1TWYA

Crystal structure of an abc-type phosphate transport receptor from vibrio cholerae
Total Genus 71
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
71
sequence length
249
structure length
249
Chain Sequence
SEITISGSTSVARIMDVLAEKYNQQHPETYVAVQGVGSTAGISLLKKGVADIAMTSRYLTESEAQNTLHTFTLAFDGLAIVVNQANPVTNLTREQLYGIYKGQITNWKQVGGNDQKIAVVTREASSGTRYSFESLMGLTKTVKDREVSDVAPTALVVNSNSMMKTLVNHNTQAVGFISIGSVDKSVKAIQFEKADPTSDNIAKHTYQLSRPFLILHYSDNADEQTKEFIAFLKSESAKKLIVEYGYIMP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein
publication title Crystal structure of hypothetical ABC-type phosphate transporter
rcsb
source organism Vibrio cholerae o1 biovar eltor
molecule tags Structural genomics, unknown function
total genus 71
structure length 249
sequence length 249
chains with identical sequence B, C, D, E, F, G, H
ec nomenclature
pdb deposition date 2004-07-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF12727 PBP_like PBP superfamily domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1twyA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1twyA01
3HO7A 4R9GA 5DVIA 3A3UA 5AE4A 2ZYNA 2Q89A 2QPQA 2RF1A 4NF8B 5HM4B 3T9HB 3KSJA 2PMSA 3K01A 5JTYA 3FV1A 1B2HA 2H9BA 2ESNA 3KFMA 1OQGA 1A8EA 2GFEA 4LONB 5A5XB 3CFZA 4R74A 2H25A 3IO6A 1ZMGA 2VGQA 1M5EA 3BKIB 2HAUA 3CSBA 4R6HA 4R75A 2XD3A 5J1DA 5JK4A 3EF7A 1B58A 3TTRA 2QS3A 3H03A 2QJEA 4PFTA 1M5FA 3HV1A 4OWDA 4MF3A 1II5A 4QFNA 3N5LA 3O2AA 1DMBA 4FJPA 4R9FA 1LAGE 1M5CA 5I2KB 3KN3A 1EZ9A 3UP9A 5FHMA 2XX9A 3IOVA 1DTZA 2O69A 3C33A 3I3VA 4MLVA 1R6ZA 1SW5A 1LSTA 1OVBA 4QSCA 3U94A 5EHMA 2V3TA 1B46A 2DWAA 3H06B 4PFWA 4DDDA 3MUQA 4IO2A 5IKBA 1LBCA 2F78A 2ZNTA 1MS7A 3VLWA 2Q88A 4F2OA 5AA2D 3PUVE 2PX1A 2ZXTA 2XXHA 2DYXA 4QFLA 3CVGA 4YB7A 4H8JA 1EU8A 3OMBA 2DS9A 5I57A 1L5TA 5ITOA 4FAJA 4YAHX 1UTBB 4RJZA 3SERA 1QVSA 4KFQA 3W15C 2B65A 5DVFA 5CMKA 2RCAA 2A5TB 2DE4A 3I6VA 1A40A 1OLCA 2RC9A 4OVJA 3JYRA 2F7BA 5F7VA 3DP6A 3RUMA 3S2VA 1MXUA 4U23A 2DOJA 2VP1A 4LQ5A 1Q35A 2OWSA 4XKQA 3SEUA 1SI0A 3KN8A 4IB2A 5DTBA 4YZZA 3L6HA 3WAFA 1NNKA 3H6UA 4GL8A 1IIWA 2P1SA 2AYSA 5ELVA 2VOZA 3RTWB 4Z7EA 2DQVA 4R73A 3O66A 4YKPA 1JQFA 3H6TA 4YB5A 3T9XB 1P1NA 5L9SA 4FE8A 3K6VA 4OFOA 3O6IA 3SEWA 1DPPA 4WXJA 2KLFA 1NNFA 1FQFA 3KBRA 1LFGA 1SBPA 3CRBA 1PB8A 2Q2AA 4IO7A 5JEIA 3KGCA 1XHYA 3TPAA 3B7DA 4OESA 3UN6A 3MZ9A 3DP8A 2DWJA 2I4BA 3MC2A 1HSJA 3TZAA 4GOTA 1M5DA 1MDQA 2ONSA 2V84A 5H8QA 4LZ7A 4G8MA 3RPWA 2QSXA 4AB6A 1MPDA 2DXRA 3PPQA 4BDLA 5B7DA 2OLBA 4KQPA 4H5FA 4LP2B 1XT8A 4KR5A 4KCCA 4U1ZA 3KN7A 4DLDA 3PMXA 1Y4CA 4NF4B 4XKRA 4ELOA 5H8SA 2OCUA 3O29A 3QSLA 1GTKA 5L9OA 3CG3A 1PDAA 5DEXA 1IEJA 4ISUA 3MVYA 3K1NA 5I58A 2F7AA 1B0HA 2X7PA 3TODA 3OO9A 1B7ZA 2O68A 3PUYE 4ZE9A 2A5SA 4GVOA 3EHUA 3MAMA 5FHOA 1BTJA 2UVIA 1GR2A 3GXAA 3H7MA 3GBBA 3OO6A 1JNFA 3V5AA 4G4PA 3T9VA 4R2FA 2O1MA 1D9YA 3R7XA 1B7UA 2AIXA 4C0RA 4AQ4A 2XXRA 4OHNA 1AH5A 4GRKA 4ND9A 1IXCA 2VHAA 1A55A 3ZS6A 1PB9A 2I4CA 1P99A 1IZ1A 1I69A 3EHTA 2QL3A 4R72A 1SW2A 3CG1A 4QFOA 4R2BA 4YKKA 1VR5A 3FVGA 3HSTA 5K2XA 1DSNA 3HN0A 1DTGA 2UVJA 4I62A 3N26A 3RLFE 1R9LA 3M3LA 4NF8A 3OD7A 3LR1A 4F3SA 3MPKA 2DE2A 4OERA 3O97A 2ALUA 4U4XA 3I5OA 2NWJA 1XOCA 2R6GE 4P11A 1JW4A 3FD3A 4LZ8A 5CMBA 1LBBA 1MH4A 4JWXA 3C9HA 2QS4A 3O6GA 3D4CA 4ZEKA 5CM6A 4RA1A 3S9LC 3Q29A 3RTFB 5I84A 4O3CA 3KOSA 3F11A 3LBSA 4IGTA 5TP9B 4KI0E 4OFJA 4OEVA 1MH3A 1ZBMA 1IUDA 3VVDA 3V83A 2XHDA 4XTCQ 3C35A 5HPQA 3EPEA 4F2QA 2Z23A 4NF5A 2UXAA 1ZU0A 5L9MA 4ZZEA 1TFAA 4ECFA 4Q0CA 3IB1A 2X26A 4RNSA 5DEXB 1B1HA 4P0IA 1MY0A 4Z0IA 4QSDA 1RYOA 4THIA 1PB7A 3CFLA 3TMGA 5I58B 4G68B 2RINA 2RC8A 3LSXA 4ZEIA 4YU0A 4FEDA 2V93A 4XKPA 2Z8EA 4WEDA 4RY1A 1MPBA 1JVYA 3RQTA 5ISUA 4DZ1A 4H0WA 1FQBA 3R26A 3U92A 1ZLQA 4OXVA 1B32A 4JSDA 5ICQA 3UK4A 4H6DA 2F35A 1XVYA 4ZZAA 4P0GA 3ZKKA 3TTNA 1FQAA 4F18A 3MP1A 1USYE 1UTBA 1H45A 4EXKA 3K4UA 3RGYA 3USDA 3GLBA 4ZEFA 3IOUA 1TT1A 2A5TA 1I6AA 5BWJA 2Q2CA 5ICTA 3TCHA 2D3IA 3HHGA 1LLSA 3K2DA 4MLQA 4F3PA 1POTA 4EF1A 1LB9A 2QS1A 2X7QA 1GV8A 1O7TA 1MM6A 4EUOA 1TXFA 1B52A 2UVGA 3CSGA 5KDTA 3TFLA 1MQGA 2CZLA 4L17A 1MY2A 1RKMA 1VFEA 1MY4A 3T9UA 3MZ1A 1BLFA 4H8IA 1MG1A 3CFXA 1SYIA 5AA2B 1FTOA 1US4A 3S9MC 1Y3NA 3ILTB 2BJJX 4UACA 3O6HA 4IO5A 5H8FB 4LATA 4OMBA 3VFJA 4G2ZA 4NF5B 2I49A 4WKMA 3K02A 3LSLA 3E4RA 2XX8A 4XKNA 3V8XB 4X1BA 2Q8JA 5CRYA 4TQUQ 1H44A 1Y1MA 5AA1A 2REJA 2OZZA 1VFDA 3TDJA 4DXCA 1DPEA 3H3GA 3U8QA 3K6XA 4IO6A 5AA3A 2DXYA 3K6WA 1MDP1 3SETA 3A09A 4NF4A 4OEUA 4I9DA 2B3FA 4GL0A 1SI1A 4X1DA 3ILUB 1D4NA 3MW0A 3BBRA 2O84X 4ONYA 1EZPA 1MQHA 4F1YA 4X48A 3MWBA 4IGRA 5FHNA 4RPOA 4FECA 2YLNA 3TCFA 4ZEDA 2NOOA 1GVCA 3FVKA 3T96B 1N0TA 2F6PA 1WDNA 2I0BA 4LUBA 3L6GA 2O7IA 2HQ0A 3PPNA 1P1WA 2OBGA 1ZKBA 3PD9A 4GD5A 2GHBA 4X9TA 4C1UA 5HBCA 3FJGA 1NMUA 3OELA 4MBPA 1SVXB 2VD2A 4HW8A 1ZJLA 1QUJA 3FIRA 5KDTB 4DXUA 3ONMA 5I59B 4EQBA 3K00A 4FEBA 3VVFA 1BIYA 4UA8A 2F34A 4U22A 4N07A 4JB7A 1URDA 1UIUA 1Y9UA 3B6WA 1FQEA 2I48A 2GHAA 3G7WA 3K1PA 1BP5A 4F22A 3VDFA 4BDOA 4GQOA 1AMFA 3TUSA 1I6QA 1UQWA 2HZKA 3MP8A 1Z7NE 3PU5A 3FVNA 3VXBA 5CBRA 3KEIA 3HCQA 5H8NA 5CC2A 1B7HA 3RY3A 3Q25A 5I2NA 2NXOA 3G3JA 3IB0A 4JXIA 4PFYA 2OJTA 4HS7A 1MXZA 2HAVA 1S7YA 3PPOA 4C1TA 4TLMB 1JVXA 2I58A 2Y7RA 5TP9A 1QKBA 2Q9TA 4DIGA 3ZSFA 5EHSA 4F3BA 4HCYA 1OQHA 2IEEA 5L8DA 5CI5A 2P2AA 4IY5A 4KCDA 4AB5A 2HEUA 4O3BA 3N6UA 1A7LA 4ESWA 4PP0A 4RXLA 3ECRA 2R9JA 5ITPA 1FCKA 4U2RA 3H4ZA 4QFKA 2XXPA 5AA4B 1LAHE 2HXWA 3W9WA 4QFPA 4G68A 3TQWA 2F36A 1B5JA 1N3XA 4ZS9A 4MH5A 4PETA 3E13X 1POY1 3EN3A 4O3AA 4GXSB 2HFBA 3LSWA 4G77A 3SDFA 1XC1A 4LQ2A 4Q5TA 2NVUB 2UVHA 1NNPA 2H98A 3UGWA 1JW1A 1QUIA 1LFHA 2D5WA 2O6AA 2XXQA 2AL4A 3S4UA 4ESXA 1MQJA 3QUFA 2ZYMA 1N04A 5CMMA 1A8FA 2XXWA 4TOZA 3G3HA 2QMWA 4ZECA 2FNCA 3U72A 2REGA 1YTVA 4OENA 1NFTA 3DLNA 4G8NA 1NKXA 5DVJA 1JETA 4YKIA 4JSOA 3IB2A 3QIMA 2QS2A 1QW0A 2XX7A 2RKMA 4NMYA 5H8NB 3PMVA 3FXQA 1B4ZA 4ELRA 1O64A 1H43A 4ZEBA 4OTEA 3FXRA 3IR1A 5I2NB 4Q8RA 1JEUA 4JDFA 4GXAA 3PV0E 3U93A 1H3DA 3IK6B 3PPRA 5K2YA 4OQOA 4E0WA 4NTLA 5EYFA 3PMWA 1QKAA 3TAJA 2W7YA 2I3VA 1SW1A 2G29A 5AA2A 1FTKA 4GLIA 3S9EA 1EH3A 1UTHA 4NF6A 4R6KA 4F19A 2F8DA 4N13A 1FQCA 5H8FA 4EQ7A 3ODBA 4GWOA 1LB8A 1VSOA 3HHFA 4EQ9A 3QK6A 2RCBA 3QYTA 5IAIA 3THIA 3O28A 3KG2A 3DP4A 4KD5A 4DXBA 4PFUA 4BDQA 1TWYA 2FYIA 2XXXA 5CBSA 3TTLA 3P7IA 4G8HA 2PYYA 4ZDMA 1ELJA 3IOWA 1URSA 3TKDA 2Z8DA 2O51A 3T22A 1ZTYA 3ZKLA 1OMPA 1OIBA 2Y84A 1SYHA 1NH8A 2WKYA 3VVEA 1T0KA 1QJMA 2ZYKA 3C31A 3PUXE 1ANFA 3PPPA 1LAFE 3IO4A 3IAZA 3R6UA 3BFUA 1USYH 3H6WA 3OOAA 4POWA 2RC7A 4LA9A 1AIVA 3MZBA 2B3BA 1F9BA 3OEKA 3W9VA 4Q30B 1JEVA 4F1UA 1XVXA 1N76A 3K1MA 3OSRA 1LCTA 1LAXA 5DYHA 1B3GA 2ZNSA 4ZE8A 3JZJA 4FORA 3S9NC 1GGGA 1SW4A 1B40A 5I59A 2DWHA 4HTGA 4OZ9A 1P1OA 2NUVA 1B1XA 1MQIA 4OYVA 1S9TA 4EDPA 1XS5A 3Q28A 4PQJA 2GRVA 1AOVA 2QMXA 4QRZA 3TCGA 1Q1KA 1UTHB 2HCAA 3EQ1A 4NF6B 4KHZE 4XXUA 1N84A 2ZYOA 4M4GA 2O1LA 3LC8A 3FUZA 3B6QA 3KJ7A 3CI8A 2V25A 4OETA 3SEXA 3E3KA 1H76A 3OSQA 5I56A 4MFIA 3PD8A 4POXA 4KYSA 4LZ5A 1B9JA 1FW0A 4NEDA 1PBPA 3VLUA 3HPIA 2Z22A 5FTHA 4F3GA 1FQDA 4DCXA 2GH9A 3VLVA 1NH7A 4IO3A 2YPNA 1HSEA 3KOTA 3N6TA 3GZGA 1MY3A 1MY1A 1UIVA 1Y20A 3VE1B 3Q26A 1IXGA 4H1XA 4RPNA 2Z8FA 2OWTA 1Z7ME 4BLAA 4NWDA 4DCYA 1Y4TA 1LGBC 3FZVA 1LFIA 1US5A 5AA4A 2XXTA 4NWCA 2F7CA 3A3CA 4YB6A 2O7UA 4I8CA 4YKJA 1P1UA 5KZTA 4EF2A 1VE4A 5KCJB 4R6YA 1PEBA 2V3QA 3KJTA 2DWIA 2DP8A 2PT1A 1CB6A 2I0CA 1SDXA 3IORA 3FVOA 4QF9A 3RT6B 1WODA 1P1QA 5H8HB 2FA7A 1YAEA 3IJOB 3G3IA 1MPCA 2ANJA 3TTMA 3MP6A 3C32A 4KPTA 4JWOA 4KYEA 4GFRA 1DOTA 3D4GA 2H5YA 4RYAA 5TPAA 2H99A 3QUJA 1PC3A 1KWHA 3UA8A 4F31B 5JTYB 1N7WA 4EXLA 1B3FA 2F5XA 3TTKA 3RT8A 2XXUA 1B51A 1AL3A 3UIFA 1B3LA 1TFDA 3G3KA 3M3KA 5F1QA 3IX1A 2I6EA 5I56B 1IQ7A 3VXCA 2DVZA 2YJPA 3PUZE 3MVZA 1MM7A 2F97A 4H67A 3MVWA 1D3KA 3TQLA 4RK9A 2XXYA 2G93A 4KYDA 4RK2A 1B3HA 3SKPA 3MQ9A 1SD3A 3PGFA 4FATA 1Y1ZA 3SESA 3WAEA 4U21A 4NE4A 3U1OA 1CE2A 1B0LA 2Y7KA 3FJMA 3VV5A 1B05A 3DM0A 2Y7WA 1QUKA 4ELQA 4BDRA 1MQDA 3MVXA 4U4SA 1MXXA 4K3FA 4LVQA 1LCFA 4JBZA 3TEPA 5I57B 4ELPA 3B6TA 4IO4A 3OXNA 3FGSA 2E0SA 2I3WA 2OK2A 1MXYA 1MXVA 3LSFB 3EHSA 2CMOA 2THIA 5M2VA 3E9XA 4G68C 2HZLA 3LUYA 3OO7A 3CIJA 5TPAB 2H4IA 1EZOA 1N3WA 4U1OA 3M3FA 3BFTA 1IITA 4YICA 3JV9A 1B5IA 5DT6A 3RN8A 2VD3A 3OEMA 1FTLA 1MRPA 2XXVA 3G3GA 1B3EA 3IJXB 3K0VA 2P0SA 4PE5B 4TLLB 2PVUA 4YMAA 2ZMBA 4E0XA 4FIMA 3KSXA 3C34A 3KZGA 1M5BA 1R9QA 3T93B 1SQYA 3QAXA 1RYXA 3G3FA 1HSLA 3GBAA 4I1DA 5FTIA 3K6UA 5TU0A 4DE8A 2XXIA 1S50A 2ZNUA 4F39A 1A99A 2AL5A 1B5HA 2Y7PA 3UORA 5H8QB 3FJ7A 1Y3QA 1JW5A 1Y3PA 5A5XA 1ATGA 1NL5A 4BDMA 2V3UA 1MXWA 4QSEA 4BDNA 1A54A 2ONRA 3MPLA 4M1VA 5B70A 1OVTA 1O63A 4XIGQ 1NNTA 4N6PA 1ZIUA 3O9PA 3FATA 4HCWA 1D9VA 1B4HA 2DSFA 2DVCA 4GIZA 2D21A 3FV2A 3H6VA 1N7XA 4H5GA 2QRYA 1YCJA 3RNNA 2Y7IA 3M8UA 2ONKE 1BKAA 3CR9A 4QHQA 3T66A 1I6BA 3C4MA 4OFLA 1IXHA 2IA4A 5I2KA 3Q27A 3DELB 1URGA 4F29A 3SEVA 3C36A 4IY6A 1FTJA 2UYFA 4F1VA 2LAOA 1WVJA 5BUUA 2PBWA 4H65A 3SEYA 1J1NA 1QULA 2M8CA 2F6GA 4GF8A 1YPNA 5LOMA 2R71A 3QXMA 2DE3A 5CMCA 1PBQA 3V89B 3TYHA 1OLAA 2ABHA 4YMBA 1IXIA 2XD2A 3AXFA 3PUWE 3MBPA 3TELA 3IL1B 3OO8A 3OENA 3IOTA 1B6HA 5KCJA 2PT2A 3FASA 2E1SA 1R1NA 4JWYA 3N94A 3MJNA 1FTMA 5H8HA 4WEPA 2UYEA 3FXUA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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