The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
7
|
sequence length |
68
|
structure length |
68
|
Chain Sequence |
GSSGSSGRRCQVAFSYLPQNDDELELKVGDIIEVVGEVEEGWWEGVLNGKTGMFPSNFIKELSGPSSG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Solution structure of the SH3 domain of SH3-domain kinase binding protein 1
rcsb |
| molecule tags |
Protein binding
|
| source organism |
Mus musculus
|
| molecule keywords |
SH3-domain kinase binding protein 1
|
| total genus |
7
|
| structure length |
68
|
| sequence length |
68
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2004-05-28 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF14604 | SH3_9 | Variant SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2AKK A; 5I22 A; 4JJB A; 2KXC A; 2F2X A; 4DEY A; 1SSH A; 2CSQ A; 2D8H A; 1SRM A; 1UHF A; 2EGC A; 2JMC A; 2YUO A; 5I11 A; 1V1C A; 1CKB A; 1H92 A; 1AWW A; 1PNJ A; 4J9D A; 3TVT A; 1VYU A; 2DYB A; 3I5S A; 4GLM A; 1VYV A; 2ESW A; 2HBW A; 4OMO A; 2BZY A; 1U06 A; 2LJ1 A; 2LCS A; 1B07 A; 3M0S A; 2FRW A; 1BK2 A; 2HEQ A; 2JTE A; 3R6N A; 3H0H A; 1SPK A; 1WI7 A; 1UUE A; 2KYM A; 3NPF A; 1FMK A; 1T3S A; 1AWJ A; 5FWC A; 1GFD A; 1OV3 A; 1ZLM A; 2C0T A; 2EYZ A; 1FYN A; 3UF4 A; 1M8M A; 1SHG A; 1X69 A; 1TG0 A; 2EYW A; 2EW3 A; 2W10 A; 2DJQ A; 2DL8 A; 1YCS B; 1PHT A; 2CH4 A; 1QKX A; 4HXJ A; 2RQR A; 4ZNX A; 2KRS A; 3PVL A; 2XMF A; 1K76 A; 1YNZ A; 1T0H A; 1I1J A; 3SHW A; 2FEI A; 4LN2 A; 2LZ6 B; 1ZX6 A; 2YUN A; 2ROL A; 1X2Q A; 5HCK A; 1W1F A; 4F17 A; 5ECA A; 1QWF A; 4M4Z A; 1OPK A; 2KRN A; 5IXB A; 1E6G A; 1M3C A; 2DMO A; 4EIK A; 2L0A A; 1G2B A; 1UEC A; 3ZL7 C; 2F2W A; 4E6R A; 1VYT A; 2GTJ A; 1AEY A; 2OJ2 A; 2K6D A; 2J6O A; 1G83 A; 4Z89 A; 4OML A; 3M0T A; 1WXU A; 3A98 A; 4F16 A; 1BB9 A; 3RBB B; 4Z8A A; 2BTT A; 1TUC A; 1ZUK A; 2C0O A; 2YUQ A; 4J9C A; 3NGP A; 4HVU A; 3H0F A; 1JXM A; 2ECZ A; 2NWM A; 1OPL A; 1YWO A; 2DL5 A; 2K2M A; 2YT6 A; 2KGT A; 2NUZ A; 4CC3 A; 4LUE A; 3VRY A; 2AZS A; 4R0K A; 1J3T A; 2RMO A; 2EGE A; 1X2K A; 2CT4 A; 1EFN A; 1I0C A; 2DE0 X; 2L2P A; 2D0N A; 3JV3 A; 2A36 A; 3QWX X; 4AFU C; 2DL4 A; 4DEX A; 2FO0 A; 3IQL A; 2FPE A; 2ENM A; 3VS3 A; 1JU5 C; 1X27 A; 1K9A A; 3GBQ A; 1QWE A; 2E5K A; 1BBZ A; 2RQW A; 1PWT A; 1UGV A; 3I5R A; 1M30 A; 4J9H A; 1M3B A; 2HSP A; 2G6F X; 3LH5 A; 2L3P A; 2LX7 A; 2DIL A; 5IHI A; 4OMN A; 1W70 A; 1AD5 A; 1ABO A; 1U5S A; 5GJV B; 1YP5 A; 2EYX A; 2SEM A; 1JXO A; 2VWF A; 4JJC A; 1NM7 A; 1T0J A; 3RNJ A; 2KNB B; 2DBK A; 1X6B A; 1K0S A; 2EVR A; 2FRY A; 1GRI A; 4RTU A; 4IIM A; 2RNA A; 4HVW A; 2LJ3 A; 2AK5 A; 2KEA A; 2V1Q A; 3THK A; 3REA B; 3EHR A; 1NYG A; 3EHQ A; 2DL7 A; 2M0Y A; 1CSK A; 3I9Q A; 2BZX A; 3M0U A; 1GFC A; 5IXF A; 2CSI A; 2GQI A; 1UJ0 A; 2FG0 A; 3REB B; 1AWX A; 1NEB A; 4GBQ A; 4J9B A; 1Z9Q A; 2ED1 A; 2P4R A; 2K79 A; 2KYB A; 1PRM C; 2D8J A; 2DBM A; 2YUP A; 2LQW A; 2JS0 A; 1X43 A; 3C0C A; 1Y0M A; 4CC7 A; 1CKA A; 1OOT A; 3TSW A; 1AZE A; 1QCF A; 1H8K A; 2A28 A; 2I0N A; 2VKN A; 1WFW A; 3U23 A; 1WXT A; 3NMZ C; 1ZUY A; 2MOX A; 4IIO A; 2KE9 A; 4RUG A; 1UFF A; 2DL3 A; 1SEM A; 4KRT A; 2H8H A; 2K7A A; 2JW4 A; 2CUB A; 2KT8 A; 3VS1 A; 1MV3 A; 1SHF A; 2A08 A; 1LCK A; 2GTO A; 2SRC A; 2X3W D; 1WA7 A; 1WXB A; 2DVJ A; 2GNC A; 1K1Z A; 2GBQ A; 4D8K A; 5IHK A; 2DF6 A; 4RTX A; 1N5Z A; 4LE9 A; 2EKH A; 2MIO A; 2IIM A; 2A37 A; 4RTT A; 2LJ0 A; 3VS2 A; 4LNP A; 1YWP A; 2GGR A; 2J6K A; 1MUZ A; 3UA6 A; 2KXD A; 2EQI A; 3PE0 A; 5EC7 A; 1NLO C; 1QLY A; 2RF0 A; 1OEB A; 2EYY A; 1HSQ A; 1ABQ A; 2RN8 A; 4CC4 B; 1NLP C; 1NG2 A; 2CH4 W; 1NYF A; 1ZSG A; 2DA9 A; 4J9F A; 1W6X A; 1Z9Z A; 2PNI A; 4JZ3 A; 2RPN A; 4OMP A; 4OMQ A; 2AZV A; 3SEM A; 2OAW A; 2L3S A; 1GCQ A; 2K3B A; 4J9G A; 3UAT A; 1WLP B; 4F14 A; 2FPD A; 4K11 A; 1H3H A; 1IO6 A; 1E7O A; 3I35 A; 3KFV A; 2YDL A; 1E6H A; 4AFQ C; 2ABL A; 2LMJ A; 3FJ5 A; 3VS5 A; 1T3L A; 1I07 A; 1A0N B; 2DM1 A; 2EBP A; 2OI3 A; 1KJW A; 5FWB A; 5IH2 A; 4J9E A; 4QT7 A; 2EPD A; 3EG0 A; 1UTI A; 2JXB A; 3PVQ A; 4HVV A; 1ARK A; 2O2O A; 4RTW A; 1WYX A; 2AKL A; 2RQT A; 2LP5 A; 3EG1 A; 2QDL A; 1PKT A; 2RQU A; 1HD3 A; 1AWO A; 1K4U S; 1MV0 B; 2VVK A; 4AFS C; 4AFZ C; 1M3A A; 3M0R A; 2JT4 A; 3NHN A; 4CC2 A; 3M0P A; 1ZUU A; 4Z88 A; 5IHN A; 3H0I A; 1RLP C; 2KRM A; 2L3Q A; 1GL5 A; 4JJD A; 4LUD A; 1ZBJ A; 2HCK A; 2O31 A; 1UE9 A; 2J7I A; 4JPB W; 2J05 A; 2JS2 A; 2V1R A; 4ORZ A; 4RTV A; 1GCP A; 1UHC A; 1KFZ A; 1SRL A; 2O9S A; 4RTY A; 1TUD A; 2LNH B; 2K9G A; 2PTK A; 1AZG B; 2CDT A; 2KBT A; 1AOJ A; 3EG2 A; 4X1V A; 2PZ1 A; 2DX1 A; 2KRO A; 2DRM A; 1U3O A; 3ULR B; 2FPF A; 2DRK A; 1PKS A; 2ED0 A; 2B86 A; 1M27 C; 1QKW A; 2BZ8 A; 4WCI A; 1WX6 A; 4A63 B; 4RTZ A; 1B3Q A; 1NEG A; 5GJW B; 4JZ4 A; 1KSW A; 2HDA A; 2J6F A; 1PRL C; 1JEG A; 4FSS A; 1GCQ C; 4AG2 C; 1YN8 A; 5L23 A; 2F2V A; 3VRZ A; 1WIE A; 4HCK A; 3VS0 A; 2O88 A; 1RUW A; 1BU1 A; 1XOV A; 2DLP A; 2C0I A; 3EG3 A; 1UG1 A; 1KIK A; 2ROT A; 3H41 A; 4OMM A; 5FW9 A; 1RLQ C; 2EGA A; 2D1X A; 1UDL A; 2X3X D; 3VS4 A; 3O5Z A; 4ESR A; 2W0Z A; 3VS6 A; 2O9V A; 1S1N A; 1JQQ A; 1WDX A; 1GBQ A; 2RQV A; 1X6G A; 2J06 A; 2CT3 A; 3UA7 A; 1GBR A; 2JMA A; 1AVZ C; 3VS7 A; 2CRE A; 2LQN A; 4J9I A; 3CQT A; 2KT1 A; 1JO8 A; 1VA7 A; 2DNU A; 2KR3 A; 2YSQ A; 2MCN A; 2JM8 A; 1RI9 A; 1Y57 A; 4Y92 A; 1UJY A; 3EGU A; 4D8D A; 4AG1 C; 3TSZ A; 3QWY A; 3M0Q A; 2M51 A; 1K0X A; 2CUD A; 2JM9 A; 1HJD A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3FLG A; 4JJB A; 2KXC A; 2F2X A; 4PFZ A; 1SSH A; 2DXU A; 1KD1 R; 2HL5 C; 5I11 A; 4O5V A; 3UDC A; 1ZSZ A; 1PNJ A; 4KUL A; 4J9D A; 1VYU A; 1VYV A; 1PSE A; 3M57 A; 1BI2 A; 3MEA A; 4RMO A; 2E6N A; 2HEQ A; 3OYL A; 1SPK A; 4QVD A; 1UUE A; 1FMK A; 2RK1 A; 3CCL A; 1OV3 A; 2RA2 A; 1YIT Q; 5LJ5 e; 3L2Q A; 2EYZ A; 4A54 A; 7AT1 B; 1YHQ Q; 4GLK A; 4PJN A; 3QYH B; 1YCS B; 1PHT A; 2CP5 A; 3HL8 A; 3X28 B; 2RQR A; 2QGG A; 1FMV A; 5DLQ E; 3GP8 A; 3BDU A; 4M77 A; 2XMF A; 1MMD A; 2FYK A; 5GAM f; 3QDR B; 2LZ6 B; 4M7A E; 2ROL A; 3OA6 A; 3MP1 A; 2XD0 A; 1M3C A; 1KD1 C; 2DMO A; 4E7H A; 4WTO B; 2L0A A; 5KYU B; 3RMQ A; 5A0G A; 3ZBD A; 4E6R A; 1TOV A; 2K6D A; 2QA4 Q; 3CPW P; 3M0T A; 4F16 A; 1BB9 A; 3FEO A; 3INZ A; 5KYY A; 4X34 A; 1R0C B; 4Z8A A; 3J7A F; 1VQP T; 1M2V A; 1W4S A; 3VYG A; 4MDX A; 1D0X A; 2YUQ A; 3V7C A; 1IHV A; 1TU0 B; 3G71 T; 1I5O B; 3SD4 A; 1OPL A; 1YWO A; 2DL5 A; 2YHT A; 1G3Y A; 1LOJ A; 4QQ6 A; 2AZS A; 2ZPF B; 2WSF E; 3L2U A; 2RMO A; 3MHX A; 2CT4 A; 2KK4 A; 4C8Q G; 1YJN T; 2L2P A; 2D0N A; 4XTU A; 5LJ3 g; 2NUP A; 2KMT A; 3JV3 A; 4LDV A; 3E19 A; 2DL4 A; 2FO0 A; 3LLR A; 2RI5 A; 2ENM A; 1YJW A; 3RR6 A; 2L89 A; 3EH2 A; 2RQW A; 3J81 E; 1FWZ A; 1VQ5 A; 2HSP A; 2G6F X; 3LH5 A; 5C0M A; 2L3P A; 2KQW A; 1ACM B; 2O4X A; 2P4T A; 1YIJ A; 2DAQ A; 2E65 A; 4C0F A; 1AD5 A; 4DBR A; 1JJ2 A; 3M4Y A; 5DM7 R; 1YP5 A; 3S3O A; 1VQK A; 3CCR T; 2FZK B; 2DFU A; 4JJC A; 3RNJ A; 4QQG A; 5GAO n; 4M77 C; 4M7A A; 4YTL A; 4EDU A; 9ATC B; 3OYD A; 3GNF B; 1ZSZ B; 2HMA A; 3CCU T; 3T9N A; 2KEA A; 3THK A; 2DD4 A; 3REA B; 4Y91 A; 4A4H A; 4JS4 A; 3I56 Q; 1UGP B; 2M0Y A; 3L1A A; 5CKB A; 3JB9 J; 5GMK h; 1D3B A; 3SWN B; 2BZX A; 4DBF A; 2VXF A; 4IKF A; 1EX4 A; 2P0Q A; 1V29 B; 1D0Y A; 2DBM A; 3HRT A; 2E5Q A; 2LCC A; 4N4I A; 2K4Y A; 3A8M B; 3C0C A; 2EIF A; 4MZT A; 4CC7 A; 2OTJ T; 3FB9 A; 2HQE A; 3ASK A; 2QK0 A; 3RDV A; 3CCM A; 2ZAE A; 2VKN A; 1BKB A; 2XIC A; 1WFW A; 1ZUY A; 3CCL Q; 2MOX A; 2QAS A; 4IIO A; 1VQ9 T; 1UFF A; 5GAN d; 2XDP A; 2KT8 A; 3CC2 T; 3V7S A; 4J8O A; 2DIQ A; 4FSX A; 1SKU B; 2EJF A; 2X3W D; 1WA7 A; 3QJ6 A; 2DVJ A; 3QBY A; 1BI3 A; 5GAM d; 2GNC A; 2E12 A; 2GBQ A; 3HKS A; 3H8Z A; 4D8K A; 5KYY B; 1VQN A; 1VQL A; 2VGM A; 4BB7 A; 1QW1 A; 4RTX A; 2IPO B; 1I8F A; 1QVG P; 2CZ6 B; 2EKH A; 4XK8 E; 1QVP A; 3VKI A; 3VS2 A; 3CMA A; 4J7F A; 4C92 E; 2J6K A; 2EKO A; 1MMN A; 4M75 C; 3UA6 A; 3I55 A; 3G71 A; 2XK0 A; 5EC7 A; 2OTL A; 1NLO C; 1QLY A; 4M77 D; 3QDF A; 4IUT A; 2EYY A; 5GMK e; 2RN8 A; 2CH4 W; 2NUP B; 1QCO A; 1ZSG A; 2DA9 A; 2EFI A; 1Z9Z A; 3ER0 A; 3A8L B; 1N9R A; 2OAW A; 2L3S A; 1IRX A; 4C8Q F; 4D6W A; 2OAU A; 4KUD K; 4E7Z A; 1WJS A; 2O4X B; 1E6H A; 3L42 A; 4PJO G; 4AFQ C; 2COY A; 1YIT T; 3L2V A; 4PJL A; 4DBH A; 2DET A; 2DM1 A; 2EBP A; 2OI3 A; 1YHQ T; 4J9E A; 2EPD A; 4HVV A; 1ARK A; 5LJ3 h; 4M7A B; 4RTW A; 2A3L A; 2RQT A; 4FL6 A; 1N8R R; 1VQ5 Q; 1PKT A; 1K4U S; 1AWO A; 1MV0 B; 2XI9 A; 5HKC A; 1YIJ Q; 2NLU A; 3CEY A; 2A7Y A; 2AHJ B; 1ZUU A; 4OGC A; 1TWB A; 1UGQ B; 4A4K A; 2VAS A; 5IHN A; 2QDY B; 4QVC A; 5GMK m; 3P8D A; 3HRU A; 2HSE B; 2O31 A; 2HKQ B; 1OYX A; 4C0D B; 1C1A A; 3JB9 G; 5CKF A; 4BD3 A; 3OSV A; 3J80 E; 1KQS A; 1O75 A; 1SRL A; 1TUD A; 4BDZ A; 2K9G A; 2O01 E; 4C92 A; 4KH1 B; 4FIB A; 4BI4 A; 3EG2 A; 3GF5 A; 3ULR B; 4PJJ A; 2FPF A; 2OTJ A; 1QKW A; 3M53 A; 4OB0 B; 4WCI A; 1YI2 T; 1LNX A; 3OYI A; 1M8V A; 4J83 A; 1G8X A; 4M7A D; 2RI3 A; 1MHN A; 1Q95 G; 1QVF A; 1PCX A; 3CXC S; 5LJ5 j; 1VQ9 A; 1C6V X; 1H3Z A; 1AT1 B; 4FSS A; 1N8R C; 3CC2 A; 4AG2 C; 5L23 A; 4KT0 E; 3ME9 A; 1VQ7 T; 3CCM Q; 2O88 A; 4EMG A; 1WPY A; 1RUW A; 3CPW S; 1WNL A; 2C0I A; 1FMW A; 5LJ3 e; 3EG3 A; 4L6V 5; 1WJR A; 2M0O A; 3VS4 A; 4A4E A; 3JCM X; 4ESR A; 2QI2 A; 4N0A A; 2ZPG B; 2O9V A; 1N8R U; 4PK4 A; 1GBQ A; 1X6G A; 2J06 A; 2CT3 A; 1GBR A; 2JMA A; 1AVZ C; 4L59 A; 1RAE B; 2JZ2 A; 1VQN Q; 1VQL Q; 3RER A; 2VB6 A; 5I21 A; 1G5V A; 2LCL A; 4KGZ B; 3I56 T; 2DNU A; 4XTW A; 2YSQ A; 4LXC A; 2D0Q B; 3CMA Q; 1RI9 A; 2BE9 B; 2VV5 A; 2EYQ A; 3I55 Q; 3G71 Q; 1VOM A; 2NYS A; 5KCH A; 2X9H A; 2OTL Q; 2JVV A; 1NZ9 A; 3M0Q A; 2M51 A; 2QQS A; 1HJD A; 3BW1 A; 2DZ9 A; 4PJO F; 4C8Q C; 2E4H A; 2CSQ A; 4CI0 C; 1RAC B; 3CCV A; 1XTD A; 1V1C A; 1VQO A; 3TRE A; 2F69 A; 3TVT A; 2HBW A; 2BZY A; 5CAI A; 1U06 A; 2LJ1 A; 1B07 A; 2IVW A; 4CRI A; 4LD6 A; 2JTE A; 3NPF A; 1LVK A; 2MF2 A; 2RI2 A; 2R57 A; 3Q1J A; 1GFD A; 3JB9 H; 2C0T A; 2ZPI B; 1JRI A; 1FYN A; 3UF4 A; 1M8M A; 1TG0 A; 5A0L A; 1RAF B; 2DL8 A; 2MWP A; 4PLI A; 1F1B B; 4JRQ A; 4C92 B; 1UGS B; 4XTV A; 4ZNX A; 1M5Q 1; 2KRS A; 3JB9 F; 4KUI A; 4PFP A; 1K76 A; 1YNZ A; 3SHW A; 3VJP A; 2FEI A; 1BIA A; 4HCZ A; 1JJ2 P; 4N0A C; 3CCS A; 1K9M R; 4M75 G; 4DBQ A; 1QWF A; 3M59 A; 2LX9 A; 1E6G A; 4EIK A; 2DEQ A; 1VQ6 A; 1G2B A; 3ZL7 C; 1VUB A; 1AEY A; 2OJ2 A; 3LGF A; 1GXI E; 2OTJ Q; 3URG A; 4BE1 A; 3MP6 A; 4J9C A; 3JCM e; 4HVU A; 4M77 E; 1QVG S; 1BIB A; 5EG2 A; 4M7D G; 1JXM A; 2QG9 B; 2YT6 A; 4E47 A; 1VQ9 Q; 4C92 D; 3CC2 Q; 1YJW T; 2EGE A; 4UC4 A; 1EFN A; 4XTZ A; 4JLI A; 2DE0 X; 1JB0 E; 5J3B A; 1B34 B; 4DQ2 A; 2A36 A; 3CCJ A; 1YIJ T; 5FRM A; 2JUF A; 3GBQ A; 1QWE A; 4ZGJ B; 1PWT A; 5LL6 S; 3RKW A; 1K9M C; 4JUV A; 4JRI A; 1VQK T; 2XHC A; 3EH1 A; 2DIL A; 1B7T A; 2QYZ A; 2YLB A; 3A8O B; 4OMN A; 3HSB A; 3X26 B; 1D1A A; 4E7I A; 1U5S A; 3D7S B; 5GJV B; 2QXF A; 3LX7 A; 5KCO A; 1KQ1 A; 5GMK j; 1TXQ A; 1T0J A; 2KNB B; 2DBK A; 1X6B A; 4F7U G; 1GRI A; 4HCC A; 5D7U A; 2RNA A; 1FXX A; 3UT1 A; 3MP8 A; 1K8A U; 3OYJ A; 4HVW A; 2V1Q A; 1PC0 A; 3PMI A; 5GAO q; 1TH7 A; 5I2M A; 1NYG A; 2BKD N; 4V2S A; 2DL7 A; 4OMF B; 4PJO C; 5HK3 A; 3M4G A; 4F04 B; 3M0U A; 3OMC A; 5IXF A; 1SSF A; 2CSI A; 5KYX A; 1UJ0 A; 3REB B; 3CCV Q; 2NUT B; 3AHU A; 1YBY A; 4B9W A; 1NEB A; 2DPP B; 2X4X A; 2Y4Y A; 3HTR A; 5GAN f; 2P4R A; 3CCM T; 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