1VDWA

A hypothetical protein ph1897 from pyrococcus horikoshii with similarities for inositol-1 monophosphatase
Total Genus 75
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
75
sequence length
253
structure length
248
Chain Sequence
SVKTWRKIAIDIIRDFDHNIMPLFGNPKASETISIETKVVDKVAENIIISKFKDLGVNVVSEEIGRIDQGSDYTVVVDPLDGSYNFINGIPFFAVSVAIFHEKDPIYAFIYEPIVERLYEGIPGKGSYLNGEKIKVRELAEKPSISFYTKGKGTKIIDKVKRTRTLGAIALELAYLARGALDAVVDIRNYLRPTDIAAGVVIAREAGAIVKDLDGKDVEITFSATEKVNIIAANNEELLETILRSIEK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords hypothetical protein PH1897
publication title The crystal structure of hypothetical protein PH1897 from Pyrococcus horikoshii with similarities for Inositol-1-monophosphatase.
rcsb
source organism Pyrococcus horikoshii
molecule tags Structural genomics, unknown function
total genus 75
structure length 248
sequence length 253
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2004-03-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00459 Inositol_P Inositol monophosphatase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.540.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Fructose-1,6-Bisphosphatase; Chain A, domain 1 Fructose-1,6-Bisphosphatase, subunit A, domain 1 1vdwA01
3.40.190.80 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 1vdwA02
3RPLA 1IMEA 1LBZA 1FBHA 1KA0A 5EQ8A 1EYIA 2BJIA 1NUYA 1RDYA 5ESYA 5IZ1A 1FPGA 2F3BA 1EYKA 3B8BA 1FBCA 2P3VA 2P3NA 4GBWA 4GX3A 1YZ0A 5A5LA 1IMCA 2Y5LA 1G0HA 1KZ8A 3RPLB 2QVVA 3D1RA 1QGXA 1FPIA 1FPLA 2HHMA 3QMFA 1NV5A 4GWWA 1BK4A 1NUWA 1FBGA 1LBYA 1FJ9A 1FPKA 5ET7A 1NV2A 5DW8A 1LBVA 4O7IA 1YYZA 1IMBA 4FBPA 4H45A 5EQ9A 1NV3A 1NV0A 1FPDA 2JJKA 2QFLA 4I3EA 1YXIA 5F24A 5EYHA 1G0IA 4GWSA 1NV7A 2GQ1A 2WEFA 1RDZA 4KXPA 5J16A 1FTAA 1DK4A 2QVRA 4GBVA 5ET6A 3BIHA 2PCRA 1INPA 4HXVA 1XI6A 3KC0A 1FBFA 3LUZA 4N81A 3IFAA 2Y5KA 1CNQA 2FHYA 2CZIA 1FBDA 1DBZA 1FJ6A 1RDXA 2VT5A 2DDKA 1KA1A 4HE0A 4GX6A 1LBWA 4HE1A 1NV1A 2F3DA 1FPEA 4MJOA 1NI9A 5I3SA 4PTKA 4GX4A 5IZ3A 4AS5A 5EYGA 2FBPA 3FBPA 4QXDA 4G61A 3BIGA 1AWBA 2Q74A 2WBDA 1FBEA 1NUXA 1K9YA 1LEVA 2FVZA 1IMFA 1EYJA 4GWYA 1K9ZA 3ROJA 3IFCA 5IZ3B 1VDWA 4H46A 2CZKA 4HE2A 3T0JA 1FSAA 2Q8MA 1IMDA 3LV0A 1JP4A 2OX3A 1LBXA 1FRPA 1D9QA 2QVUA 3RYDA 4I3YA 2FIEA 1FPBA 2OWZA 2R8TA 1FBPA 5FBPA 1FPFA 3KC1A 5EQ7A 5T3JA 1IMAA 4GWUA 1DCUA 1NV4A 1NV6A 4IR8A 1FPJA 3KBZA 4GWXA 4I40A 1SPIA 3A29A 2FIXA 5ET8A 4AS4A 5EQAA 5ET5A 1Q9DA 1NUZA 2CZHA 2WBBA 5LDZA 4GWZA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3B6TA 4G68A 3C35A 4MF3A 3KOTA 4MNIA 3LSWA 4GOTA 4U23A 3TDJA 1Y9UA 3E13X 2DVZA 4PFUA 4U22A 2ABHA 3RTWB 1LAFE 3IB2A 4PCDA 1FPKA 3T9HB 5H8FA 1NV0A 4FEDA 4LN5A 2OWTA 2GRVA 3A09A 1B5JA 3QYTA 5IKBA 4E0XA 2VPOA 3FZVA 3HSTA 5HM4B 2VT5A 3QK6A 3F11A 2DDKA 1B51A 5AA3A 1A8EA 4XEQA 1L5TA 3MVYA 1SYHA 2Z8FA 2FBPA 3KSXA 3CG1A 4MBPA 1PB8A 1ATGA 2H25A 3CSBA 3G7WA 1Y20A 1IXGA 4QSCA 3DM0A 4KYEA 3MUQA 5KDTB 4OVPA 5EHMA 4U1ZA 1NNKA 3NOHA 3D4GA 1POY1 2V3UA 5H8SA 4OEVA 4Z0IA 2XWVA 3DP6A 1IMAA 4GWUA 1DCUA 3PPNA 1FPJA 3FJ7A 3ISPA 3IX1A 1Q9DA 1H45A 1B1XA 4GWOA 2H5YA 5IM2A 1GTKA 3B6QA 2RF1A 3CR9A 2ZYNA 1POTA 4P11A 2OBGA 3B8BA 4ZEIA 1FBCA 4R72A 2QRYA 3TAJA 1QUKA 2ONKE 1MY4A 3RT8A 2B4LA 1QJMA 3FATA 1FPLA 3QSLA 4YICA 3TELA 1UTBA 1B40A 4MH5A 4FBPA 2XWKA 3IL1B 1B32A 1FPDA 2UXAA 2Y7KA 2QFLA 1FTMA 4OESA 3ZS6A 2P1SA 3IK6B 4NAPA 2HZKA 4H8IA 3OO8A 3O6GA 3TTRA 5AA2D 4ZECA 4RK9A 3S9LC 5ITOA 4EF2A 5B7DA 4EF1A 1DBZA 3C34A 4XXUA 4HE1A 3JV9A 3PV0E 2XD2A 5I58A 3CSGA 1FBEA 1Y1MA 5A5XB 2Z8DA 2QS1A 2L5VA 1URSA 1CE2A 2DE4A 3C32A 1XT8A 3RLFE 3RGYA 5LOMA 1TT1A 2NUVA 4NF8B 3KSJA 1ZTYA 3H6TA 2HXWA 4H8JA 3B50A 2PBWA 3MJNA 4XKPA 1FTLA 2FIEA 4NMYA 2B65A 1I6BA 4NF5B 4GXAA 2XXVA 3V89B 1NV6A 1BKAA 4U4XA 4GD5A 1EZ9A 1B2HA 2KR0A 3SZPA 3KZGA 3VLUA 4KYDA 1FBHA 4MMPA 5IZ1A 4THIA 1M5BA 2BJJX 2HFBA 4XFEA 3UK4A 2GFEA 3FXUA 5H8QB 4O7MA 5I56A 4C1UA 1LCTA 4H65A 4GWWA 4POXA 2I0BA 3DP8A 4EQ9A 5L9MA 3CFZA 1BTJA 1J1NA 3PD9A 4OZ9A 2XXIA 5I57B 5CM6A 5I2KB 2CEYA 1MY0A 4LUBA 4U4SA 1NKXA 4U1OA 4E0WA 3RY3A 3V5AA 4M1VA 3UN6A 2Q8JA 3EHUA 3TUSA 4GX6A 2XXRA 4XKQA 3PPOA 3QUFA 3G3GA 4GX4A 4QFOA 2Y7RA 3FBPA 1XHYA 3KEIA 3MAMA 3HCQA 1NUXA 1Y3QA 3MWBA 3E79A 1XS5A 3HN0A 1MS7A 3EF7A 1MXYA 2CZKA 3K00A 2IA4A 2WYKA 2V84A 4N13A 1P1UA 4P8BA 3TCGA 3MW0A 1FQCA 4OVRA 2QVUA 3BKIB 1JVYA 2IEEA 2CZLA 3MZ1A 4H6DA 4LQ5A 1FBPA 3LBSA 4RPNA 1B7ZA 1UQWA 3MVWA 3KBZA 4IY6A 1TFAA 4GWXA 3MP8A 5M2VA 1P99A 2F5XA 3C33A 3CRBA 2PX1A 3TTMA 5JTYA 2DVCA 4EXKA 1URGA 2XXWA 3T96B 5I59B 5EQ8A 2BJIA 1P1NA 4FEBA 1A40A 4GXSB 1HSEA 2P3NA 3UIFA 5A5LA 1IMCA 4P56A 4GF8A 4Q5TA 1PEBA 1FPIA 5JEIA 3T9VA 1QULA 4K3FA 4M4GA 4NE4A 1FTOA 1XVXA 4NGUA 3RN8A 1MQDA 3PD8A 4ZE9A 5DEXB 1ZMGA 2R71A 3VVDA 4ZE8A 3ZSFA 2QVRA 2VD3A 1XI6A 2V25A 4YZZA 1N3WA 2F97A 1CNQA 2H4IA 4OYVA 1B4HA 4NWCA 4F3BA 1DPPA 1NV1A 3VDFA 2LAOA 3PU5A 4GVOA 1NH8A 2WBDA 1K9YA 2ONRA 3MZ9A 2WX9A 1BP5A 3FVKA 3IOVA 1S9TA 2F36A 4GRKA 4PGPA 5H8NA 2O51A 4PFTA 3B7DA 2YLNA 5F1QA 3KN3A 4OVSA 4XF5A 1IXHA 2UVJA 2AIXA 3VLVA 2UVIA 1GV8A 2RCBA 4KCCA 1IXIA 2XXHA 4X1BA 1II5A 3LC8A 1A54A 1ANFA 4F19A 3U65A 1I6QA 1LAHE 4OXVA 1D9YA 1XOCA 3EHTA 1MXWA 4G68B 1BIYA 3H3GA 1JETA 3G3HA 5CMMA 4YU0A 4UA8A 4RA1A 3ECRA 1A7LA 1OVBA 2VOZA 4IO5A 3KG2A 1Q35A 3RPWA 1MXVA 2FNCA 3TTNA 4WEDA 3USDA 1M5FA 5H8FB 2Y7WA 3S9EA 5J16A 1FTAA 3TEPA 2QMWA 3TYHA 3FXRA 5IGAA 4BDNA 4HCYA 3IO4A 2F34A 2H98A 1N7XA 1Y1ZA 4LZ5A 4KCDA 5DVIA 1AMFA 5AA4A 4QXDA 1SBPA 3WAFA 3CI8A 4FIMA 3RTFB 4POWA 3H7MA 2G29A 1K9ZA 4YAHX 4OVQA 5H8HA 4KFQA 3PMWA 2M8CA 3LSFB 1RKMA 2I48A 2AL4A 4N6KA 2D21A 5CMKA 3T93B 3QAXA 4PBQA 2I49A 2R8TA 2ESNA 3PUYE 1SDXA 1ZU0A 4LONB 4NN3A 4PAFA 1AH5A 2QL3A 3EPEA 1SI1A 3PUZE 1LFHA 3C36A 1EZOA 5CI5A 4H1XA 1LBZA 1ZBMA 1FCKA 4MLVA 1EZPA 2V3TA 1B0LA 3RT6B 1WDNA 4GBWA 2X7PA 1YZ0A 1I69A 3G3IA 1ZKBA 1M5EA 3SEXA 4DCXA 1B3EA 4PFYA 1UTHA 1MM7A 2GHAA 4KR5A 2V4CA 4BLAA 1O7TA 3U94A 1B9JA 2HCAA 2Z23A 3LSLA 5DVJA 1IMBA 3IORA 5TPAA 2RC9A 5TP9B 4RXLA 2G93A 3G3KA 1B5HA 1RDZA 1UTBB 1MH4A 1DK4A 4YKPA 4QSEA 4R6HA 3HHFA 3KN8A 3EQ1A 4PF6A 3GXAA 3DP4A 2KLFA 3UA8A 5IZZA 3M3KA 3MVXA 4TQUQ 4DXBA 1IMFA 4Q8RA 1JEUA 2I0CA 3T0JA 1VE4A 2I4CA 4YMAA 5I58B 4ESXA 1JW4A 4YKJA 4G8HA 4R6KA 1N3XA 1TFDA 1ELJA 3FXBA 3UGWA 2AL5A 4X9TA 4JDFA 3SKPA 4YB7A 4R9GA 3OENA 2QSXA 5ET5A 1DPEA 3PPQA 2QS3A 4XKRA 4GIZA 1MDQA 3K02A 4RNSA 1IUDA 1M5CA 4OERA 1EYKA 3OELA 2XXXA 4PFRA 3BBRA 5K2YA 3E3KA 4GX3A 4OANA 1IEJA 3O66A 3C31A 5L9OA 2I58A 3MQ9A 3HO7A 5B70A 2F35A 1BK4A 1H3DA 2DWHA 1USYH 1NV2A 1YYZA 1B3HA 3K1MA 1DTGA 3VVEA 5I56B 4FE8A 4IO7A 1HSJA 5CMBA 3PMXA 4OWDA 1QUIA 5DVFA 4KI0E 4BDRA 2VPNA 3G3JA 2FHYA 1YTVA 5I7IA 4FATA 2XWIA 3O2AA 2PVUA 5AE4A 4DXCA 3W9VA 4MJOA 3ODBA 4KPTA 1ZLQA 4NX1A 1OQHA 1LEVA 4JB7A 3C9HA 3N26A 3TCFA 2XXUA 3VVFA 4PGNA 1EYJA 3Q28A 3ILTB 3LR1A 4QSDA 4NTLA 4H5GA 3IJXB 1FSAA 4LVQA 1B5IA 1VR5A 4MIJA 1B6HA 3M3LA 4ZEFA 4R6YA 4NF4A 5EQ7A 2Y7IA 3E4RA 4OA4A 1LBCA 4NHBA 2DYXA 3W9WA 1SPIA 3TQWA 2P2AA 4Q0CA 1S50A 3H4ZA 1TWYA 5CMCA 4FECA 4F31B 4DCYA 4OETA 4OVTA 3S9NC 3TCHA 1PDAA 5AA2A 4QFLA 1NL5A 2XXTA 4N6DA 5JTYB 1R6ZA 2Y5LA 4OVJA 4JWXA 2QVVA 2XXKA 2NWJA 4NF0A 5FHNA 4PP0A 1JEVA 2DXYA 1LBYA 2RC8A 1NH7A 3FVNA 4FJPA 4H45A 3VE1B 4QHQA 4AB6A 3KN7A 3QUJA 1OQGA 4FORA 4FAJA 5ICQA 4I1DA 2GQ1A 2THIA 4PAKA 2A5TA 5ET6A 2O1LA 3O28A 5I84A 4F2QA 1FQAA 5BWJA 3U72A 4HE0A 3CVGA 4DIGA 2DWAA 4P1LA 2DXRA 1OIBA 3E78A 3L6HA 3I5OA 1OVTA 4GWYA 3IJOB 3IO6A 1MXZA 2MKZA 5I2NA 1IMDA 5TU0A 5ISUA 4G2ZA 1F9BA 3S4UA 1US5A 3K1PA 1VFEA 2ANJA 1MQHA 4R74A 2UVGA 4F3GA 5T3JA 5H8NB 2O7UA 4JSOA 1LCFA 4H0WA 3FGSA 3OO9A 4I40A 4PF8A 3OO7A 1YAEA 2F7AA 1HSLA 3EN3A 1MH3A 1IMEA 1B3LA 1NNPA 4KQPA 4X04A 3RQTA 1SW1A 3R7XA 4ONYA 5DT6A 1LFGA 1KZ8A 2OK2A 1QGXA 1JVXA 4OFOA 4LZ7A 3LUYA 1NUWA 2D5WA 3U8QA 4HS7A 4LP2B 2OLBA 2O69A 3V8XB 5ET7A 1S7YA 4RYAA 2GH9A 2ZNTA 1NV3A 3MPKA 4P1EA 4L17A 3SEWA 5KCJA 2VP1A 1MPCA 3IB0A 4GL8A 1INPA 3OSQA 3KJTA 5K2XA 3LUZA 1JW5A 2I6EA 3IFAA 1MQIA 1MXXA 1FBDA 1PBPA 1LBWA 4MHFA 4NQ8A 4PC9A 2Y84A 4DI4B 3BIGA 1AWBA 3S2VA 4ZEBA 1OLCA 1QUJA 1MM6A 3M8UA 2WKYA 5AA4B 1LBBA 3LV0A 4N15A 3UP9A 3W15C 3M3FA 2GHBA 1GVCA 2OWZA 3Q29A 1FPFA 4TOZA 1Y4TA 1B05A 2XX9A 3TZAA 3UORA 1D4NA 4O8MA 4AS4A 2Q2AA 2XXQA 2O1MA 4QFPA 3L6GA 3FASA 4O3BA 2OCUA 4PE3A 4N91A 3PUWE 1B4ZA 4JWOA 3H06B 2RINA 1IZ1A 3PPPA 1Z7NE 4AB5A 3FJGA 5FTHA 1GGGA 1H76A 3HFUA 4ESWA 4P0GA 1PB9A 1LBVA 2CMOA 3FVOA 3ZKKA 2QMXA 1UTHB 4MNPA 4HCWA 4I62A 4GWSA 4DZ1A 1B3FA 3FV1A 2FA7A 1XVYA 5TPAB 4NF6A 3KC0A 3RUMA 4RY1A 4HW8A 3SEUA 3U1OA 4QF9A 4P47A 1KA1A 1MY2A 4GL0A 4G61A 1LAGE 3LSXA 2ZXTA 4U21A 1SI0A 3ROJA 2RCAA 4P9KA 2Q9TA 3IFCA 3OMBA 4N8GA 2F8DA 3SEYA 3TFLA 3OO6A 1KWHA 4QBAA 2F7BA 2HPGA 1FRPA 4DXUA 1FTJA 3RYDA 4PDDA 1LFIA 1H44A 1QVSA 1JQFA 3KC1A 1LLSA 1A99A 3JZJA 3IR1A 4N17A 4Z7EA 4WXJA 3H6WA 3A3UA 1B46A 4ECFA 3OD7A 3B6WA 4MFIA 2QS2A 5LDZA 4WEPA 1KA0A 1UIVA 3MSTA 4PBHA 2REGA 2ZNUA 4RK2A 1PBQA 3D1RA 3IB1A 3MP1A 2D3IA 3EKIA 4ELQA 1Y3NA 2NVUB 1JW1A 1B7UA 1ZIUA 2W7YA 4EQBA 1QW0A 4MX6A 3GZGA 4XIGQ 2XWOA 5F24A 4RPOA 3O6IA 3SERA 4EXLA 3DLNA 2PT1A 4Q30B 1DSNA 4HTGA 2F78A 2PCRA 4BDOA 4HXVA 1A8FA 4RJZA 2Y5KA 1B1HA 5FHOA 2OWSA 4IO6A 3Q27A 2DS9A 1FPEA 2F6PA 3KJ7A 5IZ3A 1SD3A 2FYIA 4G68C 4BDQA 3FXQA 3O29A 1JNFA 2R6GE 4UACA 1IIWA 2HAVA 4ND9A 4F1VA 5EYFA 3H6VA 1NNTA 4H46A 2Q8MA 1VSOA 2F6GA 2O6AA 4N8YA 3MP6A 2Q88A 4OFJA 3K6WA 1US4A 3T9XB 3N6UA 2O7IA 2ZYMA 3IOTA 3N94A 1ZJLA 1YPNA 1NV4A 4IR8A 3K0VA 2XD3A 5J1DA 1VFDA 1AL3A 3R26A 2CZHA 1NUZA 2OZZA 1OMPA 4NF4B 3RPLA 4P0IA 1PB7A 5ESYA 3SEVA 3GBBA 2REJA 3P7IA 2P3VA 4ZDMA 2HAUA 3I3VA 2PFZA 3KGCA 4JVDA 2ZYOA 4ZS9A 2HHMA 4X1DA 1TXFA 4EUOA 5AA2B 5I5PA 3V83A 1T0KA 2RKMA 5HBCA 3E9XA 1B7HA 2Q89A 4NWDA 4X8RA 1FTKA 3IAZA 5CBSA 2PFYA 4R2BA 4EQ7A 1NV7A 4MAGA 3VFJA 1R9LA 4YKKA 1MXUA 4ZEDA 2PMSA 4OQOA 3MC2A 4N81A 3D4CA 2E1SA 2ONSA 3PUXE 4ELOA 3N6TA 4PQJA 2A5TB 4PAIA 1N84A 1NI9A 3HPIA 5I3SA 4IY5A 2RC7A 4AS5A 1MPDA 3I6VA 3BFUA 4OMBA 4DLDA 1I6AA 4P3LA 3A3CA 4F22A 2XX8A 3GYYA 4HE2A 1FQDA 4YB5A 1YCJA 4DI3D 4F3SA 3OXNA 3RNNA 4JSDA 3PTYA 4I3YA 1B58A 5I2NB 3U93A 5FBPA 3FJMA 2Q2CA 2PYYA 5TP9A 4F3PA 2ZMBA 2OJTA 1FW0A 1H43A 4MNCA 2WBBA 5HPQA 3PPRA 4OFLA 4I3EA 2PT2A 1QKBA 3K2DA 4O94A 4IO2A 3CFLA 1FPGA 4ZEKA 1O64A 3FV2A 3FIRA 4YB6A 4GFRA 1MY1A 4ELRA 3T9UA 2UYEA 3FD3A 3TODA 1SVXB 4AQ4A 5L9SA 3MBPA 4LATA 4NEDA 4XKNA 5FHMA 1SW4A 4PE5B 3EHSA 3CHGA 1B3GA 1DMBA 3VV5A 1M5DA 3BFTA 2YJPA 4R73A 1MG1A 2Z8EA 4UABA 5KCJB 4F1YA 1NFTA 1NNFA 2F3DA 3KOSA 1N0TA 3R6UA 2XA5A 1MRPA 3ZKLA 5KDTA 2DWIA 1D3KA 2DOJA 3OSRA 1FQFA 4PFIA 4PETA 3TMGA 4G77A 4R2FA 1DOTA 1IXCA 3VXCA 2NXOA 3FVGA 5JK4A 1JP4A 2UVHA 1URDA 4H67A 3O97A 1LBXA 4G8NA 4GLIA 4N4UA 2HXRA 4PFWA 1Y4CA 5IAIA 3GLBA 2R9JA 2P0SA 3PMVA 1PC3A 5EQAA 2OPDA 2ZZWA 4OHNA 3K6XA 3S9MC 4G8MA 4DE8A 4OENA 1EYIA 4F39A 1RDYA 4H5FA 4PFBA 4O3AA 1AOVA 4QRZA 4LZ8A 2B3BA 1NV5A 2H99A 4JBZA 2E0SA 4DDDA 2H9BA 3O6HA 4YMBA 2B4MA 1N04A 1RYXA 1YXIA 5EHSA 3PUVE 5EYHA 1R9QA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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