1TUYA

Acetate kinase complexed with adp, alf3 and acetate
Total Genus 132
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
132
sequence length
399
structure length
399
Chain Sequence
MKVLVINAGSSSLKYQLIDMTNESALAVGLCERIGIDNSIITQKKFDGKKLEKLTDLPTHKDALEEVVKALTDDEFGVIKDMGEINAVGHRVVHGGEKFTTSALYDEGVEKAIKDCFELAPLHNPPNMMGISACAEIMPGTPMVIVFDTAFHQTMPPYAYMYALPYDLYEKHGVRKYGFHGTSHKYVAERAALMLGKPAEETKIITCHLGNGSSITAVEGGKSVETSMGFTPLEGLAMGTRCGSIDPAIVPFLMEKEGLTTREIDTLMNKKSGVLGVSGLSNDFRDLDEAASKGNRKAELALEIFAYKVKKFIGEYSAVLNGADAVVFTAGIGENSASIRKRILTGLDGIGIKIDDEKNKIRGQEIDISTPDAKVRVFVIPTNEELAIARETKEIVETE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Structural and Kinetic Analyses of Arginine Residues in the Active Site of the Acetate Kinase from Methanosarcina thermophila.
pubmed doi rcsb
source organism Methanosarcina thermophila
molecule tags Transferase
molecule keywords Acetate kinase
total genus 132
structure length 399
sequence length 399
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.2.1: Acetate kinase.
pdb deposition date 2004-06-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00871 Acetate_kinase Acetokinase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1tuyA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1tuyA02
3JXUA 3RSEB 5AR0A 4H0XB 1X3MA 4FWOA 5AZJB 5JMVA 1K8KB 5B8HA 5AQNA 4JN4A 2I7PA 3ZX0A 2IVOA 3DAWA 2Q0UA 4BQLA 4H0PA 4K42A 1NGJA 4FWPA 3QDKA 2GWJA 4BRNA 1S22A 3WQUA 1DKGD 2P9LB 3KVGA 4BR2A 3GG4A 2A40A 4PKHA 3FE1A 5FPMA 5BR9A 3MMVA 3VGKA 3AAQA 1ATNA 2OANA 2VCPA 4PKIA 4L3QA 4YDUA 1NGIA 1ATSA 4BRDA 1T44A 2P9UA 1GLCG 4H5NA 4EHTA 1HJOA 2P9LA 2F9TA 2H3GX 2QWMA 5E84A 5EY4A 1XUPO 4DQ8A 3O8MA 3BUZB 4BC3A 2A5XA 1JCGA 4RCHA 4CZEA 3DJCA 3U9ZA 2FF3B 2YI1A 3A5LC 3LM9A 4BC4A 2GEMA 4B1XB 1GLFO 4FOIA 3RSEA 4QS8A 3A8YA 4IJNA 4BGBA 3EKSA 3QFPA 4O8KA 1YUWA 4H0VB 4BRAA 4WYBA 4RTFD 4Y0WA 3CETA 4BRMA 4I6MA 1TYQB 3AAPA 2D1KA 5LJWA 3LDNA 2QWQA 1HX1A 1GLBG 2P9KA 4IWVA 3U4LA 3UKUA 1CZAN 1NGAA 2ASPA 4JAXA 3VEVA 5BRHA 3WQTA 2CGJA 1U6ZA 3WT0A 5AQFA 2VYPA 3ULEB 2QWOA 3CIPA 2E2OA 4BVOA 1NBWA 5AQKA 3W3DA 3MDQA 4BRCA 5AFUH 4EHUA 4BRLA 1SAZA 2P9SA 5AFUA 2YHWA 1U2VB 4BR4A 2KHOA 4CBWA 1R59O 2GWKA 2P9PB 3VERA 2EWSA 2HMPA 4K43A 3D2EA 1K8KA 2A3ZA 1V4TA 4WQ5A 3VF6A 3L6QA 4MO5A 3VENA 2NLXA 3ZETA 2PAVA 3F9MA 1T6CA 2QW9A 4BR9A 3CJ1A 3WEEA 5AQVA 2E20A 5AQUA 2P9IB 4BQZA 2ASMA 2IVNA 2ZF5O 3FZLA 3VEOA 5BREA 4PL7A 1HKCA 1XQSC 3CJ9A 1Q18A 3U9DA 3S41A 4BROA 3FFKB 3O1BA 4AM7A 3DXMA 1EQYA 4FL9A 4DCHA 3KZBA 3SJHA 4B1ZA 4BRKA 3LM2A 4WQ5C 2IIRA 4FO0A 3EZWA 5EXWA 3ZX2A 4B1VA 4BC2A 1MDUB 3U8XA 3AARA 4C23A 5BPLA 4BRHA 3H6EA 5ADXA 2P9KB 1NGDA 1E4GT 4IO8A 2P9SB 3VEZA 5AQWA 5AQQA 4JD2A 3BEXA 2CH5A 2WUSA 3ULEA 4JNEA 3M1FA 4FPBA 3GL1A 4H0YB 1BO5O 4BG9A 4BRPA 5KPTA 4CZIA 1TUYA 5I9EB 3B8AX 1NGGA 3HM8A 3VEWA 3UB5A 1SZ2A 4H5TA 3FZHA 4ISGA 3DXKA 2QWRA 3ZEUA 5BRFA 2P9IA 2PBDA 3MCPA 4F9OA 5KPZA 3VESA 4H5RA 3VOVA 2FSNA 4BG8A 1NMDA 1DEJA 3FGUA 4K41A 4CD3A 1BWFO 1GLEG 4B1WB 1LCUA 1P8ZA 2FLOA 2P9UB 2YHXA 3ENOA 3P4IA 3VF4A 2Q0RA 4WQ4C 5EX5A 1ZC6A 1BDGA 3WXJA 4FPAA 1QQNA 4Z94A 5KQDA 2QWNA 3EKUA 3R8EA 3VEXA 4BGAA 1BA1A 4CZMA 3CJBA 2V7YA 4JHDA 2NRHA 3SMSA 3EL2A 1YXQA 3D2FA 3UE5A 5CE3A 3CHWA 2AP1A 4H03B 1WUAA 4BR0A 2QXLA 5AZIB 4EIAA 3I33A 4QS7A 4JD2B 5LY3A 3GE1A 3H46O 1JCEA 3QBWA 1BOTO 3CJCA 3CQXA 4XH4A 2Q1NA 3SK3A 1NGEA 4FWQA 4E1JA 4H0OA 3LDQA 1NGCA 4IZ9A 5AQLA 1V4SA 4RWTA 3FLCO 2E8AA 2Q2RA 3ZEUB 4CBXA 1QQOA 1QQMA 1KXPA 3O08A 3R9PA 4CZFA 5AQPA 5KPRA 5FPEA 4BR7A 1TUUA 2YCHA 2ZWHA 3HTVA 4EFHA 3LDPA 3QBXA 4FWKA 5E26A 3A5MC 2V7ZA 4XH5A 4A2AA 3AY9A 3C7NB 1GLJO 1KAYA 4BRQA 5BPNA 5KQ8A 4PL8A 2P9NB 5AQXA 3ZX3A 5AQJA 3IUCA 1YVNA 2A42A 4CZGA 2D4WA 4I6MB 4EAHD 2ASOA 3L0QA 1Y64A 3VGLA 4GY2B 4O5FA 1H1VA 5AQHA 3CQYA 1NWKA 5AQTA 1J6ZA 4GNIA 5JLHA 5LJVA 3CJAA 3GDQA 1S3XA 1NGFA 3DXMB 4BVPA 1X9JA 5F1XA 4A62A 3MN6A 5FPNA 3J8AA 2QWPA 3QB0A 1BUPA 4MLEA 5AQOA 1GLDG 1HLUA 2QWLA 5EOYA 4B1UB 2W40A 2GUPA 3FZKA 1LOTB 2FSJA 5AQSA 3M3ZA 4WQ4A 4HWIA 3HI0A 4CZJA 3O4WA 2HF4A 4ISFA 4A61A 4IXCA 2A41A 3LL3A 3ATVA 3O80A 2E1ZA 4B1YB 4CD1A 1DGKN 4CI6A 1XC3A 3GBTA 3H1QA 1NM1A 3WXKA 1JCFA 3H3OB 1HKBA 3ATUA 5EVZA 5AQGA 2GTDA 3TU5A 2P9PA 5ADXH 3D2EB 4CZHA 4NO7A 4PKGA 4BRFA 1SQKA 2FSKA 2ZGZA 3ZETB 4MLHA 1G99A 3EN9A 1YAGA 2E2QA 3IMXA 5ELZA 2FXUA 2ZGYA 3C7NA 3H1VX 3CERA 1RFQA 3EO3A 3L4IA 4QS9A 5JICA 2HF3A 3O6WA 4H5VA 4CZKA 2IVPA 4DHYA 2YJFA 1C0GA 3H3NO 3FZMA 2Q97A 3FR0A 3G25A 2E2PA 1U2VA 3D2FB 3DXKB 3KHYA 4FSVA 4XH1A 3VEYA 3QICA 2HOEA 4FWRA 3MN9A 2W41A 3VGMA 4YDUC 3VETA 1NGHA 3WEEB 3M6GA 2I7NA 4B9QA 5F0XA 3WXIA 5AQRA 2FF6A 5AQZA 1MWKA 3UKUB 1QZ6A 4J8FA 4ISEA 4H5WA 3A5NC 5AZIA 5BN9A 4CBUA 2E2NA 4NB4A 2GELA 3UKRB 3MK6A 1MA9B 2A6AA 4MO4A 2CGKA 5BN8A 1T6DA 2V52B 3SMPA 3O1WA 3FZFA 1OKJA 5FPDA 1Z05A 2V51B 5JLFA 3C0BA 5TKYA 1E4FT 1C0FA 4BRGA 3LDOA 1HKGA 4FWLA 1ZXOA 3WUHA 2D0PA 4BR5A 4LC9B 1ESVA 3HZ6A 5AQMA 3D7EO 3TPQA 4IJAA 5AQIA 4XEIA 1GLAG 5BRDA 3CJ7A 1BU6O 1QZ5A 5AQYA 2E88A 2F9WA 1MWMA 4BC5A 4CZLA 3HBTA 3DWLA 3GOIA 1WOQA 3I8BA 3O5BA 3BP8A 2AA4A 2VWBA 1GLLO 1NLVA 2J4RA 2QM1A 3JS6A 5F2RA 1RDWX 2NZTA 4CJ7A 1KAZA 4JHDB 4HTLA 1X3NA 2D0OA 1NGBA 1RGIA 3ID8A 3QMLA 3MN7A 1KAXA 2BTFA 1BA0A 5AZJA 1BG3A 4FWNA 1IG8A 1IJJA 2ITMA 2YJEA 4FOEA 2YHYA 1Z6RA 3IDHA 2UYTA 3WXLA 3R6MA 4KBOA 3ENHA 2DPNA 4A2BA 5BPMA 3A5OC 3OHRA 4DB3A 1ATRA 4K25A 3HSCA 3LDLA 4M63C 4BREA 2CGLA 2BUPA 3VPZA 3VF2A 4FWMA 3IFRA 1HUXA 3W0LA 2E1YA 1ZBSA 2Q36A 4AM6A 3BF1A 3QFUA 1D4XA 1QHAA 3MN5A 3UKRA 4M7XA 1HPMA 2P9NA 3H45C 4M7YA 4H0TB 3A0IX 4BRIA 3CI5A 1TYQA 3BF3A 3SLCA 2CH6A 4FWSA 2Q31A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3JXUA 3RSEB 3SUNA 4CIEA 1VSMA 3IKMA 4KH4A 4CFBA 1X3MA 3A2FA 5AZJB 3OY9A 4YNQA 3K0SA 3KIOA 4JKEA 4FWPA 2A40A 2WONA 4DV0K 3AAQA 2VCPA 3T1HK 1WN7A 4YDUA 1O13A 2HB5A 3TWHA 4LSLA 4FM1A 1IH7A 5DM7L 4WF9L 4DFPA 2F9TA 2QWMA 1Q86O 4DQ8A 1RILA 1M1KO 3BUZB 4NXMK 4CZEA 3DJCA 4JKHA 2D0AA 1TK0A 1UWBA 1RBTA 2GEMA 4B1XB 2VWJA 4DTJA 1KRPA 4X62K 4CESA 1YUWA 4H0VB 1L3VA 4YOYA 4BRAA 2GV9A 3RMAA 3CYMA 4JI8K 2F8SA 4Y0WA 3AV9A 2D1KA 3DLEA 4JI6K 2QWQA 4DSLA 4DFMA 5BRHA 4W5RA 2ASPA 1G15A 3EY1A 4CK3A 4MFBA 5AQFA 3E9LA 3BZCA 3V9SA 4BRLA 1SAZA 4AH9A 2YHWA 4DV1K 4BR4A 4CGGA 1SS6A 2KHOA 4CFCA 3VQ9A 1R59O 1S1XA 2P9PB 4KH6A 3N4PA 2EWSA 3D2EA 1NK9A 3NGIA 1YJ9N 4CJVA 3L6QA 4MO5A 4DTPA 3VENA 2GBZA 1SV5A 4BR9A 2QXFA 1B92A 4FJXA 3SUOA 1CXQA 2ZF5O 3FZLA 1Q9YA 4ID1A 1XQSC 4M3WA 1SKSA 3OYNA 4JRPA 3JAMO 1A5WA 2YNIA 4CJFA 4DCHA 4BRKA 3KK3A 4WQ5C 2IIRA 3VQ6A 3ZX2A 4OVLA 3L2WA 4BC2A 3LANA 1Q82O 2P5OA 3V81A 4IFEA 3AARA 3NH1A 4M3TA 4YOUA 2FBTA 3QNOA 4Y1CA 3AO4A 4U7BA 4E7IA 3THYB 4CEFA 3R3LA 3U6FA 2P9KB 4LH5A 4LFAK 3M8PA 3ZSZA 5J2QA 3THXA 1N34K 2WUSA 4KHPK 4H0YB 1WNSA 4BG9A 4BRPA 5KPTA 4CZIA 4DQSA 3QLHA 1NGGA 3AO5A 3HM8A 3TANA 4ILHA 4ISGA 3SAFA 4B9TA 4L8RB 1EXQA 5BRFA 2PBDA 4CCHA 3QERA 4HCBA 5JVHL 1JLGA 4OPKA 4K41A 2G8WA 3SAHA 3ENOA 4EZ9A 2YKMA 3VF4A 3O9QA 4RW8A 2DFEA 5FLXO 3WXJA 1QQNA 4CJ5A 4HCCA 2QWNA 5CZ2A 1BA1A 2HBMA 4CZMA 3IG1A 4JS4A 1YXQA 3SNNA 1K8AO 3PLAA 3P1GA 1WUAA 3C6HA 5AZIB 2EX3A 3I33A 1LW2A 4JEPA 3S3OA 2F8TA 3NGZA 4JK9A 1NGEA 4H0OA 3LDQA 3VQ8A 3SV4A 1V4SA 5IWAK 3LP2A 3CCMN 1RNHA 4RW7A 4RWTA 2E8AA 2Z1JA 1KXPA 5AQPA 5FPEA 3HTVA 3OYLA 4M45A 2P1JA 3TAGA 2VQEK 3M5RA 2V7ZA 4XH5A 4CEAA 4JKDA 4ELTA 3BDPA 4B3OA 2NNWA 1JL2A 3C7NB 1HQUA 1D5AA 4JKGB 4PL8A 2P9NB 1Z25A 3D6RA 3ZX3A 5AQJA 4CF8A 3QINA 3OYJA 3QEIA 3K5LA 1W2BM 2D4WA 4QCLA 2ASOA 5K14A 4GY2B 4B9UA 1TKDA 5HBMA 3I55N 4KHNA 5AQHA 1NWKA 2HMIA 1VSJA 1TL1A 2HBLA 4CJPA 1JLBA 3I56N 4HHTA 2R7YA 3K2PA 1X9JA 5F1XA 1KVAA 4KTWA 3TARA 1XNQK 3ZCMA 3MN6A 1TK8A 1TK5A 2ZE2A 3P31A 5AQOA 4FVMA 2A1SA 3ZSYA 1VSKA 3FZKA 3AO1A 3KLIA 3NH0A 2VG5A 2YV0X 4DQQA 1VQPN 3O4WA 2UUBK 4EZ6A 3M8RA 2A41A 3LL3A 4CI6A 3N4QA 4FW1A 3I8DA 3H1QA 1VSIA 3AGRA 2PFUA 2HBJA 2O8FB 4J2EA 4H8KA 3WXKA 4Z4CA 2ZJQL 4YFUA 1YIJN 3BY5A 4KFBA 4DMNA 3ATUA 3KJVA 5AQGA 4IOCL 3TU5A 2G8KA 1VHXA 2VG7A 4BRFA 3O9UA 3V4IA 5C15A 2XY5A 2FSKA 5M1OA 4B9NA 2QKBA 4GV3A 1NKEA 4NCAA 3DYAA 5C0YA 4Z4EA 1HMVA 3LP3A 4CJUA 2WTUA 4GKKK 4CEDA 2XY7A 2RE2A 1W9HA 1XMOK 3MEGA 4DUYK 3DLBA 4DHYA 4E3SA 1KC8O 1HR0K 3K5NA 2Q97A 1BCOA 1HYSA 3VQDA 5DMRA 3Q7CA 1K9MO 4CERA 4F3TA 4OGEA 4CF0A 4KRFA 2ZD1A 4Z4GA 1S1TA 3WEEB 1WB9A 3M6GA 2I7NA 4DKWA 2FF6A 2HHXA 1MWKA 3UKUB 3DLKA 4DF8A 4H5WA 3SPZA 4DTMA 3B6OA 3UKRB 4LF6K 3KK2A 3CMAN 4ZTJA 3IRXA 1EP4A 4B8CA 1T6DA 3F5TA 3FZFA 1HNVA 5FPDA 4B08A 4OKEA 2V51B 5JLFA 3KK7A 4OJRA 3MXMA 1HKGA 4FWLA 1ZXOA 2D0PA 4BR5A 4LC9B 1JLCA 2AJQA 1P90A 3HZ6A 5AQIA 1GLAG 5BRDA 1YTUA 1UA1A 1BU6O 1QZ5A 3DRRA 3C6TA 3TSQA 4KB1A 2KKZA 2HHHK 3ITHA 3OA9A 4M3YA 3DWLA 1CLQA 4DTSA 3K58A 3PIOL 3O9SA 3O5BA 3MXIA 4IBNA 2ZM6K 3AVNA 1HYVA 2J4RA 5F2RA 2NRRA 4HTLA 1X3NA 3HT3A 2P51A 1KAXA 3PUFA 1BA0A 1IJJA 4CE9A 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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