1UA6Y

Crystal structure of hyhel-10 fv mutant sfsf complexed with hen egg white lysozyme complex
Total Genus 45
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
45
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDGNGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Immune system/hydrolase
molecule keywords lysozyme binding Ig kappa chain V23-J2 region
publication title Structural consequences of target epitope-directed functional alteration of an antibody. The case of anti-hen lysozyme antibody, HyHEL-10
pubmed doi rcsb
source organism Mus musculus
total genus 45
structure length 129
sequence length 129
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2003-02-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
Y PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1ua6Y00
3A91A 1WQMA 4WG7A 5KXZA 2ZNWY 3A3QA 1QUSA 2NWDX 5LIOA 3ZVQB 3ZVQA 1UIBA 2HECA 1LJIA 3AZ7A 3IJVA 1IP5A 4H9CA 1V7SA 1CJ6A 208LA 2Z39A 2ZQ4A 1UACY 4QGZA 1REYA 1AT6A 2D4IA 1FLWA 132LA 2DQDY 1JKCA 1WQPA 2ZILA 2BQEA 3WPLA 5APCA 1JJ0A 4LGKA 2HTXA 3IJUA 1F6RA 5KXNA 4NGLA 3HFMY 1BB5A 3FI7A 4QY9A 1UIDA 1CKFA 1I20A 1LHLA 1ZVYB 6LYZA 5J7CA 4ZFPA 1O23A 3CSRA 4TSBA 2EPEA 4TWSA 2ZQ3A 1JTOL 3ATOA 4H9AA 4H9IA 1TBYA 5APDA 1J1PY 4CJ2A 1UIGA 4LYMA 1GE4A 1REMA 1AM7A 1VDPA 4N5RA 5DLAA 1GWDA 5LYTA 1YROA 1B5YA 4D9ZA 1GB2A 2YSSC 3OJPA 4B4IA 4BADA 3LN2A 4I0CA 2YVBA 1PZYA 2HU3A 3EXDA 3W6AA 1B5VA 4G9SA 3ZEKA 1C10A 5LYMA 4H1PA 1YKXX 1FLYA 4J7VA 3A3RX 1JTPL 5AMYA 3AZ5A 1JIYA 1H6MA 1JKDA 1LPIA 3LYMA 1GF5A 1LSEA 3T6UA 1XFPL 3MGWA 1QIOA 4IATA 4NIJA 5DL9A 5LVHA 2G4NA 4NGYA 3A6CY 4PRQA 1GB3A 2DQJY 4XJHA 3WW5A 1GF6A 3TXFA 1D6PA 4MCKA 5KXWA 1B5XA 4DD7A 3KAMA 4R6CA 2DQAA 5B59A 5KXRA 5LA8A 5HNCA 1YKYX 2A7FA 1KIQC 4RW2A 5I4WA 5ILFA 4XJIA 4NGIA 4WL7A 1DXJA 3BKVA 4HPEA 1B5UA 1LJEA 1WQRA 1GFUA 1LYZA 4W94A 1IWTA 1BB3A 2B5ZA 2G4PA 1UIAA 5APEA 3TMXA 1A2YC 3WUMA 4UWUA 4NWHA 4PRUA 3ULRA 1GF3A 1GE3A 1JPOA 1RCMA 3VWOA 1DI5A 4DYGA 3CQLA 1XGQC 3WU7A 1IOSA 3WXTA 1J1XY 4C3WA 1IY3A 4DC4A 5FCPA 1GBYA 5HQ1A 1LZRA 4WM6A 2MEGA 4CHXA 4ANRA 4NG8A 3GXKA 1HEQA 1GEZA 4H8XA 1VAUA 1LMTA 2FYCA 3HBDA 3WMKA 1LZ9A 4RW1A 1OUCA 3CT0A 3WH1A 3AZ6A 1GBSA 1GF8A 3W6CA 4GLVA 4Z46A 2H9JA 2MEDA 3LYOA 3AB6A 4LZTA 2EQLA 3P66A 1BVXA 5IDDA 3D3DA 1C45A 4A7DA 4TUNA 4KPMA 1IP2A 4KL7A 4B4EA 2YBHA 1QDTA 5M1YA 1IP3A 1NMMA 2D4JA 3AGGG 3HBHA 1VFBC 5KXPA 5FEKA 4HJVA 2A7DA 5KKJA 2ZIJA 2C8OA 1ZMYL 4N9RA 5LXWA 1BWIA 1NBYC 4WM4A 3B0OA 1C46A 4N8ZA 4WM1A 5HLLA 1GBOA 1XGPC 5L3HA 3LZ2A 3M18B 3LYTA 1OUEA 1CJ8A 5HNLA 4LYTA 1GF7A 3A92A 1MLCE 4NFVA 5K7OA 4OWBA 4LYZA 3WUNA 3TMVA 2I26L 1HFZA 1TEWA 1UBZA 1GFTA 2BQDA 2BPUA 1LZBA 3A94A 3QE8A 1B7MA 1BVKC 1GFHA 1LSZA 1LMNA 1LHHA 5FELA 193LA 2LHMA 2Z19A 3W3EA 1D9UA 2D6BA 3TXGA 2FYDA 1LJGA 5F9XA 2DQFC 4B4JA 1IIZA 1LZAA 3A6BY 1JSFA 1RFPA 4HJYA 4NSJA 5F81A 1OP9B 4GN4A 4DD3A 4ETDA 2BQFA 5KXXA 1IVMA 1LMAA 3RT5X 2GV0A 2I6ZA 4DD1A 3TMUA 1HEOA 1D6QA 3AW6A 1BB7A 1PS5A 4GLAA 4LFXA 4H94A 1FKQA 1W6ZA 1I1ZA 2BQGA 4MSTA 4OWCA 5KXYA 3A34A 5L9JA 5LVJA 1IWWA 1LSBA 4J0LA 2BQKA 3TXHA 4WMGA 4G49A 1EQ4A 1H87A 4I8SA 1HEWA 4XENA 3A96A 4YEMA 2Q0MX 3WYHA 5LINA 1F0WA 1OUDA 4GCEA 4WM3A 2RSCA 5KXSA 3WXUA 3CSQA 5LVIA 4UWVA 1JEFA 1RE2A 2YBLA 1QQYA 1B7NA 2PC2A 3AGHA 3ATNA 1B0DA 2AUBA 1IR9A 3W6BA 2MEFA 1Z55A 1D0KA 1P2CC 1RI8B 4XADA 3WL2A 4LT3A 3WUAA 1WVVA 3WVXA 5I4YA 1CKHA 1TCYA 5LAGA 1UUZC 1IR8A 1YL0X 1UCOA 2DQHY 1LJNA 1AKIA 2CGIA 1LZSA 2XBSA 1CJ9A 3A67Y 1QTKA 3A95A 5KXKA 4M4OA 1HFYA 1GEVA 4PPOA 1GE1A 3FE0A 4QEQA 2HEAA 4NHPA 133LA 4NHSA 4G4HA 2BLYA 4J1AA 5C6JA 3WPJA 3TMWA 1HMLA 4NEBA 2IHLA 2HEEA 2Z37A 4B49A 4N1CC 1LMOA 3T36A 1GFGA 3HBEX 3IWRA 4TTDA 4U3XB 4WG1A 1RJCB 1LZCA 1QUTA 4IASA 4L41A 4BAFA 1FN5A 4R0FA 3F6ZA 5FHWA 1HMKA 4N1EI 1YANA 3P64A 1G7MC 2BQBA 4II8A 4WO9A 1IR7A 4HSFA 194LA 1REZA 1UC0A 3N9CA 4OWAA 4YF2A 3RNXA 3G3BB 3CT5A 1IP1A 2H9KA 2N5ZA 3EMSA 1IOTA 1JHLA 1T6VL 1XGRC 1B7SA 1IC5Y 2FBDA 4G4BA 4XN6A 4B1AA 1NBZC 1QTEA 4J1BA 1LZ8A 1W08A 3J4GA 5E9RA 1IOQA 3G3AB 5I54A 5T3FA 5KXLA 3BKHA 1UICA 4H9EA 2YBMA 2W1YA 4OWHA 1OUIA 5I53A 1FLQA 4AXTA 4WLDA 2BQHA 4WLTA 1HEMA 2MEAA 1QSWA 4YEOA 1OUJA 4TX7A 1BWJA 4OOTA 2CWIA 1ALCA 1JSEA 4HTKA 1NDGC 3OK0A 2CJLA 1UIHA 1LYOA 5B1FA 4NGVA 135LA 3CSZA 1LSPA 3W6FA 2BAAA 1NF5A 1XEJA 2ZNXY 3A90A 1B5ZA 3P65A 1JWRA 1VDSA 3A8ZA 1GPQC 5D5FA 1TDYA 1HF4A 4LT1A 4WL6A 1LHKA 1LYSA 1NKHA 1DKKA 1NDMC 4XJGA 2MECA 4NHQA 4UWNA 2LYMA 1WQNA 4HTQA 1YAMA 2DQIY 4NSHA 1E8LA 5DN5A 3WPKA 3WU9A 3GXRA 4YM8A 3B6LA 1DI3A 1LZ6A 1UIFA 1YAOA 2LYOA 1DKJA 4DT3A 5IELA 4LT2A 4KXIA 1GF0A 4DDCA 4WM2A 2H5ZA 1GF9A 1LAAA 5A3ZA 1UA6Y 4P2EA 2MEHA 1LSFA 1D0LA 1EQ5A 5HMVA 1GFJA 1LZDA 2DQCY 3N9AA 2ZYPA 1KXXA 1IC7Y 1QSAA 1IORA 2C8PA 5DM9A 5II3A 1GB5A 1VEDA 3W6EA 4HP0A 4NGWA 5B07A 2IFFY 1LZYA 1LMPA 207LA 2BQIA 1REXA 4O34A 3A93A 1SQ2L 9LYZA 1B7LA 1KXWA 1LZ4A 2F2NA 5LVKA 3WU8A 1BWHA 1B7QA 4ETBA 1YL1X 1JJ1A 1CNSA 4H90A 1LSNA 1BQLY 1JKAA 3AJNA 1LKRA 1LSMA 1LHMA 4NY5A 1JJ3A 2MEBA 2DBTA 5APFA 5FDJA 4NGZA 2BQJA 4EMNA 2BLXA 4H92A 1HSXA 4NGJA 1J1OY 1GAYA 4XYYA 3AGIA 4AGAA 4DD0A 4ETCA 3J6KA 1GE0A 1I56A 1YAQA 5LYZA 1IO5A 1LSDA 1AT5A 1IY4A 1NHEA 3RU5A 3EBAB 5A3EA 4H9BA 3LYZA 5HMJA 2HEBA 1KIPC 1UIEA 2ZWBA 1HNLA 4ML7A 1JITA 3CT1A 2Z12A 3CB7A 1TAYA 3LZTA 4B0DA 1DPWA 2XBRA 1LZNA 1A4VA 1HEPA 1LKSA 2FBBA 2HEFA 4XJDA 5IHGA 6LYTA 5KXOA 1GBWA 1QDRA 4PGJB 5FSTA 4DD9A 4FDYA 134LA 4EOFA 1DPXA 1BGIA 4GN3A 4ET8A 1SLYA 4YOPA 2YDGA 4WLYA 1IX0A 1G7JC 1HELA 1KXYA 1LHJA 4GCBA 5KJ9A 3N9EA 1F6SA 4DWXA 1YKZX 1GDWA 1GHLA 1B7PA 1FDLY 1IWUA 1WVUA 1B9OA 2XTHA 4LFPA 2X0AA 1FLUA 1ZVHL 8LYZA 1LJ3A 1HFXA 1B7OA 1GB7A 2WARA 1CJ7A 4WLXA 1DZBX 4RDSA 4DD2A 4LYOA 2HU1A 1GDXA 1GE2A 1GFRA 1VDTA 2LZ2A 4G4CA 4GN5C 1BB4A 4H9FA 4IJ4A 3WULA 4NSGA 2MEIA 1LJ4A 2BQLA 4NHTA 1LZ1A 3TXIA 1GF4A 2BQNA 2EKSC 1B2KA 1IEEA 3TXBA 3B0KA 3WW6A 4GCCA 4NGKA 1GB6A 153LA 2ZYCA 3TXKA 4ETAA 4QDNA 2ZIKA 2BQCA 1LTMA 4H8ZA 1HERA 4PJ2C 1LSYA 2HUBA 3B72A 2YBJA 154LA 1IWVA 4NG1A 4BAPA 5LVGA 4XJBA 3P4ZA 4OOOA 2BQOA 1CKCA 4BS7A 1LSGA 5ILCA 4TSCA 1V7TA 5B06A 1N4FA 3RZ4A 1LCNA 3TXDA 4CFOA 1EL1A 1XEIA 1JKBA 1FKVA 3D9AC 1HSWA 1BB6A 1LZEA 3M3UA 1ZV5L 2MEEA 2Y8PA 4YENA 1LZ5A 4HPIA 1GFAA 2D91A 1CKDA 1OUGA 1VATA 4GCDA 2HEDA 2Z2FA 4DDAA 2W1LA 1LZTA 2F4AA 5KKIA 1BHZA 4Z41A 1IC4Y 1LSCA 1IP6A 3QY4A 4HV1A 1JUGA 1EQEA 3B0IA 2G4QA 4KT3A 2XJWA 3TXJA 1KIRC 4OWEA 1VDQA 2I25L 3RW8A 3AW7A 1NWGA 4NSIA 5LA5A 1B7RA 4LYCA 1WQOA 1LJFA 2Z18A 1GD6A 3LHMA 4OW1A 4H93A 2LZTA 1IWZA 2DQGY 1GB9A 4Z3MA 2Z2EA 1GAZA 1MELL 2DQEY 1LMQA 1C08C 4H9HA 4NWEA 1GB0A 5B1GA 5LAFA 1IWYA 1G7LC 4RLNA 4LYBA 4CGEA 1OQMA 1LJHA 3EO5A 4X3BA 5I5QA 5D5CA 1NQIA 3W6DA 1WTMA 1WTNA 5C6IA 5B05A 5KXMA 4H91A 4E3UA 1AZFA 5I4XA 4MR1A 1LJJA 2BQMA 1JISA 1GBXA 1JTTL 1YILA 5F9UA 4ETEA 5L3IA 1IOCA 1DI4A 4N0JA 1LYYA 4FJRA 2CDSA 4NHIA 5JENB 1B5WA 1G7IC 5KXTA 4CFPA 1WQQA 1D0MA 4ZEEA 1XEKA 1GXXA 4XJFA 3WVYA 1GFKA 2F30A 2YBNA 4Z98A 1IP7A 1IWXA 1GFVA 1C43A 3K3TA 1INUA 4GCFA 3QNGA 3TXEA 1XSFA 1OUBA 2DKVA 2F4GA 4HTNA 4WM5A 2EIZC 4ET9A 5C6LA 4LT0A 3AZ4A 1LZGA 2W1MA 2Z38A 3E3DA 2D4KA 7LYZA 1LMCA 2BQAA 4WOAA 1OUHA 4C5FA 1CKGA 1HHLA 1F10A 1T3PA 1YAPA 2YBIA 5DN4A 3SP3A 1IP4A 4HV2A 1DQJC 2LYZA 1GBZA 1GFEA 2VB1A 3P68A 4DDBA 5F16A 4M6DA 1G7HC 1C7PA 4ZIXA 5F14A 4NGOA 4PHIA 1LJKA 4RLMA 1GB8A 1OUFA 1XGTC 1YIKA 1HC0A 1LHIA 1FBIX 4H8YA 4HJZA 1OUAA 5EBHA 5E4PA 1LOZA 1XGUC 1YQVY 2W1XA 4WO6A 4W96A 3AYQA 1GXV2 1LSAA 5KY1A 1HENA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1WQMA 1QUSA 3ZVQB 244LA 4H9CA 1CJ6A 2Z39A 2ZQ4A 1UACY 1PQDA 4QGZA 1FLWA 1JKCA 2ZILA 1CV5A 2HTXA 1L54A 1F6RA 233LA 242LA 3IJUA 248LA 1BB5A 3OE6A 4NGLA 1LHLA 178LA 2HUKA 212LA 2ZQ3A 1JTOL 4H9IA 1J1PY 1AM7A 1LYJA 5LYTA 3CDRA 4I0CA 2YVBA 262LA 1B5VA 4G9SA 4H1PA 1FLYA 3A3RX 1JTPL 3AZ5A 3DNAA 3MGWA 4NIJA 3HUAA 1DYAA 3C8QA 4MCKA 1B5XA 2F32A 5HNCA 3NYAA 210LA 4RW2A 160LA 5I4WA 5ILFA 4NGIA 1BB3A 1T8AA 2B5ZA 2G4PA 1DYGA 4NWHA 3VWOA 1JPOA 1ZURA 162LA 1XGQC 3WU7A 1IOSA 3WXTA 4C3WA 5HQ1A 174LA 1LZRA 1CTWA 159LA 1LI6A 1L60A 4H8XA 3HBDA 4W58A 3AZ6A 3W6CA 3AB6A 2OTYX 125LA 4TUNA 2YBHA 1QDTA 1NMMA 2D4JA 1C60A 3AGGG 3HBHA 254LA 4HJVA 200LA 5KKJA 1BWIA 1NBYC 3OE8A 4WM4A 5HLLA 1LYGA 1P64A 4LYTA 144LA 1C6NA 1D3JA 1L96A 4LYZA 3WUNA 130LA 1B7MA 1GFHA 3W3EA 3TXGA 1LJGA 192LA 3CDVA 171LA 1LZAA 3A6BY 1JSFA 1L03A 120LA 4HJYA 4NSJA 4ETDA 1IVMA 2BQFA 1L06A 3RT5X 2I6ZA 3GUNA 240LA 4DD1A 3AW6A 3OE9A 1I1ZA 1L79A 4MSTA 5LVJA 5L9JA 4XENA 4DQ7A 3DN4A 1C6MA 150LA 3DN8A 5LVIA 1JEFA 1RE2A 3AGHA 2AUBA 225LA 1L52A 3HH4A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3A91 A;  1WQM A;  4WG7 A;  5KXZ A;  2ZNW Y;  3A3Q A;  1QUS A;  2NWD X;  5LIO A;  3ZVQ B;  3ZVQ A;  1UIB A;  2HEC A;  1LJI A;  3AZ7 A;  3IJV A;  1IP5 A;  4H9C A;  1V7S A;  1CJ6 A;  208L A;  2Z39 A;  2ZQ4 A;  1UAC Y;  4QGZ A;  1REY A;  1AT6 A;  2D4I A;  1FLW A;  132L A;  2DQD Y;  1JKC A;  1WQP A;  2ZIL A;  2BQE A;  3WPL A;  5APC A;  1JJ0 A;  4LGK A;  2HTX A;  3IJU A;  1F6R A;  5KXN A;  4NGL A;  3HFM Y;  1BB5 A;  3FI7 A;  4QY9 A;  1UID A;  1CKF A;  1I20 A;  1LHL A;  1ZVY B;  6LYZ A;  5J7C A;  4ZFP A;  1O23 A;  3CSR A;  4TSB A;  2EPE A;  4TWS A;  2ZQ3 A;  1JTO L;  3ATO A;  4H9A A;  4H9I A;  1TBY A;  5APD A;  1J1P Y;  4CJ2 A;  1UIG A;  4LYM A;  1GE4 A;  1REM A;  1AM7 A;  1VDP A;  4N5R A;  5DLA A;  1GWD A;  5LYT A;  1YRO A;  1B5Y A;  4D9Z A;  1GB2 A;  2YSS C;  3OJP A;  4B4I A;  4BAD A;  3LN2 A;  4I0C A;  2YVB A;  1PZY A;  2HU3 A;  3EXD A;  3W6A A;  1B5V A;  4G9S A;  3ZEK A;  1C10 A;  5LYM A;  4H1P A;  1YKX X;  1FLY A;  4J7V A;  3A3R X;  1JTP L;  5AMY A;  3AZ5 A;  1JIY A;  1H6M A;  1JKD A;  1LPI A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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