1UTHA

Dntr from burkholderia sp. strain dnt in complex with thiocyanate
Total Genus 61
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
61
sequence length
219
structure length
219
Chain Sequence
TRNSFDPFASTRTFNLAMTDIGEMYFMPPLMEALAQRAPHIQISTLRPNAGNLKEDMESGAVDLALGLLPELQTGFFQRRLFRHRYVCMFRKDHPSAKSPMSLKQFSELEHVGVVALNTGHGEVDGLLERAGIKRRMRLVVPHFIAIGPILHSTDLIATVPQRFAVRCEVPFGLTTSPHPAKLPDIAINLFWHAKYNRDPGNMWLRQLFVELFSEAHHH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Development of a Bacterial Biosensor for Nitrotoluenes: The Crystal Structure of the Transcriptional Regulator Dntr
pubmed doi rcsb
source organism Burkholderia sp.
molecule tags Transcription regulation
molecule keywords LYSR-TYPE REGULATORY PROTEIN
total genus 61
structure length 219
sequence length 219
ec nomenclature
pdb deposition date 2003-12-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00126 HTH_1 Bacterial regulatory helix-turn-helix protein, lysR family
A PF03466 LysR_substrate LysR substrate binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1uthA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1uthA02
3HN0A 4I1DA 4ZE8A 3KN8A 3SEXA 4OWDA 1LCFA 3MC2A 4MBPA 4LVQA 1S50A 4ESWA 4MF3A 4NEDA 1OQGA 3IL1B 3CIJA 2ZXTA 2ZNSA 1WVJA 3TTRA 4R2BA 3S9MC 3G3IA 4I9DA 5I2NB 2QSXA 2A5TA 4R75A 3E13X 5CM6A 3PGFA 4ZEBA 1B6HA 5IAIA 2Q9TA 1A55A 1H76A 1XS5A 3MPKA 4DXBA 1DOTA 4YB6A 1B0HA 3VV5A 1FQEA 2UXAA 1GGGA 1QKBA 3MW0A 3K02A 4U1ZA 1P99A 4GOTA 3O6IA 1P1OA 4NMYA 4U4XA 4WKMA 4X1BA 4P0IA 4BDNA 3LSWA 3VFJA 2V93A 4EUOA 4OYVA 5AA3A 5CBRA 1EU8A 2XD2A 5CMKA 1P1WA 1AOVA 1MG1A 4QFLA 2O84X 1URGA 1B2HA 3GXAA 3TTKA 3UIFA 5I2KA 2F8DA 1DSNA 2XHDA 3A3CA 2F7AA 2Y7IA 1SW2A 2PT1A 4EXKA 1IZ1A 3N6UA 4OEUA 1B5JA 1ATGA 4Q5TA 5I56B 1NFTA 4G2ZA 3IB1A 2O7UA 4NF4B 3V8XB 4FORA 4L17A 4IGRA 2RCAA 1LFGA 2ZYOA 3K0VA 1UTHA 2XXRA 3IR1A 1B5IA 5A5XA 4ELPA 4OHNA 1M5CA 3B6QA 1XHYA 2UYEA 1UTBB 3EHSA 4YMBA 5IKBA 4RA1A 2IEEA 2F6GA 1N76A 1I69A 1LBBA 2AYSA 4E0WA 3PUYE 4X9TA 4NE4A 5LOMA 5HBCA 3HV1A 2NOOA 3A09A 3H7MA 3N94A 5H8SA 3C9HA 4JDFA 3TELA 4EQ9A 1RKMA 4HW8A 1ZLQA 1JNFA 1IQ7A 1Z7ME 4FECA 2ONKE 2E1SA 1PDAA 4GWOA 1YCJA 3KG2A 2XXXA 4OESA 1BKAA 1MDP1 4G68A 3O2AA 4H65A 3PUWE 5B7DA 1CB6A 3V83A 3H3GA 4C1UA 1D9YA 1NH7A 4TLLB 4F2OA 4OXVA 5K2YA 4ELQA 3O28A 4KCDA 3FVOA 2ESNA 4H0WA 4FEDA 4QHQA 2O68A 3FD3A 2Y7RA 1LFHA 5KDTB 2PT2A 4DXUA 3G3JA 4P0GA 3KN3A 4TQUQ 2DQVA 1MH4A 1LCTA 3DP4A 4LZ8A 3UN6A 3DM0A 3PU5A 3TKDA 4DXCA 1Y4TA 4QSDA 1VSOA 4HS7A 3RLFE 3OO7A 3TTNA 3ZKKA 3N26A 3S9LC 1BIYA 5JTYA 1ZIUA 2V25A 3S2VA 2HZKA 1WDNA 4GD5A 5I59A 4LONB 4ONYA 2XXTA 1Y3NA 3FVKA 4XKQA 2O69A 4GL0A 4UA8A 4H6DA 2NWJA 3CSGA 3MVXA 5AA4A 2A5TB 3K1MA 4RK2A 3FVNA 4H8JA 1QUKA 2ABHA 2HFBA 3QYTA 2DSFA 4F2QA 3TUSA 3SKPA 1LB8A 3K6VA 4KD5A 4FIMA 5ITPA 3FUZA 3MVYA 2H99A 5KDTA 1OLCA 1MM6A 2QS4A 2AL5A 3E3KA 4R9FA 4U23A 4ELOA 2XXYA 4FE8A 4F3BA 5KCJA 1PBQA 4QFPA 1JW4A 4YKPA 3T9HB 1NNKA 1Z7NE 2D5WA 2DWJA 2ZMBA 4WEPA 4EDPA 3T9UA 1ZU0A 2CMOA 1L5TA 3MQ9A 3THIA 2KLFA 3UGWA 3C32A 1LAXA 3U72A 4C0RA 5FTHA 3TPAA 5F7VA 2F36A 3LUYA 4G8HA 4OENA 2OLBA 1AL3A 3UA8A 2HQ0A 3PMXA 2H4IA 1MH3A 1RYOA 2AL4A 3M8UA 3LC8A 3WAFA 3MZBA 4G8NA 3OO6A 1R6ZA 3PUXE 3IX1A 3OD7A 4BDLA 4PQJA 1LAFE 1NNPA 3L6HA 1A7LA 1A8EA 1N7WA 2DWAA 4N13A 4RXLA 3PMWA 1D4NA 3TEPA 1MY4A 1VR5A 2R71A 2RKMA 3HCQA 3P7IA 1FTJA 2GH9A 3U94A 4DZ1A 4F3SA 2F7BA 1O63A 2V3QA 1PB8A 3M3LA 3QK6A 4R6KA 3SEYA 3TAJA 1PC3A 5I58A 3KSJA 4GFRA 4F19A 5I56A 2DE4A 3E9XA 3SDFA 5ICQA 1XOCA 2P2AA 2O7IA 4OVJA 1FTKA 2D3IA 3IOVA 4O3BA 5CBSA 1GTKA 4JXIA 5DEXA 1QULA 2B3FA 2I0CA 2XXUA 4H5GA 2QL3A 2Y7KA 1N04A 1R1NA 1LGBC 3U8QA 2O6AA 4YB5A 3RNNA 3VVDA 3C35A 1AH5A 5DEXB 2OWTA 5FTIA 4KHZE 5CMBA 3C36A 3H6VA 2XD3A 1Y3PA 5TPAA 3OOAA 2X26A 3SESA 3ODBA 4KCCA 2XX9A 4U1OA 3KOSA 4DDDA 1LFIA 3VVEA 4EXLA 2YPNA 3C31A 3FXUA 3Q28A 4UACA 3RN8A 5FHOA 5TPAB 3ONMA 3TCFA 2F7CA 4GIZA 3S4UA 1WODA 2OCUA 4LZ7A 2I4BA 4EQ7A 3C33A 1B46A 3S9NC 2PYYA 2A5SA 2ZNUA 3MUQA 1TT1A 3U93A 3W15C 3FATA 1H3DA 4AB6A 3CRBA 3O6HA 1VFEA 4G68C 1B4ZA 4YZZA 1B3EA 1BP5A 1JVYA 1B7UA 2GHAA 3OENA 4JSDA 1B4HA 2QS3A 4Z0IA 3RT6B 3KEIA 4PE5B 4OZ9A 5HM4B 4R72A 3GLBA 2OK2A 4NF6A 1MXYA 1B9JA 3H6TA 4G68B 1J1NA 4AQ4A 4BDMA 2O51A 1B58A 1ZBMA 3A3UA 4NF8A 3H06B 4OFLA 5KCJB 4FATA 4IO3A 3JYRA 2HZLA 1MRPA 1B3GA 1I6BA 4THIA 3CG3A 3W9VA 5AE4A 4IO4A 2DOJA 4DLDA 3B6TA 4YAHX 4DIGA 4OFOA 3PPPA 2OZZA 3FGSA 1PEBA 2RINA 1FTLA 1MY0A 1SI0A 4F18A 4BDRA 1USYH 3O9PA 5DT6A 3UP9A 4LP2B 4RK9A 1UIUA 4POXA 1P1NA 2FA7A 2Z8EA 1LB9A 1NL5A 1UQWA 1XC1A 3AXFA 4RNSA 2DWHA 4KFQA 1PB7A 3F11A 3IAZA 1B3LA 4NTLA 2DVCA 2THIA 1N3XA 5J1DA 4NF5B 2XXHA 5CMMA 1ZMGA 3N5LA 4BLAA 3PPOA 3FV2A 4WEDA 2GHBA 2DE3A 3K6UA 2VP1A 3CFXA 1JQFA 4IGTA 1IXHA 1Y4CA 4OETA 3K4UA 2I49A 3ZKLA 3VXBA 1MQDA 1URDA 3K00A 4H67A 4Q0CA 1OVTA 4ZEIA 3RT8A 1H44A 1JVXA 2PBWA 4DCYA 3D4GA 2NVUB 4U22A 1POY1 4LQ2A 4YMAA 2G29A 4WXJA 1N84A 1UTBA 1Y3QA 3LR1A 5CI5A 3KJ7A 2VGQA 3TCHA 3I5OA 4ZEKA 2H9BA 4TOZA 1UTHB 2Y84A 2Y7WA 2QMWA 2Z8FA 2F35A 3ILUB 3KJTA 4YKKA 1OQHA 1PB9A 2PVUA 1MM7A 1OMPA 1FTMA 1B0LA 3Q26A 1Y1MA 1Y20A 2PX1A 3KOTA 3OXNA 4GLIA 2VD3A 1SI1A 5ITOA 3FJMA 4JB7A 4ZEFA 1DTGA 3G3KA 3FIRA 3L6GA 1FW0A 5DVIA 2X7QA 4GQOA 4U4SA 3LBSA 1B5HA 2Q89A 1FTOA 5K2XA 3EPEA 5H8HB 1MXWA 4E0XA 1IEJA 3D4CA 1P1UA 4GF8A 2F78A 3SETA 1BTJA 1LBCA 5ELVA 3DP8A 3KFMA 3IB2A 1Q1KA 2B3BA 3PUZE 5BWJA 3PD8A 3UORA 2I6EA 4PFYA 4RJZA 1D9VA 2M8CA 4ND9A 4OFJA 3Q29A 4PP0A 1MPDA 2XX7A 3MZ9A 4NF6B 3DP6A 1S9TA 5F1QA 1JW1A 3SEWA 1SW4A 4OMBA 2VOZA 4QFKA 5TP9B 1N0TA 3PUVE 1O7TA 3KN7A 2I0BA 1ZJLA 4G77A 4IO6A 1FQDA 2H5YA 5BUUA 3MBPA 4U21A 1MS7A 1B52A 2P0SA 4ZE9A 4IY5A 5L9MA 1EZPA 4GXSB 4RPOA 3CR9A 4X1DA 4TLMB 5TP9A 5H8FA 2D21A 2X7PA 1IITA 1LSTA 2WKYA 3UK4A 1AIVA 4JWXA 4ZDMA 2ANJA 2Z23A 4F29A 5AA1A 1SW5A 1B7HA 4POWA 2ZYNA 3CVGA 2VHAA 3K01A 2I58A 1SBPA 3MWBA 4XTCQ 4KR5A 5H8FB 1IXCA 2UVIA 3EQ1A 4GVOA 5H8NA 3K6WA 3DELB 4F1YA 3OELA 4F22A 5DVFA 4N6PA 4EF1A 1B51A 1YAEA 3USDA 4O3AA 3ECRA 3FJ7A 5JTYB 4ESXA 3T22A 4F3GA 4NF5A 4FAJA 2OBGA 4M4GA 4U2RA 4Q8RA 2W7YA 3H4ZA 5ICTA 1QW0A 2DP8A 2UYFA 3OO8A 3T9XB 1B3FA 1MXUA 3HPIA 3IO6A 1P1QA 3CSBA 4R2FA 1NNFA 3OSRA 4F39A 2Y7PA 1SDXA 1POTA 5DYHA 5AA2D 3HHFA 3MP1A 4K3FA 5EHMA 4R6YA 5B70A 4LATA 1DPPA 1QUIA 2ALUA 4AB5A 3T9VA 5I2NA 1M5EA 4GL8A 4MLQA 3R6UA 4R6HA 1HSEA 1EH3A 3G3FA 1MY3A 2ONRA 3U1OA 3VLUA 2I4CA 1MXZA 3BFTA 3OMBA 3IJOB 5H8QA 3G7WA 4LUBA 4JBZA 1USYE 1MQHA 2QS1A 4PFUA 3FVGA 2HAUA 1H43A 5I57A 4MH5A 3IOTA 4G8MA 5CMCA 4ZZAA 5I58B 4XKNA 1M5DA 1YPNA 3VLVA 2R9JA 3B7DA 4OQOA 2XXQA 3MPLA 2OWSA 3LSXA 1M5BA 2REJA 2RF1A 1FQAA 5H8HA 3VE1B 4PFWA 4YKIA 3HO7A 1GR2A 1ELJA 5JK4A 2Z8DA 4KYEA 1SQYA 1MQJA 2LAOA 2I3VA 3RTWB 1JETA 2DE2A 1H45A 3GBBA 1MDQA 2PMSA 3PPRA 3IK6B 4HTGA 2YLNA 1ZKBA 2NUVA 2F5XA 3GZGA 3BBRA 4F3PA 1Y1ZA 2B65A 3WAEA 4JWYA 3TQWA 4ZEDA 5KZTA 3KGCA 1Q35A 4R9GA 3O97A 2QMXA 4C1TA 3Q25A 3QUFA 1DMBA 4KYDA 4OERA 1TXFA 3R7XA 2NXOA 3BKIB 3V89B 1NKXA 1IIWA 3O6GA 3PD9A 4H5FA 3TZAA 1A40A 3V5AA 2O1LA 3EF7A 1F9BA 2UVHA 2ZYMA 2F97A 3G3HA 2HCAA 1B32A 2G93A 4P11A 4QF9A 3T96B 3S9EA 4QSEA 4KPTA 3SEVA 2DWIA 2DYXA 4LQ5A 2XX8A 4YKJA 1MXVA 4NWCA 1ANFA 2HAVA 3CFLA 3RPWA 3TQLA 4ELRA 5AA4B 4DE8A 3MVWA 1OLAA 2XXWA 3M3FA 1JW5A 4MLVA 2F34A 4Q30B 3R26A 1MQIA 3MP8A 4QRZA 1ZTYA 2O1MA 3TCGA 3JZJA 4X48A 3LSFB 2I3WA 2F6PA 4QFOA 2Q2AA 5CC2A 2AIXA 1NNTA 2XXPA 4ISUA 3IJXB 3CFZA 4GRKA 1MPCA 2UVGA 2CZLA 3TFLA 2FYIA 2DVZA 4RYAA 5DVJA 4YB7A 1MPBA 1TFAA 2Q2CA 3MZ1A 3IOWA 5TU0A 2QRYA 2IA4A 1B3HA 1IXGA 2I48A 3KSXA 1SD3A 2V3UA 5I59B 1CE2A 3MVZA 1SYIA 4ECFA 3N6TA 3T93B 3W9WA 2DXYA 3CI8A 3IB0A 5L8DA 1JEVA 1B7ZA 1FQCA 2GRVA 1URSA 1XT8A 4GXAA 3FV1A 3KZGA 3JV9A 1EZOA 3DLNA 2REGA 3C34A 1B1XA 3H6UA 4H1XA 4IO7A 4KYSA 3LSLA 4IY6A 2V3TA 4BDQA 3IOUA 1NH8A 3EHTA 3PMVA 4RPNA 4NWDA 5CRYA 1LAGE 1OVBA 1A8FA 3O66A 2QPQA 4R74A 4KI0E 3CG1A 1VE4A 3OEKA 3RGYA 1R9LA 2QS2A 3FXQA 3O29A 4G4PA 1AMFA 3RQTA 4R73A 3SEUA 4F1VA 4JWOA 3E4RA 5I2KB 4IO5A 4O3CA 4OTEA 5EHSA 1B05A 1HSLA 2DS9A 3TTLA 4YICA 3QIMA 1A54A 5DTBA 1XVXA 3MAMA 5L9OA 3K6XA 2HXWA 2Q8JA 2R6GE 5AA2B 4XXUA 1M5FA 4NF4A 4ZZEA 2DXRA 3HHGA 3ILTB 2RC9A 3RY3A 3TTMA 1D3KA 3C4MA 3OSQA 1GV8A 4ZECA 1OIBA 1QKAA 3B6WA 3TODA 5I57B 1T0KA 4LA9A 5M2VA 3G3GA 2HEUA 2YJPA 2Z22A 3TMGA 4OEVA 3EHUA 5FHMA 3TDJA 4BDOA 5AA2A 4YU0A 2RCBA 5I84A 1US4A 1MQGA 1SW1A 3IO4A 3FZVA 1QJMA 4H8IA 3FJGA 4QFNA 1IUDA 1Y9UA 4F31B 1PBPA 4KQPA 4XKPA 1N3WA 1XVYA 4ZS9A 1NMUA 2E0SA 2ZYKA 5H8QB 3K2DA 3VXCA 5JEIA 3ZSFA 4N07A 2XXIA 3K1NA 1HSJA 5EYFA 1LLSA 1MXXA 1N7XA 1DPEA 4FJPA 4XKRA 4DCXA 1A99A 5HPQA 5A5XB 1SYHA 4M1VA 3SERA 4LZ5A 2P1SA 1BLFA 2VD2A 3HSTA 3Q27A 4MFIA 2UVJA 3I6VA 4PETA 3K1PA 3QXMA 3OO9A 1RYXA 3FXRA 3EN3A 1S7YA 1FCKA 3M3KA 1TFDA 2OJTA 3I3VA 4EF2A 4I62A 2XXVA 2RC7A 1IXIA 2ONSA 3PPQA 2ZNTA 2Q88A 2H25A 5ISUA 5FHNA 5L9SA 1KWHA 1TWYA 1EZ9A 1II5A 4JSOA 1I6QA 1I6AA 1VFDA 2GFEA 3H03A 4PFTA 1SVXB 4HCWA 2V84A 3TYHA 3ZS6A 4F1UA 1LAHE 1FQFA 1QUJA 1US5A 4Z7EA 4HCYA 3VDFA 3OEMA 1MY2A 3RTFB 3QSLA 3H6WA 4IB2A 3T66A 2RC8A 3VLWA 3IORA 3FASA 4QSCA 1UIVA 3GBAA 3U92A 1O64A 1B40A 1R9QA 3MP6A 2FNCA 2H98A 3PPNA 4IO2A 3RUMA 5H8NB 2BJJX 3VVFA 3QUJA 1B1HA 1MY1A 3BFUA 3MJNA 3QAXA 4EQBA 1GVCA 1YTVA 2QJEA 4I8CA 3KBRA 4NF8B 4FEBA 1FQBA 4XIGQ 1QVSA 1DTZA 3PV0E 1JEUA 4RY1A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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