1UTHA

Dntr from burkholderia sp. strain dnt in complex with thiocyanate
Total Genus 61
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
61
sequence length
219
structure length
219
Chain Sequence
b'TRNSFDPFASTRTFNLAMTDIGEMYFMPPLMEALAQRAPHIQISTLRPNAGNLKEDMESGAVDLALGLLPELQTGFFQRRLFRHRYVCMFRKDHPSAKSPMSLKQFSELEHVGVVALNTGHGEVDGLLERAGIKRRMRLVVPHFIAIGPILHSTDLIATVPQRFAVRCEVPFGLTTSPHPAKLPDIAINLFWHAKYNRDPGNMWLRQLFVELFSEAHHH'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Development of a Bacterial Biosensor for Nitrotoluenes: The Crystal Structure of the Transcriptional Regulator Dntr
pubmed doi rcsb
molecule keywords LYSR-TYPE REGULATORY PROTEIN
source organism Burkholderia sp.
molecule tags Transcription regulation
total genus 61
structure length 219
sequence length 219
ec nomenclature
pdb deposition date 2003-12-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00126 HTH_1 Bacterial regulatory helix-turn-helix protein, lysR family
A PF03466 LysR_substrate LysR substrate binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1uthA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1uthA02
4LZ8A 4NWCA 5CI5A 2RC7A 5IKBA 1MY4A 1IIWA 3K6UA 1DSNA 2O1MA 1ZBMA 1M5DA 5IAIA 3PPOA 2GHAA 4DXUA 2NXOA 1Z7ME 1B3FA 2I49A 4OXVA 2AYSA 1Y4TA 2PX1A 1BLFA 1MDQA 1B5IA 1B0HA 1BP5A 2XXUA 3IB0A 3GLBA 4HTGA 2ZNTA 1FTLA 4JSDA 3RPWA 4OETA 1D3KA 1UTHB 3T9VA 3G3KA 1JVYA 1NNPA 2OJTA 5TP9B 3E4RA 2QRYA 3CVGA 3FZVA 4LA9A 3QUFA 1MXVA 1LB8A 4QFNA 4O3CA 2O69A 4I9DA 4LQ2A 4NWDA 2XXPA 2F8DA 3K00A 1JNFA 3TELA 1O63A 2ZYKA 2HZLA 3TEPA 3FXUA 2DS9A 4XKNA 4POXA 3DM0A 1QUKA 1FQEA 4HW8A 2CMOA 1YAEA 2DWAA 2QS2A 1QUIA 3QK6A 2OLBA 5EYFA 4L17A 3OOAA 4LVQA 3TTMA 5CMMA 1H44A 1A40A 2R6GE 1USYH 4MF3A 2I3WA 5BWJA 4E0XA 5HBCA 2RC9A 3HN0A 1XVYA 3UIFA 4IO6A 4NF6B 4IO3A 4XXUA 4X1BA 2DXRA 1ZJLA 4KI0E 2VHAA 1AL3A 4DZ1A 4AB6A 2X7PA 3R6UA 1GV8A 2Q8JA 3FJGA 3K6WA 2ZYNA 2VD2A 3LSFB 3VV5A 2Z8EA 3G3JA 5DVJA 1ZLQA 3IOUA 3G3FA 1OQHA 1DPEA 3C35A 3OO6A 3MZ9A 3U8QA 1US4A 2XX9A 3S9MC 1XS5A 3VLUA 1SI1A 1B7HA 2ANJA 1QJMA 3Q26A 3OEKA 1OLAA 1SBPA 4QSCA 3W15C 2PYYA 1JEVA 3Q29A 4THIA 4ZE9A 5H8FA 4GD5A 2Q9TA 3K6VA 4F2QA 4ONYA 4BDNA 4BDOA 5I2KA 4X48A 4XKPA 1JW5A 3OD7A 2FYIA 1NNFA 4WKMA 2ONSA 1LGBC 4F29A 3M3FA 3R7XA 4IY6A 2OZZA 1TFDA 1IZ1A 3O6IA 1BIYA 1LAGE 3IB1A 2RF1A 4KYDA 3G3HA 2QS4A 4PFWA 4KHZE 1H43A 1MXXA 2DXYA 3IO4A 4IGRA 4OHNA 3D4GA 1B05A 3U72A 1Y20A 1R6ZA 4U4SA 5KDTB 2X26A 3EHSA 2V3QA 3ILTB 5I58B 3IB2A 4RPOA 5I56B 1ZTYA 2XXHA 4U21A 4RYAA 1LCFA 4GXAA 3V83A 2XD2A 1FTMA 2RCAA 4F31B 3G3GA 3HSTA 2V25A 4G2ZA 2F7CA 4DCYA 4EXKA 1TFAA 3KN8A 1Z7NE 4YMAA 3L6HA 1H45A 4IO7A 2HCAA 2RINA 3TKDA 1B5JA 5I57B 4ZE8A 5L9SA 3FVNA 1MH4A 3W9VA 1B5HA 3KGCA 4XTCQ 1SI0A 1A8FA 1WODA 5KCJB 1Y1MA 3ZKLA 2A5TA 3UGWA 1MQHA 2F6PA 2I0CA 4F18A 3MWBA 4RY1A 1ZMGA 1O7TA 3EN3A 3HCQA 1USYE 4NF4B 5CBSA 3SERA 3OO9A 1OLCA 2O84X 3H6TA 4F22A 3MP6A 3FXQA 2I48A 1XHYA 3KOTA 3QYTA 2HQ0A 1A8EA 3O66A 4WEDA 3TAJA 2ZNUA 2F97A 3PPQA 1MQGA 4ELPA 5K2YA 4EF2A 1MQIA 4RK2A 1MG1A 3IR1A 4F1UA 3ONMA 2E1SA 5AA4A 3M8UA 1ZU0A 4OTEA 2H98A 3LSXA 5AA2B 1VFEA 4R6KA 3IJXB 1LCTA 3SETA 1XVXA 2DWHA 1RKMA 3H6WA 2ZNSA 2RC8A 1AH5A 3B6TA 1R9QA 3S9NC 1SD3A 4DXBA 4RNSA 1QW0A 3MP1A 1JQFA 2B65A 3VVDA 2UYEA 4ZEIA 3HHFA 1EH3A 3SEVA 4R6YA 4XKQA 2XXVA 4X1DA 1MXZA 3S2VA 4QFPA 4YKJA 1FTKA 3KSJA 4UACA 4PFYA 4EF1A 3ZKKA 4FE8A 5ISUA 5AA1A 4MFIA 4ESXA 1LAFE 4Z7EA 2ZYOA 2ZMBA 3PPNA 4JBZA 2QL3A 3UK4A 1EZPA 4WXJA 1WVJA 3LSLA 3B6QA 3N94A 1Y3NA 5LOMA 2Q89A 1B7ZA 4OZ9A 3IL1B 5M2VA 2DWJA 3PD8A 2H25A 1EZ9A 3WAFA 4Q8RA 3I3VA 4R74A 5B7DA 3C4MA 4NE4A 1GVCA 2I3VA 3FATA 1P1NA 1KWHA 2REGA 1MXUA 3RUMA 4NF8B 1QULA 4FATA 3S9EA 5H8HA 1PDAA 1UIVA 4BDQA 2DSFA 1FQDA 3MJNA 4I8CA 4U2RA 1FTJA 1CE2A 3H7MA 3RTWB 5L9OA 4R2BA 4M4GA 3A09A 3E3KA 4MLQA 2QSXA 4ECFA 3MPKA 1UTBB 3TCFA 4ZDMA 1MDP1 3K02A 1LFHA 5F1QA 4H8JA 2FNCA 4K3FA 3I6VA 1LB9A 1SW5A 4PFUA 3U92A 5CMBA 1XT8A 1BKAA 4N13A 3H3GA 4KCDA 4LQ5A 2HXWA 4QSEA 2GFEA 4JSOA 3WAEA 5H8NA 3T22A 1II5A 3QUJA 4I62A 3IX1A 1MS7A 2DVZA 3BKIB 1FCKA 2LAOA 5A5XA 2VOZA 4PP0A 4KFQA 3S4UA 3MPLA 3UP9A 3GXAA 4ND9A 4GVOA 3MVWA 3QIMA 1B46A 4G8NA 3KEIA 1IITA 4ZZEA 2R71A 2V84A 2I4CA 1JEUA 1JETA 2V93A 1AIVA 3GZGA 1FW0A 1B51A 4OVJA 5JK4A 3USDA 1B32A 3T9HB 3SEUA 4EQ7A 3M3KA 5H8QB 2YJPA 3SEWA 5DEXB 2GH9A 1DMBA 3OEMA 3Q25A 4H5GA 2ONKE 2THIA 3FVGA 4YKPA 4LONB 3FV1A 4H5FA 1D9VA 2XD3A 1IXGA 2UVJA 2YPNA 1DTGA 3KG2A 5I2NA 3DP8A 4PFTA 4YKIA 4EDPA 1NKXA 3N5LA 4IO4A 3O2AA 4ISUA 4TLLB 3JV9A 4YMBA 5FHOA 4GOTA 4JB7A 5TPAA 1I6AA 4YZZA 3IK6B 3KOSA 3OSQA 5DVIA 4F19A 1N3XA 1RYOA 4GQOA 3K2DA 1DOTA 2ABHA 3FJMA 4H8IA 3UORA 3QXMA 2B3FA 1MXYA 4GL8A 2H9BA 3OENA 4BLAA 4Q30B 4GIZA 4EQBA 3EHTA 2V3TA 1Q1KA 4F2OA 3VLWA 3CSGA 2D5WA 2Y7RA 3H4ZA 3TCHA 4KCCA 3PD9A 1A54A 5FTHA 5HPQA 3MAMA 3B6WA 5AA4B 3SESA 3HV1A 4LZ7A 3H03A 1B2HA 2Q2CA 1Y3QA 3O9PA 1SQYA 4NF5A 3PUWE 4OERA 1VFDA 1SYHA 3PPPA 2ESNA 4F3SA 3FVOA 4KQPA 4OYVA 4N07A 4HCYA 3H6VA 1OVTA 5ELVA 1B0LA 3DLNA 3DP6A 1US5A 5JTYB 4NEDA 1JVXA 1B3HA 4NMYA 3C34A 5L8DA 2NOOA 4KYEA 1HSLA 1J1NA 3C31A 4IO2A 5FTIA 3V5AA 1MPDA 2O51A 1EU8A 2OWSA 3GBBA 2O6AA 5AA3A 1TXFA 3T9XB 4JWXA 2F34A 5ITPA 4QFKA 2D3IA 3EPEA 3OMBA 3T93B 4JXIA 3MBPA 4G77A 3N6TA 2Q88A 4O3BA 4EQ9A 3L6GA 1OVBA 1M5BA 3VE1B 2DYXA 4F3PA 2P0SA 5HM4B 4OFJA 2CZLA 3ZSFA 4F1YA 1AOVA 2NWJA 2GHBA 3TFLA 4R2FA 3PMXA 1M5EA 1B6HA 3LSWA 4ELQA 3FD3A 1DTZA 2YLNA 3JZJA 3V89B 2R9JA 4QFLA 3K1PA 3OSRA 3E9XA 4YB5A 5H8HB 4Q0CA 2O68A 3MW0A 1LLSA 2F7BA 2OK2A 3TCGA 3FXRA 3PUYE 1M5CA 4DIGA 2XXQA 3T96B 4HCWA 3Q28A 3VVEA 2Z8FA 2UYFA 1B1HA 4ZEFA 3G3IA 4R73A 2M8CA 3EHUA 1B52A 1YTVA 4FORA 2OCUA 1M5FA 5TU0A 4PETA 4QF9A 1CB6A 5AE4A 2Y7WA 3HHGA 2KLFA 3MVXA 4G8HA 4ZEDA 1GTKA 1QKBA 3CFXA 4GXSB 3OO8A 3SEYA 1YCJA 4JWOA 2IA4A 1GR2A 3TPAA 3F11A 4U4XA 5H8NB 2QPQA 1Y3PA 1IEJA 3O29A 3HPIA 4OEUA 5A5XB 4I1DA 3CI8A 4QSDA 3TTNA 4G4PA 1N3WA 1SW1A 2Y7IA 2XXIA 4WEPA 2IEEA 3RN8A 3OXNA 4MBPA 4OENA 4AB5A 1P1UA 3SKPA 4JDFA 5I84A 3G7WA 1PB8A 1LBBA 2AIXA 1B3EA 2I4BA 4F39A 1FQCA 3FGSA 4BDMA 1H3DA 4GF8A 3BBRA 4E0WA 4LZ5A 3FV2A 3ZS6A 4ZEBA 1Y4CA 2VGQA 4YKKA 2VD3A 1LAXA 2G93A 1N7XA 3N26A 2A5SA 1MPBA 1FQBA 1N7WA 4H6DA 5CMCA 1Y9UA 1IUDA 4TLMB 2PVUA 4EXLA 4H65A 2HZKA 5I2NB 4DLDA 5EHSA 5F7VA 3Q27A 4H0WA 3TMGA 5TPAB 3AXFA 3IAZA 1IXIA 5DT6A 4FJPA 4Q5TA 4ZZAA 2DWIA 5CM6A 3C32A 1B3GA 3LBSA 5B70A 1S50A 3PPRA 2UVGA 5I57A 4RJZA 4NTLA 2WKYA 3MP8A 3PUZE 3FJ7A 1PB7A 2NVUB 4OMBA 5DTBA 4C1UA 3IOVA 2DQVA 2B3BA 2W7YA 1VR5A 1T0KA 3H6UA 1TWYA 1MY0A 1ANFA 4GWOA 1B7UA 2NUVA 5CBRA 3KSXA 3K6XA 2XX8A 3KZGA 3TQLA 4IGTA 4NF4A 2XX7A 3PUVE 1N76A 2AL5A 2OWTA 3T66A 5H8FB 1B1XA 2PT2A 2UVIA 3TTKA 3IO6A 4U23A 3RGYA 3TUSA 5I2KB 3MC2A 3TODA 3LUYA 2Y84A 2V3UA 1URSA 4NF5B 4PQJA 4R72A 4FEDA 3HO7A 4G8MA 3MQ9A 1P1OA 5J1DA 1NL5A 5L9MA 2F78A 3VXBA 1L5TA 2FA7A 2QMXA 1BTJA 3C33A 2E0SA 2H99A 1NMUA 5ITOA 1NFTA 3CRBA 1B9JA 4H67A 4ZEKA 3PMWA 2O7UA 5AA2A 3TTLA 2F6GA 2O1LA 2XXWA 2ZXTA 3C36A 4OESA 3V8XB 4OEVA 1FQAA 4AQ4A 4P11A 4X9TA 1SW2A 3MVYA 1HSJA 2PT1A 3UA8A 4U1ZA 1JW4A 1P1QA 1AMFA 4QHQA 4Z0IA 1N04A 3RTFB 1MQDA 3QSLA 3TDJA 1MY2A 1PC3A 3CIJA 4YB6A 2F7AA 4EUOA 4RK9A 1MQJA 4POWA 4LUBA 1O64A 3EQ1A 3VXCA 4G68A 2QJEA 2UVHA 1MPCA 3GBAA 5ICTA 5JEIA 2DE2A 2A5TB 2I58A 2GRVA 1PB9A 4GRKA 1HSEA 3VFJA 3E13X 1NH7A 4F3BA 3U93A 4M1VA 3KBRA 1URDA 5DYHA 1POTA 2Z8DA 1Y1ZA 3RNNA 1ZIUA 4R6HA 1B40A 1MH3A 5FHMA 5I59A 3UN6A 2ZYMA 2X7QA 1MXWA 3FIRA 4IY5A 2D21A 4RXLA 5CRYA 2XXTA 4XKRA 2Y7PA 4MH5A 4DCXA 3KJTA 1S7YA 3CSBA 2XXXA 2RKMA 1FTOA 2DOJA 3A3UA 3JYRA 4F3GA 1R9LA 4PE5B 3D4CA 4P0IA 4NF8A 3VLVA 1QKAA 4F1VA 2H5YA 1LFIA 4YB7A 1P1WA 2F36A 3RY3A 5DVFA 5FHNA 2XXYA 3EF7A 4O3AA 4ESWA 1Q35A 4DDDA 3RQTA 3LC8A 3T9UA 4BDLA 1LBCA 2ALUA 1UTBA 1P99A 3P7IA 1LSTA 2XHDA 4XIGQ 3IOWA 4KPTA 2OBGA 4OQOA 3N6UA 3U1OA 3H06B 4BDRA 1I6BA 3KN3A 1MY3A 3CR9A 5EHMA 1UTHA 2Q2AA 3B7DA 1URGA 2PBWA 3TYHA 2I0BA 3I5OA 3U94A 3KJ7A 4IO5A 5TP9A 3PV0E 1NNKA 3IOTA 1IXHA 4YAHX 3KN7A 2DVCA 3RT6B 1JW1A 4ELOA 2HEUA 2QS3A 2RCBA 2Z23A 4U22A 4DE8A 1IQ7A 3TZAA 1I69A 1DPPA 3K01A 4R9FA 4YU0A 4LATA 1B4HA 3FVKA 3O6HA 1XC1A 1F9BA 1MY1A 2XXRA 5K2XA 1EZOA 5H8QA 2HAVA 2VP1A 5ICQA 1D9YA 1FQFA 1ZKBA 1SYIA 1NNTA 5DEXA 4C0RA 3THIA 1MM6A 4ZS9A 5KZTA 1S9TA 1WDNA 2PMSA 4OWDA 1LFGA 5BUUA 1ELJA 2HAUA 4U1OA 1PBQA 1I6QA 4TOZA 4C1TA 2AL4A 4GL0A 3VVFA 1GGGA 4NF6A 5CMKA 1SW4A 4KD5A 3PGFA 3PMVA 2Y7KA 3O97A 2O7IA 4ELRA 3A3CA 1B3LA 2QS1A 1QVSA 3MZ1A 4DXCA 1YPNA 1VE4A 3KFMA 4YICA 1VSOA 3S9LC 1OMPA 1B4ZA 4FIMA 4QFOA 4LP2B 2P1SA 4OFLA 3K1NA 4UA8A 4KYSA 1N0TA 1MRPA 2DE3A 4FEBA 4G68C 2BJJX 5AA2D 3R26A 3LR1A 1IXCA 1POY1 4GFRA 1A55A 2I6EA 1PEBA 3RT8A 4P0GA 1LAHE 3O28A 4ZECA 3IORA 1N84A 1R1NA 2QMWA 1RYXA 3CG3A 4TQUQ 2H4IA 4MLVA 1A7LA 4RPNA 2Z22A 3K1MA 3RLFE 3FASA 1MM7A 3ECRA 2REJA 1QUJA 3BFTA 1H76A 3MVZA 3SEXA 2G29A 3MUQA 3TTRA 1SVXB 4FAJA 3IJOB 3O6GA 4RA1A 1TT1A 2DE4A 3DELB 4GLIA 2F35A 4R75A 3ODBA 3ILUB 4FECA 2HFBA 2P2AA 4QRZA 5JTYA 2F5XA 3FUZA 3CFZA 1UQWA 2UXAA 1XOCA 5KDTA 4IB2A 4G68B 1OIBA 1D4NA 5H8SA 3PU5A 3C9HA 1SDXA 1B58A 3TQWA 5I58A 5I56A 4H1XA 1ATGA 2DP8A 3K4UA 4KR5A 3CFLA 1OQGA 5CC2A 1A99A 1PBPA 4JWYA 3CG1A 3OO7A 4R9GA 3QAXA 5I59B 3W9WA 3K0VA 3BFUA 3MZBA 3VDFA 1NH8A 4HS7A 1UIUA 3OELA 4N6PA 4OFOA 3DP4A 3M3LA 3PUXE 2ONRA 3SDFA 5KCJA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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