1U2VB

Crystal structure of arp2/3 complex with bound adp and calcium
Total Genus 57
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
57
sequence length
204
structure length
204
Chain Sequence
b'YAQGLLTGVVVDSGDGVTHICPVYEGFSLPHLTRRLDIAGRDITRYLIKLLLLRGYAFNHSADFETVRMIKEKLCYVGYNIEQEQKLALETTVLVESYTLPDGRIIKVGGERFEAPEALFQPHLINVEGVGVAELLFNTIQAADIDTRSEFYKHIVLSGGSTMYPGLPSRLERELKQLYLERVLKGDVEKLSKFKIRIEDPPRR'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structures of actin-related protein 2/3 complex with bound ATP or ADP
pubmed doi rcsb
molecule keywords Actin-Related Protein 3
molecule tags Structural protein
total genus 57
structure length 204
sequence length 204
ec nomenclature
pdb deposition date 2004-07-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1u2vB01
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 1u2vB02
2A41A 4BRCA 3VERA 1C0GA 1JCEA 4Z94A 5AFUA 2P9LA 2YJFA 1SZ2A 3VEOA 4BGBA 4DHYA 3QBXA 2A40A 3A5NC 4CJ7A 3BF3A 3ULEB 4AM6A 3LM9A 3KZBA 2ZGZA 4CI6A 1HKCA 4ISGA 4XH5A 3VF2A 3HBTA 1TUYA 4E1JA 4BVOA 4I6MB 3D7EO 3CETA 4FO0A 4LC9B 4FOEA 1P8ZA 3M1FA 2QXLA 3L0QA 3HI0A 1JCFA 4CBXA 5EX5A 4H0PA 4BG9A 5AZJB 1QHAA 1MWKA 3M6GA 4CZKA 1TYQA 1S22A 4L3QA 4FPAA 2P9LB 1WOQA 4FOIA 2GTDA 2J4RA 1GLDG 3LDOA 3SLCA 1GLCG 3LL3A 3BEXA 2Q36A 3DAWA 3VGLA 5BRDA 1HKGA 5I9EB 1NGFA 4B1VA 3ZX0A 2GUPA 1R59O 2D0PA 4ISEA 4B1XB 1MWMA 3F9MA 1X3NA 2AA4A 1KXPA 1BUPA 2E88A 3IDHA 5AQSA 3ZEUA 5JLHA 4FWRA 4BR2A 4B1UB 2GWKA 3H45C 3ENHA 5E84A 3WQTA 4M63C 3FE1A 4XH4A 3P4IA 2NRHA 3S41A 2W40A 4FPBA 4FL9A 4EAHD 3VENA 1U2VA 4BQLA 5ADXA 2FXUA 1YAGA 1HX1A 5AQNA 1TYQB 1T6DA 4MO4A 4BROA 2UYTA 4Y0WA 4FWNA 4K25A 4A2BA 2V51B 3IUCA 1J6ZA 3VGKA 3WEEB 1NGDA 4CZHA 1NGJA 1Z6RA 4NB4A 1GLLO 1DEJA 4BRPA 1GLAG 3H6EA 4WQ5A 3L6QA 4H0OA 1E4FT 3KVGA 4JNEA 2V7YA 4CZJA 1LOTB 4O5FA 2CH5A 3VEWA 2QWNA 4IJNA 3FFKB 5AQYA 3BP8A 2Q0UA 2GEMA 1V4TA 5KPTA 4K41A 3ULEA 1XQSC 2YHWA 3O5BA 3O08A 5KQDA 3JXUA 4JD2B 4JHDB 5TKYA 1GLJO 4F9OA 5EVZA 1BO5O 1QQNA 2FF3B 4BRNA 1NBWA 3VGMA 4RCHA 3CJCA 3UKUB 4I6MA 2QWPA 2Q97A 5CE3A 2V7ZA 3UB5A 3WT0A 4EIAA 2KHOA 4IO8A 2FSNA 4A2AA 4PKGA 1NLVA 3GBTA 1EQYA 5AZJA 1Y64A 3CJ7A 4QS8A 2YJEA 1ZXOA 2YCHA 1KAXA 3FR0A 2P9IA 4HTLA 3QICA 3OHRA 3EZWA 3CQYA 4BVPA 5KPZA 5FPDA 2QM1A 3FGUA 3MN9A 5BRHA 5AQPA 5FPMA 3RSEB 1MDUB 2VWBA 2QWRA 3J8AA 1BA0A 4EHUA 1V4SA 1NWKA 2ZWHA 2A5XA 3C7NA 2CGLA 4RTFD 4IZ9A 3VOVA 3R9PA 4WQ4C 3GL1A 4BR5A 1QQMA 2HF4A 1ZC6A 4IWVA 3W3DA 3QBWA 4BREA 3A5MC 3VEXA 2FSKA 3VPZA 1GLEG 1LCUA 3SMPA 4BRMA 3HZ6A 3LDLA 3H3OB 4K43A 2A42A 2E2OA 2P9IB 4BRFA 4H0TB 3A8YA 4DB3A 3GE1A 2VYPA 3FZMA 2YHYA 4QS7A 3WEEA 2P9PA 2E8AA 4H5NA 4BRKA 5BPNA 3ZX3A 3CIPA 1JCGA 4GY2B 1XUPO 1NGHA 2BUPA 2I7PA 3CJAA 3EO3A 4KBOA 4AM7A 3QMLA 4A62A 4H0VB 1NGBA 3C7NB 5AZIB 5JICA 3CHWA 5KPRA 4BRLA 4YDUA 4BRQA 4H0XB 2QWQA 3VEVA 4J8FA 4BC2A 2D4WA 1NM1A 1Q18A 4QS9A 3I33A 1ATRA 4BRDA 3MN6A 2Q0RA 4BC3A 4CZIA 2ZGYA 1T6CA 3AY9A 2E2QA 3M3ZA 4H0YB 3EKSA 4JD2A 4JHDA 1IG8A 1KAZA 1MA9B 4EFHA 1Z05A 3CJ1A 3UE5A 3UKUA 1KAYA 3QFPA 2A3ZA 2QWLA 3LM2A 4MO5A 3A5OC 3CQXA 5AQKA 4NO7A 3BUZB 2P9PB 5BN8A 2VCPA 5FPNA 3QFUA 2DPNA 4HWIA 2A6AA 4PKHA 4CD1A 4BQZA 1QZ6A 1YVNA 2CH6A 2D1KA 1NGEA 3WQUA 4H5TA 5AQIA 2HMPA 2F9WA 4M7XA 2YHXA 3FZLA 1RGIA 4CBUA 2ASOA 5AFUH 3HSCA 1DGKN 2I7NA 4B1WB 3ATVA 3H46O 3D2EB 4A61A 4CZGA 3MDQA 3RSEA 4IXCA 4BR0A 2IVPA 2BTFA 3HTVA 3U4LA 3FLCO 3DXMB 3EN9A 5AQTA 1YUWA 4BRIA 2D0OA 4CBWA 5AQFA 1BWFO 3FZKA 4CZEA 1HPMA 2AP1A 4CZLA 3AAQA 3WUHA 1NMDA 4PL8A 4WYBA 3ATUA 1U6ZA 4H03B 2E2NA 5BPMA 1YXQA 2E2PA 3LDNA 3O8MA 4DQ8A 1TUUA 1ESVA 2E1YA 3TPQA 1QQOA 3VETA 5JMVA 1D4XA 2PAVA 2QWOA 3WXLA 1RFQA 3ZX2A 4WQ5C 3FZHA 3U8XA 2FF6A 2P9NB 3MK6A 2IIRA 1QZ5A 3U9ZA 3TU5A 2IVOA 3O1WA 4BR7A 4XEIA 3DXKB 2P9UB 3D2FB 3G25A 4M7YA 3WXIA 3HM8A 2ASPA 5AZIA 3CJBA 4BGAA 5F1XA 3GOIA 5BPLA 2QWMA 1HUXA 4RWTA 1C0FA 3H3NO 5FPEA 2ASMA 1G99A 1BG3A 2NLXA 1S3XA 4BR9A 3U9DA 4BR4A 5F0XA 1GLFO 3JS6A 5ADXH 3MMVA 3R8EA 4BC4A 5JLFA 3GDQA 3L4IA 4JN4A 4XH1A 4BRGA 4H5VA 4GNIA 3SK3A 4C23A 3A0IX 3EL2A 3AAPA 2FSJA 2Q2RA 2ZF5O 5AQJA 1NGGA 1BA1A 1DKGD 2FLOA 3QB0A 2CGKA 2EWSA 4FWQA 3ZETA 1BDGA 2P9KA 1X9JA 4O8KA 4MLHA 1BU6O 1OKJA 1ZBSA 3C0BA 3GG4A 4BRHA 3D2EA 2F9TA 2GWJA 3CJ9A 4DCHA 4CD3A 4FWOA 2H3GX 2CGJA 3DXMA 2PBDA 5BREA 5KQ8A 4B1YB 3BF1A 3H1QA 4B9QA 1IJJA 4CZFA 4ISFA 4MLEA 1RDWX 1HJOA 2P9SA 4EHTA 5AQUA 5B8HA 2HOEA 5BRFA 3UKRA 3KHYA 4H5WA 1WUAA 1E4GT 1X3MA 2HF3A 2NZTA 3VF6A 5AQHA 4IJAA 4FWLA 3VEZA 5LY3A 4JAXA 2V52B 2OANA 4CZMA 5AR0A 5BR9A 3MN5A 5ELZA 1T44A 4FWKA 2ITMA 2W41A 3ZETB 2P9KB 3IMXA 3QDKA 1K8KA 4BG8A 2Q31A 2P9NA 1SAZA 2Q1NA 3A5LC 3LDPA 4B1ZA 1HKBA 3DWLA 4YDUC 5AQRA 3ENOA 5AQZA 1H1VA 5BN9A 3DXKA 2P9UA 1NGIA 3D2FA 1ATSA 3DJCA 3I8BA 3WXKA 5AQMA 5AQVA 1CZAN 3AARA 4FWPA 2YI1A 3MCPA 3ZEUB 1NGAA 5F2RA 3SMSA 5LJWA 2E20A 2E1ZA 2P9SB 3CI5A 4BC5A 3EKUA 4PL7A 3W0LA 5E26A 3UKRB 1SQKA 3O80A 2GELA 3R6MA 3ID8A 3B8AX 3O1BA 5AQWA 5LJVA 3FZFA 1XC3A 3IFRA 4FWMA 4H5RA 5AQOA 2QW9A 4WQ4A 1ATNA 1U2VB 1K8KB 3O6WA 5AQQA 3VESA 2WUSA 4PKIA 3WXJA 3H1VX 3LDQA 1HLUA 3VEYA 1NGCA 1GLBG 2IVNA 1BOTO 5EOYA 5AQLA 4FWSA 3SJHA 5EY4A 5AQGA 5AQXA 5EXWA 4K42A 3CERA 3MN7A 3O4WA 4BRAA 3VF4A 4FSVA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4BRCA 3HPGA 4AF1A 5AFUA 3VEOA 1I94K 2YKMA 4BEBA 3QBXA 2JGUA 2A40A 4OPJA 4AM6A 3LM9A 3D0PA 4FLXA 3L3UA 4DR7K 3MXJA 4YOYA 1TUYA 3ZT3A 1NG9A 3CETA 1ZBFA 3C6UA 4FOEA 4YOTA 2BE2A 3L0QA 4B8AB 1QQCA 4N5SA 3HI0A 4CBXA 4BG9A 1QSSA 1MWKA 3WXMB 1J9AA 3NGZA 4BWJA 3KTQA 1S22A 4FPAA 3LDOA 3SLCA 4DF4A 1JLQA 3QNOA 3AO3A 1HKGA 4W5RA 3C65A 4LY7A 5M1FA 4J2BA 1QVGM 1KXPA 1BUPA 4C8NA 1YTUA 5JLHA 2ZJRL 3TAGA 3SQ1A 1EWRA 3AVMA 4EZ9A 4LF4K 5E84A 3RR7A 1G15A 1E3MA 3WNGA 2D0BA 3FE1A 2OZMA 4XH4A 2NRHA 4DSFA 3VTHA 3CFPA 4DV1K 1SL0A 4BQLA 2DTUA 3ZSOA 1HX1A 2AJQA 2UYTA 4FWNA 4V19S 3ZSVA 3S9HA 4B9UA 1SKRA 1QSYA 1J6ZA 2RN2A 4JLHA 1NGDA 4ILHA 4CZHA 3L4QA 1NGJA 1Z6RA 1GLLO 4OKKA 4BRPA 1QHTA 1XMQK 4FJGA 4JS4A 1HNWK 3ZT0A 2XY7A 4JI6K 3CMEN 3M8PA 1EETA 4IJNA 3FFKB 4JYAK 5KPTA 1NK6A 4Z4GA 1RDBA 3EZ5A 2A1RA 3SV3A 3JXUA 3OVNA 1QQNA 3O3GA 5MLCQ 4NCAA 1LAWA 1TK0A 4EIAA 1WB9A 3V1RA 1DTQA 1YJNN 2XY8A 1NLVA 5GAHP 3MCAB 3NVMA 2OPRA 3V9XA 1X9SA 1L3SA 1W9HA 1RT1A 1ZXOA 2P9IA 4DTXA 4F3OA 4B9LA 3NMUA 3MN9A 1IBMK 1ASWA 2OPQA 5J2QA 4AHUA 2GBZA 1JL1A 1V4SA 3JAMO 4RTFD 4ID5A 3S3NA 4DTOA 3TAEA 3N4PA 3R9PA 4B3RK 5GADP 4FLVA 1RDDA 2O8FA 4CHPA 1QQMA 1VSHA 1ZC6A 4IKFA 4KFBA 1JLEA 4MDBA 4MDAA 4HHTA 1CLQA 2A42A 1U48A 4FJ8A 4ZTJA 2P9IB 4ILJA 1VK0A 4LFCK 5KGWA 3MEEA 3SBTA 3ZX3A 4GKKK 1XUPO 2F7TA 4FW2A 3EO3A 4KBOA 1YT3A 4J2DA 4OO1J 5JICA 3MECA 3CHWA 4DSEA 1IBLK 3HJFA 1SKSA 3VEVA 2O8FB 2UXDK 3PSIA 4HUEA 3KK7A 4I2PA 3I33A 4BRDA 4CVNE 3N4QA 4NLBA 5JVGL 1VQ7N 4CF1A 4JD2A 3T7ZA 3PIOL 1IH7A 1IG8A 5I3UA 2UXCK 4CHYA 3CJ1A 3DOKA 4JKCA 3T1AA 1KAYA 4Z4CA 2RF2A 4MO5A 3SBGA 3OYFA 4NCBA 5H1SQ 3OYHA 3P83D 4G1QA 1BIZA 1I39A 4Q5VA 4I9QA 2E5LK 2KFZA 3VQ9A 4BQZA 2CH6A 5LL6Z 3OYEA 4M7XA 2YHXA 1RGIA 3PLAA 4DUZK 3DOLA 5AFUH 1RT3A 4DQIA 2O4IA 5DM6L 3ASMA 2I7NA 3H46O 3KWGA 4CZGA 3RSEA 5M1QA 4BR0A 2IVPA 1VSFA 4UQGA 3HTVA 5C24A 4E3SA 2QA4N 3LDSA 1YUWA 4JI3K 4E72A 4OGCA 3ZT2A 3AA5X 1S6PA 3TAFA 3HL8A 2AP1A 2B6AA 5GAEP 3L2RA 3OYKA 4DLEA 1VRTA 2E2NA 3U3YA 3HP6A 5SZTA 3LDNA 3O8MA 3ALYA 3OYNA 2NRZA 4Y1DA 2UU9K 2QWOA 3K57A 1J5OA 3FZHA 4JKGA 3U8XA 1VSJA 2FF6A 2IIRA 3RR8A 3TU5A 3VQ4A 4KI4A 4XEIA 3G25A 3D2FB 3WXIA 3HM9A 4FJ7A 4CEDA 3HM8A 5AZIA 3GOIA 3SUOA 4FJ9A 4OX9K 1HUXA 2P1JA 3T1YK 1JKHA 1LWCA 1IO2A 2PYLA 4XJXA 3CCSN 1S3XA 3U9DA 4BE1A 1L3TA 4LSLA 4JKAA 4JK8A 1T03A 4GV6A 5F0XA 4CIEA 4YNQA 4KV8A 5HBMA 2XY5A 5JLFA 2IC3A 4FZZA 3DLLL 1LWFA 5J1EA 5JENA 4JKGB 4QCLA 3SAGA 4H5VA 2DY4A 4GNIA 1BL3A 1VHXA 2FSJA 3VQEA 5J2MA 2Q2RA 2FBVA 1R0AA 1NGGA 4G9ZA 4LF9K 2EWSA 1FJGK 5GINA 1X9JA 1KQSM 1BU6O 1OKJA 3LPUA 3MEDA 5C42A 2F9TA 4DCHA 2B4JA 4FWOA 2CGJA 3K5NA 4E7HA 1RDUA 2OPSA 5HROA 3PV8A 4DQQA 1FKPA 4ISFA 2WONA 4DS5A 1KVCA 2P5GA 1HJOA 4KTWA 1W97L 1TGOA 3UKRA 1RTJA 1GOBA 1ZBHA 4JAXA 2OANA 5BR9A 1WSFA 3JYTA 3V9SA 3KLFA 2HHSA 4FWKA 2W41A 1Q9XA 4LD0A 1RILA 3IMXA 3VQPA 3MX5A 3V1QA 1SAZA 4CEOA 3TWHA 4B1ZA 1HKBA 2NRWA 3ENOA 3CCQN 2Z1GA 3DXKA 4YY3K 3OYLA 1A5WA 5DMRA 3QO9A 2FBXA 1Z26A 2JLEA 5HL7L 2G8WA 1L5UA 1BQNA 5AQVA 1CZAN 2YI1A 3ZEUB 1XI1A 1RT4A 3EKUA 3HVTA 3UKRB 2GELA 2KQ2A 1J53A 3ID8A 3B8AX 2HHQA 3TR8A 1VQ9N 3HOSA 1OVQA 3K5OA 5LJVA 2KZMA 2HHHK 3IFRA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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