1UICA

Analysis of the stabilization of hen lysozyme with the helix dipole and charged side chains
Total Genus 49
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
49
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRAGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDGNGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
source organism Gallus gallus
publication title Analysis of the stability of mutant lysozymes at position 15 using X-ray crystallography.
pubmed rcsb
molecule keywords LYSOZYME
total genus 49
structure length 129
sequence length 129
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1996-11-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1uicA00
4H9AA 2Q0MX 1LSEA 1GBXA 1XGUC 3HFMY 4WO9A 3B72A 3QE8A 3A90A 5KKJA 1JKCA 4KXIA 1JWRA 1HC0A 1C43A 1UC0A 1LZ8A 1HELA 4Z3MA 5L3IA 1GD6A 3P65A 3E3DA 3J4GA 1LZNA 3CSZA 4HTKA 1VDTA 5KXPA 1G7MC 4I8SA 1B7PA 5HMJA 5IHGA 3RNXA 4ETEA 1UBZA 2YDGA 1NBYC 3RZ4A 1GFUA 2B5ZA 1LMCA 4PGJB 3CSRA 1DPXA 1OUDA 1GB6A 3EO5A 4XENA 4CFPA 4LT1A 193LA 1XEJA 4R6CA 1N4FA 1IY4A 1CKCA 2Z18A 4XJIA 3WUNA 1CJ7A 2CJLA 1E8LA 1FLWA 5IELA 4NGYA 1LTMA 135LA 1IP3A 1JUGA 5I5QA 5LVKA 1CKDA 1LMOA 1DI3A 1FLQA 1AM7A 1B0DA 2A7FA 3GXRA 4N9RA 1NDMC 1ALCA 1GPQC 3CB7A 3AB6A 1IP1A 5F9XA 2C8OA 5DN4A 4NSJA 3P4ZA 4ZIXA 1CNSA 1LMNA 3W3EA 1D0LA 1WQPA 133LA 1OUCA 5APEA 4RLNA 3QY4A 4DYGA 1LJKA 1ZV5L 1HENA 1G7HC 1VDSA 4N5RA 4WG7A 1RJCB 1GBYA 3W6EA 7LYZA 1OUGA 2I25L 1NWGA 4LT2A 1UIGA 1CJ6A 4DDBA 4LFPA 1IY3A 2MEBA 2BQNA 1LYYA 2BQEA 2Z2FA 4HSFA 1YQVY 2LZTA 3LYZA 4GN5C 4H92A 4U3XB 4WMGA 1GF4A 4B1AA 2BQLA 2I6ZA 1CKFA 1GBSA 2PC2A 4HPEA 4TSBA 5ILFA 3WPKA 1OUFA 1D0KA 4N1CC 1B7LA 4H8ZA 1LHKA 1XEKA 2XBRA 3A95A 4DD3A 5KXLA 1G7JC 3A93A 1HF4A 1LCNA 1BGIA 1UICA 1LYZA 1REXA 4W94A 4YEOA 4C3WA 1GB3A 3G3BB 1WQMA 1YIKA 4WM2A 5K7OA 1HERA 1GFEA 4B4EA 2FYDA 3A92A 4NFVA 5KXKA 2D91A 1CJ8A 1RCMA 1GF7A 3CSQA 2DQGY 3WU9A 1LZ4A 1IP7A 1RFPA 2ZWBA 1YILA 1CKHA 3A3QA 1JJ3A 5FEKA 4XN6A 1HMLA 2CDSA 1D6QA 2WARA 2LHMA 3W6AA 5JENB 3W6CA 4ETAA 5F9UA 4CJ2A 2BQCA 1DI5A 4H9HA 1IORA 1QTEA 1YAQA 5LA8A 4ETCA 1LZSA 1DZBX 1GF3A 1INUA 1HMKA 1T3PA 1LMAA 1XFPL 4WLDA 2EIZC 4WM3A 1G7IC 1BWHA 3TXGA 5HLLA 134LA 4BAFA 3TXEA 1IWUA 4FJRA 1GB8A 1HEOA 1GFGA 1B5YA 4WM1A 1PS5A 4OWEA 5IDDA 4N1EI 1NF5A 1IR8A 1QIOA 1T6VL 1JSFA 1JTOL 1LSDA 3RW8A 1YL1X 5KXWA 3EMSA 4LT3A 6LYZA 1Z55A 1DKJA 1REZA 3F6ZA 4AXTA 2ZNWY 4TWSA 1W08A 4DT3A 5B1GA 1GB7A 4RW2A 1LSCA 3TXFA 1LJHA 3SP3A 2DQIY 3LZ2A 4J1AA 3EBAB 5B59A 3A6CY 4XJFA 5APCA 4MR1A 1KIPC 1KXXA 1WVUA 4WLYA 1FLYA 5KY1A 4MSTA 3TMXA 1GAZA 1A2YC 1WQNA 3VWOA 4H9CA 1HEPA 1BB6A 2HEFA 4NHSA 1LZ5A 4NHPA 4XJDA 5B06A 5J7CA 5LYTA 5I4WA 2VB1A 4G4BA 3B0OA 2BQKA 2DQCY 4DWXA 1J1OY 4OWHA 4WLTA 3TMVA 4QEQA 4IJ4A 5I4YA 1HFYA 1GE3A 1ZVHL 2F2NA 4NGKA 3W6FA 1I20A 3A6BY 4HV2A 4LGKA 4NWHA 1XGPC 5C6LA 3M18B 3CT1A 1LZAA 4ML7A 3N9AA 1YANA 4CGEA 1IOTA 3ATOA 5LYMA 1HEWA 4H8YA 1NDGC 2IHLA 5L9JA 1JTTL 4C5FA 2Z39A 1OP9B 1JIYA 1LZBA 1EL1A 1RI8B 4HJYA 4HTQA 2FYCA 2LYMA 1LAAA 1EQ4A 2YBJA 2ZQ3A 5KKIA 1AT5A 2N5ZA 2ZQ4A 3OJPA 5LIOA 3TXIA 4NGLA 4IASA 3A67Y 1H87A 1LHIA 4H93A 1GF0A 1HEQA 1MLCE 4LYCA 4Z98A 1VAUA 1VDPA 5F81A 4ZFPA 1JJ0A 2DQFC 1LSNA 3LYMA 4H9EA 5B07A 1WQOA 4HTNA 5APDA 4QY9A 2H5ZA 2FBBA 3HBEX 4X3BA 1LZGA 1HHLA 1HFZA 2Z37A 4NG1A 1BWIA 2BQFA 3QNGA 5LVJA 1LZRA 3D9AC 3RT5X 1HNLA 2D4JA 4G4CA 1XGRC 1YAMA 2LZ2A 2ZYCA 4ANRA 1QSAA 3IJUA 1QUTA 6LYTA 4DD9A 3A91A 4DDCA 5I4XA 1BQLY 3P68A 5F16A 1LOZA 1DPWA 2HEEA 5DLAA 1V7SA 2DQJY 2EKSC 3IWRA 4OW1A 4XJGA 4B49A 1UA6Y 1WTNA 2ZNXY 4NIJA 1D9UA 1JKBA 1C08C 1GFKA 4HPIA 1LJJA 3B0IA 1BB4A 1LJEA 2DQAA 3TXKA 3WU8A 1F10A 2BAAA 4MCKA 2MEGA 4OWBA 1J1XY 3J6KA 1GEZA 1GB0A 4H9FA 1LSFA 1IC5Y 1OUEA 2BLXA 5I54A 1GWDA 3LN2A 4PRQA 1BB5A 2F30A 2IFFY 4GN3A 9LYZA 1GFAA 3P64A 1NQIA 1UIHA 1REYA 1VDQA 1AT6A 1BVXA 3MGWA 1B7SA 4NGVA 1G7LC 4AGAA 5II3A 1YAOA 1A4VA 1RE2A 4J0LA 5KXTA 2HECA 4IATA 2D6BA 1UIEA 1KXWA 4LYBA 2XJWA 3W6BA 1I1ZA 4N0JA 1XGQC 4GCEA 2MEIA 3WW5A 2GV0A 4NSHA 1NHEA 1HSWA 5FCPA 4GLVA 1W6ZA 132LA 4PHIA 1FDLY 3WXTA 3OK0A 1IC4Y 1UIDA 4W96A 1IVMA 3AGIA 1NKHA 1LMPA 1LPIA 5FHWA 2MEFA 1B5XA 1YL0X 3G3AB 4Z41A 5L3HA 3BKHA 4ET8A 5LXWA 1VATA 1QDRA 4UWNA 3AYQA 4YENA 1ZVYB 1GHLA 1LHJA 1LZTA 1GBOA 207LA 4J7VA 2A7DA 4NGOA 1GFHA 5KXXA 5KXRA 1YKXX 1MELL 2DBTA 2DKVA 3HBDA 4H94A 1TCYA 2HEDA 3A96A 1TBYA 4HJVA 4E3UA 4GCDA 2HTXA 4D9ZA 1JTPL 1GAYA 1GBWA 4CFOA 2CWIA 3ZEKA 2BQOA 5D5CA 2H9JA 1LHHA 2YBMA 1YROA 4M6DA 3AZ5A 1LJGA 4LYZA 4QGZA 5HNCA 1IC7Y 1GFVA 3TMWA 1HEMA 1PZYA 1IWYA 5KXOA 1FKQA 3N9CA 2MEEA 1LSBA 3CT5A 4WOAA 4WM6A 1B7OA 1DXJA 4HP0A 4LT0A 1J1PY 1LSYA 1FBIX 3TXHA 5LVGA 4DD7A 1QDTA 1REMA 208LA 1D6PA 5DM9A 154LA 1VEDA 5B1FA 1JHLA 2CGIA 1IWWA 5LAGA 4OWCA 1QTKA 1H6MA 2DQHY 1JITA 1GB9A 4NSGA 5E4PA 4KT3A 5KXSA 4FDYA 5KXZA 1IOQA 2BPUA 1IP6A 2MECA 1JEFA 4G4HA 1LSZA 2F4AA 2G4NA 1YKZX 2XBSA 5I53A 1UIAA 3P66A 1O23A 1WQQA 4LFXA 4WM5A 2DQDY 3AZ6A 4XADA 5T3FA 3WW6A 194LA 3FI7A 2MEHA 4ETDA 5ILCA 2YVBA 2XTHA 2D4KA 4ETBA 4WG1A 3WYHA 5HQ1A 1FN5A 4LYMA 1LJFA 1GBZA 1IOSA 2HUBA 4II8A 1IP4A 4RW1A 4YEMA 1OUIA 5LA5A 2NWDX 2YBLA 3AGGG 5APFA 1LSPA 4PJ2C 2HEAA 3AJNA 2MEAA 4XJBA 3LYOA 4O34A 1B9OA 3WXUA 4ZEEA 1GB2A 4UWVA 5F14A 1NMMA 4NGIA 1LZYA 1LSAA 4NEBA 1HSXA 3T36A 1BB7A 1GFTA 5FDJA 2W1MA 1OUJA 1SLYA 2HEBA 1OUHA 4NGJA 1IWZA 4GCBA 1LKSA 5LVIA 3ZVQA 5M1YA 1XEIA 1XSFA 3B6LA 3TXBA 1TAYA 2G4QA 1GE1A 1JSEA 1BHZA 4QDNA 2LYZA 4NWEA 2EQLA 3BKVA 4DDAA 1IIZA 2BQIA 4TX7A 2ZILA 1FKVA 1GE0A 1LJ4A 4OOOA 4RLMA 3TMUA 1F0WA 4H90A 1B7RA 1F6SA 1GXV2 2G4PA 4N8ZA 4DD2A 2YBNA 153LA 2FBDA 4UWUA 4ET9A 2LYOA 5C6JA 1OUAA 3ULRA 1LZ6A 3AGHA 1DQJC 5A3EA 2ZIJA 4HV1A 2Z12A 1LZDA 1HFXA 4H91A 3CT0A 3WVYA 1GXXA 4GN4A 2D4IA 4L41A 1C45A 1DI4A 5AMYA 1AZFA 1IP2A 1V7TA 3LZTA 4NY5A 1GF5A 1LJNA 1WQRA 1GDWA 1EQEA 2DQEY 1IOCA 1FLUA 1OUBA 2HU3A 2BLYA 2YBIA 3M3UA 4DD1A 1LHMA 1LSGA 4GCFA 3TXDA 2X0AA 1B5ZA 3TXJA 1BVKC 4BS7A 2Z38A 1I56A 1LYOA 4Z46A 1ZMYL 2W1XA 3LYTA 1LMQA 5LAFA 1UIFA 2W1LA 1B7QA 4G49A 1GB5A 2BQHA 3AW7A 4GLAA 1LHLA 2RSCA 1DKKA 1UACY 1GE4A 4WO6A 4J1BA 4EOFA 4DC4A 5EBHA 4LZTA 2W1YA 3RU5A 1LZEA 3WH1A 5FELA 3A94A 4G9SA 5E9RA 3AW6A 4DD0A 4YF2A 3WL2A 1SQ2L 1P2CC 5DL9A 4XYYA 4TSCA 4KL7A 1BB3A 1IEEA 1B5UA 3D3DA 4XJHA 1B7NA 1C46A 1JJ1A 4LYOA 4NHQA 1EQ5A 1KXYA 4A7DA 4YM8A 1LZCA 1IR7A 2BQGA 3WUMA 1XGTC 4GCCA 2ZIKA 3A8ZA 4PPOA 5HMVA 1C10A 2F4GA 1KIRC 3AZ7A 1IO5A 1IP5A 5KXNA 4M4OA 1LZ1A 4NGZA 1QSWA 1NBZC 2BQDA 4P2EA 3W6DA 5KXYA 4TTDA 1JKDA 5LINA 4OWAA 1GEVA 3WULA 1YKYX 5HNLA 4NSIA 1GFRA 1LKRA 1WVVA 4H9BA 1IWTA 1VFBC 2BQBA 3HBHA 1B5VA 1B7MA 1TDYA 4NGWA 4WL7A 5DN5A 2H9KA 5A3ZA 8LYZA 4TUNA 3CQLA 1LJIA 1KIQC 4OOTA 4WM4A 1JPOA 2YSSC 1GE2A 1GFJA 3WVXA 1GF8A 4NHTA 1C7PA 1QQYA 3WUAA 4R0FA 4B0DA 1CKGA 1QUSA 1LZ9A 4RDSA 4CHXA 3WU7A 2HU1A 1UCOA 5LVHA 1F6RA 2YBHA 3WPLA 1UIBA 1JISA 1GF9A 1YAPA 1CJ9A 4NHIA 1WTMA 3LHMA 4NG8A 2Z19A 5LYZA 4YOPA 3T6UA 3WMKA 3ZVQB 5C6IA 4BAPA 1OQMA 3A34A 1LMTA 4H9IA 1B5WA 2BQMA 4B4IA 1BWJA 1IX0A 1GF6A 4H8XA 2ZYPA 3FE0A 5KXMA 3N9EA 1IWVA 4HJZA 1D0MA 1JKAA 1GDXA 5D5FA 1B2KA 1LJ3A 3K3TA 1UUZC 4PRUA 1LYSA 2EPEA 2AUBA 2BQJA 2Y8PA 4WLXA 2C8PA 1TEWA 2MEDA 1AKIA 3AZ4A 3IJVA 4KPMA 3WPJA 1IWXA 3KAMA 4I0CA 4LYTA 1IR9A 3B0KA 1LSMA 3EXDA 4WL6A 5FSTA 3A3RX 4B4JA 2I26L 4H1PA 5B05A 2BQAA 2Z2EA 3GXKA 5KJ9A 4EMNA 4BADA 3ATNA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2Q0MX 1CUQA 3HFMY 3A90A 1JKCA 3C82A 1C43A 1LZ8A 3HH3A 1L14A 3DKEX 3CSRA 1OUDA 211LA 1G0QA 1L28A 1FLWA 5I5QA 1IP3A 3FADA 3HDFA 4N9RA 3OE9A 1NDMC 3CB7A 2OTZX 2C8OA 1L98A 1C6MA 122LA 2OEAX 3P4ZA 5APEA 3GUMA 3SB7A 1L62A 4DYGA 1HENA 1VDSA 1OUGA 1CJ6A 196LA 1IY3A 2BQEA 1SWYA 4HPEA 6LZMA 1OUFA 1D0KA 4K5YA 4N1CC 1B7LA 4YXCA 4DD3A 1HF4A 4W52A 1L84A 4WM2A 3QAKA 1HERA 2RAZX 4NFVA 107LA 1ZYTA 1YILA 257LA 1JJ3A 239LA 1D6QA 3SB6A 1C68A 5JENB 4CJ2A 110LA 4H9HA 1IORA 1QTEA 5LA8A 231LA 259LA 253LA 4BAFA 1IWUA 1GFGA 1B5YA 3DN3A 142LA 1PS5A 4OWEA 5IDDA 189LA 1T6VL 1L80A 251LA 4LT3A 1ZURA 1Z55A 1DKJA 2ZNWY 4TWSA 4DT3A 1P37A 2DQIY 3LZ2A 3EBAB 5B59A 4ARQA 1KXXA 1FLYA 1A2YC 1WQNA 3VWOA 3OE6A 2IGCA 4XJDA 1QTZA 4LZMA 1L72A 1XJUA 4OWHA 4WLTA 162LA 4QEQA 1GE3A 1KW7A 1QT5A 3A6BY 1L08A 2OE7X 4HV2A 4LGKA 1L00A 249LA 1D3MA 3ATOA 103LA 5LYMA 1QTVA 2NTGA 1C63A 4C5FA 2Z39A 1QTBA 4HTQA 1C6JA 1LAAA 1EQ4A 3SBAA 2ZQ4A 3RZEA 1LI2A 1H87A 1LHIA 104LA 1GF0A 5F81A 1JJ0A 2DQFC 3GUOA 1LSNA 3LYMA 1WQOA 5APDA 3HBEX 2Z37A 3HUKA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4H9A A;  2Q0M X;  1LSE A;  1GBX A;  1XGU C;  3HFM Y;  4WO9 A;  3B72 A;  3QE8 A;  3A90 A;  5KKJ A;  1JKC A;  4KXI A;  1JWR A;  1HC0 A;  1C43 A;  1UC0 A;  1LZ8 A;  1HEL A;  4Z3M A;  5L3I A;  1GD6 A;  3P65 A;  3E3D A;  3J4G A;  1LZN A;  3CSZ A;  4HTK A;  1VDT A;  5KXP A;  1G7M C;  4I8S A;  1B7P A;  5HMJ A;  5IHG A;  3RNX A;  4ETE A;  1UBZ A;  2YDG A;  1NBY C;  3RZ4 A;  1GFU A;  2B5Z A;  1LMC A;  4PGJ B;  3CSR A;  1DPX A;  1OUD A;  1GB6 A;  3EO5 A;  4XEN A;  4CFP A;  4LT1 A;  193L A;  1XEJ A;  4R6C A;  1N4F A;  1IY4 A;  1CKC A;  2Z18 A;  4XJI A;  3WUN A;  1CJ7 A;  2CJL A;  1E8L A;  1FLW A;  5IEL A;  4NGY A;  1LTM A;  135L A;  1IP3 A;  1JUG A;  5I5Q A;  5LVK A;  1CKD A;  1LMO A;  1DI3 A;  1FLQ A;  1AM7 A;  1B0D A;  2A7F A;  3GXR A;  4N9R A;  1NDM C;  1ALC A;  1GPQ C;  3CB7 A;  3AB6 A;  1IP1 A;  5F9X A;  2C8O A;  5DN4 A;  4NSJ A;  3P4Z A;  4ZIX A;  1CNS A;  1LMN A;  3W3E A;  1D0L A;  1WQP A;  133L A;  1OUC A;  5APE A;  4RLN A;  3QY4 A;  4DYG A;  1LJK A;  1ZV5 L;  1HEN A;  1G7H C;  1VDS A;  4N5R A; 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 3AZ7 A;  1IO5 A;  1IP5 A;  5KXN A;  4M4O A;  1LZ1 A;  4NGZ A;  1QSW A;  1NBZ C;  2BQD A;  4P2E A;  3W6D A;  5KXY A;  4TTD A;  1JKD A;  5LIN A;  4OWA A;  1GEV A;  3WUL A;  1YKY X;  5HNL A;  4NSI A;  1GFR A;  1LKR A;  1WVV A;  4H9B A;  1IWT A;  1VFB C;  2BQB A;  3HBH A;  1B5V A;  1B7M A;  1TDY A;  4NGW A;  4WL7 A;  5DN5 A;  2H9K A;  5A3Z A;  8LYZ A;  4TUN A;  3CQL A;  1LJI A;  1KIQ C;  4OOT A;  4WM4 A;  1JPO A;  2YSS C;  1GE2 A;  1GFJ A;  3WVX A;  1GF8 A;  4NHT A;  1C7P A;  1QQY A;  3WUA A;  4R0F A;  4B0D A;  1CKG A;  1QUS A;  1LZ9 A;  4RDS A;  4CHX A;  3WU7 A;  2HU1 A;  1UCO A;  5LVH A;  1F6R A;  2YBH A;  3WPL A;  1UIB A;  1JIS A;  1GF9 A;  1YAP A;  1CJ9 A;  4NHI A;  1WTM A;  3LHM A;  4NG8 A;  2Z19 A;  5LYZ A;  4YOP A;  3T6U A;  3WMK A;  3ZVQ B;  5C6I A;  4BAP A;  1OQM A;  3A34 A;  1LMT A;  4H9I A;  1B5W A;  2BQM A;  4B4I A;  1BWJ A;  1IX0 A;  1GF6 A;  4H8X A;  2ZYP A;  3FE0 A;  5KXM A;  3N9E A;  1IWV A;  4HJZ A;  1D0M A;  1JKA A;  1GDX A;  5D5F A;  1B2K A;  1LJ3 A;  3K3T A;  1UUZ C;  4PRU A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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