1UWRA

Structure of beta-glycosidase from sulfolobus solfataricus in complex with 2-deoxy-2-fluoro-galactose
Total Genus 197
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
197
sequence length
489
structure length
489
Chain Sequence
MYSFPNSFRFGWSQAGFQSEMGTPGSEDPNTDWYKWVHDPENMAAGLVSGDLPENGPGYWGNYKTFHDNAQKMGLKIARLNVEWSRIFPNPLPRPQNFDESKQDVTEVEINENELKRLDEYANKDALNHYREIFKDLKSRGLYFILNMYHWPLPLWLHDPIRVRRGDFTGPSGWLSTRTVYEFARFSAYIAWKFDDLVDEYSTMNEPNVVGGLGYVGVKSGFPPGYLSFELSRRAMYNIIQAHARAYDGIKSVSKKPVGIIYANSSFQPLTDKDMEAVEMAENDNRWWFFDAIIRGEITRGNEKIVRDDLKGRLDWIGVNYYTRTVVKRTEKGYVSLGGYGHGCERNSVSLAGLPTSDFGWEFFPEGLYDVLTKYWNRYHLYMYVTENGIADDADYQRPYYLVSHVYQVHRAINSGADVRGYLHWSLADNYEWASGFSMRFGLLKVDYNTKRLYWRPSALVYREIATNGAITDEIEHLNSVPPVKPLRH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Hydrolase
molecule keywords BETA-GALACTOSIDASE
publication title Structural Studies of the Beta-Glycosidase from Sulfolobus Solfataricus in Complex with Covalently and Noncovalently Bound Inhibitors.
pubmed doi rcsb
source organism Sulfolobus solfataricus
total genus 197
structure length 489
sequence length 489
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.23: Beta-galactosidase.
pdb deposition date 2004-02-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00232 Glyco_hydro_1 Glycosyl hydrolase family 1
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1uwrA00
1W9XA 1BLIA 4MDOA 1KXHA 1WPCA 4P7NA 1NOFA 2E8ZA 3CUHA 1UWUA 5CPSA 3AHXA 2DPEA 5HPCA 3GXIA 3WF4A 4AXNA 1JZ6A 1W3LA 1E1EA 2W63A 1J18A 3GM8A 1WZAA 2PWHA 4Q7NA 2BNJA 3JUGA 1KQZA 1VENA 1OIMA 4BQ4A 3SCTA 1KXQA 2C0HA 4IUGA 3PN8A 2D0GA 5CGMA 3WQ8A 4W84A 2QLYA 3WD2A 1LWHA 3WMSA 2E0PA 4GKLA 6TAAA 4PN2A 2XTKA 1E6ZA 4M80A 2GJXB 3MUIA 2WYSA 4BQ5A 4GIAA 1R87A 3T2QA 4AD1A 4DUVA 4PMDA 4BS0A 2J4GA 3GH7A 1Z32X 3UG4A 4M81A 2A3BA 1OGSA 3SURA 2ZWYA 3D3AA 3KL3A 1JIBA 3N11A 5CSUA 4BA0A 3B9DA 2VUYA 1CXIA 3LPPA 8A3HA 1VFOA 1RP9A 1V0KA 2BHZA 2XFRA 3ALGA 4A4AA 2NT0A 4J28A 2VQTA 2GJXA 3OGRA 4PCTA 3F5KA 1XSJA 2J7FA 4KWUA 2DSWA 4UZUA 2V5DA 3PZTA 4LYPA 1V02A 3SCWA 4PMNA 3ARQA 1SR0A 3CLWA 2J8GA 3AHZA 1EQPA 4R5EA 2JEPA 4KGJA 3WD1A 1I1WA 3GZAA 3EDFA 1W1PA 4ZE5A 4UOJA 2ZUUA 1JNEA 2X1IA 4FF5A 1MFVA 3W29A 2VCAA 5HPOA 2XFFA 1WAWA 2ZXBA 1MQPA 3VVGA 4X0NA 2J25A 5IFTA 5M03A 5DFAA 1VIWA 1QW8A 5IDIA 1JD9A 1US2A 5GNYA 3ZM8A 2BY3A 4HU8A 2JF7A 2WMHA 5FIPA 1UUQA 1EGZA 1XRVA 2NSXA 1BHGA 4HPGA 1TVPA 5IHRA 5DT5A 4RE3A 3BXWA 5A6JA 3RDKA 3AMDA 1BYAA 1DHKA 1FHLA 4JKKA 4M24A 4B15A 1NWSA 1UA7A 4L4PA 4W8BA 1HP4A 3N17A 3MUY1 4OKDA 1KR1A 2YOCA 3EMCA 1FOBA 5A2AA 1UYQA 4EAMA 2D24A 3QHMA 2XHYA 2XVPA 1H4PA 3WY1A 2WKGA 4JCLA 3AHVA 4JFSA 1KGUA 3PBGA 4OBRA 1JZ2A 1BYCA 2TAAA 3CHEA 1DWHM 3M7SA 1SMDA 2QMKA 4BCEA 4JAWA 4TVUA 1TA3B 4B9YA 3W0KA 3ARUA 1WDRA 2O9RA 4MB4A 4UFIA 1UOKA 3POHA 4U31A 2FGLA 3MSGA 5AC4A 1BYDA 4PMZA 1K9TA 1FFRA 1WZKA 3GXFA 2E4TA 3VMOA 1JL8A 3OG2A 3SEPA 4AEEA 2CBIA 2JALA 3WF2A 3GNPA 1ZBKA 3SCUA 1W2PA 1OGBA 2PF0A 3KZSA 4P7LA 4WF7A 3L4YA 5LA2A 2XUCA 1VEOA 4DUXA 2GSJA 2WSKA 3F4VA 2G3JA 1R86A 2XVGA 1TA3A 2BY2A 2IXUA 2WM0A 1ZBWA 5FD0A 5D4YA 3B8SA 1H3GA 2EPNA 3VX0A 5D9NA 3CHFA 3ZOAA 4CN4A 1GCYA 2WMGA 3NDZA 4AZBA 4XZWA 1JI2A 1PPIA 4WSKA 5D9OA 1GOWA 3BSGA 4ATLA 1GW1A 4QP0A 2VNCA 3MO4A 2XPKA 2WW5A 2UWFA 5IXEA 3S2CA 3ZJ7A 1J12A 1QNRA 1V6VA 3L4XA 3SCRA 2PWGA 5I2UA 3UCQA 3GYCA 3NCOA 1GNXA 1S46A 2J78A 1JZ3A 2D20A 1QHPA 4XZBA 3BC9A 5E09A 1MQQA 3PZQA 3IJ7A 3TP4A 2YL5A 1BQCA 1UD4A 4UTFA 2BFGA 3F5LA 1GORA 1XYZA 2FGZA 1CENA 1H0IA 4HZ6A 3TTQA 1UD6A 1W9VA 2G3NA 3AI0A 4NI3A 3TA9A 1VJSA 3VGFA 1UWTA 2W61A 1GHSA 3MSDA 5DO8A 1GUVA 5BXPA 2CKRA 4MB5A 1BTCA 1EO7A 2YDQA 3T08A 4HMCA 1G9HA 1ISZA 1XYFA 1GQJA 3WQVA 4GI8A 1PZ2A 5A69A 2Y2WA 2WANA 1CXEA 2VOTA 4OZOA 3GXMA 2VX5A 2EPOA 4IISA 1JXJA 3BCDA 1KWGA 4FLRA 3L4TA 4URIA 1CNVA 3VO0A 4HA1A 4AZGA 2QV4A 4PYSA 4U33A 3ARRA 1HT6A 3AFBA 3VPLA 1HJXA 5AC5A 5JBFA 1X1NA 2VZVA 1B30A 2J8FA 1B1YA 2X2YA 3FAWA 3N04A 4UFJA 5D9PA 4GI6A 5ABEA 1KWKA 4UFKA 2VJXA 3VKKA 3BCFA 2CEQA 3SCPA 1HJQA 3AHTA 4HA3A 1BAGA 1US3A 1VF8A 1N82A 4AEFA 1KQYA 2GUYA 3W4RA 3WN6A 1W3HA 4X0VA 1F4HA 2WC3A 3LPFA 3OLGA 2WVTA 4PMRA 2CESA 4W8AA 2JIWA 2X0HA 4OOUA 4L4OA 1CGVA 1HJSA 3WKZA 2V3FA 2WZIA 4CN6A 1V03A 3A6OA 1BPLB 1Q6FA 3I3DA 1VEMA 1ZBVA 3IANA 4LGXA 3UESA 1RD6A 2CKSA 4MB3A 1Q6GA 2GDUA 4JL2A 4CKQA 3PZ9A 2ZE0A 1YQ2A 4PTVA 1IZKA 3AIVA 1R7OA 3GDBA 3OA5A 3DYPA 4P7RA 1UKOA 4H8UA 2QMJA 5EFFA 4KGLA 1LG1A 3AIEA 5CQ1A 3M46A 1LL4A 1Q4NX 1HVQA 3VDHA 3L2LA 1A47A 2DH2A 3POCA 4B3LA 2ZUNA 1EDQA 4P7QA 3WUGA 2IXVA 4UOQA 1C3FA 1E4MM 4RE2A 1EOKA 1B90A 1MQRA 4TX6A 1K9DA 1RP8A 4LXFA 2QHAA 3PZMA 1AQHA 1R8LA 4Z2HA 2O92A 1WNOA 4BF7A 1B9ZA 4AIEA 1FFQA 1XCWA 2CITA 3WDJA 1E1FA 2YLLA 2BY1A 3OGVA 1V6WA 3TTYA 2J47A 5BXTA 3WDQA 3VX1A 2YBUA 3WH5A 5A8NA 3EDDA 2ZIDA 4AD2A 2PB1A 2Y8VA 1HX0A 4GI9A 5LYRA 3GBEA 1MXGA 1V08A 1RPKA 2VCBA 4S3KA 2VZOA 1FH9A 4OIFA 2RGMA 2VZTA 5M3WA 3T0BA 1MFUA 1PJ9A 1CXLA 1LLOA 2X05A 3WNPA 4YN5A 3ZR5A 1WZMA 3L4UA 1EQCA 1M04A 3CMJA 2DSVA 2VI0A 4GQQA 2EJ1A 1XH1A 1KFWA 2EPLX 2DT0A 5EBAA 1NH6A 5D8ZA 1P6WA 3W28A 4CD7A 1X6NA 3A4WA 1MWOA 2AAAA 2NT1A 3AS0A 1G5AA 5IFPA 2CCRA 3OGSA 5CLTA 3K8MA 4C7DA 1FHDA 3MMWA 1BG9A 3PTMA 3WMCA 5ABHA 2GFTA 3L2MA 4WKAA 3BLPX 1ZBCA 4CCDA 3TOPA 4PSPA 3GXDA 4QLLA 4IPLA 4N42A 4CGTA 3RO8A 1HL8A 4JKLA 1JYXA 1HKJA 1UHVA 2BXZA 1QNOA 1EHNA 3OIHA 4M82A 2X0YA 3WF3A 4PUEA 1J0ZA 3WL1A 5A6LA 3HU7A 2XGBA 1IV8A 4HP5A 1H2JA 4CD4A 2V3EA 2VZUA 1UH4A 4J27A 3OLDA 1QHOA 1UQYA 3U7VA 1KB3A 1L8NA 2W66A 3PZOA 3AIQA 3WNLA 3WH7A 1DWFM 1TE1A 1UQZA 3GBDA 5JBDA 3AMKA 3WD4A 3WUEA 3ZSTA 2YKKA 4HU0A 2VRQA 2WHLA 3WIJA 5M17A 1JFHA 8CGTA 2PWFA 1UR2A 2WBGA 2XIBA 3CHDA 4DM1A 4EKJA 2WB5A 4DUWA 1AQMA 4D6HA 3CZGA 3VILA 1J0HA 4AD5A 2YDSA 3CZEA 4BQ3A 3N13A 4TVDA 1O7AA 4MDPA 3ECQA 5E6YA 3NUKA 4UCFA 1OT1A 4FMVA 5CXPA 3WFLA 4HPHA 1G1YA 4C7GA 2ZUSA 1B31A 2V38A 2QF8A 5BXSA 1EA9C 4J3TA 2JF6A 2XM1A 2DSKA 5A1AA 1HNYA 4UQBA 3N1AA 2VVNA 1E6NA 2YDRA 3I3BA 1JDCA 3VD9A 2UY5A 1CIUA 3CUFA 2ZICA 3CZLA 1MXDA 3ZMRA 1LF1A 1V6YA 1LG2A 2BY0A 5A2CA 4PRWA 1MW0A 4TVCA 1JGIA 4J3UA 1LL7A 1CLVA 3UETA 1EXPA 4AC1X 1CGWA 4CD6A 4OBSA 1QI4A 3SUWA 1H49A 1H11A 1LJYA 2DT2A 4AY1A 2NW0A 3LPOA 2WZHA 3AICA 3K46A 3CPUA 3MMDA 1QW9A 3AXHA 2O9PA 5KZ6A 4E8DA 1ITXA 3WDPP 2GK1B 2FHCA 5HXMA 1UR8A 1V6UA 3K4DA 1E55A 1WKYA 1JZ4A 1EOMA 3F5JA 3CUIA 1U33A 4J3SA 4B16A 2G3MA 1JFXA 4H7VA 3WH6A 5ABGA 3MUZ1 2JE8A 4OUEA 2CERA 4PMXA 4AZ6A 3VMPA 4JHZA 1OD8A 2XVKA 3IK2A 2F61A 1HKKA 4UFHA 3UR8A 4NZCA 4HA4A 5JUVA 3U7BA 2WHKA 3NSNA 1MVYA 4W89A 1NM9A 2GK1A 5C71A 4RL3A 1SMAA 3IJ9A 4YHEA 4AMCA 1GJUA 2XWDA 3FAXA 3RJYA 3HMCA 3ARTA 1U30A 3BAWA 3AIUA 3WSUA 3LPGA 2EBNA 1ZU8A 4GZEA 1HJWA 4B9ZA 1J01A 4CU8A 4GXPA 4FK9A 3MS8A 1WE5A 2WHJA 2ZX6A 1E6SM 3GTNA 3PTQA 3QOMA 5A8MA 3WENA 4AZIA 1BVNP 3PZIA 4LX4A 5EB8A 3W25A 4UQDA 1QI0A 1HIZA 1E6PA 2XJ7A 4WJXA 1SYTA 1DWGM 2GJPA 1E4IA 3AHYA 3THCA 1OM0A 1GOKA 1CGXA 5EMYA 5D9MA 5C8BB 3FY1A 1ZS2A 3IAQA 2W67A 3ZQ9A 1G0CA 1E0VA 4IPNB 5BROA 3WEZA 4QAWA 4Z2IA 1UKQA 3UG5A 1KR0A 1J10A 1ZL1A 2QPUA 3AIWA 1BVZA 2BVTA 4ZE4A 1OT2A 1EDTA 1H5VA 5CZKA 2OLHA 4UR9A 2WPGA 1VRXA 5BRPA 4P8UA 3VIOA 1QI5A 2UY3A 1B3ZA 4JHOA 4B3KA 3CH9A 3BMWA 1VFFA 4MNLA 4PCSA 4CD5A 1PZ3A 3RIKA 4UOZA 2ZX7A 5A95A 1E5JA 4KRTA 2D0HA 2W62A 1ZJBA 3MMUA 3UEQA 4HOWA 1B3WA 1JG9A 1YHTA 1W1VA 1KGXA 1E9LA 2XWEA 1BG4A 4P7OA 1GZJA 4HTYA 5GPRA 4AWEA 3RPMA 1CGUA 1O6IA 2FHFA 4W86A 1CPUA 4W87A 2DEPA 4QFUA 3KL0A 4KRUA 2YA0A 3FXYA 4WLCA 3EDEA 4D6IA 3CMGA 1FP9A 5TD4A 4AIOA 1UWRA 2OSYA 5BYWA 3RM8A 5A94A 1VJZA 3O2LA 2WXDM 3SUSA 3FNDA 2V5CA 2E8YA 3AYRA 5ABFB 2EQDA 2WLYA 3ARZA 4D6FA 4UFLA 1E6XM 5GQBA 1Y7VA 2WMFA 1M7XA 1XSIA 2VR5A 3VDAA 1MW3A 3QOKA 2DSZA 4ZFMA 3VIKA 1VBUA 1ISYA 2PBOA 3OLIA 3II1A 1HKMA 1JZ5A 4UQEA 3SCQA 3AZTA 1W91A 2VX4A 4DM2A 1HVXA 1V02E 3VD3A 5M5DA 4UQ9A 4OOZA 4F8XA 2ZXDA 3N9KA 3TTSA 3WBEA 1W2VA 2VX6A 1JZ7A 4TX8A 1WCGA 3VDCA 3NSXA 5ABFA 2J77A 3G6MA 1E3ZA 1OBAA 2FDMA 3WH9A 3MV11 4HZ8A 1OINA 2VX7A 4MADA 2XVLA 3SCOA 2D22A 3DHUA 2CBJA 1DEDA 2BVYA 2ESCA 1UD8A 2VT0A 2X8RA 5DEZA 2EXOA 1UH2A 3RCNA 3VD4A 5A6KA 3L4VA 3PHAA 3WUFA 1XD0A 4JZ5A 5E0FA 3NYDA 1V0LA 2WMJA 4ATDA 3QHOA 2ZWZA 4AD3A 1CXFA 4ACYA 3KL5A 5AYIA 5A6AA 2FH6A 2CETA 4JL1A 1B2YA 1W1TA 4YPJA 1E4NA 5DT7A 2VO5A 1OSEA 2AOSA 5I23A 1AVAA 3CZ8A 2EO7A 3CUJA 4IM4A 3ZIZA 1E73M 3VGBA 4PMQA 1BGAA 1C8YA 2E40A 1M03A 1JZ8A 3W26A 1UWSA 1XV8A 2VCCA 1MW1A 2XG9A 4W93A 4U2YA 1UR9A 1J11A 2DT1A 3DHPA 4FLSA 2VURA 4CD8A 2VZSA 4GZJA 3VNZA 4ACZB 1I75A 2IUZA 3GH4A 5JIPA 4GO9A 1B3YA 4AD0A 4H2CA 1TG7A 4X9YA 2YA2A 1V3KA 2OWCA 2DH3A 2HVMA 5A8QA 1UG6A 2G41A 4UZSA 1UKTA 4JFTA 4LYRA 5FL0A 5F7UA 3SUTA 2J7DA 4PTXA 1PX8A 3W37A 1GQIA 1F4AA 1W9DM 3ARYA 2CXGA 1W9PA 2J79A 4HMEA 4ACZA 3BAKA 2G8ZA 1LL6A 5E9AA 1WP6A 3W82A 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chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1W9X A;  1BLI A;  4MDO A;  1KXH A;  1WPC A;  4P7N A;  1NOF A;  2E8Z A;  3CUH A;  1UWU A;  5CPS A;  3AHX A;  2DPE A;  5HPC A;  3GXI A;  3WF4 A;  4AXN A;  1JZ6 A;  1W3L A;  1E1E A;  2W63 A;  1J18 A;  3GM8 A;  1WZA A;  2PWH A;  4Q7N A;  2BNJ A;  3JUG A;  1KQZ A;  1VEN A;  1OIM A;  4BQ4 A;  3SCT A;  1KXQ A;  2C0H A;  4IUG A;  3PN8 A;  2D0G A;  5CGM A;  3WQ8 A;  4W84 A;  2QLY A;  3WD2 A;  1LWH A;  3WMS A;  2E0P A;  4GKL A;  6TAA A;  4PN2 A;  2XTK A;  1E6Z A;  4M80 A;  2GJX B;  3MUI A;  2WYS A;  4BQ5 A;  4GIA A;  1R87 A;  3T2Q A;  4AD1 A;  4DUV A;  4PMD A;  4BS0 A;  2J4G A;  3GH7 A;  1Z32 X;  3UG4 A;  4M81 A;  2A3B A;  1OGS A;  3SUR A;  2ZWY A;  3D3A A;  3KL3 A;  1JIB A;  3N11 A;  5CSU A;  4BA0 A;  3B9D A;  2VUY A;  1CXI A;  3LPP A;  8A3H A;  1VFO A;  1RP9 A;  1V0K A;  2BHZ A;  2XFR A;  3ALG A;  4A4A A;  2NT0 A;  4J28 A;  2VQT A;  2GJX A;  3OGR A;  4PCT A;  3F5K A;  1XSJ A;  2J7F A;  4KWU A;  2DSW A;  4UZU A;  2V5D A;  3PZT A;  4LYP A;  1V02 A;  3SCW A;  4PMN A;  3ARQ A;  1SR0 A;  3CLW A;  2J8G A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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