1URGA

X-ray structures from the maltose-maltodextrin binding protein of the thermoacidophilic bacterium alicyclobacillus acidocaldarius
Total Genus 120
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
120
sequence length
373
structure length
373
Chain Sequence
QTITVWSWQTGPELQDVKQIAAQWAKAHGDKVIVVDQSSNPKGFQFYATAARTGKGPDVVFGMPHDNNGVFAEEGLMAPVPSGVLNTGLYAPNTIDAIKVNGTMYSVPVSVQVAAIYYNKKLVPQPPQTWAEFVKDANAHGFMYDQANLYFDYAIIGGYGGYVFKDNNGTLDPNNIGLDTPGAVQAYTLMRDMVSKYHWMTPSTNGSIAKAEFLAGKIGMYVSGPWDTADIEKAKIDFGVTPWPTLPNGKHATPFLGVITAFVNKESKTQAADWSLVQALTSAQAQQMYFRDSQQIPALLSVQRSSAVQSSPTFKAFVEQLRYAVPMPNIPQMQAVWQAMSILQNIIAGKVSPEQGAKDFVQNIQKGIMAQGS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords MALTOSE-BINDING PROTEIN
publication title X-Ray Structures of the Maltose-Maltodextrin-Binding Protein of the Thermoacidophilic Bacterium Alicyclobacillus Acidocaldarius Provide Insight Into Acid Stability of Proteins.
pubmed doi rcsb
source organism Alicyclobacillus acidocaldarius
molecule tags Maltose-binding protein
total genus 120
structure length 373
sequence length 373
ec nomenclature
pdb deposition date 2003-10-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1urgA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1urgA01
3E13X 3KN8A 1POY1 4KQPA 3U93A 2ZXTA 2D21A 2H4IA 3GBBA 4N6PA 1R9QA 3MBPA 1B51A 3PUWE 2I49A 1DOTA 1M5CA 2F5XA 4PFUA 3B7DA 3VLWA 3SEUA 2THIA 3T9XB 1JNFA 4E0XA 3IB1A 3K01A 3USDA 4FIMA 4QF9A 4XTCQ 4IGTA 5L9SA 5I2KB 4OYVA 2Z8EA 4BDOA 3MVWA 2REJA 1FQEA 1XVYA 3KN3A 3PGFA 2DWHA 2Y7KA 4NWCA 4XKNA 3VE1B 2RC9A 4ELRA 2O51A 2R6GE 1ZU0A 4OZ9A 4PFYA 4RYAA 1FQDA 1O63A 2H25A 3RN8A 4GOTA 4IO5A 1O64A 4LA9A 4G68B 3IO6A 1B7HA 1WDNA 1FQAA 4M4GA 5KDTA 1PBPA 1UTBA 4YKKA 1Z7NE 3OSRA 5H8HA 1ZIUA 1I69A 1IXIA 1TFAA 4F3GA 1A40A 4ONYA 2NWJA 2ZYNA 2UXAA 4F18A 3CG3A 3KOSA 2A5TA 3S9MC 3C31A 2D5WA 3OXNA 1GV8A 4F3PA 3FVKA 3TTMA 1WODA 3OENA 4OWDA 3FV2A 4OESA 2RINA 3O66A 2G93A 3G7WA 3E3KA 1B05A 5L9MA 2I58A 3CR9A 2DWJA 4IO4A 3TELA 2B3FA 1VFDA 1N84A 4RA1A 1ANFA 1MG1A 1BP5A 1N0TA 1A8FA 4ZDMA 3H6VA 4WEDA 5H8NA 4I9DA 2XHDA 5FTIA 3O6GA 2DSFA 3VFJA 2CMOA 4FAJA 2O1MA 3OMBA 4K3FA 2Z23A 3U94A 3PPRA 1MXYA 3UP9A 4OVJA 5CMBA 2XXPA 1MRPA 1B9JA 1SW4A 4KR5A 3MWBA 5AA2B 3GLBA 4F1UA 5EHMA 1CE2A 1FW0A 1SW2A 4QRZA 3BFTA 1SDXA 3F11A 2XX7A 4RY1A 3U72A 4GFRA 1XC1A 2QRYA 1Y4CA 1TFDA 5IAIA 3PUZE 4DCXA 3FV1A 3D4CA 3QSLA 2AIXA 5H8FA 4H5FA 3K6XA 3IK6B 4OEUA 3M3LA 3HSTA 2GHAA 4OFOA 1GR2A 3LUYA 4KFQA 1PB8A 2OLBA 2QMXA 1JEVA 5DEXA 4R6YA 2OJTA 3H6WA 4JXIA 4YKJA 3TQWA 2F36A 1SBPA 2UYEA 3TCHA 1NL5A 2RCAA 3FASA 4EF1A 3S9LC 1RYXA 2ONSA 3KJTA 3LSXA 3GZGA 3VVFA 1MY2A 4GXAA 5DVIA 4FJPA 1MQGA 2PMSA 3N26A 4RXLA 2D3IA 3CSGA 2ZNTA 1ZKBA 3H3GA 3EF7A 2R9JA 4XKQA 3E9XA 1EH3A 4R9FA 3KZGA 3KBRA 3LSLA 3OELA 2ONKE 3BBRA 4OXVA 3LBSA 1UQWA 3IAZA 1OLAA 4DCYA 2GRVA 4QSDA 1JW5A 1B32A 1Y9UA 3GBAA 4I62A 3SEWA 3TTLA 1N04A 3W15C 4ZS9A 3RTFB 2F7CA 2E1SA 1YCJA 4BDNA 1NFTA 3E4RA 1B3EA 1BKAA 2Q2AA 3TCGA 5CMCA 2W7YA 5A5XB 1FTLA 5I59B 1H76A 1USYE 5FHMA 5JK4A 1IITA 3SEXA 4OQOA 4NF4B 2NXOA 1P1UA 5DVJA 1LAHE 4H5GA 4PP0A 3A09A 3HCQA 2YLNA 3VVEA 4IO7A 2DP8A 1OQHA 5EYFA 5DT6A 5CBSA 5JEIA 3W9VA 4WEPA 5H8QB 1IXGA 1Y20A 1QKAA 1O7TA 1PDAA 3UA8A 4LQ5A 3OD7A 1N76A 1MH4A 4OFJA 4X9TA 4G68C 1XS5A 3DP8A 4JWXA 3ZS6A 4EQBA 2VP1A 3QYTA 4KYSA 2QSXA 2XXVA 1B5HA 2OBGA 4EXLA 2O7UA 4U4SA 2RC7A 3MQ9A 3RPWA 2IA4A 4IB2A 1UTHA 4G4PA 1VSOA 3RY3A 4HCWA 4RK9A 3KJ7A 3VLVA 2DYXA 4JWYA 4XXUA 3ILUB 1H3DA 4ZZAA 5AA4B 4KHZE 2QS4A 1OQGA 3HHGA 3EHTA 4JWOA 2Y7PA 1B0LA 3OSQA 2XD2A 2OZZA 3H6UA 4MH5A 3BKIB 2VD2A 4PE5B 4I1DA 1B4ZA 2P2AA 3MVYA 4NF5B 2PVUA 2GFEA 2YPNA 5I2KA 3PV0E 3VV5A 2H9BA 4EQ7A 2V3QA 1N3XA 1UIVA 2V3UA 4Z7EA 4YU0A 3PU5A 4O3AA 4BDRA 3UORA 3I3VA 4U21A 1FTMA 3MZ9A 2I48A 5DYHA 3PMVA 4MLQA 1URSA 1VE4A 4ZE8A 4NF8A 3LSWA 3Q26A 2F6PA 3T96B 4XKRA 4PETA 1QUKA 4H8IA 3M8UA 1Y3NA 5CM6A 3S4UA 3EHUA 2GHBA 1H44A 1B46A 1RKMA 1ELJA 4Q8RA 4TLMB 2QJEA 3CFZA 3OO9A 1FTJA 2Q88A 4OERA 1AOVA 1T0KA 2DQVA 3IB2A 4EXKA 4NF6B 4R73A 4C1TA 1IQ7A 2Z8FA 1PB7A 2VHAA 3K1PA 1B4HA 3CIJA 5I56A 2XXWA 3VVDA 4R74A 3FJMA 4YKIA 3P7IA 1I6QA 3A3CA 3U8QA 3H6TA 5K2XA 1AMFA 4DDDA 4KD5A 1JVXA 2QMWA 5DVFA 1QUJA 3C33A 2DVZA 4LATA 5CC2A 1N7XA 5TP9B 4O3BA 1HSLA 4ESWA 3FIRA 4EF2A 3O9PA 2Y7WA 1GTKA 2I0CA 3G3KA 1NKXA 2QS3A 1EZPA 1IEJA 4HCYA 3DLNA 4U2RA 3KGCA 1HSEA 1B7UA 1B3GA 3TTKA 1F9BA 1TWYA 2Q9TA 1N3WA 2F35A 1IUDA 2ZYMA 5I58B 1XHYA 2XXUA 4KPTA 3K4UA 4OETA 4QFLA 4Q30B 2Y7IA 4G2ZA 3O28A 3M3FA 5KZTA 5KCJB 2F6GA 1TT1A 3IJXB 2PYYA 5B7DA 1OMPA 3CFLA 5F7VA 5ITPA 1R6ZA 2FA7A 5B70A 2Z22A 2DWIA 3CG1A 3FXQA 1MQIA 1LFHA 1IXHA 1BLFA 2I3VA 2Y7RA 4R2FA 3WAEA 4U1OA 1B58A 3ODBA 3EPEA 5M2VA 3ZKLA 4E0WA 1JETA 3QUFA 2P1SA 3FJ7A 3K1MA 3B6TA 2DOJA 1II5A 2X7PA 4LP2B 4H0WA 3HO7A 2I3WA 3K02A 3LR1A 4JBZA 3TZAA 3MP8A 1FCKA 4MF3A 3EN3A 3QAXA 3PPPA 2HAUA 5ISUA 1ZBMA 2WKYA 1M5DA 4Z0IA 1ZMGA 2YJPA 4PFTA 2I6EA 3DM0A 2ESNA 3VDFA 2UYFA 3KN7A 1QULA 3PUXE 1S9TA 3TAJA 5J1DA 1MXXA 3RGYA 1MPDA 1B3FA 3CRBA 2UVGA 5ICTA 4RPOA 3K0VA 3PD9A 1SYHA 2OWSA 3CSBA 4F39A 2UVJA 5JTYB 3OEKA 4YB5A 4JSDA 1MY4A 5A5XA 3MZ1A 5I59A 1B1HA 1USYH 1LB8A 4YKPA 4QSEA 1Q35A 4GF8A 4YICA 4NF4A 5H8HB 4DXUA 3TYHA 1MY0A 3SERA 4HTGA 3IOTA 2ZNSA 4M1VA 3ZKKA 3FXRA 3IO4A 3T22A 5ELVA 3N6UA 3IX1A 4LVQA 3K6WA 1LFGA 3JV9A 4P11A 2ALUA 4FORA 4IO2A 3OEMA 4G8MA 4RNSA 3L6HA 1A55A 2DVCA 1NNTA 3TEPA 1D9YA 1B7ZA 4ZEDA 1FTOA 3S2VA 3HPIA 4GL0A 3KEIA 3FD3A 1LB9A 2I0BA 1DMBA 4P0GA 4XIGQ 3R6UA 3S9NC 5I57B 1PB9A 1PEBA 1SQYA 2Q8JA 4NEDA 4THIA 4ND9A 4R6HA 3G3JA 2PT2A 1SW5A 2XX9A 3VXBA 2REGA 2RC8A 1ZTYA 5H8NB 4WXJA 3L6GA 3CFXA 3RQTA 1LAXA 3C35A 4JB7A 1OVTA 3Q25A 4DZ1A 4KCDA 4H67A 5AA4A 2Y84A 3FJGA 3AXFA 4GLIA 1US5A 3H03A 4OEVA 1ZJLA 1URGA 2O84X 4IO6A 4RJZA 2B65A 3FGSA 4H6DA 4IY6A 5F1QA 3B6WA 4NF5A 3UGWA 5HM4B 4KYDA 2RKMA 3RLFE 1EZ9A 4ZEBA 1J1NA 1BIYA 4F19A 3A3UA 3IOUA 3FZVA 4Q5TA 5FTHA 4YMBA 2QPQA 4R2BA 3G3HA 3ECRA 4ESXA 3DP6A 4HS7A 4EDPA 3KFMA 2X26A 3O2AA 1Y3PA 5DEXB 2G29A 1M5EA 2ANJA 3G3GA 4GWOA 1MPBA 2UVHA 4MFIA 1B0HA 5TPAB 4LZ8A 4ZEKA 4GRKA 2OWTA 1P1NA 2VOZA 4HW8A 4OENA 3VLUA 1S7YA 2NUVA 3R7XA 5I84A 3PMXA 1GVCA 1MM6A 2X7QA 3K1NA 1MH3A 1I6AA 1FTKA 3SESA 3VXCA 3UK4A 3TODA 1YAEA 4MLVA 2XD3A 4NMYA 3G3FA 3I6VA 1IZ1A 4PQJA 3TPAA 1UIUA 2LAOA 4QFKA 4X48A 1MQDA 3PMWA 5H8SA 4DXCA 2B3BA 5HBCA 4H8JA 3MVZA 3WAFA 3EQ1A 2QS2A 1P1QA 3FVOA 4P0IA 2DE4A 1L5TA 3T9UA 3TUSA 1URDA 5EHSA 1LBBA 3CVGA 3PPQA 3QIMA 4ELPA 4QHQA 3IJOB 1MS7A 4F29A 5I58A 4RK2A 4G68A 1NNPA 1KWHA 1DTGA 3RTWB 5BWJA 1R1NA 1Z7ME 3IOVA 3CI8A 3LSFB 2V25A 1JQFA 3H7MA 4QFOA 1AH5A 2E0SA 5ICQA 2A5SA 1JW4A 4C0RA 3K6VA 3SKPA 2DXYA 1SVXB 1TXFA 2ZYKA 2HFBA 3BFUA 3TFLA 3IR1A 4MBPA 5DTBA 3TTRA 3TTNA 4F3BA 4BLAA 3IOWA 4H65A 4YB6A 4WKMA 1FQFA 1VR5A 1D4NA 4N13A 1QJMA 1B1XA 3C36A 2XXHA 1AIVA 3U1OA 4IGRA 2H5YA 1OLCA 2DS9A 3MAMA 4LZ5A 1H45A 4H1XA 3OOAA 3O6IA 1MXVA 1AL3A 1IIWA 1SYIA 2XXXA 1POTA 4R75A 3PD8A 2FNCA 4OHNA 3OO8A 3LC8A 3Q29A 5L9OA 2XX8A 3C4MA 3SDFA 1M5BA 2R71A 3TCFA 2QS1A 3N6TA 1MDP1 4L17A 3FUZA 1LSTA 5AA2A 1XT8A 1OVBA 3THIA 2IEEA 2AYSA 4ELOA 4NF8B 1LGBC 1GGGA 2O68A 2HEUA 2V3TA 1CB6A 5I2NB 5JTYA 2AL4A 2F34A 4R72A 2H99A 3RNNA 3Q27A 1YTVA 3KOTA 2KLFA 4F2OA 2F78A 3FXUA 1JW1A 1P1OA 3KSJA 1PBQA 3C32A 3KG2A 1VFEA 1EU8A 2F7BA 4U4XA 4ZECA 4YAHX 5FHOA 4EQ9A 3TMGA 4G8HA 3O29A 1PC3A 4I8CA 1DPPA 3V89B 2XXRA 2XXQA 3MZBA 4PFWA 5L8DA 3R26A 2BJJX 1LFIA 4YMAA 5I56B 1LAGE 1LCFA 1XVXA 2F8DA 3JYRA 2PT1A 2ZYOA 3T9VA 4R6KA 1I6BA 3JZJA 1JVYA 4ZE9A 2NOOA 3MW0A 5I57A 4X1DA 2ZNUA 5CBRA 4X1BA 1LLSA 3SETA 4KYEA 2O6AA 4O3CA 4KCCA 1SW1A 1SD3A 2I4CA 2M8CA 4F3SA 4GXSB 5BUUA 2HXWA 3O97A 4AB6A 1MXWA 4Q0CA 2RCBA 2RF1A 4F1YA 5HPQA 2GH9A 4ELQA 3HHFA 3MUQA 5CRYA 5LOMA 3SEYA 4KI0E 4AB5A 2O1LA 4F22A 3QK6A 1Y3QA 3RUMA 4JDFA 4LUBA 4N07A 4DLDA 2FYIA 1NNFA 4BDMA 1B3LA 1NMUA 5KDTB 4QSCA 1UTBB 5IKBA 3T9HB 4TLLB 2XXTA 4GQOA 1LCTA 3N94A 4IO3A 3MC2A 5AE4A 4TOZA 1BTJA 5FHNA 5H8QA 2A5TB 4TQUQ 4GVOA 4UACA 2PBWA 4YB7A 1MXZA 1QW0A 1M5FA 1B2HA 1EZOA 3K00A 2VGQA 1Y1ZA 4R9GA 3T66A 5TPAA 1DTZA 1JEUA 1B40A 1IXCA 2I4BA 2HQ0A 1B52A 4QFNA 3H06B 2OCUA 4DE8A 4BDLA 4UA8A 2V93A 3EHSA 1MPCA 3V83A 4DIGA 2HZKA 4NTLA 3OO6A 3K2DA 3MPKA 4LQ2A 1P99A 3PUYE 3K6UA 2Q89A 1MM7A 3W9WA 5AA2D 1NH8A 1SI1A 2VD3A 4ECFA 4G8NA 1MY3A 4FE8A 2DWAA 4FEBA 3TQLA 2XXYA 2QL3A 3O6HA 4LONB 1NNKA 1QUIA 4IY5A 1Y1MA 3IL1B 4GD5A 5H8FB 1DPEA 4U1ZA 4OFLA 2AL5A 2DXRA 3UIFA 3MJNA 4POWA 3U92A 3TKDA 1Q1KA 3KSXA 3V5AA 2ONRA 1A8EA 3S9EA 2XXIA 1SI0A 4LZ7A 2CZLA 4U22A 1LAFE 1MDQA 3M3KA 4FECA 3MPLA 4OMBA 3HV1A 3G3IA 1ATGA 1HSJA 3SEVA 4U23A 3T93B 1S50A 2PX1A 5AA3A 2UVIA 1QVSA 3FVNA 1MQHA 4NWDA 1WVJA 4OTEA 4ZEIA 2HAVA 4FATA 4NF6A 3IORA 3Q28A 1QKBA 2HCAA 3TDJA 1N7WA 4EUOA 5CMKA 4GL8A 2O7IA 3PPOA 1MY1A 1MXUA 3MP1A 1US4A 3HN0A 5ITOA 4C1UA 2NVUB 3I5OA 4XKPA 1D9VA 4F1VA 2F97A 1P1WA 1Y4TA 1A99A 1B3HA 2F7AA 3C9HA 1YPNA 5TP9A 2V84A 2DE3A 4BDQA 1H43A 3DELB 2P0SA 1ZLQA 3MP6A 5CI5A 3PPNA 5CMMA 3DP4A 3UN6A 4NE4A 4GIZA 1NH7A 3H4ZA 4ISUA 3OO7A 3GXAA 3V8XB 4JSOA 3B6QA 2DE2A 2HZLA 3RT8A 3FATA 1A7LA 1LBCA 2H98A 5TU0A 3QXMA 3RT6B 3PUVE 4G77A 1RYOA 5KCJA 3IB0A 1D3KA 1B6HA 2OK2A 4FEDA 5AA1A 3ZSFA 2ABHA 1DSNA 5I2NA 1B5JA 3QUJA 4AQ4A 1B5IA 4QFPA 2ZMBA 3D4GA 4YZZA 3FVGA 3ILTB 3MVXA 1FQBA 1A54A 4F31B 5K2YA 2Z8DA 4ZZEA 3ONMA 3C34A 4DXBA 1MQJA 4POXA 1OIBA 1XOCA 2O69A 4ZEFA 1R9LA 1FQCA 3N5LA 4F2QA 1UTHB 4RPNA 2Q2CA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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