The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
7
|
sequence length |
68
|
structure length |
68
|
Chain Sequence |
b'GSSGSSGRRCQVAFSYLPQNDDELELKVGDIIEVVGEVEEGWWEGVLNGKTGMFPSNFIKELSGPSSG'
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Solution structure of the SH3 domain of SH3-domain kinase binding protein 1
rcsb |
| molecule keywords |
SH3-domain kinase binding protein 1
|
| source organism |
Mus musculus
|
| molecule tags |
Protein binding
|
| total genus |
7
|
| structure length |
68
|
| sequence length |
68
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2004-05-28 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF14604 | SH3_9 | Variant SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3TSZ A; 1K76 A; 1M8M A; 3M0Q A; 1EFN A; 1MV0 B; 1MUZ A; 1PKS A; 5FWB A; 2FRY A; 2JM9 A; 3U23 A; 1MV3 A; 1KJW A; 1VYU A; 4HVU A; 3H41 A; 2YUO A; 1Y57 A; 2A36 A; 2D8H A; 4AFZ C; 1UG1 A; 1LCK A; 1M27 C; 3I5S A; 2MOX A; 1UJY A; 2KXC A; 2X3X D; 2RN8 A; 3QWY A; 3I35 A; 4ZNX A; 2YUN A; 1B3Q A; 2CH4 A; 2DA9 A; 1T3L A; 1NLO C; 2D8J A; 2D0N A; 2JS2 A; 2ROT A; 1AVZ C; 1E6G A; 4JJD A; 1SHF A; 2DL8 A; 3UA7 A; 2ESW A; 1FYN A; 1G83 A; 4LUD A; 1K0X A; 2KT8 A; 2EGE A; 1ZUY A; 3EG2 A; 4AFQ C; 1CKB A; 1VA7 A; 1UJ0 A; 1B07 A; 1GCP A; 1QKW A; 2K6D A; 1CSK A; 4F16 A; 3A98 A; 3RBB B; 5IH2 A; 2FO0 A; 5IHK A; 3PVL A; 2L2P A; 3NHN A; 1ABO A; 1PNJ A; 2J7I A; 2L3Q A; 2J6O A; 3THK A; 2O9S A; 5IHI A; 2DLP A; 2DM1 A; 3JV3 A; 5GJW B; 4J9E A; 2GQI A; 1HSQ A; 4JJC A; 1GFC A; 4JPB W; 1TUC A; 1AWJ A; 2NWM A; 2HEQ A; 1HJD A; 2RPN A; 2FEI A; 4AFS C; 4HVW A; 1E7O A; 3EG1 A; 2DF6 A; 1OPK A; 1QKX A; 2W0Z A; 4Y92 A; 4RTY A; 3VS0 A; 2HBW A; 1GRI A; 1X69 A; 2SRC A; 4IIM A; 4J9H A; 1WXB A; 1SSH A; 4LUE A; 4R0K A; 2H8H A; 1IO6 A; 3VRY A; 2X3W D; 1GCQ A; 4LN2 A; 1K4U S; 2ABL A; 2KRS A; 1W6X A; 2AKK A; 4WCI A; 1FMK A; 1T0J A; 1U06 A; 1SHG A; 2YSQ A; 4CC3 A; 1KFZ A; 1X2K A; 3EGU A; 2JW4 A; 1M3C A; 2ENM A; 1T0H A; 1ABQ A; 2NUZ A; 2KXD A; 1I1J A; 2V1Q A; 1AD5 A; 1WYX A; 3REA B; 2DX1 A; 2GTO A; 1GBQ A; 1JU5 C; 2FPD A; 1X27 A; 1OEB A; 2RQU A; 4RTX A; 2XMF A; 1BB9 A; 4OML A; 4OMO A; 2KRM A; 1SEM A; 2KRN A; 5FWC A; 3VS2 A; 4K11 A; 3VS5 A; 1TUD A; 2GGR A; 1ZUK A; 1NYF A; 1UFF A; 4AG2 C; 2C0O A; 2FRW A; 4D8D A; 2J05 A; 4KRT A; 4HVV A; 3REB B; 4LNP A; 2CH4 W; 4Z89 A; 3KFV A; 2HCK A; 2B86 A; 4JJB A; 1JXO A; 1VYV A; 2EYX A; 1UTI A; 3IQL A; 2JMC A; 2DMO A; 1ARK A; 5I11 A; 1JEG A; 3SHW A; 1GCQ C; 2AK5 A; 3R6N A; 3M0U A; 1PKT A; 3FJ5 A; 2KRO A; 2EGC A; 1HD3 A; 1ZUU A; 2AZS A; 2QDL A; 5I22 A; 1T3S A; 1NM7 A; 2P4R A; 2CT3 A; 3EHQ A; 2EYW A; 1WX6 A; 2GTJ A; 1OOT A; 1RUW A; 4OMM A; 3I9Q A; 4IIO A; 1WIE A; 1AZE A; 3NGP A; 1V1C A; 2CSQ A; 2JM8 A; 2KBT A; 2GNC A; 2RMO A; 2M0Y A; 4GLM A; 1N5Z A; 2AKL A; 2LNH B; 5IXF A; 5GJV B; 1UUE A; 4J9B A; 1H3H A; 1NLP C; 1QCF A; 1J3T A; 3EG3 A; 2OI3 A; 4A63 B; 1XOV A; 1GBR A; 1A0N B; 2O9V A; 1AWX A; 2KR3 A; 4CC4 B; 1K9A A; 2LQN A; 2KGT A; 4M4Z A; 1RI9 A; 1ZLM A; 2FPE A; 2JXB A; 2EBP A; 2DBK A; 1Z9Q A; 2MCN A; 3H0H A; 2D1X A; 1WXT A; 2J06 A; 2ROL A; 4RTT A; 2F2V A; 1NG2 A; 3NMZ C; 2L3S A; 1UEC A; 1K1Z A; 3RNJ A; 4F17 A; 2CDT A; 2DL3 A; 2DIL A; 2EGA A; 4RTW A; 2VVK A; 1WDX A; 1JXM A; 2EVR A; 2VKN A; 2IIM A; 2CUB A; 1AOJ A; 1UGV A; 1BK2 A; 4RUG A; 2LJ3 A; 1I07 A; 2MIO A; 4CC7 A; 1U5S A; 4X1V A; 2YUP A; 2KNB B; 1UE9 A; 2ECZ A; 2FPF A; 2KEA A; 2JTE A; 2A08 A; 2L0A A; 2LJ1 A; 1Z9Z A; 1YP5 A; 4Z88 A; 1TG0 A; 2W10 A; 2CT4 A; 4JZ4 A; 5IXB A; 3UAT A; 3UA6 A; 2BZX A; 3TSW A; 3UF4 A; 2DYB A; 4J9F A; 1WXU A; 2EYZ A; 2ED0 A; 2LJ0 A; 4EIK A; 2RQT A; 1I0C A; 4J9D A; 1GL5 A; 2LQW A; 2YUQ A; 2OAW A; 3ULR B; 1SPK A; 1UHC A; 1RLP C; 1H8K A; 5IHN A; 2DRM A; 2DBM A; 1SRM A; 2KYM A; 1GFD A; 3M0S A; 2DJQ A; 2J6K A; 2F2W A; 4CC2 A; 2EW3 A; 2M51 A; 1X6B A; 2LP5 A; 2JMA A; 2GBQ A; 3M0P A; 1PHT A; 1W1F A; 5EC7 A; 1YCS B; 4QT7 A; 2DNU A; 1ZX6 A; 3VS4 A; 2FG0 A; 2DL5 A; 2C0I A; 2G6F X; 4ESR A; 1AZG B; 2C0T A; 1KIK A; 1PRM C; 3QWX X; 3ZL7 C; 1CKA A; 1U3O A; 2CRE A; 2PTK A; 5ECA A; 2O2O A; 1OPL A; 1UHF A; 2V1R A; 4JZ3 A; 1AWW A; 1WLP B; 3LH5 A; 1M30 A; 3GBQ A; 2K7A A; 4Z8A A; 3EHR A; 2KT1 A; 2LCS A; 3VRZ A; 1SRL A; 2BZ8 A; 4D8K A; 1BBZ A; 3PE0 A; 1YWP A; 1QWE A; 3SEM A; 1K0S A; 1E6H A; 1YN8 A; 2DL7 A; 1AWO A; 2EPD A; 2LMJ A; 3O5Z A; 3VS1 A; 2LZ6 B; 2DVJ A; 4DEX A; 1H92 A; 2KYB A; 2K79 A; 2RQW A; 3H0F A; 2K9G A; 2O88 A; 3H0I A; 3CQT A; 2KE9 A; 2EKH A; 3C0C A; 1PRL C; 1WA7 A; 4OMN A; 2AZV A; 2RF0 A; 2RQV A; 1JO8 A; 1ZSG A; 4AFU C; 1NYG A; 1JQQ A; 2CSI A; 3VS3 A; 4OMQ A; 1ZBJ A; 2SEM A; 2JT4 A; 1Y0M A; 3M0R A; 1QLY A; 2YT6 A; 1QWF A; 2CUD A; 2BZY A; 2RNA A; 1YNZ A; 4HXJ A; 2ED1 A; 2DE0 X; 1OV3 A; 3VS7 A; 2LX7 A; 4HCK A; 2J6F A; 4AG1 C; 1S1N A; 3NPF A; 1VYT A; 2I0N A; 2A37 A; 1UDL A; 1NEG A; 2RQR A; 1G2B A; 2F2X A; 2YDL A; 3I5R A; 1X6G A; 1YWO A; 4RTV A; 1WI7 A; 2PNI A; 5L23 A; 1X43 A; 1NEB A; 1M3A A; 3M0T A; 5FW9 A; 1RLQ C; 4OMP A; 2BTT A; 5HCK A; 1X2Q A; 2HDA A; 4FSS A; 2O31 A; 2JS0 A; 1PWT A; 2PZ1 A; 4RTZ A; 4DEY A; 2EQI A; 4GBQ A; 1WFW A; 2A28 A; 4J9G A; 2DRK A; 2EYY A; 3VS6 A; 1KSW A; 3EG0 A; 4RTU A; 4E6R A; 2VWF A; 3PVQ A; 4F14 A; 3TVT A; 2DL4 A; 2L3P A; 4J9I A; 2E5K A; 1M3B A; 2HSP A; 2OJ2 A; 2K2M A; 1BU1 A; 4J9C A; 1AEY A; 4LE9 A; 4ORZ A; 1W70 A; 2K3B A; #chains in the Genus database with same CATH topology 4AT1 B; 1VUB A; 1ZSZ A; 4NL3 A; 1MV3 A; 1R77 A; 2M16 A; 4OGC A; 2COW A; 3CCQ Q; 2HZY A; 1IHV A; 3CCJ T; 2D8H A; 1LCK A; 1M27 C; 1OU9 A; 2YWW A; 2DTH A; 3I5S A; 3CCM Q; 2RN8 A; 3I35 A; 4ZNX A; 4QW2 A; 2EQM A; 4M75 E; 2ZAE A; 2D8J A; 1D1B A; 4C5I A; 3OBY A; 1AVZ C; 2E65 A; 3TU4 K; 2DL8 A; 1G83 A; 1M2V A; 1UGR B; 4FL6 A; 2XDP A; 3HFO A; 1ZUY A; 1V29 B; 1Q95 G; 1KHC A; 3PMI A; 1VQO A; 2K6D A; 3A98 A; 4C8Q A; 4M7A C; 5IHK A; 3PVL A; 2NUT A; 2O01 E; 4BY6 B; 2D6F A; 2L3Q A; 4M77 C; 2J6O A; 4C0G A; 2O9S A; 2GQI A; 4A54 A; 1TUC A; 1VQ4 T; 1VQO Q; 2OTL A; 5C6S A; 3MEW A; 1HJD A; 3M56 A; 4HVW A; 2DF6 A; 4M78 D; 5GAN h; 4DA4 A; 2LCL A; 3ZFJ A; 3MP1 A; 3CPW S; 1W2B S; 1VQK T; 1M4Z A; 2X3W D; 1GCQ A; 4C5H A; 4WCI A; 3JB9 G; 2OTL Q; 3OYM A; 4E47 A; 1SHG A; 4BB7 A; 4CC3 A; 4Y91 A; 2VXE A; 3JCM f; 2YXY A; 1QVF A; 3HP9 A; 2VGN A; 2ENM A; 4ZTF A; 1T0H A; 1NE8 A; 1ABQ A; 4BDZ A; 1M2O A; 3LWI A; 3G1J A; 5GAN 4; 2O4X A; 4M75 A; 5HKC A; 1WYX A; 4KUL A; 1C1A A; 1TWB A; 2DX1 A; 1WJQ A; 4HA8 A; 3GF5 A; 2RQU A; 4RTX A; 5LJ3 j; 2HL3 A; 4ZTJ A; 2A7Y A; 2E70 A; 2XMF A; 2KRM A; 4J6Y A; 5LJ3 f; 2K2V A; 2GCX A; 2QG9 B; 3NTK A; 5L8R E; 2M9U A; 5KYN A; 2GGR A; 4A4E A; 2J05 A; 4LD9 K; 3CD6 T; 5CKH A; 3REB B; 3CCU T; 2E12 A; 2QQA A; 5M9O A; 3KFV A; 5GAN 8; 4DBF A; 4JJB A; 2K3X A; 5GMK m; 3JCM d; 3H8Z A; 3JCM g; 2JMC A; 3SHW A; 3R6N A; 3M0U A; 1PKT A; 3VYH B; 2QDL A; 5KH6 A; 1NM7 A; 2P4R A; 4M7D D; 4EMK B; 4P5N A; 3T9N A; 1WX6 A; 4XTW A; 2HSE B; 1KQ1 A; 2V8I A; 3GNF B; 2QQB A; 1EZZ B; 2DFU A; 3CMA A; 2E6Z A; 5GAO r; 1AZE A; 3NGP A; 2CSQ A; 3CCR A; 2D9T A; 2R57 A; 3VUB A; 1TTH B; 5HK3 A; 2LNH B; 2AKL A; 5FLX E; 4F7U G; 4GLK A; 4BY6 C; 1J3T A; 3EFO B; 2HMA A; 4C92 F; 5GAN j; 2EQJ A; 2QGF B; 4WF2 A; 1GBR A; 1A0N B; 2LX9 A; 5GAM g; 2O9V A; 3P8B B; 3V7R A; 2VUB A; 3CCR Q; 3RER A; 5GAN f; 3CBM A; 1WHK A; 4M4Z A; 2VYT A; 3EFS A; 3SDZ A; 3F70 A; 3L42 A; 4M78 G; 2JXB A; 2DBK A; 1I5L A; 1Q82 R; 3S3M A; 2NUP A; 2MCN A; 4OB0 B; 4RTT A; 2XDD A; 3QZ5 B; 5GMK l; 1K1Z A; 3RNJ A; 4M7A D; 2CDT A; 2MAM A; 1Y7X A; 4HCZ A; 1RAE B; 1JXM A; 3M57 A; 1AOJ A; 2FL7 A; 1VQM A; 3UWN A; 4QQ6 A; 4RUG A; 4QVC A; 2LJ3 A; 2XKO C; 4CC7 A; 2OTJ T; 1ZSZ B; 4MMK A; 4RCB A; 1RAG B; 4X1V A; 4BAC A; 2ZPH B; 3FDR A; 5CKF A; 2ZPF B; 2X51 A; 5A0G A; 2I2L A; 2YRV A; 2RHX A; 3FC3 A; 2JUF A; 1TG0 A; 5GAN d; 3OYB A; 2CT4 A; 4JZ4 A; 3TQ7 P; 5IXB A; 1VQM Q; 4C92 E; 3JCM e; 3VJP A; 2LNV A; 1WXU A; 4MZP A; 1M2V B; 2RQT A; 5HY6 A; 1GL5 A; 1IGU A; 2YUQ A; 1G3W A; 1H3Z A; 2DBM A; 2BE7 D; 3M0S A; 2F2W A; 4PJJ A; 1VQ8 T; 4C8Q B; 1YJN A; 3OS2 A; 1VQP T; 3PGG A; 5D6Y A; 3G6E T; 1WQ7 A; 2JMA A; 2GBQ A; 3M0P A; 5EC7 A; 5KYY B; 3I56 A; 2EJF A; 1ZX6 A; 3FJP A; 3VS4 A; 4M7D G; 2DL5 A; 2VB6 A; 4JS4 A; 4EMK C; 3JAM E; 4J6X A; 4R55 A; 3CXC S; 3QZ9 B; 2O2O A; 2RA2 A; 1OPL A; 4JZ3 A; 4E7H A; 2P0P A; 1YIT T; 3LH5 A; 3NFC A; 3GIB A; 3X24 B; 1YJN Q; 3RES A; 4PJN A; 3TCJ A; 3VUZ A; 2DXT A; 4Z8A A; 3QJ6 A; 3I56 Q; 2IG0 A; 3JSC A; 1KK7 A; 1Y96 A; 3MP6 A; 3C12 A; 3PE0 A; 1YWP A; 2CZ0 B; 4CRI A; 4ZGJ B; 1IB8 A; 3SEM A; 4C0Z A; 3MEV A; 2RJC A; 1YN8 A; 4PFO A; 2EPD A; 3HRS A; 1QMC A; 2M1H A; 5CCA A; 3CCL A; 2QEX T; 1H92 A; 1MMG A; 3HPW A; 3QHS A; 2RI2 A; 3JCM W; 4GY5 A; 5IT9 E; 4C92 A; 1D3B B; 2O4X B; 3M4Y A; 1PRL C; 4OMN A; 4N0A C; 1JO8 A; 4M7A G; 1JQQ A; 3OW2 P; 3VS3 A; 3VV0 A; 3PTA A; 3CCL Q; 2SEM A; 2RM4 A; 2JT4 A; 2YRC A; 1MND A; 2JJ9 A; 1QVP A; 4MDX A; 5GAN e; 2YT6 A; 3OYI A; 5I2M A; 3CCS A; 3MPU B; 4X9C A; 1FX7 A; 2WSE E; 3NPF A; 1VYT A; 2A37 A; 5CVI A; 2IVW A; 2LDM A; 1NEG A; 4DOW A; 5CKB A; 5CIU A; 1YI2 A; 2DYI A; 2RJE A; 5L23 A; 1X43 A; 3CCS Q; 1WHH A; 2R5M A; 3P8D A; 2ZPB B; 2BTT A; 1YJW T; 5HCK A; 4OB1 B; 3RUX A; 1VQL T; 3CPF A; 3ASK A; 2X4X A; 5KYU B; 2ATC B; 1YI2 Q; 3OYE A; 2DEQ A; 2PZ1 A; 2MI6 A; 1H64 1; 4J9G A; 1G3Y A; 3VS6 A; 1KSW A; 4NOY A; 4WTO B; 4JRI A; 2EWN A; 2ZPE B; 4DBQ A; 2P84 A; 1AEY A; 4PJO D; 2K3B A; 4LDX A; 1NJI R; 5CAI A; 3TSZ A; 2WAC A; 4JLI A; 3M0Q A; 1JB0 E; 1EFN A; 3RKX A; 1VQ9 A; 2G3R A; 3GNG A; 3EGX A; 3OW2 A; 4HVU A; 5FRM A; 4X9D A; 3EGD A; 3H41 A; 3L1A A; 2YUO A; 1Y57 A; 3CPW P; 4AFZ C; 1S72 A; 2HD0 A; 1F1B B; 3S3O A; 2XIC A; 1UJY A; 2KXC A; 3QWY A; 3QSU A; 2LT4 A; 5CR2 A; 1U8R A; 2YUN A; 2LVM A; 3FEO A; 2CH4 A; 3JB9 F; 2DA9 A; 1VQ9 Q; 2JS2 A; 2K57 A; 1NJI C; 3CBP A; 1UB4 A; 2JVV A; 4JLG A; 1VQ7 A; 4LUD A; 4CI0 C; 1S72 Q; 3VYG A; 2P0K A; 2KT8 A; 2EGE A; 3EG2 A; 4AFQ C; 1VA7 A; 4LDV A; 2ZGW A; 4XTV A; 1GCP A; 1N6A A; 4F16 A; 4KH1 B; 3MET A; 3RBB B; 5IH2 A; 1VQO T; 3NHN A; 4FM4 B; 1NPR A; 1ABO A; 1PNJ A; 2J7I A; 4PFP A; 1WHJ A; 1VQ7 Q; 5IHI A; 3OA6 A; 5GJW B; 3OB9 A; 1Y71 A; 3LH0 A; 4JPB W; 3BDU A; 3ME9 A; 1SKU B; 4O5V A; 4QQG A; 4AFS C; 4BDY A; 4FCY A; 2OTL T; 3AT1 B; 5FRN A; 2PU9 B; 2XK0 A; 4OVA A; 4Y92 A; 3OYG A; 1ZHI A; 4XAX B; 1IO6 A; 2KRS A; 2V26 A; 1FMK A; 1T0J A; 4XU1 A; 1MMN A; 2YSQ A; 4Z02 A; 1KFZ A; 1XJW B; 3G4S A; 3MEU A; 1XTD A; 2DTO A; 4OP0 A; 1X2K A; 4FSX A; 2E6N A; 2JW4 A; 1G8X A; 4M75 F; 1RAA B; 2KAF A; 3M54 A; 2NUZ A; 3QUI A; 2F5T X; 1Q7Y U; 1I1J A; 2NLU A; 3CPW A; 1R0C B; 1W2B A; 1I4K 1; 1Y96 B; 3JCM V; 2CS7 A; 1JU5 C; 2FPD A; 4F7U F; 3OMC A; 1X27 A; 1LJO A; 4MZM A; 1BB9 A; 1RAC B; 4OMO A; 3G4S Q; 4PJO G; 5FWC A; 1YHQ A; 4K11 A; 1KC8 U; 4OF1 A; 1D0X A; 3EH2 A; 2K5I A; 3S6W A; 1SSF A; 2LQ8 A; 3C95 A; 1NYF A; 4C92 B; 2E4H A; 2C0O A; 4BE2 A; 4KRT A; 2RB6 A; 4A4G A; 2B8A A; 4Z89 A; 1M1K U; 1KD1 U; 2RD1 A; 1JXO A; 1YHQ Q; 3IQL A; 1BI3 A; 2XG8 D; 2COZ A; 1VQ5 A; 1MGQ A; 1ARK A; 1JEG A; 1VQ6 A; 5I22 A; 3ER0 A; 1T3S A; 5GAM h; 1PC0 A; 2M0O A; 5D7U A; 2COY A; 1M1F A; 1VQ5 Q; 2BE9 B; 4F7U E; 1VQ6 Q; 2JM8 A; 2RMO A; 1ACM B; 3CMA T; 5GJV B; 3FRN A; 1UUE A; 4HCC A; 1H3H A; 3E1S A; 1O75 A; 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