1V6WA

Crystal structure of xylanase from streptomyces olivaceoviridis e-86 complexed with 2(2)-4-o-methyl-alpha-d-glucuronosyl-xylobiose
Total Genus 163
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
163
sequence length
436
structure length
436
Chain Sequence
AESTLGAAAAQSGRYFGTAIASGKLGDSAYTTIASREFNMVTAENEMKIDATEPQRGQFNFSAGDRVYNWAVQNGKQVRGHTLAWHSQQPGWMQSLSGSTLRQAMIDHINGVMGHYKGKIAQWDVVNEAFSDDGSGGRRDSNLQRTGNDWIEVAFRTARAADPAAKLCYNDYNIENWTWAKTQGVYNMVRDFKQRGVPIDCVGFQSHFNSGSPYNSNFRTTLQNFAALGVDVAITELDIQGASSSTYAAVTNDCLAVSRCLGITVWGVRDTDSWRSGDTPLLFNGDGSKKAAYTAVLNALNGGSSTPPPSGGGQIKGVGSGRCLDVPNASTTDGTQVQLYDCHSATNQQWTYTDAGELRVYGDKCLDAAGTGNGTKVQIYSCWGGDNQKWRLNSDGSIVGVQSGLCLDAVGGGTANGTLIQLYSCSNGSNQRWTRT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Hydrolase
source organism Streptomyces olivaceoviridis
publication title Crystal structures of decorated xylooligosaccharides bound to a family 10 xylanase from Streptomyces olivaceoviridis E-86
pubmed doi rcsb
molecule keywords ENDO-1,4-BETA-D-XYLANASE
total genus 163
structure length 436
sequence length 436
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.8: Endo-1,4-beta-xylanase.
pdb deposition date 2003-12-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00331 Glyco_hydro_10 Glycosyl hydrolase family 10
A PF00652 Ricin_B_lectin Ricin-type beta-trefoil lectin domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 1v6wA01
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1v6wA02
1MW2A 3AHXA 1HJUA 1E5JA 1M2TB 3IJ7A 1I1XA 3F5LA 3RJYA 1ISVA 1HWNB 3WQ6A 3WENA 1CXKA 5AC5A 4EKJA 2FHBA 3UD9A 4Z2IA 2ZUVA 3FNDA 4QCFA 4ZGRB 3ZJ6A 4ZXLA 4AY1A 4P7RA 2O9PA 1JY0A 1C3FA 1H2JA 1XGZA 4W84A 2VRJA 4BQ3A 4Q9PA 2K8RA 3CHDA 3WBAA 2WMIA 1XC6A 2JEPA 2VOTA 2VTFA 4KWUA 4W5UA 1UR4A 1US3A 1VBUA 4EFPA 3SCWA 1G9DA 1HVXA 4Z2HA 1DQGA 1E4IA 3MU7A 1UD6A 4ENDA 1KQYA 3F5JA 3RDKA 2J7BA 2YJQA 1UHVA 2GVYA 2V3EA 1W9BM 1WDRA 2W62A 2NTDA 5GQBA 2DSWA 1JDAA 3ARWA 2Y9XE 5A6JA 5A6KA 3A4XA 3DECA 1EA9C 3VOCA 2F61A 2E4MA 3HN3A 4II0A 3WMVA 2YA0A 5FZZA 1GORA 2J25A 5D4YA 2RSTA 1AF9A 3WNPA 4UFJA 1E70M 5CG0A 5I2UA 2J7EA 3A21A 1HXJA 4D6DA 1BAGA 3OB8A 3B9DA 3CAHA 2F8QA 3M6DA 1UKPA 1FHDA 4I4VA 1OT2A 3PZNA 4LO1C 4Q7NA 1J10A 1OT1A 1TA3A 2UY3A 2WHKA 2WCAA 3N7JA 1W9UA 4FGFA 2WPGA 2EO7A 1UD2A 2XM1A 1E6PA 9CGTA 2BNJA 3MUZ1 5I24A 3K8KA 4CU6A 4J3WA 4U3CA 3FJ8A 4WKAA 3ARUA 4UFKA 4LO8B 4ZE5A 3BSGA 3NJ5A 5I1BA 1HP5A 3AKIA 2VCAA 1P6WA 3AZRA 1AVAA 2D24A 2YUGA 3OGGA 4WIWA 4OUJA 3TONA 1HKIA 4A7ZA 1J18A 4LPCA 2WZHA 1VJSA 3K4DA 2VZTA 1XV8A 2J7FA 5E6ZA 4LO7B 3S2CA 4ATLA 1H09A 4TTUA 5BOWA 3DHPA 3UD7A 3AI0A 1VBRA 2E9MA 4C7DA 4F34A 1K5UA 5CPTA 1ISYA 3L2LA 1V0NA 2WW5A 2YLLA 1E73M 3WMBA 4CN1A 5EG6C 4UZSA 5ABHA 4IHZA 4I7IA 2WRYA 1NZKA 1BHGA 1QHZA 2J7DA 1HJWA 1TFMB 5DF0A 4I37A 4AD1A 2XPKA 2Z1SA 1HJQA 1VEPA 1UKSA 1JIBA 4JHOA 3CZJA 5A6SA 4B3LA 3HSMA 5FNWA 4UFMA 2K43A 2NVHA 1NP0A 1XD1A 1MQQA 2LIEA 1EO7A 4H04A 4AZ7A 4GOYA 1UR2A 1WZAA 1JFHA 2PC8A 4P7NA 1TVPA 4AZBA 3FJIA 1EVTA 3WINA 4X0NA 2V38A 1OD0A 5EC5A 1AQ0A 2GJXB 1JQZA 1UD5A 2RQ9A 1AXMA 2BFHA 4Q91A 4GPNA 4KC3A 4PMZA 3K4AA 1XHGA 1OGSA 4J3SA 2WKLA 7I1BA 1GJUA 5D62A 2VRQA 3T2QA 4JFUA 1KB3A 5CSUA 1VFFA 1DQOA 3AH1A 3KMVA 1ISZA 3VGHA 2VZUA 1B0IA 2E8ZA 4L4IA 4FVVA 4HTYA 4BCEA 1KGWA 1NOFA 1W3HA 2EQDA 1UR9A 3OZOA 1IILA 3BMVA 4PMQA 4A4AA 3WKZA 4RE2A 2DSUA 3BCFA 5DO8A 3MMUA 4JCLA 1CXLA 31BIA 2BXYA 1WDSA 1KWKA 6A3HA 3PZVA 2ZOXA 3RSJA 4DEPA 5I79A 1UWSA 2FGZA 4C7FA 3CZGA 3ILAA 1B3ZA 2WK2A 5BXTA 3VDCA 4PSRA 1H4PA 1NUNA 4E2OA 3FGMA 1HJVA 1W1YA 3ZR5A 1OCQA 1V3JA 2D0HA 3CBWA 5HNNA 1CXIA 1K5VA 4AN7B 4P0LA 1JG9A 3AYRA 1Z2VA 2J79A 3BAYA 4F79A 2YL6A 4TOQA 1B2YA 3VO0A 3UEQA 3AXHA 1CNVA 1JTCA 1HN1A 4KRUA 4YOLA 1FMMS 3LLPA 1RMLA 2RG9B 4J3UA 3DYPA 4B16A 1LL7A 3P6IA 4KGLA 1XH1A 2VVNA 1FP9A 1WAWA 2F2FA 1HCDA 1ECEA 1KFWA 3WFLA 4I4UA 3AFBA 1G1YA 4PRWA 1MD6A 1E6QM 1ZS2A 1N4KA 4U5KA 5IFTA 1DWHM 1V3IA 1SMDA 3ZJ8A 1H5VA 1Z4SA 1VF8A 2OSWA 1HT6A 4DWSC 3VGFA 3WL1A 2CKSA 4ZENA 5BRQA 1HL8A 2WZIA 3D7WB 1XHBA 3UETA 2E4TA 2JFEX 2C8NA 3KE0A 3OLDA 2WCGA 2Y8KA 1UR1A 3RCNA 3RTIB 3KL5A 4USPA 4AEEA 3WQ4A 2FH8A 1JYXA 4AZCB 3GXIA 4V27A 2CCRA 4QD2C 2XVNA 1DLLA 1R8NA 3NBCA 3PHZA 1FHLA 1SFSA 4MNKA 3W25A 4C7GA 4F83A 2WMHA 3RPMA 5FD0A 2WHMA 4HU0A 2FDBM 5GNXA 2GK1A 2G3MA 3GBDA 4CCEA 4X0VA 3BA4A 3A47A 4PTXA 3VSZA 4I4SA 2VSEA 2D0FA 1JFXA 4NF7A 2X2YA 4JL1A 4MDPA 5A6MA 1W3KA 1O6IA 1XG6A 3WH7A 3VD7A 1KGXA 3N7KA 2E4MC 1ZJBA 1C7SA 5I23A 1A47A 3NBNA 1AMYA 2Z49A 3POCA 1UWTA 3UDAA 3RILA 1I1EA 5CXPA 4LYPA 4G6MA 4D6IA 4DM1A 3CUJA 2D23A 3OGFA 2BXZA 2AQZA 4D6FA 2MLLB 2VJXA 1CDGA 3WEMA 1GW1A 3T2PA 2CEQA 1G9CA 1Q6FA 1UKOA 3L4VA 3QGVA 3VKKA 4P0KA 1Q6EA 2D1ZA 2E0PA 3CA6A 1QNOA 2GUYA 3KZSA 3UJ4A 2XTKA 4PBGA 4J28A 2J7GA 3O2LA 5M03A 1H0GA 2WCSA 3BAWA 2EBNA 5IHRA 5JBDA 1XH2A 3AHTA 2QYIB 4WSJA 4HU8A 4QBCA 3WNLA 2WMIB 5CGTA 3OBAA 4GP0A 2VR4A 3BAHA 2XFFA 1AVAC 2GO2A 1GOOA 4AC1X 4BF7A 1R86A 2BY1A 2J75A 3QYDA 1KR0A 3GNOA 1PUMB 3U7BA 1MW0A 1WCGA 4QD2B 1DFQA 3AZWA 3ZC8A 5FIPA 3FJFA 5B2HA 41BIA 5A1AA 5ABFA 3I3EA 1JXKA 4ML4A 1PZZA 3SEPA 3B8SA 4NI3A 3VGBA 1DEDA 2FFUA 5E24E 1Q04A 4HOXA 2FHCA 1FH9A 5A8NA 2X0HA 5A2CA 4QLLA 3BRGC 3VD5A 3ZXGA 3THDA 4ZKTB 1GQIA 4TVDA 3O4AA 1JD9A 5I6SA 2PB1A 3NYDA 4JKLA 1WPCA 4I4RA 3BAKA 2KKIA 5D9MA 1VFMA 1QNSA 2UY2A 3EDJA 4QFUA 1WZLA 3OJMA 1ZL1A 3GNPA 1JXJA 2MANA 3CGTA 1HIBA 3FAWA 3PHAA 4HZ7A 3EMZA 1TA3B 5IDIA 3WMSA 2DS0A 2V3FA 3IK2A 4MNLA 4MDOA 4URIA 5A8QA 3FN9A 3B9EA 3UERA 1S0FA 4EANA 3VD9A 1J0SA 2YL8A 4A3HA 1QI2A 3A07A 2WWDA 1WKYA 1BGAA 3GH7A 3CRHA 4KH2A 3GXFA 3LTQA 1OBAA 1I1BA 3BB2A 4IY8A 4CN4A 1JLYA 3II1A 3AS1A 5A95A 1JDCA 1JI1A 2YDSA 4AYSA 2CETA 1JGIA 1NOUA 4AIOA 1WB0A 2VCBA 1C8QA 2O9RA 3AS0A 1G01A 2IHOA 2WC3A 4PCSA 1LJYA 5FL1A 2WAGA 1GQJA 3N15A 4CJMA 2BFGA 3M7SA 2PBGA 1J0JA 21BIA 3O49A 3NSXA 4UQCA 3MO4A 1BYCA 2ZQNA 1KNMA 5CJ5A 3TTOA 3WH9A 3Q7XA 3ARRA 1V0KA 1A3HA 1E55A 2WZEA 4KGJA 1GQKA 2OYMA 1TWMA 4DUWA 1KQZA 4HMCA 3VTRA 4OJYA 1W3AA 4F66A 3JUGA 4AMCA 4ZFUB 4A7KA 3EMQA 1E6XM 3AIBA 4W87A 1RZOB 1QQKA 1J0ZA 5M5DA 3S8JA 2ZUMA 1EGZA 1XSKA 3VINA 4CD4A 3GXMA 2CESA 1E56A 2Y2WA 4FLRA 1PZ2A 4GZJA 3I2XA 5DUYA 1TUXA 4HOZA 3WDIA 2C7FA 3AYSA 4UFIA 3UESA 2F2FC 2DSVA 1G9BA 2BEAA 4CVUA 1X6NA 3MMWA 4PSPA 5DEZA 2G8ZA 5IXEA 1NQ6A 3GH5A 4FLQA 2CIPA 3WEZA 5A94A 1HJSA 3IAPA 2J62A 2WMJA 4M24A 1V02E 3HALA 1EDGA 4D8HA 3I3DA 1JNDA 2D3LA 1KCLA 2HISA 3ZJKA 1NWTA 4EB2B 2WVVA 4BQ4A 4F9DA 1JT5A 1GOKA 3WUBA 1PC8B 3C9ZA 4H9WA 1C92A 5E6YA 4W89A 5A2BA 1II4A 1QOXA 5CLWA 1M53A 2VZSA 2F2HA 1PWAA 3CHCA 3MALA 3PTQA 3TTQA 1J0KA 3W37A 3Q7WA 3FHAA 5A6BD 7A3HA 5I0DA 4V2XA 3OIHA 1SMAA 4W5ZA 2IWTB 3D5HA 2WSPA 4H7VA 3O6AA 1ZBVA 2HWAA 3T2OA 4S3KA 3BCDA 2JF6A 2PWEA 2WB5A 2TAAA 3U57A 4UOZA 2VX4A 3OLGA 3WDPP 1V0MA 4DWSA 2PWHA 5HBFA 2YA2A 4TVCA 1UUQA 1R8LA 2UY5A 1FWUA 1B3XA 1SR4A 2BS9A 2D7IA 1BSIA 4IPNB 2XYLA 3IAQA 5BQUA 4QAWA 3SUVA 4BQ5A 3M07A 1HWPB 2YBUA 3AMCA 4YHGA 1BYAA 5JBFA 2AXMA 2XVPA 3RO8A 4HPHA 3VSFA 2G41A 3BLPX 3FJAA 1V6VA 3SCOA 2DSKA 4AD0A 3FJHA 3FJCA 3N13A 5TD4A 4AD3A 4OOZA 1XYZA 2OYLA 1HWOB 1BG4A 4HA3A 3O9NA 3VGGA 4HOWA 4QALA 3D3AA 1HVQA 1E72M 1E4LA 5HOSA 3VDHA 3W38A 3E1F1 3RJXA 4BZYA 5LYRA 2YOCA 1QXMA 3VIGA 3VM7A 3VIJA 2WBCA 5LA2A 1JAEA 4I1EA 4X38A 1XCXA 3AHVA 4MB4A 1UZ1A 2GJRA 5HPCA 1HF6A 2G3IA 3AMDA 4WKFA 3THCA 1BFCA 3WD4A 1LWJA 1W2PA 4MNMA 5BXRA 5EFDA 1HWMB 4HZ8A 3AROA 3CPUA 2W92A 1VB9A 3W4RA 5C71A 2XGIA 2J3PA 3FW6A 3CUGA 3PZ9A 2OLHA 1HKNA 5JMCA 1OD8A 1DTUA 3I29B 2DH3A 3OJ2A 1VIWA 3VIHA 2GK1B 3AH2A 4MB5A 6I1BA 1QHPA 2X0YA 4G9NA 1IV8A 2DEPA 4J2YA 4YPJA 1ITXA 5FCZA 4NZCA 1V6YA 1HJXA 4TUFA 2EJ1A 1JZ2A 3VUOA 1EH9A 1J11A 3ARSA 3BGAA 3AHYA 3SCNA 4UTFA 2ET2A 3FJEA 2DT0A 2OWWA 4UNIA 1R87A 3WBEA 1R7OA 2QLYA 2ZXQA 3SCSA 3V0AA 3SCQA 3PN8A 3WUFA 1L8NA 1T9FA 4IONA 3H6QA 1CZ1A 2EXOA 3MS8A 4GQQA 3WD1A 5A69A 2J74A 1HP4A 2UWFA 3ARZA 3QHOA 4I1BA 4ACZA 4D0TA 4GI6A 5E0CA 1JF5A 3WDRA 4KEJA 3POHA 3ARTA 3VGEA 4ZOTA 3RM8A 1WZKA 1NM9A 4I8MA 1BVZA 1RP9A 2DREA 1AQMA 4UOQA 3IM7A 3A4AA 3L4UA 3K46A 2WHJA 4W85A 2ZUWA 3U5YA 4R6UB 3IM5A 5EFFA 4OUEA 7TAAA 3ZX7A 1F4AA 1QI0A 1H11A 3AS2A 4JKQA 4XV0A 3W6LA 9ILBA 4I0YA 3SUSA 5EBAA 1GHRA 1XD0A 2QPUA 4H8HA 3MPPG 4BQ2A 1GVYA 2O9OA 2ESCA 2L5XA 4LO3A 3WD3A 3BSHA 5ABFB 2BHYA 1W1VA 5EHAA 5FZYA 2WMKA 1AVXB 3L4TA 3W29A 5DFAA 1FV3A 3U5UA 1V3LA 2ERMA 1M16A 4U5IA 3VEQA 5BCAA 1V3HA 1UG6A 1CXHA 3R4SA 1MXDA 4UQ9A 4L4PA 2EPOA 1J0YA 3ZSSA 2X2TA 3AS3A 2BVDA 1M7XA 1TCMA 3S6TA 1S0BA 2RGMA 4Q22A 1JYNA 2AAAA 1KCKA 3ZOAA 1IOBA 1US2A 2ZX6A 3SUTA 2M49A 4DENA 4JIEA 3WH6A 1PX3A 4IY9A 3GDBA 3M46A 4QLJA 3WDJA 1CGVA 3WH5A 4QLKA 4GIAA 2IUZA 1W32A 1DWIM 6TAAA 3AZVA 1FFRA 1TMQA 4XFUA 4OIFA 4H41A 3BAVA 4QO3A 1B90A 3NDZA 1A8DA 2FGLA 4EAMA 3ALFA 2K4AB 5KEZA 1E6RA 1TG7A 4CD6A 3UJ0A 1NOWA 2W67A 3B9AA 3CLWA 2Z48A 3E8LC 3KWXA 2MIBA 3CMGA 3CA0A 2XOAA 2W5FA 1EIBA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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