The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
5
|
sequence length |
96
|
structure length |
96
|
Chain Sequence |
GSSGSSGTSKQRYSGKVHLCVARYSYNPFDGPNENPEAELPLTAGKYLYVYGDMDEDGFYEGELLDGQRGLVPSNFVDFVQDNESRLASTSGPSSG
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Solution structure of the first SH3 domain of KIAA0318 protein
rcsb |
| molecule keywords |
RIM binding protein 2
|
| molecule tags |
Protein binding
|
| source organism |
Homo sapiens
|
| total genus |
5
|
| structure length |
96
|
| sequence length |
96
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2004-05-28 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF14604 | SH3_9 | Variant SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2EVR A; 1B3Q A; 1E7O A; 1S1N A; 2KBT A; 2KXD A; 2LQN A; 3TSZ A; 4F17 A; 2O9V A; 2CUB A; 5IH2 A; 4J9D A; 3LH5 A; 1KIK A; 1UGV A; 1ZUY A; 3A98 A; 3I5R A; 3SHW A; 2ENM A; 4AFS C; 2KYB A; 2GGR A; 2BZY A; 3REA B; 1Z9Z A; 1AEY A; 1U06 A; 2YSQ A; 2E5K A; 4JJB A; 2GTO A; 3EHQ A; 2FPD A; 2J6F A; 2XMF A; 1UHF A; 2DA9 A; 1SSH A; 2FPF A; 2J7I A; 2CUD A; 4F16 A; 4X1V A; 2JS0 A; 2GQI A; 2OAW A; 2PZ1 A; 1X27 A; 2D1X A; 5FWB A; 2JMC A; 3CQT A; 5IHK A; 1AVZ C; 2JTE A; 1AWW A; 2JMA A; 2DVJ A; 3NGP A; 2ABL A; 3UF4 A; 2J6K A; 4R0K A; 3VS0 A; 4WCI A; 2CDT A; 2LCS A; 3UA6 A; 4AG1 C; 2EYW A; 1GFC A; 3IQL A; 1GCQ C; 1T0J A; 1QWF A; 1I1J A; 1H3H A; 2D8H A; 1MV0 B; 2FRY A; 3UAT A; 4RTW A; 1IO6 A; 4FSS A; 1YN8 A; 1RUW A; 3VS7 A; 2P4R A; 4AFQ C; 3I35 A; 2F2X A; 2GNC A; 1ZBJ A; 3EGU A; 2NUZ A; 3QWX X; 1WXB A; 1HSQ A; 1NLO C; 1ZLM A; 1K4U S; 2CT3 A; 3KFV A; 1T3L A; 2HSP A; 3U23 A; 4J9H A; 1BU1 A; 4IIM A; 3H0H A; 2EGA A; 3EG2 A; 3THK A; 1KSW A; 2K6D A; 1NYG A; 4EIK A; 1J3T A; 1MV3 A; 2RNA A; 4OML A; 1JEG A; 2MCN A; 2HDA A; 3M0T A; 2VKN A; 1GRI A; 4JJD A; 4OMM A; 2JXB A; 4IIO A; 2ECZ A; 2CT4 A; 1W1F A; 3PVL A; 3R6N A; 4HCK A; 5FW9 A; 1B07 A; 2LX7 A; 1SHF A; 2LP5 A; 3UA7 A; 3VS1 A; 3H41 A; 1UUE A; 4Z89 A; 2FRW A; 2C0T A; 3EG1 A; 2L3S A; 3H0F A; 3C0C A; 1NM7 A; 2GBQ A; 1X69 A; 3NHN A; 3EG3 A; 2YUN A; 2VWF A; 1M27 C; 2EGC A; 2KRO A; 4F14 A; 2DRK A; 1UTI A; 4LUE A; 4LUD A; 2DJQ A; 1UJY A; 2DL7 A; 5I22 A; 1VYT A; 2FEI A; 2D0N A; 2DRM A; 4M4Z A; 2EPD A; 2DBM A; 4D8K A; 3M0S A; 1KJW A; 1CSK A; 1YWP A; 2OI3 A; 3VS3 A; 2RMO A; 2KRS A; 2KRM A; 2DL3 A; 2G6F X; 4J9G A; 1OOT A; 2YUQ A; 2W0Z A; 2DMO A; 2X3X D; 1I0C A; 1AOJ A; 2KNB B; 2KE9 A; 1X43 A; 4J9E A; 2FO0 A; 2HEQ A; 2EW3 A; 1HD3 A; 4Y92 A; 1RLQ C; 2KT1 A; 2OJ2 A; 4K11 A; 1AZE A; 4LE9 A; 4DEX A; 1OEB A; 4RUG A; 2A37 A; 2AZV A; 1LCK A; 1WA7 A; 2KXC A; 2NWM A; 2RQU A; 3EHR A; 1GBQ A; 1M30 A; 4GBQ A; 1AZG B; 2KT8 A; 1UFF A; 4LN2 A; 5FWC A; 1W6X A; 1PRM C; 4KRT A; 1PNJ A; 3VS5 A; 3H0I A; 1H8K A; 5IXB A; 1QCF A; 1YP5 A; 1JQQ A; 1ZX6 A; 1YCS B; 3VS2 A; 1NG2 A; 2PNI A; 1U3O A; 1CKA A; 3SEM A; 1T0H A; 5I11 A; 2O9S A; 2RPN A; 1X2Q A; 2AK5 A; 4RTT A; 1UEC A; 1JXO A; 3VRZ A; 2DX1 A; 3RNJ A; 1RLP C; 1NLP C; 2M0Y A; 1X6B A; 1M3C A; 4J9B A; 2JS2 A; 4CC2 A; 1TG0 A; 1SEM A; 4RTX A; 2O2O A; 1N5Z A; 2M51 A; 2YUP A; 3GBQ A; 4CC3 A; 5IHN A; 1PWT A; 1E6G A; 5L23 A; 1ZSG A; 2CSQ A; 1GBR A; 2C0O A; 4RTV A; 1UDL A; 2ED0 A; 1WIE A; 4ESR A; 2CRE A; 2LMJ A; 4HVV A; 1G83 A; 4A63 B; 2KYM A; 2LJ1 A; 1K0X A; 2I0N A; 1K76 A; 1OPK A; 4D8D A; 5IXF A; 4LNP A; 2RQT A; 1JU5 C; 5ECA A; 4E6R A; 5GJW B; 4HVU A; 1T3S A; 2ED1 A; 1QLY A; 2DL5 A; 2V1R A; 1QKX A; 1YNZ A; 5GJV B; 2CH4 W; 2F2W A; 2AKL A; 2K9G A; 1RI9 A; 4CC4 B; 1K1Z A; 1JO8 A; 2EBP A; 3M0Q A; 1Y57 A; 2D8J A; 1G2B A; 4OMN A; 1SHG A; 2W10 A; 4JPB W; 2DYB A; 4ORZ A; 2DIL A; 1WXU A; 3M0U A; 1UG1 A; 1SRM A; 3ZL7 C; 4QT7 A; 4OMP A; 1XOV A; 4CC7 A; 4GLM A; 2EYX A; 1X2K A; 4JZ4 A; 2C0I A; 1MUZ A; 1TUC A; 4HXJ A; 2BZ8 A; 2ROT A; 2F2V A; 4OMQ A; 1M3B A; 2JT4 A; 3PVQ A; 1WI7 A; 4RTU A; 1NEB A; 2BZX A; 4Z8A A; 1TUD A; 1GCQ A; 4AG2 C; 1WX6 A; 2FG0 A; 1Z9Q A; 3VS4 A; 1EFN A; 1SPK A; 2V1Q A; 3I5S A; 2DF6 A; 1V1C A; 1ABO A; 2AZS A; 2MOX A; 1WXT A; 2A28 A; 2ROL A; 2EKH A; 1GL5 A; 2LJ0 A; 1WFW A; 1AD5 A; 2QDL A; 1VA7 A; 2DL8 A; 2DLP A; 4AFU C; 3NPF A; 1WYX A; 1FYN A; 2CH4 A; 3FJ5 A; 1YWO A; 1U5S A; 2DBK A; 3M0P A; 2KR3 A; 1X6G A; 1OPL A; 1NEG A; 2A08 A; 2EYZ A; 1GFD A; 2LQW A; 1K0S A; 1VYU A; 1K9A A; 2MIO A; 1PKT A; 1Y0M A; 3QWY A; 4RTY A; 2B86 A; 4OMO A; 2L2P A; 3PE0 A; 1GCP A; 2X3W D; 2SEM A; 2YDL A; 2JW4 A; 1ZUK A; 2CSI A; 1W70 A; 1UJ0 A; 2IIM A; 4DEY A; 1AWX A; 1WDX A; 2O31 A; 1KFZ A; 1HJD A; 2K79 A; 3REB B; 2BTT A; 2GTJ A; 3TSW A; 2EGE A; 1ABQ A; 4JJC A; 2A36 A; 1SRL A; 1I07 A; 2HCK A; 1JXM A; 1M3A A; 1PRL C; 1ZUU A; 2RQR A; 3RBB B; 2LNH B; 2DE0 X; 1AWO A; 1CKB A; 2RN8 A; 2RQV A; 4ZNX A; 4JZ3 A; 2J6O A; 2JM9 A; 2RQW A; 3JV3 A; 2AKK A; 3VRY A; 2KGT A; 5HCK A; 1OV3 A; 2DNU A; 1UE9 A; 2RF0 A; 4Z88 A; 1E6H A; 3EG0 A; 1QWE A; 1FMK A; 1AWJ A; 2FPE A; 2O88 A; 2L3P A; 2K7A A; 1PHT A; 2L0A A; 1QKW A; 2YUO A; 2KEA A; 3TVT A; 2KRN A; 2YT6 A; 4J9C A; 1PKS A; 2L3Q A; 2SRC A; 1UHC A; 4J9F A; 2ESW A; 4J9I A; 1M8M A; 2LJ3 A; 2EQI A; 2EYY A; 2JM8 A; 3I9Q A; 2DM1 A; 5IHI A; 2HBW A; 2J06 A; 2K3B A; 4AFZ C; 1H92 A; 1VYV A; 2LZ6 B; 2PTK A; 2K2M A; 3O5Z A; 1A0N B; 5EC7 A; 3NMZ C; 2DL4 A; 2J05 A; 1BB9 A; 2VVK A; 3VS6 A; 1BBZ A; 1WLP B; 2H8H A; 3M0R A; 4RTZ A; 3ULR B; 4HVW A; 1NYF A; 1ARK A; 1BK2 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2ZPG B; 3HP9 A; 2KXD A; 1E7O A; 2BIV A; 5KYX B; 3EFO A; 3LLR A; 1QCO A; 2RK2 A; 4M77 E; 2CUB A; 4F17 A; 1QQJ A; 5IH2 A; 3LH5 A; 1YI2 A; 3KUF A; 2VGN A; 1M2V B; 4BUG A; 3GOX A; 3WVD B; 1N8R R; 1QVF A; 3REA B; 3VJP A; 1RAB B; 3ZEH A; 5LJ3 j; 1KD1 R; 4QW2 A; 1QCN A; 2FVU A; 2YSQ A; 3CC4 T; 2A0F B; 2JN0 A; 4OF1 A; 2CS7 A; 4N0A A; 4XTW A; 1D0Z A; 4E7L A; 2DA9 A; 1QMC A; 1ZQ1 A; 4C8Q A; 2E41 A; 4M78 G; 2GQI A; 4KGX B; 5FWB A; 1NE8 A; 4QVC A; 4PJO C; 2NYS A; 2B8A A; 2JTE A; 1AWW A; 5FRO A; 5CKE A; 1KQ2 A; 4R0K A; 3VS0 A; 3EFO B; 1M9S A; 1IHW A; 2LCS A; 1VQO A; 3IQL A; 1QWF A; 1TSF A; 1ZSZ A; 1Q7Y C; 3G4S Q; 5LJ5 h; 2VXF A; 4MMK A; 2R57 A; 3N5B B; 1YN8 A; 1RUW A; 4RMO A; 2P4R A; 3I35 A; 1WJQ A; 1ZBJ A; 2NUZ A; 2XK0 A; 2HBP A; 2CT3 A; 3KFV A; 1BI0 A; 1LNX A; 3MEW A; 1KG1 A; 4IUQ A; 3HKS A; 4M75 D; 1I81 A; 1SF9 A; 1KSW A; 2JNG A; 1NYG A; 2K6D A; 2VXE A; 4F04 B; 1M90 C; 5FRM A; 3CME A; 3QUI A; 5HY6 A; 3SWN C; 4M77 D; 2DZ9 A; 4OML A; 1JEG A; 2HDA A; 2AHJ B; 3FIF A; 4OMM A; 3BDU A; 2AIR B; 3J80 E; 2M1H A; 2ECZ A; 3WVE B; 3R6N A; 3T9N A; 3HRS A; 2O4X B; 1MNE A; 1R8O B; 1ZSZ B; 2EYQ A; 5A2Q E; 1FXX A; 2V8J A; 2E64 A; 2KQW A; 5HK3 A; 3JCM b; 1M5Q 1; 3UA7 A; 3VS1 A; 3RMQ A; 4Z89 A; 3M59 A; 2C0T A; 3MET A; 4C0D C; 1VQ4 Q; 3JCM e; 1YIT T; 4FW2 A; 2P0K A; 6AT1 B; 2HMA A; 3EG3 A; 1VQ5 Q; 1XJW B; 4M75 F; 3A8O B; 4C5I A; 4LUE A; 3GP8 A; 2E4H A; 4M77 F; 5IT9 E; 1KHI A; 1VYT A; 4LDU A; 2P84 A; 4M4Z A; 1K9M C; 2BUD A; 4XTX A; 1NJI R; 2VC8 A; 1KJW A; 2DXT A; 4FYW B; 2LCL A; 1W2B S; 2RMO A; 4FIB A; 3CMA Q; 1Y07 A; 5GAM g; 3QO3 A; 2W0Z A; 2MMP A; 2X3X D; 4NS5 A; 8AT1 B; 1I0C A; 1X43 A; 4J9E A; 4PJJ A; 3OYC A; 3HHT B; 4Y92 A; 1WZO A; 1WNL A; 2RJD A; 3CC7 T; 4P5N A; 1VQK Q; 1QVP A; 4BD3 A; 2DO3 A; 1OEB A; 4FYY B; 3QJY A; 5GMK l; 2GFA A; 3V7S A; 2RQU A; 2DAQ A; 1GBQ A; 3MP8 A; 1M30 A; 1AZG B; 4DBF A; 2HQH A; 3LYI A; 3OYD A; 5FWC A; 5DY9 A; 1W6X A; 2K57 A; 1EZZ B; 3JCM P; 4JS5 A; 2DD4 A; 4E7S A; 3RIR A; 2R5A A; 2HKQ B; 3CCJ A; 1Q86 R; 1NG2 A; 1PC0 A; 3M5A A; 1RAC B; 2DXU A; 9ATC B; 3SEM A; 8ATC B; 4FU6 A; 4LD9 K; 1M8V A; 3HPW A; 3QSU A; 3CC2 T; 5LJ5 e; 2M0Y A; 1VQL A; 1X6B A; 4EPC A; 3RUX A; 2DXC A; 4CC2 A; 2NLU A; 4RTX A; 3CC7 A; 4PFP A; 1N5Z A; 1YJ9 T; 2QA4 T; 2WSE E; 2RB6 A; 2OTJ T; 1WQ7 A; 2ED0 A; 4QVD A; 5CQX A; 1LPL A; 1G83 A; 3OS5 A; 1M1K U; 4A63 B; 2I0N A; 3QZ5 B; 4FT2 A; 2E70 A; 2L3R A; 4Y91 A; 5D6Y A; 4RKU E; 2DL5 A; 1YNZ A; 1R77 A; 5GJV B; 3V7C A; 5FLX E; 2F2W A; 2EJG A; 2Y4Y A; 1X75 C; 5LJ5 j; 2HNI A; 2DTO A; 2PVO B; 2DYB A; 4C8Q G; 3G7Z A; 1Q81 C; 3CBP A; 4HKE A; 1I5L A; 4E7J A; 3CC2 A; 4L6V 5; 3EGD B; 4QT7 A; 4OMP A; 4CC7 A; 2EYX A; 1YBY A; 3F70 A; 1X2K A; 4JZ4 A; 2PVG B; 3D7S B; 4IUU A; 2D6F A; 3NFC A; 1VQM A; 3JB9 F; 3CPW P; 1YJ9 A; 5GAN d; 1NEB A; 2BZX A; 4ZGD B; 4E7Z A; 1WX6 A; 4M7A C; 1TTH B; 3OS2 A; 1TUG B; 1V1C A; 2A28 A; 4J7F A; 4VUB A; 3QZ9 B; 5GAN f; 1GL5 A; 1WFW A; 3OYM A; 1VQ9 Q; 5AYF A; 4AFU C; 3NPF A; 1WYX A; 1FYN A; 3PNW C; 1M1F A; 1HXD A; 3M0P A; 4ZTJ A; 3OB9 A; 4C92 A; 3PT9 A; 2EYZ A; 4E2F B; 4LDV A; 1BI2 A; 2LQW A; 5IN1 A; 5GAO n; 1AHJ B; 1K73 U; 1MMD A; 1IZ6 A; 2ATC B; 3JAM E; 4NOY A; 1ZBX A; 1KC8 R; 2HAX A; 2FYK A; 5GAO p; 2B86 A; 1LVK A; 2DK3 A; 2L2P A; 1IRE B; 3RER A; 1ZUK A; 4C0Z A; 3G4S T; 3RDV A; 4J7I A; 1W70 A; 2RHY A; 1W2B A; 3ER0 A; 4OGE A; 3ME9 A; 4B6M A; 2K79 A; 3L1A A; 2BTT A; 2GTJ A; 5FU7 C; 2A7Y A; 2EGE A; 1RAG B; 2RH2 A; 3M56 A; 3AT1 B; 4ATO A; 2JTF A; 2NUP A; 1QP2 A; 2GQV A; 4M7D A; 4C92 B; 1M3A A; 1V76 A; 3AHU A; 2MPX C; 1KK7 A; 2X4J A; 3CCU Q; 2DE0 X; 2RN8 A; 2EWN A; 4LDY A; 1VQ8 A; 2LC4 A; 2RQW A; 2KGT A; 1UE9 A; 4ELY C; 3EG0 A; 3DLL A; 3Q1J A; 2RI5 A; 3I56 Q; 2K7A A; 3R6O A; 4J9C A; 1PKS A; 4PKC C; 4XTY A; 3E19 A; 5KYY A; 5CKF A; 2ZCF B; 3GNF B; 4J9F A; 2ESW A; 3RR6 A; 1VQ4 T; 1M8M A; 2EKO A; 1Q82 U; 2NUP B; 1OZ2 A; 2CYZ B; 2O01 E; 4C92 E; 1VQ5 T; 1RAF B; 2COY A; 1Y96 A; 4M7D B; 2K2M A; 3GLX A; 2RJE A; 4KUL A; 5EC7 A; 3CCJ Q; 3NTK A; 2QTX A; 4FYX B; 1KD1 U; 4J8O A; 1WLP B; 3HSB A; 3M0R A; 3ULR B; 3E2U A; 3I55 Q; 1BK2 A; 4EMK C; 3M58 A; 3PIP A; 3CMA T; 2GF7 A; 1B3Q A; 3FC3 A; 3RES A; 3TSZ A; 1VQL Q; 2JVV A; 5LL6 S; 3SHW A; 1QW1 A; 2VB6 A; 5KYY B; 2RO0 A; 1HK9 A; 1AEY A; 1U06 A; 2E5K A; 2GTO A; 4BE2 A; 2J6F A; 3CCM Q; 2VUB A; 4M7D E; 3MP1 A; 3OYJ A; 3EH1 A; 3S3O A; 2FPF A; 1VQ4 A; 3CPW S; 4M7A G; 2LT4 A; 2D1X A; 2EJF A; 2JMC A; 2E10 A; 4M75 A; 5IHK A; 2DVJ A; 4A53 A; 4F7U F; 2ABL A; 2OTL A; 2J6K A; 4M77 A; 3JCM c; 4OB0 B; 4XU2 A; 4AG1 C; 5KYW A; 3A8L B; 1K73 R; 3OQ5 A; 1X6O A; 1I1J A; 1H3H A; 5GAN 8; 1MV0 B; 2L8D A; 4C92 D; 3VS7 A; 4MZP A; 3EAE A; 3EGU A; 1VQM Q; 3QWX X; 1VQK A; 1WXB A; 1NLO C; 1G5V A; 1K4U S; 5I2M A; 4B9W A; 1U8R A; 3CEY A; 4IIM A; 2X51 A; 1N27 A; 3V7R A; 3THK A; 3WXM B; 4CRI A; 4EIK A; 3X24 B; 2DET A; 5KYX A; 2MCN A; 3CBO A; 1OZ3 A; 1FMV A; 1TS9 A; 3CCR Q; 4JJD A; 2ZZD A; 4PLI A; 1M2V A; 2PU9 B; 2CT4 A; 1OQK A; 4HCK A; 5KYW B; 3X20 B; 2LX7 A; 1SHF A; 4C92 F; 4EMG A; 3EG9 B; 2JTM A; 3ZFJ A; 3DKM A; 3CCE Q; 4M7D D; 3V8J A; 1RL2 A; 1UUE A; 2DTI A; 2MWO A; 1Q81 R; 2CZ6 B; 1IXD A; 3CD6 Q; 2CP0 A; 3H0F A; 3NHN A; 2EGC A; 4F14 A; 2MF2 A; 2KVQ G; 2KDS A; 4LUD A; 5GAM d; 4J6W A; 3TRE A; 5I22 A; 2WAC A; 4RCB A; 3FJP A; 3PGG A; 2D0N A; 2DRM A; 1KHC A; 4ME7 A; 1Q82 R; 2C06 A; 2EPD A; 2DBM A; 4PL6 A; 1CSK A; 3L2R A; 3DLM A; 4C5G A; 1YWP A; 2OI3 A; 3VS3 A; 2KRS A; 4E7K A; 5GAM f; 2YUQ A; 3M54 A; 5GAN h; 2DMO A; 3C95 A; 1OI1 A; 4M7D F; 2E6Z A; 2EW3 A; 1HD3 A; 4MML A; 2LX9 A; 2RHU A; 2KT1 A; 3G71 Q; 1VQ9 T; 4K11 A; 3CME T; 4DEX A; 3EH2 A; 1C6V X; 3CCV Q; 1VQ8 Q; 4L59 A; 1G3Y A; 1UGQ B; 4BDY A; 2EQJ A; 2KXC A; 1Q86 U; 1WHG A; 3OBW A; 5D7U A; 2KT8 A; 1UFF A; 5GAN 3; 1PRM C; 1WHJ A; 4M78 F; 1D0Y A; 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