1UTHA

Dntr from burkholderia sp. strain dnt in complex with thiocyanate
Total Genus 61
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
61
sequence length
219
structure length
219
Chain Sequence
TRNSFDPFASTRTFNLAMTDIGEMYFMPPLMEALAQRAPHIQISTLRPNAGNLKEDMESGAVDLALGLLPELQTGFFQRRLFRHRYVCMFRKDHPSAKSPMSLKQFSELEHVGVVALNTGHGEVDGLLERAGIKRRMRLVVPHFIAIGPILHSTDLIATVPQRFAVRCEVPFGLTTSPHPAKLPDIAINLFWHAKYNRDPGNMWLRQLFVELFSEAHHH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords LYSR-TYPE REGULATORY PROTEIN
publication title Development of a Bacterial Biosensor for Nitrotoluenes: The Crystal Structure of the Transcriptional Regulator Dntr
pubmed doi rcsb
source organism Burkholderia sp.
molecule tags Transcription regulation
total genus 61
structure length 219
sequence length 219
ec nomenclature
pdb deposition date 2003-12-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00126 HTH_1 Bacterial regulatory helix-turn-helix protein, lysR family
A PF03466 LysR_substrate LysR substrate binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1uthA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1uthA02
4OXVA 2ZNSA 5DEXB 3KSJA 1NNTA 1B52A 4I1DA 3UA8A 5I2NA 3VVFA 5I58B 2RC7A 1UTBB 1IEJA 1FTKA 3MW0A 2DXYA 4G8MA 4KYSA 5EYFA 4OERA 4H8IA 1EZOA 3C32A 4Q0CA 1MS7A 1UTHB 1ATGA 3T22A 1TT1A 3M3LA 4GIZA 2HZLA 2A5TA 1EZ9A 1AMFA 3S2VA 4U23A 3G7WA 3M8UA 1POTA 2O7UA 3R6UA 4MH5A 1FQDA 1XT8A 3VVDA 1Y3PA 4AB5A 5H8FA 1IXCA 3GBAA 1HSEA 3KJ7A 4L17A 3H03A 4QSDA 5TPAA 3PD9A 1Z7ME 2QPQA 2XXQA 1TFDA 4X1DA 2ANJA 1HSLA 3O29A 1A7LA 2V93A 1Q35A 4C1UA 3PPNA 2F35A 4R6YA 5L9MA 1DTZA 4EQBA 2UVGA 3IO6A 1QW0A 1IXHA 1DPEA 1SYIA 3W9VA 4ZEBA 4BDOA 4R9FA 2P1SA 4K3FA 1SD3A 4R2BA 2RCBA 2I48A 3EHTA 4FATA 5HBCA 1R9LA 1NFTA 1N76A 3MC2A 1URSA 4LP2B 3OOAA 4ZZEA 1Y4CA 4ZE8A 1LBCA 3PMWA 2XXHA 1UQWA 3KEIA 3QSLA 2V3QA 2OZZA 4XXUA 1B6HA 1US5A 3WAFA 3C35A 5CI5A 5DEXA 4NWDA 2H99A 3MVWA 1Q1KA 3MZBA 2VD2A 1JNFA 3JV9A 4POWA 1B3GA 3PV0E 4P0IA 2Y7PA 3W15C 4MFIA 3CFXA 4JSOA 3RQTA 4N6PA 4XKQA 3TPAA 4X9TA 5CBSA 4QFNA 4IO5A 1FTJA 3Q28A 5DVIA 1LLSA 2DE4A 3I5OA 3N6TA 3TCHA 4DZ1A 1EU8A 3IJXB 3TCFA 1LBBA 3N5LA 1USYE 2Z8DA 4ESWA 3SESA 2O69A 2V84A 3LSWA 3E3KA 4QRZA 3K4UA 1OQHA 2ZXTA 4HTGA 2DYXA 4RXLA 1MM6A 1PB9A 1ZU0A 1DTGA 4JSDA 1FCKA 2PBWA 1IZ1A 1POY1 3O97A 4YMBA 1MDQA 2DWIA 1SW2A 3O2AA 2I3WA 1WVJA 3VXBA 2ZYNA 3W9WA 1LAHE 1RKMA 4IO4A 3G3JA 3PPOA 3TYHA 1MH4A 4H5FA 4M1VA 1I69A 1LAXA 3H4ZA 4ZDMA 5AA4A 3C36A 1MRPA 3U8QA 2V3TA 2DWJA 3CI8A 2XXIA 1YAEA 3M3FA 4GVOA 4N13A 3BFUA 4F2QA 2XX9A 5AA1A 1SVXB 3U93A 1N3XA 3S9EA 4JB7A 2NOOA 4G2ZA 1H43A 1QUJA 4GXSB 2DP8A 3S9MC 2H4IA 4JWOA 4NF8A 4DIGA 1N84A 2Q8JA 4YB7A 3TTRA 1XC1A 3TODA 2OWSA 3FUZA 2D3IA 4F3GA 4NF6B 1IITA 1R1NA 5I2KA 4R2FA 3T9XB 4DCYA 1MM7A 2R9JA 1MQHA 1US4A 4HS7A 3M3KA 2RC8A 3RUMA 1Y1ZA 2P0SA 3SEWA 1HSJA 2DE3A 2OWTA 4F29A 4KHZE 3VXCA 4F3PA 3OELA 1F9BA 1YPNA 2QRYA 2DE2A 1OLCA 4R72A 3C9HA 1B4HA 1B0HA 3IOTA 3OMBA 3O66A 1ZIUA 3LR1A 2I49A 4YKIA 4RPNA 1AL3A 3Q29A 5DTBA 4PETA 1P1QA 3D4CA 1FTLA 2RINA 1IUDA 2ONSA 1MH3A 3U94A 1ZLQA 5DVFA 1WDNA 1XHYA 4DE8A 4HCWA 1PEBA 3C34A 4WEPA 4OESA 2Z8FA 4LA9A 3G3FA 2F34A 3KJTA 2DVZA 3RPWA 3EF7A 3O6HA 3DP6A 4X48A 5AA2A 5I84A 1SW4A 1MDP1 4RY1A 1GV8A 3HSTA 1YTVA 3SETA 1A8FA 3MUQA 3ZKKA 4YICA 3CVGA 1QVSA 2ABHA 4N07A 1B4ZA 2RF1A 3QK6A 3MZ1A 1MQIA 3VFJA 3IAZA 5FTIA 2THIA 1Y3NA 4AQ4A 1T0KA 2A5TB 4GD5A 5JTYA 3FVGA 4ELPA 4JBZA 1MXUA 1SYHA 1CB6A 4TLLB 5DT6A 5FTHA 4F3SA 4BLAA 4KFQA 4LVQA 4OYVA 4TQUQ 4I8CA 4ZEDA 5H8FB 4NF5A 3TTMA 4OZ9A 2FA7A 5TPAB 3T9VA 4OQOA 2XX8A 5BWJA 3E4RA 3FVKA 3FVOA 2O84X 4DXUA 1QUKA 3HN0A 2A5SA 1B58A 4IO2A 4OEUA 4R75A 1DSNA 4DXCA 1B5HA 4I62A 3TAJA 3OD7A 3T66A 5EHSA 3WAEA 5KZTA 2XXTA 1MY2A 4R6KA 3K01A 2M8CA 4YAHX 3GXAA 1PBQA 4C0RA 3CSBA 3L6GA 2F6PA 4IY5A 4U21A 1BP5A 1P99A 4IO3A 2B3FA 3F11A 3IOUA 3Q27A 1TWYA 3FJGA 4DDDA 1OVBA 2ALUA 3VLWA 3MP1A 5CBRA 1B7HA 1ZBMA 2NUVA 2Y7WA 4C1TA 5CMMA 1ANFA 1SW5A 1NL5A 2YLNA 4F1VA 4ZEIA 3T9HB 3TEPA 2VHAA 4YZZA 2O7IA 1WODA 1QKAA 3FGSA 1NH7A 3CG1A 4LZ5A 3TTNA 3U92A 4KQPA 1FQFA 2YJPA 1B7UA 4GQOA 2NWJA 1XOCA 1IIWA 5A5XA 3V89B 4RK2A 4LQ5A 1P1NA 1BLFA 2UXAA 3QYTA 3S4UA 4YB6A 3CR9A 1GR2A 2AYSA 2QS1A 3FIRA 5L9SA 4KCDA 1MQGA 1ZKBA 1OIBA 3O6IA 2ZNUA 3V83A 4OVJA 2GH9A 1PB8A 1FTOA 1VFEA 4DXBA 1LFIA 1R6ZA 5I56A 4KR5A 4E0XA 3PUVE 4F3BA 3IB0A 3FATA 4YMAA 1ZTYA 5CMBA 3IB1A 1FQBA 2QS4A 4FAJA 4F22A 3CSGA 2DSFA 1VFDA 5H8HA 1NNFA 3T9UA 3PUWE 3IR1A 5I57A 3QUFA 2RCAA 4U4XA 3BFTA 3H6VA 3DP4A 2DS9A 3E13X 4NE4A 3C33A 2AL5A 4RNSA 2I0BA 3I3VA 4GRKA 3Q25A 5KDTA 3RTFB 5AA4B 2Z22A 4IY6A 4QSCA 3FV2A 3T96B 1LAFE 2DQVA 2DXRA 3UORA 2HCAA 4WXJA 5AE4A 2H5YA 2IA4A 5ELVA 4ZEKA 5L9OA 4YKPA 3GZGA 3KBRA 3K0VA 2UYFA 4BDMA 4NF8B 4EQ9A 1VR5A 1PC3A 4F39A 1URDA 4GLIA 4Z0IA 1VE4A 1A99A 1LFGA 3MZ9A 3K6XA 1TXFA 3K1PA 2D5WA 3THIA 3MPKA 4FORA 3KG2A 5I2KB 3IOVA 1USYH 3V8XB 2B65A 1N7WA 2O51A 3VVEA 4G68B 1IXIA 4ELOA 4XIGQ 2XXUA 1MXWA 2F7AA 2LAOA 2QJEA 5H8NA 3TQLA 3HCQA 2F97A 3EN3A 4H6DA 2UYEA 3SEVA 2DVCA 1B7ZA 4OEVA 3VE1B 1P1OA 1FQEA 4EDPA 1M5DA 4KYDA 3VLVA 2O6AA 5JK4A 2O68A 3RGYA 4LZ8A 1PDAA 2V3UA 4H0WA 1JEVA 4QFKA 5DVJA 2GFEA 3I6VA 1OQGA 4H8JA 2F5XA 1DOTA 1MQJA 1RYOA 3MWBA 3TMGA 3IJOB 1MPDA 3PPRA 3KZGA 4P0GA 3CFLA 4AB6A 3ILUB 3QIMA 5ICQA 5AA2B 3CRBA 4TLMB 1GGGA 1B1HA 4H1XA 2QL3A 2OJTA 3RT6B 3PPPA 1B46A 4QFOA 1I6AA 3H7MA 4EUOA 3KFMA 3MJNA 1R9QA 1AH5A 4PFWA 3MAMA 5F1QA 3T93B 1NKXA 4GXAA 3IORA 2VOZA 3AXFA 2P2AA 2REGA 5JTYB 1O7TA 4OTEA 3PUZE 1SDXA 3O28A 5CMCA 2F8DA 3FD3A 1B1XA 2BJJX 2Q2AA 2Q89A 5HM4B 4G68A 4IGTA 4NF5B 3S9NC 1GTKA 3K00A 2H98A 1D3KA 3LSFB 3OEKA 1NMUA 2HFBA 5B70A 3BBRA 4ELRA 3VLUA 3TUSA 4G8NA 4WEDA 1Z7NE 4FE8A 4NEDA 2ZMBA 3KOTA 2XXPA 1H3DA 1B0LA 1FW0A 4IO7A 2ZYMA 1H44A 2G29A 3N26A 1NNPA 3FVNA 4H65A 1BTJA 4R74A 2I4BA 2G93A 5ISUA 3E9XA 4Z7EA 5TP9A 1Y3QA 5I59A 1S50A 3K2DA 3G3IA 2PMSA 1O64A 4F1UA 1XVYA 1B2HA 4PQJA 1JETA 5TU0A 2WKYA 3EQ1A 4UA8A 2HAVA 3ZS6A 3TTKA 3MPLA 4PFYA 3RNNA 3IK6B 3OSRA 4NF4A 1LFHA 1SI1A 2HAUA 4ELQA 4JWYA 3L6HA 2X7PA 3H6TA 3A09A 4BDNA 4EXKA 3OO9A 5A5XB 1N3WA 4KD5A 1QJMA 1S9TA 4F1YA 2Z8EA 4G4PA 4JXIA 1Y20A 1KWHA 4ZECA 2R6GE 2O1LA 2I4CA 3FV1A 3B6QA 3RTWB 3RY3A 3U72A 2ONRA 4YKJA 2DOJA 4JWXA 2Q88A 4IGRA 3TZAA 4QHQA 3IX1A 3K02A 1GVCA 3DM0A 3RLFE 5I56B 4R9GA 3ECRA 3LBSA 4GFRA 3VDFA 2QS2A 4ESXA 1UIVA 1NH8A 1N04A 3PUYE 4LONB 4OENA 4KI0E 4OFOA 2Q9TA 5H8HB 3TCGA 4PP0A 4M4GA 4RPOA 5I57B 1B3FA 5J1DA 1H76A 4PFUA 2PT1A 3TDJA 2ZNTA 3TFLA 2I6EA 2AIXA 1P1WA 4YKKA 2OCUA 3S9LC 3H06B 3DP8A 5KDTB 1MPBA 3K6WA 5M2VA 2F6GA 3FXUA 3HHGA 5IAIA 1JQFA 3JZJA 2XD2A 1UIUA 2PVUA 1YCJA 3CIJA 1PB7A 4XKPA 2E1SA 4EQ7A 3K1NA 3PGFA 1D4NA 5CM6A 2W7YA 2CZLA 3DLNA 1II5A 3IL1B 2QSXA 2GRVA 1OVTA 1LCTA 1P1UA 2XXWA 2XXYA 4LZ7A 1IQ7A 4TOZA 2I0CA 4Q8RA 1LB8A 1D9YA 5F7VA 1EH3A 1M5EA 2QS3A 1I6BA 4YU0A 4HW8A 2X26A 4ZS9A 4ECFA 4DCXA 4ND9A 4O3CA 2DWAA 3IB2A 5H8QA 1MXXA 4G68C 3SEUA 1A8EA 3P7IA 1ZMGA 4OFJA 2Y84A 5H8NB 4G8HA 4MLVA 4PFTA 1XVXA 4Q30B 4H5GA 4QSEA 4R73A 3QXMA 3OSQA 2F36A 2F7BA 4BDRA 3ONMA 3PD8A 1LGBC 4IB2A 2FNCA 3UGWA 5KCJA 4FIMA 2O1MA 3USDA 3MP6A 3QUJA 3OENA 5K2YA 4ZEFA 4XKNA 3UP9A 3QAXA 4U1OA 1JVXA 3EPEA 1D9VA 3TKDA 4QFPA 3MVYA 2H9BA 4BDLA 3R26A 1A54A 3ODBA 4UACA 1N7XA 3KN7A 2QMWA 4KPTA 3GBBA 4YB5A 4RJZA 2D21A 1FQCA 1LAGE 1FTMA 1OLAA 3MBPA 1AIVA 3HO7A 4FECA 2V25A 3RT8A 1RYXA 3V5AA 3SEXA 4MBPA 1J1NA 2QMXA 3UN6A 2I3VA 4GL8A 3GLBA 1MPCA 1MQDA 4P11A 3B6TA 2NXOA 5AA3A 5K2XA 1N0TA 2Q2CA 1CE2A 2UVHA 5I58A 1UTBA 3PMXA 3G3GA 1O63A 1QKBA 1BKAA 4F19A 3N6UA 1UTHA 1B3HA 2OBGA 3ILTB 2X7QA 3FXRA 5H8SA 4PE5B 1M5CA 1NNKA 2PX1A 2PT2A 1B51A 4OHNA 2HQ0A 1A40A 3N94A 1MY0A 1ELJA 1Y9UA 4KCCA 2GHAA 3FXQA 5FHNA 4OETA 2F7CA 4MLQA 3KGCA 3B7DA 4HCYA 1H45A 3Q26A 2OK2A 3LC8A 2F78A 2RKMA 3KOSA 3PUXE 4EF2A 4LATA 2HEUA 4NWCA 1PBPA 1TFAA 3B6WA 1B5IA 5TP9B 5I59B 1M5FA 1JW4A 1M5BA 2VP1A 3H6WA 1MXYA 3LSLA 2XXRA 2NVUB 3MP8A 3VV5A 2CMOA 3KSXA 4O3BA 2B3BA 5HPQA 3LUYA 4H67A 4ONYA 1SI0A 3UIFA 4NF4B 4XKRA 3RN8A 1LCFA 1URGA 2ZYKA 1B05A 1JW5A 5ICTA 4I9DA 1DPPA 4ZZAA 4Q5TA 4FJPA 1MG1A 5ITOA 3A3UA 4F18A 5ITPA 3H3GA 4ZE9A 2FYIA 4OWDA 5BUUA 1I6QA 3O6GA 3OEMA 5FHMA 2HZKA 5IKBA 4U22A 4E0WA 3OO7A 2XXVA 1B32A 3UK4A 3JYRA 1Y4TA 1OMPA 1S7YA 3BKIB 4F31B 2GHBA 1IXGA 3SDFA 3ZSFA 5EHMA 4NTLA 4GF8A 3G3HA 1MXZA 1B40A 1JVYA 4EF1A 3ZKLA 5CMKA 5L8DA 4RA1A 4GOTA 4MF3A 3MVXA 4LUBA 2XXXA 1MXVA 2R71A 2VGQA 2E0SA 3HV1A 2XHDA 3R7XA 3KN3A 3TELA 3EHUA 1AOVA 2OLBA 4DLDA 2Z23A 3OO8A 3CG3A 3SKPA 4O3AA 3K1MA 3IO4A 3G3KA 2XX7A 3SERA 1LB9A 4THIA 3PPQA 4U2RA 4LQ2A 4FEDA 3FJMA 4ISUA 4F2OA 1SQYA 2AL4A 5I2NB 1VSOA 2PYYA 1EZPA 2H25A 3OXNA 4RYAA 1JW1A 2UVIA 1JEUA 4OMBA 5B7DA 1A55A 4FEBA 3HHFA 2ONKE 4GL0A 4GWOA 4RK9A 5JEIA 3TQWA 1XS5A 4WKMA 1MY1A 1SBPA 3K6UA 2ZYOA 3C31A 5H8QB 3LSXA 5CRYA 3EHSA 1Y1MA 2YPNA 4NF6A 4X1BA 2UVJA 3FJ7A 5LOMA 3PMVA 4BDQA 5FHOA 1MY3A 3C4MA 4XTCQ 3FZVA 2Y7IA 3HPIA 3MVZA 1B5JA 5KCJB 1FQAA 3SEYA 3K6VA 2I58A 2KLFA 3PU5A 1MY4A 3IOWA 4KYEA 3A3CA 2VD3A 3O9PA 4EXLA 4IO6A 3FASA 2Y7RA 4QFLA 3MQ9A 4POXA 4U1ZA 2XD3A 4JDFA 1QUIA 4R6HA 1LSTA 1QULA 2RC9A 5CC2A 4QF9A 1ZJLA 2REJA 3DELB 1DMBA 1B9JA 2HXWA 3KN8A 4U4SA 1B3LA 5AA2D 3D4GA 2IEEA 3H6UA 2Y7KA 1L5TA 2ESNA 3CFZA 3OO6A 1SW1A 4G77A 4NMYA 4OFLA 1B3EA 1BIYA 3TTLA 3U1OA 2DWHA 5DYHA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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