1V9IC

Crystal structure analysis of the site specific mutant (q253c) of bovine carbonic anhydrase ii
Total Genus 69
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
69
Knots found
sequence length
261
structure length
261
Chain Sequence
RCSHHWGYGKHNGPEHWHKDFPIANGERQSPVDIDTKAVVQDPALKPLALVYGEATSRRMVNNGHSFNVEYDDSQDKAVLKDGPLTGTYRLVQFHFHWGSSDDQGSEHTVDRKKYAAELHLVHWNTKYGDFGTAAQQPDGLAVVGVFLKVGDANPALQKVLDALDSIKTKGKSTDFPNFDPGSLLPNVLDYWTYPGSLTTPPLLESVTWIVLKEPISVSSQQMLKFRTLNFNAEGEPELLMLANWRPAQPLKNRCVRGFPK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase
source organism Bos taurus
publication title Crystal Structure Analysis of the site specific mutant (Q253C) of bovine carbonic anhydrase II
rcsb
molecule keywords Carbonic anhydrase II
total genus 69
structure length 261
sequence length 261
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2004-01-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
C PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 1v9iC00
1OKMA 1MUAA 1HECA 4K0SA 3V3IB 4E9OX 5JEGB 4KUWA 4Q7PA 1BCDA 4Q09A 1Y7WA 2W2JA 2QOAA 4FRCA 4RUYA 1UGCA 1CA2A 1CINA 1UGFA 3M2ZA 4MLXA 6CA2A 3MHIA 3TVOX 4QY3A 5FLSA 1KWQA 1CAYA 5DSKA 2NNVA 3U45X 1YO1A 4MO8A 4Q6EA 4Z0QA 5FDCA 3RZ5A 2NXSA 3MDZA 1BNNA 4YXIA 2CBAA 2Q1BA 1BN1A 4FU5A 3RZ7A 4E3FA 1HUHA 3W6IA 2FOQA 1CAJA 2WEHA 3CZVA 3M04A 4E4AA 2HKKA 1CNJA 5DSOA 1ZSAA 5BYIA 5FNKA 1UGEA 4K1QA 3UYQA 3OIMA 1CAHA 3HLJA 3QYKA 4Q87A 4QK3A 5JGTB 1RJ5A 3KNEA 3NJ9A 3IGPA 5E2RA 4QK2A 3RYVB 1XEGA 4Q07A 2FNNA 4K13A 1LG6A 5A6HA 4Z1JA 5EKJA 3S73B 4BF1A 4Q7VA 5CJFA 1THKA 1A42A 5JESB 4L5VA 3F7BA 5FNJA 3OYQA 2NXTA 5L6KA 3V3JA 4LP6A 1TH9A 2FOSA 1BNTA 3U3AX 5DSMA 4CACA 3OKVA 4FVOA 1I9LA 3DCCA 1FSNA 3D9ZA 4K0ZA 4UOVA 4HU1A 3CA2A 3KOKA 4M2WA 5FLQA 4Q6DA 1BN4A 1CAZA 1G46A 5E2KA 2GD8A 1IF7A 3K7KA 1OQ5A 1ZGFA 1ZSCA 3D8WA 5FL5A 3DD8A 3RYZA 3S75B 5AMDA 5EHVA 1URTA 1G52A 3RG4A 3HFPA 3RZ0B 1KOPA 4K0TA 2QP6A 1CNXA 3NI5A 1CNKA 1MOOA 3IBNA 5BRUA 4JSWA 1IF5A 1ZGEA 3FFPX 4YGJA 5E2SA 2ZNCA 4XIXA 1CALA 5FL4A 1FQLA 3M3XA 2FOUA 3FE4A 4MDLA 3DC3A 3JXGA 5FNLA 1HCBA 3P5AA 5SZ7A 1OKNA 1YDAA 2GEHA 1ZE8A 1I9NA 2Q38A 4RH2A 5EH7A 2F14A 4Q8ZA 3U7CA 1FLJA 4QJOA 1LUGA 5CA2A 1I9PA 5IPZA 3R16A 4MDGA 5CACA 4IDRX 3D93A 2EU2A 4QJWA 2HNCA 3S77B 1CNBA 2VVBX 3MZCA 3T82A 7CA2A 3RYXB 4QJPA 3S9TA 4JSZA 4E3GA 4Z1KA 5FNIA 4JSSA 4PQ7A 5SZ0A 1BN3A 1YDDA 3P3JA 2X7SA 4Q7WA 4QJXA 3R17B 4YX4A 1G4OA 4RFCA 2WD3A 3T84A 1DCAA 5A25A 4QSIA 4HEWA 4E3DA 5JEPB 1ZFQA 3HKQA 1BNWA 2O4ZA 3UYNA 2WEJA 1CANA 5EKHA 3DVCA 1CNCA 1IF9A 2NWZA 4M2UA 2HOCA 1HUGA 4RN4A 3DBUA 3S97A 3DD0A 5JGSB 3RYYA 3M1JA 3P3HA 5DSLA 4YWPA 3N0NA 4FVNA 3MNIA 1CNYA 1DCBA 1FSQA 4ILXA 4YGNA 1UGAA 1OKLA 4ZWXA 4E49A 4Q99A 4RIUA 2CBBA 2FOVA 5FLTA 1CVEA 3MNJA 1I9QA 4HT2A 5DSNA 3N2PA 4WUPA 5SZ3A 2NN1A 3K2FA 4PXXA 2NNGA 3FW3A 4Q9YA 4QIZA 5JDVB 4QJMA 1XEVA 1HCAA 3M2XA 4WW6A 2FOYA 3ZNCA 1G3ZA 3W6HA 1CVBA 2WEGA 1BNVA 1T9NA 3JXFA 4LU3A 3ML5A 3ML2A 4Q08A 3IBLA 3HS4A 3RZ8A 5LMDA 3PJJA 3M1QA 1FQMA 3PO6A 4RIVA 3Q31A 3B1BA 4Q7SA 5BRWA 1ZNCA 4XIWA 1TTMA 2EZ7A 3BETA 1TEQX 1G54A 3D92A 2NWYA 1CAMA 1FQNA 3MNUA 3S76A 4Z1NA 1BNQA 2Q1QA 4CNWA 4DZ7A 1UGDA 3KOIA 3RGEA 3RYJB 1TG3A 4YGFA 5CLUA 5DSRA 1CRMA 2NN7A 5L3OA 1CCTA 1AVNA 1H4NA 1TEUX 4RUXA 4LHIA 5E2NA 1F2WA 3U47A 4XE1A 4YXUA 1KEQA 3BL1A 1AZMA 1DMYA 2NXRA 2CBDA 3MWOA 3S71B 2WD2A 1G45A 2NWOA 1FR7A 3MNAA 4ETQC 5G03A 5FLOA 4DZ9A 1G1DA 3MHLA 5G0BA 4CNVA 1Z97A 4CNXA 1RAZA 1FR4A 4HEYA 4Q90A 3T5ZA 4C3TA 4RUZA 1UGGA 1IF6A 3F4XA 3RJ7A 1BNUA 3BL0A 1CAOA 5EZTX 2WEOA 3DC9A 3K34A 5FL6A 1CRAA 4HF3A 4L5WA 5AMGA 1AM6A 3IAIA 1CAKA 1G53A 3PYKA 4KNNA 4KAPA 5JG3B 3M5EA 3HKUA 1JD0A 2CABA 5JQTA 1JV0A 3M96A 4ZWIA 1UGBA 4BCWA 3DVDA 3L14A 4JS6A 3SAXA 1BV3A 12CAA 5FLRA 1G0EA 5SZ1A 3KONA 4RFDA 5SZ6A 1RZCA 5EH8A 4E5QA 3V5GA 5AMLA 3KWAA 5FNGA 1CCSA 3KS3A 4X5SA 4HT0A 4XFWA 3F8EA 3VBDA 3S8XA 4Q8XA 1G48A 5FNMA 5DVXA 4KUVA 3T5UA 2CA2A 1CVDA 5JG5B 3KIGA 4ZX1A 4CQ0A 1HEDA 1FQRA 3SBIA 4N16A 1ZH9A 4MDMA 4GL1X 4YGLA 5E2MA 4COQA 4TWMA 2ABEA 1CAIA 1H9NA 1YO0A 2NWPA 1YDBA 3P58A 1KWRA 4YGKA 4CNRA 3T85A 3MNHA 3OIKA 4QEFA 1G4JA 1FSRA 1RZEA 3B4FA 5SZ2A 4BF6A 1CILA 1Z93A 3JXHC 4L5UA 1DMXA 4YYTA 1YO2A 4PZHA 1HEBA 2NNSA 4G0CA 5SZ5A 4KV0A 1CVHA 4MTYA 1RZAA 5DOHA 5FLPA 4KP5A 4R59A 3RG3A 2FNMA 4XZ5A 2OSMA 3MNKA 5J8ZA 4ZX0A 2POWA 4Z1EA 4ZWYA 3DV7A 1HEAA 4KP8A 3P55A 5E5RA 1I9OA 4QJ0A 2IT4A 4PYYA 4G7AA 4CA2A 3V3GB 1LGDA 3ZP9A 4R5BA 3GZ0A 4KNIA 3S74B 5DRSA 3MHMA 3S72B 3MYQA 4Q81A 2ILIA 1EOUA 4QSBA 3M5SA 3V7XA 1ZSBA 3RZ1B 4M2VA 4YHAA 1CCUA 1BNMA 1XPZA 2FMGA 5JQ0A 5BNLA 3TVNX 4WL4A 3IBUA 1TG9A 4Q0LA 4R5AA 5DSJA 1LZVA 1CA3A 2FW4A 4Q78A 1RZBA 3LXEA 3M1WA 5E5UA 3IBIA 3M40A 3MMFA 3DVBA 4WUQA 5EKMA 3DA2A 3D0NA 2X7UA 1KOQA 3EFTA 3RLDA 5E28A 1I8ZA 5G01A 2CBCA 1CNGA 3MHOA 2VVAX 4QSAA 1JCZA 1RJ6A 1XQ0A 3F7UA 3P44A 5FNHA 3C7PA 1BICA 4FPTA 4PYXA 2H4NA 5HPJA 1G6VA 1Z9YA 4Q06A 2X7TA 2OSFA 2FNKA 4QTLA 3CAJA 4MLTA 1CNWA 9CA2A 3SAPA 2AW1A 4FL7A 2HFWA 2POUA 4ITOA 3V2JA 1I90A 4WW8A 1G0FA 4WR7A 1TB0X 3DAZA 5DSPA 3V2MA 4QSJA 5EHWA 4Q49A 3S78B 4FIKA 1HVAA 5EH5A 2CBEA 2AX2A 3EFIA 4E3HA 3N3JA 5DSQA 3N4BA 3OKUA 5JEHB 3IEOA 3M5TA 1IF4A 4KNJA 2QO8A 4YVYA 5EIJA 3NB5A 3T83A 1ZFKA 2NMXA 3M67A 1V9EA 3OY0A 2H15A 4QK1A 4IWZA 4YXOA 5SZ4A 1CVAA 4KUYA 1BZMA 4QIYA 3M2NA 4Y0JA 3M1KA 1LG5A 4M2RA 3MHCA 5C8IA 1TBTX 5DSIA 4JSAA 3M98A 1RAYA 5FDIA 1CIMA 4ITPA 4Q8YA 4ZAOA 2FMZA 4ZWZA 4KNMA 5EHEA 1V9IC 5EOIA 1CNIA 3DCWA 8CA2A 3CYUA 5BRVA 4HEZA 3HKTA 4HBAA 1J9WA 3KLDB 2HD6A 5DOGA 1YDCA 3OYSA 2NNOA 4Q83A 3KKXA 3P4VA 4TWLA 1IF8A 1TE3X 3HKNA 3OILA 3DCSA 1RZDA 4N0XB 3V3FA 1CVCA 3P5LA 3SBHA 1I9MA 3M14A 3V3HB 1CVFA 2HL4A 3M2YA 1CNHA 1I91A 5G0CA 1CZMA 3TMJA 1H9QA 2POVA 2EU3A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1OKM A;  1MUA A;  1HEC A;  4K0S A;  3V3I B;  4E9O X;  5JEG B;  4KUW A;  4Q7P A;  1BCD A;  4Q09 A;  1Y7W A;  2W2J A;  2QOA A;  4FRC A;  4RUY A;  1UGC A;  1CA2 A;  1CIN A;  1UGF A;  3M2Z A;  4MLX A;  6CA2 A;  3MHI A;  3TVO X;  4QY3 A;  5FLS A;  1KWQ A;  1CAY A;  5DSK A;  2NNV A;  3U45 X;  1YO1 A;  4MO8 A;  4Q6E A;  4Z0Q A;  5FDC A;  3RZ5 A;  2NXS A;  3MDZ A;  1BNN A;  4YXI A;  2CBA A;  2Q1B A;  1BN1 A;  4FU5 A;  3RZ7 A;  4E3F A;  1HUH A;  3W6I A;  2FOQ A;  1CAJ A;  2WEH A;  3CZV A;  3M04 A;  4E4A A;  2HKK A;  1CNJ A;  5DSO A;  1ZSA A;  5BYI A;  5FNK A;  1UGE A;  4K1Q A;  3UYQ A;  3OIM A;  1CAH A;  3HLJ A;  3QYK A;  4Q87 A;  4QK3 A;  5JGT B;  1RJ5 A;  3KNE A;  3NJ9 A;  3IGP A;  5E2R A;  4QK2 A;  3RYV B;  1XEG A;  4Q07 A;  2FNN A;  4K13 A;  1LG6 A;  5A6H A;  4Z1J A;  5EKJ A;  3S73 B;  4BF1 A;  4Q7V A;  5CJF A;  1THK A;  1A42 A;  5JES B;  4L5V A;  3F7B A;  5FNJ A;  3OYQ A;  2NXT A;  5L6K A;  3V3J A;  4LP6 A;  1TH9 A;  2FOS A;  1BNT A;  3U3A X;  5DSM A;  4CAC A;  3OKV A;  4FVO A;  1I9L A;  3DCC A; 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