1TUYA

Acetate kinase complexed with adp, alf3 and acetate
Total Genus 132
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
132
sequence length
399
structure length
399
Chain Sequence
MKVLVINAGSSSLKYQLIDMTNESALAVGLCERIGIDNSIITQKKFDGKKLEKLTDLPTHKDALEEVVKALTDDEFGVIKDMGEINAVGHRVVHGGEKFTTSALYDEGVEKAIKDCFELAPLHNPPNMMGISACAEIMPGTPMVIVFDTAFHQTMPPYAYMYALPYDLYEKHGVRKYGFHGTSHKYVAERAALMLGKPAEETKIITCHLGNGSSITAVEGGKSVETSMGFTPLEGLAMGTRCGSIDPAIVPFLMEKEGLTTREIDTLMNKKSGVLGVSGLSNDFRDLDEAASKGNRKAELALEIFAYKVKKFIGEYSAVLNGADAVVFTAGIGENSASIRKRILTGLDGIGIKIDDEKNKIRGQEIDISTPDAKVRVFVIPTNEELAIARETKEIVETE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural and Kinetic Analyses of Arginine Residues in the Active Site of the Acetate Kinase from Methanosarcina thermophila.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase
source organism Methanosarcina thermophila
molecule keywords Acetate kinase
total genus 132
structure length 399
sequence length 399
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.2.1: Acetate kinase.
pdb deposition date 2004-06-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00871 Acetate_kinase Acetokinase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1tuyA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1tuyA02
2QWOA 3F9MA 3DXKB 5AQFA 5EX5A 3M1FA 2D0PA 1K8KA 3D2EB 1E4GT 5BRDA 1RGIA 1QHAA 2ZGYA 3VESA 1NGJA 3C7NB 4CD3A 3W0LA 3U4LA 3ZX2A 1ZXOA 2VWBA 3A5NC 5I9EB 4BRIA 4WQ5A 2GWJA 4WQ4A 1NGFA 3VERA 1KAXA 3WXKA 3MN6A 4H0TB 3DAWA 3ZETB 4FPAA 5JMVA 5AQHA 4A61A 3ATVA 3MN9A 2E1YA 3MN7A 4EHTA 4O8KA 5FPEA 5FPMA 4AM6A 2P9SA 1U2VA 2HF4A 2ZWHA 5AZIA 3VEWA 3VGKA 3H46O 3IUCA 4PKHA 4J8FA 4HWIA 3I33A 3RSEB 3FLCO 1H1VA 4FO0A 4BRQA 3BUZB 1HUXA 1X3MA 1S22A 2P9UA 3VF2A 1NLVA 1YAGA 4E1JA 5BN8A 2WUSA 4JNEA 2CH6A 2QWRA 4K43A 4B1VA 3ZEUA 1P8ZA 3U9ZA 3VF4A 3WEEB 2P9PB 2QWNA 3HM8A 1QQOA 4BVOA 2F9TA 2AP1A 3AY9A 3FR0A 2AA4A 3VEXA 4BREA 2IIRA 4FWMA 5AQUA 4BQLA 3MCPA 2YI1A 4FWRA 1KAYA 2FSJA 4GNIA 2A41A 3ENHA 2A5XA 4JN4A 4FWLA 2IVNA 3H3OB 4MLEA 4B1ZA 2PBDA 1RDWX 3D7EO 3FFKB 4GY2B 3EN9A 2J4RA 3HI0A 1IJJA 1Y64A 3VENA 5LJVA 1U6ZA 1D4XA 4BR5A 3EKSA 1J6ZA 2GWKA 5AQPA 3ZX3A 3AAPA 2VCPA 2P9LA 1BA1A 4BR2A 3AAQA 1GLCG 4JHDA 2H3GX 3O80A 2EWSA 5AFUH 4FWOA 4FL9A 3LM2A 4DQ8A 4FWNA 5BPMA 1ATNA 5EVZA 3DXMA 2ASPA 3I8BA 3QFPA 4FOIA 3BEXA 3U9DA 1GLFO 4H0XB 1QZ5A 4B1WB 3O8MA 2FSNA 2V7YA 5AFUA 3OHRA 4RCHA 2YJFA 5KQDA 2ASMA 4RTFD 1MWKA 2QWLA 4CBXA 2OANA 3A5OC 4CJ7A 2ZGZA 1ATSA 2YJEA 4EAHD 5E26A 3CETA 3VOVA 3VEYA 2BUPA 2DPNA 2W41A 4MO4A 3CJ1A 3EZWA 5AQZA 3VGLA 3QBWA 4CZFA 4CZGA 1BOTO 3BF1A 3LDQA 5BREA 1QZ6A 4FOEA 3WT0A 1CZAN 3LDPA 4BQZA 4CZLA 2I7NA 3UB5A 2QM1A 2GEMA 2QWQA 2Q97A 1GLEG 3WXLA 2FXUA 2F9WA 2NLXA 4BR0A 4NO7A 5B8HA 3UKRA 4A62A 3CERA 1S3XA 4NB4A 4EIAA 3L4IA 2A3ZA 2P9LB 4BRGA 3LDNA 3S41A 2A40A 4H5TA 4EFHA 4JHDB 4B1XB 3ATUA 3G25A 4BG9A 1XQSC 4PL7A 5LJWA 4XEIA 1R59O 3IMXA 3R8EA 3WXIA 2P9NA 3SJHA 3UE5A 3BF3A 3SLCA 4YDUC 4BC2A 2V52B 3AARA 4FWPA 1NM1A 3L6QA 3IFRA 3W3DA 4Y0WA 1XC3A 3O4WA 1T44A 5AQVA 4BC5A 3A5LC 4BG8A 4BRHA 3GDQA 1SQKA 2FLOA 4DB3A 3O1WA 3FZFA 4CZJA 1NGEA 3H1VX 4I6MA 5FPDA 3SMSA 2HF3A 1TYQA 3D2FB 2ITMA 1HX1A 1DEJA 1GLLO 3JS6A 3VEOA 4BR7A 2ZF5O 4BGBA 1JCGA 5BPNA 5E84A 5JLFA 3GL1A 1DGKN 2D1KA 3H1QA 2VYPA 1TUYA 5F2RA 2NRHA 4H0PA 5EXWA 1K8KB 4CI6A 3L0QA 3O08A 4CZKA 5AZJA 1GLJO 2YHXA 4O5FA 3P4IA 4WYBA 4YDUA 3UKRB 1KAZA 5AR0A 5BR9A 3GE1A 4K42A 2CGJA 1GLDG 4AM7A 4H0YB 1X9JA 5AQSA 3ZX0A 3M3ZA 4H5WA 5AQTA 3FZKA 4H03B 1BG3A 4ISGA 3HSCA 4IXCA 3TPQA 3H3NO 1NGGA 1HLUA 4BRFA 1XUPO 5AQJA 2QWMA 3DXKA 5AQMA 3MK6A 4B1YB 4F9OA 3LDOA 4PL8A 3QFUA 2P9SB 1U2VB 2GUPA 2E2NA 2P9NB 3TU5A 3H45C 5BRFA 2A6AA 5ADXA 1OKJA 2FF6A 5AZIB 4CZHA 2E2PA 3LM9A 5AQOA 4M63C 1KXPA 2HOEA 4M7XA 3CJAA 4IJAA 2FSKA 5F0XA 1JCEA 2V51B 2P9UB 2HMPA 3O5BA 2IVPA 2QWPA 1HJOA 1YUWA 1JCFA 1X3NA 5AQKA 2D4WA 5AQWA 3ZEUB 2YCHA 4QS7A 2YHWA 3VF6A 1ESVA 3MN5A 1HKBA 4CZEA 5CE3A 1TYQB 4BR4A 1MWMA 1NGIA 3DWLA 1MA9B 3HTVA 3RSEA 4QS9A 1HKGA 4H5NA 4MO5A 3M6GA 1BUPA 3CIPA 4M7YA 5AQIA 4QS8A 1Z6RA 3J8AA 2E88A 3JXUA 4A2BA 3CQXA 3WQUA 3ID8A 5AZJB 3A8YA 3HZ6A 2V7ZA 2A42A 4XH1A 3WEEA 1NMDA 2P9PA 2YHYA 4L3QA 5FPNA 1T6DA 4BROA 1QQMA 4BRPA 3QBXA 4LC9B 3QB0A 4JAXA 5F1XA 4EHUA 4B9QA 2P9IA 3UKUA 3U8XA 2QW9A 4BRAA 3FZLA 4CZIA 3GG4A 4FSVA 2Q0RA 3FE1A 4IO8A 3DXMB 1NGCA 5TKYA 1V4TA 3CQYA 3HBTA 2Q31A 4H0VB 3CJ7A 3ENOA 4A2AA 4CBUA 2CGLA 3SMPA 4IZ9A 4BRKA 4DHYA 2E1ZA 5JICA 1NWKA 1BA0A 5AQYA 1NGAA 3R6MA 3A5MC 3WQTA 5AQGA 1C0FA 4K41A 3SK3A 3A0IX 2Q36A 4FWQA 1BU6O 5KPZA 4BRLA 4BRMA 4H5RA 2E2OA 2Q2RA 2E20A 4PKGA 3QDKA 1C0GA 1BWFO 5BPLA 3VEVA 3EL2A 1V4SA 4H5VA 4B1UB 4DCHA 4HTLA 5KPTA 3C0BA 3QMLA 4BRDA 2KHOA 2I7PA 1EQYA 4FWSA 4JD2A 1YXQA 4K25A 2NZTA 1ZBSA 2P9KA 2UYTA 4ISEA 4BVPA 3R9PA 3KHYA 3BP8A 4FPBA 4CD1A 1BDGA 1Z05A 3VPZA 5EY4A 3GOIA 3VETA 5AQLA 2CGKA 3O1BA 2P9IB 3ULEA 5ADXH 2GELA 3UKUB 3EKUA 2W40A 3KVGA 3WXJA 5BRHA 3QICA 1WUAA 3CI5A 3LL3A 3CJBA 3GBTA 4XH5A 2Q1NA 4BC3A 3D2EA 3VEZA 4H0OA 2CH5A 1YVNA 3O6WA 1BO5O 4XH4A 3C7NA 1GLAG 3IDHA 3B8AX 5KPRA 2BTFA 3CJ9A 4CZMA 4PKIA 1LOTB 4RWTA 1WOQA 4C23A 1NGDA 3H6EA 4BC4A 3MMVA 5BN9A 3KZBA 2GTDA 5AQQA 3ZETA 4KBOA 1G99A 3EO3A 4CBWA 4BRNA 2QXLA 4IJNA 1LCUA 4Z94A 1RFQA 2FF3B 5ELZA 4I6MB 1TUUA 1GLBG 1NGHA 5AQRA 3VGMA 3CHWA 4BR9A 1HKCA 1SAZA 4MLHA 2D0OA 1IG8A 4WQ5C 5AQXA 3DJCA 3FGUA 1DKGD 4WQ4C 1E4FT 1QQNA 1T6CA 2E2QA 2Q0UA 3LDLA 4ISFA 5EOYA 4BGAA 1SZ2A 3MDQA 5JLHA 4JD2B 2PAVA 1HPMA 2P9KB 2ASOA 4BRCA 3D2FA 3FZMA 5KQ8A 1NGBA 4FWKA 5AQNA 1MDUB 1Q18A 4IWVA 1ATRA 2IVOA 3CJCA 3FZHA 3ULEB 1NBWA 3WUHA 2E8AA 5LY3A 1ZC6A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3NBPA 2QWOA 5AQFA 1S6QA 2P51A 2D0PA 1TV6A 3M1FA 4WFBL 1E4GT 3V1OA 4WFAL 3J80O 4HUEA 1QHAA 3NGZA 4JI6K 4CD3A 3NGYA 1NNEA 4RW7A 4MDAA 2PZSA 4JKGA 2VWBA 3A5NC 4IG3A 4BDZA 4FM1A 4WQ4A 1JLAA 1FJGK 1NKEA 4H0TB 4JYAK 3PLAA 3RR7A 4OKEA 3OYMA 3ZSQA 5FPEA 1WSFA 3MN9A 4EHTA 1TK0A 3ZSXA 1RDAA 2NRTA 3CC7N 1RBTA 1U2VA 4DTJA 3ZSWA 3OYGA 4W5TA 3NH0A 3O9RA 1LV5A 3P38A 4PKHA 4FO0A 5FRNA 3L2UA 1C1BA 2FC0A 3QERA 3RMCA 4BDPA 1S22A 1C0TA 3VF2A 3RMDA 5BN8A 3E9LA 4NYFA 1W97L 3AO5A 3OYBA 3MECA 3G0ZA 2QWRA 4OGEA 3ZEUA 3C6TA 2QWNA 1NK6A 4W5RA 3D0PA 3HM8A 4A59A 4BVOA 4LH5A 3AY9A 2AA4A 3VA3A 5AQUA 4FWRA 2KFNA 3LP0A 3DLHA 5FDLA 4OPAA 1Q82O 4CF8A 3VTHA 1SS6A 4CFAA 3K57A 4IEEA 3D7EO 3FFKB 4O55A 2NRXA 5LJVA 5FROA 4FLVA 4BR5A 1IBLK 1NKBA 3SUOA 1B9DA 1X9SA 5D3GA 4X62K 3QIOA 4YORA 2H3GX 3HXMA 1Q81O 3Q7BA 2BDPA 2ASPA 3QFPA 1L3SA 1GLFO 1QZ5A 4B1WB 1LWCA 2V7YA 4RCHA 2YJFA 3L2RA 4CBXA 2WONA 1HR0K 2RF2A 1JLEA 4DMNA 2YJEA 3LPTA 5E26A 3OYDA 4C8NA 3AV9A 3CG7A 3AA3A 4IKFA 1NK5A 3K5LA 4MO4A 3ZSVA 3ZCMA 3VGLA 3HK2A 4KRFA 1JLFA 4CZGA 1S6PA 1KQSM 1KLMA 4U67L 5BREA 1IBKK 1QZ6A 4CJKA 1S72N 2BGGA 3TSPA 3EE9A 4JI1K 4BWJA 4DV7K 3UB5A 2QM1A 2GEMA 4CJTA 4N5SA 2QTDA 3HVRA 1SL2A 4JI2K 2F9WA 4ZTJA 2NLXA 4FZZA 5B8HA 1WLJA 2WBNA 3SAGA 4BDYA 3CERA 4R79A 1JL2A 4EIAA 1KFDA 1DT9A 4KREA 3L4IA 1NK8A 2HHXA 5E41A 2A3ZA 2Y1IA 2OZSA 1S9EA 4JHDB 1YI2N 3ATUA 4CGFA 4H4MA 4OGCA 4KHNA 1R59O 3R8EA 4IOCL 3SJHA 3BF3A 3K5MA 2YNIA 3SPYA 1WNSA 2G8HA 2RE2A 4Z0UA 4E7JA 2V52B 3OYFA 4M3WA 3S3NA 3H08A 3AARA 4DU3A 2WFBA 4A5AA 2JWLA 1T44A 5AQVA 4E1MA 3A5LC 4GV9A 3SUQA 2AJQA 4DB3A 4DQIA 3FZFA 1X9WA 2OCEA 4JI7K 4AHVA 2HVHA 2FBVA 5J2MA 4RW8A 5KI6A 1DEJA 3JS6A 3AVMA 2ZF5O 5HP1A 1JCGA 4OPKA 1L3UA 4JRPA 3H1QA 2VYPA 4Y1CA 4IDKA 2NRHA 4H0PA 5J2QA 1KD1O 1GLJO 4WYBA 3UKRB 4CIEA 5BR9A 4JKGB 4K42A 4DSFA 3EZ5A 4DQPA 2YHAA 4FM2A 1X9JA 1VSKA 4CW7B 4GV6A 2PYLA 4H03B 1BG3A 4OJRA 2O4GA 4C8MA 5AJ3K 4DTXA 2QWMA 3ALYA 3DXKA 1RT4A 4CHYA 3SNNA 3E9PA 5C2DA 3HP6A 4RW6A 4PL8A 4FJGA 1U2VB 2P9NB 2A6AA 3KWGA 4JKHA 4AHSA 3TR8A 3LM9A 3S3MA 5GAHP 2HOEA 5F0XA 3K9JA 4CE9A 4CECA 2IVPA 3RTVA 2QWPA 1YUWA 5J1EA 3PSFA 2G8FA 4G9ZA 5AQKA 3ZEUB 3ZSZA 2HHWA 4DR7K 4HUFA 3VF6A 3OJSA 5CE3A 1TYQB 4FJHA 3PUFA 2B5JA 3THVA 4CEDA 3M8QA 4MO5A 3G71N 4NXMK 3M5RA 3CIPA 2QKKA 4QS8A 5CYMA 4DU4A 3LPUA 3JXUA 3LWLA 1NMNA 3OTOK 5AZJB 4ELUA 4CJ4A 1XC9A 1NMDA 1C6VA 2X78A 1J54A 1CZ9A 3ASMA 4NLCA 4BROA 1QQMA 1K73O 4CJFA 3KJVA 4JAXA 4CHPA 5F1XA 5EU7A 1D8YA 3PX0A 2XRIA 4B9QA 3SI6A 3THXB 3UKUA 4CJ3A 2NRRA 4M3YA 1YJNN 3BZCA 3ZT3A 4CJRA 3KWIA 1QVFM 2Q0RA 4KH5A 1KVBA 3TABA 3VQ9A 3TAPA 4C8KA 4KHYA 5CZ1A 4Q0BA 3SAHA 3CCEN 4FJ7A 3KLIA 4DHYA 3O3GA 4FJ9A 3KTQA 4FZXC 1RT1A 1YHQN 3V9ZA 1NGAA 3WQTA 3L2VA 3THWB 4KH6A 3V81A 3A0IX 2GUIA 4CJSA 4DTNA 2D0BA 4M45A 4H5RA 5LMNK 2Q2RA 5J2NA 3QDKA 1U4BA 4O44A 1HRHA 3NF6A 2NUBA 5LL6Z 3HPGA 4DTRA 1BWFO 4LFCK 4HTLA 4JI3K 2OPSA 4JEPA 4CEQA 2I7PA 1YXQA 1EWRA 4K25A 4CGGA 4AF1A 5MLCQ 2NZTA 1ZBSA 4OLBA 1BIUA 4BVPA 1UAXA 3R9PA 4B3SK 3KHYA 4CD1A 4FYDA 3MXIA 1Z05A 3VPZA 4DQSA 3HYFA 5EY4A 3P5JA 1NJXA 5ADXH 5HLFA 3KVGA 3QICA 4CGDA 4B9LA 2Q1NA 5DK5A 1VQLN 1LAWA 3TTDA 4XH4A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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