1UIGA

Analysis of the stabilization of hen lysozyme with the helix dipole and charged side chains
Total Genus 46
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
46
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDGNGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords LYSOZYME
publication title Analysis of the stability of mutant lysozymes at position 15 using X-ray crystallography.
pubmed rcsb
source organism Gallus gallus
total genus 46
structure length 129
sequence length 129
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1996-11-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1uigA00
3A90A 4XYYA 5FEKA 2DQDY 4YEMA 1FKVA 3EXDA 2MEEA 2ZQ3A 4BS7A 3RT5X 1D9UA 4OWAA 4LT2A 4ZIXA 5A3ZA 3M18B 1NQIA 4GLAA 1ZVHL 1UA6Y 4P2EA 3WPLA 1ZMYL 5LYMA 1GHLA 2HEFA 1GFKA 4N9RA 1J1XY 1REXA 4TSBA 3WH1A 5C6LA 5HNCA 1D0MA 1W08A 4H9EA 1QSWA 1DI4A 2HEEA 4NSJA 1YAPA 3J6KA 2Z39A 1VEDA 2DQGY 4FJRA 6LYTA 3ATOA 4NSIA 3B0IA 1JTPL 2Z37A 3B0OA 2Z19A 3P66A 1GFAA 4YEOA 1AM7A 1WTMA 1IP7A 3OK0A 5L3HA 1JUGA 1WVVA 2LHMA 2Z18A 4NGKA 4WM4A 1OUCA 1YAOA 5FELA 1XGUC 4PHIA 1A4VA 4NG1A 1LZDA 1OUHA 1KXYA 4ZFPA 3LZTA 2MEGA 1IWWA 1GE3A 1LZRA 4CGEA 1W6ZA 1LSZA 3K3TA 4HP0A 4R0FA 5B1GA 4MR1A 6LYZA 2MEBA 2W1YA 1WQQA 1ALCA 3WL2A 1DI5A 2LYZA 4II8A 4OOTA 1NF5A 4J7VA 1BWHA 3AW7A 4LYMA 4B0DA 3ULRA 4QY9A 4WO6A 1CKDA 1HFYA 1CJ7A 1YL1X 4N5RA 1B7PA 1UBZA 4WO9A 4BAPA 5LAGA 1RJCB 1LCNA 2VB1A 4YOPA 5APFA 3N9AA 4H94A 1YILA 4WLDA 3AGGG 1LZBA 3WPKA 4B4EA 1C10A 4H90A 3AGIA 1BB5A 1WTNA 2ZIKA 4H9HA 4DDAA 1CKHA 2ZNXY 5IDDA 3LYTA 1GF3A 5LVHA 1GEVA 4H9BA 1FDLY 2AUBA 1DPXA 4ET8A 1IOSA 4PJ2C 3B0KA 1XGQC 4G4HA 1UIFA 5LIOA 3W6CA 1OUEA 4CJ2A 4WL7A 3W3EA 1DZBX 4NGLA 2ZILA 1QUTA 1BVKC 2HEDA 1LSBA 194LA 4B49A 4KT3A 4NGIA 1HNLA 2YBJA 1GAYA 2ZIJA 4D9ZA 2RSCA 1KIQC 1TDYA 132LA 2W1LA 4KXIA 5ILCA 1GEZA 1HEQA 1HMLA 1LZEA 1LHJA 1IORA 1HENA 4OOOA 3WVXA 1OUFA 5DL9A 3ZVQA 1H87A 3HBEX 3CSRA 5F16A 1WQNA 1GF5A 1WQRA 1YL0X 1REMA 1WQMA 2BQFA 3A93A 3LYOA 4RLNA 1LZAA 1UIBA 4MCKA 3AGHA 5LA8A 1B7QA 1LMAA 1GB3A 2BPUA 3E3DA 2CDSA 4XJIA 1LMQA 4RDSA 3CQLA 5AMYA 3TXHA 5II3A 1B2KA 3TXEA 4YM8A 4TTDA 2D4IA 5KKIA 5DLAA 1YKYX 1IWTA 2BQJA 2HEBA 2Y8PA 5E4PA 1LJNA 4NSGA 5KXYA 5I54A 4UWVA 1FLYA 3WU7A 1KXXA 3G3AB 3N9EA 1LYYA 1NBYC 3KAMA 4CFPA 3B6LA 1D6QA 2EQLA 4NWHA 1GF6A 4WM2A 1IP4A 3IWRA 4YENA 5FHWA 4H8XA 1GD6A 5A3EA 1CJ8A 3P4ZA 1GB8A 2G4NA 4H1PA 4H9AA 4NHPA 4DYGA 5HMVA 1LTMA 1GXV2 1QSAA 2H5ZA 153LA 1IC7Y 2HEAA 4NEBA 1GDWA 4B4IA 4OWBA 5T3FA 1GB6A 1LZCA 1XEJA 4RW1A 5KXNA 1NKHA 3BKVA 1B9OA 1QIOA 1AT5A 5APCA 2BQNA 1JPOA 2BQGA 1G7HC 1HELA 5I4XA 3TXFA 3W6AA 3TXBA 2Z2EA 2EPEA 4LYBA 1IP5A 3LN2A 4UWUA 4HV2A 3TXKA 4PGJB 2MEDA 193LA 4TSCA 1OUJA 2HUBA 1CJ9A 1G7IC 1JSEA 2ZYCA 1UIEA 2CGIA 4HSFA 1IWUA 1LSDA 2H9JA 1GE0A 3WXTA 4G9SA 1EL1A 1SQ2L 1IP6A 4XJFA 1BWIA 3ATNA 2HECA 3HFMY 1LZGA 1PZYA 4LFXA 1B5ZA 3A6BY 4H8YA 5E9RA 1CKFA 3TXGA 2HTXA 3WUNA 3OJPA 1AZFA 4AGAA 4DD3A 2BQMA 1LOZA 4HTKA 4WLXA 3A92A 5DM9A 2MEFA 3LHMA 1LZ6A 1UC0A 1FLWA 1RFPA 1G7JC 2BQHA 3M3UA 1IY4A 5B06A 2XJWA 3P64A 1I20A 4FDYA 9LYZA 1GPQC 5J7CA 3A91A 4M4OA 1N4FA 4PRUA 1OUAA 4DDBA 1VDTA 2LZ2A 1LHHA 4DWXA 3D9AC 1LJHA 7LYZA 1LJFA 3CT1A 3MGWA 1IY3A 2H9KA 4XJGA 2MECA 4EOFA 1DQJC 1H6MA 2HU1A 1B5VA 4ML7A 2A7FA 4TWSA 1IC4Y 1FLQA 135LA 4WG1A 5C6IA 1YROA 3N9CA 208LA 1B0DA 4PPOA 4WM5A 4J1AA 1NBZC 2N5ZA 4XN6A 1GAZA 4WMGA 4LT3A 4W96A 1E8LA 1UACY 2ZYPA 4RW2A 4NHIA 1YAMA 2XBRA 3FE0A 4NGYA 1QTEA 4H92A 1TAYA 4IJ4A 5F81A 3AYQA 1C46A 2BAAA 1GFVA 1NMMA 1FN5A 1UIAA 1LKSA 2BLYA 4LYTA 1OQMA 4H9IA 1TCYA 3HBHA 4HTNA 3T6UA 1IP2A 1G7LC 2YBMA 2ZQ4A 5HQ1A 3P65A 5IELA 1IWYA 4G4BA 3A67Y 1LSCA 2Z38A 5LAFA 1GFHA 1IIZA 1LSAA 4LGKA 1IWVA 4CFOA 1HERA 3LYZA 4A7DA 5EBHA 1IOQA 1JTOL 4GLVA 4CHXA 1BB7A 1INUA 2MEAA 5APDA 1NDMC 1LZTA 1B5XA 1T6VL 5KXXA 5LYTA 2C8PA 1OUGA 1LKRA 1LMOA 1IR7A 2Q0MX 1JKBA 5F14A 2W1MA 4OWEA 2Z12A 1GF9A 4DD0A 1HEOA 3ZVQB 8LYZA 1B5WA 1Z55A 3HBDA 2LZTA 5C6JA 2YBNA 5LINA 2D4KA 3W6FA 5M1YA 4HJVA 1B7LA 1LYOA 5L9JA 2BQKA 1CJ6A 5LVKA 1C43A 207LA 4NGZA 4NIJA 3ZEKA 1VFBC 1F6RA 1P2CC 4G49A 4DDCA 4HJYA 1XFPL 1GB0A 1ZV5L 4BAFA 3WUMA 1D6PA 1JWRA 2BLXA 3WYHA 1HF4A 1YAQA 2LYOA 2WARA 4R6CA 4M6DA 3RU5A 1LZ4A 5KXWA 4Z98A 2D4JA 1IR9A 1LJ4A 4IATA 4NHSA 5KXZA 1HSWA 5IHGA 3WU9A 1LJKA 4RLMA 1DXJA 5KXLA 2C8OA 4DD2A 1XEIA 1VDQA 1QQYA 2G4PA 4ET9A 5FCPA 5KY1A 3TMXA 1KIRC 1D0KA 4XJBA 4N1CC 1WVUA 1FLUA 1OP9B 2MEHA 3QE8A 4ETEA 1QUSA 3QY4A 1BWJA 3J4GA 4HPIA 5LVGA 1LYSA 2GV0A 3A34A 1JHLA 4HJZA 4I8SA 2YBLA 1IEEA 1LZ1A 1HEPA 4OWHA 3RZ4A 3AW6A 2DQFC 1NWGA 1RE2A 5I4YA 1CKGA 1LHLA 2BQBA 154LA 3A95A 4H9CA 1DKKA 5F9UA 1GFGA 1GE2A 3WVYA 5LXWA 2BQCA 1LSMA 5B07A 4AXTA 1LSYA 1XGRC 2DQJY 1JTTL 3AB6A 4H8ZA 1GE1A 3A3QA 3CT5A 5F9XA 1A2YC 1GFUA 3A6CY 1LJEA 5L3IA 3TMWA 3WUAA 4NHTA 2BQIA 4QEQA 1GBXA 3WW5A 5B05A 2G4QA 1LSEA 3B72A 1LMNA 1OUIA 1DI3A 2FBDA 2F4GA 3RNXA 1B7SA 1LZ9A 1BQLY 1TBYA 4HTQA 3WMKA 4GCEA 1QDTA 1GFRA 1WQPA 4WL6A 4GN4A 2FYCA 4H9FA 4ETDA 1XGTC 1RCMA 1JSFA 4NGWA 2DKVA 1HHLA 4MSTA 4B4JA 2D6BA 1GF0A 2DQCY 4NY5A 1F6SA 1SLYA 2FBBA 4LYZA 1IWXA 2XTHA 2MEIA 4H93A 1LSGA 2CWIA 2BQAA 2YSSC 5FDJA 5I4WA 1IVMA 1PS5A 1B7MA 3AZ4A 1LJIA 1LZ5A 1LJGA 1WQOA 1UIGA 1LZNA 1UIDA 3A96A 3EMSA 2F4AA 133LA 5LA5A 3SP3A 1LAAA 1GFJA 1HMKA 5KXRA 1O23A 3F6ZA 4WM6A 4C5FA 1LPIA 1AT6A 3FI7A 3RW8A 1LMTA 4DD9A 4E3UA 1RI8B 3D3DA 2B5ZA 4ANRA 3CT0A 1IC5Y 3LYMA 1CKCA 5KXOA 4Z41A 5HLLA 2XBSA 3GXRA 3AZ5A 1UIHA 1QTKA 1B5YA 4B1AA 5D5CA 4LZTA 1HEWA 1GB2A 4ETBA 1YANA 1ZVYB 2FYDA 3TXJA 1LSFA 4TUNA 1QDRA 3W6DA 4NGOA 1XGPC 5FSTA 1VAUA 2YBIA 4HV1A 3CSQA 4YF2A 3AJNA 4LT1A 1HFZA 4EMNA 1IP1A 5HMJA 3QNGA 4NWEA 4U3XB 1IO5A 4LFPA 4XENA 1LZ8A 3WU8A 1JISA 2W1XA 4QGZA 5JENB 1EQEA 2BQLA 1B7RA 1G7MC 1DPWA 1GF7A 1MLCE 3AZ7A 1LHMA 1LJ3A 1UCOA 5KXTA 1F0WA 1HC0A 1GF8A 1LHIA 4WOAA 1LSNA 4TX7A 2YVBA 3WW6A 4G4CA 2PC2A 1D0LA 1GBYA 4LYCA 1JIYA 1LMCA 1FBIX 4DD7A 5LVJA 5LYZA 4L41A 5KJ9A 5HNLA 3W6EA 1LZYA 3G3BB 1V7TA 2F2NA 1BB3A 4NG8A 5B59A 2NWDX 3BKHA 2DQEY 4H91A 4WM3A 1KIPC 1GFEA 1YIKA 4QDNA 4GN5C 1GFTA 3IJVA 4NHQA 4DD1A 1KXWA 3CSZA 4GCCA 4LT0A 4GCFA 2DBTA 1LHKA 2DQAA 1HEMA 4ETAA 3GXKA 1GB5A 4Z46A 5DN5A 4KL7A 3WXUA 2BQDA 1GDXA 3WULA 1YQVY 1TEWA 1JJ0A 1YKZX 4N0JA 3TXDA 1BHZA 1V7SA 3A94A 134LA 1C45A 1JKCA 1XEKA 1XSFA 4DC4A 2Z2FA 1HSXA 1REYA 4J0LA 3TXIA 3WPJA 5APEA 1YKXX 4ZEEA 1C7PA 4OWCA 1JJ3A 1J1OY 1NHEA 4J1BA 1MELL 1EQ4A 1DKJA 2I6ZA 2F30A 1GB9A 1LMPA 1F10A 1B7NA 1VDPA 2D91A 2BQOA 5DN4A 1OUDA 1LYZA 1LJJA 4NFVA 5LVIA 4XADA 3T36A 1IR8A 1JKDA 4WLYA 3EBAB 4UWNA 1LSPA 1VATA 1JJ1A 3LZ2A 1CNSA 3TMUA 1IOTA 1IWZA 4N1EI 1GXXA 1GB7A 4N8ZA 1AKIA 2I26L 2CJLA 1FKQA 5KKJA 2IHLA 4DT3A 2YDGA 1T3PA 1B5UA 1REZA 5I53A 1B7OA 2DQIY 1C08C 3A3RX 1BGIA 2X0AA 4PRQA 4W94A 5KXKA 3AZ6A 1HFXA 2EKSC 2A7DA 3CB7A 5ILFA 1BB6A 1EQ5A 4LYOA 1I1ZA 4C3WA 1OUBA 4X3BA 2LYMA 4IASA 1JEFA 1GWDA 2ZNWY 4XJDA 1J1PY 1GBWA 2EIZC 3EO5A 2YBHA 4Z3MA 5D5FA 1JKAA 1BVXA 4ETCA 3VWOA 4GCBA 4WG7A 4HPEA 1IX0A 1GE4A 1IP3A 1VDSA 5KXSA 4NGJA 2ZWBA 4O34A 1UICA 1JITA 2DQHY 5B1FA 1LZSA 1GBZA 4I0CA 1GBSA 5KXMA 4NSHA 1GF4A 4WLTA 1GBOA 2I25L 2BQEA 5KXPA 1I56A 3W6BA 3P68A 4NGVA 1UUZC 3TMVA 4GN3A 4WM1A 2HU3A 4GCDA 5I5QA 4KPMA 4XJHA 4BADA 1IOCA 1BB4A 3IJUA 4OW1A 5K7OA 3A8ZA 2IFFY 1NDGC
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1L87A 252LA 5A3ZA 1L80A 1UA6Y 1L69A 5LYMA 1L51A 1REXA 3WH1A 3SN6R 1D0MA 4EPIA 1QSWA 2HEEA 4NSJA 3J6KA 1D3FA 2DQGY 4NSIA 3HTDA 1WTMA 3DMZA 2Z18A 5FELA 178LA 4PHIA 221LA 1B6IA 1GE3A 1L71A 1LSZA 4HP0A 2W1YA 230LA 1DI5A 4OOTA 142LA 1T97A 4B0DA 3ULRA 4WO6A 1CKDA 1CJ7A 1YL1X 1LI3A 2B6WA 1OVJA 171LA 1RJCB 3C8QA 151LA 255LA 1CV0A 3N9AA 4H94A 137LA 1YILA 4WLDA 152LA 4B4EA 1C10A 3AGIA 2ZIKA 4DDAA 5IDDA 3HH6A 4H9BA 143LA 1L26A 1IOSA 1XGQC 1L48A 4WL7A 4NGLA 2HEDA 4NGIA 2ZIJA 1KIQC 132LA 2W1LA 4KXIA 5ILCA 1HEQA 1L56A 5DL9A 3CSRA 1GF5A 3HH4A 1WQRA 1YL0X 2BQFA 3A93A 2B6ZA 3LYOA 1CV3A 1LWGA 139LA 3TXHA 3TXEA 2F47A 4ARMA 5KKIA 3G3VA 248LA 1FLYA 1L14A 4CFPA 4NWHA 1CV5A 1CJ8A 2XQOA 2G4NA 4I7RA 1OWYA 4DYGA 1LTMA 1DYDA 2RAZX 147LA 4NEBA 1L62A 4OWBA 5T3FA 156LA 1NKHA 1C6TA 1B9OA 172LA 4I7SA 2RB2X 2BQGA 4OO9A 1L55A 3TXFA 2EPEA 3LN2A 193LA 1OUJA 1CJ9A 2ZYCA 4ZPUA 1UIEA 1LGXA 1IWUA 1QUHA 2H9JA 3WXTA 4G9SA 1L08A 2HECA 2LCBA 1B5ZA 1DYEA 3A6BY 4H8YA 1L63A 3TXGA 2HTXA 2BQMA 2MEFA 1L25A 2BQHA 144LA 4M4OA 4PRUA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3A90 A;  4XYY A;  5FEK A;  2DQD Y;  4YEM A;  1FKV A;  3EXD A;  2MEE A;  2ZQ3 A;  4BS7 A;  3RT5 X;  1D9U A;  4OWA A;  4LT2 A;  4ZIX A;  5A3Z A;  3M18 B;  1NQI A;  4GLA A;  1ZVH L;  1UA6 Y;  4P2E A;  3WPL A;  1ZMY L;  5LYM A;  1GHL A;  2HEF A;  1GFK A;  4N9R A;  1J1X Y;  1REX A;  4TSB A;  3WH1 A;  5C6L A;  5HNC A;  1D0M A;  1W08 A;  4H9E A;  1QSW A;  1DI4 A;  2HEE A;  4NSJ A;  1YAP A;  3J6K A;  2Z39 A;  1VED A;  2DQG Y;  4FJR A;  6LYT A;  3ATO A;  4NSI A;  3B0I A;  1JTP L;  2Z37 A;  3B0O A;  2Z19 A;  3P66 A;  1GFA A;  4YEO A;  1AM7 A;  1WTM A;  1IP7 A;  3OK0 A;  5L3H A;  1JUG A;  1WVV A;  2LHM A;  2Z18 A;  4NGK A;  4WM4 A;  1OUC A;  1YAO A;  5FEL A;  1XGU C;  4PHI A;  1A4V A;  4NG1 A;  1LZD A;  1OUH A;  1KXY A;  4ZFP A;  3LZT A;  2MEG A;  1IWW A;  1GE3 A;  1LZR A;  4CGE A;  1W6Z A;  1LSZ A;  3K3T A;  4HP0 A;  4R0F A;  5B1G A;  4MR1 A;  6LYZ A;  2MEB A;  2W1Y A;  1WQQ A;  1ALC A;  3WL2 A;  1DI5 A;  2LYZ A;  4II8 A;  4OOT A;  1NF5 A;  4J7V A;  1BWH A;  3AW7 A;  4LYM A;  4B0D A;  3ULR A;  4QY9 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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