1TUYA

Acetate kinase complexed with adp, alf3 and acetate
Total Genus 132
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
132
sequence length
399
structure length
399
Chain Sequence
b'MKVLVINAGSSSLKYQLIDMTNESALAVGLCERIGIDNSIITQKKFDGKKLEKLTDLPTHKDALEEVVKALTDDEFGVIKDMGEINAVGHRVVHGGEKFTTSALYDEGVEKAIKDCFELAPLHNPPNMMGISACAEIMPGTPMVIVFDTAFHQTMPPYAYMYALPYDLYEKHGVRKYGFHGTSHKYVAERAALMLGKPAEETKIITCHLGNGSSITAVEGGKSVETSMGFTPLEGLAMGTRCGSIDPAIVPFLMEKEGLTTREIDTLMNKKSGVLGVSGLSNDFRDLDEAASKGNRKAELALEIFAYKVKKFIGEYSAVLNGADAVVFTAGIGENSASIRKRILTGLDGIGIKIDDEKNKIRGQEIDISTPDAKVRVFVIPTNEELAIARETKEIVETE'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Acetate kinase
publication title Structural and Kinetic Analyses of Arginine Residues in the Active Site of the Acetate Kinase from Methanosarcina thermophila.
pubmed doi rcsb
source organism Methanosarcina thermophila
molecule tags Transferase
total genus 132
structure length 399
sequence length 399
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.2.1: Acetate kinase.
pdb deposition date 2004-06-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00871 Acetate_kinase Acetokinase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1tuyA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1tuyA02
2ASOA 4H0PA 3CETA 3ULEA 3CJ1A 4H5WA 3UKRA 3ZETA 5AQYA 1R59O 3FZHA 4M7YA 5JLHA 1G99A 4CZGA 2YHXA 4RWTA 4H5VA 2E20A 4A2BA 1QQMA 2YI1A 4FOIA 4JD2A 4FPBA 5AQXA 1J6ZA 1NGCA 3W3DA 3BF3A 5AQSA 3A5NC 3AAQA 4WQ5A 4IO8A 2GUPA 3GDQA 2QWQA 4H5TA 1ATRA 2FF3B 4CI6A 3GL1A 1Z05A 4DHYA 3GE1A 1QZ6A 2NLXA 2D0OA 5LJVA 4K41A 5AR0A 1GLBG 1ZC6A 2P9SA 5FPNA 3L0QA 2QM1A 2P9KA 4JHDB 2Q2RA 3FLCO 4H0YB 2I7NA 1GLDG 3OHRA 1E4GT 1SZ2A 1BA1A 1OKJA 1SQKA 2P9UA 1KAZA 3IFRA 4EFHA 3U8XA 1YUWA 2FXUA 3EL2A 5AQLA 4JN4A 3TPQA 5BR9A 2YHYA 4BQLA 4FWMA 4FWSA 4QS8A 4PL7A 3C7NB 1ATSA 4CZHA 4BRIA 4BRDA 2CGLA 2GELA 4FWKA 1DGKN 4IJNA 2P9PB 4IZ9A 5AQTA 1X3MA 3QFPA 3VERA 4A62A 1DEJA 2IIRA 5AQRA 3O5BA 3LM9A 4FOEA 2CH6A 2HF4A 3CJCA 3C0BA 5AQIA 5EVZA 3ZETB 3CI5A 4IWVA 3H1QA 4ISFA 1C0GA 2V51B 5BPLA 2QWNA 3JS6A 3H3NO 2ZGZA 3L6QA 4FWOA 5JICA 3O6WA 3WEEA 4XH1A 4JD2B 2Q97A 2WUSA 2VYPA 3EKUA 3VEYA 3VGLA 1MWMA 3MDQA 4K42A 3BP8A 2V52B 1E4FT 5AZIA 4IJAA 4BG8A 4BR2A 2QWPA 4XH4A 5AQUA 4FL9A 3ATVA 5BRHA 3M3ZA 2GWKA 4LC9B 3LM2A 4BC4A 3DXKA 3HSCA 3MN5A 4CZMA 3QFUA 4WQ4A 1ZXOA 4HTLA 4MLHA 3TU5A 3WQUA 4BRAA 5TKYA 3ID8A 1NGBA 2P9SB 1Y64A 3C7NA 4BRPA 3FGUA 2VWBA 1NMDA 1DKGD 3VESA 4BGBA 2DPNA 1GLEG 4AM7A 2P9PA 3HM8A 4H5RA 4AM6A 1JCGA 5BPNA 3WQTA 4CZJA 3VETA 1IJJA 2P9UB 2UYTA 5FPMA 5JLFA 3M1FA 4CZLA 5I9EB 5AQHA 3VGMA 3CJAA 3MN6A 1TUUA 3EZWA 1NM1A 1T44A 2D4WA 3H45C 1QQOA 1HJOA 4FWQA 3CERA 3MMVA 5AZJB 5AQMA 4B1XB 1XC3A 5BREA 1KAXA 3D2EA 4BRNA 4EAHD 4C23A 3AARA 1V4TA 3FFKB 3W0LA 3WXJA 2F9WA 4FO0A 3GG4A 3HZ6A 5JMVA 2HOEA 2AP1A 2CGJA 4K25A 1BWFO 4GY2B 5KQDA 3VF4A 4BRHA 2E1YA 2A42A 3CIPA 3H3OB 1NGAA 3A5MC 3EO3A 3H1VX 3FZKA 3RSEB 3FR0A 3O4WA 4CBXA 1BUPA 2EWSA 1KAYA 2YJEA 3VGKA 2H3GX 5AQGA 3WEEB 3I8BA 4BRFA 3UKUB 1Q18A 3ENHA 1NGGA 5AFUA 1QHAA 4YDUA 3FE1A 1JCEA 2HMPA 3R9PA 1GLAG 5B8HA 4B1WB 5AZIB 3R8EA 1Z6RA 3A5LC 1JCFA 1WOQA 2CGKA 1TYQA 4ISEA 5AQQA 3IUCA 3CQXA 2V7YA 5BRDA 1IG8A 4B1ZA 1YVNA 3DXKB 3U4LA 1SAZA 2ZGYA 5AQJA 3BEXA 4RTFD 1K8KA 2GWJA 3H46O 2BUPA 1EQYA 1GLFO 3O1BA 4KBOA 5AZJA 3DJCA 5BPMA 5EXWA 1X3NA 4I6MA 4WQ5C 2E2OA 2IVOA 3ZX0A 5LJWA 3LDQA 4QS7A 4F9OA 1NGHA 1YAGA 4BR5A 2A41A 2Q0RA 3UB5A 2A6AA 3DAWA 1RFQA 4M63C 1QZ5A 2E2QA 3VEVA 1HX1A 2E1ZA 4RCHA 1S3XA 3I33A 3D2FA 1HUXA 3RSEA 3WUHA 2KHOA 2P9NA 3HI0A 4FWLA 4BROA 4BRCA 4FWNA 3UKUA 4BRKA 5BRFA 2A40A 3HTVA 4BR9A 4BR0A 4DB3A 3VENA 5EOYA 4CD1A 5AQOA 3D2EB 3FZFA 4M7XA 5CE3A 1BA0A 3GBTA 1XQSC 3QBXA 5ADXH 3ZEUA 5F2RA 2PAVA 5E26A 1MA9B 2D1KA 4BR4A 1RGIA 4IXCA 5KPRA 5AQFA 3G25A 3FZLA 1C0FA 4CZIA 2GEMA 3KZBA 3O8MA 5AQWA 3SMSA 3VEXA 1GLLO 2J4RA 4BQZA 3DXMB 1NLVA 3S41A 3F9MA 3CJ7A 2Q0UA 5ADXA 3U9DA 2ZF5O 1NGEA 1T6CA 4XEIA 3O80A 1P8ZA 3JXUA 2E2PA 1NGJA 3A0IX 3R6MA 4HWIA 4ISGA 3A8YA 4H03B 2QXLA 2F9TA 4JAXA 3SK3A 5KPTA 1H1VA 1TYQB 3QDKA 5AQKA 2QWMA 2FF6A 2P9LA 1NGDA 1U2VA 2Q31A 2E88A 1TUYA 3M6GA 1BOTO 4QS9A 1K8KB 2ASMA 1T6DA 2NZTA 4FWPA 4XH5A 2V7ZA 4PKHA 2HF3A 1MDUB 1WUAA 4I6MB 1HPMA 2FSKA 4O5FA 3FZMA 4PKGA 2FSJA 3KVGA 3J8AA 3MN7A 1BU6O 2P9IA 2E8AA 3ZX3A 5AFUH 3WXLA 3CHWA 4H0VB 3ZX2A 2VCPA 3U9ZA 3LDPA 5F1XA 3VEOA 4BC3A 3D2FB 1HKGA 3P4IA 2OANA 5KQ8A 5AQPA 4WQ4C 4DQ8A 4FSVA 3WXKA 2W40A 3LL3A 3DXMA 4BRLA 1S22A 1MWKA 2GTDA 2P9NB 4B1VA 4BRGA 3UE5A 4MO5A 3VF2A 4EIAA 2QWOA 3VEZA 3AAPA 5BN9A 4BC2A 2ZWHA 5FPDA 3H6EA 4FPAA 3BF1A 4WYBA 4CJ7A 4BVPA 1HKBA 5FPEA 3ZEUB 4BR7A 5EX5A 4BREA 2Q36A 3IDHA 4EHTA 3O08A 1ATNA 4MLEA 4B9QA 1QQNA 4Y0WA 1BG3A 2YHWA 5EY4A 3L4IA 2NRHA 4PKIA 2IVPA 3MK6A 5AQVA 2QWLA 4BG9A 3LDLA 1HLUA 4BVOA 1GLJO 4J8FA 2E2NA 3GOIA 4CD3A 4DCHA 3CJBA 1ESVA 2CH5A 4K43A 3QICA 2P9LB 3ENOA 2FLOA 1U2VB 4CZFA 2ITMA 2IVNA 1KXPA 3LDNA 1NWKA 1RDWX 4B1YB 3QMLA 1NGFA 4O8KA 5LY3A 5E84A 4CZEA 3EN9A 1YXQA 3SJHA 3WT0A 4H0TB 4Z94A 3CJ9A 1LOTB 3ATUA 4YDUC 1XUPO 4PL8A 2W41A 3ULEB 3UKRB 3B8AX 3DWLA 1BDGA 4NO7A 4H0OA 2P9IB 4CZKA 3QBWA 2YCHA 3VEWA 1CZAN 3QB0A 4CBWA 2PBDA 4CBUA 2FSNA 1BO5O 1X9JA 2A5XA 2QW9A 3MN9A 3HBTA 1GLCG 4NB4A 5KPZA 1V4SA 4JHDA 3A5OC 4A2AA 3O1WA 4BRQA 3MCPA 4BRMA 3VF6A 4A61A 3BUZB 4B1UB 1NBWA 5F0XA 2A3ZA 4BC5A 1U6ZA 4L3QA 2YJFA 3WXIA 3SLCA 1NGIA 4JNEA 4GNIA 4MO4A 2BTFA 3CQYA 2Q1NA 2I7PA 1ZBSA 2ASPA 3EKSA 5ELZA 3VOVA 4FWRA 1HKCA 3KHYA 4H0XB 2D0PA 3IMXA 4H5NA 5AQNA 3AY9A 3SMPA 3VPZA 4E1JA 3D7EO 2AA4A 5BN8A 5AQZA 4BGAA 2P9KB 1D4XA 2QWRA 4EHUA 1LCUA 3LDOA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1RBSA 3KKRA 3CETA 3CJ1A 3EE8A 4HVJA 4LSLA 1SV5A 4IO9L 5JLHA 1S6PA 2B4JA 4KV8A 2E4LA 4FJIA 4RWTA 2E20A 2RN2A 4KI6A 1L3VA 3TAGA 1EETA 4FOIA 4FPBA 4GVEA 3C94A 3QERA 4M3RA 2O8BA 3VQQA 1W0HA 3CG7A 4N47A 4LFAK 2GUPA 4HTUA 4JK9A 4B9TA 3ZSZA 3CM5A 1ATRA 1N6QA 1Z05A 1NG9A 2UUCK 4RG8A 1HNXK 3CYMA 2D0OA 2I5JA 5KRSA 4I9LA 2HSTA 2OZMA 4O5BA 4CGJA 1S1VA 3OYIA 2HMIA 2Q2RA 3FLCO 1M1KO 3SAGA 1MU2A 3K0SA 1VQ8N 1OKJA 2HB5A 3C65A 4EFHA 3U8XA 2FXUA 3TPQA 4WFAL 4ZTJA 1A5WA 5BR9A 2YHYA 3OYHA 4FWSA 4QS8A 4PL7A 4B9SA 1ATSA 4JKCA 3O9SA 3NF9A 3CMEN 2GELA 2Z1JA 4J2EA 2KW4A 4ILJA 5AQTA 4BWMA 3SV3A 5AQRA 3LM9A 3C0BA 5AQIA 5DM6L 1YTUA 3KK3A 2PZSA 4JK8A 1CZ9A 3NVMA 5C42A 2UU9K 1KTQA 4IKFA 4ICLA 2QWNA 3JS6A 4AHTA 3CCLN 2ZGZA 3L6QA 3L4QA 3SYZA 3SI6A 4XH1A 4X62K 4JV5K 2PFUA 2WUSA 5FDLA 1WN7A 3AO4A 5CR4A 2KTQA 3MDQA 3BP8A 4C1NI 3TI0A 4BR2A 4B9LA 4FLZA 3BZCA 4Y1DA 5M1FA 3I56N 4IDKA 4IOXA 5BRHA 2BDPA 5DK5A 3AVFA 1LV5A 3ID6A 1TKZA 1RDCA 1ZXOA 1NK7A 3HRGA 1QSYA 2VWKA 4AHSA 1NGBA 2EHGA 3FGUA 4CF0A 1DKGD 4DSEA 2DPNA 4IDHA 1GLEG 3J81O 3HM8A 4DU3A 2G8FA 3OBWA 5M1PA 4E7KA 1C1CA 1NJZA 4CZLA 3L2UA 4DTJA 3VGMA 1NK5A 1TUUA 3G10A 1WSHA 2D4WA 4LFCK 1QQOA 1VQ6N 1HJOA 4WFBL 3DM2A 3NGYA 4C8KA 2FBVA 4FWQA 3LPUA 4GKKK 2XY7A 5AQMA 4B1XB 1XC3A 2KFNA 4CJ4A 4BRNA 1T3VA 1IKVA 1Q9YA 5C15A 4EP5A 1KVAA 1NNEA 3GG4A 3TAMA 1KFSA 3EZ5A 2AP1A 2CGJA 4M3UA 5KQDA 1LWCA 1UWBA 5HL7L 3VF4A 4L8RB 3CCSN 1YT3A 1NGAA 1U47A 3H1VX 1BUPA 2EWSA 2YJEA 2QI2A 1W9HA 1I3AA 5AQGA 3CXCM 4J2DA 1JCEA 3DLLL 3SPYA 4B1WB 1Z6RA 1WOQA 2KFZA 3MEDA 4ISEA 4E7JA 3V1RA 1IG8A 4B1ZA 1VQ9N 3DLGA 1YVNA 3OYJA 1SAZA 5J2MA 2BUPA 2A1RA 1EQYA 1T7PA 3LAKA 4CVNE 3VQAA 2RF2A 4DQIA 1RTHA 2HBMA 5JS1A 3LDSA 3CF5L 1RDDA 4BE1A 4BACA 2NRXA 4QS7A 4JI5K 1WSEA 3CD6N 1YAGA 3C6TA 2A41A 2Q0RA 4M63C 1QZ5A 3VEVA 1C0MA 1W7AA 3I0RA 3RSEA 4LF9K 4CIEA 2UUAK 4DR4K 3B6OA 1FW6A 1QQCA 4FWNA 4F2RA 4DB3A 4DG1A 5EOYA 4CD1A 4DTOA 4CJSA 2QKBA 1QE1A 4OO1J 5CE3A 3FFIA 3O4QA 4FJKA 1K8AO 1XQSC 1QHTA 5ADXH 4CEAA 2KZZA 2BGGA 3WNEA 1KVBA 3L3VA 3FZLA 3RVCA 1C0FA 3VEXA 5JVGL 3C6HA 1SL0A 3S41A 1NLVA 3VQ8A 3CJ7A 5ADXA 2ZF5O 1HYVA 4AH9A 1T6CA 2HHTA 3N4QA 1LWFA 2F8SA 1NGJA 4HWIA 3A8YA 1QVGM 1B92A 3R3LA 1WBBA 1TV6A 2W42A 4KI4A 4OGEA 1H1VA 2RPIA 3CFRA 2QWMA 4C8MA 1U2VA 1TUYA 4FZZA 4W5QA 4DUZK 3CCJN 2ASMA 2WOMA 4DR2K 5M1NA 4FWPA 3ZSRA 3LWLA 1ITGA 4DV3K 4XH5A 1Q8IA 2D0CA 4O44A 3WNGA 1KFDA 1HPMA 2FSKA 4O5FA 3E66A 4DQSA 3J8AA 4U7BA 2O8FA 1HNIA 1RILA 4JKEA 3THWB 4FJHA 1DTQA 1RT1A 5AFUH 3WXLA 3CHWA 5IWAK 1HMVA 2VCPA 3LWMA 3U9ZA 3N4PA 3VEOA 5M1QA 2Z1GA 5AQPA 2DY4A 4ELVA 3WXKA 1NK0A 3DXMA 4BRLA 4E7IA 1Q82O 4CGIA 3M8SA 1XNQK 1RDAA 4MO5A 3MX5A 3AO5A 5JS2A 3AGRA 1LAWA 1GOCA 4LF6K 4PHTX 4GKJK 4FPAA 3OJUA 1HKBA 1S1WA 4JI4K 3O08A 1ATNA 4CGHA 4I2QA 1O1WA 5M1KA 2YHWA 4ILGB 5EY4A 3L4IA 2NRHA 1KD1O 2IVPA 4PWDA 4GVMA 3C95A 5AQVA 4FM1A 3KK2A 4BG9A 4LF8K 3M8PA 1NJXA 3KJVA 1KC8O 2HBJA 3QICA 1NKEA 3CCMN 3ENOA 1U2VB 1XNRK 2IVNA 4O0JA 4KTWA 2PYLA 1NWKA 1RDWX 4JKAA 2KZMA 5E84A 1VHXA 3EE9A 4BDPA 4CK2A 4GV6A 4H0TB 4Z94A 1JKHA 4KKOA 2B5JA 3E1YA 2KLAA 3CPEA 3OS2A 2W41A 3OA9A 4CE9A 3AO2A 3P38A 4KO0A 4F2SA 2O8FB 2VG5A 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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