1URDA

X-ray structures of the maltose-maltodextrin binding protein of the thermoacidophilic bacterium alicyclobacillus acidocaldarius provide insight into acid stability of proteins
Total Genus 119
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
119
sequence length
370
structure length
370
Chain Sequence
QTITVWSWQTGPELQDVKQIAAQWAKAHGDKVIVVDQSSNPKGFQFYATAARTGKGPDVVFGMPHDNNGVFAEEGLMAPVPSGVLNTGLYAPNTIDAIKVNGTMYSVPVSVQVAAIYYNKKLVPQPPQTWAEFVKDANAHGFMYDQANLYFDYAIIGGYGGYVFKDNNGTLDPNNIGLDTPGAVQAYTLMRDMVSKYHWMTPSTNGSIAKAEFLAGKIGMYVSGPWDTADIEKAKIDFGVTPWPTLPNGKHATPFLGVITAFVNKESKTQAADWSLVQALTSAQAQQMYFRDSQQIPALLSVQRSSAVQSSPTFKAFVEQLRYAVPMPNIPQMQAVWQAMSILQNIIAGKVSPEQGAKDFVQNIQKGIMA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title X-Ray Structures of the Maltose-Maltodextrin-Binding Protein of the Thermoacidophilic Bacterium Alicyclobacillus Acidocaldarius Provide Insight Into Acid Stability of Proteins.
pubmed doi rcsb
molecule tags Maltose-binding protein
molecule keywords MALTOSE-BINDING PROTEIN
total genus 119
structure length 370
sequence length 370
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2003-10-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1urdA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1urdA01
5CMKA 1N3XA 3KSJA 5ICQA 4Q5TA 4F3GA 4NWDA 3K0VA 4EQBA 4MH5A 3JZJA 1EZ9A 1PC3A 4G68B 4F22A 2QPQA 2O7IA 3T9UA 5I84A 1NNPA 1R9LA 4EQ9A 4NF4A 1MY0A 2OBGA 4NF6B 4GRKA 1USYE 5FHMA 2VGQA 4GOTA 2HXWA 4OERA 3PD8A 2HAVA 4XKPA 3KZGA 3TQWA 4E0WA 1LBBA 2XXHA 1YTVA 3K6WA 1EZOA 2AL4A 3O6HA 2IEEA 1WVJA 3N26A 3QYTA 3GXAA 1PBQA 2XD3A 1Y3NA 4XKRA 3S9LC 1VE4A 1B7HA 1JW1A 4GWOA 3E13X 4OFOA 3KN3A 1A8EA 2A5TA 3ODBA 4JWXA 4F19A 5H8FA 1ANFA 1SBPA 1ATGA 2DOJA 1QULA 3H6VA 3H3GA 4I1DA 5TU0A 3W9WA 1ZLQA 3S9MC 1B9JA 2YLNA 4AQ4A 5AA1A 4ECFA 1WODA 3E4RA 4ZE8A 4GLIA 4DCXA 4DCYA 3SEWA 5CBSA 5AE4A 1UTHA 2VD2A 4Q30B 4KCCA 3RQTA 4K3FA 1B5JA 2DXYA 3JV9A 3TYHA 1DPPA 3T9HB 1MPCA 3OENA 1IXIA 1VR5A 1PB8A 2HZKA 1UIVA 2DXRA 3CG1A 3M3KA 2F36A 2H9BA 2QJEA 3MVXA 4JDFA 4YICA 1MY3A 3FV2A 2Q2CA 1IQ7A 5CI5A 3CFLA 4RK9A 3U72A 4WKMA 1I6QA 3HO7A 3MPKA 1EZPA 3K1MA 1DSNA 4NTLA 1N04A 3E9XA 1M5EA 3EHUA 4OENA 1LLSA 2ONKE 3LSWA 2B65A 1N7WA 2LAOA 3MVYA 3OMBA 5HBCA 2HEUA 2XXUA 4QSEA 3KJTA 4YMAA 5AA2B 1B32A 4KHZE 4R74A 1RKMA 2ZNTA 1FQFA 4U4SA 5H8QB 4C1UA 4ZS9A 2VP1A 2W7YA 1QVSA 2Q89A 2Y7KA 3O66A 3PD9A 1B46A 4LUBA 4YKKA 3ZKKA 1LFHA 4PQJA 2UYEA 2QS1A 2PVUA 2QRYA 2NWJA 4HCWA 2XXIA 4QFPA 2DS9A 3N6UA 4R9GA 5H8HB 4TOZA 1US4A 2QS2A 4RYAA 5BUUA 3MZ9A 3IL1B 1MM7A 3HHGA 1A54A 5KCJB 2UVGA 1I69A 3Q26A 4KYDA 4YZZA 2O68A 2OWTA 3G3FA 3IO4A 4ESWA 4KYEA 3U94A 4L17A 5TPAA 2ONRA 1OQHA 3OEMA 4OWDA 3QUJA 1XHYA 1IUDA 3AXFA 3DP6A 4MLQA 4NF5B 4TLMB 1IXGA 1NNTA 4G2ZA 3UGWA 3OO7A 4PFTA 4NEDA 4LONB 1IZ1A 1SVXB 3CSBA 3Q29A 4H8IA 4P0GA 3H6UA 1NFTA 2PT2A 1MY1A 1OMPA 1NL5A 2KLFA 2DSFA 1QUIA 4NWCA 3IJXB 4G4PA 1B4HA 3MJNA 3PPQA 4OEUA 3MQ9A 3EQ1A 5FTIA 3G3IA 4LQ2A 1BIYA 1MM6A 4Z0IA 4ZEBA 1FTLA 3M3FA 4GVOA 4R2FA 3UP9A 3MC2A 1B3LA 1H44A 2R9JA 2F35A 1Y1ZA 3OXNA 4LATA 3KOTA 5AA3A 3PUXE 4G77A 3PUWE 4OYVA 4H8JA 3K1NA 4XTCQ 5DVJA 4YKIA 4RNSA 4ZEIA 2Z8EA 3EN3A 3PPNA 2V3QA 5H8QA 1MH4A 4X48A 2AL5A 3T66A 3U93A 4F3SA 2GFEA 2I0BA 3KN7A 3RT6B 1TWYA 2F34A 1VFEA 1N84A 3FZVA 4U1ZA 5CRYA 1N7XA 4FJPA 3MVWA 3CSGA 3KJ7A 3BKIB 3L6HA 4RJZA 3PUVE 1MDQA 4H67A 4KQPA 5JTYB 2XXYA 4F18A 3C35A 2HFBA 2RCAA 2V3UA 3OSQA 2Q9TA 1VFDA 3N6TA 3PPRA 2O51A 4IO2A 4R6YA 1P1WA 4FE8A 4PETA 4QFKA 5L8DA 4QSDA 2XXTA 2QS3A 3PU5A 2BJJX 1HSEA 3BFTA 5H8SA 5KZTA 1Y4TA 4G68A 3F11A 4YMBA 4OMBA 4LP2B 3CFZA 1TT1A 1Z7ME 2F8DA 2F5XA 1BLFA 2I0CA 3SERA 3TTLA 5I57A 1I6AA 3QAXA 4ND9A 3IO6A 1B4ZA 2V3TA 2Z8DA 3CRBA 1B51A 4R72A 3HCQA 4POXA 4NF5A 3GLBA 3USDA 1B0HA 3PGFA 3PMWA 1IITA 1B2HA 1N3WA 2F7CA 3O2AA 3Q27A 1MY2A 3LSXA 2HAUA 1O7TA 2QS4A 2QMXA 2ALUA 4QF9A 1SI0A 3H6TA 1JVYA 3PMVA 1MXXA 4OESA 1O64A 5TP9B 4RPNA 1Y4CA 4I9DA 1OVBA 1NH7A 2QSXA 3LUYA 5H8NA 3WAFA 1KWHA 1PBPA 1I6BA 4F1VA 1MPDA 4Q8RA 1B1HA 1B5HA 3IB0A 3QXMA 3C33A 4JB7A 1US5A 4OFJA 3R7XA 4IY5A 1M5FA 5DVFA 5ISUA 2I48A 3ZS6A 3TTMA 3UA8A 3KEIA 3TMGA 5JK4A 5L9SA 1S7YA 1UTBA 1FTOA 3B6TA 3OO6A 4MFIA 3TTRA 3U8QA 3K6UA 3VE1B 3IOWA 2A5SA 1AMFA 3IB1A 3R6UA 4FORA 5KDTA 2CMOA 1SDXA 4DLDA 1B52A 3R26A 4IO3A 3U92A 4UA8A 3SEVA 3G3JA 2DWJA 1HSJA 3C9HA 4YAHX 1B1XA 3T93B 1A55A 5FHNA 5CMMA 1S9TA 1MQDA 4PP0A 3VDFA 4F3BA 5CC2A 5KDTB 4JWOA 1USYH 3KSXA 3RTWB 1B7ZA 3FXUA 5F1QA 1EH3A 3MZ1A 4HTGA 5I2KA 1N0TA 3P7IA 3HN0A 5DTBA 1LCTA 1MQIA 3QUFA 1J1NA 3VVEA 2ZNSA 4F1UA 2Y7RA 4U2RA 3IAZA 4ESXA 3SEUA 3W9VA 3GBAA 4R6HA 2HZLA 5EYFA 3O6IA 2THIA 3CFXA 5H8NB 2G93A 3TFLA 2PMSA 1JQFA 3TQLA 1Y20A 3CG3A 1Q35A 4OHNA 1PB7A 2X26A 4FAJA 3B6QA 4X9TA 1FTMA 3IR1A 2Y7WA 4BLAA 3FJ7A 3H7MA 4YB5A 3MP6A 5H8FB 3RNNA 2F7BA 1DOTA 2D21A 4F29A 5J1DA 1XVXA 3HV1A 1PDAA 2Q2AA 4M4GA 4ONYA 3RGYA 3H6WA 4OEVA 4DXCA 2F6PA 3O9PA 1MDP1 2IA4A 4P11A 5ELVA 3SESA 3S9EA 3TEPA 4DE8A 3C34A 3Q25A 1A7LA 2R71A 1D9YA 4O3AA 1LGBC 1MXZA 2ONSA 4O3BA 4RPOA 2Q8JA 2FYIA 2E1SA 2VOZA 3EF7A 1QKBA 4AB5A 1UTBB 1LCFA 4YU0A 4JBZA 4RA1A 1MRPA 3ZKLA 4F39A 5TP9A 4BDOA 2FA7A 4DDDA 5ICTA 1BP5A 3RUMA 1XVYA 2HQ0A 3PUZE 3THIA 4THIA 1PEBA 4C0RA 2REGA 3ONMA 3IB2A 1ZJLA 3FUZA 4I62A 1GVCA 5JEIA 1A99A 2GH9A 5BWJA 3DELB 2PBWA 1MY4A 1LAFE 3FVOA 3RLFE 4GXSB 5AA2A 2D5WA 3T9XB 4M1VA 3O28A 2DE2A 1MXWA 2AYSA 1MQGA 1LAGE 1URDA 3E3KA 5I2KB 3EHSA 1SQYA 3MPLA 3MUQA 4IO7A 2NOOA 3TCHA 1MXVA 2O7UA 1QJMA 2XHDA 4EXKA 1SW2A 1GR2A 4DXUA 1DTGA 1P99A 2DVZA 4F3PA 2ZYKA 1Y9UA 2ESNA 3FV1A 3FXRA 3G3GA 5L9OA 1O63A 1OIBA 4ZDMA 2NVUB 1GTKA 3RY3A 4HW8A 1D3KA 2Y7PA 3FXQA 2RC7A 1R9QA 4Q0CA 4KI0E 4OZ9A 4F2OA 5JTYA 4H5GA 5TPAB 5I59B 1D9VA 1DMBA 3OO8A 2DE4A 2XXRA 2OLBA 4FEBA 3TTNA 3FJGA 3IOTA 4ZEFA 2UVJA 5ITOA 3D4GA 2P0SA 3GZGA 4I8CA 3TTKA 3UORA 2DVCA 1FTJA 4LVQA 3TUSA 4U23A 1M5BA 2I58A 4GFRA 4JXIA 1LB9A 4O3CA 3TCGA 3V5AA 2B3BA 1OLCA 3BFUA 3MAMA 4PE5B 3LBSA 3KGCA 3DLNA 4FEDA 1ZIUA 1JEUA 1MXUA 4U22A 1XOCA 3L6GA 4FIMA 4H1XA 3MVZA 2I3VA 4G68C 2UYFA 5K2YA 3S2VA 3TPAA 3VXCA 4PFYA 1IIWA 4U1OA 2O6AA 1NNKA 3G3HA 3V89B 4FATA 1JEVA 5K2XA 2ANJA 3V8XB 5DT6A 1B0LA 1MG1A 3CI8A 4EF2A 4N13A 2UVHA 4OETA 1SYIA 2DE3A 1WDNA 1H3DA 4H65A 3RT8A 2XXVA 1Y3PA 4IY6A 1XS5A 4QFNA 1BTJA 2DP8A 4Z7EA 4EUOA 2P1SA 5I56A 5F7VA 1ZU0A 3PMXA 4RXLA 1B3EA 3MBPA 4JWYA 4LA9A 5AA4A 3M3LA 4DIGA 4R73A 2XX7A 3W15C 2Y7IA 4YB7A 4ELQA 5I56B 2OWSA 4GD5A 1ZTYA 4U21A 4EDPA 1AL3A 2O84X 5AA4B 2Z22A 3H4ZA 1QW0A 4X1BA 4R2BA 3QSLA 2XX8A 4NE4A 1UIUA 4ISUA 3IORA 3SDFA 3TKDA 1OLAA 1MH3A 4XXUA 3VFJA 2DWHA 4NF4B 4NF6A 4E0XA 3VVFA 2V25A 3U1OA 5I57B 4XIGQ 2Q88A 1IXHA 1YAEA 5EHMA 2AIXA 1FQDA 3MWBA 1RYXA 2P2AA 2ZYOA 3EHTA 4ZECA 3B6WA 3FVGA 1Z7NE 4GIZA 1FQCA 4ELOA 3O29A 4GL8A 3KFMA 2XXPA 4F2QA 3ILTB 1ELJA 1RYOA 1IXCA 2I4BA 5I58A 3G7WA 4H0WA 1MS7A 4KYSA 2DQVA 2M8CA 2DWAA 4N6PA 4NMYA 2A5TB 1P1QA 1LAXA 2O1LA 2RKMA 3GBBA 3RTFB 2VD3A 2RC9A 1B3GA 2ZXTA 3K00A 2X7PA 3ECRA 4GXAA 1XT8A 1DPEA 1PB9A 4H5FA 5DVIA 5B70A 4N07A 1LFIA 4MBPA 4GL0A 1NMUA 3T96B 4MLVA 5CMBA 1UTHB 3VV5A 4AB6A 1AIVA 3HPIA 2ZYNA 3OO9A 3CR9A 3VLWA 5IAIA 2VHAA 3S4UA 3A3UA 2UVIA 3FVKA 3G3KA 4IB2A 3SKPA 3OEKA 4DZ1A 4DXBA 1Y3QA 4POWA 4F31B 2CZLA 3FATA 2H25A 2QMWA 4IGRA 4OXVA 4R6KA 3SEYA 2HCAA 4QHQA 4RK2A 3K1PA 3N94A 4G8HA 4QSCA 4FECA 3T22A 2ABHA 2PYYA 4ZEKA 1EU8A 3DM0A 2YPNA 1P1OA 3LSLA 3PPOA 4X1DA 4YKJA 4ZZAA 1B58A 4G8NA 4OQOA 2RCBA 3SEXA 1QUKA 2Y84A 2F7AA 1ZKBA 3B7DA 1SW5A 4GF8A 2XXXA 2D3IA 1SW4A 3HHFA 3C31A 3K6XA 4KCDA 1L5TA 3WAEA 4EF1A 2XXQA 2OZZA 3PPPA 2QL3A 4ZZEA 3RN8A 1JW4A 4EQ7A 1YPNA 3OSRA 4LZ8A 2H5YA 2I49A 4BDNA 3UN6A 2ZNUA 2V93A 3OOAA 4P0IA 2H98A 1LSTA 1T0KA 3D4CA 1YCJA 4QFLA 4OVJA 1TFAA 4PFUA 4R9FA 4XKNA 3IX1A 3VVDA 2REJA 2Z8FA 1ZMGA 2O1MA 3JYRA 5HM4B 1H43A 3H06B 3H03A 3EPEA 4QRZA 4IO4A 1A40A 1S50A 1B3FA 3ILUB 5DEXB 4LQ5A 1FQBA 3A09A 2I3WA 1POY1 3FIRA 3UK4A 4UACA 1ZBMA 2WKYA 1B5IA 1FQEA 1M5CA 3UIFA 1URGA 4HCYA 1B7UA 4WEPA 1NKXA 1SYHA 3DP8A 3KN8A 3TDJA 1HSLA 4NF8B 1FCKA 1LFGA 1MPBA 1IEJA 5ITPA 5DYHA 3LR1A 3TELA 3O97A 1GV8A 3VLUA 1XC1A 4BDLA 3C36A 4HS7A 4QFOA 3VXBA 1JVXA 3V83A 1AH5A 4U4XA 2XX9A 3IOUA 4NF8A 3TAJA 5B7DA 5HPQA 3K4UA 4LZ7A 3DP4A 3HSTA 1MQHA 1F9BA 4IO6A 4KR5A 3LC8A 3I6VA 1OVTA 3N5LA 3S9NC 3T9VA 3MP1A 3K01A 5L9MA 4ZEDA 3O6GA 1FTKA 5EHSA 1R1NA 1SD3A 5IKBA 4TQUQ 1II5A 4JSDA 4F1YA 4ZE9A 4YB6A 2ZYMA 3TCFA 2G29A 3FGSA 2PX1A 5H8HA 2GRVA 4XKQA 1SI1A 5M2VA 1LB8A 3ZSFA 2RINA 5A5XB 3I3VA 1CE2A 3KBRA 3MZBA 3IK6B 4R75A 1GGGA 2F6GA 4TLLB 1DTZA 4BDRA 5FHOA 1P1UA 2F97A 2Z23A 2ZMBA 1POTA 4C1TA 3M8UA 1TXFA 5CBRA 3RPWA 2NXOA 5A5XA 5CMCA 2PT1A 1H76A 1R6ZA 2XD2A 2GHAA 3FJMA 4IGTA 4RY1A 2F78A 5I2NB 5I59A 3TZAA 2B3FA 2NUVA 4KD5A 4OTEA 5FTHA 2X7QA 5LOMA 3OELA 3PV0E 3TODA 5DEXA 1MXYA 2I6EA 1QUJA 4YKPA 3FVNA 1LBCA 4KFQA 2GHBA 2OCUA 1NNFA 4BDQA 5KCJA 5I2NA 3I5OA 1JNFA 2H99A 3IOVA 3QK6A 1B05A 1FW0A 1URSA 3OD7A 4WXJA 1FQAA 3FASA 4ELRA 3C4MA 3VLVA 2FNCA 1BKAA 1D4NA 1Q1KA 3K02A 3KG2A 5AA2D 5CM6A 1B40A 3CVGA 3CIJA 3SETA 5I58B 2DWIA 1N76A 2E0SA 2OJTA 2RF1A 4WEDA 2OK2A 1A8FA 4GQOA 1LAHE 1JW5A 3A3CA 3BBRA 2YJPA 2DYXA 2R6GE 1B3HA 2RC8A 1VSOA 3MW0A 4H6DA 3FD3A 2H4IA 3PUYE 1JETA 2O69A 1Y1MA 2UXAA 3MP8A 4OFLA 1H45A 1M5DA 3LSFB 4G8MA 1B6HA 1QKAA 1CB6A 3K2DA 4LZ5A 4ELPA 3QIMA 4JSOA 1AOVA 1P1NA 1OQGA 1NH8A 2V84A 4IO5A 3IJOB 4BDMA 2XXWA 4KPTA 3KOSA 1SW1A 1UQWA 1MQJA 4PFWA 4EXLA 1TFDA 2I4CA 3K6VA 4MF3A 3C32A 3Q28A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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