1TXFA

Crystal structure of the glur5 ligand binding core in complex with glutamate at 2.1 angstrom resolution
Total Genus 83
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
83
sequence length
248
structure length
248
Chain Sequence
TLIVTTILEEPYVMYRKSDKPLYGNDRFEGYCLDLLKELSNILGFLYDVKLVPDGKYGAQNDKGEWNGMVKELIDHRADLAVAPLTITYVREKVIDFSKPFMTLGISILYRKGTPIDSADDLAKQTKIEYGAVRDGSTMTFFKKSKISTYEKMWAFMSSRQQSALVKNSDEGIQRVLTTDYALLMESTSIEYVTQRNCNLTQIGGLIDSKGYGVGTPIGSPYRDKITIAILQLQEEGKLHMMKEKWWR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Crystal structures of the GluR5 and GluR6 ligand binding cores: Molecular mechanisms underlying kainate receptor selectivity
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Membrane protein
molecule keywords Glutamate receptor, ionotropic kainate 1
total genus 83
structure length 248
sequence length 248
ec nomenclature
pdb deposition date 2004-07-04
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1txfA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1txfA02
1L5TA 3RT8A 2O7IA 1DMBA 3KN8A 4IY5A 4NWDA 3DELB 4P0GA 5DVJA 3VV5A 5JTYA 1B3GA 3QAXA 3S9NC 2AIXA 4F31B 3ZSFA 4NF8B 3IJXB 5A5XB 2VHAA 5AA4A 2UVIA 4R6HA 4ZZEA 4ESWA 4R6YA 4F29A 3PPNA 3PUVE 4NEDA 2G29A 4BDNA 3OSRA 1R9QA 1IXGA 3H6VA 4Z7EA 4QFNA 3THIA 2H9BA 5AA1A 4EF1A 3M3LA 4KFQA 4ECFA 2Q9TA 5I56B 4RA1A 3KG2A 2HAVA 1PBQA 1LAHE 1LGBC 3MUQA 2XX9A 4FORA 2DP8A 2RC9A 3T66A 4LVQA 2ZYNA 4EDPA 1MXUA 1S9TA 4H1XA 1Y4TA 2DOJA 2H25A 3JYRA 3E4RA 4XTCQ 3OO8A 3N6UA 5KDTB 2DWIA 5AA4B 2DE4A 5A5XA 3LSFB 1QKBA 4AB5A 3H6WA 2NWJA 2Q8JA 4R9FA 3MPLA 1II5A 4KQPA 1SDXA 1Y9UA 3PMWA 1OLAA 2UVGA 1PB8A 4G8MA 4NF5A 3EQ1A 4C0RA 4YMAA 2UYEA 1MQGA 2XXIA 1B58A 1IXIA 3R6UA 3SEUA 3FJ7A 3MZ1A 4G77A 5H8FB 1NH7A 3N5LA 5AE4A 3V8XB 3SEWA 3ZS6A 4XKQA 4I9DA 4YICA 1IXCA 2Q2AA 3E3KA 2O51A 4JWYA 2R9JA 1ZMGA 4G2ZA 2NVUB 2DS9A 2VGQA 3TKDA 1D9VA 4I62A 3H06B 1N7XA 3H6UA 3ZKLA 2V3QA 5IAIA 3TPAA 3PUYE 1LAXA 5JK4A 1GGGA 3KJ7A 4LONB 2YLNA 4M4GA 1HSJA 4TQUQ 1B7ZA 3V83A 1AMFA 1JEUA 4FE8A 3KEIA 2QMWA 3RGYA 3FV2A 3KSXA 4BLAA 4QRZA 2F6PA 2A5SA 1OLCA 4OERA 3RQTA 4YKPA 4O3BA 4ZE9A 2DWAA 3DLNA 3MWBA 3S4UA 3V89B 1SVXB 2OWTA 2XD3A 2B65A 4G4PA 1LB9A 3MZ9A 4HS7A 1PB7A 2LAOA 3QK6A 1PB9A 4OWDA 1LB8A 3IR1A 1NH8A 2Y7WA 2I3VA 3GLBA 3IB0A 4IO6A 4EQ7A 3U92A 4DIGA 5H8NB 4XKNA 4MFIA 2I3WA 3W9VA 3CSBA 2ZMBA 3CG1A 3MQ9A 3HPIA 3PPQA 4POWA 4PFTA 2H99A 1LFGA 1MRPA 3G3FA 1XVXA 1LCTA 5AA2B 1FTOA 3QYTA 1LCFA 5L9OA 3FXQA 1B0LA 2XXYA 3MPKA 3AXFA 4L17A 4ZS9A 4FAJA 1N84A 4YMBA 4HCWA 2O68A 3SETA 2I0CA 1AH5A 3GBAA 1MXZA 3UORA 5I58B 5H8FA 1FTMA 1YPNA 2THIA 4H8IA 4U1ZA 3MP1A 4JBZA 3I6VA 4LUBA 4NF5B 2GHAA 1USYH 4F2QA 1B4HA 4JDFA 5EHSA 2GH9A 1LBCA 2QSXA 4GQOA 3BKIB 3IX1A 3B7DA 2HQ0A 2Y7IA 4Q30B 1P1UA 3OOAA 5HBCA 3O66A 1BKAA 1B3HA 3EHTA 3KN3A 1UIVA 4ISUA 3TMGA 3DP4A 3RPWA 2Z22A 2D3IA 4GOTA 3KZGA 3LSXA 2ANJA 4U2RA 1FQEA 2RCAA 2VD2A 2E0SA 1QW0A 3HSTA 4DCXA 4EF2A 1TWYA 3I5OA 2A5TB 5I56A 5I57A 1B4ZA 2PBWA 1MY2A 4KPTA 4OFJA 1TFAA 3K00A 4ELRA 1VFDA 4F3GA 3IOWA 3PU5A 1MXXA 5FHMA 3EHSA 2DWJA 1MH4A 1A54A 2VD3A 2X7PA 3CVGA 2YPNA 3E13X 1MXWA 1FQAA 1H44A 1IXHA 3K02A 3Q25A 4JXIA 4OETA 4POXA 4YB5A 3TQLA 4WXJA 2F97A 3FVGA 1PBPA 3FVOA 1D3KA 3A09A 2DXRA 1JVXA 4O3CA 5JTYB 5JEIA 3OELA 4H5FA 3HN0A 2DWHA 5CRYA 4C1UA 5F1QA 3TFLA 4LA9A 3UA8A 2F5XA 3K1PA 4DCYA 2I49A 2YJPA 1P1QA 4P0IA 2B3FA 4FEBA 1JETA 3MJNA 3MVXA 1OVTA 2OWSA 1EZ9A 3HCQA 1VFEA 3FXRA 3IL1B 1LBBA 3FASA 4Z0IA 4GXSB 4MF3A 3SKPA 3TTKA 1FQFA 2GHBA 2VP1A 2DVCA 1TT1A 3H03A 3K6XA 4BDOA 4F3BA 5ITPA 3EF7A 1QUIA 1LFIA 1BLFA 4G8HA 1Y1MA 2OK2A 4PFUA 2FNCA 2Z8DA 1UTHA 1HSLA 2V3UA 4FJPA 2Y7PA 4OEVA 1B6HA 3SEVA 3IO4A 4GIZA 2REJA 1N3XA 3D4GA 3TCHA 4F3PA 1ZLQA 4GL0A 3FVNA 1BTJA 1BIYA 2ONRA 4YB7A 4Q5TA 1FCKA 2H5YA 4XKRA 1H3DA 4FIMA 1I6AA 2A5TA 4E0WA 1H76A 2OCUA 2Q88A 3ONMA 4QFLA 1P1WA 1MXYA 1QJMA 4OVJA 4PFYA 3U8QA 4PETA 2O6AA 4G68A 1IEJA 1URGA 2KLFA 2F34A 1B46A 3OO9A 4QFKA 4XXUA 4EXKA 2OJTA 4F1YA 3OD7A 3LC8A 3EN3A 3N26A 2DQVA 4YB6A 3TCFA 3M3FA 4WKMA 4R75A 4DDDA 5B7DA 1DOTA 1I69A 1DTZA 5KZTA 2HCAA 4LZ8A 1B32A 3FVKA 3TTMA 3K1MA 1B0HA 1MQJA 3PGFA 1R6ZA 3KN7A 4R2BA 4U4XA 4K3FA 4F2OA 1LFHA 4O3AA 2AL4A 3FV1A 1MDP1 1A99A 2RKMA 3GXAA 3PUZE 4R74A 1B1XA 1GVCA 2H4IA 2ONSA 4ZZAA 5FHOA 1B7UA 2ESNA 4ZEKA 3C34A 1NMUA 1NL5A 4PQJA 4ZECA 5KCJB 1P1OA 3PPRA 1YAEA 5FTHA 4IO2A 1MQDA 4G68B 2XXVA 5AA2A 1JNFA 1PC3A 5B70A 3FIRA 3IO6A 5HPQA 2RF1A 5FTIA 3T9XB 2HXWA 2PYYA 1OQHA 3FXUA 3OEKA 3P7IA 5H8QA 3KGCA 2XX7A 3CIJA 1MS7A 4N13A 5I59A 3O97A 4QHQA 1NNFA 2G93A 2O7UA 1R9LA 1ZKBA 2XXXA 3SERA 4DXUA 3IAZA 3C4MA 2Y7KA 3BFTA 3G3KA 5M2VA 3U72A 1B3EA 2IEEA 3F11A 3H3GA 1CB6A 1EH3A 4HCYA 4MH5A 3PPPA 1WDNA 5EYFA 5L8DA 3A3UA 1SQYA 4NE4A 1EZPA 1OVBA 1MQHA 1UTHB 4EUOA 3W15C 3RTFB 2ZXTA 2ZYKA 5ITOA 1UIUA 4JWXA 1ATGA 4M1VA 3ZKKA 4BDMA 1IQ7A 1XHYA 1MY4A 2DVZA 4I8CA 1P99A 4GL8A 1B5JA 1XOCA 2P0SA 2RC7A 3K6WA 4U21A 4U1OA 3PMXA 3LSLA 3VXBA 5I2NB 3TELA 3D4CA 4AQ4A 4RNSA 1MDQA 1NNPA 1QUJA 3O6IA 3O9PA 1FW0A 1MXVA 1SD3A 3Q27A 2Z8FA 1RYOA 2I4BA 4R72A 4TLMB 1A8FA 4RY1A 3L6HA 3DP8A 3CFZA 2ABHA 4XKPA 2CZLA 4DLDA 2F7CA 3PD8A 4F1UA 5AA2D 1POTA 2GRVA 2OBGA 1Y3PA 3TODA 3GZGA 2OZZA 2QMXA 1VE4A 1TXFA 3FJMA 3C31A 3IOUA 3PUXE 4OQOA 1DPEA 5HM4B 3FATA 3LBSA 4KYDA 4GF8A 5L9SA 4GRKA 3TDJA 1ZIUA 4GVOA 1Q35A 1QVSA 4IGTA 3KOSA 2VOZA 2DXYA 3H7MA 4FEDA 2P2AA 1B5HA 1RYXA 3HV1A 3PUWE 1Z7NE 5AA3A 3SDFA 4OMBA 1D9YA 2F35A 2NUVA 2R6GE 3K4UA 3G7WA 4GXAA 4RYAA 4X9TA 1B2HA 3MVZA 3R7XA 1B05A 1JW4A 2PT1A 5K2YA 3HHFA 5CMKA 4HTGA 1UTBA 2QS3A 4H6DA 1SW1A 2XX8A 1S7YA 3RN8A 1JVYA 3IB2A 3VLUA 3VLVA 4JSDA 4U23A 3CI8A 4KHZE 1DSNA 4NF6B 1M5EA 1JEVA 2CMOA 4FECA 4NWCA 1Y4CA 4IGRA 5CMMA 5I2KA 5DVIA 3VDFA 5I58A 3T96B 3K2DA 3CFXA 3FJGA 4KCDA 4X48A 4NF4A 3TAJA 1B3LA 3RUMA 3VVEA 5I2NA 4TOZA 4YKIA 1B3FA 2I6EA 3IB1A 3FUZA 2XXRA 3MC2A 4PFWA 2R71A 1N0TA 3SESA 1PEBA 2V93A 4R2FA 1O64A 1GR2A 1MG1A 3DM0A 1USYE 4TLLB 4X1DA 5L9MA 3RY3A 3CFLA 2UVHA 1US4A 1Y3QA 4G8NA 3W9WA 1Q1KA 1NNKA 1SW2A 2B3BA 1POY1 4RPOA 2Y84A 5H8NA 2PT2A 4ZDMA 4ZEDA 1SYIA 2REGA 4H67A 5H8HB 4GD5A 1KWHA 2RINA 2ZYOA 4THIA 3JZJA 1R1NA 4OEUA 3PD9A 4LP2B 5DVFA 2DYXA 2HAUA 4KCCA 4GFRA 4QSEA 4ND9A 4G68C 2O1LA 3CR9A 3RT6B 3USDA 2ZNTA 1URDA 3FD3A 3Q26A 4KYEA 3TQWA 3UGWA 4FATA 1MQIA 4EQ9A 1AL3A 3QUJA 2HEUA 1A55A 2XXPA 1I6BA 1MPBA 1SW5A 3BFUA 4I1DA 4F3SA 3G3GA 1AOVA 1N3WA 4OHNA 1SBPA 2Z23A 3B6QA 3TTNA 5KCJA 1MM7A 4U22A 1XVYA 1A40A 3U1OA 1FQBA 5ICQA 5H8SA 1Y1ZA 1OIBA 3C33A 3G3JA 3IOVA 3MVYA 4KYSA 4NF4B 4YU0A 5DT6A 3S9LC 3IOTA 3RNNA 3QIMA 4YKJA 4Q8RA 2V84A 3K0VA 2Q89A 4N6PA 3RLFE 3KJTA 4XIGQ 5I2KB 2X7QA 1BP5A 1LAFE 1OMPA 2DE3A 4NF6A 1A8EA 3VE1B 4C1TA 3C35A 1J1NA 2QRYA 3C9HA 4MLQA 3M8UA 2UVJA 2E1SA 3PV0E 2XXWA 1UQWA 1B40A 5J1DA 2O1MA 2QS2A 1UTBB 1ZBMA 4Q0CA 1QULA 2H98A 2AYSA 1B1HA 1M5FA 3QXMA 4HW8A 4DZ1A 3B6WA 1H45A 4JWOA 3UIFA 4QSDA 5KDTA 3GBBA 3S9EA 3MP8A 3TUSA 1LSTA 4UACA 5TU0A 1ZJLA 3B6TA 4RK9A 3I3VA 3T93B 3WAFA 1IUDA 1QKAA 3S9MC 2BJJX 5FHNA 1LLSA 2IA4A 2Z8EA 3H4ZA 4QFOA 3DP6A 4DXCA 1M5BA 2Y7RA 1D4NA 2M8CA 4RK2A 3OXNA 3T9UA 4E0XA 1Y20A 3IK6B 4LATA 1N76A 5CI5A 1URSA 5CM6A 1IIWA 1HSEA 1TFDA 2F8DA 3LSWA 3O28A 1NKXA 4ESXA 1WVJA 3TEPA 2I48A 3OO7A 4X1BA 1QUKA 3PPOA 3T9HB 2P1SA 1Y3NA 4NF8A 1SI1A 4QF9A 4BDQA 4R9GA 4F18A 3S2VA 3T9VA 2PVUA 2XD2A 1A7LA 4LQ5A 3SEXA 3TYHA 3G3HA 3UN6A 3IORA 3TTLA 3OEMA 1CE2A 2I4CA 3ILTB 2DE2A 1B51A 1EZOA 3UP9A 2RC8A 1ANFA 1F9BA 1SYHA 4U4SA 2PMSA 4F22A 4QFPA 5DEXA 1FQCA 1M5CA 5EHMA 5CMCA 3KFMA 4YZZA 4ZEBA 1IZ1A 3K6VA 2F7BA 1NNTA 1I6QA 1MPDA 3O2AA 2ZNSA 1MY0A 2QS1A 5DEXB 4OFOA 5BUUA 2XXUA 3OENA 5BWJA 3R26A 4IY6A 1H43A 3TTRA 2XXTA 3ODBA 5CBSA 1MH3A 2AL5A 1GV8A 1DTGA 3TZAA 3HHGA 3MW0A 2DSFA 2OLBA 3CG3A 4R73A 1VR5A 1B7HA 3MBPA 3SEYA 1SI0A 3E9XA 4PE5B 2PX1A 3OO6A 3L6GA 4ONYA 1S50A 1XC1A 5TP9A 3KSJA 1EU8A 3LUYA 4MLVA 4ZE8A 1MPCA 1US5A 4WEDA 3VFJA 3CSGA 2GFEA 5K2XA 2ALUA 5I59B 4JB7A 4KR5A 5IKBA 2UYFA 1RKMA 4IO3A 4H65A 5I57B 5DYHA 4F19A 5H8QB 1ZTYA 1NFTA 1WODA 2XHDA 2I0BA 2HFBA 2FA7A 4GLIA 5ELVA 1O63A 4ELQA 5ISUA 4BDLA 3C32A 3ECRA 3O6HA 3K6UA 4PP0A 2QPQA 2NOOA 4N07A 3UK4A 4YAHX 4OYVA 3QUFA 3VXCA 3H6TA 3O6GA 4H5GA 4RXLA 1O7TA 1YTVA 1YCJA 1MM6A 3O29A 4OFLA 3JV9A 5TPAA 2F7AA 3HO7A 4DXBA 2QL3A 4NMYA 5TPAB 5CC2A 1AIVA 3U94A 1FTKA 3EPEA 2O69A 1JQFA 2F36A 2ZYMA 3Q29A 4R6KA 4EQBA 1P1NA 1ZU0A 4WEPA 4F39A 3ILUB 1B5IA 3FGSA 3CRBA 1FTJA 1MY1A 2V25A 4RJZA 2W7YA 3EHUA 3K01A 1ELJA 1GTKA 1MY3A 2X26A 4H8JA 5ICTA 2UXAA 1XS5A 4KD5A 1VSOA 1FTLA 3N94A 2HZKA 2ZNUA 4RPNA 4P11A 4LZ5A 2F78A 2D5WA 2FYIA 3K1NA 4OZ9A 4ELPA 3PMVA 4UA8A 2O84X 4IO4A 4OXVA 3KBRA 3WAEA 3OSQA 4LQ2A 4BDRA 1DPPA 3KOTA 3MP6A 2V3TA 2NXOA 4IO5A 1JW1A 3QSLA 4EXLA 1PDAA 3RTWB 1B9JA 5TP9B 1T0KA 4NTLA 3MZBA 4IB2A 2XXHA 1M5DA 2XXQA 5H8HA 2WKYA 2ONKE 2HZLA 2Q2CA 4AB6A 1JW5A 4QSCA 1B52A 3T22A 3VLWA 3VVFA 1N04A 5CMBA 1IITA 5F7VA 2I58A 3M3KA 3MVWA 4IO7A 4OTEA 3V5AA 4DE8A 3BBRA 4OESA 3TCGA 4F1VA 2D21A 4ZEFA 3FZVA 4MBPA 4YKKA 3A3CA 2QS4A 3U93A 4H0WA 5CBRA 5LOMA 4KI0E 5I84A 3G3IA 2QJEA 3MAMA 4GWOA 1Z7ME 1LAGE 4LZ7A 5DTBA 3LR1A 3C36A 2RCBA 4ZEIA 1FQDA 4ELOA 1OQGA 1XT8A 4JSOA 3OMBA 4OENA 3VVDA 1N7WA 3N6TA 3Q28A 3IJOB 1SW4A 2F6GA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1DMBA 4NWDA 3QAXA 3S9NC 4R6HA 4MNPA 3PUVE 4NEDA 1R9QA 4QXDA 1LGBC 2RC9A 1MXUA 1LBYA 3E4RA 4XTCQ 3OO8A 3N6UA 5KDTB 5AA4B 3PMWA 2UVGA 3SEUA 5H8FB 4G77A 1NH7A 3N5LA 5AE4A 3ZS6A 4NAPA 4P47A 2R9JA 1FJ9A 2NVUB 2VGQA 3H06B 3ZKLA 2V3QA 2XA5A 3TPAA 1GGGA 3KJ7A 2YLNA 4M4GA 1B7ZA 3RGYA 3KEIA 4BLAA 2GQ1A 3FV2A 2XWVA 3RQTA 5EQ9A 4NQ8A 3S4UA 1SPIA 3V89B 2PFZA 1SVXB 2OWTA 2XD3A 4HS7A 4G4PA 4X9TA 3MZ9A 5ICQA 1PB9A 1LB8A 4HXVA 3IR1A 3GLBA 4PC9A 3U92A 2CEXA 2QFLA 4DIGA 4O7IA 3CG1A 3MQ9A 3PPQA 4PFTA 1FPJA 1MRPA 3G3FA 1XVXA 1B0LA 4HCWA 3UORA 3GBAA 5I58B 4H8IA 1NUWA 3MP1A 4PGNA 4GWUA 3BKIB 3O66A 3KN3A 3EHTA 3TMGA 3DP4A 2ANJA 5EQ8A 1K9ZA 1QW0A 1AWBA 1TWYA 4GBWA 1JP4A 3K00A 3EHSA 2DWJA 2X7PA 4POXA 1H44A 3Q25A 1PBPA 1D3KA 3A09A 5JTYB 4H5FA 2DWHA 5CRYA 5IZ1A 4C1UA 4DCYA 1DBZA 1P1QA 4P0IA 2B3FA 1VFEA 3SKPA 2GHBA 4F3BA 5ITPA 4G8HA 4FJPA 2QVRA 3D4GA 2VT5A 3FVNA 1BIYA 4Q5TA 1H3DA 1I6AA 2A5TA 4EXKA 2OJTA 3OD7A 4YB6A 2ZZVA 5B7DA 2HCAA 4LZ8A 1B0HA 4O94A 1R6ZA 1MDP1 1GVCA 3ISPA 4ZZAA 4ZEKA 4DI3D 1NL5A 3MSTA 5B70A 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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