1US5A

Putative glur0 ligand binding core with l-glutamate
Total Genus 103
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
103
sequence length
297
structure length
297
Chain Sequence
AQEFITIGSGSTTGVYFPVATGIAKLVNDANVGIRANARSTGGSVANINAINAGEFEMALAQNDIAYYAYQGCCIPAFEGKPVKTIRALAALYPEVVHVVARKDAGIRTVADLKGKRVVVGDVGSGTEQNARQILEAYGLTFDDLGQAIRVSASQGIQLMQDKRADALFYTVGLGASAIQQLALTTPIALVAVDLNRIQAIAKKYPFYVGFNIPGGTYKGVDVTTPTVAVQAMLIASERLSEETVYKFMKAVFGNLEAFKKIHPNLERFFGLEKAVKGLPIPLHPGAERFYKEAGVL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Structure of the Thermus Thermophilus Putative Periplasmic Glutamate/Glutamine-Binding Protein
pubmed doi rcsb
molecule tags Receptor
source organism Thermus thermophilus
molecule keywords PUTATIVE GLUR0 LIGAND BINDING CORE
total genus 103
structure length 297
sequence length 297
ec nomenclature
pdb deposition date 2003-11-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF16868 NMT1_3 NMT1-like family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1us5A02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1us5A01
4XKNA 2F36A 1VFDA 1B4HA 4U21A 4OFLA 3CI8A 2O1LA 2HXWA 2ZYNA 2RCBA 4AQ4A 3TQLA 3G3IA 1J1NA 2Y7RA 2Q8JA 2XX7A 4KYEA 3E13X 1LB8A 4JXIA 2ABHA 3TYHA 4LZ8A 1PC3A 3PUZE 4TQUQ 1LBCA 1OLCA 3QK6A 2I58A 1SVXB 1Y3NA 4IGTA 1VFEA 3SEWA 1POTA 4KPTA 4ESWA 1IZ1A 4U4XA 3G3FA 5IKBA 4RK9A 1A8EA 3V89B 5CC2A 1CE2A 1B32A 2X7PA 3IO4A 1Y20A 3LUYA 4ESXA 1QW0A 2NWJA 4GXSB 1NMUA 3N6UA 1JVXA 1B46A 1MXXA 4QRZA 4XKPA 3KJTA 3ZKLA 3C4MA 5AA2D 2KLFA 4OESA 3ILUB 4ELQA 4LVQA 1H3DA 4OHNA 1DTZA 2Q89A 4THIA 5AA2B 1QKBA 2RINA 4OEVA 4QFNA 2PMSA 3O9PA 4GOTA 1FQDA 4O3BA 3N94A 4YB6A 3O29A 1LAHE 2A5SA 3G3JA 4RYAA 1A55A 3OO7A 3VV5A 3Q29A 2PT2A 2X26A 4K3FA 4NF4B 4YB7A 2QMXA 2BJJX 4C0RA 1O63A 3GBAA 4IO6A 2H99A 1QVSA 4O3CA 4C1UA 3HV1A 2UVJA 4LONB 1LB9A 3PPRA 4ELOA 2X7QA 4GQOA 1AOVA 1JNFA 3KOSA 4DIGA 1HSLA 5FHOA 1VSOA 1WODA 4YMBA 5A5XB 3AXFA 1R6ZA 1Y1ZA 4F1YA 1H43A 1BIYA 1FTMA 1ZKBA 4DCXA 3QUFA 4BDQA 4YKJA 2IEEA 4KYSA 4H8IA 5EHSA 3CG3A 2QS2A 1US4A 4MBPA 1S50A 1Y3PA 1GR2A 3JZJA 2XXTA 5JTYB 1Z7NE 4GLIA 4H5FA 3RT6B 1I6BA 2I3WA 2RC8A 5ITOA 5FTHA 3H6WA 4NF4A 5I59A 4KHZE 1ANFA 4WXJA 4EF2A 5ITPA 5L9MA 5FHMA 4QFKA 4HCWA 1B9JA 1DMBA 2Z8DA 2QJEA 5ELVA 1N84A 3U92A 2I49A 4BDLA 4RY1A 4IO4A 4LZ7A 4OXVA 3IOVA 1N0TA 2I4BA 2Z23A 1NKXA 5M2VA 3EHSA 4WEDA 3SEXA 4Q8RA 1DSNA 3G3GA 3VDFA 2GRVA 3IORA 2DOJA 4F2OA 1I6AA 1HSJA 4DXUA 5DEXA 4NF5B 3TCHA 1FQFA 1R1NA 4ONYA 2YJPA 3CFLA 3VLUA 2H4IA 4IY5A 4KR5A 5CI5A 1LFHA 1AL3A 3JYRA 3FVOA 2HAVA 2DE3A 3TTKA 5H8QA 1QUIA 1MPDA 3OSRA 1A7LA 3U94A 2DXRA 3SEVA 3K0VA 1B0HA 4FIMA 2XD3A 2RC7A 3FATA 3FV1A 4RK2A 3K02A 4R2BA 4KI0E 4IGRA 2R9JA 4H8JA 2XX9A 4QSEA 4YKKA 1UTHA 1PDAA 1MY0A 3D4CA 3VVDA 3TUSA 3DM0A 4MLQA 3FJMA 2G93A 1SD3A 2F6GA 5H8HA 5I57B 4R74A 3VVEA 1FTJA 1RYOA 3C36A 2D21A 3S9NC 1YAEA 4LZ5A 2HCAA 1L5TA 4F31B 1TFAA 1MG1A 3Q27A 1NNFA 3GLBA 4GL8A 5CM6A 2V25A 3O66A 2H25A 4F1VA 1IQ7A 3LC8A 3I5OA 3MWBA 3E9XA 4G68B 1IXCA 2VD3A 4NF6B 5I2NB 4ISUA 3WAEA 5CMCA 3PU5A 1MRPA 5KZTA 3KSXA 1UTBB 3SETA 3RQTA 4ZZAA 3VLVA 3MVZA 3BKIB 2RF1A 1IXGA 4GXAA 4Z7EA 3TAJA 4TLMB 2ZXTA 1DPEA 3QSLA 3G3KA 1BLFA 3HO7A 4FATA 1XVXA 2NOOA 3MZBA 2Q2AA 4Q30B 3OEMA 5H8NB 1TT1A 3PMWA 3MJNA 1JEUA 1M5BA 4G2ZA 2OZZA 5IAIA 5KDTB 5ISUA 1SI0A 3MW0A 4P11A 3M3KA 3OELA 2VP1A 2O69A 4N07A 3EN3A 4KYDA 2P1SA 4G77A 3DP6A 4OWDA 2I4CA 3PPNA 1P1OA 4EDPA 1MY1A 4PFYA 4G68A 4BDNA 3K1NA 1FTKA 4OVJA 3OENA 3MPLA 3MQ9A 4R6HA 4F22A 3IL1B 3F11A 3K4UA 4QFPA 1RYXA 2DWIA 2RC9A 1LAXA 5CBRA 1B05A 3RUMA 3PV0E 3RNNA 5I56B 3GBBA 2XD2A 3H03A 2ANJA 3VFJA 2DP8A 3M3LA 4GRKA 3C33A 4PETA 1MQGA 3MAMA 3UIFA 1MXYA 2QRYA 4NF8B 3QUJA 5B7DA 1ELJA 3BBRA 4M1VA 1LBBA 2F8DA 3IB0A 4GF8A 4U2RA 3TQWA 3A3UA 5L8DA 3G3HA 4P0IA 1JEVA 5H8NA 1EZOA 4G68C 3GZGA 5H8FA 3KJ7A 1QKAA 4JDFA 3CRBA 4LP2B 3TMGA 2UYEA 3PUWE 1B1XA 3K6UA 4F3GA 4PQJA 3OO8A 2HQ0A 4Q0CA 3TTLA 2IA4A 2LAOA 1B3FA 3RGYA 2THIA 1Z7ME 3IOUA 1EZ9A 1SBPA 3U72A 2D3IA 4HW8A 1MM6A 2F6PA 5I2KA 1TXFA 2Q88A 1A99A 5TPAB 4RPNA 3GXAA 1WVJA 1RKMA 3OO9A 5I58B 2R71A 3CR9A 3PD9A 4H1XA 3C35A 2H9BA 3MVYA 2FA7A 4EUOA 2A5TB 2DYXA 2XXPA 1B4ZA 2CZLA 4O3AA 3KFMA 1JQFA 4R6YA 4EXLA 4BDRA 2YLNA 1M5EA 3TCGA 2HFBA 3Q25A 3IO6A 5TP9B 1MPCA 3LSXA 4U22A 1WDNA 2F35A 1H44A 3MP6A 1M5CA 1ZMGA 4IO5A 1UQWA 3PMVA 3U8QA 4ND9A 4JWYA 3OMBA 3FXRA 5HBCA 5AE4A 4YZZA 3OD7A 4DXCA 1XS5A 1IIWA 4MF3A 3H06B 4ZEKA 2F78A 2VGQA 1MXVA 1FTOA 1D4NA 3S9EA 1N7XA 1YPNA 4DDDA 3K6WA 3FVGA 5L9SA 2O84X 4XIGQ 1FQCA 4OEUA 5L9OA 1Q1KA 3S9MC 1PEBA 1MY2A 1ZLQA 3SESA 3L6GA 3V83A 4YB5A 5TPAA 3PUXE 4QFLA 2V3TA 3CSBA 3S9LC 2PYYA 3MZ1A 4MH5A 3ECRA 2DWHA 2ZNUA 1R9LA 2F34A 4GD5A 3C31A 2P2AA 2XXWA 5JK4A 1PB8A 2Q9TA 3KG2A 2ONSA 3LSLA 5AA2A 1LFIA 2XX8A 3JV9A 2AIXA 1A40A 3C34A 1H76A 2G29A 2XXRA 3VLWA 3RLFE 4L17A 3P7IA 1OVBA 4XXUA 5DVJA 1EZPA 4R9GA 1LLSA 4I1DA 4BLAA 4Z0IA 3OEKA 5KCJB 1SW1A 2FYIA 4JBZA 3FXUA 3I6VA 1ZJLA 3Q26A 2REJA 1NL5A 2QSXA 4YAHX 4N6PA 1B0LA 2E0SA 3MP1A 3I3VA 5B70A 1YCJA 4JB7A 4KCDA 3QIMA 3HHGA 1AH5A 5AA4B 1FQBA 3PPPA 5A5XA 1BKAA 3IOTA 3T9HB 2B3BA 3SEUA 1OQGA 4EQ9A 2F7CA 1SI1A 4E0WA 3DP4A 2OWSA 1SQYA 1N3WA 1I69A 2ESNA 1OQHA 1MY3A 1P99A 2V3UA 4LA9A 1B6HA 2HAUA 2DE4A 1GV8A 1JW1A 5DT6A 3MVXA 2UXAA 3DLNA 3HCQA 4PFWA 5F7VA 3TTNA 1B5JA 1D3KA 3QYTA 3KSJA 5JTYA 5FHNA 4F3PA 2FNCA 3R7XA 1OVTA 2RKMA 3L6HA 3OOAA 3R26A 3W15C 3CSGA 3PMXA 4X9TA 4RJZA 3K1PA 4H6DA 3SDFA 4ECFA 1B5HA 2XXHA 4KD5A 4GVOA 3LSFB 5CRYA 3TCFA 5AA1A 3EHTA 2DXYA 5DVFA 3RY3A 2Y7KA 2Q2CA 3ODBA 3LSWA 3HSTA 1O64A 1M5FA 3C32A 5CMBA 4N13A 2ZNTA 5K2YA 3CIJA 3O2AA 1XVYA 3IJXB 1GTKA 4ZECA 4IY6A 1SW4A 5DTBA 2XXYA 1NNKA 2WKYA 2P0SA 3RTWB 4AB5A 1LAGE 1DTGA 3O97A 4TOZA 1ZIUA 1NNTA 3FJ7A 3PPQA 3TFLA 4BDMA 3K1MA 4F3BA 1B58A 3VXCA 3FUZA 3ILTB 3KN7A 1LSTA 4G8HA 4ELRA 1I6QA 1GGGA 3D4GA 4NF5A 3O6GA 1QJMA 1A54A 4YKPA 1JW5A 1N76A 4EF1A 4QF9A 3U93A 4FEBA 4NMYA 2OCUA 1URGA 2DQVA 4DE8A 4ZDMA 2PVUA 4E0XA 3MBPA 3PD8A 1URDA 4R72A 1QULA 4H67A 4F1UA 3BFTA 4KFQA 2VOZA 4G8MA 4MFIA 1HSEA 3O6HA 2QPQA 3CG1A 3K01A 3SKPA 3EHUA 3MUQA 4FORA 4P0GA 3H6TA 1Y4CA 2Y7IA 1B5IA 3KZGA 4IO2A 4F3SA 2I0CA 4TLLB 2PT1A 5CMKA 5I57A 1UIVA 4ZEDA 1Y3QA 2O6AA 1N7WA 4XKRA 4RNSA 3FJGA 1B52A 3B6QA 2ZMBA 3WAFA 4YICA 2GH9A 2XXXA 4AB6A 3UN6A 2OBGA 2W7YA 4OTEA 1Q35A 4NWCA 4OYVA 1MXZA 1B3EA 2GHBA 2XXUA 1VE4A 3IR1A 5I2NA 4NF6A 5AA3A 3T93B 2PX1A 1GVCA 1H45A 4ZE8A 1F9BA 3H6UA 1A8FA 1UTBA 2XXIA 5HM4B 4YKIA 3IOWA 1AMFA 4I9DA 3BFUA 3W9WA 2ZNSA 2I6EA 1XOCA 3OSQA 3N26A 2Z8FA 1R9QA 3O28A 5CBSA 2NXOA 1B1HA 1MQJA 1AIVA 1XT8A 4JSOA 2I48A 4OFOA 2F7BA 3TZAA 4BDOA 1QUKA 3TEPA 5JEIA 3KOTA 2E1SA 5EHMA 4OMBA 2DE2A 1VR5A 1US5A 3QAXA 4R2FA 4U1OA 3OO6A 3K2DA 4F2QA 2HEUA 1B40A 3H7MA 5DVIA 3LR1A 4PE5B 3ONMA 5KDTA 2V84A 2QMWA 3K6XA 1MXWA 3B7DA 1SYHA 1ATGA 2XXQA 3MPKA 3B6TA 1EH3A 4U23A 4POWA 1MH4A 3UORA 2ONKE 2XXVA 4LQ5A 2B65A 3MZ9A 2QS4A 2AYSA 3V8XB 3K00A 4EQBA 2I0BA 1LGBC 1B3HA 4MLVA 1P1QA 1CB6A 2Z22A 3MVWA 1O7TA 1SW5A 4OFJA 2VHAA 1MQHA 5I56A 4OERA 4X1BA 4DCYA 3EPEA 1KWHA 3T22A 3T9VA 1IITA 4RXLA 4POXA 2HZLA 1EU8A 1B7HA 1IXHA 4NF8A 2I3VA 2UVGA 5H8SA 3SERA 3OXNA 4HS7A 4PP0A 3T9UA 3TPAA 1LCTA 4DLDA 3ZSFA 4LUBA 1IEJA 4R9FA 3MP8A 3R6UA 4QSCA 3EF7A 2B3FA 1FCKA 3EQ1A 3KN3A 1UIUA 2DVZA 3IX1A 4OENA 5I59B 3MC2A 1ZTYA 2OK2A 3RT8A 4ZEIA 3T66A 3UP9A 4GIZA 5I58A 3IB1A 4H5GA 4Q5TA 3FGSA 4PFTA 4QFOA 4DXBA 1LCFA 4KQPA 4WKMA 2A5TA 4LATA 1SW2A 4OZ9A 4ZEFA 3W9VA 3CVGA 1Y4TA 2ZYKA 3PGFA 1USYH 1S9TA 2XHDA 5TP9A 3A09A 1B51A 4F19A 4X1DA 5ICQA 3FVKA 1D9VA 1Y9UA 3T96B 3T9XB 3THIA 3UK4A 3USDA 5DEXB 2QS3A 4IO3A 4FAJA 1TWYA 3ZS6A 2ZYOA 4R6KA 1SYIA 4H0WA 1FQAA 4FEDA 3IB2A 4GFRA 2DVCA 4ELPA 1MQIA 1IUDA 2NVUB 1P1UA 2DSFA 3DP8A 3PUVE 4KCCA 3ZKKA 5H8QB 1XC1A 1N3XA 4WEPA 1JW4A 4GWOA 4R75A 2DWJA 4YU0A 4OQOA 3TODA 4C1TA 4JSDA 4EQ7A 1DPPA 1B7ZA 4HCYA 1USYE 1ZBMA 1PBPA 4NEDA 1Y1MA 1PB9A 4I62A 1OLAA 4QHQA 1BP5A 1UTHB 4PFUA 1FW0A 2O1MA 4G8NA 5DYHA 2D5WA 1BTJA 3KGCA 3QXMA 5H8HB 2YPNA 4M4GA 1JETA 3IAZA 3RPWA 3S2VA 4FE8A 4HTGA 3UA8A 1B3GA 2GHAA 2V3QA 4JWOA 1NNPA 2VD2A 3H4ZA 2OJTA 1URSA 3LBSA 1SDXA 3CFXA 4JWXA 1MDP1 1YTVA 4R73A 3M8UA 2O68A 3S4UA 4YMAA 3VVFA 1MPBA 2F5XA 1N04A 5EYFA 1QUJA 1M5DA 1OMPA 2OLBA 4NE4A 2M8CA 1PB7A 5KCJA 4EXKA 2ONRA 3FVNA 4ZE9A 3TELA 2AL4A 3KEIA 2REGA 1MDQA 2CMOA 2ALUA 3M3FA 3K6VA 1P1WA 3FV2A 4H65A 1LAFE 2PBWA 3DELB 5AA4A 1MM7A 3N6TA 3IK6B 1MH3A 4XTCQ 3TDJA 2O7UA 5LOMA 3RTFB 4IB2A 4DZ1A 2ZYMA 1S7YA 1XHYA 4ZEBA 4LQ2A 3UGWA 1JVYA 4FECA 3Q28A 2F7AA 2RCAA 3B6WA 3FIRA 3E3KA 3C9HA 1DOTA 2NUVA 5FTIA 1MQDA 2AL5A 5BUUA 4F39A 2DS9A 1B2HA 4OETA 2GFEA 3FZVA 4NTLA 4U1ZA 1PBQA 3FD3A 2V93A 1LFGA 4UA8A 1MS7A 4F18A 4GL0A 3H6VA 3E4RA 3FASA 3V5AA 3KN8A 3HHFA 5BWJA 2UYFA 1T0KA 3H3GA 5ICTA 1NH8A 4NWDA 4RA1A 4I8CA 3TKDA 3KBRA 4X48A 4ZS9A 2OWTA 2F97A 1D9YA 3A3CA 2UVIA 4U4SA 3HN0A 1B7UA 1P1NA 3CFZA 1ZU0A 2UVHA 2H98A 3HPIA 3N5LA 3U1OA 2O7IA 5TU0A 2QL3A 4G4PA 5HPQA 1NH7A 4UACA 4XKQA 1FTLA 5F1QA 4RPOA 1NFTA 4ZZEA 1TFDA 5CMMA 3TTRA 5K2XA 5H8FB 3VE1B 1FQEA 2O51A 5J1DA 2Y7PA 5I84A 3FXQA 4FJPA 3PUYE 2Y84A 3PPOA 1IXIA 4QSDA 3G7WA 2QS1A 3TTMA 2HZKA 2Z8EA 3O6IA 1MY4A 1B3LA 5I2KB 2H5YA 1MXUA 1OIBA 1POY1 4F29A 2DWAA 4IO7A 3IJOB 3VXBA 3RN8A 3SEYA 2Y7WA 1II5A 2R6GE
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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