1UIFA

Analysis of the stabilization of hen lysozyme with the helix dipole and charged side chains
Total Genus 48
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
48
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRVGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDGNGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
source organism Gallus gallus
publication title Analysis of the stability of mutant lysozymes at position 15 using X-ray crystallography.
pubmed rcsb
molecule keywords LYSOZYME
total genus 48
structure length 129
sequence length 129
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1996-11-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1uifA00
1ZV5L 4OW1A 1B7NA 1GFVA 4NGOA 4TSBA 1BQLY 4DC4A 1W08A 2A7DA 3AGHA 5KXOA 1RI8B 1E8LA 1SLYA 4H8YA 1QDRA 1H87A 1IWYA 3LYOA 3A91A 1CJ9A 1YIKA 3AZ4A 1UIGA 4DD3A 1GB9A 1WQNA 2PC2A 1GBSA 2HEDA 4H9EA 1AKIA 1WTMA 2ZNXY 4OOTA 4E3UA 1CKGA 3E3DA 4WG7A 2X0AA 1GE3A 3AJNA 1IVMA 1LJHA 2BLYA 2BQOA 2WARA 2Z19A 3FE0A 1IORA 2H5ZA 3OJPA 4LT2A 133LA 4U3XB 1QIOA 4B0DA 1DPXA 1LAAA 4HSFA 1EQEA 3WU8A 1YAMA 2IHLA 3AW7A 1XEKA 1YILA 1JWRA 2MECA 2N5ZA 1JPOA 3ATNA 4ZFPA 2A7FA 4RW1A 4PPOA 2CGIA 4GCBA 3EBAB 4M6DA 4I0CA 2IFFY 1OUFA 5F9UA 4WM2A 5LA8A 4TWSA 1EQ4A 1CJ6A 2BQBA 1GE2A 4NGJA 3VWOA 4WM1A 2Z37A 4NEBA 1LSNA 3TXGA 3TXKA 4GCCA 1LZ9A 2D4JA 4HPEA 1FLYA 1GFHA 1LHHA 4NSIA 4EOFA 5LINA 4CHXA 4H9FA 2ZIKA 4LYOA 3ULRA 1DPWA 1ZMYL 1CKCA 4DT3A 2DQJY 2DQAA 207LA 1C45A 4NSGA 4NY5A 4P2EA 1B7OA 3A6CY 4WLYA 1LPIA 5I4WA 4IASA 4H1PA 5HNLA 5C6IA 4KT3A 2YSSC 2MEAA 2C8OA 1GB7A 1OUEA 1VFBC 1UIHA 1V7TA 2BQGA 3ATOA 1DKKA 4L41A 4NIJA 2AUBA 1OUJA 3WU7A 4XJBA 1DI5A 1IWUA 3WUMA 1LHLA 1WQOA 3WPJA 4KL7A 3N9EA 4Z3MA 3BKHA 4CJ2A 4Z41A 1AZFA 208LA 1EL1A 2EQLA 4YOPA 4LYMA 3N9AA 1CKDA 4HJVA 4G9SA 5LVIA 3LYZA 1B5WA 3ZEKA 1WTNA 3A3QA 5APCA 1AT5A 2Q0MX 5E9RA 1LSBA 4DD9A 4HV1A 2Z2EA 1BVXA 5EBHA 1LZNA 4WL6A 1I20A 2FBDA 5KY1A 1CKFA 4ANRA 4A7DA 3A96A 5D5CA 1IOQA 1BGIA 4NWEA 5KXTA 3CT0A 1REZA 1IP4A 4ETBA 3RZ4A 1OQMA 1DI4A 3N9CA 2DQIY 2BLXA 1GFAA 1LTMA 1DXJA 4UWVA 2RSCA 5APDA 2D4IA 4H9CA 1IP7A 1GDXA 1HFZA 1LZTA 3TXJA 3LYMA 5LVKA 1UICA 1JITA 2XTHA 4ML7A 4QDNA 3CSZA 1LMQA 4NFVA 1ZVYB 1LYOA 4G4HA 5T3FA 1B9OA 1VATA 4CGEA 4NGLA 5DN5A 5IELA 2G4PA 2BQCA 3LYTA 5DM9A 4HP0A 5B06A 3GXRA 4HTNA 3QE8A 4OWHA 3WMKA 3CT1A 4LT3A 1YROA 4N5RA 1LZRA 5C6JA 1P2CC 4NHIA 1IX0A 1LYZA 4PJ2C 3B0OA 3W6EA 2YBNA 1LJFA 5LYZA 2ZYCA 2ZWBA 4N1CC 5C6LA 4G4BA 1OUAA 1HEMA 1IOCA 1PZYA 1G7JC 4H9AA 3WYHA 1B2KA 2HEAA 4M4OA 2Z39A 2Z2FA 2VB1A 3TXEA 1FDLY 5LVHA 1JISA 1LKSA 5B05A 3AB6A 2W1LA 3HFMY 5B59A 5B1GA 5DN4A 1LJGA 1LJ3A 1LYYA 1JKAA 3QY4A 2HEEA 1JTPL 4NGZA 1IR9A 1Z55A 2BQEA 3GXKA 4HJZA 1UIEA 1LSYA 4PHIA 3WH1A 1VDTA 1ZVHL 1GBWA 4ET9A 2MEIA 4QGZA 1UIBA 1GF6A 3G3BB 3WVYA 2BQKA 2DKVA 4QEQA 4ET8A 1B5VA 1GBZA 1KIPC 4YEOA 5LXWA 1GHLA 3AZ6A 1UIAA 4ZIXA 3CSQA 3WU9A 1JKBA 4TTDA 1HNLA 1OUDA 3M18B 1KXWA 3A67Y 1B7SA 5LA5A 1IOTA 4B4IA 4PRUA 4LZTA 1HFXA 4NGVA 4DDBA 1GAYA 1SQ2L 2LZ2A 3WXTA 4TX7A 4KPMA 1XGRC 1BB3A 4B4EA 1UIFA 1LKRA 5HQ1A 3WULA 4J1BA 1KXYA 1D6PA 4J0LA 3RU5A 4WG1A 1FKVA 4NG8A 1FLQA 4LYTA 5AMYA 1ALCA 1BHZA 4WMGA 1GFJA 4Z46A 4UWUA 1GE1A 1G7LC 4NSHA 1BVKC 4Z98A 1C10A 2EPEA 2D91A 6LYTA 5I5QA 5LIOA 1GBYA 1YKYX 3CQLA 3AZ7A 3W6DA 1FLUA 3A94A 5I4XA 3AGGG 1NBZC 2G4NA 1GDWA 2XBSA 3HBDA 1GEVA 1JEFA 3M3UA 4G4CA 1PS5A 2DBTA 3TMXA 1XGPC 1LMCA 4OWAA 4BADA 1LOZA 4DDAA 132LA 1LZ5A 4B49A 1HHLA 1YANA 5KXXA 1D6QA 4HV2A 4GCEA 4LYZA 5KXLA 1LZ1A 4WOAA 1GEZA 1GF9A 2Z38A 3P65A 1B7MA 1OP9B 1WVVA 2BQMA 1BWHA 1TEWA 1FKQA 2MEHA 5DLAA 3IWRA 5L9JA 8LYZA 1HENA 1A4VA 1DKJA 5B1FA 2FBBA 1JJ1A 2DQGY 2HECA 3BKVA 1HEQA 1RCMA 1HMLA 1IWXA 153LA 1GWDA 1BB4A 4WO9A 1IIZA 1QTEA 1F6SA 1G7IC 4DD1A 3RNXA 4H93A 3W3EA 1GFUA 1A2YC 4IJ4A 4WM3A 4J7VA 2Y8PA 4B1AA 1G7HC 4DDCA 1V7SA 3P66A 4II8A 4LYBA 1VDSA 1QTKA 134LA 4OOOA 4NHTA 4QY9A 1QDTA 3AGIA 4H92A 3ZVQB 4DWXA 1IWVA 2DQFC 1OUCA 1XGTC 1LZAA 3WW6A 4LT0A 1B5XA 3A34A 5ILCA 5APEA 194LA 3TMVA 1YKXX 5I4YA 1F6RA 1TDYA 5D5FA 4NWHA 1HELA 4H94A 1NWGA 1GF8A 4R6CA 1IR8A 4FJRA 1UACY 3TXDA 5F81A 4WM5A 2BQAA 193LA 1JIYA 4O34A 3TMWA 2LHMA 1LJKA 2BQFA 2HU1A 1JJ0A 1D9UA 1OUIA 3ZVQA 1LHIA 3A90A 3SP3A 3P4ZA 5F9XA 2YVBA 4GN5C 1GB5A 2HUBA 1JTOL 2CDSA 1JSEA 5KXMA 3A3RX 1BWJA 2EIZC 1DQJC 1IOSA 2YBHA 1XGUC 1GFKA 1O23A 4N0JA 1HSXA 2ZQ3A 3TXFA 1LZ4A 2HEBA 1LSFA 2XJWA 1UA6Y 3RW8A 4B4JA 2DQEY 1HC0A 1GB0A 5HMVA 5FCPA 1B5YA 4C5FA 4XN6A 3KAMA 1NF5A 2ZYPA 5KKJA 4GLAA 1IWZA 3HBEX 4LFPA 4CFOA 1IWTA 4YF2A 1IP3A 1LMOA 4NGYA 1OUHA 2HU3A 2CJLA 1JSFA 2BQIA 4G49A 1TBYA 4BAPA 1KIQC 1LMNA 1N4FA 2YBIA 4LFXA 4N9RA 1HSWA 4XENA 1WQPA 1GB8A 3CB7A 3EMSA 1VDQA 5L3HA 1LZDA 1NHEA 3WUAA 6LYZA 3WUNA 1BB7A 4IATA 5LVGA 4XJHA 2W1MA 1HEWA 1I1ZA 3B6LA 4ETEA 1BB6A 4H8ZA 4LYCA 4N8ZA 4OWBA 5KXWA 1GFRA 2MEBA 5LVJA 1LSAA 3D9AC 4NGIA 1LZEA 5F14A 5L3IA 1JTTL 5KXSA 5II3A 5KKIA 4FDYA 1IY3A 1GPQC 2BQJA 4PRQA 4H90A 5DL9A 1GFEA 1GE4A 1LZYA 1D0MA 1BB5A 1JKCA 1RFPA 1GD6A 3EXDA 2W1YA 2Z12A 3CSRA 4KXIA 2BQNA 3A92A 4GN3A 3AZ5A 1HMKA 1IEEA 1LZ8A 4XYYA 1EQ5A 3A8ZA 4XJFA 1NDGC 3HBHA 4GN4A 1C43A 5APFA 1MLCE 2EKSC 3B0KA 4DD0A 4WLDA 5HMJA 3WXUA 4BAFA 4MSTA 1VDPA 4UWNA 1IWWA 1IO5A 1UUZC 1GAZA 2H9KA 2YDGA 4OWEA 4RLNA 4EMNA 4AGAA 1J1OY 1CNSA 3J4GA 2D6BA 2BQHA 2BQDA 4WO6A 2CWIA 3CT5A 5FSTA 4C3WA 7LYZA 1CJ8A 2BQLA 5KXNA 1REXA 1LZBA 1WQRA 4XADA 3TMUA 4HTKA 4ETAA 5LAFA 3WVXA 4YENA 3WL2A 3T6UA 2FYCA 2LYOA 3T36A 1JHLA 3A95A 1IP2A 5J7CA 4ZEEA 3W6FA 1GF7A 2ZQ4A 3FI7A 3RT5X 3W6CA 4TUNA 4WLTA 1QSAA 1HFYA 1GFGA 1LZSA 4NHPA 1GFTA 1IP5A 4AXTA 1HF4A 5KXKA 2DQCY 1XEJA 1LJIA 3LZ2A 4H91A 1KXXA 1GXV2 1JUGA 2XBRA 3B0IA 4NGKA 2BPUA 4GLVA 1LSDA 1T6VL 4PGJB 1B7LA 1F0WA 1NMMA 3K3TA 4H9HA 4RDSA 4RW2A 5LAGA 1XGQC 5M1YA 3WPLA 3A6BY 2MEFA 1LJEA 2FYDA 2MEEA 4YEMA 2G4QA 4WM4A 5KXZA 1LMPA 2LYMA 4I8SA 1TCYA 4GCFA 4HJYA 1OUBA 1LZGA 5K7OA 1NKHA 5JENB 4R0FA 4W94A 4WM6A 2ZNWY 1IC7Y 1MELL 1QUSA 1YAPA 5FHWA 2DQHY 2BAAA 4MCKA 1IC4Y 1W6ZA 2H9JA 3W6AA 154LA 4YM8A 1QQYA 4ETDA 1LSMA 2MEDA 2ZILA 2ZIJA 2D4KA 1BWIA 3WPKA 1C08C 3LN2A 1OUGA 1REYA 5KXYA 4N1EI 2I25L 1UC0A 1GB3A 1WQQA 4LT1A 1YQVY 1YAOA 3TXIA 1GF0A 1NDMC 2YBMA 1G7MC 4GCDA 1NQIA 5I53A 1YL1X 5FELA 1LMTA 4WL7A 3TXBA 1TAYA 1INUA 1LSEA 1XSFA 5KXPA 1C7PA 1QUTA 5IDDA 4DYGA 3W6BA 1FLWA 5B07A 1UIDA 4XJDA 1I56A 1LCNA 1FN5A 2F30A 4NGWA 4TSCA 1B7QA 1LMAA 4LGKA 2I26L 1GBXA 1XFPL 3A93A 1F10A 1GF5A 3TXHA 4ETCA 4H9IA 4NSJA 1D0LA 1LJ4A 1CJ7A 9LYZA 5KJ9A 1HERA 1GB2A 2NWDX 4RLMA 1WQMA 2B5ZA 2Z18A 4BS7A 2W1XA 3B72A 1LZ6A 3J6KA 4WLXA 4DD7A 1AT6A 1YKZX 3P68A 4NHQA 5FEKA 1LYSA 3QNGA 1GF3A 1YL0X 2MEGA 3LHMA 3F6ZA 1NBYC 1IC5Y 4OWCA 4X3BA 4XJGA 1FBIX 1H6MA 1UBZA 1YAQA 1DI3A 1JKDA 1GB6A 2HEFA 2I6ZA 2LZTA 1IR7A 1RJCB 3D3DA 4H9BA 3IJVA 3MGWA 4NG1A 1UCOA 4DD2A 2YBLA 4W96A 2GV0A 3P64A 5HLLA 5LYMA 1LHMA 1GF4A 1DZBX 1J1PY 1GXXA 1VEDA 1LSCA 1IP6A 1IP1A 1B7PA 1JJ3A 1C46A 1VAUA 1WVUA 1LSZA 5LYTA 4CFPA 3EO5A 1GBOA 1GE0A 1LHJA 1XEIA 4MR1A 3G3AB 1HEPA 1LSPA 1IY4A 135LA 1CKHA 1LSGA 1T3PA 2HTXA 3LZTA 4J1AA 1HEOA 1REMA 3AYQA 3IJUA 5E4PA 4H8XA 2C8PA 1J1XY 5A3EA 5HNCA 2F4AA 5KXRA 2YBJA 4HPIA 4HTQA 5FDJA 1LHKA 5I54A 1RE2A 4NHSA 1B5ZA 1AM7A 3WW5A 1B0DA 1LJJA 2F2NA 1D0KA 1LZCA 3OK0A 1LJNA 4D9ZA 5A3ZA 5IHGA 2DQDY 5ILFA 3AW6A 1QSWA 1B7RA 2F4GA 5F16A 1KIRC 1B5UA 2LYZA 4XJIA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3HH5A 4NGOA 4TSBA 3C8QA 5KXOA 1RI8B 1SLYA 1L84A 1QDRA 1IWYA 1QUGA 3LYOA 120LA 1G0KA 1D2YA 3AZ4A 247LA 1GB9A 4I7RA 1WQNA 2HEDA 1C6QA 2ZNXY 4H9EA 1L12A 3E3DA 4ARQA 2X0AA 1GE3A 2BQOA 3FE0A 4LT2A 1L45A 2IHLA 1L11A 1YILA 181LA 2N5ZA 2NTHA 4PPOA 3C82A 3DMVA 3EBAB 4GCBA 1CU6A 1GE2A 1C61A 3TXGA 3HH4A 4GCCA 1LZ9A 2D4JA 3SB9A 192LA 1FLYA 1OVJA 3CDVA 5LINA 4H9FA 1QT6A 1DPWA 1ZMYL 1CKCA 1CU2A 4NY5A 207LA 4NSGA 5I4WA 1L74A 2C8OA 1OUEA 4YX7C 3FA0A 125LA 1P5CA 3WU7A 4DQ5A 1DI5A 1L17A 1WQOA 3WPJA 4CJ2A 4W54A 1L71A 1DYGA 1EL1A 1L18A 4LYMA 2F32A 4HJVA 3LYZA 110LA 2CUUA 1AT5A 1L25A 1L53A 4DD9A 1BVXA 4WL6A 3FADA 4ANRA 4A7DA 4NWEA 3RZ4A 2BLXA 2B70A 5APDA 1GDXA 141LA 1HFZA 3LYMA 5LVKA 2RAZX 191LA 1ZVYB 5DN5A 3GUNA 143LA 3GXRA 1PQOA 1YROA 197LA 1LZRA 1XEPA 3W6EA 5LYZA 1L76A 1OUAA 1QT5A 1D3NA 3HUAA 4W51A 1G0QA 5B59A 1LJ3A 4ARQB 1JTPL 4NGZA 2BQEA 1LSYA 4PHIA 1LYFA 1VDTA 1ZVHL 1L02A 2MEIA 1UIBA 2DKVA 234LA 4YEOA 3AZ6A 1C6TA 3CSQA 3WU9A 1JKBA 1KXWA 5LA5A 1IOTA 237LA 4B4IA 1HFXA 4TX7A 249LA 4EPFA 3WULA 4J1BA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1ZV5 L;  4OW1 A;  1B7N A;  1GFV A;  4NGO A;  4TSB A;  1BQL Y;  4DC4 A;  1W08 A;  2A7D A;  3AGH A;  5KXO A;  1RI8 B;  1E8L A;  1SLY A;  4H8Y A;  1QDR A;  1H87 A;  1IWY A;  3LYO A;  3A91 A;  1CJ9 A;  1YIK A;  3AZ4 A;  1UIG A;  4DD3 A;  1GB9 A;  1WQN A;  2PC2 A;  1GBS A;  2HED A;  4H9E A;  1AKI A;  1WTM A;  2ZNX Y;  4OOT A;  4E3U A;  1CKG A;  3E3D A;  4WG7 A;  2X0A A;  1GE3 A;  3AJN A;  1IVM A;  1LJH A;  2BLY A;  2BQO A;  2WAR A;  2Z19 A;  3FE0 A;  1IOR A;  2H5Z A;  3OJP A;  4LT2 A;  133L A;  4U3X B;  1QIO A;  4B0D A;  1DPX A;  1LAA A;  4HSF A;  1EQE A;  3WU8 A;  1YAM A;  2IHL A;  3AW7 A;  1XEK A;  1YIL A;  1JWR A;  2MEC A;  2N5Z A;  1JPO A;  3ATN A;  4ZFP A;  2A7F A;  4RW1 A;  4PPO A;  2CGI A;  4GCB A;  3EBA B;  4M6D A;  4I0C A;  2IFF Y;  1OUF A;  5F9U A;  4WM2 A;  5LA8 A;  4TWS A;  1EQ4 A;  1CJ6 A;  2BQB A;  1GE2 A;  4NGJ A;  3VWO A;  4WM1 A;  2Z37 A;  4NEB A;  1LSN A;  3TXG A;  3TXK A;  4GCC A;  1LZ9 A;  2D4J A;  4HPE A;  1FLY A;  1GFH A;  1LHH A;  4NSI A;  4EOF A;  5LIN A;  4CHX A;  4H9F A; 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 1GBX A;  1XFP L;  3A93 A;  1F10 A;  1GF5 A;  3TXH A;  4ETC A;  4H9I A;  4NSJ A;  1D0L A;  1LJ4 A;  1CJ7 A;  9LYZ A;  5KJ9 A;  1HER A;  1GB2 A;  2NWD X;  4RLM A;  1WQM A;  2B5Z A;  2Z18 A;  4BS7 A;  2W1X A;  3B72 A;  1LZ6 A;  3J6K A;  4WLX A;  4DD7 A;  1AT6 A;  1YKZ X;  3P68 A;  4NHQ A;  5FEK A;  1LYS A;  3QNG A;  1GF3 A;  1YL0 X;  2MEG A;  3LHM A;  3F6Z A;  1NBY C;  1IC5 Y;  4OWC A;  4X3B A;  4XJG A;  1FBI X;  1H6M A;  1UBZ A;  1YAQ A;  1DI3 A;  1JKD A;  1GB6 A;  2HEF A;  2I6Z A;  2LZT A;  1IR7 A;  1RJC B;  3D3D A;  4H9B A;  3IJV A;  3MGW A;  4NG1 A;  1UCO A;  4DD2 A;  2YBL A;  4W96 A;  2GV0 A;  3P64 A;  5HLL A;  5LYM A;  1LHM A;  1GF4 A;  1DZB X;  1J1P Y;  1GXX A;  1VED A;  1LSC A;  1IP6 A;  1IP1 A;  1B7P A;  1JJ3 A;  1C46 A;  1VAU A;  1WVU A;  1LSZ A;  5LYT A;  4CFP A;  3EO5 A;  1GBO A;  1GE0 A;  1LHJ A;  1XEI A;  4MR1 A;  3G3A B;  1HEP A;  1LSP A;  1IY4 A;  135L A;  1CKH A;  1LSG A;  1T3P A;  2HTX A;  3LZT A;  4J1A A;  1HEO A;  1REM A;  3AYQ A;  3IJU A;  5E4P A;  4H8X A;  2C8P A;  1J1X Y; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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