1US5A

Putative glur0 ligand binding core with l-glutamate
Total Genus 103
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
103
sequence length
297
structure length
297
Chain Sequence
AQEFITIGSGSTTGVYFPVATGIAKLVNDANVGIRANARSTGGSVANINAINAGEFEMALAQNDIAYYAYQGCCIPAFEGKPVKTIRALAALYPEVVHVVARKDAGIRTVADLKGKRVVVGDVGSGTEQNARQILEAYGLTFDDLGQAIRVSASQGIQLMQDKRADALFYTVGLGASAIQQLALTTPIALVAVDLNRIQAIAKKYPFYVGFNIPGGTYKGVDVTTPTVAVQAMLIASERLSEETVYKFMKAVFGNLEAFKKIHPNLERFFGLEKAVKGLPIPLHPGAERFYKEAGVL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Structure of the Thermus Thermophilus Putative Periplasmic Glutamate/Glutamine-Binding Protein
pubmed doi rcsb
molecule keywords PUTATIVE GLUR0 LIGAND BINDING CORE
molecule tags Receptor
source organism Thermus thermophilus
total genus 103
structure length 297
sequence length 297
ec nomenclature
pdb deposition date 2003-11-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF16868 NMT1_3 NMT1-like family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1us5A02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1us5A01
3H6WA 1B0HA 2QS3A 1URSA 1WODA 1FTLA 2HAVA 1MQIA 1EZ9A 1FQBA 4ND9A 1OLCA 3CFLA 1OVTA 5DT6A 3IB0A 1MH3A 1MXVA 2ONSA 5KCJA 1AOVA 2UVGA 1MRPA 4O3AA 2QJEA 4QF9A 1YAEA 2ALUA 3S4UA 1MQHA 5KDTA 4OVJA 3UGWA 1O7TA 4GXAA 4NF5B 3AXFA 1UTHB 2QMXA 2V84A 4QFNA 1MG1A 3SETA 4YKPA 2AYSA 2IA4A 2I4BA 1D9VA 5ELVA 2DWAA 4YICA 2GFEA 5L9MA 3MP8A 1ATGA 4R73A 1MXUA 1USYE 2VHAA 4DCYA 1Y4CA 3V5AA 1B5HA 2V25A 4ZDMA 4HCWA 1NH7A 4JWOA 4OZ9A 5H8FA 1ZTYA 1UIUA 1SW2A 1Z7NE 5ICTA 3PUZE 1IIWA 2QS4A 5I84A 2YPNA 1OIBA 4U1OA 4JWYA 2D3IA 3LR1A 4JB7A 3SEUA 3VV5A 5M2VA 3ZKLA 4F2QA 4YU0A 3UA8A 2DOJA 3ILUB 3LUYA 1FW0A 3FUZA 3RTFB 4NTLA 2F7BA 1PB7A 4OFLA 3EPEA 4GF8A 4DCXA 1NMUA 4Q5TA 2NOOA 4I8CA 1MPDA 3KSXA 3F11A 1S50A 1MXXA 1MM7A 4KFQA 3K6UA 1M5EA 4PQJA 1B7UA 2RF1A 2M8CA 4G68C 5TP9A 2RC8A 3CG1A 4H65A 4WKMA 5CMKA 4JSDA 4QSDA 1Y20A 5CI5A 1B3HA 5CRYA 2Z22A 2ANJA 3OEKA 1N76A 1LAFE 1IXHA 4RPNA 3A09A 3KBRA 1XVXA 3GBAA 2O7IA 1B32A 4ZE9A 4EUOA 4RY1A 3UN6A 1AL3A 1VSOA 4M4GA 4MF3A 2Q8JA 4RXLA 2Z8EA 3PUWE 3CR9A 2DSFA 1R9LA 3H6UA 2OJTA 2RC9A 2ZNUA 1M5FA 5F7VA 4F18A 1LBCA 3EQ1A 1S7YA 3OD7A 3K2DA 2VGQA 2XX7A 3TYHA 4BDLA 3T9UA 1ELJA 3RUMA 5CMBA 3HV1A 1GR2A 2Y84A 3DP6A 4IO3A 3TMGA 4EF2A 3C34A 5JEIA 4IY5A 4ZEKA 2GRVA 3FVKA 4N13A 1ZMGA 3IK6B 4AB6A 1UQWA 4THIA 3B6TA 3IORA 4MLQA 4YZZA 1Y1ZA 3OOAA 3QIMA 2V3UA 3KJTA 5KZTA 2G29A 1M5BA 2D21A 4FJPA 3PPQA 1R9QA 2DWHA 3OEMA 3IOTA 3H6TA 1MY1A 1B3LA 3VXBA 3L6GA 2I4CA 5AA2A 3MC2A 1L5TA 2ZNTA 3K0VA 3T93B 1NFTA 4Z7EA 4YMBA 5I58A 1CE2A 1MXYA 4F1UA 4XTCQ 1N3WA 3SERA 3H06B 4GWOA 4ZECA 2XXIA 3DP8A 1KWHA 1JVXA 1B52A 2XXVA 1EU8A 4TQUQ 5F1QA 2ZYKA 5CMMA 3KG2A 1LBBA 2HCAA 1LCTA 3SESA 1H43A 3V89B 2V3TA 2UYFA 4LUBA 1I6BA 1PBPA 3I6VA 2UXAA 4I62A 1XS5A 3O6IA 4XXUA 4IB2A 4X1DA 1MY2A 4KYDA 5CC2A 4E0WA 3T66A 3H4ZA 1VE4A 1B51A 3PMWA 4FE8A 3N6UA 4OETA 3TCGA 3MAMA 5I2KA 1O63A 2DVCA 2OWTA 2WKYA 3R6UA 3IL1B 1JEUA 5AA1A 2Q2AA 1P1UA 1LLSA 1BIYA 2F7AA 4WEDA 1MDP1 4MFIA 1GGGA 3PPPA 3B7DA 3BBRA 1DTZA 4KQPA 5H8HA 4DE8A 1IXGA 4EDPA 3FJGA 2W7YA 3G3IA 1MXWA 1RYOA 3K4UA 3ECRA 4KYSA 1UTBB 3V83A 2X26A 3VVEA 3VLWA 4R6HA 3M3LA 4U2RA 3IJOB 5CM6A 3BKIB 4U22A 4AQ4A 2REJA 1LCFA 5TU0A 4X48A 3RN8A 4NF6A 2XX8A 3KZGA 3IOVA 4OERA 3O97A 4ESXA 3CFXA 5FHNA 4KPTA 3G3GA 1BLFA 2DYXA 1JVYA 4IO7A 3TKDA 4G2ZA 1JW1A 1PC3A 3VVFA 1B2HA 2A5TB 4U4XA 1B5JA 4NF4A 3GZGA 3OSRA 4C1TA 3RT6B 2ZNSA 2HQ0A 3O6HA 4YB5A 4YAHX 2HZLA 5I57B 4G8NA 4ESWA 4JDFA 1N0TA 1SVXB 5I56B 1QULA 5HM4B 4R9FA 3N94A 2H9BA 3CIJA 1P1WA 3FGSA 3SEWA 2FA7A 3RNNA 4ELRA 4KYEA 1H76A 3SKPA 5DEXA 2F8DA 4H8IA 3GLBA 1D3KA 5I2NA 3RTWB 2PX1A 1LAGE 3N26A 2H99A 3KJ7A 1OVBA 2I58A 5DVJA 2I0CA 4RA1A 1LFGA 3T22A 3KN3A 5EHMA 3EHTA 3KFMA 2H98A 3HHFA 3S9LC 3MW0A 1MQGA 1A40A 5A5XB 3MVYA 4NF8B 4EQ7A 3TDJA 1JQFA 4LA9A 1B3FA 3TQLA 3IB2A 1MH4A 1B1XA 1YPNA 1ZLQA 3MPKA 5FTHA 5ITPA 5BUUA 2V3QA 4H8JA 4HS7A 2RCBA 1I6AA 1SI1A 3FVNA 1BP5A 3KN8A 4QSCA 1B0LA 2P0SA 1TFDA 4XIGQ 3KN7A 3W9WA 1UTBA 1XVYA 2OZZA 3TPAA 1IXCA 3P7IA 3B6QA 3FV2A 2UVHA 4RK2A 3GXAA 3IAZA 1XOCA 2Y7RA 3LSWA 3Q29A 2DQVA 3CSBA 4R75A 3LBSA 1VR5A 2F36A 1DPPA 1HSLA 3TQWA 1QJMA 2GH9A 4F1YA 3TZAA 3PGFA 1FTJA 2PBWA 5B7DA 2OWSA 4U4SA 2NUVA 3OXNA 3MZBA 2PMSA 4OEUA 4F1VA 1NNPA 1MY3A 3A3UA 3SEYA 2XHDA 4OXVA 3G3FA 2VOZA 3SEXA 4LONB 2PVUA 4PE5B 2XXRA 4NWDA 4U1ZA 5I57A 4KHZE 4WEPA 1B9JA 3PD8A 2OCUA 4BDNA 1HSEA 5CBSA 3QSLA 4PFYA 4H6DA 1IITA 4L17A 1US4A 4MBPA 3OO8A 4HCYA 3USDA 1NL5A 3IR1A 4POXA 3ZKKA 2ZXTA 1MXZA 1S9TA 3O2AA 4F3PA 1GV8A 3MP6A 4F31B 5JK4A 2F78A 1MM6A 2Y7KA 4E0XA 1US5A 5EYFA 5ICQA 1ZBMA 2F35A 2RCAA 5FHOA 3K02A 4GL8A 1OQGA 1Q1KA 3A3CA 4GVOA 3D4GA 5JTYB 1DSNA 1DPEA 3PD9A 2R71A 3EN3A 3IOWA 1D9YA 2I3WA 3PV0E 4NF5A 4OFOA 1LSTA 1UTHA 4RK9A 2XXPA 3TCFA 4M1VA 3IO4A 3KOTA 1NNKA 5A5XA 3CI8A 1H3DA 4KI0E 1PBQA 1ZU0A 4R74A 4R6YA 3MUQA 1NNFA 3O66A 4F22A 3E13X 1A99A 3G3KA 5DYHA 3WAFA 1B40A 3U92A 2DE2A 3R7XA 3VLUA 4XKQA 3CRBA 3QYTA 2Q9TA 3RT8A 3OO9A 1DOTA 1SI0A 3DLNA 2Z23A 4XKRA 4HTGA 1SW4A 3LSFB 4PFWA 1PB8A 2XX9A 3MPLA 3K01A 4ZEBA 4KR5A 1FQEA 2X7PA 3OO7A 4ELPA 1B3GA 2ONRA 5K2YA 3FVOA 1DTGA 3S2VA 2PT2A 5CBRA 5I59B 4G77A 3TODA 4YKJA 2UVIA 3H7MA 2X7QA 4UA8A 3H03A 1B46A 4H0WA 3OENA 3KGCA 1P1NA 1M5DA 3FATA 4EQBA 2XXTA 1BKAA 3DP4A 2GHBA 3Q26A 5TPAB 2NWJA 1EZOA 4GRKA 3BFUA 4IY6A 5AA4B 3HSTA 3JYRA 1USYH 2VP1A 3EHSA 2F6GA 4GD5A 4LZ5A 4ZZAA 3Q28A 1P1OA 3K1NA 5HPQA 3LSLA 1B7ZA 4GIZA 5L9SA 1MS7A 3VXCA 3HO7A 3TAJA 3E4RA 3TCHA 4XKNA 1SW5A 4I1DA 4LQ2A 3JZJA 2OBGA 1B6HA 4DZ1A 3TFLA 1A7LA 2ESNA 5HBCA 2F97A 2Y7WA 1SYHA 1YTVA 4MH5A 3OSQA 3W15C 1ZIUA 3T9VA 3VE1B 2XXYA 2R9JA 4F3GA 5KCJB 4HW8A 2AL5A 5FTIA 5JTYA 3M8UA 4Z0IA 5IKBA 2DXYA 2THIA 2F5XA 3S9MC 4K3FA 1PB9A 2RC7A 4IO5A 2CMOA 2I0BA 4DLDA 5IAIA 1NKXA 4FAJA 1J1NA 1B3EA 4ZEFA 1Y1MA 4RPOA 4TLMB 4FIMA 3C4MA 3N6TA 4P11A 4BDMA 4Q30B 1FQAA 2B3BA 3U93A 1B58A 3QXMA 2FYIA 2I6EA 5ITOA 1XC1A 4H5GA 4X9TA 3T9XB 4ELQA 1SYIA 3MQ9A 4F3BA 1YCJA 4YMAA 1F9BA 5H8FB 2XD3A 4NE4A 3OO6A 4OMBA 1H44A 4XKPA 2Q2CA 1EH3A 4UACA 1FTMA 4F19A 3PPNA 1VFDA 2DE4A 2AL4A 3H6VA 3MVWA 4BDRA 1AIVA 3MZ9A 3IJXB 2OLBA 4JXIA 4EQ9A 4O3CA 2Y7PA 1N84A 2ZYMA 5TPAA 3D4CA 4QFPA 1T0KA 3K00A 4IO2A 5AA4A 4QHQA 4F2OA 1AMFA 1JETA 1Y9UA 2NXOA 5H8NB 3OMBA 2ZMBA 3O29A 3RLFE 3PMVA 4OEVA 3JV9A 4PP0A 3LC8A 1B1HA 3IB1A 4P0GA 3PUVE 3FXUA 4ZE8A 3T9HB 1D4NA 5TP9B 4P0IA 3ZS6A 3U94A 4H67A 4IO4A 1FTKA 3PUXE 4TOZA 1LFHA 1JEVA 4OYVA 2YJPA 1RKMA 2UYEA 2Z8DA 1MY4A 1SBPA 1B7HA 4PETA 2NVUB 1A55A 2H5YA 1TXFA 3G3JA 2Z8FA 2ONKE 3CFZA 5LOMA 2I48A 2PYYA 1QW0A 3PPRA 4OENA 5AA3A 1Y3QA 2RINA 2HEUA 4FEBA 2IEEA 4O3BA 4G8HA 5H8QB 3ODBA 3PPOA 2UVJA 1QVSA 5H8SA 2QPQA 4X1BA 4N07A 4GXSB 1JW5A 4GL0A 2QSXA 4GLIA 1Y3PA 1Q35A 3EHUA 4G8MA 1MY0A 1SQYA 4AB5A 4DDDA 4EXKA 1IEJA 2B3FA 3L6HA 3O28A 1B4ZA 3PU5A 4IO6A 2QRYA 4G68B 3ONMA 2P2AA 4DXBA 4Q0CA 2Q88A 1MQDA 1AH5A 2HFBA 1ZJLA 2E0SA 4I9DA 2DXRA 4ECFA 2CZLA 1SD3A 2XXWA 2XXHA 2DS9A 4RNSA 3RPWA 1ZKBA 5AA2D 3MP1A 1URDA 3K6VA 5B70A 3OELA 4ISUA 4JSOA 1N04A 5K2XA 3S9NC 3IOUA 4R9GA 1O64A 1Y4TA 5FHMA 2F34A 1P99A 4POWA 5L9OA 4GOTA 3W9VA 3E3KA 1RYXA 4RJZA 1JW4A 4QSEA 2A5TA 5J1DA 2O68A 5ISUA 1N7XA 5AA2B 2PT1A 4DXCA 3M3KA 4FECA 3FASA 4JBZA 4ZS9A 3UK4A 3FV1A 3I5OA 5I58B 3CSGA 1A8FA 3DM0A 3IO6A 4GQOA 3MJNA 5H8NA 4GFRA 5I56A 2E1SA 3HPIA 4EF1A 3WAEA 1SDXA 2O6AA 1IXIA 3K1PA 4H1XA 3MBPA 4BDOA 4IGRA 4FORA 1IQ7A 4IGTA 3TTRA 1FQCA 1MPBA 3UORA 1P1QA 3K1MA 4U23A 2ZYOA 3FXRA 2B65A 1LGBC 1UIVA 4PFTA 4OHNA 2XXXA 3FJ7A 3MVZA 3EF7A 1XT8A 3KSJA 1II5A 3TTKA 3QUJA 1NNTA 4ZEIA 1BTJA 1JNFA 1HSJA 4OFJA 5I2KB 3G3HA 1POTA 4OTEA 2HAUA 3I3VA 4DIGA 1WVJA 4NF8A 5H8QA 2QS1A 3O6GA 4OWDA 1LAHE 4LQ5A 4YB6A 4LATA 4ZEDA 5CMCA 3VVDA 1I69A 4JWXA 5DVFA 1LFIA 2XD2A 3MZ1A 5H8HB 1TFAA 4QFLA 4YKKA 4G68A 2F6PA 3TTLA 4EXLA 3SEVA 3CVGA 3FD3A 4G4PA 3TEPA 1PDAA 3U8QA 3V8XB 2VD2A 3BFTA 2Q89A 2VD3A 4FATA 3K6XA 1MPCA 1IUDA 1XHYA 1TT1A 3C35A 1Y3NA 3VFJA 1MDQA 4R2FA 1FQDA 5L8DA 4NF6B 3QAXA 4KCCA 2I49A 1MQJA 3U1OA 2ZYNA 1LB8A 2O51A 2DE3A 1R1NA 4NMYA 2RKMA 3FVGA 2HZKA 4LVQA 1A54A 4PFUA 4F3SA 4U21A 2V93A 1GTKA 1QKBA 3HN0A 3CG3A 4RYAA 1WDNA 1H45A 1R6ZA 3R26A 1ANFA 4NF4B 1M5CA 1OLAA 3QUFA 5DVIA 3ILTB 4F29A 4OESA 2H4IA 1A8EA 2DWJA 5DTBA 3SDFA 3MVXA 4H5FA 1DMBA 3RQTA 1QKAA 5BWJA 4NWCA 3THIA 1N3XA 3UIFA 1B5IA 2O1MA 3FJMA 4TLLB 3FZVA 1OMPA 3RY3A 3VDFA 2DVZA 3KOSA 3Q27A 2D5WA 3KEIA 5DEXB 1FQFA 4R2BA 3IX1A 4MLVA 5I2NB 3UP9A 1QUIA 3TUSA 2H25A 2DWIA 4LP2B 3TTMA 2O84X 2O69A 1FCKA 2DP8A 3C9HA 4FEDA 4ZZEA 1QUKA 4WXJA 3GBBA 2XXQA 5KDTB 4BDQA 1I6QA 2HXWA 3U72A 2YLNA 3TELA 3HCQA 3K6WA 4Q8RA 1SW1A 3T96B 2BJJX 4F39A 1QUJA 3G7WA 2F7CA 4C1UA 2AIXA 3E9XA 2G93A 3PUYE 2QL3A 3ZSFA 3PMXA 3LSXA 2R6GE 3M3FA 3VLVA 1LB9A 3N5LA 4ELOA 1IZ1A 3C31A 4C0RA 5EHSA 4NEDA 3S9EA 2O7UA 1N7WA 1NH8A 4BLAA 2QS2A 2REGA 2FNCA 1POY1 1VFEA 2I3VA 1EZPA 3HHGA 4YKIA 2LAOA 2A5SA 2GHAA 4KD5A 1OQHA 4LZ8A 2Y7IA 4N6PA 1FTOA 1GVCA 4R72A 1LAXA 3O9PA 3B6WA 4QFKA 1CB6A 4DXUA 5I59A 2O1LA 2ABHA 5AE4A 3FIRA 3H3GA 4QFOA 2XXUA 2KLFA 1B4HA 3QK6A 4KCDA 3C32A 3C36A 3MWBA 1B05A 1URGA 3TTNA 4QRZA 4YB7A 3FXQA 4ONYA 2OK2A 4R6KA 4LZ7A 3C33A 3DELB 1Z7ME 3RGYA 3Q25A 2P1SA 1PEBA 1TWYA 4OQOA 2QMWA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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