1VZOA

The structure of the n-terminal kinase domain of msk1 reveals a novel autoinhibitory conformation for a dual kinase protein
Total Genus 91
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
91
sequence length
322
structure length
319
Chain Sequence
QLLTVKHELRTANLTGHAEKVGIENFELLKVLGTGAYGKVFLVRKISGHDTGKLYAMKVLKKATIVQKAKTTEHTRTERQVLEHIRQSPFLVTLHYAFQTETKLHLILDYINGGELFTHLSQRERFTEHEVQIYVGEIVLALEHLHKLGIIYRDIKLENILLDSNGHVVLTDFGLSKEFVADETERAYDFCGTIEYMAPDIVRGGDDKAVDWWSLGVLMYELLTGASPFTVDGEKNSQAEISRRILKSEPPYPQEMSALAKDLIQRLLMKDPKKRLGCGPRDADEIKEHLFFQKINWDDLAAKKVPAPFKPVIRDELDV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
publication title The Structure of Msk1 Reveals a Novel Autoinhibitory Conformation for a Dual Kinase Protein
pubmed doi rcsb
molecule keywords RIBOSOMAL PROTEIN S6 KINASE ALPHA 5
total genus 91
structure length 319
sequence length 322
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2004-05-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 1vzoA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 1vzoA01
3H4JA 3U6JA 1Y57A 4K8AA 3FKLA 4IAAA 4AN9A 1F3MC 5A3XA 4LQMA 4JVGA 1REKA 4YJSA 3QXOA 5CSWA 4OTGA 3KMWA 4EH6A 2R3KA 1SYKA 2GSFA 5AR2A 3OWLA 5DGZA 4CEGA 2YWVA 2BRMA 4DFBA 3E8NA 4L46A 5GJDA 4RBLA 3QGWA 4O82A 5T3QA 2WGJA 4UMPA 2IZUA 5CQUA 4DGMA 4HGTA 4G6NA 4LV8A 2BKZA 2OIDA 2VV9A 4IB1A 4LM5A 3OUNB 2AYPA 4FKRA 1XR1A 4O0SA 5JGDA 2WD1A 2YHVA 2X2MA 4AZFA 3H0YA 4BDDA 4BIEA 1DAYA 2WKMA 4IADA 4X3JA 2CHLA 2JFLA 2BVAA 4FKSA 3KK9A 4NSTA 4IACA 1QCFA 1SVGA 3R1QA 2ONLA 4NKSA 3ZUTA 4RWKA 4S30A 4XNEA 4D0XA 2BHEA 3VO3A 5AFVA 4NZWB 4ZXTA 4J53A 4QYHA 4RJ8A 5D41A 2G9XA 2WTDA 3FV8A 2R9SA 4JAIA 3KVXA 1WBOA 4O2ZA 2I0VA 2Y4IB 2HIWA 1GZKA 3IW7A 3G0EA 2C1BA 4E6DA 5AX3A 4CMTA 4YMJA 2G1TA 2HELA 3C1XA 4L45A 3TV6A 4E4XA 4ZOGA 4BR3A 5AUXA 1BKXA 4U41A 3P23A 3PXYA 5AAGA 4JBOA 5HU3A 3MGYA 4AACA 4OTPA 2CLQA 3PA5A 3F3UA 2WTIA 3V5TA 4E93A 3ZUVA 2CDZA 3HV6A 4OUCA 2JKQA 3GT8A 3LJ0A 3CD8A 5AMNA 5I4NA 4EHVA 3TKIA 4CG9A 3P7BA 4WRGA 4D2TA 3D9VA 3LFSA 4KIOA 3GOPA 4OW8A 4AP7A 3GB2A 3R8VA 3OEFX 4XHKB 5HCXA 3OTUA 3FC1X 2UZVA 3IKAA 3CTJA 3KRXA 4ANOA 3Q52A 5CI6A 2OF4A 3RZBA 4O0UA 4YJNA 1SVHA 4GVJA 4UYNA 3GOKA 1JKTA 4D0WA 3QD3A 4F9WA 4TWPA 4G16A 2C68A 3R02A 5G1XA 2QONA 4XRJA 4TY1A 4QMPA 1FQ1B 2XJ2A 4OTFA 4ZTMA 1H1RA 2WAJA 3NSZA 4JR3A 5M4UA 2C5OA 3DPKA 4UWBA 3DJ6A 4B0GA 2YLFA 4V04A 1PXNA 3V5QA 4D2WA 3PSCA 2XIYA 3FBVA 2UW5A 5EYDA 5H8BA 4APPA 5IQBA 2UW6A 4HNIA 1PY5A 4BCPA 4BWKA 1VZOA 4ANBA 1LUFA 3BHUA 1O6LA 2PZ5A 4O7VA 4DTKA 3NNVA 1H27A 2OXDA 3OF0A 3WIKA 1UWHA 2WTJA 3MFUA 5CT0A 4BI1A 3O23A 4FSYA 4D1XA 1QPJA 4NL0A 5FQDC 4D58A 4XP3A 4FUYA 4EEVA 3LXKA 3EQPA 2JITA 5EI6A 2LAVA 4BB4A 3I79A 1BI7A 5CEIA 3W33A 2OJFE 4ACMA 4JT3A 2ZB1A 3O7LB 3CP9A 3NYNA 4JX7A 3R63A 4V05A 5IQDA 1DI8A 1XHAA 1ATPE 4O0YA 4RJ7A 2O2UA 5B2LA 3ANRA 1WCCA 1ZOHA 2X39A 3FDNA 5E1EA 3ZLYA 3HP5A 2J0IA 1QL6A 3NNUA 3UP2A 1ZYJA 1XH4A 1XWSA 2QOCA 3BBTB 1YI6A 3M1SA 4L01A 3FZSA 3LFCA 4MHAA 4WRSA 3W32A 3GC0A 4WA9A 4ZTQA 3VUKA 3W8QA 5M51A 2BDFA 4U43A 2E9UA 3ZFMA 1X8BA 4IVBA 1G8AA 3AD6A 5BYYA 3S0OA 3I6WA 3DS6A 3ZSHA 5IA3A 4AW0A 4E1ZA 2YIRA 3L9LA 3E8DA 4XJ0A 4IWOA 4KSPA 4DH5A 4QYEA 4UALA 3V6SA 5K0XA 4KIKA 5EOLA 4AN3A 4O7LA 4DG3E 1W82A 4IAYA 4K1BA 5DIAA 3GU7A 4U79A 4NM0A 5GIPE 3JY0A 5FDXA 2Z2WA 2JC6A 3KN6A 1CSNA 3ALOA 4BCHA 1R0EA 4RWJA 3UPZA 1Q97A 2QO7A 3RCDA 1IAHA 4OAUC 3RKBA 4PMPA 3HLLA 4EHEA 2YFXA 4IMYA 3VS4A 1FVTA 2H9VA 2XRUA 5KZ0A 1URWA 5ANJA 1DI9A 3ROCA 4IZ7A 5DBXA 5AUYA 1BYGA 3S95A 2E9VA 1GJOA 3EQDA 1NT2A 2YCRA 4YLKA 5CEOA 3TUDA 4AFJA 2CPKE 5J95A 2X0GA 2R3MA 4AT4A 2Z7RA 4R5YA 1XH7A 3BU6A 4OTHA 3H9FA 4A4LA 4FKGA 3MVJA 4Q2AA 4TW9A 4A9SA 2JFMA 3O7LD 3ZTXA 1HCKA 4FV7A 5CVGA 3FEGA 1CMKE 5E4HA 1I09A 4P2KA 3IQ7A 4LOOA 5FLFA 2UW8A 4QQ5A 4EJ7A 1PYXA 1OB3A 2H8HA 4Y5QA 1M7QA 5HOAA 4EH9A 1GZOA 3JXWA 4FGRA 4ASXA 1GNGA 4TYEA 3ODZX 3R9HA 3WILA 3UIUA 2I40A 2QLUA 4I5CA 5HBHA 2JIVA 4RIOA 1CKPA 3ZDUA 4ENYA 3VBXA 5HGIA 4EOLA 4CQGA 4RWIA 4PMMA 1ZOGA 3PP1A 4EL9A 4IWDA 2XIKA 3MFSA 3H9OA 4MNEB 5KUPA 3I0OA 4EK5A 2BIYA 4BDKA 5DE2A 3G15A 1OKWA 3W16A 4BBFA 1KUTA 2VWXA 3LQ8A 3QTWA 1ZYLA 3NAXA 3EYGA 4UMUA 2R3NA 5J7BA 1ERKA 1NXKA 2OSCA 3MY1A 4G6LA 5LMKA 3F7WA 2OXXA 3GXLA 1OL2A 4F4PA 4MYGA 4UY9A 5I3OA 3QYWA 2HW7A 3W2OA 5KMOA 2PU8A 3DXNA 4FV8A 5AIKA 1OMWA 4FTUA 3GGFA 4ASZA 5A54A 2BRBA 2YIQA 4FBXA 3F2NA 4FTQA 4GMYA 3LAUA 5AUZA 1OVEA 3KULB 3A62A 5KCVA 3BV3A 4MWIA 4DA5A 3S3IA 2GTNA 2JBOA 4IFGA 5C27A 4ZJIA 4HPUE 2BDWA 5CAVA 2BROA 2PSQA 3U4UA 1FVRA 4F9YA 4ALUA 3ZFYA 5HIDA 2C0OA 2GQGA 3PVWA 4ALWA 4C3RA 3DFCB 4NW5A 1ZZ2A 1YDTE 3BE9A 4FG9A 2NP8A 4I5MA 4XYFA 5DA3A 1UU9A 1WBWA 2WHBA 2YDJA 3WF9A 2X4FA 4O1PA 4F0IA 5L2TA 2VTJA 4D4RA 2HZ4A 2OBJA 2VO0A 3MPAA 1MRVA 3C4ZA 2GHLA 2V7OA 2CGWA 3FLSA 4NKAA 5AM6A 1JLUE 3SRVA 2VUWA 3UQGA 4IXPA 3PSBA 5AR5A 3GFWA 2WTVA 2DYLA 3R1SA 2VAGA 3RAWA 3E62A 2F49A 3NCZA 5H2UA 3K2LA 4ZTNA 1KV2A 2UZUE 4FG7A 3ZLWA 3BWFA 4C4JA 3AC2A 4EONA 2WNTA 4CMUA 2V62A 4KKGA 5IA2A 5HNIX 3R71A 1TQIA 3EJ1A 3KMMA 4Q5HA 5LARA 4AW1A 1JBPE 3PJ1A 1UNGA 3VS1A 4FT7A 3DNDA 3MB7A 4QPMA 3DOGA 5IQHA 2XEZA 3GEQA 2CGVA 4HNFA 4DC2A 4JOAA 4DITA 4I4EA 4FEWA 3PA4A 2UW0A 4UWCA 3GCVA 1UU8A 4BYIA 5DT3A 4BICA 2BRNA 2XRWA 3QTRA 3DBQA 1JSUA 3FMMA 4O91A 4YP8A 3HDNA 5CU2A 5EW9A 4RIYB 4Z55A 5JK3A 5BPYA 2YIXA 4C02A 5M53A 2G15A 1PMUA 4APCA 2REIA 4CMOA 4ANMA 4ZTLA 2X6DA 3R9NA 2WU6A 4A9YA 1XKKA 1TKIA 3BHYA 4WD5A 5DOSA 3SDJA 3L9MA 3F3TA 5ANDA 3EMGA 2IWIA 3QWJA 4LG4A 3IS5A 3QHWA 3BQCA 2XUUA 4FTNA 4PTGA 2PVRA 2CCHA 3KK8A 4HVGA 1GY3A 3G9LX 1JSVA 4WT6A 4NIFB 5EKOA 5KX8A 2A2AA 3NIEA 3QUDA 3EKNA 4F63A 2C0TA 4FIEA 2GFCA 4RC3A 2QQ7A 3MB6A 3NW5A 2JAMA 4CLIA 4FTLA 4K18A 3VNTA 4GKHA 3AT3A 3IDPA 3Q04A 3DKOA 2CGUA 3TKUA 3BI6A 4V0GA 2YCFA 1XH5A 3QD0A 3R2BA 5LMAA 3RAKA 2C5YA 2QOHA 2QKRA 2ETKA 2O65A 4JDHA 4PF4A 3OFMA 4RQVA 5CXHA 2O5KA 4MBJA 5EI8A 4FTAA 3UG2A 4DT8A 4G17A 4MD9E 5F95A 5J87A 3QA0A 5DLSA 5HLWA 4ZSAA 3HL7A 1TQMA 3ACJA 4WUAA 2QHMA 2J0KA 3SX9A 3UG1A 3ZRKA 2VTQA 4R3CA 4BF2A 3E5AA 2GNJA 4EQUA 3ZXZA 3CCNA 3QUPA 4M13A 4MWHA 5HTCA 3QC9A 1P4FA 4G1WA 2PULA 4Z7HA 2C5NA 3UQFA 4ANSA 3HX4A 1DM2A 3F88A 2VN9A 5BMMA 3WF7A 4C35A 1Q41A 3GQIA 2R4BA 2ZV7A 4CQEA 4BL1A 1WBVA 1ZMUA 2XKDA 3V3VA 3G90X 4G3EA 3FKNA 4B4LA 4QTCA 5HG5A 1UA2A 3E8CA 4PPAA 5C8NA 4L42A 4U9AA 5AA9A 2VGOA 3Q6UA 4K33A 3TNHA 5E8XA 3VUIA 4XG4A 4W9XA 4YC6A 2PVHA 2FSTX 3F6XA 4TWCA 4B7TA 5HBJA 3OMVA 1CM8A 3VUGA 3FKOA 3FL4A 3MH0A 5BUJA 3BZ3A 1MP8A 1UKIA 4JIAA 4FKQA 4NM7A 5K5NA 5IH6A 2XZSA 4JQ8A 2XH5A 4I92A 3UGCA 2RG6A 2WTKC 3AOXA 4AE6A 3ORKA 1ZYCA 2X9FA 4DG2E 2VWWA 3MI9A 3D15A 2XKEA 4IM2A 4ZS4A 4IQ6A 5DRBA 5FG8A 4QMTA 2XBJA 4EOOA 2P3GX 3S1HA 2ETMA 4U44A 4IE9A 3TN8A 4DGLC 4I3ZA 2HY81 4FV9A 4TYGA 3UOLA 1OL7A 4TNDA 5L2IA 2C6LA 5F9EA 3DJ7A 2XJ1A 1M2PA 1WZYA 2X9EA 3R7GA 3P08A 4FMQA 2Q0BA 5HHWA 3I5NA 2BCJA 3AC5A 2C69A 1OM1A 2VGPA 4O7YA 5FBNC 4AW5A 3VS5A 3PPKA 4KAOA 4BGQA 3QWKA 2VNYA 4DH7A 4MF1A 1GIHA 4CKIA 4JQ7A 1PF8A 4OLIA 5KMJA 2B0QA 3PY0A 4O0VA 4CV9A 4BCQA 5AEPA 3TNPC 4I23A 3GP0A 3VN9A 3VHEA 2BKKA 2G2HA 4EOKA 3UC3A 4UXQA 3QCYA 4RGJA 3LFBA 3EQFA 2I0HA 4U97A 3QCXA 1H08A 3I81A 4QNYA 5L2SA 1H01A 4ZSLA 2F9GA 4E6AA 2HK5A 4BVUA 4BYJA 1J7LA 1ZLTA 2RG5A 2IVUA 5KBQA 5AJQA 4ZSEA 3UYSA 4FTMA 4CKRA 4ZY5A 3HV4A 3ODYX 4Y46A 5AV3A 1TQPA 1YKRA 4JLCA 3R04A 4GW8A 1E1VA 5CX9A 1QMZA 4ZY6A 4D9UA 2RFNA 3R8MA 5EYMA 4GU6A 5HORA 3AXWA 4KKEA 1YRPA 5M06A 3FY0A 5IQCA 1U5RA 2X8EA 4LMUA 4BDEA 1CDKA 5IDNA 5IU2A 1AQ1A 5DN3A 2Q83A 4RRVA 2CNUA 4BTMA 4BHZA 4FZDB 4R3PA 3A7GA 2FO0A 4I1ZA 4LRJA 4F6SA 5L8KA 1K2PA 4L43A 4UMRA 1STCE 3N9XA 3ZO3A 4RLKA 2X6EA 4GK4A 4DGOA 4BTJA 5A9UA 3N4VA 4DTBA 4FIJA 4YJVA 1IA9A 4GVAA 4O81A 3MVHA 2CN5A 5CSVA 3Q96A 3C4CA 4OT6A 3ZUUA 3PRFA 4EK6A 1AGWA 2WQNA 4YHFA 3JR1A 4C59A 1XBAA 1ZOEA 1FINA 4FTIA 1ZXEA 3FI2A 4FK3A 5IDPA 5BUIA 1WBSA 5IMXA 3S4QA 3SXSA 4W8DA 2J90A 4L7FA 3VS3A 3VUHA 5CF4A 2QD9A 4HZRA 4TWNA 5EK7A 3LCSA 3NEWA 3ORTA 4C0TA 4EKLA 2FH9A 5GHVA 3TI1A 5AUUA 2GMXA 3RALA 3VULA 4CFMA 2Y4PA 1PMEA 3EQHA 3ZOSA 4IX5A 4O1OA 4QQJA 5E8WA 1G5SA 3U4WA 4FODA 3ATSA 4YNOA 4YJOA 2Y0AA 3EN4A 3A8WA 4ENXA 3BHVA 5LCKA 2JD5A 2YJRA 2YEXA 3BYSA 4AN2A 5CAUA 4YNEA 2CKQA 2O3PA 5C9CA 2JDOA 3P5KA 3D5WA 3SD0A 3UZRA 4ZAUA 4OBQA 4GV1A 1CKJA 1YHVA 3RWQA 3FI8A 4I6FA 2QOBA 2O0UA 2IVVA 4BGGA 4XRLA 1PRYA 4G3CA 3GC9A 3HVCA 2XS0A 3QQHA 4PUZA 4UXLA 4ZZOA 2C5XA 4H3PA 2Z8CA 4QMWA 1BX6A 3RM7A 3NR9A 5C26A 1R1WA 2BRHA 5M55A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3H4J A;  3U6J A;  1Y57 A;  4K8A A;  3FKL A;  4IAA A;  4AN9 A;  1F3M C;  5A3X A;  4LQM A;  4JVG A;  1REK A;  4YJS A;  3QXO A;  5CSW A;  4OTG A;  3KMW A;  4EH6 A;  2R3K A;  1SYK A;  2GSF A;  5AR2 A;  3OWL A;  5DGZ A;  4CEG A;  2YWV A;  2BRM A;  4DFB A;  3E8N A;  4L46 A;  5GJD A;  4RBL A;  3QGW A;  4O82 A;  4QDV A;  5T3Q A;  2WGJ A;  4UMP A;  2IZU A;  5CQU A;  4DGM A;  4HGT A;  4G6N A;  4LV8 A;  2BKZ A;  2OID A;  2VV9 A;  4IB1 A;  4LM5 A;  3OUN B;  2AYP A;  4FKR A;  1XR1 A;  4O0S A;  5JGD A;  2WD1 A;  2YHV A;  2X2M A;  4AZF A;  3H0Y A;  4BDD A;  4BIE A;  1DAY A;  2WKM A;  4IAD A;  4X3J A;  2CHL A;  2JFL A;  2BVA A;  4FKS A;  3KK9 A;  4NST A;  4IAC A;  1QCF A;  1SVG A;  3R1Q A;  2ONL A;  4NKS A;  3ZUT A;  4RWK A;  4S30 A;  4XNE A;  4D0X A;  2BHE A;  3VO3 A;  5AFV A;  4NZW B;  4ZXT A;  4J53 A;  4QYH A;  4RJ8 A;  5D41 A;  2G9X A;  2WTD A;  3FV8 A;  2R9S A;  4JAI A;  3KVX A;  1WBO A;  4O2Z A;  2I0V A;  2Y4I B;  2HIW A;  1GZK A;  3IW7 A;  3G0E A;  2C1B A;  4E6D A;  5AX3 A;  4CMT A;  4YMJ A;  2G1T A; 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