1TXFA

Crystal structure of the glur5 ligand binding core in complex with glutamate at 2.1 angstrom resolution
Total Genus 83
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
83
sequence length
248
structure length
248
Chain Sequence
TLIVTTILEEPYVMYRKSDKPLYGNDRFEGYCLDLLKELSNILGFLYDVKLVPDGKYGAQNDKGEWNGMVKELIDHRADLAVAPLTITYVREKVIDFSKPFMTLGISILYRKGTPIDSADDLAKQTKIEYGAVRDGSTMTFFKKSKISTYEKMWAFMSSRQQSALVKNSDEGIQRVLTTDYALLMESTSIEYVTQRNCNLTQIGGLIDSKGYGVGTPIGSPYRDKITIAILQLQEEGKLHMMKEKWWR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Crystal structures of the GluR5 and GluR6 ligand binding cores: Molecular mechanisms underlying kainate receptor selectivity
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Membrane protein
molecule keywords Glutamate receptor, ionotropic kainate 1
total genus 83
structure length 248
sequence length 248
ec nomenclature
pdb deposition date 2004-07-04
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1txfA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1txfA02
1NMUA 3C35A 4DZ1A 1D9VA 2XXVA 4PFUA 3PPRA 3IX1A 3MVYA 4FEBA 4NWCA 4THIA 4AB6A 4AQ4A 3A09A 2I48A 2RC7A 2F7AA 2A5TA 3K6UA 2VOZA 4M4GA 5CMCA 1SD3A 3O28A 3O29A 3VLUA 4EXKA 3R6UA 5H8FA 1ZLQA 2XXRA 1LBBA 4RY1A 4U1ZA 1NNPA 2Q2AA 3TMGA 1AL3A 1TFAA 3U93A 1A99A 1MQDA 1M5DA 1URGA 4GRKA 4POXA 3PMWA 3MC2A 4OFLA 3T66A 1LAXA 4OEVA 3V8XB 5DVIA 2I49A 2H99A 2AYSA 1MS7A 3PD8A 3G3KA 3A3CA 5DVJA 3RN8A 3MPKA 3N94A 4OENA 1IXIA 1JEVA 5BUUA 2UVJA 4ELPA 3U72A 2F36A 4GXAA 1SDXA 4G4PA 3TDJA 5LOMA 4YMAA 2UXAA 5H8QA 3TODA 3RY3A 1EU8A 1BKAA 2CMOA 2HXWA 2RCBA 4MF3A 4R6HA 5A5XB 4TLMB 5I56B 5ISUA 3HO7A 4DXCA 1FW0A 5B70A 4ELQA 3TPAA 5L9OA 1FQAA 3FV1A 3MAMA 1FTLA 3VXCA 4G68B 2QS3A 3IOWA 3LSLA 5AA2A 3SEYA 3KSXA 5I2NA 5JK4A 2GHBA 4O3BA 3ECRA 3LSWA 4WKMA 4NF6A 4RNSA 1USYE 5I57A 3FVKA 2AL4A 5TPAA 2WKYA 4KCCA 4RPNA 3GZGA 2R9JA 1P1QA 1VE4A 3HCQA 3K1MA 4PFWA 3H6VA 2I0CA 2OJTA 4MFIA 1B5IA 1MXXA 5ITOA 3G3FA 2H4IA 3E9XA 4JSOA 4JB7A 4DDDA 4F18A 2HEUA 4MBPA 3DP6A 3ILTB 2NUVA 1LAHE 2Z22A 3VVEA 3CG3A 1POTA 4DCYA 5I2KB 2ABHA 2UVHA 4GVOA 3C9HA 5EYFA 4I9DA 3MPLA 4QFPA 4BDMA 3OO6A 3IB0A 1A7LA 1Y4CA 2UVIA 4NWDA 2RF1A 3KG2A 4NMYA 5AA3A 3E3KA 3LC8A 4FEDA 3MP1A 5CM6A 4BDRA 3TUSA 4ZDMA 4RA1A 3THIA 1QUJA 1XC1A 1QUIA 5DYHA 3LSXA 3U8QA 3OEKA 3T9HB 1LFIA 3HPIA 4X48A 3G3HA 4R72A 4H6DA 3PPPA 5AA2D 3K1PA 4F3GA 4F3BA 5I59A 5TP9A 1N76A 1MPDA 1Y1MA 2PT1A 1M5FA 4LQ2A 3OENA 2DWHA 1IXGA 3PUVE 1Y3PA 2O6AA 2PMSA 4P0GA 3K01A 1B05A 4XKNA 3UN6A 1AOVA 5L8DA 4G2ZA 1B4HA 3MW0A 4TQUQ 1T0KA 3V89B 2F34A 2ZMBA 2HAUA 4NF4B 4R6KA 3OO8A 4OETA 2R6GE 3T9UA 3N26A 4I62A 1Q35A 1B5HA 2ZNTA 3TTMA 5B7DA 1B32A 2QL3A 3KGCA 2F8DA 1QKAA 3EHSA 3QK6A 1B3GA 4NE4A 3T93B 4POWA 3LR1A 1XHYA 1CE2A 4WXJA 4ZEFA 1VFEA 4LATA 2QMWA 2ZYMA 2NXOA 3CI8A 4PQJA 1B7ZA 4ND9A 1P1UA 1P1NA 2HAVA 1P99A 2Z8EA 3O2AA 1MY3A 1TWYA 3M8UA 3PPQA 4F29A 2Q88A 4N07A 1O7TA 3TCHA 3UIFA 1R1NA 4RK9A 2A5SA 3RTWB 3TCGA 1B6HA 4F22A 1N84A 4KYDA 4QRZA 1SBPA 3C34A 3CRBA 3ONMA 3KN3A 3RT8A 2DE2A 1XT8A 1GVCA 4MLQA 2B3FA 2OCUA 1FQCA 3BKIB 3EHUA 3MVWA 1MG1A 4IO2A 4LQ5A 1KWHA 1HSLA 1LB8A 3E4RA 1A40A 1DTGA 2QSXA 1IITA 3D4GA 3UGWA 4LZ5A 4AB5A 5KDTB 1PDAA 4YKJA 4ZEKA 4FIMA 1R9LA 4QSEA 2Q89A 5TPAB 1MM6A 1PBPA 2HFBA 3OD7A 1ZTYA 3MZ1A 4NF6B 1MDP1 2PT2A 4F2QA 1B3EA 5AA4A 5CMKA 3KOSA 3CSBA 3QSLA 4H5FA 3M3KA 4G68A 3SERA 3U92A 1IEJA 3S9NC 4P11A 1N7XA 2I58A 4U23A 1B2HA 2XXTA 4E0XA 4C0RA 5L9SA 2DSFA 4IO4A 1B3FA 2ESNA 3K0VA 1TXFA 1ZKBA 3IK6B 1EZ9A 3W9WA 1N04A 1S7YA 3FASA 1MXZA 4MLVA 1M5EA 4HCWA 1FQFA 1POY1 2X7PA 2XXIA 3Q25A 3TKDA 1N3WA 1ZMGA 3I3VA 3K02A 1B5JA 4LP2B 4XIGQ 3S2VA 1IXCA 1SQYA 1Y3NA 3RLFE 4R73A 4R9FA 4DXBA 1P1OA 4R9GA 4KYEA 1VR5A 3O6IA 1OIBA 2YJPA 4QHQA 1B7HA 1LB9A 3MP8A 4G8HA 4EQ9A 1H76A 2F78A 3K4UA 4IB2A 4XTCQ 5H8SA 2I4BA 3MWBA 4BDQA 2DWJA 2W7YA 5J1DA 1VFDA 2RC8A 3M3FA 4NF8A 4U4XA 4YICA 3FJMA 4Q0CA 4XXUA 3EN3A 1NH8A 2Q2CA 3G3JA 5IAIA 3TYHA 1AMFA 2F7BA 4H8JA 3EPEA 2QJEA 2ZYKA 1SI1A 4KHZE 1LLSA 4O3CA 3IOVA 1FTJA 1NKXA 4G8NA 3O6GA 3TELA 5KCJB 2I6EA 3IAZA 5FHOA 4KYSA 3PMVA 3ODBA 4RXLA 3FV2A 4HTGA 5DTBA 1FTKA 2ANJA 2PBWA 2I0BA 2RINA 4ONYA 2ONKE 1A8FA 4ZZAA 5AA1A 4F39A 3S9LC 3C33A 1B9JA 3HSTA 3OO9A 4JSDA 4OTEA 5FHMA 4OXVA 5HBCA 3FJ7A 3K2DA 2QMXA 1URSA 3CG1A 3VVFA 4JBZA 4NF8B 1A8EA 1HSJA 4DE8A 3DP8A 3SEXA 4IO3A 4QF9A 2FNCA 2D21A 2XXWA 3H7MA 1UTHB 3KZGA 2O69A 4ELRA 1JQFA 4OZ9A 3HV1A 1IXHA 1UTBA 1MPBA 3I5OA 4QSDA 3FXUA 3IJXB 3IORA 3B6QA 1B51A 3HN0A 2YLNA 3MBPA 2I3VA 4IY5A 2Q8JA 5ITPA 4IO6A 1SVXB 1H44A 2F6GA 3W9VA 3SKPA 1QKBA 1MY1A 1SYHA 2QS1A 4JDFA 3UK4A 3VXBA 4H67A 1ANFA 2DWIA 3FGSA 5HM4B 1NFTA 2HZKA 3O9PA 3Q26A 1JEUA 1MPCA 1B0LA 1US5A 4OQOA 3RTFB 4WEDA 2RKMA 3N6TA 4ZE9A 2HQ0A 3KN7A 2IA4A 5H8FB 1L5TA 3SETA 5K2YA 1QUKA 5FHNA 2DXYA 2FA7A 1YTVA 3TAJA 2LAOA 4GL0A 1IIWA 4X1BA 4ZEBA 4GWOA 1LGBC 2UVGA 4OWDA 4I1DA 1EZPA 4EDPA 3ZSFA 2XXHA 1DMBA 3EQ1A 2XX8A 1II5A 3OSQA 3PUWE 1JNFA 3LUYA 1F9BA 1OMPA 4PE5B 1MY4A 4Z0IA 4KI0E 2F97A 2R71A 4DLDA 1JVXA 2P2AA 3OSRA 4N13A 1B1HA 4F1VA 3PU5A 4ZEDA 4OHNA 1WVJA 2Y7KA 1OVTA 3KJTA 1LCFA 1B7UA 1FTOA 5AE4A 1AIVA 1EH3A 1MXYA 2O7IA 3KBRA 3GBAA 5I57B 2E1SA 2ONSA 1B0HA 3TQLA 2HCAA 3VVDA 4DCXA 4YMBA 4ZS9A 1BP5A 4YAHX 5I2NB 3FJGA 5AA2B 2I4CA 1CB6A 3CVGA 3EHTA 3JV9A 4EQ7A 4U2RA 4OFOA 4DXUA 4KR5A 2V3UA 3PMXA 4MH5A 1JW1A 1DOTA 3FXRA 2GRVA 4M1VA 5I84A 3R26A 4N6PA 4UACA 5H8QB 1NNKA 4JXIA 2BJJX 2XHDA 2O51A 3O6HA 2XD3A 4EQBA 3VLVA 3SESA 1RYXA 2OWSA 3RPWA 1HSEA 4IGTA 4Q8RA 1QULA 3GLBA 4YKIA 4YZZA 3WAEA 1B3LA 3TCFA 1QJMA 3P7IA 2QRYA 1R9QA 2QS2A 4GOTA 1BTJA 5ICQA 1UTBB 1Y20A 1Z7NE 4IGRA 1URDA 2NOOA 4U21A 3UP9A 2F35A 5KZTA 2F5XA 2OWTA 4FECA 4H8IA 4XKRA 3QAXA 4OEUA 4GFRA 3TTNA 2G93A 2V3QA 3ZKLA 3FATA 5BWJA 1I69A 3K6WA 1LAFE 5FTHA 1SW1A 1NNTA 3IB2A 4OMBA 3FIRA 1P1WA 1QW0A 2REJA 2XD2A 3H4ZA 3MVZA 1RKMA 2OZZA 4KCDA 2H25A 5F1QA 4EF1A 3BFUA 4X9TA 1MQGA 1O64A 1NNFA 1J1NA 1PC3A 1XVXA 2F6PA 2O84X 2Z23A 2ZYNA 3B6TA 3K00A 4QFLA 5CMBA 5JTYB 1Z7ME 3T9XB 4F31B 3FD3A 4C1UA 3FVNA 1AH5A 3RQTA 4F1UA 5CBSA 4LVQA 1Y1ZA 3H06B 4KQPA 4BLAA 3Q27A 4G77A 4QFKA 3PV0E 3SEVA 3MQ9A 1OVBA 3A3UA 4GXSB 3LSFB 4LZ8A 4RPOA 3VFJA 1EZOA 2PYYA 2DOJA 4U1OA 2CZLA 2DVZA 3IL1B 4ESWA 3S9EA 4IY6A 3UORA 1XVYA 1MQJA 1MRPA 5L9MA 4GL8A 1OQHA 3CIJA 3PUZE 3TFLA 1WODA 5CBRA 2Z8DA 1DPPA 1LBCA 4G8MA 4U4SA 3PUYE 4H65A 1D9YA 5I2KA 4HS7A 4JWOA 3U1OA 3R7XA 5H8NA 1PB8A 1JETA 4F3SA 1OQGA 3H3GA 2DWAA 2PVUA 4DIGA 4G68C 4RJZA 5EHMA 1Y9UA 4NF5B 5I58A 3CSGA 3KN8A 1ZU0A 1RYOA 3IB1A 4TOZA 1YCJA 1ZJLA 1BLFA 2Y7IA 3H6TA 1H3DA 1B3HA 3BBRA 2F7CA 3OELA 3KFMA 4P0IA 1USYH 2O7UA 3ZKKA 5I56A 4HCYA 4K3FA 5IKBA 1R6ZA 3B6WA 3I6VA 4RK2A 2P0SA 2XXUA 5AA4B 3DLNA 4NF5A 1SYIA 2HZLA 3TTRA 1D4NA 3Q29A 1MH4A 2REGA 4Q5TA 4XKQA 3D4CA 4F19A 3G7WA 2P1SA 1LFHA 4C1TA 3JYRA 4YKPA 5EHSA 2VGQA 3DP4A 3KSJA 1OLCA 4R75A 1MQIA 3RGYA 1MDQA 5KDTA 1ATGA 5DT6A 1LFGA 2XX7A 4X1DA 2UYFA 2ZNSA 3DM0A 3H03A 1US4A 3L6HA 1LCTA 2DVCA 3PD9A 1TT1A 4H0WA 4LONB 5DEXA 3VV5A 2V25A 3MUQA 4OYVA 1DPEA 1OLAA 4QFOA 4PFYA 4R6YA 5CMMA 4ZZEA 5HPQA 1NH7A 4U22A 4WEPA 2B3BA 1A55A 2GFEA 1UIVA 3OEMA 3VE1B 1N0TA 4NEDA 3OXNA 4LZ7A 3IOUA 4FE8A 4R74A 1QVSA 3MP6A 3C4MA 2VP1A 3G3GA 3QUJA 4Q30B 4QFNA 3HHFA 5JEIA 4BDNA 1GR2A 2DE4A 3QIMA 3TZAA 2XXQA 2Y84A 2Z8FA 3C32A 3HHGA 4LUBA 1ZBMA 1S9TA 4ELOA 3MVXA 1IZ1A 1B46A 1S50A 4GIZA 4NTLA 3SDFA 4Z7EA 4JWYA 2DYXA 4HW8A 3KJ7A 2G29A 3OO7A 3PPOA 4EXLA 1MM7A 5F7VA 4BDLA 2VD3A 2I3WA 1UIUA 2H5YA 3MZ9A 3O97A 2DE3A 4NF4A 4OVJA 3U94A 1O63A 1YPNA 1Y4TA 2PX1A 3H6UA 3FXQA 1D3KA 3K1NA 4O3AA 3ZS6A 1MH3A 3IO4A 3JZJA 1ELJA 2QPQA 3H6WA 4ISUA 2Y7PA 3GBBA 1SW5A 3L6GA 2XXPA 4XKPA 1GV8A 4R2FA 4F2OA 5I59B 2OK2A 1VSOA 3CFZA 4GD5A 1SW4A 1JW4A 3GXAA 2NWJA 1JVYA 3QYTA 3RNNA 2ONRA 2XXXA 2ZYOA 3QXMA 1PB9A 4EF2A 1TFDA 5H8HA 1JW5A 4YB5A 1ZIUA 3IR1A 2GHAA 3BFTA 3IO6A 1BIYA 2B65A 4FORA 3C31A 3IOTA 4GLIA 1FQDA 4FAJA 3TEPA 3FZVA 1WDNA 3SEWA 2D3IA 2DQVA 3N6UA 2DS9A 1B40A 2AL5A 2FYIA 2V84A 2ZXTA 2D5WA 2RC9A 3E13X 1XS5A 3FUZA 4GQOA 1I6BA 4YB6A 3Q28A 4YU0A 1FQEA 4H1XA 3DELB 3AXFA 2GH9A 5FTIA 3TQWA 3W15C 1I6QA 1SI0A 1M5CA 1N3XA 2E0SA 5CI5A 5M2VA 1H43A 1SW2A 5DEXB 1I6AA 2KLFA 3TTLA 2XX9A 3V83A 4KFQA 4ZEIA 3USDA 3FVGA 2RCAA 1GGGA 1B52A 3C36A 2O68A 3PPNA 3VDFA 2YPNA 2XXYA 4ESXA 1H45A 3VLWA 1IQ7A 4YB7A 3FVOA 3CR9A 3S9MC 3KOTA 4E0WA 4IO7A 4FATA 2V3TA 4UA8A 4RYAA 4PP0A 1Y3QA 2X26A 3OOAA 1M5BA 3B7DA 5K2XA 1FTMA 5TU0A 3UA8A 1B4ZA 2Q9TA 2ZNUA 4ECFA 4PETA 1LAGE 2QS4A 3M3LA 3O66A 3MZBA 4FJPA 3TTKA 1MY0A 1NL5A 2AIXA 2H9BA 4PFTA 5A5XA 2VD2A 4ZECA 3RUMA 1MXUA 5H8HB 3OMBA 2DXRA 1PBQA 5I58B 4GF8A 4KD5A 4LA9A 4TLLB 4H5GA 3K6VA 3MJNA 2DP8A 3LBSA 2M8CA 4JWXA 1MXVA 2H98A 4R2BA 3S4UA 4BDOA 3PUXE 5H8NB 1LSTA 2O1LA 1MQHA 3IJOB 2OBGA 2ALUA 1DTZA 2UYEA 3ILUB 3WAFA 2THIA 3CFLA 4L17A 4F3PA 1B58A 2NVUB 4QSCA 1UTHA 5CC2A 3T96B 3G3IA 1IUDA 1N7WA 2IEEA 3F11A 5CRYA 5ELVA 3QUFA 3RT6B 1FQBA 3T9VA 2A5TB 4EUOA 4F1YA 2O1MA 1FCKA 5DVFA 2V93A 3EF7A 3CFXA 2Y7RA 4OESA 4IO5A 4YKKA 1GTKA 1PB7A 1PEBA 4OFJA 3V5AA 4I8CA 3SEUA 1Q1KA 1YAEA 5ICTA 3K6XA 1DSNA 4OERA 1A54A 3T22A 3KEIA 5KCJA 1UQWA 3PGFA 1XOCA 2OLBA 4KPTA 5TP9B 5JTYA 2X7QA 1MY2A 2VHAA 3N5LA 1MXWA 2Y7WA 4ZE8A 1B1XA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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