The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
13
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sequence length |
58
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structure length |
58
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Chain Sequence |
MARRVRALYDFEAVEDNELTFKHGELITVLDDSDANWWQGENHRGTGLFPSNFVTTDL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Structural insight into modest binding of a non-PXXP ligand to the signal transducing adaptor molecule-2 Src homology 3 domain.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
signal transducing adaptor molecule (SH3 domain and ITAM mot
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| source organism |
Mus musculus
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| molecule tags |
Signaling protein/signaling protein
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| total genus |
13
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| structure length |
58
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| sequence length |
58
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2003-07-24 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2GGR A; 1PHT A; 4OMN A; 1WLP B; 2FRW A; 4RTX A; 2K6D A; 3H41 A; 2RQT A; 1FMK A; 3I5R A; 2J6F A; 2YDL A; 1CSK A; 1GBQ A; 2J6O A; 2KYB A; 3TSW A; 1ZLM A; 2F2X A; 1WDX A; 1NG2 A; 2V1R A; 3VS3 A; 1QWF A; 2D8H A; 3VS1 A; 3UA7 A; 4WCI A; 2W0Z A; 2DLP A; 4ZNX A; 1U3O A; 1X2K A; 1H8K A; 2KRO A; 3UF4 A; 4ESR A; 1K0S A; 2GTJ A; 2LNH B; 4JJD A; 1GCP A; 2I0N A; 1MUZ A; 2KGT A; 2LP5 A; 3REA B; 3O5Z A; 2DL7 A; 4JZ4 A; 1AD5 A; 4E6R A; 2GNC A; 1NM7 A; 1NYF A; 1NLP C; 2M51 A; 4AFU C; 3C0C A; 1AWO A; 2DNU A; 2K7A A; 4GBQ A; 1QWE A; 1UUE A; 1VYU A; 1ZSG A; 2CRE A; 2CUB A; 2IIM A; 4AG1 C; 2W10 A; 1SRL A; 2KR3 A; 4JJC A; 1TUC A; 4J9I A; 3M0U A; 4Z89 A; 3FJ5 A; 2EPD A; 2KNB B; 1UEC A; 1M8M A; 2DRK A; 4OMO A; 4J9D A; 2K79 A; 2RPN A; 3NPF A; 1QLY A; 2C0I A; 2EGE A; 1QKW A; 2KEA A; 1S1N A; 1PNJ A; 4HVW A; 4CC4 B; 1MV3 A; 5IHI A; 2C0T A; 2O9V A; 1UG1 A; 2P4R A; 1YWP A; 2QDL A; 1OV3 A; 2ROT A; 3NMZ C; 1KSW A; 2EW3 A; 5EC7 A; 4CC3 A; 2BZY A; 4CC2 A; 2L3P A; 1BB9 A; 1I1J A; 1X2Q A; 1UFF A; 2EYW A; 2RQU A; 1XOV A; 2DYB A; 2O2O A; 2ECZ A; 4JJB A; 2HBW A; 4FSS A; 2CUD A; 2X3W D; 2JT4 A; 2O31 A; 2V1Q A; 3H0H A; 3M0Q A; 3U23 A; 2EGC A; 4LUD A; 2G6F X; 3VS7 A; 1JXO A; 1ZBJ A; 2EYX A; 2EBP A; 4LE9 A; 2L0A A; 2XMF A; 1H92 A; 3I5S A; 2D8J A; 5IXF A; 1M3A A; 1W6X A; 1GFD A; 2BZ8 A; 2YUN A; 3VS2 A; 5I22 A; 3ULR B; 4EIK A; 2GTO A; 2MOX A; 2HDA A; 5IH2 A; 3QWY A; 2KT8 A; 4CC7 A; 2KT1 A; 2JM9 A; 2GQI A; 1WXB A; 1JO8 A; 3THK A; 1SPK A; 3EGU A; 2O88 A; 5GJV B; 3KFV A; 2RQR A; 2CDT A; 4J9E A; 2DJQ A; 1MV0 B; 1SSH A; 1NLO C; 2FRY A; 1SHG A; 2DBK A; 4RTT A; 1H3H A; 1AOJ A; 1A0N B; 2NUZ A; 3UA6 A; 4D8K A; 1AWJ A; 2HCK A; 4RTV A; 2KRN A; 1SEM A; 1HJD A; 1E6G A; 1JXM A; 3VRY A; 2K9G A; 1GBR A; 3IQL A; 1Z9Z A; 1AZG B; 1CKB A; 1PWT A; 2L2P A; 3H0F A; 1V1C A; 2KYM A; 5IHN A; 1IO6 A; 2KRS A; 1FYN A; 3VS5 A; 5IHK A; 1WYX A; 1QCF A; 2LJ3 A; 1UTI A; 4RTY A; 1T0H A; 1KIK A; 4J9F A; 3I35 A; 3H0I A; 1X43 A; 2CH4 W; 5FWB A; 3M0R A; 2A36 A; 2CH4 A; 2L3S A; 2PTK A; 2A08 A; 2BZX A; 1K76 A; 2J06 A; 1X69 A; 2AKK A; 2FO0 A; 1WI7 A; 3VS4 A; 1ZUK A; 3M0P A; 1UHC A; 2AZS A; 2EVR A; 1J3T A; 2L3Q A; 2JS0 A; 4J9G A; 1PRL C; 2DVJ A; 2VWF A; 1K4U S; 4J9H A; 2ENM A; 2DMO A; 2JW4 A; 2A28 A; 4RTZ A; 2C0O A; 2DE0 X; 4KRT A; 2ABL A; 1YP5 A; 4F17 A; 3RBB B; 2EQI A; 3R6N A; 2KE9 A; 1ZX6 A; 1Y57 A; 1CKA A; 4M4Z A; 1G2B A; 1N5Z A; 2FPD A; 1B07 A; 1I0C A; 2RNA A; 1UHF A; 2YUO A; 2LQN A; 2J7I A; 2DA9 A; 2SRC A; 3UAT A; 2E5K A; 1VA7 A; 1M3B A; 1ABQ A; 2SEM A; 4J9B A; 4HXJ A; 2RF0 A; 4JZ3 A; 2CT3 A; 2K2M A; 1UGV A; 1M30 A; 1WXU A; 3VS0 A; 1ZUY A; 2LX7 A; 1AWX A; 1TUD A; 2YUQ A; 2DX1 A; 2OAW A; 3NHN A; 2FEI A; 1K1Z A; 2YT6 A; 2ED1 A; 1YWO A; 2DRM A; 1TG0 A; 3EG3 A; 1NYG A; 1AEY A; 2DL3 A; 4DEY A; 2FPE A; 1LCK A; 1M3C A; 2LMJ A; 4IIM A; 2LQW A; 1UJ0 A; 3GBQ A; 4LNP A; 2JMC A; 1BBZ A; 2D0N A; 3M0S A; 1KJW A; 2JTE A; 2LZ6 B; 2X3X D; 3EHR A; 4K11 A; 3LH5 A; 2AK5 A; 2NWM A; 3A98 A; 3EG1 A; 3I9Q A; 1T3L A; 2OI3 A; 1K0X A; 2DL4 A; 3EG0 A; 2GBQ A; 1RLQ C; 4OMM A; 4OMP A; 2O9S A; 2JS2 A; 2HEQ A; 1OEB A; 4OMQ A; 2KBT A; 1E6H A; 5L23 A; 1W1F A; 4HVV A; 5I11 A; 1NEB A; 1JQQ A; 2VVK A; 2KXD A; 2CSQ A; 1M27 C; 2B86 A; 2ROL A; 4HVU A; 4X1V A; 1Y0M A; 1UE9 A; 1OPK A; 4Z8A A; 4F14 A; 3RNJ A; 1T3S A; 3SHW A; 2LJ1 A; 1AWW A; 2FPF A; 4HCK A; 5GJW B; 4ORZ A; 2BTT A; 2DF6 A; 1RUW A; 4DEX A; 4F16 A; 1YCS B; 2PNI A; 1B3Q A; 1OOT A; 2DL5 A; 1PRM C; 1WXT A; 2A37 A; 1QKX A; 4AG2 C; 1RI9 A; 3NGP A; 1SHF A; 2MIO A; 4QT7 A; 2DM1 A; 4A63 B; 2DIL A; 2YSQ A; 2CSI A; 2J05 A; 2DL8 A; 1G83 A; 1WX6 A; 4GLM A; 3ZL7 C; 1GL5 A; 1GCQ A; 1UDL A; 1Z9Q A; 1BK2 A; 5HCK A; 5FWC A; 2F2V A; 1HSQ A; 3M0T A; 2DBM A; 4R0K A; 1UJY A; 5IXB A; 2M0Y A; 2MCN A; 2JMA A; 2ESW A; 4RTU A; 1AVZ C; 1WFW A; 1YN8 A; 1X27 A; 1K9A A; 1PKS A; 4J9C A; 3PVQ A; 1WA7 A; 1RLP C; 1EFN A; 1OPL A; 4LN2 A; 2EYY A; 1T0J A; 2KXC A; 2EGA A; 2LJ0 A; 1KFZ A; 2YUP A; 1HD3 A; 2RQV A; 1I07 A; 1YNZ A; 3VS6 A; 2K3B A; 2AZV A; 1PKT A; 2CT4 A; 2HSP A; 2VKN A; 4Y92 A; 3EG2 A; 2FG0 A; 1AZE A; 4RTW A; 1GCQ C; 1ABO A; 2OJ2 A; 2KRM A; 2RMO A; 1VYT A; 4JPB W; 4AFZ C; 2PZ1 A; 2J6K A; 2JXB A; 1BU1 A; 3VRZ A; 3CQT A; 2JM8 A; 3EHQ A; 3REB B; 4RUG A; 1ARK A; 2AKL A; 4AFS C; 1W70 A; 3TSZ A; 3PVL A; 4Z88 A; 5ECA A; 1NEG A; 1X6G A; 4LUE A; 2H8H A; 3JV3 A; 1GRI A; 2D1X A; 2EYZ A; 4AFQ C; 2F2W A; 4OML A; 1E7O A; 1SRM A; 1U06 A; 3TVT A; 3QWX X; 2LCS A; 2RN8 A; 2ED0 A; 4D8D A; 5FW9 A; 1X6B A; 3SEM A; 1WIE A; 1JEG A; 1U5S A; 1VYV A; 1GFC A; 3PE0 A; 1ZUU A; 4IIO A; 2EKH A; 2RQW A; 1JU5 C; #chains in the Genus database with same CATH topology 2QG9 B; 1PHT A; 1NZ9 A; 1Q7Y R; 2K6D A; 1FMK A; 2VC8 A; 4C5G A; 1VQN A; 1RAD B; 2YDL A; 3E9F A; 1CSK A; 2J6O A; 2KYB A; 1ZLM A; 2F2X A; 2RB6 A; 3CCL T; 1WDX A; 2MMP A; 3CC2 A; 1NG2 A; 3A8O B; 2OAU A; 3KUF A; 3S6W A; 2DAQ A; 1K73 R; 3VS3 A; 3UA7 A; 4PJJ A; 4PJO E; 4EMK B; 2W0Z A; 4EPC A; 1U3O A; 5FLX E; 1YBY A; 3EFR A; 1X2K A; 1H8K A; 2E64 A; 4ESR A; 2GTJ A; 2KMT A; 3CCS T; 2I0N A; 4AMC A; 4M7A C; 2RI3 A; 3TCJ A; 1UGQ B; 3O5Z A; 3BW1 A; 4JZ4 A; 3FIF A; 5M9O A; 4M77 E; 1QP3 A; 4QQ6 A; 3RES A; 4AFU C; 1AWO A; 3PMT A; 2DNU A; 4DA4 A; 4QW2 A; 2CRE A; 4AG1 C; 3OSS C; 2W10 A; 1KD1 U; 4LD6 A; 5A0G A; 2RJF A; 2K5I A; 4M75 G; 3TRE A; 3QSU A; 1OQK A; 1X75 C; 4OP0 A; 2EGE A; 5FU7 C; 2C0T A; 3CME A; 3OYB A; 3LWH A; 3CD6 A; 2ZZD A; 1YWP A; 2QDL A; 2ROT A; 2XDP A; 3NMZ C; 3X28 B; 1KK7 A; 2WSC E; 2H3J A; 2OTL T; 1QP2 A; 1UFF A; 2EYW A; 2QGF B; 2O2O A; 4JJB A; 3TU4 K; 2KK4 A; 3PIP A; 3GNF B; 3SFM A; 3PIO A; 5GAN h; 4FSS A; 5IT9 E; 5GMK h; 3H0H A; 4LUD A; 3MP8 A; 9ATC B; 2EBP A; 2QQB A; 4LE9 A; 3CCS A; 2D8J A; 5GAN j; 4HCC A; 5IXF A; 1W6X A; 1OUL A; 3EFS A; 4M7A D; 2EKO A; 2DTH A; 2JOY A; 1TUG B; 3JAM E; 5KYU B; 1WXB A; 1VQ5 T; 2RHI A; 4F7U A; 1SPK A; 1K8A U; 3QUI A; 2RQR A; 2LQK A; 4OB1 B; 1MV0 B; 2CP0 A; 2FRY A; 2DD4 A; 1HK9 A; 1SHG A; 3F70 A; 4OMF B; 4KGV B; 4ZGE B; 4RTT A; 1Q81 U; 1M1K C; 3M53 A; 1H3H A; 1AOJ A; 4M77 F; 2NUZ A; 1A0N B; 4IUV A; 1AWJ A; 4D8K A; 3JB9 D; 1YIT T; 2K9G A; 3CPF A; 4GY5 A; 1Z9Z A; 1BIB A; 1B7T A; 2YLB A; 2OTL A; 3H0F A; 1QVG P; 4DQ2 A; 2FYK A; 2RJC A; 4M75 E; 1W2B A; 1IO6 A; 4KGX B; 4FCY A; 1QVG S; 1YJN T; 4M77 B; 2E70 A; 3P8D A; 5IHK A; 4QVZ A; 3ZFJ A; 1QCF A; 4RKU E; 5HKC A; 4RTY A; 1T0H A; 2XID A; 4C8Q G; 2YRV A; 5CKE A; 5LJ3 h; 1VQ8 Q; 2CH4 W; 1D3B B; 3V7S A; 3Q1J A; 2A36 A; 4CRI A; 5D7U A; 3QJY A; 1Y96 B; 1X69 A; 3EG9 A; 1YCY A; 2XK0 A; 2AZS A; 2AT1 B; 4LDX A; 2DVJ A; 2VWF A; 2VUB A; 1VQ5 A; 1S72 Q; 2CP6 A; 1M4Z A; 1X6O A; 2JW4 A; 3MO8 A; 2DE0 X; 2ABL A; 3RBB B; 2EQI A; 4ZN3 A; 2ZGW A; 1G8X A; 3FDR A; 1Y57 A; 2EJ9 A; 4PFO A; 4M4Z A; 2RM4 A; 3BY7 A; 1G2B A; 1N5Z A; 2FPD A; 5GAO r; 1JJ2 S; 3OYG A; 1UHF A; 2E4H A; 1ZSZ A; 5KCH A; 1NBE B; 3I55 Q; 3QG1 A; 1KC8 R; 2P0P A; 3OY9 A; 4JRI A; 5D6Y A; 1M90 C; 2XU8 A; 3NTI A; 1PD1 A; 2RF0 A; 4C92 E; 2K2M A; 4B9W A; 1M30 A; 1K73 U; 4KH0 B; 4M78 E; 1WHG A; 2RI5 A; 1TUD A; 2YUQ A; 2DX1 A; 1Y7X A; 2FEI A; 3EG3 A; 3L42 A; 1OX8 A; 3BE3 A; 3CCJ Q; 1LCK A; 2DXB A; 1N8R C; 1BI3 A; 3OYJ A; 2BE9 B; 2F69 A; 4LNP A; 4M7D F; 1AHJ B; 4XTW A; 5DY9 A; 3CCM A; 1VQ6 A; 3M0S A; 2JTE A; 3FB9 A; 2LZ6 B; 1VQM T; 2K4Y A; 4B6M A; 1BI2 A; 3JCM h; 2AK5 A; 3JCM V; 1T3L A; 2GBQ A; 2QA4 Q; 2PVO B; 3EGD A; 2DEU A; 4DBH A; 3SWN B; 3QHS A; 1KQS P; 1XNI A; 2K3Y A; 3T9N A; 3WVD B; 2E6Z A; 3EFO A; 4M75 B; 1VQL Q; 3OW2 P; 8ATC B; 3KBG A; 4HVU A; 3OW2 S; 4X1V A; 1Y0M A; 4A4F A; 3R6O A; 3PTA A; 4BE0 A; 2HBP A; 4F14 A; 5KCO A; 1WHL A; 2LJ1 A; 2FPF A; 4HCK A; 4CI0 C; 2DF6 A; 1NPP A; 2DET A; 4D6W A; 3OYI A; 1N9S A; 1VQO Q; 4F16 A; 3P8H A; 1B3Q A; 2CP2 A; 2A37 A; 1RI9 A; 4JRK A; 4C0D B; 2DM1 A; 3EH2 A; 2P0Q A; 2YRD A; 2YSQ A; 4OB2 B; 1YJ9 T; 4EMK A; 5CKB A; 1GL5 A; 3HFO A; 5LL6 S; 1Z9Q A; 1RI0 A; 5LJ5 j; 5C0M A; 3A8G B; 2COZ A; 1NJI R; 2DJZ A; 2DBM A; 4EMH A; 4BUG A; 2RA2 A; 4DOV A; 3V8K A; 4BB7 A; 3HTR A; 5A0L A; 4KBM B; 1X27 A; 1K9A A; 3PVQ A; 5GAM h; 2JUF A; 2CP5 A; 2MF2 A; 2VXF A; 1EFN A; 1K9M U; 3CEY A; 1WNL A; 1SG5 A; 1TS9 A; 4BY6 B; 3QPH A; 3DKM A; 3V7C A; 2YUP A; 5GMK i; 4A4G A; 3URG A; 5GAM j; 2K3B A; 2FB7 A; 2AZV A; 4XTV A; 1ZBX A; 3EG2 A; 2M16 A; 4XU1 A; 2BKD N; 2E6N A; 3X25 B; 4C8Q F; 3M4G A; 2KRM A; 1YI2 T; 4Y91 A; 3UT1 A; 2RMO A; 4XTU A; 4AFZ C; 3PT9 A; 1TOV A; 1BU1 A; 3CQT A; 4JDS A; 3REB B; 4RUG A; 1ARK A; 3TSZ A; 4ANJ A; 1KD1 R; 1NEG A; 2EQJ A; 3A8H B; 2DK3 A; 3G6E A; 3CPW A; 1YJ9 A; 1YIJ Q; 4C8Q B; 2CKK A; 3S3O A; 2F2W A; 4OML A; 1U06 A; 2LCS A; 2OX7 A; 4ZGD B; 5FW9 A; 1X6B A; 2EQU A; 3I56 T; 1VYV A; 1GFC A; 3PE0 A; 1ZUU A; 1Y71 A; 2LDM A; 1YIT Q; 3SB2 A; 2RQW A; 2JTF A; 4OMN A; 5KYU A; 1WLP B; 2FRW A; 4IUQ A; 3OYF A; 2MWO A; 1VQP Q; 2J6F A; 5FRN A; 1GBQ A; 5LJ5 f; 3UWN A; 1D0Y A; 3D7S B; 5A0D A; 2YHT A; 3VS1 A; 1RAE B; 1PCX A; 2NLU A; 1UEB A; 4OGC A; 3VYG A; 2DLP A; 2XHC A; 3MEW A; 5J3B A; 1YI2 A; 2A7Y A; 5KYY B; 3UF4 A; 2KRO A; 3ZEH A; 3TQ7 P; 2COY A; 1GCP A; 1VIF A; 5HK0 A; 4AT1 B; 2DL7 A; 1OYX A; 2V8K A; 1K8A R; 5GAN 2; 1NYF A; 1VQ7 Q; 1NLP C; 2M51 A; 2DTI A; 3C0C A; 1AT1 B; 1FX7 A; 5EG2 A; 4BI3 A; 3J7A F; 2L3R A; 3QYG B; 2FHD A; 1UUE A; 2FVU A; 3BFM A; 1ZSG A; 3MET A; 2QDY B; 1SRL A; 3NFC A; 2QEX A; 1Q81 R; 3JCM W; 1WJQ A; 4PJO G; 4FYW B; 3CCQ Q; 1D09 B; 1RAB B; 3FJ5 A; 1H64 1; 2EPD A; 2BIV A; 3PNW C; 4LDV A; 3PFS A; 4J9D A; 1VQN T; 4HCB A; 2HL5 C; 1Y96 A; 4X9D A; 2X4W A; 3G1J A; 1M5Q 1; 3CC2 T; 4HVW A; 3CCU T; 1MV3 A; 2P0K A; 5IHI A; 1UG1 A; 3INZ A; 3EGX B; 4IKF A; 1TWB A; 2EW3 A; 2MYS A; 1I1J A; 1I5O B; 2RQU A; 3L2W A; 5CKD A; 2P84 A; 1RAI B; 2HBW A; 3CCV A; 3PGG A; 2NUT B; 3CBM A; 4PFP A; 4XTX A; 3GIB A; 3M0Q A; 2PUO B; 3WXM B; 3ZBD A; 1JXO A; 2KY9 A; 3QBY A; 4E47 A; 3I5S A; 1M90 U; 4EMG A; 3E19 A; 3VS2 A; 2EYQ A; 3N5B B; 2HDA A; 5IH2 A; 2G3R A; 2MPX C; 2KT8 A; 8AT1 B; 2D6F A; 2X35 A; 4XAX B; 3BDU A; 3EGU A; 3JCM d; 3OB9 A; 4C0F A; 4FIB A; 4J9E A; 3CME T; 1VQ4 Q; 3JCM e; 2CZ0 B; 4WF2 A; 3CD6 T; 1KQ2 A; 1IB8 A; 5KH6 A; 1UGS B; 1BYM A; 2JJ9 A; 4XTY A; 4XU3 A; 3UA6 A; 4TVR A; 3VUZ A; 2Y4Y A; 4QQD A; 3G4S Q; 2VYT A; 3CCU A; 1E6G A; 4PFZ A; 3VRY A; 1HJD A; 2R5A A; 4FSX A; 3QO3 A; 1Q86 U; 2VGN A; 2GCX A; 3M59 A; 4OGE A; 1KHI A; 2O4X A; 4JRQ A; 2L2P A; 1C1A A; 4KGZ B; 5I2S A; 1HXD A; 2EQM A; 4M7D A; 2B8A A; 2KRS A; 3VS5 A; 2QYZ A; 4PNO A; 3JCM b; 1PSF A; 2K5F A; 3JB9 H; 2E10 A; 1UTI A; 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