1VFEA

Human lactoferrin, n-terminal lobe mutant with arg 121 replaced by ser (r121s)
Total Genus 88
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
88
sequence length
321
structure length
321
Chain Sequence
SVQWCAVSQPEATKCFQWQRNMRRVRGPPVSCIKRDSPIQCIQAIAENRADAVTLDGGFIYEAGLAPYKLRPVAAEVYGTERQPRTHYYAVAVVKKGGSFQLNELQGLKSCHTGLRSTAGWNVPIGTLRPFLNWTGPPEPIEAAVARFFSASCVPGADKGQFPNLCRLCAGTGENKCAFSSQEPYFSYSGAFKCLRDGAGDVAFIRESTVFEDLSDEAERDEYELLCPDNTRKPVDKFKDCHLARVPSHAVVARSVNGKEDAIWNLLRQAQEKFGKDKSPKFQLFGSPSGQKDLLFKDSAIGFSRVPPRIDSGLYLGSGYF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Mutation of arginine 121 in lactoferrin destabilizes iron binding by disruption of anion binding: crystal structures of R121S and R121E mutants.
pubmed doi rcsb
molecule keywords HUMAN LACTOFERRIN
molecule tags Iron transport
source organism Homo sapiens
total genus 88
structure length 321
sequence length 321
ec nomenclature
pdb deposition date 1996-10-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1vfeA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1vfeA02
5FHNA 3PPPA 1TT1A 3MC2A 2IEEA 1RYOA 2B3FA 1SYHA 1N76A 4AB5A 2F6GA 1QULA 5FHOA 3GLBA 3EHSA 5AA1A 2M8CA 4KQPA 4F31B 4R73A 4OZ9A 3PUVE 1NNFA 3E4RA 3PD8A 4QFKA 1GR2A 4EXLA 1A7LA 3ZKKA 4PP0A 4DE8A 3VVEA 3PV0E 1UTHA 5AA2A 1B9JA 1SW4A 4H67A 4F3SA 3U94A 5JTYA 2RF1A 2LAOA 3VXCA 1B0HA 2Q2CA 1H44A 4JWYA 2ONRA 1PDAA 3TQWA 2O51A 1A54A 4G77A 4BDOA 2UYEA 4OETA 1XC1A 4LZ5A 1R6ZA 3IR1A 1M5FA 3SDFA 3RT6B 3MWBA 3I3VA 3O66A 4IO3A 3CSBA 1LAXA 3C35A 2NWJA 4WKMA 3V89B 4GXAA 3RLFE 4N07A 1WDNA 5CRYA 1KWHA 4PETA 1IUDA 1Y1MA 3HCQA 4RPOA 3B6WA 3VE1B 4ZDMA 4IO6A 2V93A 2DSFA 1PB8A 1NNKA 3HV1A 1NL5A 4RJZA 5LOMA 3FV1A 4R72A 4YKKA 4R6HA 3G3JA 4DZ1A 1VSOA 1SVXB 3O29A 1URSA 4KYDA 3MVZA 1P1QA 3OEMA 5I58A 3IX1A 1POY1 3PUWE 3VV5A 1B7UA 2DWAA 1IIWA 2ZMBA 1JW5A 1QUIA 2AYSA 4F22A 1N0TA 1EH3A 3QSLA 2NVUB 4WEDA 5H8FA 1LFHA 2Z23A 2GRVA 5L9OA 3MZ9A 2VD3A 1IXCA 3ILTB 1BKAA 2UXAA 3S2VA 2B65A 2GFEA 4G8NA 2UVIA 2A5SA 2OJTA 3MPKA 1LLSA 3MBPA 2RINA 4U4XA 1LAHE 2HEUA 4PFUA 3C31A 4H1XA 2F7CA 3ECRA 4GL0A 3IB0A 1OIBA 4IGRA 4YU0A 5ICQA 2RC9A 1N7WA 2O6AA 4ZE8A 4JXIA 4F3GA 3HHGA 1Y3NA 3K6VA 4LATA 2DE4A 2XX9A 5F7VA 3DP6A 1B3LA 4YMBA 5BWJA 2HAUA 1MQGA 4OYVA 3MPLA 1FTKA 3O97A 1ZTYA 1BTJA 3H03A 1Y20A 1Y4TA 2I58A 1LCFA 3RUMA 3OXNA 4Z0IA 1MRPA 1MXWA 4DLDA 5HPQA 3ZKLA 2ANJA 1ATGA 4O3CA 4POXA 3C32A 3K6WA 5I59A 1OQHA 4R6YA 3M8UA 1P99A 2F8DA 4GL8A 3CIJA 2DVZA 3KG2A 2UVHA 3H6VA 1QW0A 3PUXE 3U8QA 1MY1A 3C9HA 5I2KB 3FJGA 4ONYA 5FHMA 3QAXA 1I69A 5IAIA 2XD2A 2DWHA 3LSWA 4YKJA 5DEXB 2H99A 1NKXA 3W9VA 4JB7A 3O6IA 3BFTA 3IO4A 3O6HA 5B7DA 2ABHA 2THIA 2ZYKA 3C33A 3OO8A 4HTGA 2DXRA 3FXRA 1MXYA 2DQVA 3OENA 2UYFA 4HS7A 3SEUA 1P1NA 1SQYA 2XX8A 3TAJA 2REJA 4IB2A 1QVSA 3MQ9A 4EQ7A 1LFGA 2NOOA 1JW4A 4JWXA 4JSDA 3DP8A 1IXIA 2WKYA 1US5A 3IB2A 3CG3A 3U93A 2D5WA 1QKBA 2B3BA 1S50A 3SEVA 1SBPA 1P1WA 1MXUA 4OFOA 4AB6A 3K02A 3EHTA 2XXYA 3T22A 4NF5B 1MG1A 3TEPA 3CI8A 4FJPA 4I1DA 3OO7A 4BDMA 3RQTA 2F34A 2I4BA 5KDTA 2ESNA 4LQ5A 4AQ4A 3TKDA 4OENA 1B3HA 2HAVA 3OEKA 5KZTA 3A3CA 3OELA 2QL3A 4G8MA 4GWOA 1MY0A 3VVDA 3PPNA 2I4CA 1B1HA 4R6KA 2AL5A 5H8HB 1Z7NE 4LZ7A 4NF4B 3N5LA 2DVCA 4LP2B 3IOTA 4DDDA 1B7HA 2HZKA 1MM6A 4YKPA 2KLFA 2DE2A 3TDJA 1OLCA 1O63A 4RXLA 5A5XB 2ZNUA 4PFYA 1QUJA 4F1YA 4U1ZA 4F1UA 2F7AA 1BP5A 4EXKA 4LVQA 3GZGA 4QFLA 1AMFA 3TPAA 1UIUA 3FVGA 1UTBB 5I2NB 1ZU0A 1ZIUA 1POTA 4GIZA 3K2DA 2Y84A 2GHBA 3TFLA 4G68A 4F3PA 3CG1A 1MQDA 4EQ9A 3N6UA 1JEVA 1Y3PA 3UP9A 3RPWA 3T9HB 4YB7A 2F7BA 1A55A 4Q0CA 2XHDA 5J1DA 2H25A 5H8QB 4MLVA 2HFBA 2NXOA 2V3UA 3PGFA 1SD3A 1B6HA 2DOJA 2Z8EA 5L8DA 4ND9A 4R9GA 4JWOA 4OQOA 4E0WA 4ESXA 1L5TA 4Q8RA 3IJOB 4F19A 2R9JA 2Q9TA 3KZGA 3O28A 3LSXA 3KOTA 2Y7IA 1ZJLA 3IOVA 1MPDA 3I6VA 4NF6B 4EUOA 4YB6A 1N04A 3M3LA 4RK9A 4BDQA 4H8IA 4UACA 4QSEA 4OEUA 2V3QA 2HZLA 3CSGA 1XS5A 1JQFA 4ESWA 4QRZA 3N6TA 2O7IA 2PBWA 1II5A 3V8XB 1SDXA 1SI0A 1MY4A 1DPPA 3SEXA 3E3KA 5B70A 5AA2D 1YAEA 2DP8A 5TU0A 4GOTA 5DVIA 4EQBA 4YKIA 4FORA 4OWDA 3T93B 1HSJA 4DXUA 4X1BA 3QXMA 4R2FA 1JVYA 1VE4A 3UORA 4KCCA 5CMKA 4KYSA 4P11A 1YCJA 2NUVA 5KCJB 3WAEA 5TPAB 3H3GA 1USYE 3FATA 4ELPA 2X26A 1B1XA 3OMBA 4H0WA 3THIA 3L6HA 1LB9A 3R6UA 3V83A 4UA8A 1O7TA 3HO7A 1T0KA 1BLFA 5L9SA 3OOAA 5I57A 3G7WA 2Y7KA 3JV9A 1EU8A 2QPQA 1MQJA 1OMPA 1URDA 5FTHA 2ZYMA 3G3HA 1N3WA 3ZS6A 5K2XA 1OVBA 3HSTA 1FTMA 3TQLA 5CM6A 1IEJA 4WXJA 3RN8A 2V84A 3MVXA 4DXCA 5DT6A 4QFOA 3G3IA 2I3WA 3TTKA 3E13X 3K4UA 4HCWA 2YLNA 3TTMA 1I6BA 4OESA 3A3UA 1PEBA 4NF8A 2XXPA 1JETA 3FASA 4F3BA 3G3KA 3USDA 1FTJA 1BIYA 2Q8JA 4XKNA 4TLLB 1B3FA 3MP6A 4ZS9A 3KOSA 1AIVA 3H6WA 2OCUA 4NMYA 2DE3A 3H4ZA 1HSEA 1MXZA 3EPEA 1AOVA 1Y1ZA 4ELQA 4HW8A 2HXWA 2PMSA 3IJXB 3KN3A 4KPTA 1OQGA 3KSJA 4LZ8A 2R71A 1USYH 3MUQA 3DELB 1D3KA 3VLVA 4H8JA 3DM0A 2QJEA 2QS4A 5I56B 5I84A 2PYYA 3BKIB 4GVOA 3ONMA 4IO2A 1JNFA 5ELVA 3UN6A 5AA4B 1M5EA 3M3KA 3VLUA 1NNTA 2RCBA 3FIRA 3AXFA 4ELOA 3CFZA 3MVWA 2XXIA 4NWDA 1JEUA 1B4HA 2RC7A 3TTLA 2ALUA 1RYXA 1SW5A 2VHAA 1N84A 4DCYA 3CRBA 5HM4B 1XOCA 5DVJA 1EZPA 2ZNSA 1B5JA 4H6DA 1VFEA 1ZLQA 2O1MA 4QSCA 3SEWA 2H5YA 3TELA 4EF1A 2OWSA 1LSTA 2CMOA 4ZECA 2XXVA 4RK2A 3B6TA 4MLQA 4MH5A 4GXSB 3K1PA 4MBPA 1B2HA 4ZZEA 4I8CA 4DIGA 5EHSA 4POWA 5CBRA 2Z8DA 2A5TB 4GLIA 4TOZA 3W15C 3LC8A 4C0RA 1NH8A 4KHZE 4N6PA 3QUJA 4XIGQ 1TFDA 1MM7A 1NNPA 3DP4A 4YICA 1MPBA 4H65A 3MAMA 4WEPA 3IORA 5H8NB 2GH9A 2XXQA 2UVJA 1LBBA 3Q26A 1MPCA 4ZZAA 2I0BA 3PU5A 3OSQA 2ZXTA 4OHNA 4FAJA 2UVGA 1MH4A 1PBQA 2E1SA 4DXBA 4U4SA 1GTKA 3MZBA 1B7ZA 3WAFA 2R6GE 4F2QA 3RTWB 3K6XA 3KN8A 2DWIA 3B6QA 3V5AA 3VFJA 3N94A 3U72A 1MXVA 5K2YA 3FGSA 3SKPA 4R75A 1NFTA 3FJMA 1LCTA 5ISUA 4C1UA 3H6TA 2Q89A 1TXFA 2XXRA 2OBGA 3LBSA 1N3XA 4LONB 3ZSFA 2VP1A 2OK2A 1M5BA 3S4UA 5CMBA 4IO7A 3K1NA 5DTBA 3RT8A 4OMBA 2FYIA 1UTHB 1MXXA 5AA2B 3TCHA 4FEBA 4H5FA 5JTYB 5CI5A 3H06B 3PD9A 4G2ZA 1M5CA 4RPNA 1NH7A 3G3GA 2H4IA 1PBPA 2HQ0A 5CBSA 4GF8A 3OO9A 3CFXA 4G8HA 4ZEBA 4U21A 4M4GA 5FTIA 3TCFA 3LSLA 3EN3A 4Q30B 1FQEA 3IB1A 1S9TA 3IOUA 1MH3A 2RC8A 3VLWA 4NTLA 2P2AA 4RY1A 2G93A 4RNSA 5AA3A 3M3FA 4KR5A 3TODA 2VGQA 4U23A 4PFTA 5I2KA 2FA7A 3CVGA 3TUSA 2F6PA 2DXYA 4XXUA 1IXHA 1Y9UA 4BDNA 3RY3A 3TCGA 5DEXA 2AL4A 3LUYA 3RNNA 4OXVA 3OO6A 2ZYOA 4X9TA 3TZAA 1S7YA 4ZEDA 4F1VA 2Y7RA 4H5GA 5I58B 4R9FA 5IKBA 1B32A 3N26A 1F9BA 3KN7A 4RYAA 1SYIA 3TMGA 4EDPA 2H98A 3TTNA 1XVYA 3S9NC 1DPEA 4NWCA 4GQOA 1GGGA 3FVNA 3K00A 3IK6B 2XXTA 2ZNTA 4P0GA 4I9DA 4PQJA 2XXWA 3K1MA 1LB8A 4KFQA 2V3TA 4N13A 1ANFA 2XD3A 1CE2A 2Q2AA 1YPNA 1ZKBA 1D4NA 2PX1A 3Q29A 1HSLA 4IY5A 3TYHA 3MJNA 4NF5A 3KJTA 1PB9A 2F97A 4IO5A 3KJ7A 1B46A 1UQWA 2F5XA 1VFDA 4X1DA 1IXGA 3Q25A 4L17A 4PE5B 4QHQA 2OWTA 4G4PA 1ZBMA 3H6UA 2RCAA 4BDLA 5JEIA 1CB6A 3HN0A 3IAZA 3PPOA 5H8HA 1Z7ME 2F36A 3SERA 3K0VA 1A8EA 3FZVA 4NF4A 4ECFA 3D4CA 2V25A 3IO6A 5H8SA 2DYXA 1IQ7A 1FQAA 1FQFA 2VOZA 2XXUA 3FVOA 4F18A 2BJJX 5A5XA 3P7IA 2P1SA 1Y3QA 4LUBA 1R1NA 4GFRA 4JDFA 5I59B 2GHAA 3S9LC 1JVXA 1B52A 1R9LA 2OZZA 2PT2A 4IY6A 2Y7PA 4FEDA 1UTBA 1WVJA 5I2NA 1MS7A 1DTZA 4ZEFA 3T96B 3L6GA 1XHYA 1SW1A 1PB7A 1B51A 1FTLA 1A40A 3SESA 3PMVA 4FECA 4KYEA 5EYFA 1Y4CA 5BUUA 5M2VA 2XXHA 1P1OA 1XVXA 3RTFB 1FQDA 4O3BA 1Q1KA 4C1TA 5H8QA 1O64A 1RKMA 2ONSA 3PMXA 3U1OA 3EHUA 1FQCA 3R26A 1DSNA 3JYRA 3FVKA 3PMWA 1Q35A 4THIA 1LFIA 2QS2A 1DMBA 4MF3A 3CR9A 1B40A 1YTVA 3VXBA 3PUYE 1DOTA 3K01A 4PFWA 2H9BA 3VVFA 1B3GA 4FATA 2O84X 4OEVA 1ELJA 1A99A 3OD7A 4NF6A 1A8FA 4NEDA 4BDRA 2I6EA 5CMCA 4RA1A 3O2AA 3MVYA 3T66A 3EQ1A 1LAGE 1EZ9A 3SETA 2D21A 1FTOA 4KI0E 4U22A 1JW1A 2ONKE 2E0SA 5TP9B 4ZE9A 1OLAA 4LQ2A 4ELRA 2Z8FA 5KDTB 2YPNA 1B5IA 1US4A 4LA9A 3Q27A 2XX7A 1LGBC 1IITA 3R7XA 4U2RA 4OERA 1B58A 1J1NA 1B05A 3EF7A 4F29A 4IGTA 4R2BA 1MDQA 3D4GA 1P1UA 3FXQA 3G3FA 3T9UA 1GVCA 5KCJA 4JSOA 3S9MC 1OVTA 2G29A 5JK4A 5TPAA 2O68A 2QSXA 2W7YA 2F78A 1TFAA 2QS1A 4I62A 2DWJA 3FUZA 1ZMGA 2O7UA 3JZJA 4TQUQ 1I6QA 1SW2A 4QFPA 3MW0A 1R9QA 1H3DA 3T9VA 3E9XA 3UIFA 3HPIA 3KBRA 1MY3A 4F39A 1H45A 3IL1B 3O6GA 3U92A 2QMWA 2QRYA 2RKMA 1URGA 3C34A 1M5DA 2REGA 1UIVA 4G68B 3DLNA 2P0SA 4O3AA 4R74A 3GXAA 2X7QA 2D3IA 4BLAA 4YB5A 4JBZA 4MFIA 5DVFA 3Q28A 5CMMA 2OLBA 2HCAA 3RGYA 3S9EA 4ZEKA 1MQIA 3B7DA 3QYTA 2F35A 3C4MA 1D9VA 3PPQA 3CFLA 2I49A 3QIMA 3T9XB 1B5HA 3QUFA 2Y7WA 3KGCA 3MP1A 1TWYA 4OFLA 2FNCA 1B0LA 4ZEIA 4GD5A 1LBCA 1IZ1A 5ITOA 4U1OA 2YJPA 3OSRA 2Z22A 2I3VA 5HBCA 3BBRA 1VR5A 3ODBA 5I56A 4NE4A 3H7MA 1NMUA 4F2OA 4XKRA 5TP9A 3KFMA 3UGWA 3GBBA 4YZZA 3FD3A 4ISUA 5AA4A 1QJMA 1LAFE 3A09A 5DYHA 1AL3A 4QF9A 4X48A 4EF2A 4KD5A 3SEYA 1AH5A 4OVJA 3ILUB 3FJ7A 4OFJA 2AIXA 1EZOA 5AE4A 4E0XA 3K6UA 4G68C 5EHMA 4XKPA 3O9PA 1SI1A 2O1LA 4TLMB 1MDP1 4QFNA 1D9YA 2Q88A 1WODA 3KEIA 2ZYNA 3HHFA 2X7PA 1QKAA 4YAHX 1I6AA 3BFUA 4OTEA 1B3EA 4FE8A 3PPRA 2I0CA 1MQHA 4XKQA 2O69A 4IO4A 5F1QA 4HCYA 3FV2A 1FW0A 2XXXA 3MZ1A 5I57B 2A5TA 4FIMA 4M1VA 3I5OA 2I48A 5L9MA 3FXUA 1H43A 2IA4A 1PC3A 3QK6A 2PVUA 5ITPA 2QS3A 2VD2A 5CC2A 3F11A 4YMAA 1GV8A 1QUKA 2PT1A 5H8NA 3LR1A 3C36A 1FCKA 3UK4A 4K3FA 3VDFA 4XTCQ 4Q5TA 1XT8A 3LSFB 3TTRA 4KCDA 3KSXA 2QMXA 5ICTA 3PUZE 4GRKA 3W9WA 3MP8A 4QSDA 4Z7EA 2DS9A 1DTGA 1FQBA 1N7XA 3GBAA 3IOWA 3UA8A 1B4ZA 4P0IA 2CZLA 1MY2A 5H8FB 4DCXA 1H76A 4NF8B
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3EKIA 5FHNA 4PC9A 3PPPA 1TT1A 3MC2A 4DI4B 2IEEA 1RYOA 2B3FA 1SYHA 1EYJA 1N76A 4AB5A 2F6GA 1QULA 5FHOA 3GLBA 4GWZA 3EHSA 5AA1A 2M8CA 4KQPA 4F31B 4R73A 4OZ9A 3PUVE 1NNFA 3E4RA 3ROJA 3PD8A 4QFKA 1GR2A 4O7IA 4EXLA 1A7LA 3ZKKA 4PP0A 5IM2A 4DE8A 3VVEA 3PV0E 1UTHA 5AA2A 1B9JA 3FXBA 1SW4A 4H67A 4F3SA 3U94A 5JTYA 2RF1A 2LAOA 3VXCA 3KC0A 1B0HA 2Q2CA 4MCOA 1NV3A 1H44A 4JWYA 2ONRA 1PDAA 3TQWA 2OX3A 2O51A 1A54A 4G77A 4BDOA 2UYEA 4OETA 1XC1A 4LZ5A 1R6ZA 3IR1A 1M5FA 3SDFA 3RT6B 3MWBA 3I3VA 2Q74A 3O66A 4IO3A 3CSBA 1LAXA 4AS5A 5IZ3A 4N8YA 2Y5KA 3C35A 2NWJA 4WKMA 3V89B 2XWIA 4GXAA 3RYDA 3RLFE 4N07A 1WDNA 5CRYA 1KWHA 4PETA 1IUDA 4FBPA 1Y1MA 3HCQA 4RPOA 3B6WA 3VE1B 4ZDMA 2F3BA 4IO6A 2V93A 2DSFA 1PB8A 1NNKA 3HV1A 1NL5A 4RJZA 5LOMA 3FV1A 4R72A 4YKKA 4R6HA 3G3JA 4DZ1A 1VSOA 1SVXB 3O29A 1URSA 2Q8MA 2Y5LA 4KYDA 4QBAA 3MVZA 1P1QA 3OEMA 5I58A 3IX1A 1POY1 3PUWE 3VV5A 1B7UA 2DWAA 1IIWA 2ZMBA 1JW5A 3NOHA 1QUIA 2AYSA 4F22A 1N0TA 1EH3A 3QSLA 2NVUB 4WEDA 5H8FA 1LFHA 2Z23A 2GRVA 5L9OA 2VPNA 3MZ9A 2VD3A 1IXCA 3ILTB 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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