1WIKA

Solution structure of the picot homology 2 domain of the mouse pkc-interacting cousin of thioredoxin protein
Total Genus 14
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
14
sequence length
109
structure length
109
Chain Sequence
b'GSSGSSGLKVLTNKASVMLFMKGNKQEAKCGFSKQILEILNSTGVEYETFDILEDEEVRQGLKTFSNWPTYPQLYVRGDLVGGLDIVKELKDNGELLPILKGESGPSSG'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Solution Structure of the PICOT homology 2 domain of the mouse PKC-interacting cousin of thioredoxin protein
rcsb
molecule keywords Thioredoxin-like protein 2
source organism Mus musculus
molecule tags Electron transport
total genus 14
structure length 109
sequence length 109
ec nomenclature
pdb deposition date 2004-05-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00462 Glutaredoxin Glutaredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1wikA01
3ZZXA 1QMVA 2ON7A 5CYYA 2KUCA 1YY7A 4KB3A 1U3AA 4NV5A 1PX6A 3DKSA 4HU9A 3LWAA 2H19A 2P5QA 1DE2A 5FT3A 2MMZA 1PQNA 1ERVA 2JACA 2OKAA 4POBA 3WYWA 3BBYA 2B5EA 2K9FA 3ERGA 3W8SA 1F37A 9GSSA 4IKHA 4WKWA 2M80A 4ZB8A 1TRSA 2DJ0A 3GH6A 3FZ4A 4EL1A 4NWYA 4BVYA 1EEJA 3TKPA 5D9XA 5GSSA 4KSOA 3BD2A 3M9JA 2DLXA 3GN3A 2IFQB 1FOVA 2F8AA 1TK8B 1OKTA 1PGTA 3TJGA 1LJRA 1XW5A 1A2JA 5H5SA 3F8UA 3ME7A 1IYHA 1BAYA 3Q6OA 3ZITA 2VUPA 2I9HA 1YKCA 1E6BA 1A8YA 4MF7A 2GSSA 3H8QA 1SK2A 3I6AA 3TOUA 2WS2A 2IMIA 3TRPA 2YV9A 3UJ1A 2G0FA 4GRFA 4LMWA 3HVVA 2LUSA 5IO0A 1NHOA 2PERA 6GSXA 1ON4A 1WE0A 1XVWA 3CRTA 5J9CA 4GSTA 3GURA 3UBLA 5DQSA 3US3A 3LFLA 4ZBDA 4EF0A 2H6YA 3HY2A 3F9UA 1G7EA 1EZKA 5DDLA 1QXHA 2HSHA 4MMMA 4KW6A 2X8GA 4DSRA 1GP1A 4IGJA 1GNEA 4N11A 2XPDA 2I1UA 4XRAA 1U88A 1GTUA 3E0UA 1ACVA 2H75A 3WGEA 3ZL5A 3TRQA 5EPFA 4POLA 3HZ8A 5JCWA 4MH2A 3RHCA 4TR4A 4BWQA 2IL3A 5CRDA 4G19A 1AQVA 5G1LA 1T8EB 5H5RA 1KEBA 1JHBA 3GL5A 5AIVA 4F9ZA 1GSEA 1CQHA 4K7NA 4OO5A 2VD1A 2VD0A 3U6VA 4PUAA 5AISA 1OE7A 5IMZA 4KDXA 4AJ8A 2DJ2A 1TRUA 3ME8A 4TN8A 2P31A 2V41A 4XS4B 2H0HA 3IV4A 1JLWA 3M1GA 3GV1A 4F82A 3E9JB 2P0GA 5CREA 1MDJA 2MMNA 5J4UA 4TR3A 3KD0A 4JR4A 2O87A 3C1RA 4F0BA 2HXKA 2M72A 2HI7A 2AHEA 5ID2A 3FKFA 2L59A 4OFTA 1A2LA 2L5OA 1TRWA 2VM1A 2B3SA 3TJJA 5DAKA 1FB0A 2C3TA 1MDIA 3APQA 4X0XA 4ECIA 2TRXA 4D73B 2OACA 4PNFA 3F4RA 1TTZA 3HVSA 3UIWA 5ECPB 2H70A 1S3DA 4RQXA 3ZTLA 5CRGA 2LNTA 1ZGNA 1EGRA 3GKKA 3QFBC 4J56E 2IMEA 4MPGA 1V9WA 4PX1A 5ECLB 3P90A 4IJ3A 3LXTA 2H76A 2EC4A 2CZ2A 2YZHA 4POKA 3D4TA 2RIIA 4WBRD 3A2VA 2BTOT 1F3AA 1O73A 5ECRB 4OD7A 5G1KA 1A23A 2REMA 1G7OA 2J9HA 2PBJA 2H01A 4XS1A 3TUEA 5HQPA 2I81A 2B5YA 1R5AA 3M3MA 3GIXA 2LQQA 1YEPA 4PQIA 4JEDA 6GSWA 1Y6EA 3CTGA 1X5CA 1A0FA 2YANA 1M0UA 4ML1A 2LSTA 3IAM2 2I3YA 4MDCA 1T00A 3S9FA 3F3RA 1GSFA 2B1LA 3GSSA 2R2JA 1ERTA 13GSA 1B4QA 3IC4A 1QQ2A 1OE8A 2EIRA 4ID0A 5DALA 4ECJA 2IIYA 6GSVA 2ON5A 2E2GA 3DMLA 1TKDB 3LEFA 1JFUA 3VFIA 1V98A 2RLIA 1O6JA 2FHEA 3DEXA 4EVMA 4NPBA 2GQKA 1EP7A 1WRYA 2AB6A 3UOMA 1PSQA 3LYPA 3HJPA 4MPFA 1H4OA 2JL4A 1GUKA 4HQZA 2HZEA 3APOA 2ZCTA 2GTUA 1K0BA 5IPHA 1JZOA 2HZFA 4KDYA 3PR8A 1OC8A 4POMA 4QL9A 2TIRA 5DBQA 1NHYA 2LQOA 3GUSA 1TW9A 2HNLA 1VF1A 5IMDA 1A24A 1GLPA 4MABA 1OKDA 5EY6A 3CSIA 5DCGA 3ZFBA 2LS5A 5DJMA 1Z7RA 2C0FA 1ML6A 2ES7A 3A3TA 5ECOB 1OVNA 4GXZA 2JADA 2VL9A 2J23A 2MMAA 3VI5A 5LCZA 2MZCA 1MTCA 2WGRA 5C00A 5D9TA 1Z3EA 1PMTA 3D22A 5KEJA 2NBSA 4EDYA 1SKSB 1SL1B 4L0UA 4TR1A 1JZRA 4KCAA 1NSWA 3F63A 3FHKA 5JCGA 1UN2A 3EU3A 4O5RA 1S3CA 4CDOA 3F0IA 3RPNA 3WGDA 4E8EA 2GSTA 4ZL9A 1PN9A 4GLTA 5HR1A 2YJ7A 3TKRA 4XTSA 4YQMA 2CX3A 1TU7A 4IBPA 5HFIA 3Q74A 3QOUA 1TP9A 2FA4A 4K6XA 1AC1A 1ZMAA 4ZILA 2JSYA 5FHIA 1XBSA 3EVIA 3ZREA 3HCZA 4MJBA 2H30A 1T7PB 2WB9A 4MJCA 4YQUA 5ABRA 2L4CA 1NW2A 3F4TA 5IQYA 1XWKA 2HSYA 3GMFA 3IBHA 4K9ZA 1C72A 3G7JA 2VOCA 1BG5A 4HI7A 1GWCA 5DCHA 3UBKA 3IXRA 1M2BA 2GVPA 4N0ZA 2ALBA 4MJEA 2VCTA 3K8NA 1MD4A 1VF4A 3FR3A 4MJAA 5J3RA 2YZUA 3IAS2 5GAND 2GDRA 2IPAA 1UVZA 2CVDA 1R5PA 4XCSA 2VL2C 3QPMA 5HR3A 3HHVA 1O7UA 5L71A 3RHBA 2GQMA 2LJAA 4I6XA 4TOPA 3KJYA 5HFKA 3EURA 1M2AA 4TKYA 5ECSA 2AJQB 3L9UA 3VI7A 2WULA 5ECKB 2F8FA 4YQVA 2IN3A 1QFNA 2IMFA 3I9V2 5ECIB 5F05A 4NMUA 4TXOA 5D73A 4PURA 4HDEA 1DUGA 3IRAA 4Q5NA 5EL8A 5F0GA 3WT2A 4NV2A 1YQ1A 2WZ9A 2YPMA 3FR6A 3CYNA 2FWHA 2L57A 1SJ6A 1X0RA 4L5LA 3D6IA 3D21A 4GSNA 4X43A 2V6KA 3CMIA 2DJ1A 3GKNA 10GSA 2VCZA 1RK4A 3RAZA 2F51A 3TKSC 3KGKA 4ZBBA 5G5EA 1EEMA 5ID2B 1U3IA 2FCHA 2JZSA 3F4SA 2GT5A 5DAKB 1WWJA 2F3MA 3IHQA 1XOAA 3IK7A 1TXXA 4EXJA 3FRCA 1AXDA 5ECNB 2QGVA 1Z9HA 4XRDA 5KN2A 5COHA 5B8BA 3ISOA 4HEA2 1GUHA 1TOFA 3QDNA 3AY8A 3VK9A 4V1Ap 4LMVA 5AIXA 2GSQA 2WJUA 2YN1A 3KXOA 3GA4A 4F2IA 2IWTA 2LKUA 3NOFA 1F3BA 4H86A 2OADA 1WPIA 3EE2A 5ELAA 2X99A 3UVTA 2H74A 5CP1A 3WT1A 1TJDA 1U6TA 4V1Ag 3DXBA 1URMA 2L4QA 2QKEA 4HJ2A 1X5DA 1OC9A 12GSA 1XWCA 4ULXA 1M9AA 1WOUA 2C0EA 4I97A 2X8HA 1KNGA 3DIEA 1O8XA 3RDWA 5INYA 3TKQA 5AGYA 3APSA 20GSA 4FH8A 1K0OA 2C8UA 2DBCA 2NDOA 1EOHA 2H6ZA 2HFDA 2IMKA 1A8LA 4CHSA 2H72A 4GSSA 5IOXA 1G0TA 1GNWA 1FB6A 2YWNA 2DIZA 1XWAA 5E4WA 4FIWA 4TR0A 3IK9A 4MH3A 1GRXA 1FG4A 5B8AA 1GSUA 2DC5A 1EWXA 5A5KA 1I5GA 5DALB 2L5LA 4CW9A 4K0GA 5AN1A 4V2LA 2LNSA 1UC7A 3GH9A 1DSBA 5CRWA 2CT6A 3TOTA 1PKZA 4KDUA 4GCIA 1B9XC 5IO2A 4Z7XA 3IA1A 4X1UA 1OYJA 5GZZB 2BJXA 1TU8A 1BQ7A 1GH2A 3A2WA 2HZEB 3QCPA 4YAVA 1V57A 3I43A 4FYUA 3UL3A 2RUFA 4HZ2A 1GLQA 2XPEA 3MWHA 3V1WA 2JU5A 4IVFA 4YH2A 1QGVA 2VAFA 4PQ1A 3MSZA 1KTEA 4I8BA 1T4ZA 1LU4A 2OJLA 4GWRA 1QK8A 2H71A 2QSIA 4WR5A 2XHFA 4IN0A 5IMFA 1B9YC 4KUNA 2XC2A 2AAWA 1HQOA 4PXOA 3GTUA 3H93A 1GSYA 2DJ3A 1HNCA 17GSA 2RM6A 1YF1A 4BL7A 5D8IA 3FZ9A 3HA9A 2PUKC 2C0GA 3DRNA 4ILFA 4IP1A 2LRTA 1H75A 2N5FA 4JU5A 1MEKA 4KAEA 4TR1B 3LJRA 2NVLA 2BMXA 2DMLA 2VCVA 3W8JA 3C8EA 3L9SA 2N5BA 3HDCA 4ECBA 2XBIA 3GYKA 5JWOB 4JRRA 2GGTA 1XW6A 5A4UA 1SD9A 3CBUA 1AQXA 2K18A 4ISDA 2PPTA 3ZIVA 4OO4A 2PVOC 4RUVA 1R4WA 3ZMKA 4GTUA 1SL2B 3ZRDA 1Z6MA 4K1FA 3QAGA 1GTAA 3C71A 4AJ6A 4MLYA 4V2NA 1YZXA 3SBCA 4FO5A 3KTLA 2Z9SA 2A4VA 4NXIA 3VPTA 3KH7A 2JSZA 4J2FA 3DD3A 4BVXA 1PL2A 5DVBA 2FUG2 2KHPA 5A4WA 1K0AA 3KM6A 4KE3A 1LBKA 4Q5QA 4ZB6A 4HZ4A 4N10A 2B1KA 4GF0A 4G10A 3HKRA 3EMPA 4BA7A 3VWWA 1OC3A 4WR4A 2FY6A 3QR6A 3Q18A 2FLSA 2CVBA 1TI1A 1Q98A 6GSYA 1ZZYA 1G6WA 3GKXA 2DJKA 3N5OA 1VF3A 2VCWA 5ECMB 4WETA 4HS1A 3L9VA 4FYBA 1WIKA 2DSAA 4LL4B 3OR5A 4KA0A 3F6FA 2L6CA 2HYXA 1M7TA 3TDGA 5IMVA 1SYXA 2GT6A 3VWUA 1ZL9A 3EYTA 1EV4A 4KX4A 1AUCA 4DSSA 2OBIA 4MF6A 2KP1A 4HOJA 3KIJA 1PRXA 3EWLA 4I5QA 4HU7A 4ML6A 1R7HA 2DIYA 4TXOB 4ZL7A 1RW1A 2R6KA 18GSA 3UAPA 2C4JA 2X64A 1W4VA 1Y25A 2KP2A 1V58A 2CAIA 5CNWA 4ZBAA 4EKZA 2D2ZA 1XOBA 1JZWA 3FYGA 4F03A 1SENA 5JWRB 1A0RP 1SD8A 3TJBA 2GSRA 1SYRA 2PVQA 3P8WA 1Z5YE 1TK5B 4E8HA 3FEUA 4MZWA 4PUFC 3EC3A 2CZ3A 4OCFA 3FY7A 4N30A 5DJLA 3IPZA 1EGOA 4HJMA 1B48A 1OAZA 4K8MA 1VGLA 1XXUA 1E2YA 2H6XA 1G6YA 2M46A 2GQLA 4ACSA 5IIZA 3O76A 4OWYA 1K3LA 3WD6A 1S3AA 5HFGA 3BOAA 1Q4JA 3FW2A 3Q19A 3PH9A 5ENUA 2GZPA 1GULA 2YWOA 5EVOA 4IQ1A 1SK1A 1K0CA 2XBQA 1EP8A 1HD2A 2B7JA 1AIUA 4BPYA 1XIYA 2WDUA 3ZVJD 5D96A 2JZRA 4MCUA 3H1NA 4YAPA 3KP8A 2H0GA 1NM3A 4L0WA 5KN1A 2YJHA 5FWGA 3IDVA 1Z7PA 1BX9A 1OC9B 4MF5A 3J7Yk 3M8NA 2R3XA 1T1VA 1GSDA 5CAXA 3ZLPA 3DVWA 2L6DA 3VWVA 2FD3A 5F8BA 1XZOA 2HLSA 3TKSE 2WCIA 1GTIA 1SKRB 1RQMA 3MDKA 4NAXA 1AAZA 2H66A 2NPBA 4HQSA 4FYCA 5DQYA 4K7OA 5KN3A 6GSTA 4DSQA 3GKMA 3HJMA 4XIHA 4LL1B 2K8SA 3DVXA 4L5OA 3ZMLA 4N0VA 1R26A 3FZAA 1YKAA 1USBA 4OCEA 1TK0B 1THXA 4O7HA 3E3EA 4EO3A 4I2TA 3HYPA 4XS6A 3TCOA 1J0FA 1DBYA 3C7MA 3BCKA 4L8EA 4IP6A 3CSJA 3LYKA 4JZQA 3KMNA 5A4VA 4AF2A 4PQHA 4QQ7A 3MAKA 3TKSA 1PL1A 3CRUA 2A2RA 2CA8A 3JCML 1K3OA 2VO4A 1DE1A 3QD9A 2O89A 5HR0A 1M99A 4EUYA 3GSTA 2YNXA 1BYEA 2WFCA 1PX7A 2VLVA 2PU9C 4DVCA 1W89A 7GSSA 1GSQA 3O6TA 2LRNA 2OE3A 5ECHB 3NIVA 2HRFA 5IPGA 22GSA 2C3QA 2PWJA 2YP6A 2VCQA 2MYGA 3ZVJA 3L0HA 1JLVA 1VRSD 2V6OA 3GTUB 2VL3A 2GZZA 1FVJA 3UVHA 1PKWA 3HD5A 4KSMA 1FW1A 2E2MA 4NHZA 4PNGA 1ILOA 1ERWA 3DWVA 3NZNA 4K2DA 2C0DA 1XW9A 2CV4A 1O85A 2V2GA 2R4VA 3G9BA 2H8LA 1SL0B 2P5RA 4EDZA 2EIOA 1M9BA 4F0CA 2FWFA 1YEXA 1T3BA 1BJXA 1BEDA 3GL3A 1V2AA 2WRTA 3U5RE 3IOSA 2O85A 3LSZA 16GSA 3ZFLA 4O32A 2E0QA 4K0NA 1K0NA 1QUWA 1JZDA 3GHAA 2KLXA 2AUVA 3PGTA 2N5AA 3I69A 4AJ7A 3KP9A 1IYIA 3KTBA 4TRXA 1PA3A 1XWBA 4AGSA 1CQGA 3GX8A 5JWQB 5LD0A 2VLUA 1Z6NA 2A2SA 2VM2A 1X5EA 4G9HA 2LJRA 4O92A 3QAWA 2CX4A 2YV7A 2B6MA 1GL8A 1B8XA 2G2QA 3F6DA 3L78A 1TDIA 4KNDA 4OMVA 1ERUA 3G7YA 2DMMA 5LNKe 4J57E 2IFQA 2RUEA 3LXZA 3HZ4A 1ZYQB 3D0ZA 2O8VB 5G5FA 3DGQA 1HNAA 1N8JA 2H1DA 2QC7A 2ZUPA 1X9SB 1F6MC 2CVKA 4ZL8A 2F9SA 3VWXA 3IE3A 3F3QA 1PD21 2CQ9A 2HE3A 2V1MA 1F9MA 4LLRA 2H1AA 2FGXA 3LG6A 3RBTA 1SJIA 1TI3A 2LRCA 3BJ5A 2GZYA 4DSSB 1SJZA 4IHUA 3ERWA 4WXTA 3FK8A 11GSA 2JZTA 1MD3A 1FO5A 1XCCA 3P7XA 3PINA 4MP4A 4MK3A 4ZIJA 4V2MA 14GSA 3KCMA 2V32A 4JR6A 3EMXA 4WF5A 5B6NA 3EU4A 4IJIA 4JBBA 3GRXA 1U87A 4WEYA 1K3YA 3TGZA 2HRNA 2H1BA 1XFLA 2TRCP 5KN0A 1EOGA 3TJFA 2H73A 3D4MA 4GQFA 2LV3A 3HXSA 1WP0A 2C1YA 3R2QA 5H5QA 1SK0A 6GSUA 3TRXA 4EC0A 5C04A 2C3NA 3D5JA 4K7IA 5G31A 3KEBA 5IMAA 4QL7A 3ED3A 2MBSA 2PN8A 2AV4A 3W6GA 4OFNA 4MZCA 1WMJA 3M9KA 4MZBA 1K0DA 3UARA 1YDKA 2O7KA 4LA1A 3ERFA 1FVKA 1MDKA 19GSA 2B7KA 4Q5FA 1ST9A 1B4PA 1F2EA 3A5WA 2H0IA 3FR9A 3KMOA 1ZOFA 4BWSA 5F06A 1FAAA 1XWGA 3H4KA 2PMTA 1M2DA 3C73A 4XHMA 4IS0A 3MNGA 4GQCA 4KGIA 8GSSA 5J41A 4IW9A 3GNJA 4ECCA 4IELA 1T4YA 1SKWB 3VURA 2PGTA 3KZQA 3TB2A 4XS4A 3QMXA 2YWMA 1V40A 4JE1A 4RQRA 2IJYA 4WBJA 5JCUA 2C80A 3FZ5A 4TW5A 1FHEA 2FA8A 1EV9A 3HVXA 3ZYWA 1VF2A 3ZIJA 3G7IA 2ZNMA 3VLNA 2YWIA 1XPVA 4Q5RA 4IQAA 5ELGA 2GS3A 3A2XA 3RPPA 2YCDA 5E59A 5IM9A 1I9DA 3M0FA 3GX0A 1ZCPA 3LGCA 1YF0A 4KH7A 4KCEA 5B6MA 2R37A 1X9WB 4G2EA 5HR2A 1UA5A 3IR4A 1YJ6A 3UEMA 4D73A 5D9WA 2X8CA 2YOIA 5F07A 4RI6A 2LEGA 3C1SA 3UMAA 4P3YB 2FWGA 5B7CA 5ECQB 4OFMA 4EE0A 2IMDA 3H79A 3TJKA 1J9BA 5J9BA 1THOA 5GSTA 6GSSA 2KOKA 3VPQA 3O3TA 4ZB9A 4WF4A 2GLRA 1O81A 1AW9A 5G2ZA 1GTBA 1TRVA 5D93A 3CSHA 5IOWA 1GUMA 4ZXGA 2OE1A 2VLTA 2EIQA 3BCIA 2LTKA 2OA7A 3DYRA 1XVQA 1ZYEA 3QAVA 2K8VA 1K0MA 2NTOA 2I4AA 2DJJA 5CRHA 4DEJA 1A2MA 2HT9A 2LJKA 5CO3A 1J08A 3L4NA 3WGXA 4MA9A 3CTFA 4NHWA 2AYTA 5D9VA 1HYUA 3J7Yb 4RI7A 1HNBA 2B5XA 1AQWA 3GFKA 2K6VA 1X9MB 1GSSA 3EINA 5IMCA 3SWLA 4TXVA 3HJOA 2E7PA 2MMOA 1KBNA 1N2AA 3CXGA 2MBTA 3LORA 5J5NA 3P2AA 2FNOA 3N9JA 5G30A 1O8WA 5GAPD 1ABAA 1SU9A 1WJKA 2R5GA 2VIMA 4PGTA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#similar chains, but unknotted
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#similar chains in the pdb database (?% sequence similarity)
...loading similar chains, please wait...
How to cite