The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
53
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sequence length |
153
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structure length |
153
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Chain Sequence |
VLSEGEWQLVLHVWAKVEADVAGHGQDILIRLFKSHPETLEKFDRFKHLKTEAEMKASEDLKKHGVTVLTALGAILKKKGHHEAELKPLAQSHATKHKIPIKYLEFISEAIIHVLHSRHPGDFGADAQGAMNKALELFRKDIAAKYKELGYQG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Crystal structures of CO-, deoxy- and met-myoglobins at various pH values.
pubmed doi rcsb |
| molecule tags |
Oxygen storage
|
| molecule keywords |
MYOGLOBIN
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| total genus |
53
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| structure length |
153
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| sequence length |
153
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 1996-01-09 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3VHB A; 3VRG A; 4NXC A; 4MBA A; 1FN3 B; 101M A; 1LFY A; 4IRO B; 2ZLU B; 3S66 A; 1Y8H A; 1MLF A; 1V4U A; 1HBS B; 1MYF A; 5EYS A; 5EE4 D; 3M3A A; 2MYC A; 1Y8K B; 3AQ5 A; 2AUO A; 3ZJL A; 2BLI A; 3LB2 A; 2GTL C; 3VAU A; 2V1E A; 3R5I B; 4XS0 B; 3NFE B; 1MBO A; 1MCY A; 2ZS1 D; 1FN3 A; 4U8U C; 4IRO A; 2ZLU A; 2BW9 M; 1CIO A; 4F6B A; 1F65 A; 2D2M A; 2ZLT B; 2JHO A; 2Z6T A; 1Y2Z B; 1Y8K A; 3ZJH A; 1YHR A; 3G4Q A; 1ABS A; 4M4A B; 3R5I A; 4WJG 1; 3S1I A; 1BVD A; 3G4R A; 2MGB A; 3NFE A; 2MYD A; 1IBE B; 3LB1 A; 4NXA A; 1VXC A; 4YU3 A; 1JPB A; 3QQQ A; 1TU9 A; 3LB3 A; 1J40 A; 2ZLT A; 1UX8 A; 2ZT2 A; 1Y4V B; 1Y2Z A; 3AQ6 A; 1L2K A; 5ILR A; 1Y83 B; 4M4A A; 1IDR A; 1JW8 A; 1HSY A; 1EBT A; 1HLB A; 3E5O A; 3VRE A; 1IBE A; 1DXV B; 3WCV B; 2WTG A; 1K1K A; 2V1J A; 4O35 A; 4FWX A; 4FC3 B; 3LR9 A; 4NI1 B; 7HBI A; 3LR7 A; 1Y4V A; 4ODC B; 2W6Y A; 3OO5 B; 5CN8 A; 2O5T X; 2FRF A; 4UZV A; 1A0U A; 3UH6 A; 1Y83 A; 1HGA B; 5HY8 B; 5EET A; 1BIJ B; 4ESA B; 1GDI A; 2QFN A; 1DXV A; 3WCV A; 5KER B; 1NQP B; 2W72 C; 2GRZ A; 4FC3 A; 4NI1 A; 1LH6 A; 3QJE B; 3OO5 A; 1GBV B; 1HGA A; 1YOH A; 2HCO B; 2QSS B; 1Y4R B; 1MKO B; 4MQC B; 5KER A; 1NQP A; 2ZSS A; 4XDI A; 3WTG A; 3QJE A; 2GTL D; 4ROL B; 3WCW C; 1GBV A; 1DXD A; 1Y4F A; 1XZ7 B; 2HCO A; 4U8U D; 1GLI B; 2QSS A; 1Y4R A; 5CN5 A; 4F6I A; 3NMM B; 1MKO A; 1GCV B; 2QU0 B; 4AVE A; 1C7D B; 3ZJN A; 1U7R A; 2WY4 A; 2BLJ M; 2MGA A; 1LFT B; 4ROL A; 3UHX A; 4TWV A; 3DUT B; 2SPL A; 1HGB B; 1YHE A; 1VXE A; 2ZS0 B; 1MNH A; 1XZ7 A; 1PBX B; 5HLQ A; 3K3U A; 3GQR B; 3D17 B; 1YZI B; 1THB B; 2D2N B; 3WCT C; 2VLY A; 1GLI A; 2MBW A; 3NMM A; 1KD2 B; 1GCV A; 1UX9 A; 2QU0 A; 1C7D A; 1R1X B; 3O89 A; 1LFT A; 2DN2 B; 1DWR A; 3QM6 A; 1J7W B; 3O7N A; 3DUT A; 1HGB A; 2ZS0 A; 1PBX A; 3GQR A; 1YZI A; 3D17 A; 1THB A; 2D2N A; 3WCU A; 1DUK A; 2ZSQ A; 1MLG A; 1KD2 A; 2BK9 A; 1XZ4 B; 4YU4 A; 1GJN A; 4KMW A; 5ILM A; 1R1X A; 2BLH A; 5EUI B; 1DTI A; 1Y8W B; 1Y46 B; 2ZS1 B; 2ZSZ A; 2DN2 A; 1MYM A; 1YCB A; 1XY0 B; 1YOI A; 2OHA A; 2PGH B; 1J7W A; 1N9X A; 2LH7 A; 2W6X A; 1H1X A; 1YVQ A; 2EVP A; 2LH6 A; 5EUI A; 4JAC A; 1V4W B; 1Y8W A; 1Y46 A; 2ZS1 A; 2ZSX A; 1MBA A; 1MLM A; 1XY0 A; 3DHR B; 4NI0 B; 1JL7 A; 2LH5 A; 2PGH A; 1JL6 A; 3UH5 A; 4UUR A; 1FAW B; 2FRJ X; 1CH3 A; 3UHB A; 1CH4 A; 3G4W A; 5CMV A; 1AZI A; 4ROM B; 1MNI A; 1V4W A; 1HDA B; 1XZ5 B; 3WCW D; 3ZJQ A; 1S0H B; 2D6C A; 3DHR A; 3UHI A; 1HBI A; 1HV4 B; 3D1A B; 1CO9 A; 1IOP A; 1MOC A; 1VXD A; 1FAW A; 1XQ5 B; 1YHU B; 1YGD B; 4G1B A; 2MGC A; 1YDZ B; 1MWD A; 2XYK A; 4ROM A; 1HDA A; 1XZ5 A; 1KR7 A; 2O58 X; 3BCQ B; 1S0H A; 1HJT A; 5JDO E; 3ORD A; 2RAO B; 4OF9 A; 3NL7 A; 5B84 A; 3HEN A; 1HV4 A; 3WCT D; 1CO8 A; 4MBN A; 2ZLX B; 2Z6N B; 1S5X B; 3OK5 A; 1XQ5 A; 1YHU A; 3ZHW A; 3GQG B; 2R4W A; 1YDZ A; 1O1K B; 1AJ9 B; 1YEO B; 1Y0W B; 3UH3 A; 4C44 A; 1C40 B; 3BCQ A; 2ZFO B; 2RAO A; 5HU6 B; 2R4Z A; 2BNL A; 3QZX A; 2GNW A; 2ZLX A; 5E6E B; 3S1J A; 2Z6N A; 1S5X A; 1Y45 B; 1MDN A; 1Y7C B; 3PI8 B; 3WCP B; 111M A; 1HLM A; 3GQG A; 4HRT B; 1IWH B; 5JDO F; 1XXT B; 1O1K A; 1AJ9 A; 1YEO A; 1RTX A; 2HBG A; 4HSW A; 1Y0W A; 1LFL B; 1C40 A; 1SI4 B; 2ZFO A; 6HBI A; 3K9Z A; 5HU6 A; 4DWU A; 1SHR B; 4O4Z A; 3PI3 A; 2ZT0 A; 1EMY A; 5E6E A; 2V1K A; 1Y45 A; 1VRE A; 4BJA A; 4SDH A; 1HAC B; 1A9W A; 1CIK A; 1Y7C A; 3WCP A; 4F6G A; 1NAZ A; 4HRT A; 1XYE B; 1IWH A; 2HHB B; 1XXT A; 2QLS B; 2R4X A; 2ZT1 A; 1ABY B; 1LFL A; 1LH1 A; 2DHB B; 1SI4 A; 2BMM A; 1Y01 B; 1J7S B; 1SHR A; 4F4O A; 3LHB A; 1HAB B; 1BZ0 B; 3ARL A; 1BBB B; 5HLX A; 1CQX A; 3D7O B; 1HAC A; 3UBC A; 1COH B; 2HHB A; 2QLS A; 2MB5 A; 3QM8 A; 1J3Y B; 1HBH B; 1ABY A; 1BIN A; 1Y22 B; 2DHB A; 3MJP B; 4MQK B; 4F69 A; 1MYH A; 1YH9 B; 1MLU A; 1C7C B; 1J7S A; 1MLS A; 1V9Q A; 2MGF A; 1BZ0 A; 3DR9 A; 1CH1 A; 2AUQ A; 3E5I A; 2HBS B; 3GQP B; 2CMM A; 2VYZ A; 1BBB A; 1MBD A; 3D7O A; 1DXC A; 3UHD A; 2H8F B; 3TM3 A; 1DO3 A; 1VXH A; 1COH A; 2ZST A; 4B3W A; 1PMB A; 1F5P A; 3UGZ A; 2MYE A; 1J3Y A; 1HBH A; 1Y22 A; 3MJP A; 2VEB A; 4MQK A; 1YH9 A; 1C7C A; 1C7B B; 2ZSR A; 3PI4 A; 3KUO A; 4JYQ A; 2HBS A; 3DHT B; 3GQP A; 1OR4 A; 2HBD B; 1RQ4 B; 2Z6S A; 2H8F A; 5JOM A; 2GNV A; 4HBI A; 5F0B A; 1LJW B; 1HBS A; 1YVT B; 1QXD B; 2H8D B; 2FRK X; 3EDA A; 1NZ2 A; 4F6J A; 2D60 B; 2MGI A; 1MLO A; 3WCW B; 4XS0 A; 2G14 A; 3DHT A; 2VLZ A; 2QSP B; 3QJB B; 2HBD A; 3G52 A; 1RQ4 A; 1G0B B; 1LHT A; 1OJ6 A; 2O5B X; 3BJ1 B; 1LJW A; 1QPW B; 1URY A; 1VWT B; 4GZG A; 3H58 A; 2FAL A; 5E83 B; 2PEG B; 1UT0 A; 1N9H A; 1B86 B; 1X9F C; 1YG5 B; 2D60 A; 4NK1 A; 1CLS B; 1CH7 A; 4IT8 A; 2QSP A; 3QJB A; 4ZVB A; 1MYJ A; 1ABW B; 1OFK A; 5AZQ A; 1G0B A; 1CQ2 A; 1G0A B; 2VHB A; 4LPI A; 1J41 B; 4HSX A; 3VRF B; 4WCH D; 3BJ1 A; 1QPW A; 5HBI A; 2VYY A; 4PNJ A; 3HHB B; 1VWT A; 1B0B A; 1YIH B; 5E83 A; 1HBA B; 2PEG A; 1YG5 A; 1B86 A; 1XZV B; 2V1I A; 1URV A; 1Z8U B; 4FH6 A; 1Y35 B; 1CH5 A; 1YGF B; 3QM9 A; 1ABW A; 3AT5 B; 1O1M B; 1HBR B; 3ARJ A; 2NX0 A; 1J41 A; 2G0R A; 104M A; 5SW7 B; 3QZZ A; 3PT8 B; 1UFP A; 1MWC A; 3HYU B; 2MGK A; 3EOK B; 3HHB A; 4ODC A; 1YIH A; 5CN6 A; 1HBA A; 3H57 A; 4MXK A; 1XZV A; 4F68 A; 108M A; 2D2M C; 3QJC B; 1DXT B; 2QMB B; 6HBW B; 5HY8 A; 1V07 A; 4O2G A; 3ZJS A; 3ECX A; 1BIJ A; 1NS6 B; 3SDN A; 4ESA A; 1Y35 A; 1JZM A; 1YGF A; 1RTE A; 1S61 A; 3AT5 A; 1O1M A; 1HBR A; 3QM7 A; 4PQ6 A; 5SW7 A; 3QMA A; 3HXN B; 3PT8 A; 1ECO A; 2D5X B; 3HYU A; 2OHB A; 2ZT4 A; 1MLH A; 3CY5 B; 2ZFB B; 3QJD B; 4G51 B; 2HBE B; 2AUP A; 1ECN A; 3QJC A; 1DXT A; 2QMB A; 6HBW A; 1GDJ A; 3BJ3 B; 1NS6 A; 3ZOM A; 3UHW A; 4C0N A; 1CG5 B; 4MQC A; 1R1Y B; 1A9W E; 3HXN A; 4UIQ A; 3GYS B; 2D5X A; 5F2A A; 1O1O B; 2GKN A; 3CY5 A; 2ZFB A; 3QJD A; 4G51 A; 1W92 A; 2HBE A; 4TWU A; 2M6Z B; 3UHR A; 2HZ1 A; 3UHT A; 5JDO C; 4PQC A; 1YOG A; 3KUN A; 5EV5 A; 1NXF A; 5EOH A; 1CG5 A; 2LH1 A; 1A4F B; 1IRD B; 1R1Y A; 1LH7 A; 3GYS A; 1O1O A; 3D1K B; 1A3O B; 2AUR A; 1X9F D; 3WCV C; 1NIH B; 5D1V A; 5ILE A; 1J3Z B; 1SDK B; 5CN7 A; 2M6Z A; 3M3B A; 1WMU B; 1M6M A; 1OUT B; 4N7N B; 2R1H B; 5B85 A; 4F6D A; 1DTM A; 2MYB A; 1MLL A; 3IXF A; 1SDL B; 1LFZ B; 1A4F A; 5IKS A; 1IRD A; 1O1P B; 4B4Y A; 3D1K A; 3MN0 A; 1A3O A; 3LB4 A; 3D4X B; 1GDL A; 3ECL A; 1J3Z A; 1SDK A; 1YMB A; 1BZ6 A; 1U7S A; 1JF3 A; 1WMU A; 1OUT A; 2R1H A; 5CNB A; 3UHY A; 2ZWJ A; 3R0G A; 1Y4P B; 3RJN B; 1SDL A; 1LFZ A; 3ZH0 A; 4MAX A; 4NS2 A; 1XZ4 A; 1O1P A; 2W31 A; 3SZK B; 5AB8 A; 3GOU B; 3WI8 A; 3KMF A; 2D2M D; 3D4X A; 109M A; 1O1L B; 1Y4B B; 2O5L X; 3A5G A; 4TYX A; 5EQM A; 3ZJR A; 1Y4P A; 1G9V B; 3MYN A; 1VXA A; 1CG8 B; 1S69 A; 1Y0C B; 105M A; 1YEQ B; 3SZK A; 3GOU A; 1NGK A; 1JP8 A; 1DXU B; 4NI0 A; 1Y4B A; 2VLX A; 4N8T B; 107M A; 1Y5J B; 3ED9 A; 1DLW A; 1G9V A; 1CG8 A; 2ZS0 C; 2G3H A; 1Y0C A; 2D2N C; 3WCU C; 1UMO A; 3UHN A; 1YEQ A; 3MBA A; 2DN3 B; 3ZJI A; 2DN1 B; 5JDO D; 1DXU A; 2ZSN A; 3UHZ A; 1BUW B; 1A01 B; 1IRC A; 1MTK A; 3D1A A; 1GZX B; 1Y5J A; 2GRF A; 2OH8 A; 4KN3 A; 1CP0 A; 4QAU A; 1QSI B; 3S65 B; 4MQI B; 4DWT A; 1HBG A; 1YGD A; 1T1N B; 1MBI A; 1A3N B; 3AQ9 A; 3WCV D; 3PEL B; 1O1N B; 4O1T A; 2DN3 A; 1MLQ A; 1UFJ A; 2HZ3 A; 2G0Z A; 1Y7G B; 3A59 B; 3GKT A; 4H2L B; 1BUW A; 3BJ2 B; 3ASE A; 1A01 A; 2ZLV B; 2ZS1 C; 1YMC A; 1GZX A; 1DUO A; 1BZR A; 2BKM A; 2GTL B; 1D8U A; 1QSI A; 3S65 A; 1QI8 B; 1T1N A; 1OUU B; 1DM1 A; 2XKG A; 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1LFQ B; 1LA6 B; 1YFF A; 2ZFO C; 1CPW A; 5CNC A; 3W4U A; 2D2M B; 4G1V A; 1Y0A B; 3PIA A; 1RVW A; 1RQ3 A; 1MOD A; 2GRH A; 102M A; 1OBM A; 1YHR B; 1BZ1 B; 1MGN A; 1N9I A; 1GBU B; 2W72 A; 4MQG A; 1YEV B; 5HLU A; 4NZI A; 1G09 B; 1C7B A; 3G4Y A; 1LFQ A; 1LA6 A; 2G0S A; 110M A; 3UHV A; 4YU3 B; 1LH3 A; 2GDM A; 5ILP A; 1NZ5 A; 1ECD A; 1OFJ A; 1VXF A; 1Y0A A; 1J40 B; 2NSS A; 4KMV A; 1DWS A; 2MGE A; 1Y8I B; 3A0G B; 2O5M X; 1YCA A; 3CIU B; 3OVU C; 5KDQ B; 1YVT A; 3HC9 A; 1QXD A; 2H8D A; 1BZ1 A; 5MBA A; 1GBU A; 3RGK A; 1CP5 A; 4L7Y B; 1KFR A; 1YEV A; 1G09 A; 3VRE B; 1MBS A; 1M6C A; 2ZSP A; 1A6N A; 1G08 B; 1K1K B; 1SPG B; 3HF4 B; 3WCW A; 3K8B B; 2G10 A; 2ZT3 A; 3G4U A; 1MYG A; 1Y8I A; 3RJ6 A; 3A0G A; 2YRS B; 3WCT B; 3CIU A; 5KDQ A; 1A0U B; 3U3E A; 2FAM A; 1BVC A; 3ARK A; 4L7Y A; 4VHB A; 1AJH A; 1G08 A; 1SPG A; 1CLS A; 3HF4 A; 3ZJO A; 2AV3 A; 3K8B A; 1JY7 B; 1UIW B; 1G0A A; 1JDO A; 3VRF A; 2YRS A; 3WCT A; 1YHU D; 3G4V A; 1JZL A; 3MVC A; 3OO4 B; 2R4Y A; 1RPS B; 4O4T A; 4FH7 A; 1FHJ B; 2GL3 A; 1S6A A; 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