The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
12
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sequence length |
69
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structure length |
69
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Chain Sequence |
MTETDKKQEQENHAECEDKPKPCCVCKPEKEERDTCILFNGQDSEKCKEFIEKYKECMKGYGFEVPSAN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Yeast cox17 solution structure and Copper(I) binding.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Cytochrome c oxidase copper chaperone
|
| molecule tags |
Chaperone
|
| source organism |
Saccharomyces cerevisiae
|
| total genus |
12
|
| structure length |
69
|
| sequence length |
69
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2004-08-09 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF05051 | COX17 | Cytochrome C oxidase copper chaperone (COX17) |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Helix Hairpins | CytochromE C oxidase copper chaperone |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2HP8 A; 1HP8 A; 2LGQ A; 1U97 A; 1Z2G A; 2RNB A; 2LQT A; 2RN9 A; 1U96 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1JX9 A; 2H94 A; 1KP2 A; 2PUS A; 2EIK B; 1SRY A; 2WWW A; 2EIM B; 4UCV A; 3DGE A; 1IBL B; 5JH7 B; 3E8F A; 1X59 A; 4CH3 A; 3H1L H; 2HKO A; 4DV0 B; 3G80 A; 3CCS V; 4ABM A; 2YEV B; 3CRQ A; 5E79 Z; 1NU1 H; 3T4D A; 3JCZ A; 2YIA A; 5IWA B; 3A0R A; 3DC6 A; 3T4Z A; 4RUE A; 1KB9 F; 4DV6 O; 2QSA A; 3EFF K; 4QGP A; 1ZAU A; 3WB2 A; 2LW7 A; 1G1X B; 1US6 A; 4MVM A; 4E2L A; 1H2M A; 2AXT Z; 2F93 B; 3JAT A; 5BXZ A; 4HNA B; 5CBH A; 1GN3 A; 1GK9 A; 2EUL A; 1S5H C; 2RQ6 A; 2WPD G; 1QHT A; 1PNL A; 1UJW B; 4LWS B; 1EM1 A; 4JI4 B; 4DW1 A; 1N36 O; 5DM6 V; 2JEU A; 4MTX A; 3BRC A; 1IX9 A; 2JIZ G; 4O4J A; 4B3M B; 1XOU A; 3JD2 A; 2YXY A; 3HKE A; 4JI3 B; 1L1F A; 3K5N A; 2E74 B; 1P49 A; 4JV5 O; 3CWB H; 1R3J C; 2PYL A; 3FB7 C; 3CCJ V; 5LMU B; 4LCU C; 4N21 A; 2O57 A; 4MVQ A; 1JVM A; 4MSW C; 3L9D A; 4UCT A; 1HNW O; 3IAY A; 2DOS A; 2UXX A; 1N32 O; 4KL1 A; 3OT7 A; 4DR5 B; 1GTO A; 1Y67 A; 1Z5V A; 4NYK A; 3I56 V; 4DR3 B; 1JOY A; 4NKG B; 3JAR A; 4K0K O; 2A9H A; 4JI1 B; 3ZHR A; 4LFA B; 1WA8 B; 4MVS A; 4K8Z A; 3WB0 A; 2AHY A; 1N34 B; 2Q7G A; 1K5Q A; 1AR4 A; 1JJ2 U; 2IM9 A; 1MOF A; 3TCU A; 5FPO A; 2AHZ A; 3HPL C; 4P2Z A; 4IIJ B; 1HNX B; 3FAV B; 3UKM A; 4LF4 O; 3K58 A; 4HBN A; 4F6R A; 2ZDI A; 1FKA O; 2A79 B; 5B3S C; 1NZ6 A; 4YJ2 A; 2KKW A; 2WAM A; 3LSU A; 4UV8 A; 3IC7 A; 4FMT A; 3U11 A; 4EEQ A; 4DV3 O; 4JI8 O; 3ABM B; 1RSO A; 5LP6 C; 3ETQ A; 4ASU G; 3HKC B; 1YDX A; 2V7Q G; 5LP6 A; 3ZMS A; 4DO2 A; 4Z1M G; 3A0B Z; 3AG3 C; 3ZCC A; 1CXZ B; 5JVD B; 5J9P C; 4OPA A; 3RYI A; 1VEW A; 3T2M A; 2LQT A; 4RO2 A; 2RDC A; 3PJS K; 2EIL C; 4PDM A; 3G6B A; 3ABK C; 1IXM A; 3UT5 A; 3SYQ A; 3AK2 A; 4J80 A; 1XMQ B; 4MTO A; 2WLH A; 3JAS A; 1WNS A; 1XMO O; 1F23 A; 4TQF A; 4JAV A; 5EK0 A; 4DV4 B; 4NXM B; 1I7F A; 4LF9 O; 1XNQ O; 4KFM A; 2UXB O; 1OHH G; 2VWK A; 4I55 B; 3MAQ A; 1Z2G A; 2QM4 A; 2W6I G; 5LGU A; 2QKA A; 5L3C A; 4FLY A; 2CUG A; 4PDR A; 3JSL A; 4WFH A; 1KYO F; 1IXB A; 2K9P A; 3ZRS A; 3RW0 A; 3QTC A; 1K3E A; 4YHH O; 2QTO A; 2Q7E A; 1SQQ H; 4FLZ A; 1GAX A; 5CN0 A; 3KCY A; 2XHB A; 1SQV H; 2XND G; 5DED A; 2N04 A; 1NH2 B; 1IDS A; 3ZHV A; 2Z5U A; 1H38 A; 1PP9 H; 1YVW A; 3LSS A; 4YY3 O; 1EZV H; 4ZI7 A; 2CTP A; 1HWY A; 4F6E A; 2DQ3 A; 1Y76 A; 3G6E V; 4I4T A; 4TQD A; 2JGU A; 2Y4U A; 1FAF A; 2HFE C; 3F5T A; 1O9G A; 2WLK A; 1AB3 A; 4UCU A; 5KHH A; 2A3Q A; 4JAS A; 4TSF G; 2BSK A; 3TET A; 1BT8 A; 5GTI Z; 4A5U B; 1MZE A; 2BCC H; 3CD6 V; 3CXC U; 1PNM A; 3CS5 A; 5KX5 A; 2Z0A A; 2IH1 C; 4FFK A; 3TJT A; 1A32 A; 4O2B B; 1YJN V; 1OCO B; 2YDE A; 1FXK A; 2C2A A; 2EZO A; 2HR3 A; 5B66 Z; 3UQ8 A; 1ZTE A; 2IBZ H; 4X1I B; 5JCO C; 1VF6 A; 3OTO B; 3JSN A; 3ZMV A; 5EC1 C; 3ABT A; 4O4I A; 2X0L A; 5JCO A; 4DV5 B; 1IBM O; 3RVY A; 3BY6 A; 2JK5 C; 1JFF B; 5JQG A; 2OIG A; 1LUW A; 4IL6 Z; 2UXC B; 3QVN A; 1QR8 A; 2ADP A; 4RQF A; 1FPO A; 2ZIM A; 5BR8 B; 2QGN A; 1CEZ A; 1YTF D; 1EBO A; 4O4L A; 5LMN O; 1TUB B; 4X20 B; 1SF9 A; 3OW2 U; 5FLX N; 3SPG A; 1V54 C; 3OMI B; 2VS0 A; 5B1O A; 1ZL8 B; 4P9O A; 4YJ3 A; 3N2G B; 2E76 B; 3ZMT A; 3CRM A; 5JJE B; 2ODM A; 4EFB A; 2ZNJ A; 1YJ9 V; 1HR0 O; 3E8G A; 1K33 A; 3OFN G; 3WG7 C; 1M90 W; 5BMV B; 4R50 A; 2ARH A; 4H33 A; 2P90 A; 5KHJ A; 4FLU A; 3D3Q A; 4GYC B; 2JRI A; 3AG4 B; 4IYI A; 4HAM A; 1NTK H; 4PA6 A; 3ZHQ A; 4EKW A; 2XAH A; 5KHK A; 2LO1 A; 3KZI Z; 4PDL A; 3N2K B; 1OCR B; 4DYL A; 4J7Z A; 2YXL A; 3APO A; 3GB7 C; 2XAQ A; 4C7U A; 3MHS C; 3AG7 A; 1NVP B; 3RYC A; 4FFB A; 4JI0 O; 2Q9L A; 3E22 B; 2R72 A; 4CS4 A; 4QIW F; 2UXN A; 3D3I A; 2IU3 A; 3HKD A; 4UVB A; 5FNV A; 1HP8 A; 5EC2 C; 5KHG A; 3FYE B; 1QBZ A; 1OCC C; 5J2U B; 2WLN A; 5K1X A; 3ZX6 A; 1RM1 B; 2EX3 A; 2E5L O; 2HHH B; 1WJZ A; 2HLD G; 3ETE A; 1CP9 A; 3C90 A; 2P5O A; 5IYD O; 4Q20 A; 1XDC A; 4EB6 B; 5DN6 G; 2YIB A; 1SES A; 3CC2 V; 4PD4 F; 1TVK B; 4NR1 A; 1QU7 A; 3L72 H; 4JYA O; 1AJP A; 3RT3 C; 2OCC C; 3BA9 A; 4TWK A; 4LC1 A; 4OGQ B; 1R3I C; 3SYP A; 1MSD A; 1SQX H; 3C3T A; 4ZOL A; 1NT2 B; 3SYA A; 1YF2 A; 1OCZ B; 1P7G A; 5KUK A; 2XAF A; 3CCV V; 4IYH A; 4JI2 B; 1NS1 A; 4G2K A; 1UFI A; 3OGI B; 5KMG B; 2JEX A; 1SKV A; 3P3N A; 4DR7 B; 4DV1 O; 5IY5 B; 1MZF A; 2KB1 A; 4DR6 B; 3K3W A; 1BSM A; 1WP7 A; 3ASO C; 1VQP V; 1I08 A; 2UXD O; 3OMN B; 3CX5 F; 4I0X A; 4U7O A; 2ZR3 A; 2P4K A; 3STZ C; 2CH7 B; 2DYS C; 2PF4 E; 3H1J H; 3D8C A; 4B3S B; 5ITZ A; 1D5A A; 1Y4M A; 3A8T A; 1RFY A; 2ZM6 O; 4O2A B; 3G67 A; 4X65 O; 1H2L A; 3FB6 C; 3T1H O; 2VQE O; 2UUB B; 2DW4 A; 1KEC A; 2ZE6 A; 4DV7 B; 1SER A; 1KKC A; 2YXH A; 3K08 A; 4GKK B; 2UUC O; 3Q4H B; 4OPH A; 3B8M A; 1VAR A; 1HW7 A; 3BAA A; 3OEE G; 2LFS A; 2QWQ B; 4NTY A; 2Y69 B; 1TGO A; 2KG7 B; 1P7B A; 4MTF A; 3STL C; 4X64 B; 3QNE A; 4FZ0 A; 4BR6 A; 4PI2 A; 1FJG O; 3ABL B; 4DUY B; 5IJ9 B; 2GTA A; 1M4U A; 3KKY A; 2R70 A; 1S76 D; 4RUF A; 2EIM C; 1SS3 A; 2ZT9 B; 4X1K B; 2ZQM A; 3CCQ V; 3K9A A; 3ZBH A; 1Q90 D; 3DXR B; 4UCO A; 2HG5 C; 3BA8 A; 2UUA O; 3ZHS A; 1FFX B; 4FJC C; 4LNU A; 5A9G A; 4WBN A; 4XBF A; 1SA0 A; 3FD9 A; 3O65 A; 1XNR B; 3LSQ A; 4FM1 A; 1YIJ V; 1NR7 A; 4I7Z B; 4TV9 A; 4RQE A; 2GBO A; 3RGB A; 4I5S A; 1G6U A; 4B3R O; 4G27 B; 1O9H A; 1ORQ C; 2ETN A; 3X2Q B; 5IWA O; 1YHQ V; 3BPZ A; 4I50 A; 3E89 A; 1MNG A; 1PM9 A; 2YIB D; 1VQN V; 2P22 C; 4F4L A; 4GUN A; 4MVO A; 2KSD A; 5J2T B; 3HKB A; 2HVJ C; 1LUV A; 5LXT A; 4UV9 A; 3SPC A; 4B7K A; 4JI4 O; 3QO7 A; 1AP6 A; 2Y48 A; 2NNU A; 5IJ0 B; 1Y74 A; 2AGA A; 1Q82 W; 1D2D A; 4B3M O; 4JI3 O; 2HEP A; 1I0H A; 3B4S A; 5CBF A; 3QO5 A; 3LUT B; 4GCZ A; 3RVZ A; 1Q5O A; 3ZRV A; 4JAU A; 3RYF A; 1BS3 A; 1MMM A; 2G38 A; 4JYY A; 4YIO A; 4B7E A; 1R73 A; 4LF8 O; 2E75 B; 1XIL A; 1VQ7 V; 2WA4 A; 5JWP A; 5EZY A; 1AJN A; 4DR5 O; 5IDJ A; 1JMK C; 2N05 A; 4QNH B; 4ZHQ B; 5CMU A; 4DK0 A; 3K0D A; 4JI1 O; 3ETD A; 4DRX A; 3JAK A; 4LFA O; 2DE0 X; 3ZRW A; 3W7S A; 2QWN B; 4I9W A; 2JS5 A; 4TV8 A; 1ENV A; 1JCH A; 3RN4 A; 4CBC A; 5C93 A; 2Q68 A; 1NKD A; 1N8R W; 5H9C A; 4IIJ A; 3LDD A; 1J5E B; 4H0L B; 1OZ0 A; 3OUS A; 4LFC B; 3QO8 A; 4LH7 A; 3K5L A; 2GV9 A; 1HNZ O; 1K7D A; 2K1E A; 2IJJ A; 3AG1 B; 4J9Z B; 1R6T A; 3SJA C; 1AI7 A; 1OJH A; 4NTX A; 1ZWI C; 2A7W A; 4JI6 B; 3H1I H; 3ABM C; 3E8B A; 3JAT B; 2RNB A; 5LHI A; 1KBH A; 5C8Y A; 2DN9 A; 1V55 B; 4UVA A; 3W7X A; 1U97 A; 1VMG A; 3FFQ A; 3JD0 A; 5KUM A; 2PGG A; 1N0N A; 1WPB A; 2P6J A; 1ARO P; 4O4J B; 1RP3 B; 3QG5 A; 4JYB A; 3SGI A; 2ZIO A; 3HKE B; 4OXS A; 2WA3 A; 2GHY A; 2W0X A; 3AK1 A; 2P7T C; 1P4R A; 3B2E E; 2Y0P A; 2MW2 B; 2ILM A; 2L6L A; 2WLI A; 2BTQ A; 2WLM A; 4FIP C; 2N74 A; 1VQ5 V; 1HNW B; 3CRA A; 5LHG A; 1CPY A; 2QA4 V; 2GDS A; 4DR2 B; 1S5J A; 5FL7 G; 4LF7 B; 2EZP A; 1EN4 A; 3SR2 C; 5B5E Z; 4DV4 O; 1H2N A; 2ADQ B; 4K0K B; 3JAR B; 2QR4 A; 3FX7 A; 1M57 C; 1BMF G; 3JD4 A; 3G4S V; 3CC4 V; 2JS3 A; 5H6R A; 3U0Z A; 4PI0 A; 4FM2 A; 2BE3 A; 4FLV A; 4WFF A; 4X62 O; 3EHB B; 2UU9 O; 2R9I A; 2Q8V A; 1MAB G; 1PL0 A; 1WP8 A; 4D7T A; 4I9Q A; 2BOC C; 4F6R B; 3MDS A; 2BTO A; 4R8C A; 1XHX A; 3VQW A; 5B3S B; 3B40 A; 4YJ2 B; 1HDJ A; 1JPX A; 2HVK C; 3DC5 A; 4TOI A; 2ZXW C; 1B6Q A; 2EJ7 A; 1RSO B; 1VQM V; 4J42 A; 1D5N A; 5CB4 A; 1N33 O; 5LOV B; 1Q3E A; 1S77 D; 2JGD A; 1OCO C; 5IYB O; 4JTC B; 2ZE7 A; 3RYI B; 3AG3 B; 2HJF C; 3CPW U; 4WF9 V; 1VQ4 V; 1NTM H; 2QJ1 A; 5B1B B; 2X6C A; 5L3B A; 3H9V A; 3UT5 B; 1XMO B; 1F7Y A; 1M56 B; 3JAS B; 2EIL B; 1M93 A; 3ABK B; 3K5O A; 1XNQ B; 3IFX A; 4GKJ B; 1W0K G; 2QWR B; 4PA4 A; 2WLJ A; 1SET A; 2IW5 A; 1Y66 A; 4N23 A; 2EBO A; 5L3F A; 4DV5 O; 4H37 A; 3E86 A; 3IGA C; 1TA8 A; 3EVK A; 3MD0 A; 2EIJ B; 3QF7 A; 4PDV A; 4U3J A; 3CP1 A; 5KAF Z; 3N27 A; 1BQ0 A; 1COW G; 1WPX A; 3ZN1 A; 5BR8 O; 3A2F A; 3CJH A; 3ZIA G; 1M9N A; 3B8N A; 4D6T H; 4ZIB A; 1PL4 A; 1QR9 A; 4DV2 B; 2B5U A; 1DF4 A; 1WB7 A; 3ZHT A; 5EIB C; 2HP8 A; 1EZJ A; 4PEL A; 1NJI W; 4YY3 B; 1ZL8 A; 3UCS C; 5GON A; 3FB8 C; 3OR7 C; 3N2G A; 4NXN B; 4ZI7 B; 4XDJ A; 3ZHU A; 2F43 G; 4QJF B; 1Y76 B; 2GUZ A; 2P06 A; 4I4T B; 1RPR A; 4OX9 B; 2DJV A; 1K73 W; 1IBK O; 4KP4 A; 3RWR D; 1XEQ A; 4X8A A; 1DF5 A; 3D36 C; 1YJW V; 2BSK B; 5LA6 A; 4P9P A; 4L8J A; 1F4M A; 2CDY A; 2H8P C; 3SPI A; 3AK3 A; 3D36 A; 3P3P A; 3I55 V; 3RYH B; 3AG2 C; 5KX5 B; 1NR1 A; 3GWO A; 1OCR C; 4LF5 B; 3CYO A; 2RJZ A; 2VRZ A; 4JI5 B; 1FXK B; 2OIE A; 3JAL A; 3K04 A; 4PJ0 Z; 3M99 B; 5KLV H; 2CAZ C; 1KD1 W; 2CE4 A; 2XAS A; 1NH2 D; 4Z1V A; 4JZ2 A; 4O4I B; 4CC6 A; 1GN6 A; 1K5S A; 2Q6A A; 1YIT V; 1AVM A; 3ASN C; 3PN1 A; 5JQG B; 3S3X A; 1TAE A; 3T1Y O; 2W0F C; 1IVS A; 5B1A B; 1YZB A; 3E8H A; 4JGS A; 3CCE V; 4UVC A; 4LFB B; 3K06 A; 4O4H A; 1RM1 C; 4QPK A; 3CSX A; 1W0J G; 3ZRX A; 5LMN B; 2W6J G; 4LR3 A; 4O4L B; 3THO A; 2YID A; 5LGN A; 2VQF B; 4Q6G A; 4JI7 B; 3CEI A; 4W4L A; 2HHH O; 4LF6 O; 3GVM A; 1IUR A; 3SPH A; 2NLJ C; 2PTM A; 3R65 A; 4RAI A; 5KA6 A; 1HR0 B; 4L87 A; 2Q73 A; 1LR1 A; 3SJC C; 1U96 A; 5EYP B; 1JJO A; 4PA7 A; 4DR1 B; 2EIN B; 1PV0 A; 1FS0 G; 1GM8 A; 1GMG A; 4J9Y B; 4X88 A; 3ETG A; 3WG7 B; 2PY5 A; 4MW8 A; 1AI4 A; 1Q6U A; 5EBM C; 5IY5 C; 3CCM V; 4B3T B; 4G28 B; 2OTL V; 4P30 A; 1R6N A; 2YIC A; 4MT8 A; 1SQF A; 3VBB A; 4DR4 B; 4DR6 O; 4LH6 A; 5KAI Z; 2NN4 A; 1OV9 A; 2XT9 A; 1GH6 A; 2WLL B; 5CA1 A; 3ML0 A; 4GX1 A; 4UB6 Z; 5LL6 Y; 2CH7 A; 3FKS G; 4H13 B; 1DLB A; 3LDE A; 3K57 A; 1BHB A; 4NB5 A; 4B3S O; 3RYC B; 4FFB B; 4NVP A; 4GX5 A; 4O2A A; 1W2B U; 1BHA A; 4R7C A; 5GW7 A; 3W7W A; 3K0G A; 4X1Y A; 3RBZ A; 5D5P A; 4FM0 A; 2AZ2 A; 1R1B A; 2Q69 A; 3HKD B; 2F4V O; 2CTW A; 2F1M A; 5FNV B; 4MVR A; 5E1A C; 1EN6 A; 5LYJ B; 4GX2 A; 1KC8 W; 2ZCE A; 2M6Y A; 4DV7 O; 5AG2 A; 4AQY O; 3BVO A; 1SZX A; 2Y69 C; 1I94 O; 4X9Q A; 5D5Q A; 4X66 B; 2E5L B; 3VQX A; 3ABL C; 3M7M X; 1FFT B; 4IHJ A; 3OD4 A; 1FYJ A; 3P30 A; 1WAZ A; 2JDI G; 4FPP A; 2F95 B; 4K35 A; 3JYC A; 1KQS U; 1EFR G; 2XUM A; 1WN7 A; 2XOK G; 2QEX V; 3U10 A; 3F7Y C; 2Q5Z A; 4BIU A; 4UUJ C; 3J80 N; 4ZOL B; 5IYZ A; 1IZ3 A; 3JD3 A; 2YSU B; 3S3W A; 4FK5 C; 4DUZ O; 3LNN A; 3L71 H; 3NR7 A; 2Q7H A; 1AJQ A; 3CMA V; 4CS3 A; 3F7V C; 5EBL C; 4FVM A; 1S0V A; 4J10 A; 2RN9 A; 4JTA B; 2E3C A; 1XNR O; 1X4T A; 1L0N H; 1I5X A; 3X2Q C; 4J41 A; 2UXD B; 1MG1 A; 3JAW A; 2ZKO A; 1H8E G; 1MA1 A; 4I0X B; 1PKX A; 2EIK C; 5CA0 A; 3TXS A; 1K9M W; 1GO3 F; 2LJ2 A; 5KHI A; 1ROP A; 1K4C C; 1YCI A; 4WFG A; 2ZM6 B; 5ITZ B; 4X65 B; 4TUY B; 4ICG A; 5JH7 A; 4QE7 A; 2VQE B; 2XTA A; 1IBL O; 3DSQ A; 1AIL A; 4WFE A; 4BAY A; 2FKX A; 1VQL V; 4DV0 O; 2LGW A; 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