1V9EA

Crystal structure analysis of bovine carbonic anhydrase ii
Total Genus 75
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
75
Knots found
sequence length
259
structure length
259
Chain Sequence
SHHWGYGKHNGPEHWHKDFPIANGERQSPVDIDTKAVVQDPALKPLALVYGEATSRRMVNNGHSFNVEYDDSQDKAVLKDGPLTGTYRLVQFHFHWGSSDDQGSEHTVDRKKYAAELHLVHWNTKYGDFGTAAQQPDGLAVVGVFLKVGDANPALQKVLDALDSIKTKGKSTDFPNFDPGSLLPNVLDYWTYPGSLTTPPLLESVTWIVLKEPISVSSQQMLKFRTLNFNAEGEPELLMLANWRPAQPLKNRQVRGFPK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords Carbonic anhydrase II
publication title Structure of bovine carbonic anhydrase II at 1.95 A resolution.
pubmed doi rcsb
total genus 75
structure length 259
sequence length 259
chains with identical sequence B
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2004-01-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 1v9eA00
2FOQA 3KKXA 4YVYA 3MNJA 3RG4A 2ILIA 1CNHA 3P4VA 5DRSA 4YXIA 1CNKA 1G52A 4RIVA 3OILA 5DOGA 2QP6A 3HKQA 3IBUA 1RJ6A 3JXGA 4QSBA 5FLRA 1G1DA 3RLDA 3T5UA 3U45X 4YX4A 3S8XA 4QTLA 1F2WA 2OSMA 2H15A 1IF6A 1IF8A 4KNJA 1EOUA 2NNGA 3CA2A 3MDZA 1AVNA 3DD8A 5E5RA 1DMYA 5JGTB 1YDBA 1CVDA 4HT0A 2CBBA 3P3HA 2GEHA 5AMLA 3KS3A 4Q8XA 1CAOA 3BL0A 3HKTA 5DVXA 1CAMA 1FQLA 4CA2A 3M98A 4Q78A 3W6HA 5DOHA 3RG3A 2CBEA 2Q1BA 5E2KA 2WEOA 4HBAA 5EH8A 2WD2A 1T9NA 3M14A 3SBHA 1HEBA 4Q8ZA 3OYSA 2HL4A 2FNMA 5EHVA 5EOIA 1TH9A 3HFPA 3BETA 4N16A 5C8IA 1G4JA 1H9QA 2FOSA 2NWPA 1BNTA 3D9ZA 4G7AA 4QK2A 5EHWA 5FNIA 1LUGA 1CANA 1FQMA 3RJ7A 3RYZA 4YHAA 3VBDA 4MLTA 5FNKA 4PQ7A 5EKMA 4QIYA 1CA2A 5CLUA 4FU5A 1CNBA 1BN4A 4KNMA 5EH5A 2EU2A 5DSQA 2OSFA 3CZVA 3M5TA 4TWMA 1CILA 4YYTA 3P44A 3V3GB 4LU3A 1CCUA 5A6HA 9CA2A 3FE4A 3S75B 1TG9A 1G54A 4WUQA 1CVHA 4Q87A 1G46A 3NI5A 4XZ5A 1CNXA 5EKHA 5BNLA 4M2VA 4ITOA 4QJWA 1H4NA 2FMGA 3P5AA 1G0EA 3UYQA 3RZ0B 5DSLA 3ZP9A 1URTA 4FIKA 4KUWA 2VVAX 1CAHA 1YO2A 4RUYA 1CVCA 2Q1QA 3M2NA 3MNHA 1JCZA 4E3DA 3JXHC 5G0BA 5E2SA 5E2MA 4YGFA 5FLOA 3S77B 1YO0A 5JEPB 1KWRA 3TVNX 4QJ0A 5FNLA 3M1JA 1ZNCA 1UGAA 3U47A 4ZX1A 3NJ9A 1ZGEA 5EIJA 1JV0A 3M2ZA 5SZ4A 3Q31A 1V9IC 4FVOA 3IAIA 5DSPA 1RZEA 3RYJB 4Q7WA 1FR4A 2F14A 2H4NA 4XIWA 5DSOA 4JSWA 2EU3A 4E49A 5JQTA 4YGLA 1HEAA 2NWYA 3RYVB 1CRAA 4ZWYA 1UGBA 3T5ZA 1Z9YA 4FL7A 1XEGA 4KNNA 1AZMA 3ML2A 1MUAA 4DZ7A 5E2NA 1BNMA 1XEVA 4Q9YA 3CYUA 1FQRA 1YDCA 3V7XA 2HOCA 1RZDA 4QSJA 5BYIA 3V5GA 5LMDA 1CNIA 2FOUA 4IWZA 5SZ7A 1YDDA 4HEZA 3MHIA 1THKA 2NNSA 2NXTA 1CAIA 1ZH9A 4E3HA 1TBTX 3DD0A 4WR7A 5DSKA 1FSQA 1CCSA 1DCAA 4KP8A 4KUVA 1HUHA 1CINA 3B1BA 4KAPA 5G03A 3T84A 4JSSA 5JGSB 3SAXA 1ZGFA 4Z1KA 2WEHA 5AMGA 4G0CA 2CBDA 3M2YA 3RZ8A 3DVDA 1FSNA 2HNCA 3FW3A 3N2PA 4YXOA 2NWZA 3IEOA 3S74B 5J8ZA 3MNUA 4Q6EA 1I9NA 5E5UA 4YGNA 2NN7A 3S97A 1CNGA 1I90A 5E2RA 4UOVA 3DVBA 3DCSA 4YGJA 5FNJA 3IBIA 4ZWZA 4ETQC 3P58A 1I8ZA 1G6VA 1KOQA 1CNJA 4Q0LA 1CIMA 3P55A 4WW6A 4YXUA 1G48A 4Q99A 4E3FA 2QO8A 1CVBA 1BNVA 1FQNA 3RZ1B 4RFDA 5FL4A 1YDAA 2NMXA 4Q7VA 3M96A 3MNAA 2NXSA 2AX2A 5SZ5A 2HKKA 4CQ0A 4JSAA 1BN3A 1CCTA 3D8WA 3OIKA 3K2FA 3OY0A 5FDIA 1KEQA 2WEJA 3RGEA 1RJ5A 1IF5A 1BNWA 1HCAA 4HU1A 5JG3B 1HEDA 1I9QA 1BNUA 3B4FA 1ZFKA 5G0CA 4K0SA 3P5LA 4Q6DA 2FNNA 4PYXA 4PXXA 3NB5A 5EH7A 4YGKA 1FSRA 2POWA 1CAKA 5FLSA 4CNWA 1Z93A 5FL6A 4ZWXA 4MTYA 1UGFA 1CAYA 5FNHA 3OIMA 3T82A 1BCDA 1CNWA 3C7PA 1I9LA 8CA2A 3EFTA 1XPZA 1DCBA 5JQ0A 4Q49A 3U3AX 4CNRA 2Q38A 3OKVA 4HT2A 1TG3A 4K0ZA 5FLTA 4ZWIA 5BRUA 1I91A 4MLXA 2QOAA 2W2JA 3W6IA 1BNNA 1UGCA 3DV7A 3OYQA 2NWOA 3MNKA 5SZ6A 1BICA 4M2RA 4Q7PA 3RZ7A 3K7KA 3MZCA 4Z0QA 4Q06A 3DVCA 3KLDB 5CACA 1LG5A 4YWPA 5JDVB 1I9MA 4XIXA 3S73B 1RZCA 1OKLA 2FW4A 2POVA 4LHIA 4QJMA 1TE3X 4QSIA 5IPZA 5DSJA 4KP5A 4RUXA 3F7BA 4JS6A 3R17B 4WW8A 5EKJA 4CNXA 5SZ1A 3R16A 3TVOX 3PYKA 3ML5A 4Q81A 4Y0JA 4QJXA 4Q07A 1TEQX 2HFWA 4RN4A 4COQA 1I9OA 1G53A 1LZVA 4N0XB 4QSAA 3V3HB 5FLPA 3D92A 1TTMA 2WD3A 1LGDA 4E9OX 4FRCA 3S76A 3F4XA 1IF7A 2NXRA 4FVNA 1BN1A 1TB0X 1AM6A 4R5AA 3V3IB 3V2MA 3S71B 1V9EA 1RZBA 4QJPA 1UGDA 2X7UA 1TEUX 2X7TA 5JESB 3PJJA 1I9PA 3HLJA 1RZAA 3QYKA 1CA3A 3S9TA 3FFPX 4PZHA 1OKMA 4MDMA 1HCBA 3ZNCA 1RAZA 3HKNA 1G45A 5BRWA 5DSIA 4L5WA 4K1QA 3HS4A 3DC3A 3DBUA 1IF4A 4Z1JA 4E5QA 1UGGA 1CRMA 1Z97A 4QK3A 4M2WA 2VVBX 4CNVA 3M5SA 3MHOA 4L5UA 3OKUA 3UYNA 4X5SA 4CACA 3T83A 5JG5B 4HEYA 1HECA 1MOOA 4ZAOA 5EZTX 4BCWA 4MDGA 1DMXA 3S72B 2FNKA 3V3JA 1FR7A 1ZSCA 2FMZA 4QK1A 1Y7WA 4QIZA 3M3XA 4DZ9A 7CA2A 2AW1A 3GZ0A 5AMDA 5E28A 5A25A 2FOYA 3JXFA 4XFWA 4HF3A 5SZ2A 3LXEA 3M40A 4QY3A 3DCWA 3DA2A 4JSZA 5JEHB 3M1WA 3MHLA 2IT4A 2CBAA 1CNYA 1IF9A 4Q8YA 2O4ZA 1CALA 5EHEA 3RYYA 2FOVA 3M1QA 3N3JA 3N0NA 1FLJA 3DC9A 1XQ0A 4K0TA 2NN1A 4BF6A 2WEGA 4E3GA 3PO6A 3KNEA 4MDLA 2CABA 2GD8A 3CAJA 4Z1EA 4QEFA 4R5BA 5FL5A 5CA2A 3TMJA 1CZMA 5JEGB 4RH2A 4Q7SA 6CA2A 3D0NA 3SBIA 4Q83A 3MMFA 1RAYA 4GL1X 1ZSBA 3IBLA 3K34A 4WUPA 1CAJA 2EZ7A 3MHMA 4IDRX 1CAZA 3N4BA 3V2JA 3F7UA 1UGEA 2NNOA 4RIUA 2ABEA 3DAZA 1ZE8A 3KOIA 4RUZA 4QJOA 5FDCA 3M5EA 4PYYA 4HEWA 3KOKA 5G01A 3M1KA 12CAA 1YO1A 4K13A 4L5VA 1G4OA 1HVAA 5L3OA 1JD0A 3EFIA 5FLQA 1BV3A 4ZX0A 3RZ5A 3KIGA 5DSMA 3M2XA 4MO8A 5SZ3A 4Q90A 4XE1A 3HKUA 3DCCA 3M04A 1H9NA 4C3TA 1CNCA 1CVEA 3S78B 1G3ZA 3MYQA 1HUGA 5CJFA 5BRVA 1BNQA 3D93A 4ITPA 4RFCA 4KUYA 3P3JA 3V3FA 1J9WA 3BL1A 1OKNA 2ZNCA 3L14A 1G0FA 3SAPA 3IBNA 4E4AA 2NNVA 1KOPA 3T85A 4Z1NA 3IGPA 1ZSAA 4KNIA 5DSNA 5HPJA 2HD6A 5DSRA 1BZMA 4R59A 2X7SA 3U7CA 3KONA 3MHCA 4FPTA 4WL4A 3RYXB 3MWOA 4LP6A 1OQ5A 1CVAA 2CBCA 3KWAA 1A42A 4KV0A 5FNGA 5SZ0A 5L6KA 4BF1A 2CA2A 3MNIA 2POUA 1KWQA 4M2UA 1CVFA 1ZFQA 4TWLA 3F8EA 4ILXA 3M67A 4Q09A 4Q08A 5FNMA 1LG6A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2FOQ A;  3KKX A;  4YVY A;  3MNJ A;  3RG4 A;  2ILI A;  1CNH A;  3P4V A;  5DRS A;  4YXI A;  1CNK A;  1G52 A;  4RIV A;  3OIL A;  5DOG A;  2QP6 A;  3HKQ A;  3IBU A;  1RJ6 A;  3JXG A;  4QSB A;  5FLR A;  1G1D A;  3RLD A;  3T5U A;  3U45 X;  4YX4 A;  3S8X A;  4QTL A;  1F2W A;  2OSM A;  2H15 A;  1IF6 A;  1IF8 A;  4KNJ A;  1EOU A;  2NNG A;  3CA2 A;  3MDZ A;  1AVN A;  3DD8 A;  5E5R A;  1DMY A;  5JGT B;  1YDB A;  1CVD A;  4HT0 A;  2CBB A;  3P3H A;  2GEH A;  5AML A;  3KS3 A;  4Q8X A;  1CAO A;  3BL0 A;  3HKT A;  5DVX A;  1CAM A;  1FQL A;  4CA2 A;  3M98 A;  4Q78 A;  3W6H A;  5DOH A;  3RG3 A;  2CBE A;  2Q1B A;  5E2K A;  2WEO A;  4HBA A;  5EH8 A;  2WD2 A;  1T9N A;  3M14 A;  3SBH A;  1HEB A;  4Q8Z A;  3OYS A;  2HL4 A;  2FNM A;  5EHV A;  5EOI A;  1TH9 A;  3HFP A;  3BET A;  4N16 A;  5C8I A;  1G4J A;  1H9Q A;  2FOS A;  2NWP A;  1BNT A;  3D9Z A;  4G7A A;  4QK2 A;  5EHW A;  5FNI A;  1LUG A;  1CAN A;  1FQM A;  3RJ7 A;  3RYZ A;  4YHA A;  3VBD A;  4MLT A;  5FNK A;  4PQ7 A;  5EKM A;  4QIY A;  1CA2 A;  5CLU A;  4FU5 A; 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