1UTHA

Dntr from burkholderia sp. strain dnt in complex with thiocyanate
Total Genus 61
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
61
sequence length
219
structure length
219
Chain Sequence
b'TRNSFDPFASTRTFNLAMTDIGEMYFMPPLMEALAQRAPHIQISTLRPNAGNLKEDMESGAVDLALGLLPELQTGFFQRRLFRHRYVCMFRKDHPSAKSPMSLKQFSELEHVGVVALNTGHGEVDGLLERAGIKRRMRLVVPHFIAIGPILHSTDLIATVPQRFAVRCEVPFGLTTSPHPAKLPDIAINLFWHAKYNRDPGNMWLRQLFVELFSEAHHH'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords LYSR-TYPE REGULATORY PROTEIN
publication title Development of a Bacterial Biosensor for Nitrotoluenes: The Crystal Structure of the Transcriptional Regulator Dntr
pubmed doi rcsb
source organism Burkholderia sp.
molecule tags Transcription regulation
total genus 61
structure length 219
sequence length 219
ec nomenclature
pdb deposition date 2003-12-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00126 HTH_1 Bacterial regulatory helix-turn-helix protein, lysR family
A PF03466 LysR_substrate LysR substrate binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1uthA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1uthA02
1H45A 3MZ1A 4OFOA 4BDMA 3TTMA 4JSDA 1RYXA 3RY3A 4IO4A 2B3FA 3C36A 1LAGE 1LBCA 1MG1A 2PT2A 2XD2A 1SVXB 3TFLA 1FTMA 3KFMA 2PVUA 2DWIA 4F1YA 4KPTA 4YMAA 5BUUA 1B0LA 3G3HA 1BKAA 1OLAA 4OEUA 1MY1A 5I84A 4GRKA 2F7BA 4NF5A 3H03A 3KG2A 4LATA 3HV1A 3IB1A 4POXA 1MY2A 3TEPA 1A54A 3TELA 4RXLA 3FUZA 1POY1 4JXIA 2YLNA 2AL4A 5CMBA 3R7XA 4X48A 2HFBA 3KOSA 2I0CA 3DM0A 4E0XA 1VSOA 1LFGA 3AXFA 4YB6A 4AB6A 4ELOA 3VLWA 2YPNA 2ZMBA 3VVDA 3OXNA 3PUWE 2UVIA 3IOVA 1SD3A 1SI0A 3LBSA 2I4CA 1IXGA 1R9QA 1XVXA 4QFNA 5FTIA 1SDXA 4F31B 1FTJA 1Y4CA 2I6EA 5H8SA 4KCDA 3OOAA 4P0IA 4F3GA 1Y3NA 4ESWA 3OO6A 5I59B 4JWOA 3FVOA 2Q2AA 3Q26A 3TTRA 5IKBA 1ZJLA 3DP8A 4LA9A 5B70A 2FYIA 5H8NB 1A40A 4NE4A 2I3VA 5FHNA 5LOMA 4RJZA 2NVUB 1UQWA 4WEPA 3CRBA 3VFJA 3OELA 5CC2A 1ELJA 4P0GA 1FQEA 2X7QA 2V84A 1Q1KA 4IO3A 2I4BA 1UTBB 3L6HA 5M2VA 3PMWA 1YCJA 3KBRA 2I58A 3VLUA 2QRYA 3UP9A 2F34A 2QPQA 2ZNSA 3TYHA 1ZLQA 2X26A 3MZ9A 1MY4A 3BKIB 2ONSA 3MPKA 4Q0CA 2I0BA 3UK4A 3HHGA 1B3EA 1ZU0A 5I58B 4U4XA 4ECFA 3K0VA 1Y3PA 5I56A 1Y20A 1FQFA 1MXVA 2BJJX 1XOCA 4PFWA 3U8QA 3VVFA 3U92A 2Z8EA 5A5XA 1IZ1A 3B7DA 3LSLA 3L6GA 3O29A 3FATA 3QYTA 3HCQA 3FVKA 3CVGA 1US5A 3USDA 2OCUA 2THIA 2H25A 1LGBC 1ZMGA 1Y3QA 3H06B 4F2QA 4ELPA 1B51A 2PYYA 2XX8A 4THIA 1NNTA 2QL3A 3K02A 2YJPA 4RPNA 2DS9A 1FQAA 1QKAA 3TCFA 1JQFA 3KGCA 4ND9A 3T93B 4LQ5A 1R9LA 3FZVA 3FGSA 1DTGA 3VLVA 2RCAA 2REGA 3UIFA 1SYHA 1D9YA 4U1OA 1H3DA 1D3KA 1UIUA 3T96B 1MY0A 4F29A 2ABHA 2Q9TA 4Q30B 3EF7A 5H8QB 3Q28A 1JETA 3BFUA 1LSTA 3EHTA 5L9SA 1ZTYA 5IAIA 1JW1A 3B6WA 3CFXA 2Z8FA 4JWXA 2V25A 3MVZA 4YICA 2UVHA 2P2AA 3C35A 2CMOA 4O3BA 1SW5A 2UYFA 3OO7A 4AB5A 2F5XA 3I3VA 3K6WA 3MWBA 2Y7IA 3C31A 5CMMA 3TAJA 4RPOA 2DYXA 4F19A 5AE4A 5AA3A 4WXJA 3KJTA 1QULA 1RYOA 3EN3A 4BLAA 4ZZAA 2CZLA 4BDQA 1XC1A 5I2NB 3HN0A 3M3FA 4DIGA 3PPQA 4BDLA 2Y7KA 4EXLA 1VFEA 3VDFA 3M3LA 4DDDA 3VXCA 3UORA 1YAEA 3BFTA 1J1NA 5K2XA 4DLDA 3I6VA 2ESNA 2DOJA 1ZKBA 4WKMA 4F3SA 3V5AA 4I1DA 2XXPA 2ONKE 1OLCA 4KYSA 5CBSA 2OJTA 3CG3A 3E3KA 3FVGA 1Z7ME 1IITA 3MP1A 2KLFA 2HXWA 4ZECA 4ISUA 1XHYA 3FIRA 1DOTA 4DXCA 3IJOB 1B1HA 5CMCA 2W7YA 3TMGA 2ALUA 3MJNA 3P7IA 4H6DA 3IO4A 5H8FA 4U23A 1PB8A 4KYEA 3SEWA 3U94A 5I59A 5L9OA 1URSA 4RK9A 4DCXA 4OENA 2RINA 2PBWA 1DPEA 1M5BA 3LSFB 5H8NA 1SW2A 2XXRA 5L8DA 1MQJA 4GXSB 1IXCA 3EPEA 4FJPA 3THIA 5CM6A 2H9BA 4OFJA 4PETA 3QSLA 2AL5A 4KHZE 1D9VA 3LC8A 1A8EA 2F8DA 4RK2A 1TXFA 1CE2A 3RGYA 1DMBA 4OXVA 2Q2CA 4ZS9A 3IX1A 4EF1A 1UTBA 1F9BA 3O28A 1MM7A 5B7DA 3Q27A 1SYIA 4NEDA 2UXAA 4K3FA 3KSXA 4OMBA 4OERA 2XXTA 4FE8A 5JEIA 3OENA 4ZEFA 3PUYE 3VV5A 3FASA 2O1LA 2ZNTA 4OFLA 1IUDA 2Z23A 5I58A 1AL3A 3UA8A 4U21A 1FW0A 1MXUA 1MQDA 4EDPA 1BTJA 4NF4B 5ICQA 4GQOA 4XXUA 4U1ZA 5J1DA 4YMBA 2AYSA 1FQDA 2RCBA 4Q5TA 4NF8B 1PB7A 1B9JA 2OWTA 1NFTA 3DLNA 4OESA 3TTLA 2ANJA 4P11A 2IA4A 5F7VA 2GHBA 1TWYA 3GZGA 3UGWA 1O64A 4H1XA 1B3LA 1B2HA 3S9NC 3PU5A 3A09A 4DXBA 1SBPA 4I62A 3TCHA 2ZXTA 4YAHX 2VHAA 1ZBMA 5KCJB 1PB9A 1MH3A 3K6VA 4FEDA 4ZEIA 3BBRA 2E1SA 1GVCA 3MC2A 5ELVA 3KJ7A 3K1NA 3LSWA 1P99A 2HEUA 5H8HB 1QUIA 1MM6A 1OQGA 4X1DA 4PFTA 3CIJA 4ZEDA 3H6UA 4R6YA 2R71A 1IIWA 1LFIA 3QIMA 5H8QA 2DWAA 4UA8A 4XIGQ 4G68C 3K4UA 1FCKA 1NKXA 2F7CA 1II5A 3T9UA 4XKRA 3S9LC 1JVXA 2REJA 3H7MA 2XXQA 2O1MA 4R9FA 2VOZA 1LAXA 2RC9A 2PX1A 3TCGA 2RKMA 4QSCA 1QUJA 1HSJA 2B65A 1NNPA 4ZEKA 4N13A 4OEVA 2FNCA 3R6UA 3ZS6A 1NNKA 1B7HA 2WKYA 4MBPA 3RTFB 2Z22A 4GF8A 4IO7A 4QHQA 1VFDA 4OTEA 3WAFA 3MVYA 2VD3A 4F3PA 5I2NA 3ZKLA 2D21A 2NXOA 4TLLB 2I48A 1LAFE 2OBGA 4DZ1A 3M3KA 5ITOA 3RPWA 3W9WA 2F97A 3MW0A 2O7IA 5DVFA 4I8CA 2IEEA 1NNFA 1P1WA 2OK2A 1T0KA 3DP6A 2O6AA 1PC3A 1BP5A 2DWJA 4H8IA 4HTGA 4QRZA 4G8NA 1FQCA 2QS4A 4F2OA 3O6IA 3TKDA 3EHSA 5I2KB 3CFLA 4JDFA 3OEKA 3N5LA 4OWDA 3IORA 1Y1ZA 3TDJA 3PMVA 3SEUA 2DE2A 4DE8A 2QJEA 3D4GA 4R9GA 2OLBA 4FIMA 3TZAA 3C9HA 5ICTA 3PPNA 1B0HA 2Z8DA 3O6HA 3OD7A 2XXWA 4GWOA 3Q29A 4BDRA 2Y7RA 1QUKA 2QMXA 4KFQA 2XHDA 4JB7A 1DSNA 4U2RA 1XT8A 4EQ7A 3FXQA 1A55A 1D4NA 2E0SA 3LR1A 2V3UA 1JNFA 4NF6B 4XKNA 1O7TA 4PP0A 1XVYA 3OSRA 4NWDA 5TU0A 3O97A 3H4ZA 3IB2A 2AIXA 3MP8A 1FTLA 1AIVA 1VR5A 1ANFA 3KZGA 2A5TB 4KI0E 4LQ2A 4NTLA 1QW0A 3RUMA 1BLFA 2V3QA 5CMKA 2HCAA 3FXUA 1GGGA 1OQHA 3ODBA 4QFKA 3RLFE 3ZKKA 2UVGA 3MZBA 4OZ9A 1UTHB 1YTVA 3MPLA 3LSXA 4MLQA 5DEXB 3T9XB 3RN8A 1B3FA 1O63A 2Y84A 4C0RA 3GXAA 1PBQA 1OIBA 1N3XA 1L5TA 3ONMA 3SEYA 5TPAB 3VVEA 3S9MC 4TOZA 4NF4A 1MQHA 3HPIA 3V8XB 4L17A 2G29A 1MRPA 3UN6A 1FQBA 2GH9A 3OMBA 3O2AA 2NWJA 1LB8A 1B40A 4I9DA 4M1VA 2DP8A 5DVJA 3PD8A 4H5GA 2UVJA 3RNNA 3LUYA 1QJMA 4R74A 5KCJA 1M5DA 5AA4B 2FA7A 3IOUA 3GBBA 5H8HA 3SERA 1Y9UA 4R6HA 4G77A 4PQJA 1M5FA 3CSBA 3OO8A 2HQ0A 3KEIA 5DT6A 1B4ZA 1TFDA 2QSXA 1EZ9A 4R2FA 3T66A 1P1QA 3O9PA 1AOVA 1NMUA 1M5EA 3RT6B 1H43A 3V89B 5ISUA 3OO9A 4ZDMA 4F22A 4ELQA 1OVBA 4YKIA 3A3CA 2OZZA 1JW4A 2V93A 4DXUA 3K6UA 5AA2B 4XKPA 3T9VA 3RTWB 4MF3A 4RYAA 3G3FA 4YU0A 3IOWA 1B5JA 1B32A 1B5IA 4IO2A 4HCWA 3EQ1A 1MXXA 1BIYA 3DP4A 2NOOA 4R75A 4RNSA 1NL5A 1IXHA 3FJ7A 3SESA 1MDQA 4GIZA 3F11A 4RY1A 4UACA 1FTOA 4LZ5A 2ZYMA 4Z0IA 4FAJA 4IGTA 3CI8A 1I6QA 3HHFA 3CFZA 3TUSA 5DTBA 4YZZA 1JEUA 4IB2A 4TQUQ 2HAVA 3PMXA 1URDA 2A5SA 4HCYA 1B3GA 1TT1A 1I69A 2Y7PA 2Q8JA 2QS3A 4G8HA 1A8FA 3ILTB 1P1UA 4NMYA 4LVQA 4GD5A 4DCYA 1USYE 1WVJA 3S9EA 5CRYA 5HBCA 4GL8A 2QS2A 1N04A 2D3IA 2P1SA 2O69A 3B6QA 4N6PA 3PUXE 2ONRA 2GRVA 4YKPA 3S4UA 4R72A 1PBPA 1IQ7A 3N94A 4ZZEA 5I57B 1FTKA 4U22A 3JV9A 2I49A 3PPRA 2DE3A 1EU8A 3M8UA 1KWHA 3N6TA 4C1TA 2PMSA 3K1MA 1GR2A 1MPBA 1ZIUA 1OVTA 1IXIA 1JEVA 2H5YA 3ZSFA 2ZYKA 4JSOA 4GLIA 3SDFA 4JWYA 3WAEA 4NF6A 3KN8A 2DQVA 1MDP1 3MQ9A 4H0WA 1P1OA 5AA1A 4OQOA 1N7XA 1TFAA 3C34A 4G4PA 4PFYA 1XS5A 3QK6A 1Q35A 4F18A 2I3WA 4MH5A 4KYDA 1YPNA 3GLBA 1B52A 5K2YA 1HSLA 1MXYA 1US4A 2M8CA 3QUFA 2ZNUA 2A5TA 2RF1A 2VP1A 5JTYB 1I6BA 5F1QA 5TP9B 4KQPA 3G3IA 3E13X 4KR5A 3B6TA 4H8JA 1SW1A 1UTHA 2F78A 3C4MA 3FJMA 5DEXA 3VE1B 3SEVA 1LAHE 2HZKA 1MXWA 2Y7WA 3IB0A 1OMPA 2H98A 4ONYA 2GHAA 4ELRA 1EH3A 3SEXA 4R73A 5TPAA 3MUQA 4PFUA 3KSJA 3MAMA 5L9MA 3K00A 5H8FB 4IO5A 2ZYOA 3PUVE 1MPCA 3IJXB 3TQWA 4F1UA 5CI5A 1AH5A 5KDTB 4ESXA 1POTA 4QSDA 1AMFA 2F35A 4QFPA 2LAOA 3KN7A 2XX9A 1ATGA 1QVSA 3E9XA 4H65A 4G68B 1GTKA 3A3UA 1N7WA 1S50A 2HAUA 5HPQA 3G3JA 5AA4A 2QS1A 3TQLA 1CB6A 1Y1MA 2VGQA 2P0SA 3V83A 1H44A 2B3BA 1MS7A 3G7WA 4X9TA 3JZJA 3T9HB 4POWA 5FTHA 2H99A 3IO6A 3G3KA 3JYRA 4RA1A 1WDNA 4G2ZA 1B5HA 3FXRA 4EQBA 4MFIA 3TTNA 3H6WA 4EXKA 4QF9A 3W9VA 1LCFA 3K2DA 1LB9A 1MPDA 4HS7A 5AA2A 1B7ZA 4JBZA 4XTCQ 2OWSA 3FD3A 2ZYNA 4BDNA 4X1BA 4YB5A 5FHOA 1IEJA 5CBRA 3FV2A 1NH7A 4GOTA 3PV0E 1UIVA 4O3AA 1VE4A 1DTZA 3I5OA 4IY5A 2DE4A 4C1UA 4YKJA 3E4RA 4NF5B 1WODA 4ZE8A 3ECRA 4F3BA 3IL1B 3MBPA 1RKMA 2DVCA 2XXHA 4N07A 1B58A 3S2VA 2XD3A 2XX7A 1R1NA 5DVIA 1LCTA 2V3TA 4QSEA 4YB7A 4FORA 4GL0A 3RQTA 2QMWA 1I6AA 3T22A 1SI1A 5FHMA 4R6KA 1A99A 1B1XA 3CSGA 4E0WA 1S7YA 2O7UA 3K01A 4M4GA 1JW5A 3FJGA 1MH4A 2O84X 4GXAA 3ILUB 3TTKA 3Q25A 3KOTA 1SW4A 3MVWA 4OYVA 1LLSA 4NWCA 2Q88A 3EHUA 1N3WA 3C32A 5I57A 5KZTA 3N26A 1H76A 3GBAA 1M5CA 2F36A 3K1PA 1EZOA 1SQYA 3OSQA 3TODA 4NF8A 3OEMA 4Z7EA 4MLVA 4YKKA 4LONB 3U93A 4FECA 3O66A 4F39A 3SETA 1NH8A 5HM4B 3U72A 3PPOA 3PPPA 3PUZE 2DWHA 1MXZA 1PDAA 1B6HA 3QAXA 3CR9A 1PEBA 4FEBA 4GFRA 4IO6A 3MVXA 2F6GA 3VXBA 5ITPA 2HZLA 4EQ9A 3H6TA 3MP6A 3IR1A 1N84A 2XXXA 4ZE9A 1S9TA 5DYHA 1B05A 4FATA 4EF2A 5EYFA 5JTYA 2RC8A 4LUBA 5TP9A 1N76A 4EUOA 5BWJA 1B4HA 3N6UA 2H4IA 2PT1A 2G93A 1B46A 4F1VA 2DXYA 5EHSA 3PD9A 1EZPA 3D4CA 4O3CA 2O51A 5I56B 2DXRA 1P1NA 3H6VA 5JK4A 4H5FA 1MQGA 2F6PA 5A5XB 1R6ZA 4PE5B 5EHMA 4IGRA 3HSTA 1N0TA 3H3GA 2RC7A 2R9JA 4OVJA 1QKBA 4KD5A 4GVOA 2XXUA 4G8MA 2XXIA 5KDTA 4H67A 4OETA 1HSEA 3PGFA 3W15C 2D5WA 1MY3A 4TLMB 2R6GE 2NUVA 5AA2D 3IK6B 4U4SA 1Z7NE 4LZ8A 1GV8A 4G68A 2VD2A 3DELB 4WEDA 1LBBA 3C33A 3IOTA 4R2BA 4IY6A 3QUJA 1Y4TA 3O6GA 3IAZA 4KCCA 4AQ4A 3G3GA 1B3HA 2XXYA 4ZEBA 1JVYA 2F7AA 4QFLA 3SKPA 1B7UA 4LP2B 2X7PA 5I2KA 4HW8A 4XKQA 2DVZA 3FV1A 3HO7A 2DSFA 4Q8RA 3QXMA 3TPAA 1USYH 2UYEA 2Q89A 3R26A 2O68A 3CG1A 1URGA 4OHNA 1LFHA 2XXVA 3KN3A 4BDOA 1DPPA 3RT8A 1MQIA 1A7LA 2GFEA 4QFOA 3U1OA 3FVNA 3K6XA 4LZ7A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1H45A 3MZ1A 4OFOA 4BDMA 3TTMA 4JSDA 1RYXA 3RY3A 4IO4A 2CZKA 4N6DA 2XWOA 2B3FA 3C36A 1LAGE 1LBCA 1MG1A 2PT2A 2XD2A 3CHGA 1SVXB 3TFLA 3LUZA 1FTMA 3KFMA 2PVUA 2DWIA 4F1YA 2WX9A 4KPTA 4YMAA 5BUUA 1B0LA 3G3HA 2ZZWA 1BKAA 1OLAA 4OEUA 1MY1A 5I84A 4GRKA 2F7BA 4NF5A 3H03A 3KG2A 4LATA 3HV1A 3IB1A 4POXA 2PFZA 1NUYA 1MY2A 3TEPA 1A54A 1RDZA 3TELA 1YYZA 4RXLA 1FBPA 3FUZA 1POY1 4JXIA 2YLNA 2AL4A 5CMBA 3R7XA 4X48A 3IFAA 2HFBA 3KOSA 2I0CA 4LN5A 4MAGA 3DM0A 4E0XA 1VSOA 2HXRA 1LFGA 3AXFA 4YB6A 4AB6A 4ELOA 3VLWA 2YPNA 2ZMBA 3VVDA 3OXNA 3PUWE 2UVIA 3IOVA 1SD3A 1SI0A 3LBSA 2I4CA 1IXGA 1R9QA 2XWVA 1XVXA 4QFNA 5FTIA 1SDXA 4F31B 1FTJA 1Y4CA 2I6EA 5H8SA 4KCDA 3OOAA 4P0IA 4F3GA 1Y3NA 4ESWA 3OO6A 5I3SA 5I59B 4JWOA 3FVOA 2Q2AA 3Q26A 3TTRA 5IKBA 1ZJLA 3DP8A 4LA9A 5B70A 4GWWA 2FYIA 5H8NB 1A40A 4NE4A 1FPFA 2I3VA 5FHNA 4GBVA 4PE3A 4GWSA 5LOMA 4RJZA 2NVUB 1UQWA 1INPA 4WEPA 4G61A 3CRBA 3VFJA 3OELA 5CC2A 1ELJA 5IZZA 1FBEA 4P0GA 1FQEA 2X7QA 2V84A 1NV1A 1Q1KA 4IO3A 2I4BA 2Y5KA 1UTBB 4NN3A 3L6HA 4PFBA 5M2VA 3PMWA 1YCJA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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