1UTHA

Dntr from burkholderia sp. strain dnt in complex with thiocyanate
Total Genus 61
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
61
sequence length
219
structure length
219
Chain Sequence
TRNSFDPFASTRTFNLAMTDIGEMYFMPPLMEALAQRAPHIQISTLRPNAGNLKEDMESGAVDLALGLLPELQTGFFQRRLFRHRYVCMFRKDHPSAKSPMSLKQFSELEHVGVVALNTGHGEVDGLLERAGIKRRMRLVVPHFIAIGPILHSTDLIATVPQRFAVRCEVPFGLTTSPHPAKLPDIAINLFWHAKYNRDPGNMWLRQLFVELFSEAHHH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transcription regulation
source organism Burkholderia sp.
publication title Development of a Bacterial Biosensor for Nitrotoluenes: The Crystal Structure of the Transcriptional Regulator Dntr
pubmed doi rcsb
molecule keywords LYSR-TYPE REGULATORY PROTEIN
total genus 61
structure length 219
sequence length 219
ec nomenclature
pdb deposition date 2003-12-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00126 HTH_1 Bacterial regulatory helix-turn-helix protein, lysR family
A PF03466 LysR_substrate LysR substrate binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1uthA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1uthA02
2QJEA 3D4CA 4X48A 1TFAA 3S9LC 3JYRA 1HSJA 2QS3A 3EHUA 5IAIA 1FTMA 2O69A 3G7WA 2QRYA 4QSDA 2NOOA 4FEBA 1A40A 1B4HA 3IX1A 3KSJA 3R26A 1AMFA 2HXWA 1SI1A 4ISUA 2ONRA 2AIXA 2XXHA 2Y7WA 1RYXA 4NWCA 2Z23A 4OEVA 2XX7A 5J1DA 1MQGA 4OERA 4KCCA 1SD3A 4PETA 2X7QA 2UVHA 4F29A 3W15C 2ZXTA 3EQ1A 3HHGA 3UN6A 1NH7A 2Q2AA 1AIVA 1NNTA 5I58A 3S4UA 4IO5A 2THIA 2IEEA 4ZEBA 2O6AA 3SDFA 3S2VA 1BP5A 4FAJA 5A5XA 5FHNA 1O63A 1SYIA 4G68C 5AA3A 5L8DA 4XKRA 4G77A 2Q2CA 4I62A 2RKMA 4XKNA 3TCFA 3MP8A 4KYSA 2GHBA 2DE4A 2VD3A 2ZNUA 3O2AA 5I2KB 2DXRA 5EYFA 1M5DA 2O1MA 1FCKA 4ND9A 3W9WA 4TLLB 3FJGA 2XXWA 2CMOA 2H98A 3IO6A 4C1TA 4LP2B 3PMXA 1XS5A 4YKPA 4JWOA 3IR1A 4IY6A 2QL3A 4NF6B 1ZU0A 4PFUA 4R75A 4H8IA 2A5TB 3MVWA 1MQIA 4F3BA 1SW2A 1XOCA 3KBRA 4OFLA 1AH5A 1MDP1 2O1LA 4QFOA 3Q26A 4HCYA 2H25A 4NF8B 4FIMA 2VP1A 1XVXA 3VXBA 4G68B 2I6EA 4X9TA 4PQJA 4YMAA 1H45A 5CMKA 2UVIA 2HAVA 1UIVA 3MWBA 4ZEDA 3H6VA 5I2KA 4QF9A 3DP4A 3FIRA 1EZ9A 2R71A 2ONKE 5HPQA 4ZE9A 3H4ZA 3TZAA 2X26A 5IKBA 2CZLA 1MS7A 2ZYMA 3U94A 3V83A 2OJTA 1FQDA 1D3KA 1JEUA 4OETA 4JWYA 3G3KA 4R6YA 1JETA 3K6XA 4MLVA 4N6PA 1LBCA 4Q0CA 4KR5A 1MXZA 4NF6A 2F8DA 3MAMA 1TT1A 4P0IA 2A5TA 4OEUA 2NVUB 2OZZA 4FECA 2OWTA 4H8JA 3HPIA 4G8HA 4XKQA 1I6AA 2VD2A 4NF8A 4QFKA 4GVOA 1MY1A 5KDTB 1LCTA 3SERA 4G68A 1OMPA 3KEIA 4EDPA 3UORA 4IY5A 1MXWA 1TFDA 2HZLA 4F1UA 4QRZA 3DP6A 3QK6A 1II5A 4U23A 2O84X 3C34A 1DSNA 4ONYA 1FTOA 2XXUA 2P0SA 2DE2A 2VOZA 1OLAA 2I49A 3PMWA 1EZOA 1EU8A 1GVCA 3K01A 2ZMBA 1FQBA 3H3GA 1R6ZA 1B7HA 4OFOA 1Y20A 4QFPA 2G29A 3UK4A 2UVJA 5B7DA 4N13A 4G8NA 4JXIA 5HBCA 3I5OA 4GRKA 3I6VA 1MXXA 4BLAA 4RJZA 3FV2A 4EUOA 1SW1A 3FZVA 3B7DA 3OO8A 3SEUA 3K4UA 3M3FA 4KYDA 3K02A 3OSRA 3A3UA 1MQHA 5DTBA 4R9FA 3CSGA 2RF1A 2BJJX 3E4RA 1SVXB 5KDTA 3KG2A 3VVEA 3U92A 2DE3A 4H5FA 4OENA 4OXVA 4YKKA 1URGA 4F22A 4GLIA 1EZPA 3TUSA 4LZ7A 1ZKBA 4FEDA 4OTEA 1S9TA 3FVNA 4ZEFA 1N84A 3MZBA 2ESNA 4R74A 1LB9A 4HW8A 1M5EA 3RNNA 2ZNTA 1A54A 4R73A 1LB8A 5FTHA 1DOTA 2XD3A 3G3HA 3TELA 5JK4A 2IA4A 3IJXB 3PUWE 4X1BA 3KSXA 3BFTA 4MBPA 2DWIA 5DYHA 5ICTA 4R6KA 5K2YA 3CG1A 3OELA 2QMWA 3V5AA 2PT1A 4F18A 1B9JA 5ELVA 3THIA 4YKJA 2F5XA 1B3EA 1CE2A 1IQ7A 4RPOA 1B7UA 4JB7A 3PV0E 4GF8A 3MP1A 3EN3A 4OMBA 4RPNA 3C31A 4QHQA 1R1NA 3M3LA 5CMMA 2NWJA 2I58A 2HCAA 4BDRA 1P1UA 5FHOA 3SKPA 1B52A 3H7MA 3K6UA 4PP0A 1PB9A 2RC7A 1S7YA 2YPNA 2DYXA 4DXUA 5M2VA 4DE8A 1SDXA 3RQTA 1MM7A 3Q25A 4YAHX 1LGBC 4JSOA 3T22A 2F35A 1QUKA 2YLNA 3LSFB 2ZYKA 5JTYB 4LQ2A 5I2NB 2GFEA 4U22A 1UQWA 3SEYA 4R2BA 4H6DA 3TQLA 1POY1 4O3AA 3RT8A 1MXVA 3T93B 4LVQA 4RXLA 3MP6A 4GXAA 4EXLA 2Z8DA 1B0LA 1WVJA 2GHAA 2UVGA 3MBPA 4AB6A 3VE1B 3RT6B 1Y1MA 2B3FA 3DM0A 2QMXA 1B5JA 2DOJA 4HCWA 2Y7IA 2ABHA 3VXCA 5H8FB 2Y7KA 3PD8A 2O51A 3H6WA 4JSDA 3O6GA 4EQBA 3KOTA 1H43A 2OCUA 4ZE8A 3H06B 2XXPA 1IUDA 3IK6B 4H67A 3LSWA 3T9UA 1UTHB 4DIGA 2PVUA 3OENA 4NTLA 3AXFA 2F7BA 3T9HB 1RKMA 5JTYA 4LONB 4XKPA 5I2NA 4MFIA 2FA7A 2NXOA 2DS9A 2F97A 3IOTA 4GL8A 2VHAA 1BKAA 3IORA 2FNCA 1N7WA 5I84A 3PGFA 3MPLA 2XX9A 1US4A 3B6QA 3GZGA 4GWOA 3TFLA 1MXUA 2V25A 3OO7A 3CFZA 1ZTYA 3Q29A 5H8NB 1DPEA 4GD5A 2RC8A 3C33A 3S9EA 1NMUA 2F6PA 4OVJA 1JNFA 2I3VA 1A99A 5H8FA 3E3KA 3Q27A 4UA8A 3PPPA 2OK2A 2XXRA 4IO6A 1IXCA 4PE5B 4ELRA 4NEDA 3C9HA 3HSTA 1I69A 4YU0A 2XXVA 2XXTA 4OESA 3ILTB 3C35A 4ELQA 2DWHA 1UTHA 4RA1A 2H4IA 3ZSFA 1ZIUA 1B58A 1B3FA 4LA9A 2HEUA 2PMSA 1Y3NA 3V8XB 5AA2B 2Z8FA 3K6WA 3TYHA 1LSTA 2RINA 3MUQA 3B6WA 4IGRA 1O64A 2F36A 1QJMA 1B2HA 4M1VA 5ITOA 1YTVA 3ZS6A 1DTGA 3RPWA 1S50A 5H8NA 4LQ5A 2DXYA 1NNFA 1RYOA 1MPCA 3FGSA 1OLCA 2Q88A 3GBBA 1F9BA 1VE4A 3OOAA 3IOUA 2D21A 2PYYA 3TQWA 4POXA 4ECFA 3PPNA 1FTLA 3G3IA 3RN8A 3PUXE 4XIGQ 4P11A 3CIJA 3KJTA 2Z8EA 3LBSA 3ZKKA 3BKIB 1Y3PA 3TTRA 4YZZA 2VGQA 3VFJA 2GH9A 3U93A 3VVDA 5EHMA 5K2XA 5DVJA 4Z7EA 2B3BA 3CSBA 1HSLA 5AA2A 3K1MA 5I57B 5DVFA 1QUJA 3RLFE 2I4BA 2R6GE 1GTKA 3PMVA 5CBRA 4RNSA 3DP8A 2B65A 4G4PA 4HS7A 1FQAA 3Q28A 4G8MA 2XD2A 3UP9A 4XXUA 4F3GA 1POTA 3IL1B 3FD3A 1A55A 3MVYA 3PUYE 5F7VA 1JW4A 1SYHA 3MVXA 1LLSA 5AA1A 3GXAA 1MH4A 3SEXA 1Q35A 1PC3A 4DLDA 3LSLA 4BDOA 4KFQA 1WDNA 1B40A 3OD7A 4ESWA 1PBQA 1JEVA 5ISUA 1HSEA 3OO9A 4EF2A 4PFWA 1NNKA 2Y84A 1OQHA 3TAJA 1B4ZA 5I57A 3FXUA 1FQCA 2AL4A 1B5IA 4BDNA 1M5CA 4YB7A 4U4SA 3IO4A 1QW0A 5L9SA 2REJA 3SEVA 3QUJA 4FORA 4I9DA 4BDQA 1URDA 2OBGA 2RC9A 2P1SA 3EF7A 1N3XA 4M4GA 1EH3A 4MF3A 5L9OA 4IO4A 1MXYA 3G3JA 1BLFA 4GOTA 5HM4B 2ZYOA 4L17A 1Y9UA 3MZ9A 3TCHA 3HV1A 2DQVA 4OFJA 1Y4TA 3QIMA 1JW5A 3P7IA 4H0WA 2QS1A 3N94A 4MLQA 3A3CA 1H44A 4PFTA 4ZEKA 1VR5A 1B5HA 4DCYA 5TP9B 3ZKLA 3KGCA 3BBRA 2F78A 4Q8RA 4F31B 1IEJA 1FW0A 1N04A 1QKBA 1H3DA 3B6TA 4WXJA 4E0WA 1GGGA 3FVGA 4GXSB 4MH5A 3ECRA 1B46A 3USDA 2W7YA 1D9YA 1NKXA 3GLBA 2XXXA 4IB2A 3IB1A 2Z22A 4DXBA 2DVZA 1B3LA 3S9MC 2OWSA 3HCQA 1N0TA 3PUZE 4AQ4A 1LFIA 2UYFA 3IJOB 5L9MA 1BTJA 4O3BA 5FTIA 2DWJA 4NE4A 4BDMA 4F39A 2O68A 5B70A 1N7XA 3PUVE 2UYEA 2REGA 4QSEA 4YICA 1B1XA 1Q1KA 2AYSA 1LAGE 2E0SA 4WEDA 2I0BA 1IIWA 1MH3A 2F7CA 4P0GA 4QFLA 5TP9A 3RGYA 2AL5A 1JVXA 3TTNA 3O6IA 3H6UA 1YCJA 2Q8JA 4H5GA 4JWXA 1ZJLA 2LAOA 3ODBA 3IOWA 3LC8A 3N6UA 1P1OA 2O7UA 3K1PA 1OVTA 4KCDA 1B6HA 5I56B 3TDJA 4QFNA 3FATA 5FHMA 4FJPA 4C1UA 1MPDA 2NUVA 3T9VA 3JZJA 4R9GA 4ELPA 4ZZAA 1QULA 3QXMA 4NF4B 3GBAA 2QS2A 1ZBMA 4WEPA 1AL3A 3OEKA 5CM6A 1B05A 4ZZEA 3FUZA 5AA4B 3HHFA 1Y3QA 3K00A 2V93A 3IB2A 3PU5A 5CC2A 1QVSA 4F19A 4FE8A 4IO3A 1KWHA 4THIA 4IO2A 1LFHA 4QSCA 1CB6A 3O66A 1TXFA 2H9BA 5I59B 2XX8A 2QSXA 4F1YA 5DVIA 2OLBA 4PFYA 1LAFE 1USYH 4OWDA 4IGTA 1T0KA 1A8EA 2DVCA 3TCGA 2I0CA 1MQDA 3KFMA 4BDLA 1FQFA 3SESA 3EPEA 1MQJA 5I56A 5JEIA 3FVKA 5KZTA 3PPRA 4U1OA 3K0VA 3UIFA 1JQFA 1ELJA 1N3WA 4OHNA 2RCAA 1VFEA 2F6GA 3OMBA 5LOMA 3O28A 2A5SA 3VLUA 3RUMA 1MY2A 2H99A 2XHDA 4NF4A 4RK9A 2PBWA 3TEPA 3C36A 3L6HA 3K6VA 1GV8A 5AA4A 1TWYA 4KQPA 2M8CA 3QUFA 4GIZA 2KLFA 1SI0A 1LFGA 4HTGA 1B3GA 1R9LA 4DXCA 5I59A 3T96B 4POWA 5CBSA 3PPOA 4EXKA 4EQ9A 3U72A 1N76A 3EHSA 3TKDA 1D4NA 2P2AA 2ZYNA 1FTJA 4EQ7A 3IOVA 1UTBB 4ZECA 1P99A 2HQ0A 3RTFB 3KZGA 4DZ1A 4ESXA 4YB5A 1MG1A 5TU0A 2PX1A 3ONMA 3KJ7A 3R6UA 1OVBA 5H8QB 2DP8A 3TPAA 4F1VA 1B0HA 1JW1A 4ZDMA 1QUIA 3QAXA 3HO7A 1SW5A 4UACA 3C32A 3UGWA 1DMBA 2ALUA 3CG3A 4LZ5A 3O29A 3EHTA 4NF5B 3MJNA 1DTZA 1MPBA 3TTKA 1YPNA 3RTWB 5TPAB 1USYE 4GFRA 2G93A 2HZKA 4H1XA 1PB8A 3LUYA 3QYTA 1IZ1A 1ZMGA 4OYVA 1NH8A 4FATA 3PPQA 1PBPA 2WKYA 1NNPA 2PT2A 2F34A 1OQGA 3SEWA 4JBZA 4I8CA 1J1NA 1UTBA 3E9XA 3N5LA 3MPKA 3MVZA 3F11A 3DELB 4OQOA 2R9JA 2ZNSA 4ELOA 3MZ1A 5ICQA 1M5BA 2E1SA 3M8UA 1M5FA 2D3IA 1B3HA 1IITA 1XHYA 1IXGA 3VV5A 5H8QA 4TLMB 4KD5A 4WKMA 3A09A 3OSQA 3WAEA 3IB0A 4C0RA 1SQYA 1IXHA 1AOVA 3TTMA 3K2DA 4NF5A 5CRYA 3VLWA 1O7TA 4Q5TA 4LATA 3G3FA 3VDFA 3TODA 1XC1A 5TPAA 3TTLA 5CMCA 4I1DA 4YKIA 3H6TA 4K3FA 5EHSA 3CI8A 1BIYA 4F2OA 2V84A 3BFUA 5ITPA 3KN3A 3RY3A 1B1HA 4YMBA 1OIBA 1US5A 2V3QA 1B7ZA 3KN7A 2Y7PA 2V3TA 1VFDA 4DCXA 3O6HA 4TOZA 3T66A 3V89B 3MC2A 4TQUQ 1MRPA 4GQOA 1QKAA 1Y4CA 2Q89A 1B32A 3UA8A 1LCFA 1LBBA 4RY1A 2O7IA 1H76A 1MY0A 3L6GA 3H03A 4KPTA 5CI5A 3G3GA 2DSFA 5H8HB 1A8FA 3OXNA 2YJPA 3KN8A 1D9VA 3CRBA 1SW4A 3QSLA 4U4XA 1JVYA 4KHZE 5AA2D 1R9QA 1P1NA 3N6TA 2XXQA 3E13X 2I4CA 4KI0E 3FXRA 2V3UA 1A7LA 3DLNA 2X7PA 1PB7A 3D4GA 5BWJA 3ILUB 3TMGA 1IXIA 4RYAA 4R2FA 4E0XA 1XVYA 4R6HA 4DDDA 3MQ9A 4U2RA 3U8QA 4AB5A 1Y1ZA 1I6BA 1MY4A 5DEXB 1UIUA 3FV1A 3O9PA 1I6QA 1FTKA 1YAEA 4ZEIA 2Y7RA 1NFTA 1ANFA 4F2QA 4R72A 3JV9A 4F3PA 3S9NC 3HN0A 3SETA 3FASA 4N07A 3MW0A 1LAXA 3FVOA 3FJMA 2GRVA 3FXQA 2I3WA 3WAFA 4ZS9A 4F3SA 4YB6A 5H8SA 2ONSA 4NMYA 4U21A 3T9XB 4G2ZA 4RK2A 4LUBA 3W9VA 3OEMA 4OZ9A 1MY3A 5CMBA 5H8HA 1PDAA 2HFBA 5AE4A 3LR1A 3N26A 3OO6A 4Q30B 5KCJB 3R7XA 1PEBA 3FJ7A 3M3KA 4XTCQ 3CFXA 1XT8A 4U1ZA 1SBPA 1FQEA 4Z0IA 5DT6A 3VVFA 1ZLQA 1LAHE 4EF1A 4GL0A 2QPQA 2HAUA 2F7AA 2UXAA 3U1OA 4X1DA 2H5YA 2DWAA 1GR2A 1Z7ME 5DEXA 4KYEA 3C4MA 2XXIA 4JDFA 1Z7NE 3LSXA 4LZ8A 1NL5A 1WODA 5BUUA 1MDQA 3I3VA 1DPPA 3KOSA 4O3CA 5F1QA 3CR9A 2Q9TA 2FYIA 1B51A 3VLVA 1MM6A 2XXYA 5I58B 1VSOA 1URSA 1L5TA 2I48A 1P1WA 2ANJA 2D5WA 3O97A 5A5XB 3IAZA 1P1QA 3K1NA 2QS4A 3CVGA 5KCJA 1ATGA 3PD9A 4NWDA 3CFLA 4IO7A 4H65A 2RCBA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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