1URGA

X-ray structures from the maltose-maltodextrin binding protein of the thermoacidophilic bacterium alicyclobacillus acidocaldarius
Total Genus 120
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
120
sequence length
373
structure length
373
Chain Sequence
QTITVWSWQTGPELQDVKQIAAQWAKAHGDKVIVVDQSSNPKGFQFYATAARTGKGPDVVFGMPHDNNGVFAEEGLMAPVPSGVLNTGLYAPNTIDAIKVNGTMYSVPVSVQVAAIYYNKKLVPQPPQTWAEFVKDANAHGFMYDQANLYFDYAIIGGYGGYVFKDNNGTLDPNNIGLDTPGAVQAYTLMRDMVSKYHWMTPSTNGSIAKAEFLAGKIGMYVSGPWDTADIEKAKIDFGVTPWPTLPNGKHATPFLGVITAFVNKESKTQAADWSLVQALTSAQAQQMYFRDSQQIPALLSVQRSSAVQSSPTFKAFVEQLRYAVPMPNIPQMQAVWQAMSILQNIIAGKVSPEQGAKDFVQNIQKGIMAQGS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title X-Ray Structures of the Maltose-Maltodextrin-Binding Protein of the Thermoacidophilic Bacterium Alicyclobacillus Acidocaldarius Provide Insight Into Acid Stability of Proteins.
pubmed doi rcsb
molecule tags Maltose-binding protein
source organism Alicyclobacillus acidocaldarius
molecule keywords MALTOSE-BINDING PROTEIN
total genus 120
structure length 373
sequence length 373
ec nomenclature
pdb deposition date 2003-10-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1urgA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1urgA01
1ELJA 4OFLA 4PFTA 3EHSA 1ANFA 3FVNA 2DYXA 4IO6A 5LOMA 4HTGA 2XD2A 2Y7PA 3GBBA 4LQ2A 4ZEDA 4G68A 4OFJA 3FV1A 1OMPA 4R74A 4BDNA 4O3BA 1MXUA 1N84A 4PFUA 4X9TA 4ELPA 4JWOA 5DVIA 3OO8A 5DEXA 5KDTB 4F22A 1GVCA 3OD7A 3CRBA 5H8NA 3PMVA 4EQ7A 4PE5B 4O3AA 3S9LC 4WXJA 4FIMA 3VVDA 3SDFA 2THIA 3O9PA 4ISUA 5M2VA 1SW4A 2GHAA 1TXFA 4KR5A 2NVUB 5TP9A 4KI0E 1H45A 4N13A 5K2XA 2H9BA 1B9JA 2H98A 1SD3A 4OMBA 1N04A 4U21A 1B7HA 3CIJA 3UIFA 5ITPA 1NL5A 2YJPA 3FVOA 3RQTA 2ZNSA 3UA8A 4G77A 2DS9A 4G8HA 2XXWA 5H8HB 4ONYA 3DLNA 1MPCA 5FTHA 2GRVA 5JEIA 1B5IA 1Z7NE 2ONRA 3OO9A 1I6AA 1JVXA 1H43A 1TWYA 1N3WA 3VVEA 4RPNA 4IB2A 3LUYA 3LR1A 1QKAA 5L8DA 4BLAA 3CR9A 5JTYB 2I48A 4HS7A 4NF5B 3QUFA 1LAHE 4LATA 1N0TA 1A40A 4BDQA 1B32A 3E4RA 5L9OA 3U72A 1VFDA 4U4XA 4KYSA 3IX1A 4NTLA 1ZU0A 4OEVA 3QYTA 3KOSA 3O6IA 4RA1A 3K4UA 1N7XA 3TEPA 3E13X 1OVBA 1IXIA 2XXHA 1DMBA 3CG1A 1A7LA 4N6PA 5TPAB 2AL4A 1OIBA 5HBCA 4HCYA 4LVQA 2VP1A 2ZNTA 1Y4TA 2CMOA 1POTA 4JWXA 4MLVA 4C0RA 2DVZA 1B3FA 4IY6A 1F9BA 3KJ7A 1Y3NA 4UA8A 3HV1A 2G93A 2I0BA 3CG3A 4QSDA 3T22A 3TCGA 3TKDA 1EZOA 2Q89A 1USYH 5ICQA 4GRKA 3V5AA 1ZLQA 1FQFA 4EDPA 1O64A 3TTLA 1J1NA 4KHZE 4Z0IA 3MP1A 2QL3A 4IY5A 3BKIB 3L6HA 4O3CA 3H6UA 3LSFB 2I3WA 4BDLA 4F3GA 1XVXA 3A3UA 5ICTA 4EF2A 3DP6A 4KYEA 1FQBA 3VFJA 4L17A 5I84A 4RK2A 4YICA 2UYEA 4R6YA 3IR1A 4FE8A 3CFXA 1RKMA 3CSGA 2XXUA 1IIWA 1LBCA 2O7UA 2QS4A 1IXHA 2XX7A 3TTRA 1AIVA 4X1DA 3K1MA 5A5XA 5B7DA 2ZYNA 3KSXA 2YLNA 3UN6A 1BTJA 4OENA 4JWYA 4KCDA 4KPTA 4OEUA 2Z8DA 3FXQA 4RJZA 4F31B 2F7AA 4QFNA 3Q26A 3FIRA 3PMXA 5CBSA 3H3GA 3O6GA 4FJPA 4M4GA 4IO4A 3G3JA 3H6WA 5CI5A 3N94A 4R2BA 5BWJA 1XVYA 3ODBA 1LBBA 3C35A 3MZBA 1H76A 3B6QA 4P11A 1IITA 3T9XB 3HHGA 1JW5A 2DE4A 3ONMA 3I3VA 1OLAA 3WAEA 3SEXA 1YPNA 3T93B 1N7WA 2HEUA 1MQGA 2IA4A 2RCBA 4P0GA 5ISUA 2F35A 3S4UA 1SYHA 3K1PA 1D3KA 2NOOA 2DVCA 3OO7A 4F1UA 4QFKA 4C1TA 3D4CA 1PDAA 4I9DA 3C9HA 3CFZA 4BDMA 1QVSA 1R9QA 2F7BA 5CMKA 3U8QA 1MQJA 4ZS9A 4LA9A 3EF7A 4KQPA 5H8QB 3SEVA 1DPEA 1QW0A 1LCFA 1FQAA 1URDA 4H8JA 2M8CA 2GH9A 1LAFE 1NMUA 4XTCQ 2VGQA 1VE4A 4IGRA 3FZVA 3Q25A 2O1MA 2OLBA 1BKAA 4OWDA 2ZYKA 3N6TA 4LZ5A 5I2KA 2A5TA 1M5CA 2H4IA 3PUZE 1Y3PA 2I4BA 1B7UA 3IOVA 1QJMA 4N07A 4FORA 4POWA 3FUZA 1Y1ZA 1P1OA 2ALUA 1R1NA 3S9NC 4R73A 3ZKKA 3JV9A 5CC2A 3PPRA 2F6PA 3OENA 4R72A 2REJA 3K01A 5AA2D 1ZMGA 4G8NA 3O28A 5F7VA 3R7XA 1B40A 3UP9A 4OQOA 2I58A 3UORA 3S2VA 4LZ7A 2FYIA 2XX8A 3H6VA 2Y7WA 3IOTA 2HXWA 3H4ZA 4QFPA 3TTMA 4RY1A 4H65A 5CRYA 4OETA 2I0CA 3EPEA 1DTZA 2PMSA 1FTLA 4JB7A 2OBGA 3IB0A 3Q27A 3IL1B 2ONKE 1IXGA 1EZ9A 1R9LA 1MXZA 2UVJA 2Z8EA 3T9VA 1XT8A 2F5XA 5I57A 1S7YA 3V89B 3K02A 1DSNA 2X26A 4GF8A 2I4CA 3IAZA 4F3SA 3FASA 3CSBA 1MDP1 4H6DA 4G68B 3RLFE 3CVGA 3HN0A 3KSJA 2XD3A 5DEXB 1QULA 1B6HA 2QJEA 3F11A 3DP8A 5H8NB 4ZDMA 2PT2A 4JSOA 4EUOA 1NNPA 2P0SA 2UVIA 1JEUA 1P1UA 1A55A 2DQVA 2O84X 1GV8A 3JYRA 4ZE9A 4H1XA 4ELQA 2W7YA 1MS7A 1I69A 4AB5A 4EQBA 4XKPA 5TP9B 2Z23A 3DM0A 4F3BA 3FATA 4XXUA 5AA3A 3KFMA 1GGGA 2RCAA 3KN3A 4F2OA 3U92A 2B3BA 1PC3A 1GR2A 3VE1B 1MM6A 1RYXA 3WAFA 1PB9A 5CBRA 3SETA 2D5WA 2WKYA 4KCCA 1B0LA 1PEBA 2P1SA 1FW0A 3HO7A 3K0VA 4GXSB 1MH4A 1Y20A 4LUBA 2XXXA 4PQJA 2V3QA 2DWAA 3IK6B 3K00A 3M3FA 3RN8A 4DXCA 2O6AA 4RYAA 3RT6B 4EXKA 1PBPA 1P1WA 3C33A 1US5A 3KBRA 3PUYE 1PB7A 3V8XB 4F19A 2DE3A 2QS2A 2AL5A 2GFEA 3MBPA 1IXCA 1FTJA 5EYFA 1OLCA 5CMMA 4ZE8A 2VD2A 1B1HA 3VXBA 1ATGA 2R9JA 1FQCA 1UIUA 2ANJA 1URGA 3KJTA 4EXLA 2NWJA 3CI8A 3HHFA 2VHAA 1SBPA 5DT6A 1I6QA 3B6WA 1MQIA 4HW8A 3I6VA 4I62A 1GTKA 4PFYA 1OQHA 3M3KA 2VOZA 4NEDA 3U94A 3G7WA 3MVWA 3MP8A 3TELA 2DE2A 4I1DA 3K6XA 1UTBA 5B70A 3KEIA 2QS1A 2X7PA 4LP2B 2H25A 3VLUA 2E1SA 5FTIA 3IOUA 1SW1A 4Q30B 4YB5A 1P1QA 3T96B 2GHBA 3VXCA 5J1DA 3IO6A 3BBRA 4RPOA 5AA4A 2B65A 4JBZA 4YZZA 4F3PA 2QMWA 1Y4CA 2HFBA 3TODA 4NMYA 5H8FA 5L9SA 3N6UA 2RKMA 1Y1MA 4QHQA 3TTKA 2QMXA 1Q1KA 1EU8A 4U22A 1H3DA 3LSWA 3U93A 4U23A 2ZYOA 1Q35A 5A5XB 4IO2A 3EHTA 4GIZA 3QSLA 2XXRA 1A54A 4YAHX 2X7QA 3IJXB 4F2QA 3ZSFA 4R2FA 3H6TA 4Q5TA 5K2YA 3ECRA 3G3FA 3VLWA 4ESWA 4GXAA 4NE4A 5I59A 2DWIA 3K1NA 4DCXA 1Z7ME 3O29A 5DVFA 3C4MA 1JW1A 2OCUA 3IJOB 5CMBA 2QPQA 2XXVA 3MW0A 3PUXE 5FHOA 4JDFA 2A5SA 1MRPA 3Q29A 1R6ZA 3Q28A 1N76A 3KN7A 1JETA 2O51A 3UK4A 2NUVA 4NF4A 4FAJA 3G3KA 4U1ZA 4H5GA 4C1UA 1SI1A 1SW2A 3PUVE 5TU0A 1TFDA 2Q2CA 3MC2A 1MY2A 3SEYA 3O97A 4YB6A 4YKPA 3N26A 1FTOA 1XHYA 4OHNA 1B1XA 4X1BA 1FCKA 3GLBA 2Y7IA 3C32A 1WDNA 1L5TA 2REGA 1A8FA 5I2NA 1B5JA 4WKMA 1EZPA 1UTHA 5I58A 3RUMA 2AIXA 4IO7A 3KOTA 3DP4A 3V83A 3TQLA 4MH5A 4G8MA 1ZIUA 4F18A 5KCJA 1MDQA 2ESNA 3OSRA 5L9MA 3LBSA 3BFUA 3RTWB 3A3CA 2RINA 1ZJLA 1AL3A 1P1NA 4H8IA 1LGBC 3JZJA 2NXOA 4YU0A 2FA7A 2HQ0A 1JQFA 1HSJA 1VR5A 4LQ5A 5IAIA 1MPBA 3K6WA 1NH8A 1SDXA 4ZEFA 5FHNA 1OVTA 3AXFA 4Z7EA 2HCAA 2UVHA 2OK2A 1FTKA 3MPLA 4OZ9A 2F6GA 5I2KB 1H44A 2A5TB 2CZLA 4XKNA 4FEDA 1D9YA 4DCYA 1WVJA 1NNKA 2VD3A 3C31A 4KYDA 1KWHA 4OVJA 4Q8RA 4PETA 4DDDA 1QUKA 1BIYA 1MXYA 4BDRA 3B7DA 4GL0A 4YKJA 2V25A 2Y84A 1QUIA 3OEKA 3RY3A 1JEVA 3OEMA 4H67A 4EQ9A 1Y9UA 3W9WA 1IUDA 3T9HB 1WODA 2QSXA 4OXVA 3TTNA 2V3TA 1PBQA 3MZ1A 1P99A 1LB9A 1II5A 1O63A 3O2AA 2F78A 3MVYA 1ZBMA 4TLLB 1B52A 3O66A 5FHMA 2O68A 4R9FA 3TUSA 1RYOA 1CE2A 1SVXB 3FD3A 3FVGA 4ZECA 4GOTA 4NF6A 1MPDA 5AA2A 1SW5A 2I6EA 3C36A 5JK4A 2I3VA 1N3XA 4K3FA 2HAVA 3PUWE 4QFOA 4EF1A 3TCFA 4RXLA 2DXYA 4NF8A 4R6HA 1B2HA 1ZTYA 3IB2A 4DXBA 4ELOA 1SQYA 1LAGE 1TFAA 5I57B 3M3LA 3K6VA 1JNFA 5AE4A 4GL8A 2V93A 1ZKBA 4X48A 4GFRA 3MVZA 2KLFA 2O7IA 2F36A 3W9VA 4I8CA 4E0XA 1HSEA 5I56A 2XXTA 5DVJA 3I5OA 4PP0A 3SERA 1QUJA 4ZEIA 4U2RA 1IZ1A 2O1LA 1IEJA 4LZ8A 5EHSA 1TT1A 5ITOA 1OQGA 4YKKA 1YTVA 3OMBA 1NKXA 1LSTA 4WEDA 1HSLA 4RNSA 2HAUA 2Q88A 3IO4A 3FVKA 3SEUA 2XXQA 2D21A 2E0SA 3QXMA 4OYVA 4IO5A 2ZYMA 3PPNA 4XIGQ 2OZZA 4DE8A 4M1VA 2Y7RA 4WEPA 4GQOA 5F1QA 3TZAA 3C34A 4DIGA 3H06B 2Y7KA 5KDTA 1S50A 4FATA 1M5FA 2Q9TA 2V84A 3QUJA 2PVUA 4JSDA 4F39A 4GD5A 4THIA 4QRZA 1M5EA 4AB6A 3OSQA 4KFQA 2LAOA 2H5YA 1IQ7A 1B3HA 3S9MC 1XOCA 4R6KA 1YCJA 2ABHA 4H0WA 1D9VA 4XKQA 4G4PA 3TYHA 1BLFA 3RNNA 3H7MA 3OELA 5DYHA 4P0IA 3LC8A 4DXUA 2XHDA 1LFGA 4E0WA 3MZ9A 1LCTA 1A8EA 4KD5A 5H8HA 3PD8A 2RF1A 4MLQA 2P2AA 4QSEA 4TQUQ 2Q2AA 4FECA 2Z8FA 2R6GE 3BFTA 3VV5A 3M8UA 2PT1A 4TLMB 2ZNUA 4AQ4A 1URSA 1B3EA 3K6UA 4NWDA 5JTYA 4OTEA 4NF5A 4IGTA 3OO6A 1BP5A 3PMWA 3QK6A 4ZEBA 1LLSA 4QFLA 1MY1A 5CMCA 2DP8A 4DLDA 5HPQA 1NFTA 3E3KA 3MJNA 1UQWA 3P7IA 2XXYA 4OERA 1UTBB 5DTBA 1B4HA 1AMFA 1DTGA 3G3IA 1B05A 1MXVA 2HZLA 3GBAA 1B3GA 3IORA 5TPAA 4GLIA 4RK9A 1MY4A 4Q0CA 3PU5A 3TFLA 3MUQA 5AA4B 3KN8A 4FEBA 1B5HA 1MXXA 3PV0E 2UVGA 4OFOA 3OXNA 4TOZA 1B58A 5H8FB 1UIVA 3N5LA 3MP6A 2DSFA 2RC9A 3KG2A 3PPQA 3RGYA 3W15C 3S9EA 4R75A 2I49A 2OWSA 4YMBA 4LONB 3KZGA 3PPPA 3SESA 4MF3A 3FJ7A 1DOTA 3VDFA 5CM6A 3E9XA 3FJGA 4GVOA 3U1OA 1SYIA 2H99A 1LFHA 4DZ1A 1FTMA 1JVYA 2RC8A 3CFLA 1LFIA 1VSOA 2D3IA 3ILTB 2PYYA 5I59B 4BDOA 3EN3A 2OJTA 1A99A 2O69A 1M5DA 2RC7A 4PFWA 2F34A 4G68C 1MG1A 2DWHA 2QRYA 1NH7A 4QF9A 1YAEA 3RT8A 4QSCA 4NF4B 4HCWA 3HSTA 3PD9A 2ZMBA 1FQDA 4F1YA 4ZZEA 3GXAA 1EH3A 1B4ZA 4R9GA 3THIA 2XXIA 3OOAA 1MQDA 1MQHA 2FNCA 2Q8JA 3K2DA 3EQ1A 1DPPA 2XXPA 3VVFA 5I2NB 4YMAA 1UTHB 5I58B 3LSLA 1B3LA 2Z22A 3FXRA 4G2ZA 4ZEKA 5KCJB 2HZKA 2UXAA 3FV2A 3D4GA 4H5FA 3TCHA 4GWOA 1MXWA 4ELRA 2XX9A 3SKPA 1SI0A 1B0HA 1FQEA 1US4A 3G3HA 3R26A 3USDA 2DOJA 3VLVA 3LSXA 2G29A 1B7ZA 3RTFB 3EHUA 5BUUA 1CB6A 3PGFA 5H8QA 4NWCA 1LAXA 3DELB 2QS3A 1LB8A 5H8SA 1AH5A 3UGWA 3HCQA 4ECFA 5ELVA 1Y3QA 3MPKA 3ILUB 1B51A 3QAXA 3A09A 3KGCA 3FXUA 3MVXA 3HPIA 3MAMA 4IO3A 3FGSA 3TPAA 3TQWA 3MQ9A 2YPNA 3ZS6A 4ZZAA 2DXRA 4ESXA 4MFIA 2BJJX 3TAJA 1VFEA 2F97A 1MH3A 2OWTA 1QKBA 5HM4B 2AYSA 3FJMA 2R71A 4U4SA 1T0KA 3GZGA 3QIMA 2V3UA 4U1OA 5KZTA 3R6UA 1D4NA 3T9UA 4NF6B 3PPOA 5AA2B 4POXA 2F7CA 3B6TA 2PBWA 1NNTA 2UYFA 1S9TA 3IOWA 2DWJA 1PB8A 4XKRA 3TDJA 2F8DA 4NF8B 3H03A 3MWBA 3O6HA 1NNFA 3G3GA 2IEEA 4ND9A 1MY0A 4JXIA 5EHMA 1AOVA 1POY1 1JW4A 1XC1A 5AA1A 5IKBA 1M5BA 4UACA 1O7TA 4MBPA 1USYE 4F1VA 1MY3A 3T66A 3ZKLA 3RPWA 3TMGA 5I56B 1MM7A 1I6BA 2ZXTA 2B3FA 2PX1A 4YB7A 3IB1A 4YKIA 4F29A 3SEWA 3L6GA 1XS5A 4OESA 1B46A 2ONSA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1ELJA 4OFLA 4HXVA 1NV2A 4PFTA 2P3NA 3EHSA 1ANFA 3FVNA 2DYXA 4IO6A 5LOMA 4HTGA 2XD2A 2Y7PA 3GBBA 4PF8A 4LQ2A 4ZEDA 4G68A 4OFJA 3FV1A 1OMPA 4R74A 4BDNA 4O3BA 1MXUA 1N84A 4PFUA 4X9TA 4ELPA 4JWOA 5DVIA 4DI4B 3OO8A 2FHYA 5DEXA 1NI9A 5KDTB 4F22A 1GVCA 2Q74A 3OD7A 3CRBA 5H8NA 3PMVA 4EQ7A 4PE5B 4O3AA 3S9LC 4WXJA 4FIMA 4PF6A 3VVDA 3SDFA 4I40A 2THIA 3O9PA 4ISUA 5M2VA 1SW4A 2GHAA 1TXFA 4KR5A 1INPA 2NVUB 3IFAA 5TP9A 4KI0E 1H45A 4N13A 5K2XA 2H9BA 1B9JA 2H98A 1SD3A 4OMBA 1N04A 4U21A 1B7HA 3CIJA 3UIFA 5ITPA 1NL5A 2YJPA 3FVOA 3RQTA 2ZNSA 3UA8A 4G77A 2DS9A 4G8HA 2XXWA 5H8HB 4ONYA 3DLNA 4MNIA 1MPCA 5FTHA 2GRVA 5JEIA 4H46A 1B5IA 1Z7NE 2ONRA 4HE2A 3OO9A 1I6AA 1JVXA 4MX6A 1H43A 1TWYA 4MMPA 4GWYA 1N3WA 3VVEA 4RPNA 2CEYA 4IB2A 3LUYA 3LR1A 1QKAA 5L8DA 4BLAA 3CR9A 5JTYB 2I48A 4HS7A 4NF5B 3QUFA 1LAHE 4LATA 1N0TA 1A40A 4BDQA 1B32A 3E4RA 5L9OA 3U72A 1VFDA 4U4XA 1CNQA 4KYSA 1K9YA 3IX1A 4NTLA 1ZU0A 4OEVA 3QYTA 3ROJA 3KOSA 3O6IA 4PTKA 4RA1A 3K4UA 1N7XA 3TEPA 3E13X 1OVBA 1IXIA 2CZKA 5I5PA 2XXHA 1DMBA 4PC9A 3CG1A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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