1TXFA

Crystal structure of the glur5 ligand binding core in complex with glutamate at 2.1 angstrom resolution
Total Genus 83
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
83
sequence length
248
structure length
248
Chain Sequence
TLIVTTILEEPYVMYRKSDKPLYGNDRFEGYCLDLLKELSNILGFLYDVKLVPDGKYGAQNDKGEWNGMVKELIDHRADLAVAPLTITYVREKVIDFSKPFMTLGISILYRKGTPIDSADDLAKQTKIEYGAVRDGSTMTFFKKSKISTYEKMWAFMSSRQQSALVKNSDEGIQRVLTTDYALLMESTSIEYVTQRNCNLTQIGGLIDSKGYGVGTPIGSPYRDKITIAILQLQEEGKLHMMKEKWWR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords Glutamate receptor, ionotropic kainate 1
publication title Crystal structures of the GluR5 and GluR6 ligand binding cores: Molecular mechanisms underlying kainate receptor selectivity
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Membrane protein
total genus 83
structure length 248
sequence length 248
ec nomenclature
pdb deposition date 2004-07-04
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1txfA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1txfA02
1IZ1A 3DELB 3IJXB 2VGQA 4HTGA 1US4A 1LB9A 2WKYA 4YKKA 5H8FB 4GF8A 1OQHA 1H43A 3IL1B 5HPQA 5FTIA 3ODBA 1PDAA 1YAEA 1D9VA 1EZPA 2OK2A 4P0GA 3SEVA 3IO4A 2UVHA 5KZTA 3C31A 1VSOA 4IO5A 1Y9UA 1B7HA 1NL5A 3A3CA 1MY1A 2H4IA 3OOAA 3FVNA 4LZ7A 5CBRA 3T96B 4OEUA 2A5TB 4G8NA 1YCJA 4Q30B 5ISUA 2Y7IA 4GL0A 2PYYA 4Z7EA 1OLAA 1QKBA 3IOVA 5BWJA 3OO9A 3TMGA 4OQOA 3PUYE 4NMYA 3VV5A 1JEUA 4YB5A 2LAOA 4LP2B 4OYVA 4BDQA 4JWXA 3PD8A 2F36A 3CI8A 1P1NA 1LFGA 1QW0A 3PMXA 5JTYA 2ZYKA 4U1ZA 1MRPA 1DMBA 2B3BA 2DWHA 4FE8A 1XC1A 3MC2A 3FIRA 2YPNA 3UIFA 4KQPA 4DCXA 3CSBA 1F9BA 4RPNA 4F1UA 3H6TA 1XVXA 1OLCA 3H4ZA 1A55A 5JTYB 3FZVA 1DPEA 4EQBA 1MS7A 4JWYA 4K3FA 1J1NA 1BKAA 4U4XA 3C34A 1QVSA 3PMWA 2UYFA 2DE3A 1TT1A 4H8JA 1XOCA 4AB5A 5DVFA 5L8DA 4OFJA 4G8MA 4TLLB 3Q27A 2XX9A 2ALUA 1MH4A 1OVBA 1B2HA 3JV9A 3GZGA 3PV0E 3H7MA 4HS7A 1SYHA 4MBPA 2F97A 3TZAA 4XKPA 2RKMA 4P0IA 2P1SA 1ZIUA 5AA2D 3Q29A 1RYXA 3UA8A 4RYAA 3TCHA 2D3IA 2B3FA 2I6EA 1MDQA 3ECRA 3E3KA 1LAFE 1PBQA 2OWSA 1USYE 2XXIA 4RJZA 4IB2A 1Q1KA 3U92A 3MW0A 1B3EA 2XXHA 4OETA 3GLBA 1IEJA 4DXBA 4F1VA 3LSWA 2GH9A 4LZ5A 4JSDA 2ZNTA 1MPBA 1O64A 4JWOA 4G8HA 1MDP1 3TTLA 3U94A 1VR5A 3EHUA 2NWJA 3K6UA 2ONKE 2OBGA 4ONYA 2XXWA 3K1PA 4BDNA 1LSTA 3PUVE 4ZEKA 4OEVA 2QSXA 2ONSA 4FAJA 4R2FA 4F18A 4NF8A 3LBSA 1GVCA 4F3BA 4ESWA 3I5OA 4GXAA 1M5DA 4I62A 3PU5A 5TPAB 1PB8A 1EZOA 2DS9A 2I3WA 1FQFA 5H8QA 4N07A 3FV2A 3H03A 3N6UA 2AL4A 3ZS6A 4DE8A 3MZ1A 3TAJA 2DXYA 2ZXTA 3U8QA 1UTBA 4XKRA 5H8QB 2UVGA 3CFXA 2Q89A 3B6TA 4ZEIA 2PX1A 2ANJA 4BLAA 2ABHA 1UTBB 2PT1A 3ZKKA 3MZBA 3S9NC 5I84A 2Q9TA 3CR9A 1IXHA 3V83A 2Y7RA 1VFEA 3MQ9A 1FTLA 3TODA 2O6AA 3O6HA 2RC9A 4QFPA 3S9EA 1AOVA 4IO4A 3P7IA 4F3SA 1A8EA 3MAMA 3TPAA 2IEEA 3KN8A 5A5XA 1UIVA 3FXQA 1SI1A 4JB7A 1JQFA 2B65A 4LUBA 1GGGA 4R2BA 2XXTA 3GBBA 4H67A 2FA7A 4F3PA 3G3HA 5A5XB 5BUUA 2GFEA 3O66A 4GFRA 4OTEA 3SEXA 3C36A 1XHYA 2XD2A 5AA4A 1MY4A 1I6BA 3PPQA 4QF9A 3CFZA 1IXIA 1VFDA 2RCBA 1JNFA 4ZEFA 4C1UA 3KSJA 2CZLA 3K4UA 4BDLA 3FVKA 5CRYA 5AA4B 2QS2A 3VVDA 1N3WA 2NXOA 2V25A 4POXA 4DLDA 1LFIA 4M4GA 4NE4A 1IITA 3SERA 3O2AA 3D4CA 2XXQA 1MXXA 3IOTA 2XXXA 1SW5A 4LQ5A 4YKIA 3KGCA 2RC8A 1MM7A 2Q2CA 4PFTA 5DT6A 3T9HB 4YU0A 5I57B 1WDNA 2F6PA 2P2AA 4L17A 2ZYOA 1NH8A 1B1HA 1LAGE 3W15C 1DTGA 3TTMA 4IGTA 4X48A 4C0RA 1FW0A 4RK2A 2Q8JA 2VP1A 3QK6A 4G68A 4H1XA 1B46A 4KYSA 4I8CA 3VLVA 3SEWA 3IB0A 3RN8A 1I6QA 5B7DA 1A40A 1P1QA 4OWDA 3OO8A 3VVFA 1R9LA 1FQBA 3PUXE 4FORA 3U93A 3KFMA 1B40A 2ZNUA 4G68B 1II5A 1LFHA 3KOSA 5L9MA 5I58A 1M5EA 1MXZA 1TFAA 4JDFA 3OXNA 1YPNA 4ELPA 4R9GA 1B0HA 3FXUA 5L9OA 3MPLA 4O3BA 4R72A 3RT8A 3V5AA 4F22A 2UVJA 1MXWA 3TQLA 5I58B 5ICTA 3G3IA 3OEKA 1FTKA 2DE2A 3H6UA 1GTKA 2PVUA 2X26A 2UYEA 2HEUA 3G3KA 1SBPA 4JBZA 1O7TA 5F1QA 2RCAA 1A7LA 3CVGA 2F35A 2QJEA 4OERA 2HAUA 2V3UA 3RPWA 3V89B 3B6WA 3HPIA 2DWAA 3CSGA 2DE4A 2W7YA 4YB7A 1NNPA 2DYXA 4F39A 1AH5A 3OSRA 3CRBA 1B7UA 1PEBA 3HN0A 1MG1A 4KCCA 4P11A 4QSCA 2GHBA 2PBWA 3FGSA 1QUKA 1T0KA 1OQGA 4YKJA 4H65A 2ONRA 4F3GA 2HFBA 3E13X 4XKNA 3CIJA 3S9MC 4XIGQ 1UQWA 4KD5A 5AA2A 4JXIA 5IKBA 2KLFA 4IO6A 1Q35A 5TP9A 3VLUA 1LBCA 3N26A 4F2QA 3QUFA 2QS4A 3T93B 4PE5B 3DP4A 3PUWE 4O3AA 2ZYMA 4OESA 1VE4A 4TOZA 1Y1MA 5AA2B 1IUDA 4IY6A 1MQHA 1ZU0A 3MVWA 5TP9B 4ELQA 1ZMGA 1PBPA 1URGA 1OIBA 4OZ9A 2QS3A 3M3LA 1XS5A 2XXUA 3FJ7A 3U1OA 4EUOA 4IO3A 1URSA 2O1MA 4ZE8A 4U21A 4FIMA 4GXSB 2OJTA 1N84A 5LOMA 1S7YA 3TTNA 1B58A 3A3UA 4EXKA 1POTA 1Y20A 3O6GA 1QUJA 4OMBA 3PD9A 3WAFA 4UA8A 3O6IA 2V84A 4PQJA 3IOWA 2Z8FA 2OLBA 5CMCA 1Z7NE 3RY3A 4ZZEA 2Y7PA 1M5CA 4WEPA 5I56A 4QHQA 5DTBA 1A8FA 1OMPA 3TCGA 2O84X 4ND9A 4R9FA 3W9VA 4U22A 3UORA 1MY0A 2H25A 1B3LA 3EN3A 3I3VA 5L9SA 3FASA 4WEDA 5AE4A 1YTVA 3TTKA 4YMAA 4PFWA 3K1NA 2I48A 2Y7WA 1MY3A 1IQ7A 1MXVA 1MQIA 4BDMA 1P1OA 4I1DA 2I0BA 2XD3A 5CC2A 1MQJA 4NF4A 3TFLA 2Z8DA 3TCFA 5M2VA 2XHDA 5CM6A 1ZTYA 2QPQA 5I2KA 2R9JA 4UACA 2YLNA 2Z22A 3HHFA 5JK4A 3O9PA 5DEXA 1JW4A 4BDOA 4NEDA 5HM4B 3MBPA 2HZLA 1ATGA 4NF4B 4XKQA 1BIYA 4G4PA 3OEMA 1B3FA 3LC8A 4DCYA 1FQAA 4KYDA 1L5TA 3RTFB 4GVOA 1LLSA 5I2KB 4F2OA 4NWDA 1NKXA 3M8UA 3K01A 3FV1A 5DEXB 2AYSA 3HV1A 4NF8B 4H0WA 1SVXB 3VVEA 2IA4A 4GWOA 4OHNA 3IX1A 4U2RA 3PMVA 1B6HA 4NF5A 3OO7A 3QYTA 1D9YA 5AA3A 3IORA 4KHZE 4ELRA 4GIZA 5DVIA 3K6WA 5FHMA 1B51A 1BP5A 1NFTA 5ELVA 2QS1A 1QUIA 3MP8A 3TTRA 4NF5B 3S2VA 2ESNA 2X7QA 3GXAA 2H9BA 3QIMA 4MF3A 3EPEA 3PUZE 4LA9A 3GBAA 3N6TA 1I6AA 1RYOA 2Q88A 2I58A 4ZS9A 2I0CA 1B4ZA 3K2DA 1B5JA 3JZJA 3KSXA 1LBBA 3RLFE 3BKIB 3KG2A 3PPOA 1ELJA 3B7DA 1B3GA 1S50A 4LQ2A 5HBCA 2REJA 2F6GA 3FD3A 5EYFA 5K2XA 3PPPA 4MFIA 1XT8A 3R7XA 2V3TA 3L6GA 3KN3A 2HQ0A 1Y3NA 4PP0A 4RNSA 2DWJA 4EDPA 1AIVA 3VDFA 4H5FA 4RPOA 3QSLA 4RXLA 4KI0E 2F8DA 1Y3QA 2RC7A 3UP9A 4ZECA 1JW5A 1HSLA 1FTJA 4I9DA 5TU0A 3K00A 3VFJA 4EQ9A 1NMUA 4KCDA 3G3JA 4OFLA 3FVGA 5H8SA 1TXFA 4QRZA 2F78A 2ZMBA 3MP1A 3EQ1A 1H3DA 2VHAA 2X7PA 2O68A 3BFUA 4XXUA 4R6HA 1LB8A 1SW2A 3M3KA 4Q0CA 4TLMB 5K2YA 1SW1A 4AQ4A 2F7AA 4KYEA 4DXUA 2DSFA 4OFOA 4FJPA 1R1NA 1QKAA 1KWHA 2O69A 3LUYA 5ITOA 3WAEA 4R6YA 3TEPA 1N0TA 3IJOB 1WVJA 1ZKBA 2E0SA 1P1WA 1PB9A 2H98A 4JSOA 3TYHA 1MXUA 4QFKA 2BJJX 1XVYA 1OVTA 2QRYA 3E9XA 1EZ9A 1LAXA 2THIA 1N7XA 4WXJA 4HCWA 2P0SA 3EF7A 3RGYA 3KJTA 3UK4A 3FVOA 2PT2A 4Z0IA 3SETA 2I4BA 4YKPA 1N76A 4ZEDA 3H6WA 1ZBMA 2FNCA 3IB1A 1POY1 2F34A 1US5A 2NOOA 3R26A 5DVJA 3K02A 4IO7A 2YJPA 1Y4TA 3PGFA 3H3GA 3K1MA 4ISUA 4YAHX 1CB6A 2HZKA 1SDXA 2REGA 2UVIA 2RINA 1DSNA 3PPNA 1GR2A 3Q25A 2R71A 4X1DA 2NUVA 3ZSFA 4DZ1A 1B5HA 3PPRA 4U4SA 3S4UA 5I59A 2O7UA 3Q28A 1ZJLA 3H06B 3OENA 1IXCA 3USDA 4MLVA 3W9WA 1Y3PA 2XX8A 5ITPA 2A5TA 2G29A 4THIA 1DOTA 1UTHA 3MP6A 5I59B 4FECA 3MVZA 1A54A 1B52A 3T9XB 3ILUB 3R6UA 4HW8A 3TUSA 4GLIA 3O97A 3F11A 4FATA 3C4MA 1LAHE 1NNFA 1UTHB 1Y4CA 3ZKLA 2I3VA 4LZ8A 2XXPA 2V3QA 4FEBA 1TFDA 4OVJA 5ICQA 4G68C 4DXCA 1AL3A 3IB2A 2GHAA 1MQDA 4ELOA 4F29A 3TDJA 3FJMA 2HXWA 3OD7A 1BLFA 4PETA 3SESA 2DP8A 4MLQA 4POWA 3C33A 3CFLA 3E4RA 1SYIA 3OELA 1RKMA 4QFNA 5B70A 4FEDA 3LSFB 4IGRA 3B6QA 4N6PA 2M8CA 1MPDA 2VOZA 5FTHA 5CI5A 2Y7KA 2H5YA 4F1YA 3A09A 1NNKA 1LCFA 3MWBA 3EHSA 1MH3A 2E1SA 4KFQA 4LONB 2VD3A 4H6DA 2NVUB 1EH3A 4GRKA 2DXRA 4LVQA 4AB6A 4X1BA 3RUMA 4LATA 4R73A 1H45A 5CMKA 3D4GA 2FYIA 2ZNSA 3ONMA 4X9TA 1LGBC 3CG1A 2GRVA 1WODA 4NTLA 5KDTA 3THIA 4E0WA 1JETA 4YMBA 4XTCQ 2QL3A 1ZLQA 3LR1A 2HAVA 3LSLA 1FTOA 4ZEBA 3UGWA 1JW1A 3DM0A 3DP6A 2O51A 1S9TA 5CBSA 5CMMA 5KDTB 3CG3A 5H8HA 3Q26A 3OO6A 5I56B 3G3GA 3QAXA 3S9LC 3VXBA 4KR5A 1USYH 2XXRA 1B0LA 3M3FA 2Z23A 4N13A 3LSXA 1BTJA 3QXMA 4R6KA 5H8HB 4YZZA 1FQCA 1SI0A 3TELA 1P1UA 3VLWA 3KJ7A 1UIUA 3MVYA 3EHTA 4GL8A 3C35A 3O28A 5FHOA 3T9UA 1ANFA 1MPCA 5TPAA 1AMFA 1JVYA 3BBRA 4NF6A 1HSJA 1FQDA 4M1VA 4U23A 4OENA 4EQ7A 2G93A 1O63A 4OXVA 3FJGA 2O7IA 1N7WA 4ZE9A 1M5BA 3JYRA 1QJMA 4GD5A 5FHNA 1LCTA 3T22A 1DPPA 3TKDA 4NF6B 4QFLA 1PC3A 1SW4A 5F7VA 3IR1A 4GQOA 2I49A 1I69A 1SQYA 3KEIA 4H8IA 3IK6B 2V93A 5AA1A 3SKPA 3RT6B 2H99A 4GOTA 2F5XA 3DLNA 3G7WA 1N04A 3IOUA 2OCUA 4C1TA 3UN6A 1FQEA 3KOTA 4U1OA 4G77A 2ZYNA 4YB6A 4RY1A 2QMWA 2DQVA 2OWTA 4EF2A 3KN7A 4HCYA 4BDRA 2D21A 5CMBA 5IAIA 3T66A 1HSEA 2Y84A 1B7ZA 1FTMA 2AL5A 2QMXA 3BFTA 1R6ZA 1URDA 1FCKA 3MZ9A 3SEYA 1Y1ZA 3RTWB 1PB7A 1MXYA 3RNNA 4IY5A 1SD3A 1Z7ME 2AIXA 2A5SA 4EXLA 3T9VA 1MQGA 3FXRA 2Q2AA 2DVCA 5KCJA 4H5GA 1GV8A 3KZGA 1H44A 1NNTA 4ZDMA 3SDFA 2DWIA 2XX7A 3FATA 3C9HA 3U72A 4ESXA 2CMOA 2F7CA 1NH7A 1MM6A 3G3FA 1B9JA 4PFUA 1JVXA 1A99A 3OSQA 4QSEA 1P99A 5KCJB 1TWYA 3TQWA 4KPTA 4IO2A 4RK9A 1B05A 3IAZA 2PMSA 5J1DA 4Q8RA 1B32A 3MPKA 4YICA 1JEVA 1R9QA 3HHGA 3HSTA 4RA1A 1QULA 3SEUA 3K0VA 4R74A 3DP8A 2OZZA 2D5WA 1IXGA 4R75A 1B5IA 2XXVA 4ECFA 3MVXA 4Q5TA 5H8NA 1IIWA 5I57A 3HO7A 5JEIA 2DVZA 3K6XA 4F19A 1EU8A 2Z8EA 4QSDA 1H76A 3KBRA 3N5LA 3H6VA 3ILTB 4DDDA 2R6GE 4EF1A 2VD2A 3L6HA 4F31B 2UXAA 1B4HA 5H8NB 2XXYA 5EHMA 3HCQA 1D4NA 4WKMA 4MH5A 1DTZA 1D3KA 2RF1A 5EHSA 4DIGA 3FUZA 4ZZAA 4O3CA 4G2ZA 5I2NA 1M5FA 4TQUQ 1N3XA 3I6VA 3VXCA 3C32A 3OMBA 3QUJA 2HCAA 3RQTA 1B3HA 4NWCA 5DYHA 2DOJA 3IO6A 5I2NB 3V8XB 3O29A 1CE2A 2I4CA 1B1XA 4QFOA 3VE1B 4E0XA 5H8FA 3AXFA 3K6VA 3MUQA 2O1LA 3MJNA 4PFYA 2F7BA 1MY2A 3N94A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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