1U2VB

Crystal structure of arp2/3 complex with bound adp and calcium
Total Genus 57
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
57
sequence length
204
structure length
204
Chain Sequence
YAQGLLTGVVVDSGDGVTHICPVYEGFSLPHLTRRLDIAGRDITRYLIKLLLLRGYAFNHSADFETVRMIKEKLCYVGYNIEQEQKLALETTVLVESYTLPDGRIIKVGGERFEAPEALFQPHLINVEGVGVAELLFNTIQAADIDTRSEFYKHIVLSGGSTMYPGLPSRLERELKQLYLERVLKGDVEKLSKFKIRIEDPPRR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Structural protein
molecule keywords Actin-Related Protein 3
publication title Crystal structures of actin-related protein 2/3 complex with bound ATP or ADP
pubmed doi rcsb
total genus 57
structure length 204
sequence length 204
ec nomenclature
pdb deposition date 2004-07-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1u2vB01
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 1u2vB02
1TYQA 2CGJA 3MN7A 3A5MC 4BRAA 2VCPA 2YCHA 5F1XA 3IDHA 1C0FA 5F2RA 5I9EB 5AQOA 5KPRA 3H45C 3UKRB 3VGMA 2VWBA 1YXQA 2D0PA 3F9MA 3QFPA 4M63C 4EFHA 5AFUH 3BF3A 2IVOA 3BP8A 3C7NA 4K42A 2QW9A 3DXMB 3FZLA 2QWRA 3L0QA 4K43A 3MMVA 4BR9A 4BVOA 1TUYA 3VEWA 1YAGA 2J4RA 1HX1A 1BOTO 2Q2RA 4NO7A 5AQTA 5FPMA 3KZBA 4CD1A 1NGBA 3CQYA 3A5LC 3FE1A 5AQXA 3ZEUA 3VF4A 3O08A 4FWRA 3O4WA 4ISFA 1JCEA 3VF2A 1XUPO 2A3ZA 2E2NA 4BRIA 2IVNA 3HBTA 1BA1A 1OKJA 5BN9A 5KPTA 3ZETB 4BRNA 4JN4A 1HLUA 4FWOA 3AAQA 4B1WB 4BRMA 4WQ4A 2AP1A 4FOIA 3EKUA 3WQTA 3ATVA 4BROA 1X3NA 2QWOA 5BRFA 3A5OC 3FZKA 1GLCG 2QWQA 3BF1A 4CZHA 5KPZA 1MWKA 4IO8A 4JHDB 3H46O 3HTVA 4BVPA 1NM1A 2W41A 4WQ5C 2NZTA 1JCFA 5ELZA 1E4FT 3CHWA 4HWIA 1GLAG 4CZEA 4PL7A 5AFUA 3QICA 5EVZA 5AQIA 3O8MA 3SLCA 3CJAA 1BG3A 4A2BA 4BC3A 3ID8A 1QZ6A 1NGAA 3MN6A 2GWJA 5TKYA 3WXKA 1HUXA 2I7NA 4J8FA 4B1YB 1NGEA 1GLDG 5AQWA 4RCHA 4GNIA 2P9PA 2QXLA 4RTFD 3U9DA 3VGLA 1T6DA 4CBWA 5LY3A 2CGLA 3ZX2A 1Z05A 4XH1A 5CE3A 4IZ9A 3ENHA 1NMDA 3D7EO 4CZGA 4JD2B 3LM9A 3DAWA 3DXKA 3C7NB 1X9JA 3GL1A 3MK6A 4H5RA 1S22A 4H5WA 3RSEA 2E88A 3FFKB 4RWTA 4FWNA 3HI0A 4H0PA 3UE5A 5ADXA 3LDPA 4A61A 3D2EA 2P9SA 2E1ZA 3FLCO 2D4WA 2ITMA 3CJ1A 2PAVA 3CETA 3R6MA 5AQHA 3VEXA 2P9KA 1BUPA 4FSVA 3VETA 3QMLA 2P9LA 3S41A 2BTFA 4BRLA 4FWQA 1DGKN 3VEVA 4F9OA 2A41A 3ZX0A 4XH4A 2PBDA 4I6MA 3JXUA 3CJBA 2FLOA 1HPMA 1E4GT 1KAYA 5FPNA 3GDQA 4NB4A 2ZGZA 4FO0A 1U2VA 2F9WA 1DEJA 4BGAA 2FXUA 1GLBG 4BRQA 4FPAA 2E20A 2P9UA 3EN9A 4BRPA 4YDUA 2CGKA 3QBWA 2QWMA 3WUHA 4PL8A 2YI1A 3O1BA 3R9PA 2ASPA 3FZMA 4H5TA 3EO3A 4FWMA 4H0OA 1HJOA 5AZJA 3A5NC 2GTDA 2OANA 2H3GX 5AQRA 4CJ7A 5BPLA 3AARA 5FPDA 1YUWA 3WEEB 1KXPA 2Q0UA 4CZMA 3HZ6A 5JLHA 4H5NA 1WUAA 5KQ8A 2YJFA 4BR4A 2ASOA 2P9IA 4DB3A 3GBTA 5BRDA 1T6CA 4BQZA 1T44A 1MDUB 4IXCA 3SJHA 4HTLA 4QS9A 5JICA 4H03B 2ZWHA 2HMPA 3C0BA 5AQFA 2FSNA 4GY2B 4IWVA 4K25A 2F9TA 1BA0A 3DJCA 3VGKA 1QQMA 3IFRA 3IUCA 2Q31A 5AQMA 1SQKA 4E1JA 2P9PB 3WXJA 4H0VB 1NGFA 2Q36A 3SMPA 5JLFA 4EAHD 4QS7A 1RDWX 3MDQA 3LM2A 1K8KB 3QFUA 1GLEG 4FPBA 1CZAN 3D2FA 5BREA 4BRDA 4IJNA 3H3NO 3GG4A 2Q0RA 2FSKA 1RGIA 4JAXA 1ESVA 5AZIB 2HOEA 1MA9B 3VEZA 4WQ4C 4H5VA 5AR0A 5AQZA 4O8KA 3G25A 4BC2A 4CBXA 3O1WA 3UKUA 4Z94A 2D1KA 1BWFO 1IG8A 3U8XA 4O5FA 5EY4A 4B1UB 5AQVA 3VOVA 3ATUA 4WQ5A 4A62A 5AQKA 4EIAA 3VESA 1NLVA 5BR9A 4I6MB 5F0XA 1NGJA 1ZBSA 5EX5A 4BR5A 2V7YA 3H1QA 3QDKA 3W3DA 3M6GA 1SZ2A 3IMXA 1TYQB 1QQOA 2YHWA 3DXMA 3KVGA 2CH5A 1ATSA 3LDQA 2QWPA 4K41A 1H1VA 3MCPA 5AQJA 2Q97A 1D4XA 1HKCA 3VERA 3LL3A 3CQXA 1V4TA 1R59O 2QM1A 4FL9A 1S3XA 4MLEA 5BPNA 3I8BA 2Q1NA 4BRKA 3ZETA 2BUPA 2WUSA 1U6ZA 2IIRA 1ATNA 3L4IA 2EWSA 3ZEUB 2A42A 2ZF5O 1NWKA 3GE1A 3MN5A 1G99A 4PKHA 2W40A 3FR0A 1SAZA 3CIPA 2D0OA 4L3QA 4BQLA 1JCGA 1NGIA 1RFQA 3O6WA 4CZLA 3LDNA 2A40A 3M1FA 4JHDA 4BRCA 3EZWA 3A0IX 3CERA 5AQUA 4PKGA 3I33A 1C0GA 2GWKA 5FPEA 4BC5A 3LDOA 1ZXOA 3VENA 5EXWA 3OHRA 4MO5A 3VEOA 2FF6A 3GOIA 3WXLA 4WYBA 4KBOA 1GLJO 4AM7A 2P9NA 3H6EA 2GEMA 4YDUC 4XH5A 1NGCA 4JNEA 3BEXA 2E1YA 3H1VX 3WXIA 3WQUA 4B1VA 4B1XB 3U9ZA 4QS8A 3TPQA 3MN9A 4BRFA 2DPNA 3ULEA 4FWPA 4BC4A 1P8ZA 5LJWA 4A2AA 5B8HA 4ISEA 3FZFA 4JD2A 5AQYA 4FWLA 1HKBA 4B9QA 3CI5A 4H0TB 3AY9A 4BR2A 2HF3A 3HSCA 3JS6A 4CZIA 3A8YA 1KAZA 1XQSC 3WT0A 4EHTA 2YHYA 4AM6A 5AQPA 1BDGA 3O80A 4MO4A 5AQSA 5JMVA 4M7XA 3QB0A 4PKIA 3DXKB 3QBXA 5AQQA 4B1ZA 3RSEB 2KHOA 3J8AA 3VPZA 2CH6A 2V52B 2FF3B 3D2EB 1DKGD 2P9SB 4CZKA 1WOQA 4Y0WA 1V4SA 1X3MA 2P9KB 2ZGYA 1ATRA 2GUPA 5E26A 3L6QA 2P9LB 5BRHA 5ADXH 3R8EA 2AA4A 1Y64A 3SMSA 3UKRA 1LOTB 5BPMA 2NLXA 3KHYA 4H0XB 4CD3A 4DQ8A 1BU6O 4BR0A 2A5XA 1XC3A 3H3OB 4C23A 1U2VB 2V51B 3W0LA 2E2OA 2FSJA 2YHXA 3HM8A 2E2QA 3U4LA 2P9UB 3ENOA 3FGUA 3WEEA 4FOEA 4BG9A 3CJ9A 2E8AA 5AQNA 1IJJA 2VYPA 4BR7A 3LDLA 3P4IA 5AZJB 1GLLO 1GLFO 2P9NB 3VEYA 2UYTA 4FWSA 1NGGA 4M7YA 3EKSA 4IJAA 3M3ZA 3TU5A 2ASMA 3UB5A 4DCHA 5EOYA 4FWKA 4DHYA 1QHAA 2HF4A 2E2PA 1BO5O 2QWLA 2I7PA 1KAXA 1NGDA 2P9IB 2GELA 3ULEB 1J6ZA 1QQNA 5KQDA 5E84A 1K8KA 4ISGA 4XEIA 4CI6A 1ZC6A 1QZ5A 1Z6RA 2A6AA 3CJCA 2QWNA 2V7ZA 5AZIA 4CZJA 2YJEA 5AQGA 4BGBA 4BREA 4LC9B 4EHUA 5AQLA 4CBUA 3D2FB 1NGHA 1MWMA 4BG8A 2NRHA 3ZX3A 3EL2A 3CJ7A 5LJVA 1NBWA 3BUZB 3AAPA 4BRHA 3B8AX 4BRGA 1HKGA 3DWLA 1EQYA 4H0YB 3VF6A 4CZFA 3SK3A 1Q18A 1LCUA 2IVPA 1YVNA 1TUUA 3FZHA 4MLHA 5BN8A 3O5BA 3UKUB
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2VG7A 4RW7A 3MN7A 5FLXO 3PX0A 2EHGA 4M3RA 5I9EB 5AQOA 5KPRA 4I7FA 2D0PA 1D8YA 5AFUH 4C8MA 3LAKA 4OGCA 1KSPA 3CC2N 3BP8A 1WSFA 2NRVA 4W5QA 3THWB 4M3YA 4JK8A 3O3GA 3LAMA 3VEWA 1K73O 2J4RA 3R1XA 1HX1A 2KZMA 4CCHA 4BWMA 4NO7A 5AQTA 4ZTJA 1TGOA 3AVCA 3KWGA 2UUBK 1RT6A 5AQXA 3VF4A 1VSJA 3O4WA 4ISFA 3VF2A 4CEZA 5KRSA 1JLQA 2E2NA 3V9XA 1XHZA 3IG1A 1HNVA 1VQPN 1LAWA 5KPTA 4CIEA 2DFHA 4BRMA 2JWKA 4JEPA 3J7YP 4G1QA 4IEIA 3ATVA 4LSNA 4CJFA 1SUQA 2QWOA 3KK2A 3NVKA 3FZKA 4LH4A 3RMDA 2UUAK 3KK7A 3ZSOA 1MWKA 5HRSA 3L2UA 4CFAA 2WFBA 3B6PA 4WQ5C 3CHWA 1HYZA 4HWIA 4DTNA 3PIPL 3OYKA 5C12A 5AQIA 3V4IA 4DV7K 3O8MA 4E3SA 5KGWA 2VWJA 4A2BA 2O8FA 3ENBA 4FXDA 1NK8A 3ZT1A 1WSEA 1DT9A 4GNIA 3AVJA 1T8EA 1ZBLA 4IG3A 2QXLA 3U9DA 3VGLA 3OYIA 1HYSA 2KFNA 5LY3A 4ELVA 1Z05A 4XH1A 4JKFA 3ITHA 3D7EO 2QI2A 4JD2B 3GL1A 3DLHA 1RILA 1ZYQA 3MXJA 2O8BB 5M1OA 4RWTA 3OS0A 4OKJA 4A61A 1W0HA 4CGDA 2WTUA 2E6MA 3K5LA 3VQ6A 3CJ1A 4Z4HA 4CHQA 2OPRA 3LZIA 3AGRA 2QEXN 1BIUA 3C6UA 3VETA 2BTFA 3ZX0A 3QNOA 1T05A 2O8DA 1J53A 2B5JA 1GOAA 3U6FA 5SZTA 2FLOA 1HPMA 2UU9K 1E4GT 1KAYA 1OH7A 2NRWA 1U2VA 1JKHA 2F9WA 2FXUA 1N8RO 3CPWM 3NBPA 4DQIA 4BRQA 1J5OA 2P9UA 4YNQA 1S1TA 4BRPA 4FJNA 4E7HA 4KH5A 4QCLA 2AJQA 1S1WA 1KRPA 3FZMA 3EO3A 3O3FA 4FLZA 4DV6K 5AZJA 4IFYA 3A5NC 3AA4A 1Q8IA 2GTDA 1ITGA 4FLWA 3IKMA 4Y1CA 4CK2A 1A5VA 3SAFA 4JI5K 3WEEB 1KXPA 2XRIA 1Q9YA 4DQPA 3P83D 1O13A 4DR7K 4EP5A 4DR6K 4CEOA 1LW2A 4BR4A 3I0RA 1I39A 4OO1J 2O4IA 4DB3A 4Z0UA 3U3YA 3K57A 2C1GA 3EE8A 4C8NA 3K59A 4H03B 3ZSRA 5AQFA 1IKXA 3TAMA 4K25A 1BA0A 3VGKA 4NYFA 3IFRA 3HPOA 1SQKA 4EZ6A 1GLEG 4O5BA 4BRDA 3GG4A 2Q0RA 4N76A 1Z26A 4HTUA 2GX9A 1MU2A 3VEZA 3I8DA 4ZHRA 5AQZA 2OPPA 4DKWA 4BC2A 3H08A 1N5YA 1FXXA 4O5FA 3U8XA 3OYJA 4B1UB 4DFPA 1L3UA 3V81A 3SNNA 4A62A 4I6MB 2W6LA 1UA1A 1XHXA 4CHZA 2HBJA 4CHOA 4HVJA 3AGKA 3H1QA 3QDKA 1EWRA 1S72N 4YOUA 4FM1A 1C0UA 3KD5E 1BQMA 3KVGA 4KHSA 1NKCA 3KTQA 1RT7A 4B9VA 3CM6A 4OLAA 4JK9A 3CCJN 4CEEA 1YJWN 1IKVA 3NF6A 4NCGA 4JK7A 2GV9A 3A2FA 3RVCA 1HQEA 3ZCMA 3SUQA 4IOXA 4CIGA 4FK0A 3ZETA 2BUPA 2KW4A 1U6ZA 2WUSA 3QERA 4JI0K 1KCFA 4FCYA 3AVKA 4RW8A 2A42A 1BGXT 2ZF5O 4CF0A 4E7JA 2UXCK 3TSUA 1UAXA 3MN5A 3OJUA 1CLQA 2HHHK 3FR0A 3CIPA 5AJ3K 4L3QA 3OYAA 4BQLA 4HUFA 3CCSN 1RFQA 3O6WA 3M1FA 4FZZA 4JS5A 3CCLN 4CJ3A 4KB0A 1F21A 3G0ZA 4JRPA 5GAHP 2GWKA 3CCEN 1VSEA 4BC5A 1ZXOA 3AV9A 3VENA 5EXWA 3OYLA 1L3SA 3VEOA 4RG8A 3ZT4A 2HHSA 2D0CA 4WYBA 3IS9A 1GLJO 4OGEA 3OTOK 4AM7A 2P9NA 3H6EA 3CYMA 4K8XA 3JSMA 1FKOA 2DY4A 1OH8A 4YDUC 1NGCA 4PA1A 3ZSXA 3BEXA 4PY5A 4DSEA 4JKGA 4FJHA 1YITN 2YNIA 3N4QA 4M41A 5C42A 5J2QA 3SQ4A 3LP0A 4DTUA 3L2QA 3DLLL 4MDBA 4A2AA 3VA0A 5B8HA 4FWLA 5LMNK 3AY9A 3TTCA 3P39A 2D0BA 4BR2A 3HSCA 1X9WA 4FK2A 4CFBA 4DV3K 4AM6A 1BDGA 5JMVA 3KWIA 2G8UA 3AO4A 3DXKB 1IH7A 4BDYA 3VPZA 2CH6A 3BGRA 4IBNA 3G71N 1NK9A 3D2EB 1NNEA 4LY7A 4Y0WA 1V4SA 4H4OA 3J7AP 3QEVA 2P9LB 4CW7B 3LDSA 3M8SA 4Q5VA 3V1OA 3G10A 3THYB 1LOTB 3MCAB 4DQ8A 2P5OA 3CMEN 2KFZA 3H3OB 4C23A 2V51B 3SPZA 3KLGA 4HHTA 4E7KA 3KLHA 2KLAA 3OYNA 1M1KO 4OKEA 3LDLA 1GLLO 4M3ZA 1GLFO 1WAJA 2JLEA 5FDLA 1XWLA 3L3UA 3LWMA 5J2PA 3OW2M 5EOYA 3E01A 1BO5O 4OPKA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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