The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
6
|
sequence length |
93
|
structure length |
93
|
Chain Sequence |
GSSGSSGYRALYPFEARNHDEMSFNSGDIIQVDEKTVGEPGWLYGSFQGNFGWFPCNYVEKMPSSENEKAVSPKKALLPPTVSLSATSGPSSG
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Solution structure of the first SH3 domain of human intersectin2 (KIAA1256)
rcsb |
| molecule tags |
Endocytosis/exocytosis
|
| source organism |
Homo sapiens
|
| molecule keywords |
Intersectin 2
|
| total genus |
6
|
| structure length |
93
|
| sequence length |
93
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2003-05-29 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF14604 | SH3_9 | Variant SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1A0N B; 1GCQ A; 1MUZ A; 4K11 A; 1KJW A; 1X69 A; 1OPK A; 2L0A A; 2MOX A; 1H3H A; 3NHN A; 2EYX A; 2LMJ A; 3VS2 A; 1OEB A; 2YDL A; 2JM8 A; 2OI3 A; 2W10 A; 3H0F A; 1SRL A; 2F2V A; 1VYT A; 1M3A A; 1QWE A; 1OPL A; 2DL8 A; 5I11 A; 4LN2 A; 4OML A; 4E6R A; 3M0R A; 3M0U A; 4AFQ C; 2DNU A; 1PRL C; 1TUC A; 2KXC A; 1K9A A; 1PWT A; 3I5S A; 2ED0 A; 1GFC A; 2K79 A; 4J9G A; 2RQV A; 2O31 A; 4A63 B; 1NEG A; 2DRM A; 5FWB A; 2DL7 A; 2RF0 A; 4J9H A; 2ROL A; 2W0Z A; 2ED1 A; 2JTE A; 2YT6 A; 1EFN A; 4RTX A; 5GJV B; 2GQI A; 5IH2 A; 1AOJ A; 1K0S A; 2LX7 A; 2BZY A; 4F17 A; 1B07 A; 1W1F A; 1Y57 A; 5IHN A; 2KE9 A; 2RPN A; 3QWX X; 4F14 A; 2EYW A; 2EKH A; 3M0Q A; 1PKS A; 2GTJ A; 2D8H A; 3PE0 A; 2X3X D; 1G83 A; 2A08 A; 4J9B A; 3ULR B; 2LCS A; 5ECA A; 1FYN A; 2FRY A; 1NEB A; 1ABQ A; 2FPE A; 1MV0 B; 2A28 A; 1U5S A; 1X2Q A; 1WLP B; 2CSQ A; 1WDX A; 1YN8 A; 2DBK A; 1UDL A; 1YNZ A; 1E7O A; 4J9E A; 2JM9 A; 1NYG A; 2CT4 A; 4RTV A; 2RQU A; 4Z88 A; 1JU5 C; 1I1J A; 1WXU A; 1X27 A; 1UJY A; 3THK A; 1V1C A; 2AZS A; 1ZUU A; 2AZV A; 2AKL A; 1SSH A; 2PTK A; 3U23 A; 3RNJ A; 2V1Q A; 2KYM A; 1FMK A; 1UHF A; 1I07 A; 2EYY A; 5IHI A; 1Z9Q A; 2D1X A; 5GJW B; 2SRC A; 2LQW A; 1GCQ C; 2DL3 A; 5EC7 A; 3M0P A; 2VVK A; 1KIK A; 3PVQ A; 4Z8A A; 3SHW A; 1ZBJ A; 1KSW A; 2RN8 A; 4CC7 A; 2B86 A; 4WCI A; 1NLP C; 2CDT A; 2CH4 W; 2QDL A; 2EQI A; 1SRM A; 1NM7 A; 2DMO A; 2A37 A; 4OMO A; 2JT4 A; 4JJC A; 1WXB A; 4CC2 A; 2IIM A; 4CC3 A; 3NMZ C; 2EVR A; 4HVU A; 1QWF A; 3REA B; 1MV3 A; 1LCK A; 4AFU C; 4J9C A; 4JPB W; 1RLQ C; 2DJQ A; 1ZUY A; 5FW9 A; 1OV3 A; 5IXB A; 1H92 A; 2YUP A; 1QCF A; 1B3Q A; 3VRY A; 1UG1 A; 2K7A A; 1BB9 A; 4AFS C; 2YUN A; 2MIO A; 3M0T A; 3VS6 A; 2DVJ A; 4RTU A; 1JO8 A; 1AVZ C; 1PHT A; 2LJ1 A; 1Z9Z A; 4IIO A; 2JS0 A; 3EG1 A; 1AWX A; 2L2P A; 3TSZ A; 1JXO A; 4HVW A; 2BTT A; 1M30 A; 4RTT A; 4ZNX A; 3H0I A; 2J6F A; 1U3O A; 1KFZ A; 2LZ6 B; 5HCK A; 1WFW A; 2G6F X; 2ENM A; 2F2W A; 2O2O A; 3O5Z A; 4ESR A; 3VS5 A; 3REB B; 1YCS B; 1CSK A; 1YWO A; 2FG0 A; 2P4R A; 1CKA A; 3SEM A; 2HSP A; 2KXD A; 1M27 C; 4OMM A; 2A36 A; 1PRM C; 2K6D A; 2DE0 X; 2HEQ A; 1VYU A; 1WYX A; 1PNJ A; 2KT8 A; 2YUO A; 1M3C A; 2C0T A; 2DL4 A; 2NUZ A; 4J9F A; 1GFD A; 2DM1 A; 1GL5 A; 2ESW A; 2DL5 A; 1GBQ A; 3JV3 A; 4LNP A; 4DEX A; 3QWY A; 3PVL A; 2EPD A; 3ZL7 C; 1Y0M A; 1QLY A; 2EGE A; 4AFZ C; 1UUE A; 3NPF A; 4OMQ A; 1S1N A; 4AG2 C; 2FEI A; 2VKN A; 2FRW A; 3TSW A; 1W70 A; 4LUD A; 1GRI A; 2DIL A; 2L3Q A; 3LH5 A; 1QKX A; 3RBB B; 2MCN A; 3UA6 A; 2DYB A; 2GTO A; 1HJD A; 2L3P A; 1VA7 A; 2FPD A; 1ZX6 A; 3CQT A; 1K1Z A; 2GGR A; 1UE9 A; 1AWJ A; 2V1R A; 2X3W D; 2M51 A; 2CT3 A; 4Z89 A; 2L3S A; 1AEY A; 1E6G A; 1ZSG A; 3UAT A; 1GBR A; 1QKW A; 4GLM A; 1SHG A; 3H0H A; 1N5Z A; 5L23 A; 4DEY A; 2XMF A; 2SEM A; 1T0H A; 2I0N A; 1SEM A; 2PNI A; 1VYV A; 3VS0 A; 1SPK A; 1AWW A; 5IXF A; 2C0I A; 2D8J A; 4HVV A; 3R6N A; 5IHK A; 3C0C A; 1OOT A; 2O9V A; 1M8M A; 4OMN A; 1YP5 A; 2HDA A; 3I9Q A; 1G2B A; 2CRE A; 2EGC A; 2LNH B; 1U06 A; 4ORZ A; 3EGU A; 4JZ4 A; 2C0O A; 1X6B A; 2HCK A; 1JQQ A; 2GBQ A; 2JXB A; 2DRK A; 1XOV A; 4AG1 C; 2O88 A; 1K4U S; 2CH4 A; 2DLP A; 4RTW A; 1T3L A; 1UJ0 A; 2J05 A; 2JW4 A; 4HCK A; 1UHC A; 3A98 A; 1WIE A; 3I35 A; 1UFF A; 1NYF A; 4JJB A; 1HD3 A; 2DA9 A; 4J9I A; 5I22 A; 1JXM A; 2KRO A; 2RQR A; 1RI9 A; 4IIM A; 1BBZ A; 4GBQ A; 2JMA A; 1H8K A; 2O9S A; 3VRZ A; 2YSQ A; 1NLO C; 2HBW A; 2H8H A; 3TVT A; 1IO6 A; 3FJ5 A; 1X43 A; 2LQN A; 3NGP A; 2EGA A; 2BZ8 A; 1UGV A; 1I0C A; 2DX1 A; 1J3T A; 2NWM A; 4JJD A; 4CC4 B; 2ECZ A; 2FPF A; 2J6K A; 2KGT A; 2RNA A; 1ARK A; 1ZUK A; 1WA7 A; 2FO0 A; 2KR3 A; 3I5R A; 2J06 A; 1GCP A; 1WXT A; 2YUQ A; 2JMC A; 1JEG A; 1BK2 A; 1T0J A; 3UF4 A; 4LE9 A; 1W6X A; 1UEC A; 2AKK A; 1TUD A; 4R0K A; 1PKT A; 3UA7 A; 1WI7 A; 3VS1 A; 4RUG A; 2J7I A; 4FSS A; 4D8K A; 2EYZ A; 5FWC A; 2KEA A; 2KRM A; 2KRN A; 1ABO A; 3KFV A; 4Y92 A; 3VS4 A; 4OMP A; 4F16 A; 3IQL A; 2AK5 A; 2CUB A; 2E5K A; 3M0S A; 2DBM A; 1ZLM A; 1E6H A; 3GBQ A; 1UTI A; 1X6G A; 2D0N A; 2JS2 A; 2K2M A; 4JZ3 A; 1K0X A; 3VS7 A; 2OJ2 A; 2LP5 A; 2ROT A; 1M3B A; 4D8D A; 4M4Z A; 4RTY A; 2EW3 A; 2LJ0 A; 1AZG B; 4J9D A; 2M0Y A; 2KBT A; 2PZ1 A; 4HXJ A; 1HSQ A; 1BU1 A; 1RUW A; 4EIK A; 2BZX A; 2KRS A; 4QT7 A; 4X1V A; 2GNC A; 1NG2 A; 1TG0 A; 2K9G A; 3EG0 A; 2CSI A; 1AD5 A; 3VS3 A; 2KT1 A; 2RMO A; 2VWF A; 3H41 A; 3EG3 A; 3EHR A; 2J6O A; 2RQT A; 1AZE A; 4RTZ A; 1CKB A; 2K3B A; 2OAW A; 2KYB A; 3EHQ A; 2LJ3 A; 3EG2 A; 1AWO A; 2EBP A; 1T3S A; 2DF6 A; 1YWP A; 2F2X A; 2RQW A; 1K76 A; 2CUD A; 2KNB B; 1RLP C; 4LUE A; 4KRT A; 2ABL A; 1SHF A; 1X2K A; 1WX6 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1MUZ A; 2VYT A; 2PUK B; 4EMK B; 3NHN A; 4LDV A; 5FRN A; 1WJS A; 3A8L B; 3CCS T; 2OI3 A; 2HL5 C; 4L6V 5; 1SRL A; 1VYT A; 1M3A A; 4OB0 B; 4PLL A; 3JCM J; 5KCH A; 4QW2 A; 3M4G A; 5I11 A; 1Q95 G; 2DXB A; 4OML A; 1QW1 A; 3CCS Q; 3M0U A; 5A0L A; 4PJM A; 2DNU A; 4AFQ C; 3GNG A; 4FSX A; 3NFC A; 3OW2 A; 2HBP A; 3I5S A; 1PG5 B; 1YHQ T; 2DTO A; 3JCM f; 4J9H A; 1V76 A; 4ZN3 A; 4PJO B; 2ED1 A; 1Q7Y U; 3URG A; 2RJE A; 2RI2 A; 4HCC A; 1YHQ Q; 1WHG A; 4XTW A; 1IHV A; 5GAO m; 5GAN 3; 3SWN B; 3MO8 A; 4PFO A; 3GIB A; 1B07 A; 2QI2 A; 2COY A; 5KYY A; 3L1A A; 5LJ5 g; 2EKH A; 3M0Q A; 3PE0 A; 2X3X D; 5GAN g; 4J9B A; 4BB7 A; 2CZ0 B; 1FX7 A; 1FYN A; 2YLC A; 2A28 A; 1U5S A; 4HT8 A; 1X2Q A; 2EFI A; 3Q1J A; 2CSQ A; 4C92 A; 1VQK A; 1H64 1; 1XQH A; 1JBM A; 4XTY A; 2VAS A; 5I2M A; 5J3B A; 2E65 A; 1AT1 B; 2FHD A; 4Z88 A; 2DK3 A; 1I1J A; 2Y4Y A; 1D3B B; 4X9D A; 3QYH B; 1D3B A; 1PD1 A; 3THK A; 2WSC E; 3CPF A; 2LVM A; 2KAF A; 4FL6 A; 1SSH A; 2E64 A; 3M9Q A; 2V1Q A; 1Y7X A; 2A7Y A; 4TVR A; 3OS0 A; 1MMA A; 5GJW B; 2DL3 A; 3M55 A; 1KIK A; 3SHW A; 1ZBJ A; 3X25 B; 5GAN 4; 4CC7 A; 4M7A G; 2CZ7 B; 2EQI A; 1WHH A; 1NM7 A; 4N4I A; 2DMO A; 5LJ3 e; 1WXB A; 3CCR T; 1HYO A; 4RCB A; 1QWF A; 3REA B; 2ZPE B; 3UPU A; 1LCK A; 3OBY A; 4AFU C; 2DXU A; 3CD6 A; 4PJL A; 3CCR Q; 3RKY A; 1BI3 A; 4JDS A; 3CCS A; 3MCA B; 2DKG A; 5D6W A; 2EKO A; 3V8L A; 1YI2 T; 1IGU A; 5GAN 5; 3O8V A; 3J7A F; 5AT1 B; 4C5I A; 1FXX A; 3A8M B; 1QVF A; 3EFS A; 1AVZ C; 1YI2 Q; 4M7A C; 2LJ1 A; 2EQU A; 2JS0 A; 4M75 G; 1YHQ A; 4PFP A; 1M30 A; 4ZNX A; 4JLG A; 4X34 A; 2FB7 A; 3CPW P; 5HCK A; 5J39 A; 2O2O A; 3JB9 I; 3VS5 A; 4M77 G; 3OYI A; 1YCS B; 2RI3 A; 1YWO A; 2RJF A; 5FU7 B; 1RI0 A; 1QCO A; 1TU0 B; 2HSP A; 2KXD A; 1M27 C; 4OMM A; 2K6D A; 4LDY A; 5GAM f; 1PNJ A; 4FYV B; 1D1A A; 1VQN T; 1M3C A; 2FL7 A; 3M4Y A; 4M7A E; 1PCX A; 4J9F A; 1GFD A; 3RKX A; 1GBQ A; 1M1G A; 5DM7 R; 1VQN Q; 3QWY A; 4PK4 A; 3OA6 A; 1K73 R; 4M75 C; 4FW2 A; 3NPF A; 1S1N A; 2GCX A; 4PJO F; 3ER0 A; 4OP0 A; 3G1J A; 2FRW A; 3TSW A; 1VQ8 T; 1KD1 U; 1U1S A; 1W70 A; 3E2U A; 4LUD A; 1NJI U; 4M77 C; 2DIL A; 2L3Q A; 3FIF A; 1QKX A; 3VKI A; 2DER A; 3FC3 A; 1OI1 A; 5A0D A; 2QA4 T; 1VQ8 Q; 3MEA A; 3LLR A; 4X9C A; 1UE9 A; 1AWJ A; 2P4T A; 2CP6 A; 4J83 A; 3OYM A; 3VYG A; 1E6G A; 1LOJ A; 1ZSG A; 3UAT A; 1GBR A; 5KYW B; 1QP2 A; 2QA4 Q; 1SHG A; 3E9G A; 3H0H A; 4HKE A; 1VQ7 T; 1K8A R; 4M7D D; 3G4S T; 1K73 C; 3JB9 F; 4M75 E; 2R57 A; 3AT1 B; 1YIT T; 4XTV A; 4ELY C; 1VQ7 Q; 4J7I A; 4KT0 E; 5GAN 7; 3G4S Q; 5KYX A; 1QVF P; 2GFU A; 3CCR A; 1M8M A; 3OYC A; 4MML A; 1YP5 A; 2MF2 A; 2LNV A; 1YIT Q; 1Q81 U; 2LDM A; 3PNW C; 1VQP T; 1PSF A; 2FYK A; 4C0Z A; 3P8D A; 1QVG A; 1YBY A; 3NTK A; 2O88 A; 1K4U S; 3JCM d; 3RIR A; 1VQP Q; 1UJ0 A; 1EX4 A; 2J05 A; 2VV5 A; 1EIF A; 3HRS A; 2AIR B; 1WIE A; 1LJO A; 1YI2 A; 4M7D G; 2NYS A; 1K8A C; 1NYF A; 1TH7 A; 3TCJ A; 4J9I A; 3EGX A; 3OYH A; 1TOV A; 4PFZ A; 2EQK A; 1BYM A; 1D1C A; 2JMA A; 2DYI A; 2YSQ A; 3FLG A; 4BD3 A; 2F5K A; 3NGP A; 2P0P A; 2RK1 A; 2DX1 A; 1M1K R; 3OSV A; 4V2S A; 3DKM A; 4C8Q C; 2E41 A; 2XID A; 3OS1 A; 8AT1 B; 3KBG A; 2KGT A; 2RNA A; 3PIP A; 2DAQ A; 1B7T A; 2O01 E; 1GCP A; 1JEG A; 1T0J A; 4LE9 A; 4EDU A; 3JCM Q; 2CP5 A; 1W6X A; 3QDR B; 2HZY A; 2HSE B; 4XK8 E; 4RUG A; 1UGR B; 1BI2 A; 4D8K A; 5FWC A; 3LYI A; 2KEA A; 2KRM A; 3V8J A; 2KRN A; 3TQ7 P; 2CP2 A; 1RAH B; 3P8B B; 4XTU A; 5KH6 A; 3PFS A; 1M1K C; 1NPR A; 4C8Q E; 3IQL A; 1W2B A; 2E5K A; 2V8I A; 3PTA A; 1WHM A; 1ZLM A; 3CBP A; 2JS2 A; 1GXI E; 2QA4 A; 4F04 B; 3MEU A; 2ROT A; 5FU6 B; 1M3B A; 4M4Z A; 2M0Y A; 5GAO p; 2KBT A; 2PZ1 A; 4HXJ A; 1HSQ A; 4LDW A; 1KQS S; 2ATC B; 3EG9 B; 2X51 A; 2DIG A; 1QVG P; 1VQ7 A; 2GNC A; 1KHC A; 4QVZ A; 1TG0 A; 2CSI A; 2ZCF B; 2RMO A; 3F70 A; 3CCJ Q; 4J8O A; 3PIO A; 1YIT A; 2CZ1 B; 3OYD A; 2BKD N; 1AZE A; 2HQX A; 4RTZ A; 1N9S A; 3ASK A; 1CKB A; 2OAW A; 1U1T A; 2FVU A; 2LJ3 A; 2B8A A; 3A8G B; 2EBP A; 1T3S A; 1B34 B; 3NTH A; 2BE7 D; 1K76 A; 4OB1 B; 1VQP A; 3OYY A; 2RJD A; 2VC8 A; 4KH0 B; 4LUE A; 5AYF A; 5CK9 A; 3HL8 A; 2E6Z A; 1GCQ A; 4DBR A; 4K11 A; 2MOX A; 4MZT A; 4E7L A; 1ZSZ C; 5KE2 A; 1OEB A; 3CCV T; 2YDL A; 3OYK A; 1WNL A; 2JM8 A; 4NOY A; 1D1B A; 4DBF A; 3EFR A; 1OU9 A; 1WHK A; 1QWE A; 4BDZ A; 4PLI A; 3OYB A; 3CCV Q; 2FZK B; 4LN2 A; 2KSS A; 2DZ9 A; 4L5G A; 2E1H A; 4B9W A; 1PRL C; 5GAM d; 2A3L A; 2KXC A; 1K9A A; 2ED0 A; 2QAS A; 2K79 A; 8ATC B; 4M78 D; 1JJ2 A; 2IG0 A; 2DRM A; 2RF0 A; 2DET A; 1V29 B; 2DO3 A; 3A1P A; 1W2B P; 4JRI A; 3GLX A; 5GJV B; 3X28 B; 1AOJ A; 2CGH A; 3AHU A; 4F17 A; 4OF1 A; 1W1F A; 4KGX B; 3S3O A; 5IHN A; 3OS2 A; 3QWX X; 1I81 A; 5CKB A; 4MMK A; 3HFN A; 3FEO A; 1Q86 U; 3RER A; 2RHU A; 1F1B B; 1NEB A; 3JCM X; 2FPE A; 2LTO A; 4C0G A; 2DEU A; 4FW1 A; 3OQ5 A; 2NUP A; 2K5I A; 2MWO A; 4OMF B; 1WDX A; 5CKD A; 2RHX A; 5KYU B; 1YN8 A; 2KY9 A; 1UDL A; 1Y96 B; 3QHS A; 4F7U B; 1Y96 A; 2JM9 A; 2DTH A; 4F7U A; 1YJN A; 4RTV A; 1PD0 A; 2G3R A; 4C8Q F; 2I2L A; 1BKB A; 4DOW A; 4Z02 A; 3TU4 K; 4QQD A; 4J6W A; 1X27 A; 1UJY A; 1V1C A; 3CME T; 2AKL A; 3MP1 A; 3OMC A; 3JCM h; 5DLQ E; 1FMK A; 1OX8 A; 1UHF A; 3JB9 D; 5IHI A; 2DXC A; 1Z9Q A; 2D1X A; 4PJO G; 3CME Q; 4A4E A; 2ZAE A; 3RR6 A; 4YTL A; 5IAY A; 2L89 A; 4N4H A; 3PVQ A; 1KSW A; 4EMK C; 2QTV A; 2DFU A; 3TEE A; 3G7Z A; 1NLP C; 2CDT A; 2ZPH B; 3FDR A; 2EJG A; 3OBW A; 4ZGD B; 4N0A A; 4OMO A; 4CC3 A; 5CQY A; 3L2R A; 2R58 A; 3NMZ C; 4O5V A; 4KBM B; 3CD6 T; 4VUB A; 1OQK A; 4JPB W; 1JJ2 P; 2DJQ A; 3QG1 A; 2VGN A; 3JCM P; 2RD1 A; 2AHJ B; 3JB9 G; 3CCV A; 3S3N A; 3CD6 Q; 1QCF A; 4DBQ A; 4XU1 A; 1BB9 A; 4PJO C; 2LT4 A; 4JRQ A; 3MKD A; 3P8H A; 3PMT A; 5FRO A; 2H3E B; 2ZZD A; 4M78 A; 1SSF A; 2DJZ A; 3SWN C; 1Z9Z A; 3EG1 A; 4EMH A; 1AWX A; 2GFA A; 3TSZ A; 1JXO A; 3CC7 A; 1ZBX A; 1OYX A; 4RMO A; 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