1A 4CERA 4CK3A 4CJRA 3PX6A 3L3VA 4CEQA 3RWUA 4CHQA 4DR7K 3VENA 3V9XA 4FJGA 1VQON 3NMUA 2IC3A 4FWSA 3SI6A 2A6AA 2VGMA 2H3GX 1OH8A 1K73O 1O13A 2QXFA 3VQ9A 5AQJA 1Z6RA 3HXMA 3VPZA 1J54A 4CE9A 4QS8A 4FWPA 1C1CA 3SV3A 4B9VA 3K9KA 4K42A 3ZEUA 3OYIA 3O1WA 1HNIA 4E7IA 1QQMA 4BROA 2HVIA 4BWMA 4O0IA 4DTJA 5KQ8A 4B3SK 3CPEA 1VSJA 5DM7L 4IDKA 3LM2A 3NFAA 4FJMA 1HQUA 5J2QA 4HUGA 3NAEA 3RMAA 1TYQB 3SK3A 1HKGA 1Q82O 4KHUA 2RPIA 3LDQA 4DV0K 3C7NA 4W5OA 3VQ5A 1HNWK 1W0HA 2Z1JA 3WXMB 4BR4A 4J2BA 3CETA 3Q7BA 4Z4HA 3SZ2A 4DTPA 5EX5A 1MU2A 1E3MA 2KFZA 2FBYA 2QXLA 3WQTA 5HBMA 3LDOA 2UXDK 3RSEA 1NGEA 3BY5A 4CIFA 2P9IB 2X6NA 4DUYK 4OKKA 3TAPA 1J5OA 2FSKA 3QDKA 1GLDG 5AQWA 2RE2A 2IVPA 1R0AA 3AA5X 1ATNA 1NWKA 1TGOA 4YNQA 4LSLA 3TAFA 3HI0A 1RBVA 5GINA 1WBBA 2ITGA 2NRVA 2E2PA 4AHTA 5EY4A 3ENBA 3TSPA 3T69A 2X6SA 4M42A 2YHXA 1HNXK 4Y1CA 1RT3A 1OVYA 4CZJA 1HYSA 3QNNA 4CF8A 3U3GA 3I56N 1NJXA 2OZSA 4M63C 5B8HA 1BDGA 4BE1A 3KLGA 3C94A 2V7ZA 3ZX0A 1KSPA 1NMDA 3VQQA 1WBDA 3RR8A 3CQXA 4B3MK 1NK6A 4FWKA 4CZLA 4MQ3A 1HRHA 3KK7A 1DTQA 4FYDA 1OH6A 4JEPA 4BR0A 2RKIA 5EOYA 3U8XA 3P31A 3L2QA 2HOEA 4EFHA 4KI6A 3VF2A 5AQFA 2HHTA 4LSNA 3M6GA 3OW2M 4DQIA 2O8EA 4JD2B 1K6YA 4DV6K 4E3SA 5C0YA 4B1YB 3NH0A 3H1VX 4CW7B 2Q3SA 1D4XA 2O8CA 2VG5A 3OYJA 5LMNK 5FPMA 2WFBA 4O8KA 1YVNA 5CYMA 3K5OA 4CD1A 4FPBA 1Q7YO 4M7YA 1JLCA 4GKKK 3CM6A 3THWB 3AAPA 3H08A 4CGIA 4FL9A 4AHUA 4DQPA 2VGNA 1NK5A 5CZ1A 4DFJA 3SUOA 4WFNL 1LAWA 4LF7K 3OS0A 3NF8A 3U9ZA 2D0PA 2HHHK 4JV5K 3DWLA 1XUPO 2RHKA 3AVLA 1X9JA 5A2QO 1VSKA 1NMNA 3RR7A 2KKZA 4DR6K 4JI5K 1BWFO 3F9MA 4J2AA 3WUHA 3ZCMA 4AHSA 4A2AA 1ASWA 2KHOA 4N56A 5AQPA 3QLHA 4DQRA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 3TTF A;  4FWL A;  4RW4 A;  3BDP A;  2VQE K;  3E9O A;  2Q0U A;  4YDU A;  3D2F A;  3ITH A;  1UA1 A;  5H1S Q;  4DCH A;  2JGU A;  2P5O A;  2Y1J A;  4Q5V A;  5JMV A;  4G9Z A;  2P9U A;  5FRN A;  2GUI A;  4O5F A;  1TVR A;  3ZX3 A;  1SKW A;  4BRF A;  4H0X B;  2Q31 A;  4BRD A;  1RDD A;  5AQS A;  1HYV A;  3B6O A;  4GVE A;  4EP4 A;  3HOS A;  2YCH A;  1OH5 A;  4FK0 A;  3V9U A;  2XY7 A;  3O3F A;  3C6A A;  5AQN A;  1IH7 A;  3TAG A;  2OAN A;  3O9R A;  4E1J A;  2OTL N;  5CHI A;  3PLA A;  4DS4 A;  4CD3 A;  1NOZ A;  3CCJ N;  2CGK A;  1X3M A;  4CK2 A;  1C0F A;  2NRH A;  4HUF A;  4DLE A;  1ATS A;  1TAQ A;  4IFV A;  3AO5 A;  1U48 A;  1ZBI A;  3K5M A;  3P1G A;  4WCE L;  3T7Z A;  1WLJ A;  4DSF A;  3QER A;  4C1N I;  1VSD A;  4AH9 A;  4LF9 K;  3FR0 A;  5HRP A;  4CED A;  4GKJ K;  4E19 A;  3GG4 A;  2PYJ A;  4C8K A;  3MED A;  1XQS C;  3EKU A;  1EET A;  3R1X A;  2ZJR L;  2YI1 A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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