1URDA

X-ray structures of the maltose-maltodextrin binding protein of the thermoacidophilic bacterium alicyclobacillus acidocaldarius provide insight into acid stability of proteins
Total Genus 119
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
119
sequence length
370
structure length
370
Chain Sequence
QTITVWSWQTGPELQDVKQIAAQWAKAHGDKVIVVDQSSNPKGFQFYATAARTGKGPDVVFGMPHDNNGVFAEEGLMAPVPSGVLNTGLYAPNTIDAIKVNGTMYSVPVSVQVAAIYYNKKLVPQPPQTWAEFVKDANAHGFMYDQANLYFDYAIIGGYGGYVFKDNNGTLDPNNIGLDTPGAVQAYTLMRDMVSKYHWMTPSTNGSIAKAEFLAGKIGMYVSGPWDTADIEKAKIDFGVTPWPTLPNGKHATPFLGVITAFVNKESKTQAADWSLVQALTSAQAQQMYFRDSQQIPALLSVQRSSAVQSSPTFKAFVEQLRYAVPMPNIPQMQAVWQAMSILQNIIAGKVSPEQGAKDFVQNIQKGIMA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title X-Ray Structures of the Maltose-Maltodextrin-Binding Protein of the Thermoacidophilic Bacterium Alicyclobacillus Acidocaldarius Provide Insight Into Acid Stability of Proteins.
pubmed doi rcsb
molecule tags Maltose-binding protein
molecule keywords MALTOSE-BINDING PROTEIN
total genus 119
structure length 370
sequence length 370
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2003-10-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1urdA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1urdA01
1FQFA 3BFUA 3TODA 3M3FA 5TPAA 3TDJA 2I58A 1B9JA 4F2QA 3K02A 2ZYKA 1UTHA 2A5TA 1OIBA 2AIXA 4GXAA 4QFPA 2XD2A 3MZ9A 2ZNTA 4U4SA 4IY5A 3CFZA 3O29A 4YKIA 3M3LA 4HCYA 1ZMGA 2XXHA 3OSRA 4F1YA 3HCQA 3W9VA 4ELOA 3CIJA 4JDFA 4RJZA 2Z22A 2QMWA 1YCJA 2I3WA 3CSBA 3K6WA 4PQJA 3FXQA 5DEXA 1MXXA 2QS1A 5DVFA 1HSEA 2B3FA 1VR5A 3BKIB 2ANJA 2PT1A 3I5OA 3K4UA 1UTHB 3T96B 4PETA 1TFDA 1O64A 2XXQA 3CVGA 4F1UA 2A5SA 1B3HA 4KCDA 4U23A 1VFDA 4PE5B 3S9LC 2H4IA 4C0RA 3H06B 5CBSA 3IB1A 2OK2A 2D5WA 1I69A 4GIZA 2RF1A 1S7YA 4LATA 3V8XB 3S9NC 3THIA 4OVJA 3DP8A 3PU5A 1YAEA 5K2YA 3PD9A 2R6GE 3LR1A 1S50A 3MP1A 3MWBA 1B7HA 3O28A 5H8HA 3E4RA 4MLQA 2H98A 2Z23A 2XD3A 4TQUQ 4EXKA 4JSOA 4OXVA 2Y7IA 3C35A 4RYAA 4GF8A 2AL4A 2R71A 2Z8DA 2NXOA 3FXUA 2Z8FA 1I6AA 4KHZE 1O7TA 1A8EA 5TP9B 3MPLA 3RT6B 4EQ9A 3B6TA 4GFRA 4DXCA 3TTLA 3HV1A 1SBPA 1MY0A 4RXLA 1GGGA 3PUWE 1US4A 3VLWA 1LBCA 3N6UA 3Q25A 4MLVA 1XVYA 1ZJLA 3BBRA 3CG3A 2P0SA 4ZEKA 2O1MA 3DLNA 2E1SA 1B5HA 5KDTA 3JZJA 4H8IA 1PB8A 3C33A 2I6EA 3OD7A 3SESA 4H0WA 2DXRA 4R2FA 1QUIA 1TXFA 2DYXA 3RY3A 3M8UA 2PMSA 2DWHA 3PUXE 5ITOA 3UIFA 5HPQA 1B1HA 2DVCA 3T93B 2HAUA 4GWOA 3FJ7A 1BLFA 4JBZA 2HXWA 4LA9A 3KBRA 2REJA 4F31B 1BTJA 3N6TA 1AOVA 1NH7A 1OVTA 2THIA 2I4BA 5JK4A 3PUVE 5H8NB 5KDTB 4EDPA 3RNNA 1CB6A 5L9OA 1HSJA 2WKYA 3SEYA 5CMKA 1N3XA 1PC3A 1LAGE 2VGQA 2ONRA 3MPKA 1N3WA 3ILUB 2F78A 2ESNA 4F3GA 3FJGA 4IO3A 2F7AA 1B58A 4IB2A 2QS2A 1L5TA 5ITPA 3B6QA 2IA4A 1MDP1 4JWXA 3ONMA 3G3FA 1IUDA 4G2ZA 1SW2A 3R7XA 1EZ9A 3OMBA 4XKPA 3TTRA 1JVYA 3I3VA 3MVXA 3FVOA 2V3TA 2I49A 4IGTA 1M5EA 2ZNUA 5DVJA 4YKJA 5AA1A 2PX1A 2Y7KA 2AYSA 1I6BA 1LCFA 2UVJA 2ZMBA 5TP9A 1MXVA 1UQWA 4THIA 4EQBA 2XX7A 4NTLA 4KR5A 4OETA 3PPOA 4RNSA 5I58B 3U92A 1H45A 1DPEA 1P99A 3IO4A 2UVIA 3FGSA 5TU0A 3SKPA 3UP9A 5FTHA 3V5AA 4DDDA 2OLBA 3EHUA 3MP8A 2FA7A 2VHAA 4AB6A 5H8FA 1USYH 1R6ZA 2V3UA 2GFEA 3KSXA 1FTKA 4FE8A 2HQ0A 4DIGA 1SD3A 3FJMA 3WAEA 5AA3A 4JWOA 5F1QA 4OFJA 3RQTA 1AIVA 4IY6A 4OMBA 3EQ1A 4G68A 3RN8A 1MG1A 3PPNA 4NF8B 1XC1A 4R6YA 4YAHX 3IB0A 3C34A 1IEJA 4L17A 4N07A 3LSWA 4ESWA 3CSGA 4FORA 1N76A 1R9LA 2REGA 3C32A 3U93A 4GXSB 4IO7A 1LB8A 1RYXA 1B46A 3H3GA 3MVWA 3PV0E 4R9GA 4FIMA 4OFLA 1OVBA 2NVUB 1MY1A 3CFLA 1FTJA 1NH8A 2RKMA 1IIWA 1UTBB 1ZIUA 3A3UA 3IO6A 4YKPA 1MPDA 1URSA 3SEWA 3IOUA 5EHSA 4E0XA 3IJXB 1OMPA 2OZZA 4U22A 2QL3A 2O68A 1MPCA 1B4HA 3FV1A 3OELA 5I2NA 2XXPA 1NKXA 1XS5A 4BDRA 2A5TB 2O7IA 1NMUA 4NWDA 3B7DA 1N7WA 1DSNA 5J1DA 3B6WA 3H03A 4KD5A 4LUBA 3SERA 5I56A 4KFQA 5I57A 4G68C 2OJTA 4TLLB 1SI0A 3ILTB 3ZKLA 2DSFA 2XX9A 4NF5A 1AMFA 1FTMA 2XX8A 4NE4A 3VV5A 1SYIA 4R2BA 5L8DA 3TMGA 3T9VA 3VXBA 1IXHA 3Q27A 3K2DA 2VD2A 4P0IA 4X48A 4UA8A 3Q28A 1JVXA 1SQYA 2I0CA 4PFTA 3S2VA 2QS4A 4PP0A 3JV9A 4KYEA 3FATA 3FD3A 4X9TA 5DYHA 3PPQA 1IXIA 3LSXA 3PPRA 1MH3A 1IXGA 1OLAA 4DE8A 2PT2A 2H9BA 4ELPA 4BDNA 1IITA 2VP1A 1B0HA 4OZ9A 4ISUA 4F39A 4F3SA 5K2XA 5KCJB 5H8HB 4G77A 5CMCA 1LFGA 3FUZA 4KQPA 1MH4A 1MS7A 1SW1A 3PPPA 4EUOA 4E0WA 3OOAA 4QFLA 5AA4A 2XXUA 3QYTA 4OERA 3H6TA 2F6PA 1EH3A 4FEBA 3CG1A 4GRKA 3IR1A 1I6QA 2AL5A 3FZVA 3KN3A 3ECRA 3MQ9A 1N0TA 1B3EA 2DWAA 2X7PA 1II5A 2XXXA 4M1VA 5JTYB 4NF6B 2XXIA 3PD8A 1LFIA 1GVCA 1QKBA 4OENA 1SI1A 3T22A 5IAIA 3IB2A 4JWYA 2Y7RA 1MQGA 1POY1 3U8QA 5CRYA 5A5XA 4POXA 1KWHA 4Q30B 4YMAA 3K00A 3TQWA 5FHNA 1JEVA 1QVSA 4LONB 4KYDA 1B3GA 3A09A 3BFTA 1LAXA 1N7XA 2GH9A 4EF1A 2V93A 5ICQA 5ISUA 3E13X 3I6VA 3O97A 3HHGA 1B5JA 1Y20A 2DWIA 1QUKA 3FVNA 3MZ1A 3CI8A 5EHMA 5TPAB 3SEVA 1FQEA 1LFHA 4F3PA 1MXUA 1DPPA 3FIRA 1MM7A 3HO7A 4R6KA 2ZYMA 4R72A 2NUVA 3VVDA 1FCKA 1LBBA 2H25A 3OO6A 1MQDA 4ECFA 5ELVA 3SEXA 2GRVA 5IKBA 1EZOA 1Q1KA 4RPOA 2FYIA 5B7DA 4AQ4A 1ZTYA 3S9MC 5BUUA 4I1DA 3RUMA 2Q88A 1R1NA 1JW4A 2HZKA 5FHOA 3EPEA 4Q8RA 3PGFA 4G4PA 4QRZA 1FTOA 3MVZA 1MXYA 4TOZA 4JSDA 3U1OA 3IL1B 4LVQA 4OEVA 5A5XB 2D21A 4R75A 2O1LA 2ABHA 2YLNA 4OHNA 3RGYA 3VLVA 3K1MA 3TCGA 4DXBA 2OWTA 4QFKA 4R73A 1LCTA 2ONKE 1YTVA 2F97A 1B0LA 1JW1A 4FEDA 3S9EA 5HM4B 1B05A 2GHBA 4X1BA 1MY4A 1MY3A 1LLSA 3MBPA 4ND9A 2O51A 3EF7A 4QF9A 4OWDA 1B7ZA 4DZ1A 4RY1A 2W7YA 3OO8A 4IO4A 3K6UA 2RCAA 5H8SA 4BDQA 1QJMA 4N6PA 4XKRA 2F5XA 3PUZE 2RCBA 1N04A 4M4GA 3T66A 1Z7NE 4PFUA 4N13A 3R6UA 4GL0A 1CE2A 2H99A 4QSEA 1Y3PA 2UVHA 3PMWA 3HHFA 3VXCA 4HS7A 3T9UA 1IZ1A 2O69A 1Y4TA 2QRYA 4F29A 1MM6A 3TELA 2F8DA 1QULA 1PB7A 3H6WA 5CMBA 2DP8A 1ELJA 4GLIA 1QW0A 4Z0IA 4YKKA 2Q9TA 4ZE8A 3W9WA 3IAZA 4TLMB 4GD5A 5CI5A 3RPWA 3VDFA 4DCYA 5I59B 3KJ7A 1UIUA 4NF4A 2Q89A 2X7QA 3MAMA 2XXRA 4GL8A 4NWCA 4QFOA 1P1NA 3SEUA 3UA8A 4AB5A 5B70A 1A99A 4OFOA 2PYYA 1ZKBA 2XXWA 3U72A 3IK6B 3ODBA 5CM6A 1IQ7A 1NNKA 3QUFA 4ZECA 5H8QA 3HSTA 4RK2A 3RT8A 4H8JA 3K6XA 2E0SA 2XXVA 4I9DA 1VE4A 2NWJA 3TTNA 1MQHA 2UYFA 3KJTA 3ZSFA 2DE2A 4WXJA 4YICA 3OENA 3TYHA 2QSXA 4H6DA 1MQJA 3EN3A 2P1SA 4PFYA 1XHYA 4FJPA 2ZYOA 3OO9A 4NF4B 2NOOA 4O3BA 5DVIA 4ZS9A 1RYOA 3IX1A 5AA2D 3K01A 2OCUA 5L9MA 4POWA 1B3LA 3H6VA 4G8NA 4XIGQ 4ZZEA 1NNTA 1M5BA 2P2AA 3UGWA 1B40A 2PVUA 3K1PA 2IEEA 2QJEA 2VD3A 3TPAA 4LP2B 5FTIA 4ESXA 4F3BA 4FAJA 1USYE 2I0BA 1QUJA 5I2KB 4GVOA 3E9XA 1PB9A 2B65A 2LAOA 1US5A 3FXRA 3PMVA 4OYVA 3TTMA 3P7IA 1OLCA 1Y3NA 3MW0A 3FVKA 4XXUA 4LQ5A 2YPNA 1B51A 2Q8JA 5AA2B 1MXZA 2DQVA 4K3FA 1NL5A 1SW5A 3TCHA 4JB7A 5I84A 3UN6A 1NNPA 1TT1A 4FATA 3G3HA 3D4CA 3RTWB 4RPNA 2I4CA 3MC2A 1VFEA 4C1UA 3WAFA 1FTLA 4GQOA 3RTFB 2XHDA 1Y1MA 5JTYA 1OQHA 4ZEDA 3IORA 2RC9A 5I2KA 2UVGA 3MP6A 3W15C 5AA2A 2V84A 3OXNA 2Y7PA 2DS9A 2M8CA 4X1DA 5M2VA 2F34A 2OBGA 2Q2AA 3CFXA 3IJOB 1BP5A 3MJNA 3MUQA 4MF3A 4QSCA 4F1VA 5H8FB 1B3FA 1FQAA 3U94A 2ZYNA 4WEDA 5BWJA 1UTBA 2ZXTA 4KI0E 3H4ZA 3H7MA 1D9YA 3O2AA 3VVFA 4IGRA 4F19A 1D3KA 5ICTA 3E3KA 3N94A 3QK6A 4ZDMA 2CMOA 1JETA 1JNFA 4BLAA 4YMBA 3R26A 4U4XA 3K0VA 3KFMA 3QUJA 4PFWA 1P1WA 4XKNA 1S9TA 1H43A 3CRBA 4EF2A 3DELB 4ELRA 3V83A 1MY2A 2D3IA 3KSJA 2O84X 3TEPA 3LSFB 1FQBA 3G7WA 3G3GA 5AE4A 3O9PA 1P1UA 4QSDA 4F22A 2V25A 4G8HA 4NF6A 4P0GA 3O6IA 1H44A 3LC8A 4O3AA 4ZE9A 3VFJA 1DTGA 1P1QA 1B1XA 4GOTA 4H5FA 4O3CA 1XOCA 1DTZA 5CMMA 5I59A 3QAXA 3FV2A 2RC8A 1BKAA 4YB6A 5DT6A 5CBRA 3HPIA 1A7LA 2HAVA 2F35A 4Q5TA 1LSTA 1VSOA 1URDA 2ZNSA 4R9FA 5JEIA 1QKAA 3C36A 2BJJX 5L9SA 2R9JA 5KCJA 1EZPA 3CR9A 1FQDA 1IXCA 3N26A 3N5LA 3QSLA 4P11A 3TKDA 4BDMA 3DP4A 3K6VA 3LBSA 4OESA 4C1TA 2HZLA 5KZTA 1YPNA 1Z7ME 2KLFA 4UACA 3F11A 4YU0A 3VE1B 4LZ8A 1DMBA 2Y84A 3GXAA 3KGCA 3MVYA 4F2OA 2DXYA 4XTCQ 1JEUA 2UYEA 4WKMA 1B6HA 1LAFE 1WODA 3G3KA 1JQFA 1M5DA 1JW5A 3OSQA 2Q2CA 4KCCA 2F7CA 3KOSA 4U2RA 3RLFE 1N84A 4RK9A 5H8QB 3TTKA 1GR2A 4XKQA 4BDOA 3GBBA 4LQ2A 1Y1ZA 3C9HA 1AL3A 4KYSA 2DVZA 3O6HA 2H5YA 1D4NA 2X26A 2Z8EA 3Q29A 1AH5A 1A40A 3IOTA 3DP6A 4ONYA 3KN8A 3TFLA 3USDA 3TUSA 1B32A 4H1XA 4OEUA 2OWSA 1M5FA 2HCAA 3V89B 4HW8A 3VVEA 1B4ZA 3FVGA 3KOTA 3QIMA 2G29A 2O6AA 4I62A 3TZAA 4ELQA 2XXYA 4NEDA 3UORA 4Z7EA 1OQGA 3TAJA 5AA4B 1GV8A 2YJPA 4G8MA 2CZLA 1XVXA 1ZLQA 3GLBA 1SYHA 3SDFA 4JXIA 1A55A 4IO5A 1B5IA 1Y4CA 3M3KA 5DTBA 1ZBMA 2ONSA 2HEUA 4R6HA 1D9VA 3C31A 4OTEA 4KPTA 3IOWA 1F9BA 4HCWA 3K1NA 3HN0A 4IO6A 3GBAA 5I2NB 4Q0CA 2RC7A 4MH5A 1SDXA 3QXMA 4YB7A 1ATGA 5LOMA 1O63A 3S4UA 5H8NA 3G3JA 5CC2A 4I8CA 2F6GA 4IO2A 1WVJA 3EHTA 1M5CA 4MFIA 3L6GA 1H76A 3O66A 4QHQA 2QS3A 4BDLA 2DE3A 1DOTA 2F36A 2UXAA 1HSLA 4HTGA 4H5GA 1NFTA 4NMYA 1NNFA 2FNCA 3C4MA 3PUYE 4NF5B 5HBCA 4ZZAA 2G93A 2ALUA 3KZGA 5F7VA 1SVXB 3D4GA 5I56B 1URGA 4EQ7A 5I57B 3KEIA 1MRPA 2DWJA 1ANFA 3OEKA 2VOZA 3O6GA 3Q26A 4ZEIA 1MQIA 4U1OA 1LGBC 2I48A 4MBPA 3VLUA 1MPBA 4EXLA 1J1NA 3EHSA 3KG2A 1TFAA 2F7BA 2V3QA 3UK4A 3ZKKA 1Q35A 2PBWA 2I3VA 4H67A 1PEBA 2Y7WA 1FQCA 1POTA 2QMXA 3KN7A 3GZGA 1GTKA 3OO7A 4U21A 3T9HB 4F18A 5I58A 1R9QA 1A54A 4YZZA 4ZEFA 2XXTA 3H6UA 3AXFA 3PMXA 4DLDA 2B3BA 1Y9UA 2DE4A 1BIYA 4WEPA 3LSLA 3SETA 1FW0A 2HFBA 3MZBA 4ZEBA 1B7UA 2DOJA 4H65A 1B52A 1ZU0A 3G3IA 1H3DA 1WDNA 3L6HA 5EYFA 1RKMA 4YB5A 3TCFA 4DXUA 4RA1A 2QPQA 1A8FA 5FHMA 3DM0A 1PDAA 4LZ5A 1LAHE 1PBQA 3FASA 4NF8A 1UIVA 4G68B 2RINA 4OQOA 1T0KA 3LUYA 1TWYA 3T9XB 1MXWA 4QFNA 4LZ7A 1XT8A 3A3CA 3OEMA 3ZS6A 2GHAA 4DCXA 1PBPA 2O7UA 4U1ZA 1LB9A 1MDQA 1B2HA 1P1OA 4FECA 3TQLA 1EU8A 3IOVA 5DEXB 1Y3QA 4R74A 1SW4A 3JYRA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5LTCA 3M3FA 2I58A 3MZ9A 4U4SA 4IY5A 3O29A 4YKIA 4HCYA 2CEYA 2XXHA 3OSRA 2WBDA 2QS1A 1AWBA 1EYKA 4MNIA 1VR5A 2ANJA 1UTHB 3T96B 4PETA 1TFDA 4MAGA 4U23A 1VFDA 2H4IA 4C0RA 3H06B 2GQ1A 1I69A 1DCUA 3S9NC 2DDKA 2QVRA 1YAEA 4FBPA 1LBWA 1S50A 5LDZA 5H8HA 4MLQA 4TQUQ 4EXKA 4RYAA 2NXOA 4KHZE 1A8EA 5TP9B 3RT6B 4EQ9A 3B6TA 4GFRA 4DXCA 1GGGA 3PUWE 1LBCA 1XVYA 1ZJLA 4JVIA 3CG3A 2P0SA 2O1MA 2E1SA 1B5HA 3JZJA 3SESA 4QXDA 1QUIA 5HPQA 2FVZA 1KA0A 4JBZA 4LA9A 3KBRA 1AOVA 4GBVA 3N6TA 1INPA 1OVTA 2I4BA 3PUVE 4EDPA 1CB6A 1N3WA 4IO3A 1L5TA 1B58A 5ITPA 1MDP1 2FIXA 3G3FA 1IUDA 3R7XA 1EZ9A 3FVOA 2V3TA 2I49A 5DVJA 2ZNUA 5TP9A 1MXVA 4P56A 2XX7A 2UVIA 3U65A 5FTHA 4DDDA 2FA7A 2VHAA 1FTKA 5ESYA 3WAEA 5F1QA 3RQTA 4IY6A 4OMBA 3EQ1A 2ZZXA 4R6YA 4YAHX 4O8MA 3C34A 1IEJA 1R9LA 4GXSB 2HHMA 3A29A 3FXBA 3H3GA 3PV0E 4OFLA 4P3LA 1QGXA 4P47A 3IO6A 4YKPA 4E0XA 3IOUA 5EQ7A 3FV1A 2XXPA 1XS5A 2O7IA 1NMUA 1DSNA 5J1DA 5I57A 4KFQA 2OJTA 2QFLA 2DSFA 4NF5A 3VV5A 1SYIA 4R2BA 3TMGA 1IXHA 4UA8A 3Q28A 2I0CA 4KYEA 4X9TA 4HXVA 3LSXA 1KZ8A 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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