The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
9
|
sequence length |
72
|
structure length |
72
|
Chain Sequence |
GSSGSSGTPFRKAKALYACKAEHDSELSFTAGTVFDNVHPSQEPGWLEGTLNGKTGLIPENYVEFLSGPSSG
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Solution structure of the SH3 domain of human olygophrein-1 like protein (KIAA0621)
rcsb |
| molecule tags |
Protein binding
|
| source organism |
Homo sapiens
|
| molecule keywords |
Olygophrenin-1 like protein
|
| total genus |
9
|
| structure length |
72
|
| sequence length |
72
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2003-06-20 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF14604 | SH3_9 | Variant SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1G83 A; 2DL8 A; 3RNJ A; 2LCS A; 2EYW A; 2K6D A; 2FRY A; 1BK2 A; 4OMN A; 4AFU C; 2HEQ A; 2RQW A; 1M3C A; 2DE0 X; 1ZSG A; 1M27 C; 2D0N A; 1E7O A; 2KR3 A; 2H8H A; 1CKB A; 2GTO A; 2RQT A; 2MOX A; 2P4R A; 1PRL C; 4OML A; 4AFQ C; 2OJ2 A; 2DL5 A; 2IIM A; 1OPL A; 4DEY A; 1RLQ C; 1WLP B; 2J6O A; 2C0T A; 5HCK A; 1YWP A; 1IO6 A; 3TVT A; 1RUW A; 2CRE A; 1N5Z A; 1BBZ A; 3VRY A; 2GNC A; 3VS5 A; 4GBQ A; 2DJQ A; 1YP5 A; 3M0U A; 1HJD A; 4QT7 A; 2M51 A; 2GGR A; 1Z9Q A; 4Z88 A; 5IXB A; 1BB9 A; 2F2V A; 4LN2 A; 2BZY A; 3VS7 A; 4RTX A; 1JQQ A; 1QCF A; 1W1F A; 2PZ1 A; 4JJD A; 1ARK A; 4Z89 A; 1VA7 A; 2FRW A; 3NHN A; 2FPE A; 1U3O A; 1GFC A; 3M0S A; 1UGV A; 4Z8A A; 3REA B; 2CH4 W; 1PHT A; 4IIO A; 3RBB B; 1QKX A; 5IHN A; 4ZNX A; 2O2O A; 2DX1 A; 2W10 A; 2ED1 A; 2I0N A; 3VS4 A; 1X2K A; 4X1V A; 2EYX A; 1WXT A; 2JS0 A; 4OMM A; 2KE9 A; 1K9A A; 1X27 A; 2CSQ A; 1UG1 A; 1ZBJ A; 2JMC A; 2BZX A; 1AWX A; 2F2W A; 2X3W D; 4RTW A; 1MV3 A; 2JTE A; 1QKW A; 2EBP A; 3PE0 A; 1I07 A; 2XMF A; 2GBQ A; 5ECA A; 3UAT A; 2QDL A; 1OOT A; 1AEY A; 1AWO A; 1WFW A; 2C0I A; 2GTJ A; 1HSQ A; 2D8J A; 2HDA A; 2JM8 A; 4K11 A; 1AWW A; 4D8D A; 2DBM A; 1UJ0 A; 3EG3 A; 1HD3 A; 4RTT A; 5IHK A; 1SRM A; 2KXC A; 5GJV B; 4D8K A; 4E6R A; 4FSS A; 3QWY A; 1NLP C; 1NYG A; 2EPD A; 1UHF A; 3H0I A; 1LCK A; 3VS1 A; 4AG1 C; 2CUB A; 1ZX6 A; 4Y92 A; 1K0X A; 2FO0 A; 3I9Q A; 3ULR B; 3H41 A; 1G2B A; 2G6F X; 4J9D A; 1ABO A; 1NEB A; 2B86 A; 1UEC A; 2LZ6 B; 3KFV A; 2DBK A; 2VVK A; 3H0H A; 4WCI A; 2RQU A; 2AZS A; 2DVJ A; 1W70 A; 4LUD A; 3IQL A; 2LNH B; 1U5S A; 1K76 A; 4RTY A; 4J9E A; 2V1Q A; 1TUD A; 1H92 A; 2RMO A; 4AFZ C; 1VYV A; 2CT3 A; 2YUO A; 3THK A; 3EHQ A; 3M0T A; 3EG0 A; 1ABQ A; 2L3P A; 1SSH A; 2E5K A; 4CC2 A; 3A98 A; 2L3Q A; 2KBT A; 2ROL A; 2AK5 A; 2ABL A; 2EGC A; 3U23 A; 1UE9 A; 1TUC A; 4EIK A; 1GCQ A; 2J6F A; 4JJB A; 2D1X A; 1UHC A; 1WYX A; 2K79 A; 2HBW A; 3VS0 A; 1UJY A; 1X69 A; 1UDL A; 2D8H A; 1GCP A; 2EKH A; 2O31 A; 3PVL A; 2DL4 A; 2KNB B; 2PNI A; 1AWJ A; 1FMK A; 1PRM C; 3I5S A; 3VRZ A; 1WX6 A; 1ZUK A; 2ROT A; 2DM1 A; 2FPD A; 1I0C A; 1Y0M A; 1WXU A; 2KEA A; 3REB B; 2JS2 A; 4ORZ A; 2JT4 A; 3TSW A; 1NLO C; 1NM7 A; 1QLY A; 2BZ8 A; 2RN8 A; 1CKA A; 2KYM A; 1B3Q A; 2F2X A; 2SRC A; 4LE9 A; 2FPF A; 1K4U S; 2L2P A; 5L23 A; 1RLP C; 2YSQ A; 2DNU A; 3I5R A; 3EHR A; 2K7A A; 3FJ5 A; 2HSP A; 2L0A A; 2C0O A; 3PVQ A; 4HCK A; 5FW9 A; 2K3B A; 4F17 A; 1I1J A; 2RQR A; 4J9G A; 1QWF A; 1AOJ A; 1KIK A; 1T3L A; 4CC7 A; 1A0N B; 2DLP A; 1FYN A; 1UFF A; 3EG2 A; 3VS2 A; 2KRO A; 2CSI A; 4AG2 C; 1TG0 A; 3CQT A; 1WA7 A; 3M0P A; 2DRK A; 1YN8 A; 2DL3 A; 2HCK A; 1CSK A; 1SEM A; 1XOV A; 4J9B A; 1SPK A; 3R6N A; 4CC3 A; 2MIO A; 1PKS A; 3NPF A; 1OPK A; 2A08 A; 2JMA A; 2J06 A; 4RTU A; 5GJW B; 3JV3 A; 2JXB A; 2LX7 A; 2EVR A; 4JPB W; 4J9F A; 2KGT A; 2KRN A; 2EYZ A; 1UUE A; 3NMZ C; 2KRM A; 1GBQ A; 2JW4 A; 1E6H A; 1SRL A; 2ENM A; 1JXO A; 2LJ3 A; 1MV0 B; 3QWX X; 1NYF A; 2FEI A; 2LMJ A; 1T0J A; 3UA6 A; 1VYT A; 3VS3 A; 2X3X D; 1OEB A; 2SEM A; 1WI7 A; 1GRI A; 2W0Z A; 1ZUU A; 1W6X A; 2RPN A; 4M4Z A; 4HXJ A; 4ESR A; 1M30 A; 4HVV A; 1KSW A; 1K1Z A; 1YNZ A; 1Z9Z A; 3M0Q A; 1AZE A; 1JXM A; 1YWO A; 2AZV A; 1MUZ A; 1RI9 A; 1VYU A; 2J7I A; 1X43 A; 3C0C A; 2ECZ A; 1SHG A; 4CC4 B; 2O88 A; 1WXB A; 2A37 A; 2CUD A; 3M0R A; 4GLM A; 1NG2 A; 2EW3 A; 1ZLM A; 1EFN A; 3EGU A; 4RTZ A; 1M3B A; 2O9S A; 2DA9 A; 2KT8 A; 4HVW A; 2CH4 A; 2A28 A; 2PTK A; 1M8M A; 4AFS C; 3VS6 A; 3I35 A; 2KXD A; 1NEG A; 1WDX A; 3SHW A; 2J05 A; 5EC7 A; 2DL7 A; 4DEX A; 1H8K A; 4HVU A; 4F14 A; 1KJW A; 2AKL A; 1JU5 C; 1OV3 A; 2OAW A; 2RF0 A; 1H3H A; 1PWT A; 2K2M A; 4F16 A; 4IIM A; 4J9C A; 4R0K A; 5IXF A; 2NWM A; 1JO8 A; 1T0H A; 1T3S A; 2VKN A; 2EGA A; 1X6B A; 1U06 A; 2ED0 A; 2GQI A; 2LP5 A; 5IHI A; 2V1R A; 1B07 A; 2KT1 A; 1S1N A; 4J9H A; 1GL5 A; 3TSZ A; 2YUQ A; 2J6K A; 4OMQ A; 3NGP A; 3H0F A; 2YT6 A; 2YUN A; 1YCS B; 2DIL A; 3SEM A; 1AD5 A; 2JM9 A; 3UF4 A; 2RNA A; 2MCN A; 2YDL A; 5FWB A; 3UA7 A; 2BTT A; 1KFZ A; 4KRT A; 4RUG A; 4JZ4 A; 2EYY A; 2LJ1 A; 5I22 A; 1BU1 A; 4LUE A; 2LQN A; 4A63 B; 1AZG B; 4JJC A; 2DRM A; 2ESW A; 2A36 A; 3LH5 A; 3EG1 A; 1JEG A; 1PKT A; 1J3T A; 2EQI A; 2K9G A; 2LQW A; 2KYB A; 2L3S A; 2DF6 A; 4OMP A; 2LJ0 A; 4OMO A; 1WIE A; 1GFD A; 2CT4 A; 2M0Y A; 2FG0 A; 1ZUY A; 4RTV A; 1AVZ C; 5I11 A; 2OI3 A; 1UTI A; 2RQV A; 2NUZ A; 2VWF A; 3ZL7 C; 1PNJ A; 2KRS A; 2EGE A; 1SHF A; 1QWE A; 5IH2 A; 2YUP A; 1V1C A; 1M3A A; 4JZ3 A; 1X6G A; 2O9V A; 4LNP A; 1X2Q A; 1K0S A; 2DMO A; 1GCQ C; 3GBQ A; 1E6G A; 1GBR A; 1Y57 A; 4J9I A; 2AKK A; 3O5Z A; 2DYB A; 5FWC A; 2CDT A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2DL8 A; 1DJ7 B; 2FRY A; 4E7K A; 4J5Y A; 2RQW A; 1M3C A; 3HPW A; 2K5F A; 1ZSG A; 5LJ5 e; 3VU3 C; 4M7D G; 2QQ9 A; 8ATC B; 2CP5 A; 5IAY A; 1OU8 A; 1E7O A; 2GTO A; 2DIG A; 3CCR A; 2MOX A; 4F7U G; 1PRL C; 1PC0 A; 4JUV A; 1VQ8 Q; 1VUB A; 2OJ2 A; 2X4Y A; 2QTX A; 1RLQ C; 3CXC A; 1H3Z A; 1WLP B; 1LOJ A; 5HCK A; 3CC4 Q; 1G5V A; 4BB7 A; 2HL5 C; 3JB9 J; 2GNC A; 3M4Y A; 2QG9 B; 4GBQ A; 3VS5 A; 5CKB A; 4QT7 A; 2M51 A; 1D1B A; 4J7I A; 2VC8 A; 1VQ7 T; 2WSE E; 3LYI A; 2RK2 A; 5C0M A; 3OYI A; 4M78 B; 4JJD A; 2ZGW A; 2LX9 A; 3NHN A; 3M0S A; 3G71 Q; 4KUD K; 4Z8A A; 2LTO A; 2RI3 A; 3I56 T; 3JB9 I; 2W10 A; 5FU6 B; 4IUQ A; 2EIF A; 3RMS A; 3CCL Q; 1LPL A; 2BZX A; 2F2W A; 4J6W A; 4AT1 B; 3F70 A; 2P0K A; 1M1K U; 2E41 A; 5DY9 A; 2JTE A; 3HP9 A; 2EBP A; 4IUR A; 1I07 A; 4C92 C; 3PT9 A; 3UAT A; 5J39 A; 1VQN T; 1OOT A; 1Q7Y U; 5KYW A; 1WFW A; 2C0I A; 1YJN A; 5FRM A; 1BYM A; 2DTH A; 2D8J A; 3OW2 A; 1U1S A; 1VQ4 A; 1VQK Q; 1BCM A; 2MI6 A; 2XID A; 2D9T A; 4D8D A; 1KQS P; 3EG3 A; 1XTD A; 3SB2 A; 2JVV A; 3A8M B; 4E6R A; 3QWY A; 4M7D E; 2EPD A; 1KQ2 A; 2DTI A; 1UHF A; 2BIV A; 3UWN A; 3VS1 A; 1VQ5 A; 4PK4 A; 4ME7 A; 1ZX6 A; 4F7U E; 5GMK l; 2FO0 A; 1G2B A; 4TVR A; 3SDZ A; 4JLI A; 2G6F X; 1OYX A; 2E6Z A; 1M5Q 1; 4C8Q C; 5GAN h; 3CME A; 1W2B A; 3M56 A; 4M7A A; 1UEC A; 1N27 A; 2XU8 A; 3VKI A; 4R56 A; 1RAG B; 2OTL A; 2QEX A; 1YIT T; 4WCI A; 2RQU A; 1W70 A; 1OX9 A; 1QP3 A; 4FT4 A; 2LNH B; 3CC2 Q; 8AT1 B; 1VQL A; 1K76 A; 4J9E A; 4C92 A; 3G4S T; 1H92 A; 2HNI A; 3L1A A; 4PFZ A; 3EG0 A; 3QJ6 A; 3C95 A; 2E5K A; 1U1T A; 1K9M U; 2DYI A; 4F7U A; 2ROL A; 2AK5 A; 4C0F A; 2ZPF B; 3GIB A; 4PNO A; 3S3O A; 1ZSZ B; 2O4X A; 4GLK A; 1VQO A; 3U23 A; 2C06 A; 4EIK A; 3CCS A; 1PSE A; 1K73 U; 2RJF A; 2DPP B; 3QDF A; 1JB0 E; 4LDU A; 1ZHI A; 4ZTF A; 1WYX A; 3PFS A; 5GAM f; 3S6W A; 5GAO r; 2HBW A; 2K3X A; 2FB7 A; 2HZY A; 3CCV T; 1X69 A; 3N5B B; 4PFP A; 4QQ6 A; 5LJ5 d; 3BE3 A; 3PVL A; 4IKF A; 2PNI A; 4C8Q A; 1QMC A; 5GAN j; 4PJO F; 5GAM g; 1EZZ B; 4QW2 A; 3TRE A; 2QQR A; 5HK3 A; 3DLM A; 4FSX A; 2JT4 A; 1NLO C; 1QLY A; 1KHI A; 3HHT B; 1CKA A; 2SRC A; 1K4U S; 5CKF A; 3A8H B; 3VJP A; 2DNU A; 3URG A; 3EHR A; 1W4S A; 4HCK A; 2JJ9 A; 4M75 D; 5FW9 A; 4HCB A; 4F17 A; 2RA2 A; 2XKO C; 4M78 D; 1Q95 G; 1YIJ A; 4C5H A; 3OS1 A; 4CC7 A; 1Q81 U; 1FYN A; 1KD1 U; 4AG2 C; 1N8R U; 3M0P A; 3M4G A; 2R5M A; 1UGS B; 2DRK A; 2BE9 B; 2DL3 A; 2HCK A; 1CSK A; 1KC8 C; 3CC7 A; 3RKX A; 2CP2 A; 1TXQ A; 1TUG B; 2ZPH B; 1D0Y A; 1KQ1 A; 4M77 D; 4BI4 A; 2KGT A; 3HFN A; 5KYW B; 2KRN A; 2EYZ A; 1UUE A; 5GAM e; 3NMZ C; 1GBQ A; 1BI3 A; 1BI1 A; 2XHC A; 1JXO A; 3VYH B; 2LJ3 A; 4A4F A; 2EKO A; 1HXD A; 2FEI A; 4M75 G; 1YJW T; 2EAY A; 3UA6 A; 1VYT A; 2ZPG B; 4KGV B; 4IUU A; 3Q1J A; 1YIT Q; 1W6X A; 4M4Z A; 2NLU A; 3BDL A; 3OQ5 A; 4E7Z A; 4J83 A; 5C6S A; 1IZ6 A; 1KSW A; 3M0Q A; 3PGG A; 2M9U A; 1OZ3 A; 1KQS A; 1RAI B; 1VYU A; 3M9Q A; 1VQM T; 1X43 A; 2ECZ A; 2YLC A; 1WXB A; 2DKG A; 4M7A B; 4Z02 A; 1YI2 A; 3ER0 A; 3R6O A; 4GLM A; 2EJF A; 4RTZ A; 3EGU A; 5GAM h; 3PTA A; 1RAB B; 1M3B A; 4HVW A; 3CCM T; 1I4K 1; 2PTK A; 1OU9 A; 3CCQ A; 5CR2 A; 1NEG A; 2VXE A; 3SHW A; 1W2B S; 5EC7 A; 4LD9 K; 4M77 G; 5A0G A; 1G3W A; 3OS0 A; 3I55 A; 3CCV Q; 4FYX B; 4M7D B; 1YHQ Q; 1NPR A; 1F1B B; 5IXF A; 1VQ9 T; 4F7U B; 5CKE A; 1U06 A; 4FM4 B; 2O4X B; 5IHI A; 2V1R A; 2DTO A; 2HD0 A; 2RHX A; 4E47 A; 4J9H A; 3EGD B; 2J6K A; 3NGP A; 5KCH A; 3H0F A; 3CD6 A; 1PCX A; 1AD5 A; 2JM9 A; 3OY9 A; 1PD0 A; 3J81 E; 3OS2 A; 2MCN A; 3MP1 A; 3OBW A; 4ATO A; 3QPH A; 1KFZ A; 2EWN A; 5GAN 8; 4BDZ A; 3QSU A; 3EG9 A; 4JJC A; 2CS7 A; 4L59 A; 5A0L A; 2V8K A; 2MK5 A; 3JB9 D; 3RUX A; 3A8G B; 1PKT A; 4PJM A; 2EQI A; 2L3S A; 2LT1 A; 3JCM c; 1JBM A; 1QCN A; 2XG8 D; 4J8O A; 2FG0 A; 1ZUY A; 3RDV A; 4M75 E; 4E7L A; 4C5E A; 4Y91 A; 2OI3 A; 1IXD A; 1WQ7 A; 2IVW A; 4JRQ A; 3EGX A; 2R57 A; 4M78 E; 1V76 A; 2KRS A; 1SHF A; 5GMK e; 2YUP A; 1V1C A; 2F5K A; 3JCM X; 3J80 E; 1Y96 A; 2AT1 B; 1GCQ C; 3GBQ A; 1E6G A; 1Y57 A; 4OB1 B; 5CKH A; 4HKE A; 1M2O A; 4P5N A; 2K4Y A; 2JOY A; 4C0Z A; 2DXB A; 1YJW Q; 2LCS A; 3LWH A; 3HKS A; 4ELY C; 4FL6 A; 4JLG A; 4EMK A; 5FU6 C; 1Y71 A; 4M77 E; 4M75 A; 3JB9 G; 2CZ6 B; 2KR3 A; 2H8H A; 1CKB A; 1FXX A; 3CCJ Q; 1M1K C; 3JSC A; 4BD3 A; 2P4R A; 1D3B A; 4OML A; 4AFQ C; 5GAN 4; 1S72 T; 2HQX A; 1IGQ A; 2XI9 A; 3GLX A; 3M54 A; 4FYW B; 3NTI A; 1ACM B; 1TOV A; 3E19 A; 2IIM A; 1OPL A; 1Q7Y C; 2DZC A; 4DEY A; 2P4T A; 5FRN A; 1WHH A; 1MHN A; 1SSF A; 1YWP A; 4XU1 A; 5GAM d; 1LVK A; 3CCM Q; 3TVT A; 1RUW A; 2M02 A; 3RMQ A; 2X9H A; 3UDC A; 3AT1 B; 5I2M A; 1YP5 A; 3M0U A; 2GGR A; 9ATC B; 5DLQ E; 4UC4 A; 1RAC B; 1IRE B; 1OZ2 A; 3CMA Q; 4CRI A; 4RTX A; 2PZ1 A; 4M77 A; 3VUZ A; 2RH2 A; 2KMT A; 1ARK A; 3G71 T; 5EG2 A; 4BE2 A; 1VA7 A; 1M2V A; 4JS4 A; 2FPE A; 4M7A D; 4XTU A; 1GFC A; 2OTJ A; 1UGV A; 1YCY A; 2D0Q B; 3RBB B; 1QKX A; 3D7S B; 5IHN A; 2DIQ A; 2LNV A; 3WVE B; 1WJR A; 2ED1 A; 3CCL T; 1X2K A; 1WXT A; 2BKD N; 4C92 D; 4DBQ A; 1X27 A; 1UG1 A; 2Z0W A; 4DBR A; 1W2B P; 1AWX A; 2HBP A; 4C0D C; 3QZ9 B; 2HSE B; 3EAE A; 2FVU A; 1QKW A; 2QGF B; 3TQ7 P; 1Q82 U; 2DD5 A; 1IHV A; 3A8L B; 1VQK T; 1K73 C; 1AWO A; 1SF9 A; 2GTJ A; 1HSQ A; 2K5L A; 3LWI A; 4K11 A; 5GAO l; 1AWW A; 1HD3 A; 4RTT A; 1VOM A; 1KHC A; 3QBY A; 1BIA A; 4PJL A; 4C8Q D; 2MAM A; 3H0I A; 3FIF A; 4X9D A; 4F04 B; 3G6E Q; 3HRT A; 2XIC A; 1SG5 A; 3DKM A; 5HK0 A; 4QQD A; 2B86 A; 5GAN 3; 1KC8 R; 2E4H A; 2V26 A; 4C92 G; 2LZ6 B; 3KFV A; 2DBK A; 1QVF S; 4IUV A; 3CCR T; 3EGX B; 4ANJ A; 5GAN f; 3H0H A; 3CC2 T; 2DVJ A; 3SWN A; 3OYD A; 2LDM A; 2LRQ A; 3V8K A; 4D6W A; 2DET A; 3OYB A; 1TUD A; 1S72 Q; 5GAN 2; 4AFZ C; 5GAN g; 1Q81 C; 3MHX A; 2YUO A; 1C1A A; 3EHQ A; 3KUF A; 2VB6 A; 1KD1 C; 2CYZ B; 4MDW A; 5KYU A; 2L3P A; 1N8R C; 2CZ0 B; 4J7F A; 2QA4 A; 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