1VFEA

Human lactoferrin, n-terminal lobe mutant with arg 121 replaced by ser (r121s)
Total Genus 88
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
88
sequence length
321
structure length
321
Chain Sequence
SVQWCAVSQPEATKCFQWQRNMRRVRGPPVSCIKRDSPIQCIQAIAENRADAVTLDGGFIYEAGLAPYKLRPVAAEVYGTERQPRTHYYAVAVVKKGGSFQLNELQGLKSCHTGLRSTAGWNVPIGTLRPFLNWTGPPEPIEAAVARFFSASCVPGADKGQFPNLCRLCAGTGENKCAFSSQEPYFSYSGAFKCLRDGAGDVAFIRESTVFEDLSDEAERDEYELLCPDNTRKPVDKFKDCHLARVPSHAVVARSVNGKEDAIWNLLRQAQEKFGKDKSPKFQLFGSPSGQKDLLFKDSAIGFSRVPPRIDSGLYLGSGYF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Mutation of arginine 121 in lactoferrin destabilizes iron binding by disruption of anion binding: crystal structures of R121S and R121E mutants.
pubmed doi rcsb
molecule keywords HUMAN LACTOFERRIN
source organism Homo sapiens
molecule tags Iron transport
total genus 88
structure length 321
sequence length 321
ec nomenclature
pdb deposition date 1996-10-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1vfeA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1vfeA02
3MPKA 4MLQA 1LFHA 3VVDA 1YCJA 2ZNUA 3B6QA 4NF5A 1UTHB 3E13X 1MXZA 3G3IA 4GOTA 2VP1A 1QUJA 3EF7A 1P99A 3O2AA 1ZMGA 4R73A 2DWJA 1D9VA 4BLAA 4QSCA 4C1TA 1MG1A 3MPLA 2O51A 1MXYA 1PB8A 4XTCQ 3SEVA 2FNCA 3TTLA 2F78A 3HN0A 1MXVA 2GRVA 3PUZE 3LSWA 4HS7A 3D4GA 1NL5A 5DT6A 4F3PA 3G3JA 3G7WA 5FHOA 4ZE9A 4QFPA 4X1BA 4GXAA 3IO4A 2Y7IA 5H8QA 3KJTA 3K6UA 1MXXA 1US4A 1MY1A 3FIRA 1SW5A 1Z7NE 3UGWA 4EF2A 3H3GA 3BFTA 1FQEA 4F3GA 5JTYB 5L9MA 2WKYA 4G8MA 3QUFA 1QUIA 1JVYA 5DVIA 3H6VA 3IL1B 3QAXA 4YB5A 4FORA 4C0RA 2A5TA 5H8NB 4OHNA 4GD5A 4GFRA 4YU0A 5H8HB 3CG3A 4R74A 1YAEA 3EHTA 5L9OA 2Y7PA 1GTKA 3KN7A 4G77A 5H8SA 1MDP1 4U23A 5TP9B 2Y7KA 4KFQA 3PPQA 2YPNA 4YICA 2OWSA 3RQTA 3VE1B 3N6TA 1USYE 1JW1A 4F3BA 1S50A 4XXUA 1UTHA 2ZMBA 1IQ7A 2CZLA 4R9GA 2PT2A 3U72A 2HZKA 2E1SA 1M5FA 4PFYA 1XT8A 5I58B 1DMBA 3K6WA 2NOOA 1ZTYA 3MZ1A 3WAEA 2R71A 3T9UA 2X7QA 5ICTA 3A3UA 1A8FA 2V3QA 2DYXA 1MH4A 4PFUA 3T66A 3VVEA 3FD3A 4YB7A 1POY1 1T0KA 2V3TA 5CBSA 2AL4A 4MBPA 2XD2A 2F7CA 1TT1A 4U1ZA 2UYFA 4DE8A 3V83A 3AXFA 1MPBA 3LR1A 4EQBA 3DP4A 3T9VA 1I6BA 4THIA 3QUJA 3IAZA 3PD9A 2IEEA 3ZKKA 3W9WA 4EQ9A 1JQFA 1UIVA 1MQGA 4GF8A 2DQVA 3PUWE 2ZNTA 1DTGA 4JBZA 4Z7EA 1RYXA 1XVYA 1I6AA 5JTYA 4PFWA 1GR2A 3V89B 2AYSA 5CMCA 1B6HA 1OLAA 3TTRA 2F7AA 3FVOA 5I84A 1SQYA 5H8NA 2V25A 2D21A 3UN6A 3IB1A 2Q88A 4GL8A 1SW1A 2XXVA 3PPRA 5H8HA 4I1DA 1QUKA 2F8DA 2DOJA 2R6GE 4JWOA 3VFJA 1M5BA 4JWYA 5ELVA 1PC3A 2UVIA 1XVXA 3OELA 4XKQA 5TP9A 3G3GA 4P11A 1FQCA 2I3VA 4OFOA 2HAVA 1JEVA 4MH5A 2ZYKA 1GVCA 3N26A 3S9MC 3N6UA 2B3FA 1MY0A 3E3KA 3OO9A 2REGA 1B7UA 1USYH 1JW4A 1JVXA 1O63A 5I58A 1UIUA 4OENA 4OFLA 4ZEFA 3TTKA 4ZS9A 4Q0CA 2HXWA 2QS1A 2ONRA 4ZEBA 2UYEA 1WODA 1J1NA 3GLBA 3M3KA 1TFDA 4ESWA 4G68C 3T22A 4LZ8A 3FXUA 2F6GA 4LQ5A 3SERA 3TQWA 1AMFA 4YKJA 3CRBA 1LAFE 3FXQA 3K6VA 4DDDA 2O7UA 4OTEA 2O1LA 3M3FA 3FVGA 3RUMA 2QS3A 3HHGA 1MPCA 1Y4CA 2OWTA 1VFEA 5K2XA 3IX1A 5B7DA 3IK6B 3CR9A 1LSTA 3V8XB 4L17A 1NH7A 1B05A 3HO7A 1LB8A 4F31B 4H6DA 3KBRA 3K2DA 5IAIA 5A5XB 3WAFA 3FATA 3K1NA 1B5HA 3RTWB 1I69A 3MVWA 4KI0E 3FV1A 1MQJA 4F22A 3F11A 1BTJA 3MJNA 2THIA 1MQIA 2Q2AA 1Y20A 4NF5B 3OD7A 1MXWA 4NF8B 3W9VA 3KN8A 1LBCA 2ESNA 4BDOA 2KLFA 3RNNA 3DELB 3V5AA 3SEYA 2XXHA 4BDRA 1B3FA 3TMGA 1II5A 1EH3A 3O28A 4OEVA 3TFLA 3HCQA 2I48A 3EPEA 3IB2A 2DE2A 4PP0A 2QS4A 1B7ZA 2X7PA 2XX8A 3TQLA 1DSNA 2XXRA 1IXIA 3K4UA 4IO6A 3KEIA 3EQ1A 2QMWA 1JEUA 4I62A 4F2OA 1VR5A 4NTLA 4R6KA 2FYIA 2P0SA 3VLWA 1O7TA 1OIBA 1N7XA 3OO6A 2XHDA 1NKXA 3DLNA 4U21A 4IGTA 2HQ0A 1DPPA 2DWAA 3ECRA 1LCTA 4FJPA 2Z23A 2GHAA 4ZDMA 3ONMA 1A7LA 5L8DA 2P1SA 1LLSA 4GLIA 2I6EA 3CVGA 4OZ9A 4U2RA 3RLFE 3O66A 2GHBA 2O1MA 1R1NA 2Q8JA 4YB6A 1HSJA 1R9QA 1VSOA 3PMXA 4K3FA 3OOAA 2RINA 4QFOA 1A54A 1QW0A 2ZYMA 1MDQA 3CSGA 3CI8A 3K1MA 4NF8A 5DVJA 4O3CA 1MM6A 2HAUA 5DEXB 4ELPA 3K01A 4OVJA 4H67A 2QSXA 3A09A 4JXIA 5B70A 4KQPA 2RC7A 4EQ7A 3HHFA 2RCBA 4Q8RA 1MPDA 3CFLA 4I8CA 2DWHA 4LATA 2BJJX 1NFTA 4G68B 1ZU0A 1B4HA 3KOTA 4JWXA 1H45A 3SEWA 4F1YA 1P1QA 2VD3A 4NE4A 3DM0A 4RYAA 1SI1A 1JETA 2FA7A 1S9TA 3RN8A 2F34A 1XHYA 3PPOA 2G93A 4GRKA 2DS9A 2AL5A 1WVJA 2DVCA 2XXWA 4R72A 4MFIA 4HW8A 4JSOA 2Q9TA 1LAXA 5HM4B 4EXLA 2M8CA 4TLLB 2REJA 3TDJA 2YLNA 4U4SA 2IA4A 2QJEA 2H5YA 5KCJA 2RCAA 2PVUA 2HEUA 1BLFA 1P1OA 2ZYNA 3TTNA 4FEBA 4ONYA 3VV5A 4X48A 3TKDA 4MF3A 3KFMA 3KZGA 3KN3A 4ND9A 3MAMA 4H8JA 1RYOA 3RPWA 4BDNA 4XKRA 2NVUB 4O3AA 1GGGA 1PDAA 4FE8A 3MW0A 3O29A 4OXVA 4N13A 4DCYA 2H99A 1FQAA 5KDTB 3MVXA 4F39A 4H1XA 1D9YA 4GXSB 4RA1A 2OCUA 5ITOA 5DEXA 3VVFA 1N76A 1B46A 5BWJA 4F19A 1NMUA 4H5GA 5EHSA 1EZPA 3I3VA 3KSJA 3GBAA 1B5IA 1WDNA 4H8IA 3TCFA 1SDXA 3FZVA 1YPNA 2VOZA 1FTKA 4NWCA 5K2YA 4G68A 4ZZAA 3N5LA 4H65A 3OSRA 3T96B 2HFBA 1YTVA 3FVNA 4YKIA 4JB7A 4IGRA 1ZKBA 3PPPA 4N6PA 1PB7A 1Z7ME 1P1NA 3LUYA 3MP1A 5FHNA 4YZZA 5I56B 1N7WA 2Z8FA 4GQOA 2LAOA 4ZECA 4QSEA 5J1DA 4RPOA 4KHZE 1B4ZA 1TXFA 1MM7A 3JZJA 4R2FA 4IO7A 3RGYA 4YMBA 3TTMA 4EDPA 2I58A 2PMSA 4QFKA 2V3UA 3TCGA 1ANFA 5AA1A 1FQDA 3HPIA 2D5WA 5CMMA 4FECA 4OETA 3U94A 2UVJA 1FW0A 2F36A 3CFXA 5TPAB 4QFNA 3S9EA 1FTOA 4RK2A 1OVTA 1IIWA 5M2VA 3DP8A 2Q2CA 4AB6A 2PYYA 1R6ZA 2NUVA 4F3SA 4JDFA 5AE4A 2XD3A 4MLVA 1B32A 5FHMA 5KDTA 1SW4A 3B6WA 3I6VA 1B52A 4ECFA 2DXRA 1A8EA 2ONSA 2OLBA 2DVZA 5JK4A 1SYHA 4GIZA 4HCWA 1GV8A 3ZS6A 4ELOA 1O64A 4RK9A 1B3HA 4YKPA 3U1OA 4DXBA 3I5OA 3K00A 4EXKA 4LQ2A 4Q5TA 4WKMA 4BDLA 3K1PA 3OXNA 2RC8A 3QIMA 1N3XA 1RKMA 3TODA 5I56A 4FIMA 4LP2B 2RKMA 2V84A 3QK6A 4F29A 2F5XA 3H6UA 3JYRA 3U93A 3C9HA 2QMXA 2ANJA 1QKBA 4EF1A 4KYEA 1MRPA 5AA4B 4NEDA 5FTIA 4LUBA 3MUQA 4WEDA 1L5TA 2H4IA 3ZKLA 5BUUA 1Q1KA 5TPAA 4WXJA 3RY3A 3TCHA 4ZEDA 5I57B 4OQOA 3B6TA 4ZEIA 2XXQA 4PFTA 4E0XA 3OO7A 4U1OA 1FTJA 1EU8A 1ZLQA 2F7BA 4UACA 3O6HA 1LAGE 1A40A 3H06B 1B7HA 3PPNA 3THIA 3FVKA 1QJMA 4F18A 4ISUA 3JV9A 3H03A 4F1UA 2RF1A 4YAHX 1QVSA 5AA2B 3KG2A 4I9DA 4YMAA 2I4CA 3Q25A 1D4NA 3UORA 1B3EA 4G2ZA 4ZZEA 2QPQA 4N07A 4POWA 5DYHA 3PD8A 2H25A 2VHAA 1MXUA 1CB6A 3SEUA 4NMYA 1OQHA 3IOVA 1M5EA 4OFJA 3PGFA 4BDQA 2I0BA 1P1UA 1B51A 4ESXA 4DCXA 3C31A 3LSXA 3Q29A 4ELRA 3PUYE 2Z22A 5KCJB 3MVYA 4C1UA 2UVHA 5I2NB 4IO5A 1NNFA 5CMKA 2O84X 2NXOA 3SETA 5AA4A 1VFDA 4FAJA 2Y7WA 1F9BA 1A99A 4PQJA 4E0WA 2GH9A 1Y3NA 1N84A 3VLVA 1QKAA 5I57A 1JW5A 4PETA 1NNKA 2AIXA 3ZSFA 2B3BA 4BDMA 2ALUA 3VLUA 4DXUA 3T9HB 4AB5A 2UXAA 4R2BA 2R9JA 1FCKA 3EHUA 4TQUQ 1UTBA 1Y1MA 3SKPA 1OVBA 4TOZA 2F97A 3FUZA 4ZE8A 3FJGA 2O7IA 3RT8A 4UA8A 1OQGA 5FTHA 2B65A 2YJPA 2I0CA 1LB9A 2I49A 4OESA 3K02A 4P0GA 1N04A 2QRYA 3PMVA 4ZEKA 2OBGA 5AA2A 1MY3A 2DSFA 2Z8DA 3MVZA 2O69A 2Y84A 5EYFA 1BIYA 3B7DA 3KSXA 2CMOA 3R6UA 2XXXA 4LZ5A 1MY2A 2DXYA 2A5SA 1M5CA 4WEPA 4QHQA 3Q27A 1UQWA 1H76A 4R6HA 1SD3A 4XKPA 1ZBMA 1P1WA 3IJOB 2XXPA 3PUXE 2XXTA 5HBCA 4OWDA 1PBPA 4LZ7A 4IO3A 1TFAA 5CI5A 2OK2A 3LSLA 3K6XA 1SW2A 3C35A 3G3FA 3ILUB 1HSLA 3TPAA 1I6QA 5ISUA 2DP8A 3GZGA 3FASA 2UVGA 5I2NA 5IKBA 3S9NC 1B58A 3QYTA 1AH5A 4AQ4A 1Y4TA 5CRYA 5JEIA 4QSDA 4G8HA 3TEPA 3KGCA 5CC2A 4R6YA 1FQBA 3E9XA 1IITA 1XC1A 3PUVE 1PBQA 5L9SA 1AOVA 4KD5A 3IOUA 1EZ9A 4KCCA 3O97A 4IO4A 3MC2A 4DLDA 2ZNSA 2O68A 3H4ZA 3D4CA 4RNSA 1NH8A 3O9PA 1N3WA 4KR5A 1LFIA 3A3CA 2XXYA 3UP9A 2H9BA 5CM6A 4GL0A 5ICQA 1IXHA 5LOMA 3RTFB 4GWOA 4XKNA 4NF6B 3FV2A 3FXRA 2RC9A 1B3GA 1QULA 2QL3A 1Y3PA 3VDFA 3E4RA 5EHMA 3R26A 5CMBA 1B40A 3TZAA 3O6IA 3SDFA 4RY1A 1MQHA 4F2QA 1DPEA 3UA8A 1TWYA 3MQ9A 3CG1A 4IY6A 1LAHE 3S9LC 4GVOA 1JNFA 1ELJA 3HV1A 5I59B 3C33A 3ODBA 3BFUA 4KPTA 2V93A 1H43A 5DVFA 3IOWA 2VGQA 1H3DA 1KWHA 2ZYOA 1HSEA 4DIGA 3W15C 4M4GA 1EZOA 1R9LA 3VXBA 1Y1ZA 1B2HA 3QXMA 5AA2D 2XXUA 4QRZA 2DE4A 4QFLA 4F1VA 1N0TA 1CE2A 4HCYA 4G8NA 3BKIB 5CBRA 2XX7A 4U22A 1URGA 2QS2A 3MBPA 1SYIA 1A55A 1LBBA 3CIJA 3M3LA 4IO2A 3KJ7A 4DZ1A 5ITPA 3EHSA 3IORA 5F7VA 2XX9A 3P7IA 1BKAA 3HSTA 3Q26A 1PB9A 3Q28A 4ELQA 5DTBA 5AA3A 2XXIA 3OEKA 1B3LA 3FGSA 1B5JA 4RPNA 4DXCA 4XIGQ 1ZJLA 1ATGA 4NF4B 1SI0A 1LGBC 1MS7A 3L6GA 3TUSA 4OMBA 3G3KA 1LCFA 2PX1A 4POXA 4NF6A 2Z8EA 3LBSA 4X9TA 2E0SA 3UK4A 1B0LA 3ILTB 1URDA 4P0IA 1M5DA 1XOCA 1ZIUA 1OMPA 2HCAA 4Q30B 3PV0E 4FEDA 2Y7RA 3T9XB 1Y3QA 3G3HA 2PBWA 5KZTA 3MP6A 4TLMB 4R75A 2P2AA 3U92A 2ONKE 1OLCA 5I59A 2HZLA 2I4BA 4O3BA 4RJZA 5H8FB 3MZ9A 2I3WA 5F1QA 4Z0IA 3OENA 3MWBA 4M1VA 4EUOA 2O6AA 2OJTA 1AIVA 3R7XA 1VE4A 3IR1A 2NWJA 1LFGA 4PE5B 3VXCA 4H0WA 2ABHA 3M8UA 1Q35A 1NNPA 4QF9A 5I2KB 1B1XA 1SBPA 4FATA 4OYVA 3O6GA 3IO6A 4U4XA 1XS5A 1IXCA 2X26A 1MQDA 1D3KA 3PU5A 4YKKA 3TYHA 1MY4A 1IUDA 3CFZA 4IY5A 3S4UA 1URSA 3KOSA 5TU0A 3OSQA 2ZXTA 3L6HA 3LC8A 3LSFB 3SESA 1FTLA 3K0VA 1NNTA 2DE3A 2F6PA 1UTBB 1PEBA 4R9FA 4NF4A 3C36A 1FTMA 4RXLA 4IB2A 5HPQA 1FQFA 3C32A 3H7MA 2GFEA 4LA9A 3DP6A 4LONB 4OERA 4G4PA 1IZ1A 2OZZA 1MH3A 3IOTA 2PT1A 1B1HA 3T93B 3CSBA 1IXGA 3USDA 2F35A 4KYSA 1Y9UA 3QSLA 2VD2A 3OEMA 3SEXA 4OEUA 3FJ7A 2D3IA 3FJMA 3GXAA 2W7YA 2H98A 3C34A 3U8QA 3MP8A 2Q89A 5H8QB 3TAJA 1S7YA 5H8FA 3N94A 1B9JA 1AL3A 3EN3A 1H44A 2DWIA 3UIFA 2G29A 1SVXB 1POTA 1B0HA 3PMWA 4KYDA 4KCDA 1IEJA 3IB0A 3GBBA 4NWDA 3TELA 3OMBA 4H5FA 3H6WA 1DOTA 5I2KA 1US5A 2A5TB 1BP5A 3C4MA 3IJXB 4X1DA 3S2VA 1DTZA 3MZBA 3OO8A 5A5XA 4LVQA 3RT6B 4HTGA 3BBRA 3H6TA 4JSDA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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