1WD3A

Crystal structure of arabinofuranosidase
Total Genus 154
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
154
sequence length
482
structure length
482
Chain Sequence
MGPCDIYEAGDTPCVAAHSTTRALYSSFSGALYQLQRGSDDTTTTISPLTAGGIADASAQDTFCANTTCLITIIYDQSGNGNHLTQAPPGGFDGPDTDGYDNLASAIGAPVTLNGQKAYGVFMSPGTGYRNNEATGTATGDEAEGMYAVLDGTHYNDACCFDYGNAETSSTDTGAGHMEAIYLGNSTTWGYGAGDGPWIMVDMENNLFSGADEGYNSGDPSISYRFVTAAVKGGADKWAIRGANAASGSLSTYYSGARPDYSGYNPMSKEGAIILGIGGDNSNGAQGTFYEGVMTSGYPSDDTENSVQENIVAAKYVVGSLVSGPSFTSGEVVSLRVTTPGYTTRYIAHTDTTVNTQVVDDDSSTTLKEEASWTVVTGLANSQCFSFESVDTPGSYIRHYNFELLLNANDGTKQFHEDATFCPQAALNGEGTSLRSWSYPTRYFRHYENVLYAASNGGVQTFDSKTSFNNDVSFEIETAFAS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Hydrolase
molecule keywords alpha-L-arabinofuranosidase B
publication title Crystal structure of a family 54 alpha-L-arabinofuranosidase reveals a novel carbohydrate-binding module that can bind arabinose
pubmed doi rcsb
source organism Aspergillus kawachii
total genus 154
structure length 482
sequence length 482
ec nomenclature ec 3.2.1.55: Non-reducing end alpha-L-arabinofuranosidase.
pdb deposition date 2004-05-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF05270 AbfB Alpha-L-arabinofuranosidase B (ABFB) domain
A PF09206 ArabFuran-catal Alpha-L-arabinofuranosidase B, catalytic
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 1wd3A01
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 1wd3A02
4LO3A 4QBCA 4I4YA 1JT4A 3H6RA 2DWRA 1MS9A 1IJTA 3BAOA 1ULGA 1V6XA 4Q8KA 5CAZA 3WINA 1DZQA 4X39A 1AF9A 3B9CA 3CAHA 3O4DA 1SBDA 3CA3A 1OQ1A 3WLUA 3ILFA 1W6OB 3IPVA 2Y9FA 2RHPA 2D43A 1V6VA 2WSUA 3T1LA 2DV9A 3SITA 3MPPG 2ZMNA 4FOWA 5B2HA 5EXOA 3FJDA 3MW3A 1CVSA 3AZZA 4FPFA 2ZQOA 1FWUA 3SISA 1QOTA 5DZEA 4GAFA 4RA0A 1ISYA 3CRGA 1Q04A 1G7YA 2EXIA 3ZVXA 1JLYA 5DUVA 4YM1A 3AP6A 2XOAA 3WDWA 1PC8B 1TWEA 4ZGRB 2VSAA 4YW5A 5GAQA 4J2KA 2EIGA 5BP5C 1AVAC 3OY8B 3AJ6A 5GZEA 3AP5A 4TYSA 3BRFA 2PHTA 1HWPB 5GJ6A 2A7AA 3BAUA 3OJVA 3FUOA 4I6IA 2WKKA 2Q9XA 2A6ZA 4II0A 2NP0A 2FHRA 3BADA 5FZUA 3ZPYA 2VUAA 5JOXA 3V79C 3ZSJA 4HL0A 2ZQNA 1YRZA 1FV3A 1SCRA 4A7KA 2RSTA 2BFHA 1WW4A 2NZ9A 5D61A 1W6MB 2DURA 1R8OA 1EPWA 5DG1A 3SH3A 2AR6A 4H55A 1MR5A 3P53A 3A22A 1AXYA 2DS0A 1W6QB 1WW5A 5FREA 2DUQA 3IAGC 5GZDA 2NMNA 2DREA 2L5XA 3ZXDA 4PBPA 5HCBA 4LO0C 4XTPA 4XXAA 5GZCA 1IKPA 5CA6A 5DXDA 5I1BA 2GNMA 4H04A 1APNA 4JQ0A 3NV2A 1BLDA 1I1BA 4WVVA 1ILR1 2GN3A 1UX6A 1IHKA 1F31A 1F9KA 1DHKB 2P39A 1DQ5A 1G86A 4ATFA 2ZGLA 2DVFA 1WD3A 31BIA 1HIBA 4ZOTA 1BYHA 2W39A 2ZGPA 1FX5A 4BLJA 3OYWB 1H9WA 4LBQD 3UK9A 2FFUA 2GMMA 1LULA 4M3CA 3RTIB 1IS5A 1Z78A 5BXTA 5H9QA 1M2TB 2Z49A 4USPA 4LBKA 3S8KA 1AX1A 1YTOA 1MS4A 2YY1A 3LCPA 4GA9A 3N35A 1VALA 1DQ4A 1C57A 4EKXB 1YI7A 2D7IA 1W6NA 1YIFA 2ZZJA 1AJOA 4OZXA 1AZDA 4XJWA 4EEEB 1WD4A 2GNTA 5CB7A 4A7YA 4GP0A 1JQZA 5LK5A 1L2HA 1C1LA 3ZC9A 5BP5A 2GN7A 3S8JA 1QU0A 3ZXKA 1GNHA 2D44A 4XXPA 3W59A 1QOOA 2A3YA 4X37A 5JVVA 1ENQA 2Z42A 1WBFA 3H0OA 2K43A 4LO7B 3F1RA 4JKQA 1LU1A 1V6WA 3USUA 4ITCA 4G1RA 1KQRA 2AUYA 2VXTI 1W6PA 1N3PA 3WHTA 2R1BA 3CQAA 4JKXB 1BFCA 1MD6A 1W3FA 3FJ9A 5BQUC 3VKOA 1A78A 1GV9A 2JKBA 3V0BB 4GAIA 1SBFA 4R9CA 3BAQA 1H30A 5EWSA 4GOYA 3APBA 4UW4A 2FMDA 1G9BA 8I1BA 1KJLA 5BXSA 4DRRA 1KRIA 2D3RA 3NV4A 3SH4A 2ZACA 3I8TA 5T5LA 1LOAA 3NJ5A 4LO0A 5IK8A 4EFPA 1HQWA 4TZDA 2TEPA 1AX2A 4YFZA 1KDKA 3O4BA 4BMBA 3M3EA 5DG2A 2KM2A 1MS8A 2F2FC 1S0BA 1RZOB 5H9RA 5JOZA 3GALA 1LHUA 3M3OA 2D6PA 4OEEA 3FJ8A 4Q9GA 5GLWA 4QO3A 1Q56A 2ZBJA 3BOPA 4XBNA 1ISWA 1FN0A 1FATA 3AXEA 3WMVA 1MVQA 4XJZA 1KDMA 4Q1PA 5EYXA 3O49A 4LO8B 4I96A 3AX4A 1QQKA 3QCWA 1IILA 1R8NA 1JHNA 1K5VA 4M01A 4Y20A 1JT5A 4FGFA 2JE9A 2ZHLA 5H9PA 9ILBA 4YG3A 4AVVA 2ZMKA 4ZA3B 2I2SA 1DFCA 2M49A 1ONKB 1PZ9A 1V00A 1AXKA 3CRHA 4Z9WB 1URXA 2Y9WC 1QMJA 2A6VA 1FAYA 3FFZA 2LIEA 1ULCA 3R4SA 4ISQA 4LO3C 3ZSKA 1OKQA 2I1BA 3DUIA 4PQ9A 5HPZA 3MW4A 3V65A 5EG6C 2WT2A 4P0JA 2P37A 3WG2A 1J1TA 1UZZA 2Q3NB 4OW4A 4YGDA 5BQUA 4I4UA 4CJMA 1HCDA 1UL9A 3GNEA 2WT0A 3OYWA 3HOMA 3L2YA 5CBLA 1IOBA 1IS6A 5F8SA 3OBRA 1LU2A 2LTNA 4YGEA 4Q27A 3AK0A 3WVJA 3AKIA 2WRYA 5JOYA 4XYXA 4BPZA 2DVDA 5F90A 2AAIB 1DFQA 4XFTA 1G82A 5DUWA 4ZXKA 4QD2B 4Y26A 2F2FA 2AENA 1Z0HA 3C2UA 2VY0A 4ZFUB 4XBLA 3Q9OA 4IQPA 3T1MA 2Y9XE 1JOJA 3KM5A 3AZVA 1LOEA 2WLQA 2W52A 1IRPA 1YBIA 4I8MA 1BASA 2NN8A 3HN1A 2CL2A 1BZWA 1DYPA 3FJKA 1O4ZA 1S0GA 2ZABA 4RL7A 3VT0A 4ASMB 4FPGA 4GXLA 4JPZA 1JT7A 1ZM1A 4NOTA 2C5DA 1A3KA 5BOWA 2K4AB 2QYIB 4EFRA 3WNXA 4R6UB 3HSMA 3AZYA 4DENA 1LGCA 2OVUA 4XBQA 1V6NA 2HZ9A 4P0KA 4HANA 3O3QA 4CZSA 3D6EA 3WDVA 1ZA4A 3WO4A 2ZGKA 4LBOA 2PHUA 3VT1A 1DBNA 2DTYA 2UU8A 2DRYA 2UWAA 3BTAA 4FP2A 4YGBA 3A21A 2SLIA 4LBLA 3EF2A 3M2MA 1IS3A 4LBJA 3D7WB 3CA1A 1HWMB 2YROA 4IHZA 4ZLBB 3AFKA 3IM0A 4JAWA 5FRAA 2GMEA 3QLQA 3POYA 5DSSB 2P23A 3IM7A 3WG1A 4HR6C 2P3JA 4JRAA 1SLTA 1Q8PA 3W58A 3I4IA 3JRRA 2D23A 3Q7YA 5D63A 4FPOB 2KH2A 4ISRA 3N7KA 2OW4A 4P14A 5KXCA 2WT1A 1DQ1A 5IUQA 4J2XA 2WNEA 2ARBA 4FOQA 1M16A 1IOAA 2GMPA 1SZ6B 4LO2C 1V6JA 3AP7A 2JE7A 3M1HA 1HWOB 4KEIA 2Y9GA 2EF6A 2V73A 4P9YA 1J0SA 1ENSA 1SACA 3O4AA 3FUQA 3BA7A 1Q8OA 1DQOA 3WDUA 1G9DA 2RQ9A 1JYIA 3PMEA 1MS0A 1S0IA 6I1BA 3PVNA 3R05A 1SLAA 3AH2A 2ZMLA 5DZGA 4P9XA 3OGGA 3O0WA 3B01A 2NTDA 1LOFC 5DUXA 1H9PA 1FYUA 2CTVA 3FJEA 1LEMA 3KMVA 1N47A 2FDBM 3CA6A 4I4VA 4I2SA 1G9FA 3PHZA 1UKGA 2ZGOA 3AKFA 4EFQA 1HWNB 1MS1A 2D22A 1CIWA 3ZXLA 4Y1VA 3O0VA 3WO2A 2DRZA 2VLCA 1BFBA 2R1DA 4D69A 5KXBA 3AP9A 4Y1UA 3N7LA 3ZYPA 2ZHMA 2JDZA 3ENRA 4Q9PA 2CWMA 4QKSA 3H6QA 3CA4A 5IK5A 4Q2FA 3WDYA 2A6XA 4LBQA 4YM3A 3PG0A 2CY6A 4XILA 3LLPA 3JUTA 1FWVA 1CESA 1GGPB 2EALA 4AN6A 3MALA 3TAYA 3WMUA 2ZKNA 1A8DA 2GALA 3V64A 4YM0A 4I4OA 1HLCA 4DCKC 3M3CA 1LCLA 2AFGA 2X2SA 3V0AB 1WLDA 4GKXA 1RMLA 1B09A 1GZWB 2VH9A 3UJ0A 4D0TA 4XJ9A 4P6AA 4FP3A 2H0BA 4WZFA 2A6YA 3WZ1A 2VSEA 2GDFA 4Y24A 1DGLA 2ZR1B 1UN1A 3WG3A 4XFSA 2ZGSA 1SLIA 4LO2A 1AVXB 1PUUB 3AZXA 4GWMA 2IWTB 3HALA 1UPSA 4USOA 2W68A 1C4RA 1D0HA 1JXNA 1WW6A 1NLSA 1AVBA 2PHFA 1I1EA 1YXWA 4Q26A 3B9UA 3LSDA 4C1WA 1LGBA 1MZ5A 1MS5A 2WJSA 4HJJA 1TTUA 4YZ5A 3SNVA 1O4YA 1LOFA 3H6SE 1WW7A 1I3HA 5JDBA 5T52A 3VT2A 1LENA 5KXEA 1DIWA 3AJZA 3ZSLA 1W6OA 1PZ8A 1CE7B 3WV6A 3VKNA 5F5QA 4BLIA 2D6OX 3POSA 3AXDA 4XDQA 3HMYA 4M00A 2YV8A 5GZFA 3ZSMA 4YW4A 1Q8SA 2AREA 2ERFA 5HCAA 2ZGUA 2P34A 1LHVA 5T5PA 1V6LA 1LOBA 1ISVA 1CN1A 3PJQA 4KEKA 3SLIA 4YG0A 4I4XA 5EYYA 4FPCA 2DVAA 1HKDA 3FJHA 4ZBVB 1CQ9A 3OY8A 1U0AA 1SLCA 1II4A 3BB2A 2D24A 1GANA 1KJRA 1JN2P 4ATEA 5L73A 1N4KA 2CNAA 4F34A 1DQ2A 3UD8A 5T5OA 1GBGA 4LO7C 1ENRA 4ZFYB 3BAVA 3A23A 4QKRA 3H6RB 2Z48A 3MEPA 1MVEA 2D7FA 3PUBA 1N3OA 2FO1A 4FPJA 4G6MA 1GZCA 2R0FA 1HDKA 1DJSB 3UJ4A 4AWDA 1RG8A 4YOLA 1S0CA 4XHBA 2KI6B 3BAGA 1AVWB 1Q8VA 4G6JA 4XIKA 1W6MA 3OBTA 4I7IA 4LBNA 1QDOA 1N3QA 1ULDA 5FZYA 2DVBA 1TIEA 4PC4A 1W6QA 1FGAA 1P63A 4LBMA 4I4SA 4FOYA 3ZXEA 4XMIA 1S0DA 3FJIA 2NM1A 1S0JA 2DUPA 3B3QE 3WDTA 1EV2A 3AH4A 1R1ZA 5IT6A 1VLNA 3AYDA 1TFMB 3T8SA 1FNYA 3AYAA 1QNWA 1WLWA 2VW0A 1ISXA 4OWLA 3RS6A 2UWCA 3FGMA 4H9WA 3BA5A 3MW2A 3O12A 3D5OA 3FLTA 1PUMB 2D6MA 2A3XA 2D3SA 2VW1A 4UW6A 5DZUA 2JJ6A 4XKIA 4XZPA 1LGNA 2SBAA 3CRIA 2DU1A 4FVVA 1GZWA 4R9DA 4K1YA 1MS3A 3BRDA 3O5WB 3VUOA 4YW2A 2VU9A 2LIQA 2RG9B 1DYKA 5EHAA 1VAVA 3I29B 4XJ8A 2YMZA 4I1EA 4AGVA 5H9SA 4Y1XA 3ILRA 1XQNA 3O4CA 2DYCA 4CRQA 2ZAAA 1LHOA 1LTEA 3PVOA 1G9AA 3JU9A 4M3CF 4W65A 1JW6A 1XHBA 4LO1C 2QN4A 5D62A 1LOGA 2GNDA 2PHWA 3HR9A 2A71A 1UAIA 2G4IA 5T55A 3POKA 1QXMA 3OJ2A 3FJBA 1S1AA 2P2KA 7I1BA 4FPEA 5AVAA 4XJAA 3RMYA 1DZDA 5FZZA 3ZC8A 4ENDA 3VKLA 4I4PA 3A0KA 1LOCA 2UWBA 3LSEA 1G9CA 2HW9A 5BXRA 4D8HA 1F5FA 2JECA 5E88A 3V0BA 4YLZA 4IZXA 4OUJA 3AZWA 4U2AA 1BARA 3ZX7A 2AH2A 1MACA 2YZ4A 3IN9A 4WV8A 3NBCA 1T9FA 3NBEA 3BAHA 4L8QA 3NV1A 1SCSA 1LODA 3TB0A 3O0XA 2VW2A 3BIWE 2R0HA 4YZ2A 3LTQA 4Q8LA 3CU1B 4Y1ZA 1RINA 2V5YA 1W6NB 1WCSA 5CNAA 3WUDA 3NBNA 2WBCA 5FNWA 2E53A 5F8YA 2E7QA 3PVEA 4GP3A 4QD2C 2DUOA 2NVHA 4AVSA 3O5SA 1T4QA 3I2AA 2WQZC 2EXJA 4ZFWB 1IRAX 5DUUA 1QQLA 2UUSA 3VWCA 3RTJB 4J23B 1LEDA 2CWSA 2ZGMA 4BOWA 4KEJA 2AXMA 4K1ZA 2D20A 4KC3A 4R9BA 1XG6A 4QALA 4OEFA 1FMZA 5GLZA 3USUB 1N1TA 1JYCA 1W6PB 4U36A 1TOOA 3O4OA 1WBCA 1SLBA 3D4KA 1TWMA 1UMZA 2DVGA 3UL2A 1Q8QA 4Q91A 2ENRA 2OUHA 2P3IA 4YW3A 2YXSA 2D7RA 2MLLB 5KXDA 1Z2VA 3N36A 2A75A 4D0ZA 1IKQA 1Y7BA 4C1XA 1MC9A 4P9WA 2MC2A 5F9TA 3IMNA 2ES3A 1VCLA 5FNXA 1CVNA 4I37A 1S0FA 4Q1RA 1JT3A 4YFWA 3E8LC 4LO1A 2ZHNA 2HWAA 4YGCA 2EAKA 4IONA 1EVTA 2D6LX 1D2SA 1ULFA 4L4HA 3VEQA 4JCKA 1SBEA 4M3CE 4PCRA 4K21A 4F83A 3I2XA 1BQPA 1BLAA 3WCRA 4AVTA 1W3AA 1W3GA 1JY0A 1YF8B 1QDCA 5E89A 1AX0A 3RSJA 2UURA 4I0YA 1SR4C 1IT0A 1DZCA 4SLIA 1ONAA 2BEAA 1BFFA 5DZFA 2EXHA 3A4UA 1CONA 4K20A 4Y20B 2LALA 3AYCA 3FLRA 1JTCA 1YO8A 1N1YA 1G8WA 1Q1UA 2WSVA 2A70A 1XYFA 4YG6A 1S0EA 3FBYA 3WG4A 1OQLB 2R9KB 4JC1A 1DQGA 2PHXA 4JP0A 1OFSA 1ISZA 3UJQA 4OWKA 1KITA 5T5JA 2DTWA 4I4RA 3RG0A 2YUGA 4BQ1A 2D6KA 4I4QA 4XFUA 1V6IA 4OWJA 4X3AA 2ZGTA 3QYDA 3N0KA 1NUNA 2MIBA 2A6WA 5GLUA 4X38A 3OJMA 3Q7XA 3NV3A 2A5ZA 1RITA 2X2TA 3WUCA 3AKGA 2D3PA 1PZ7A 2ERMA 5IK7A 4YZ3A 4ZKTB 1AXZA 1LECA 1AXMA 2KKIA 1DQ6A 3DGTA 4UW3A 2ESUA 3P6IA 1K5UA 4Y22B 1LJ7A 5GLVA 3AP4A 3WO3A 1DLLA 4IY8A 4IZEA 3NBDA 4WBCA 5EC5A 3ZXJA 3FJCA 4TLPA 1BFGA 1NXD1 1N1SA 1GSLA 3VSZA 1C1FA 3WDXA 1FNZA 1QOSA 3WOGA 4GOVA 1YYNA 4WVWA 1JBCA 1AVUA 1WBAA 4IY9A 3AH1A 3SH5A 1BXHA 2ZGNA 3N3HA 2HWMA 4QBVA 2F8XC 5IK4A 4A7ZA 2AQZA 2E51A 3POWA 3AKHA 1BKZA 3RRDA 1N1VA 4UW5A 4Z8SB 3AYEA 3AJ5A 2PELA 1SR4A 2EXKA 3BA4A 5HCFA 4AGRA 4IYBA 3WHUA 2K8RA 3UD9A 3ZYRA 3QR5A 4BMEA 4DPNA 4L4IA 1TEIA 3FJAA 1ULEA 4Y1YA 2KLLA 4I3NA 2ARXA 4G9MA 4PBOA 4HA2A 4AN7B 2BQPA 4BM8A 1E0OA 5G00A 2JD4A 1PWAA 3ILAA 3SNMA 2FFVA 1V6OA 3WA1A 3R4UA 3W9TA 1AJKA 4AYUA 2XB6C 3UD7A 1WBLA 3RQ0A 1GZ9A 3VV1A 1W0OA 4FOVA 1GLHA 3Q7WA 4NO4A 3TC2A 3IM6A 1CPMA 1NZKA 1CR7A 1SLLA 3HBWA 1W0PA 2A3WA 2KI4A 1QNYA 4DEPA 3BRGC 1VAMA 2GNBA 3OGFA 2AGSA 2B7YA 1Q03A 1LESA 4FPYA 3NWKA 1RIRA 2ZHKA 4DS0A 1RY7A 3UJOA 3ZXGA 3IM5A 2Q5TA 2VXRA 41BIA 3IPVB 3IIRA 5T54A 2W08A 4YZ1A 3P6JA 4J2YA 1BJQA 3C9ZA 2XG3A 1X50A 3BODA 3CA5A 1LHWA 3U4XA 2R16A 2E4MC 2R49A 1DQ0A 3ASIA 5F8WA 1UZYA 2GO2A 4MYEA 4KBBA 1V6KA 4I30A 3A0NA 3O44A 1FV2A 3OPZA 1CJPA 2NYYA 4AGGA 3JUUA 2GZBA 1VIWB 2D6NA 2E7TA 1MZ6A 3IKWA 1AFCA 1PZZA 3B00A 5GLTA 1GNZA 1GICA 4PF5A 3K1XA 5SV8A 2HYKA 3FJJA 1XZZA 3VSFA 2IHOA 1CPNA 1JLXA 3V0AA 3KQRA 4FPLA 1ITBA 3UDAA 2D1ZA 3WINC 2BEBA 3CNAA 5T50A 4XJUA 3N7JA 4FPHA 3ATGA 1TP0A 3CA0A 1HQLA 4FQ4A 4XOGA 5E8AA 1WUVA 2PHRA 2AYHA 1Z4SA 5E24E 4Y22A 4YZ4A 4CTEA 4XIOA 3FJFA 1V6UA 1LHNA 5JLVA 2J3PA 4GALA 3WCSA 2E6VA 3VKMA 1ABRB 3BX1C 1GYKA 5DUYA 4XE9A 4DRVA 1JUIA 4DFSA 4OEGA 1S0LA 5JMCA 1IS4A 5GALA 5BYNA 3F62B 1SFYA 3AJYA 1QF3A 4FQZA 2NMOA 4I1BA 3OJBA 5BVPI 3B69A 4LBQB 2P3KA 1BA7A 1WLCA 4GWNA 4XHXA 1FQ9A 4XTMA 1HCEA 4G9NA 3INAA 1QKQA 3M3QA 1V6MA 4R9AA 2ET2A 4DQAA 5GM0A 2CYFA 2DU0A 4J2SA 3VKFC 1KNMA 2C9AA 2ZGQA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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