1UTHA

Dntr from burkholderia sp. strain dnt in complex with thiocyanate
Total Genus 61
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
61
sequence length
219
structure length
219
Chain Sequence
TRNSFDPFASTRTFNLAMTDIGEMYFMPPLMEALAQRAPHIQISTLRPNAGNLKEDMESGAVDLALGLLPELQTGFFQRRLFRHRYVCMFRKDHPSAKSPMSLKQFSELEHVGVVALNTGHGEVDGLLERAGIKRRMRLVVPHFIAIGPILHSTDLIATVPQRFAVRCEVPFGLTTSPHPAKLPDIAINLFWHAKYNRDPGNMWLRQLFVELFSEAHHH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Development of a Bacterial Biosensor for Nitrotoluenes: The Crystal Structure of the Transcriptional Regulator Dntr
pubmed doi rcsb
source organism Burkholderia sp.
molecule tags Transcription regulation
molecule keywords LYSR-TYPE REGULATORY PROTEIN
total genus 61
structure length 219
sequence length 219
ec nomenclature
pdb deposition date 2003-12-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00126 HTH_1 Bacterial regulatory helix-turn-helix protein, lysR family
A PF03466 LysR_substrate LysR substrate binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1uthA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1uthA02
3W9WA 3EQ1A 3B6QA 2GHBA 4QSCA 3U94A 3T66A 3LR1A 3T93B 5I56B 2UVJA 1O63A 1POTA 3LSFB 3SEVA 2DP8A 2F34A 2GFEA 3A3UA 3O97A 1LAGE 1Y4TA 3K2DA 3TKDA 1GVCA 3OOAA 1B46A 4R6YA 1N84A 2ESNA 1UTHB 2KLFA 3ECRA 2Z8FA 1S7YA 2Y7KA 3I3VA 4BLAA 5KZTA 5ICQA 1ATGA 4LUBA 4YKIA 2PBWA 1MRPA 4RPOA 1MY4A 5L9SA 2R71A 4Q30B 4OTEA 4EXLA 2Q2CA 1B5IA 1SW2A 3RY3A 3K4UA 1SW1A 4L17A 2UXAA 5K2YA 2O7IA 2QS2A 1XVYA 2V25A 3LSLA 4RYAA 1NNFA 2I3VA 1IZ1A 1XHYA 2W7YA 2Z23A 1BIYA 4KHZE 3PD8A 1PDAA 1M5DA 4F39A 2XXRA 4GWOA 5TU0A 1S50A 4KYDA 3T9VA 3V89B 4DDDA 5JEIA 4XXUA 2I4BA 1MXVA 3FVOA 4H6DA 1B1HA 2RC7A 3EHUA 3M3KA 4POWA 2NXOA 2B3BA 2NWJA 5CC2A 4TOZA 4E0WA 1CB6A 1FQCA 2RC9A 4YZZA 4LZ8A 3W15C 5KDTA 1PB8A 2RINA 3K6VA 1UTHA 3QIMA 2F5XA 1AIVA 1B2HA 3MZBA 3U8QA 3IX1A 4RY1A 4ELPA 3BKIB 1LCTA 2OJTA 1Y4CA 3FV2A 4H67A 4R6KA 1MDP1 2HXWA 5ITPA 1FQAA 1Y1ZA 4EDPA 1Q1KA 3OO6A 3N6TA 2OWTA 2O84X 4UACA 1OQGA 1US5A 3Q27A 4ZE8A 3RQTA 4DLDA 3MUQA 4NF8B 4GOTA 1N7XA 5CM6A 1URSA 4FATA 4O3AA 3UIFA 2HFBA 3D4GA 3EHTA 4LONB 2M8CA 5DVFA 2I4CA 2RKMA 3K0VA 3Q28A 1MXXA 1ZKBA 4QSDA 1AMFA 3K02A 4NTLA 3Q26A 2QPQA 4DE8A 1HSLA 1ZBMA 4ZZAA 2GHAA 2XXQA 4F1YA 4F2OA 4EF2A 1DTZA 5H8HB 2V84A 3DELB 4NF4A 1GR2A 1TT1A 1N76A 1M5BA 2QS4A 2CZLA 2QMXA 2R9JA 4DZ1A 2XX7A 4DXCA 3PPOA 5FHNA 1A54A 3GBBA 3MJNA 4G8MA 4OFOA 3FZVA 4QFNA 3TCFA 4FAJA 2B3FA 1B7HA 1AH5A 1II5A 4WEPA 5HBCA 4LA9A 2UVHA 4JWYA 4DIGA 1LAHE 1H76A 2AIXA 2I0BA 3KN7A 3PV0E 1PBPA 1US4A 4G68A 4KYEA 4LZ7A 4TLMB 3RNNA 1I6BA 1I6AA 1SYHA 3VDFA 3RPWA 1JW1A 1TXFA 1ZIUA 2R6GE 3A09A 3KJ7A 2DVCA 1JEVA 3KN8A 3OEMA 4FECA 4OEVA 4F1VA 4EXKA 4GVOA 4XKQA 5DT6A 1HSJA 4IO5A 3PPQA 4OESA 5B70A 2YJPA 4E0XA 1TWYA 4ELQA 4MBPA 4IGRA 3OO7A 1NKXA 4NWDA 4G8NA 1BTJA 1A8FA 1I69A 4RNSA 1B05A 2PVUA 1SDXA 4IGTA 5DVJA 1B7ZA 1FQDA 3H03A 4OYVA 4TQUQ 5AA2D 1MPDA 1FTMA 3VV5A 3CG1A 1O64A 1IXGA 4GQOA 4JDFA 4OQOA 2XXUA 3TAJA 4BDOA 5I59A 3S9EA 2WKYA 3TEPA 2Z8DA 1URGA 3T96B 3V5AA 3HPIA 2REJA 5I59B 4QRZA 4NF6B 2DE2A 4GFRA 1N3XA 4LVQA 4THIA 1ZTYA 1M5FA 2Y7PA 3C9HA 3IOVA 1L5TA 3N5LA 4DCXA 4EQ9A 5AE4A 2HQ0A 3VVEA 4LZ5A 3E4RA 1Y20A 2DWHA 1R6ZA 3OXNA 1MY1A 2VD2A 4ELOA 1SBPA 4ZEBA 1M5EA 3T9HB 2YLNA 3OD7A 3FATA 3UK4A 2YPNA 1A40A 3FVNA 4U23A 3SETA 2Q89A 1B3FA 1SD3A 1SI1A 1IQ7A 4KQPA 3THIA 3IAZA 2UYEA 4FEBA 1B9JA 4N6PA 4U1ZA 1RYOA 4TLLB 3EHSA 2UYFA 4Z0IA 2REGA 1WVJA 4M4GA 3TELA 3K1MA 1XC1A 4IY6A 1UQWA 2D5WA 3FVKA 3HN0A 3PMXA 4RK9A 4F1UA 1POY1 4YU0A 4PQJA 4EF1A 2ZMBA 3FXUA 3CFXA 3KGCA 2RF1A 4ZZEA 1XT8A 1GV8A 1NNPA 4NEDA 1VFEA 3FJ7A 3MZ9A 4R6HA 1VR5A 3TTLA 3LSXA 3MVYA 3ZS6A 1UIVA 1IXHA 4I1DA 1F9BA 4ZEKA 1P1QA 4NF5A 1D9YA 1UIUA 3MP6A 3DP8A 1ZJLA 4KR5A 3IORA 3I5OA 5H8NA 3G3FA 1A7LA 3RLFE 2Y7RA 3QSLA 2HZKA 1EZOA 1MY3A 2XXWA 2XXTA 4PE5B 4PP0A 1B3EA 3U93A 2DVZA 1JNFA 1D9VA 1LGBC 3PUWE 2F6GA 2QMWA 3KSXA 4O3BA 3SEYA 3HSTA 5KCJA 4H0WA 4LP2B 3TTRA 1LAXA 1RKMA 4PFWA 3QXMA 5F1QA 3TODA 3EF7A 2XXPA 1NFTA 4JXIA 4YMBA 1MQHA 2G29A 2I6EA 1B1XA 2I0CA 4QFOA 2ANJA 3TTKA 4C1UA 4H5FA 3M3LA 2O51A 4H8IA 1QUJA 1LB9A 2P0SA 1MPBA 1MH3A 4H8JA 4BDRA 4G68B 3OMBA 4LQ2A 1FQEA 1FCKA 1MXYA 2FNCA 3R26A 3AXFA 3HHFA 4YB7A 3FD3A 1MM6A 2QJEA 3RTWB 5CMMA 1FQBA 3UA8A 1ELJA 4RJZA 1FTOA 2F97A 5H8QA 1P1OA 4K3FA 3OSQA 3BFUA 3O6IA 4FEDA 1OVTA 4IO6A 2VD3A 2ZYMA 4R72A 4EQBA 4GL0A 1PB7A 4X1BA 1B5JA 2HAVA 3MWBA 4P0GA 1GGGA 1MQIA 3G3IA 4ESWA 2XXXA 2G93A 4KYSA 3H06B 3Q25A 1LLSA 1PEBA 3P7IA 4JSDA 4P0IA 1OIBA 1FTJA 1ZLQA 1URDA 5DTBA 3S9MC 2I3WA 3FJMA 1MXWA 1YAEA 2Z22A 2XX9A 1MQJA 3M3FA 3R6UA 4Q5TA 3TZAA 3FXRA 1LCFA 4OFJA 3OO8A 3KFMA 2UVIA 3ZKLA 2XXHA 4ZEIA 4C0RA 2HZLA 2QSXA 4BDMA 5CBSA 4KCDA 3TDJA 1YTVA 2DXRA 3QUJA 2ONSA 4Q0CA 4IB2A 3V8XB 5H8FA 5DEXB 1B7UA 4OVJA 2AYSA 5IAIA 4X1DA 3KG2A 5EHMA 3IJXB 2PX1A 4BDQA 3H4ZA 3M8UA 4OFLA 1P1NA 2BJJX 2DWAA 1J1NA 4ESXA 3FIRA 1TFAA 5JK4A 1B0HA 2XXIA 1B51A 2FA7A 2QRYA 2Q8JA 1GTKA 1UTBA 4JB7A 4MLQA 2DYXA 4Q8RA 4HCYA 3MPKA 4NF6A 1JEUA 1WODA 4XIGQ 1UTBB 5AA1A 4F3GA 3MC2A 4JSOA 3SESA 2V3UA 3B6WA 5I57A 3VVDA 5CI5A 3PMWA 3QAXA 3H3GA 3VXBA 1OMPA 1LAFE 2AL5A 1FW0A 3HO7A 3E3KA 4Z7EA 2QS1A 3B6TA 5IKBA 1DOTA 2F7AA 1Y3QA 4R2FA 5L9OA 3IB1A 1KWHA 1H45A 3UP9A 1OVBA 3JV9A 4ISUA 3BFTA 3HV1A 3IK6B 4NWCA 4WKMA 4AB6A 1B58A 4ELRA 4OETA 1R1NA 4IO7A 2H98A 1OQHA 2DSFA 2ZYKA 2OZZA 3K6UA 1N7WA 5H8NB 4ONYA 5I58B 5LOMA 3OO9A 4QFKA 4YB6A 4JBZA 1EU8A 2IA4A 3ILTB 4U22A 5I84A 1NNTA 3H6VA 4M1VA 3QUFA 2O6AA 3CIJA 3ODBA 4JWXA 4XTCQ 1LB8A 1LBCA 4PFYA 5JTYB 2Z8EA 4LQ5A 2ONRA 1NMUA 3DLNA 3EN3A 3Q29A 3SEUA 4F22A 1MXUA 1N0TA 3KBRA 3IOTA 3ONMA 3PGFA 1B5HA 5L8DA 5EYFA 4WEDA 3SERA 5AA4B 1IITA 1QKBA 3QYTA 3MVXA 2VGQA 1MS7A 1IUDA 4QFPA 4YKJA 5I2KB 5DEXA 3LC8A 3WAFA 5H8SA 3U92A 3MP8A 1A8EA 3KZGA 5FTHA 2H4IA 3IB0A 4YKPA 3TCHA 1MQGA 1H3DA 3VFJA 3TCGA 1N3WA 1NH8A 1DPEA 3G7WA 3K1NA 4F2QA 3K6XA 2A5TB 2Q9TA 5A5XB 3CG3A 2NUVA 1LSTA 1B3LA 2OK2A 3CSBA 3CSGA 3IO4A 1QVSA 4YAHX 3U1OA 4U4SA 4ZECA 3S4UA 4ZS9A 5HPQA 5ELVA 3H6UA 3BBRA 1P99A 5F7VA 5TPAB 2HEUA 4PFTA 3N6UA 1A55A 1IXCA 3W9VA 2V3TA 5K2XA 3RT6B 5CRYA 3G3HA 3N94A 1QUIA 4R9FA 5FHMA 1JQFA 1QULA 1MXZA 3CRBA 4ZEFA 2X7PA 1JW4A 1EZ9A 3PUVE 2ZYOA 3C36A 4I8CA 1RYXA 4NF5B 3SKPA 4F19A 4YMAA 1XS5A 2DQVA 2VHAA 2XD3A 1PBQA 3S9LC 4OEUA 1JW5A 2QL3A 4F3BA 3E13X 5I2NA 3T22A 1B0LA 3CFLA 4U2RA 1Z7NE 4G4PA 4ECFA 1NH7A 4G8HA 4WXJA 1MM7A 2F35A 4AQ4A 2UVGA 2VP1A 3ILUB 3KN3A 3LUYA 3MQ9A 4X9TA 1PB9A 4OERA 1JVYA 3OELA 1LFGA 1SW5A 3O28A 3IOUA 5DVIA 4F18A 4P11A 2O7UA 3I6VA 2F8DA 3G3GA 3TMGA 4IO4A 2O68A 3VLUA 1MDQA 1OLCA 4QHQA 4GIZA 2HAUA 3DP4A 1A99A 4IO2A 4IY5A 1MY0A 2I48A 1I6QA 1FQFA 1NL5A 4OZ9A 5AA3A 2ZNUA 3LSWA 4O3CA 3OSRA 3USDA 2P1SA 1N04A 3VXCA 1B4ZA 3T9XB 1LFHA 4GLIA 1Q35A 2X26A 2DWIA 4KFQA 5J1DA 2FYIA 1XOCA 4U21A 3CFZA 4NF8A 3UORA 3VLVA 1IXIA 1SQYA 2XXYA 1YCJA 1Y1MA 1Y9UA 1D4NA 1LFIA 3UN6A 3TQWA 3IOWA 1IEJA 1VSOA 2GH9A 4XKPA 1B40A 5TPAA 4N13A 3D4CA 1B6HA 1SYIA 3OENA 4LATA 3U72A 1T0KA 3KSJA 1H43A 5FTIA 3S2VA 3H6WA 1AL3A 2P2AA 3PUXE 4FE8A 1TFDA 2I58A 1H44A 5M2VA 3V83A 3MPLA 3O6HA 4FORA 1NNKA 1R9QA 4RA1A 2O1MA 4BDLA 1R9LA 3K01A 1WDNA 3R7XA 1ZU0A 2OBGA 3TTMA 3C34A 3G3KA 5AA2B 4I62A 1USYE 1BKAA 2XHDA 3DP6A 5L9MA 3SEWA 3T9UA 1O7TA 3K1PA 2F78A 4HCWA 3TFLA 1D3KA 3CI8A 3FJGA 4ND9A 2E1SA 2F7CA 4AB5A 2PT2A 2A5SA 2O1LA 3PU5A 4OENA 4U1OA 4XKNA 1OLAA 3JZJA 4YKKA 5I2KA 2VOZA 3PPRA 2V3QA 4MF3A 3C31A 2DE3A 4EQ7A 2RCAA 1P1UA 4QSEA 3TYHA 4BDNA 3MVWA 4KI0E 2ZXTA 3C4MA 4G68C 5DYHA 5ITOA 1Z7ME 3C35A 5CMBA 2XD2A 3SDFA 3SEXA 4XKRA 5CMCA 2AL4A 4H65A 5H8QB 5FHOA 5ICTA 4GXAA 5JTYA 1XVXA 4I9DA 4GF8A 2PYYA 2XXVA 3FVGA 3LBSA 2GRVA 4HTGA 4DCYA 3TQLA 3ZSFA 2E0SA 4U4XA 4DXBA 5AA4A 4ZDMA 2HCAA 4F3SA 1LBBA 3OEKA 4MLVA 1ANFA 3O6GA 4NMYA 4NE4A 2PMSA 3PPPA 1BP5A 3MVZA 1VE4A 3PUZE 3PUYE 4QF9A 2DE4A 4MH5A 4H1XA 1Y3NA 2H25A 4MFIA 1DSNA 2OLBA 5EHSA 5AA2A 4G77A 1MG1A 2Q88A 3CR9A 2RC8A 2ABHA 5TP9B 2ONKE 5CMKA 3GZGA 5HM4B 4F31B 3F11A 4R9GA 5I58A 2H99A 4RK2A 5ISUA 1QW0A 3L6GA 2DXYA 1FTKA 4QFLA 3S9NC 4ZEDA 1MH4A 2F7BA 3PPNA 1JVXA 1CE2A 4PFUA 1SI0A 3IR1A 1QKAA 3N26A 3IJOB 4POXA 1DTGA 1ZMGA 1IIWA 4FJPA 5B7DA 2ZYNA 3MP1A 3KOTA 3L6HA 4PETA 4HW8A 1B3HA 2D3IA 2F36A 3FASA 3HHGA 4OXVA 3PMVA 4F29A 3RTFB 4RXLA 1B3GA 3FGSA 1MQDA 3H6TA 3RN8A 3TUSA 4FIMA 3C32A 2I49A 2Y84A 2OWSA 1JETA 2ZNSA 3IO6A 3PD9A 5H8FB 1SW4A 3VLWA 1P1WA 3O29A 5I56A 1AOVA 5KDTB 1USYH 1EH3A 2A5TA 3FV1A 3HCQA 4GD5A 3GXAA 2NVUB 3GLBA 2LAOA 3VVFA 3WAEA 2ZNTA 3DM0A 5TP9A 2B65A 3H7MA 2IEEA 1B32A 3ZKKA 1Y3PA 2O69A 3B7DA 2H9BA 1B52A 2THIA 1YPNA 2D21A 3CVGA 1S9TA 3MZ1A 3E9XA 5BUUA 4EUOA 3EPEA 2H5YA 2Y7IA 4OHNA 3O2AA 2ALUA 1FTLA 1PC3A 1M5CA 1DPPA 4IO3A 4KD5A 2Y7WA 3MW0A 3RUMA 5I2NB 4X48A 3KJTA 3RT8A 3G3JA 1EZPA 2RCBA 3A3CA 4R2BA 3K6WA 3GBAA 2DWJA 3MAMA 2DS9A 3O9PA 4YB5A 1HSEA 3RGYA 1B4HA 3TPAA 3TTNA 2OCUA 1MPCA 2PT1A 4HS7A 4KCCA 2CMOA 3MBPA 2NOOA 2V93A 4N07A 4R73A 4NF4B 4OMBA 1MY2A 3KOSA 2X7QA 2Q2AA 1VFDA 3QK6A 5H8HA 3UGWA 3C33A 5CBRA 2F6PA 1QJMA 4OWDA 2QS3A 4ZE9A 3FXQA 5BWJA 5KCJB 1DMBA 2XX8A 3FUZA 1SVXB 3KEIA 3JYRA 1BLFA 4GRKA 4GXSB 4H5GA 4R74A 2DOJA 4G2ZA 3VE1B 4KPTA 4DXUA 4YICA 5A5XA 4UA8A 5I57B 3IL1B 4RPNA 3K00A 1QUKA 4R75A 4JWOA 4C1TA 4GL8A 3O66A 4F3PA 3IB2A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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