1WIKA

Solution structure of the picot homology 2 domain of the mouse pkc-interacting cousin of thioredoxin protein
Total Genus 14
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
14
sequence length
109
structure length
109
Chain Sequence
b'GSSGSSGLKVLTNKASVMLFMKGNKQEAKCGFSKQILEILNSTGVEYETFDILEDEEVRQGLKTFSNWPTYPQLYVRGDLVGGLDIVKELKDNGELLPILKGESGPSSG'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule keywords Thioredoxin-like protein 2
publication title Solution Structure of the PICOT homology 2 domain of the mouse PKC-interacting cousin of thioredoxin protein
rcsb
source organism Mus musculus
molecule tags Electron transport
total genus 14
structure length 109
sequence length 109
ec nomenclature
pdb deposition date 2004-05-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00462 Glutaredoxin Glutaredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1wikA01
3N5OA 1PX7A 3IOSA 1TOFA 4GXZA 4ZBDA 4MLYA 2B5YA 3HVXA 2VM2A 2DIYA 3DMLA 1A2MA 3KGKA 2YCDA 2MMNA 5ECSA 2N5BA 4ECBA 5IIZA 4IJ3A 1E6BA 3KMNA 2FA8A 1FB6A 2R5GA 5KN1A 2PN8A 1J9BA 3WD6A 2WDUA 1WJKA 3FYGA 2RLIA 2N5AA 1V2AA 4V1Ag 3W8JA 1ABAA 1SYRA 2E7PA 3ZFLA 1KTEA 3CTGA 2H74A 2OBIA 1B8XA 2HRNA 2XBQA 2DC5A 3ZRDA 3H1NA 4K9ZA 2KUCA 5ECRB 2FUG2 1XPVA 2R37A 1DE1A 2TIRA 5CYYA 1T3BA 2WGRA 2A2RA 2PU9C 2HSYA 1J0FA 5D9XA 1DSBA 1PL2A 2YOIA 4ZB6A 3M3MA 2HZEA 3DXBA 3HY2A 3C1SA 2YJ7A 1WRYA 5DAKA 1GLQA 2RUFA 2OE1A 2OBKA 2CVKA 2C0FA 2I3YA 4KSOA 1Q98A 2AYTA 3M1GA 2WRTA 2K18A 1QXHA 3UBLA 1YEPA 2YWIA 1ZCPA 2PMTA 2X8CA 3MWHA 1PQNA 1WP0A 5GSTA 1K0DA 5HR3A 4MF7A 3EE2A 5IPHA 5LCZA 5EY6A 1AQVA 5G31A 1F37A 3HJPA 3ERFA 3UL3A 4F0BA 2FA4A 3N9JA 1RQMA 3RDWA 4QL7A 6GSWA 9GSSA 2XPEA 2L4QA 3GUSA 5DALB 2VD0A 2AUVA 1CQGA 1DUGA 1F2EA 1FOVA 2IMDA 4RI6A 2MMOA 2H1GA 4HS1A 2D2ZA 4MMMA 1LJRA 5JWRB 4IELA 3GSSA 4WBJA 1KEBA 3M8NA 4DEJA 3MAKA 5FWGA 1B9XC 3GHAA 3UJ1A 1R26A 4KW6A 1WPIA 3UAPA 2IMFA 4EDZA 3J7Yb 5A5KA 3I43A 2X99A 3EMPA 3GFKA 2PVQA 1ZYEA 4TR4A 3LG6A 3A2WA 3M9KA 4MPGA 3Q74A 1DE2A 1JZOA 3KJYA 4ZILA 3C71A 1K0MA 2LKUA 5AIXA 1H75A 2GT5A 4I6XA 4ILFA 2DLXA 2H70A 4GWRA 1M2BA 1Z6MA 4MJAA 4ML1A 2GLRA 4N0ZA 2FLSA 2M72A 3FR9A 4ZL8A 4TW5A 3G7YA 4FYUA 1G7OA 4IBPA 1OAZA 1XW5A 4PQIA 2GT6A 2V1MA 3L4NA 3H79A 3IV4A 2IWTA 4AJ7A 3Q6OA 5IMVA 3VI7A 2H76A 2R6KA 2JADA 4TRXA 3TOTA 4BPYA 1DBYA 4IW9A 1GTAA 1GUMA 1GSQA 1ERTA 1ZL9A 3KP8A 3GTUA 2B5EA 1T4YA 1TJDA 1M9BA 4PNGA 2OACA 2CT6A 2E0QA 2VL9A 5AISA 1YKAA 1ZGNA 4L0WA 3AY8A 4KE3A 1QFNA 2B1LA 3FR3A 3TKPA 2RM6A 4CHSA 1TK8B 3F9UA 4IN0A 1EGOA 3L0HA 3A3TA 3FRCA 1XW9A 4XS4A 4IGJA 1WWJA 4BL7A 4YAVA 1PKWA 2HE3A 4TXOA 2V32A 2H72A 3GIXA 3C8EA 1Z3EA 5D9VA 1XOBA 5A4UA 4EDYA 1IYIA 1T7PB 2FWHA 2H0IA 2L59A 3TRQA 1O6JA 2GQLA 5J9BA 1C72A 2XC2A 1AQWA 2YWOA 2FD3A 5DCGA 1V40A 2IPAA 1B48A 1SD8A 1EZKA 3RPNA 3UOMA 3EINA 3VPTA 3LFLA 3ZMLA 3HA9A 1AIUA 1M2DA 4MF5A 2OJLA 3CRTA 3P8WA 4AF2A 2LRCA 3TDGA 1O8WA 3TJBA 1U6TA 2TRXA 3KH7A 4K2DA 1PN9A 4KDXA 1XIYA 3FZ5A 3GYKA 3HZ8A 1BQ7A 2O85A 2H1DA 2VCVA 4KGIA 2GGTA 4ULXA 1A8LA 5CAXA 4L0UA 1O73A 3DRNA 1GTIA 2CV4A 1ON4A 3IPZA 2FY6A 4TXVA 3TJGA 3Q18A 2ZCTA 2F51A 1U3IA 4XS6A 3GX8A 2IFQA 1F3AA 4OCFA 4OWYA 2HNLA 3L9SA 5B8AA 3UBKA 1IYHA 3FW2A 3EMXA 1UA5A 2IJYA 3P7XA 4MCUA 3D4MA 1GSSA 5HR1A 1AW9A 2DJ3A 4PQ1A 1EEMA 12GSA 2IMKA 1OE8A 3GRXA 2V6KA 2GZYA 5J4UA 4HQSA 4CDOA 2VCQA 1NHYA 4YQUA 2H1BA 3ERGA 4MJEA 3KZQA 1M2AA 4TR1A 3A5WA 1V57A 2Z9SA 1SENA 3QR6A 1A8YA 3ZZXA 3HVVA 2FHEA 4GSSA 5ELAA 1GP1A 3LXZA 2DJ2A 3HJOA 3KD0A 4Z7XA 5ECQB 3CTFA 4HDEA 2O8VB 4O32A 5INYA 1ML6A 3KMOA 1ACVA 1TTZA 5F07A 3DEXA 2IN3A 2I9HA 2PERA 1GH2A 2LUSA 1TK5B 1M7TA 3KP9A 3GV1A 4WBRD 4YAPA 4X43A 2MYGA 2JZTA 3QDNA 1T1VA 5G2ZA 1QGVA 1O81A 2G2QA 4D73A 4ECCA 4V2NA 1H4OA 4ZBAA 4POMA 5DDLA 4G19A 2HI7A 2NPBA 3HXSA 1OC9A 1J08A 3QMXA 3VFIA 3IDVA 2HYXA 4HJ2A 3HJMA 4MJBA 2L5OA 4EXJA 3GKXA 3VK9A 1V9WA 5E4WA 2J9HA 1F3BA 5DBQA 2JZRA 4WETA 1TDIA 2K8VA 3FK8A 3O6TA 1GNEA 1EWXA 1XCCA 2H73A 2DJ1A 2HT9A 2F8AA 1XWAA 1JZDA 2N5FA 2HRFA 2VCTA 3F4RA 3HKRA 3L9UA 4X0XA 1N8JA 3W8SA 5CRHA 2YZHA 2WB9A 4O92A 2KLXA 4KCAA 2RUEA 3QOUA 4L5LA 2VLTA 1SU9A 2PPTA 2NDOA 4J56E 1V98A 2KP2A 3GL3A 3CBUA 1JZRA 5CO3A 2C4JA 4KCEA 3NIVA 2LRTA 2LV3A 1FB0A 3FZAA 2HFDA 4EE0A 5G1KA 4DSSB 1X9SB 3ZITA 1PRXA 5DJMA 2LQQA 5JWOB 2GS3A 4ECJA 2WCIA 2TRCP 5D96A 1OVNA 2H6ZA 3I9V2 2FCHA 5ECLB 2GZPA 2WULA 5KN0A 3DWVA 1SJ6A 1XWKA 1XZOA 4N30A 4BVYA 3HVSA 3OR5A 5IO0A 3P2AA 1EGRA 5DCHA 3O3TA 20GSA 1GULA 5IOWA 3VPQA 3LXTA 3C1RA 1YQ1A 1HNCA 3QAVA 1BAYA 3FZ9A 3TOUA 4Q5RA 5F06A 2H6YA 2B7JA 1WMJA 3U5RE 4V2LA 4GSNA 2V41A 3VWVA 3ISOA 3US3A 2GSSA 5LD0A 3KM6A 3F6FA 2L5LA 1MDJA 3A2XA 4WKWA 5ECPB 4I2TA 1THXA 1XWBA 3P90A 5CRWA 3CSHA 4NHWA 3GKNA 4HU9A 4K7IA 2YWMA 3F3RA 5IMZA 1O85A 4JU5A 2F9SA 3LYPA 1PL1A 3KTBA 1TU7A 5IMDA 1LBKA 1HYUA 1OYJA 1PGTA 2ON7A 4TKYA 5EVOA 3WGXA 3ZL5A 4V2MA 4HEA2 2AHEA 1Y25A 3TJFA 4NWYA 2MZCA 4AGSA 3TKQA 3UMAA 1Z7RA 2K8SA 5LNKe 3EU3A 1A2JA 4ZL9A 2FWGA 2R3XA 3ZLPA 2WZ9A 2ON5A 3HCZA 2VD1A 2AB6A 1HD2A 5HFKA 1UN2A 1GUKA 1ZMAA 5D73A 1KBNA 4ZB9A 3BJ5A 22GSA 1YDKA 3GSTA 1JZWA 1GLPA 5IO2A 4KH7A 2VCZA 3FHKA 4KX4A 4KSMA 1V58A 2B3SA 2H0GA 3MDKA 3PGTA 2R2JA 5D93A 3Q19A 1ZYQB 2FNOA 4WF5A 4IP6A 5ECIB 2DJJA 3LJRA 1A0FA 3LWAA 3DD3A 4YQVA 5JWQB 4WEYA 1GTBA 5KN2A 1QMVA 4MZCA 3TUEA 4OFTA 4TN8A 4GF0A 5FHIA 2VOCA 2KOKA 5AN1A 2FWEA 1WE0A 4FH8A 2EIOA 5E59A 4MF6A 4MH2A 2KHPA 2QGVA 2JL4A 3V1WA 4ID0A 5IMCA 5F05A 4POLA 4L5OA 2HSHA 4Q5QA 5EPFA 1YEXA 4RQRA 1YY7A 3VWWA 5G30A 2BJXA 2F8FA 2MMZA 1BJXA 1MTCA 4KDYA 4K0GA 3QFAC 1TW9A 1UC7A 8GSSA 4TVEA 1Y6EA 3BCIA 3EWLA 4HUAA 4FO5A 4MJCA 5KEJA 4AJ8A 5CRGA 1R5PA 1HQOA 3QPMA 3SWLA 18GSA 2LQOA 5D9TA 2LS5A 3DYRA 1VF2A 3ZYWA 5ELGA 3KTLA 3WT2A 1U88A 4GCIA 4QQ7A 2X64A 2C0GA 1GNWA 3BD2A 3TJKA 3ZVJA 1VRSD 3GA4A 3LQ7A 2H1AA 4P3YB 4WXTA 2HZFA 4NPBA 1X5CA 1PSQA 1K0OA 19GSA 2YP6A 5C00A 1X9WB 1MD4A 2NBSA 3HZ4A 4E8HA 4MK3A 3BCKA 1TRSA 4LA1A 1O7UA 4DSSA 6GSVA 1EV4A 1QK8A 4ECIA 1ILOA 4O7HA 2H66A 2E2MA 1M0UA 2H01A 2K9FA 1SK0A 5JCUA 1EP8A 2YANA 3GH6A 2IL3A 1AAZA 1URMA 3UIWA 4EVMA 2LJKA 1MEKA 1EV9A 5CREA 1XOAA 3IXRA 2XBIA 6GSXA 4XIHA 1WOUA 2HZEB 2PVOC 2OE3A 3PH9A 4XRDA 3KH9A 5DAKB 1GSFA 1RW1A 3TCOA 6GSYA 1NHOA 3ZVJD 3EYTA 1TXXA 2I1UA 6GSUA 1FO5A 1TU8A 16GSA 3VLNA 3DVWA 3HD5A 3PINA 1X5DA 1X5EA 1EOGA 2F3MA 5D9WA 3HDCA 4OFMA 4G2EA 4GRFA 3IAS2 2VUPA 1G6WA 5D8IA 4PUFC 4MDCA 2DIZA 5DJLA 2CAIA 1LU4A 2QC7A 2BMXA 3I6AA 1PA3A 1TI1A 4NAXA 1Q4JA 2CVDA 5IQYA 3RHCA 4WR5A 5H5SA 4BWQA 1B4QA 2V6OA 1FHEA 3DGQA 2VLVA 3FY7A 5IOXA 4EKZA 3GH9A 2RM5A 1EOHA 1K0AA 4XHMA 1K3YA 5DALA 3C73A 1UVZA 3QCPA 2H19A 2O89A 2YNXA 3IRAA 17GSA 4JE1A 2IIYA 1USBA 3WYWA 1QUWA 4I8BA 2VL3A 3LORA 3TRPA 3WT1A 2EIQA 1F6MC 4DSQA 4K7NA 1BYEA 1TRVA 4OFNA 1OE7A 2B6MA 2M46A 4WF4A 3U6VA 2DMLA 3F0IA 2CZ2A 2FGXA 2H30A 2C80A 5GAPD 2WS2A 3HYPA 3TKSE 3IK9A 4K6XA 5J3RA 4ZB8A 4J57E 1GSYA 4I5QA 4FYCA 5H5RA 5A4VA 4ZXGA 3L9VA 1S3DA 2CX3A 4PUAA 3H8QA 1SKRB 2VCXA 4EO3A 1PX6A 1XW6A 3APOA 2VO4A 2PWJA 2YV9A 6GSTA 3CXGA 3VURA 3LGCA 2ZNMA 5B7CA 2CQ9A 5JCGA 1Z9HA 2PGTA 2V2GA 1R5AA 2B5XA 3M0FA 1YZXA 4MZBA 1TKDB 4MA9A 4IHUA 3SBCA 3MSZA 4YH2A 3R2QA 3GTUB 3RAZA 4GTUA 4IQAA 4KUNA 5DQYA 4IVFA 2CVBA 2VL2C 3GL5A 5ABRA 1W89A 4N11A 4IJIA 5G5FA 3KCMA 2ES7A 4HU7A 1R4WA 5J5NA 2OA7A 2X8HA 4XS4B 1GSEA 2P5RA 3NOFA 2X8GA 5C04A 3KEBA 1A0RP 6GSSA 4HOJA 4TXOB 3FKFA 2DSAA 5ECKB 3F6DA 4EF0A 1BG5A 2C3QA 5COHA 2H0HA 2WJUA 4X1UA 3GX0A 2GSQA 2LNTA 3J7Yk 1OC8A 4NMUA 2JSZA 4F2IA 3APQA 4MH3A 2VCWA 4OO4A 3F4SA 5GAND 5JCWA 4RQXA 3ME8A 1R7HA 1EP7A 1YF1A 3D21A 1W4VA 3IK7A 3UVHA 3DIEA 4H86A 5CNWA 2XPDA 5EL8A 3QD9A 5ID2B 4K7OA 1THOA 3D6IA 1N2AA 2B1KA 2C3TA 1JLVA 2HXKA 2H75A 1XVWA 4O5RA 3APSA 2YPMA 3A2VA 1HNBA 5H5QA 1F9MA 4I2UA 5A4WA 4BA7A 1AC1A 2CZ3A 2H71A 2IFQB 3RBTA 2GQMA 4IS0A 4QL9A 3GMFA 5DVBA 4NHZA 3W6GA 2JACA 3IR4A 1SKSB 3S9FA 2YV7A 5DQSA 4ACSA 2AV4A 2VLUA 5HR2A 1GRXA 5G5EA 2QKEA 4E8EA 1CQHA 4NV5A 3E3EA 2LEGA 2XHFA 4TR1B 4K1FA 3TGZA 4JZQA 1JLWA 3QAGA 5HFIA 1NSWA 3ZIVA 1K3OA 1SYXA 3KXOA 4ISDA 4HZ2A 4ML6A 2EIRA 3K8NA 2JU5A 3ZIJA 3TKRA 4IKHA 4FYBA 3BOAA 4GSTA 5B6MA 3H4KA 2P5QA 3WGDA 2LTKA 1RK4A 4PGTA 2OE0A 1ERWA 4F0CA 5ENUA 4JEDA 5AIVA 3IA1A 2VL2A 2DJ0A 1ERVA 4NXIA 5AGYA 4KA0A 1T8EB 3CYNA 5G1LA 2PBJA 2L4CA 3VWXA 5B8BA 3QFBC 4D73B 3E9JB 3IAM2 3IHQA 4Q5NA 5CP1A 3CSIA 1U87A 1NM3A 4BWSA 1OC9B 3EURA 1Z5YE 1FW1A 3WGEA 1VF4A 4ZBBA 1XXUA 2ZUPA 2RIIA 2A4VA 2C0EA 3G7JA 2VIMA 4YQMA 2GSTA 2YWNA 4KNDA 3BBYA 3UVTA 4JBBA 4PXOA 1MDKA 3VWUA 3ZFBA 3F4TA 5ECMB 4FIWA 1SK1A 3F63A 3L78A 5IMFA 1U3AA 2IMIA 1K0CA 3TRXA 4OD7A 2P0GA 4N0VA 1S3AA 1YKCA 1T00A 2DJKA 2E2GA 2JSYA 3UARA 4LL4B 4HZ4A 2LRNA 3ERWA 4LMVA 1FVKA 3QAWA 1ZZYA 3IE3A 2B7KA 1T4ZA 1E2YA 13GSA 4KAEA 1SD9A 1YF0A 5F8BA 1A23A 2EC4A 4OO5A 3VI5A 5KN3A 4EL1A 3F3QA 5HR0A 1QQ2A 4F03A 2IMEA 2CA8A 1GTUA 3H93A 1XBSA 3TJJA 1ERUA 1BEDA 4GLTA 5J41A 2JZSA 3RHBA 1BX9A 4L8EA 2GZZA 1A2LA 4JRRA 2NTOA 3IBHA 2HLSA 1TK0B 4MZWA 1M9AA 3C7MA 2J23A 3EC3A 3MNGA 1GWCA 4XRAA 3LYKA 1FAAA 3UEMA 1G0TA 3ZTLA 5GZZB 2M80A 2VAFA 2VM1A 3DKSA 10GSA 4XS1A 1AQXA 14GSA 3PR8A 2FWFA 5L71A 2C0DA 1M99A 3NZNA 4DVCA 5J9CA 1I5GA 2L6DA 3GKMA 3KIJA 2OADA 2MMAA 2NVLA 3FZ4A 3CMIA 4OMVA 3TKSC 5GSSA 2OKAA 2YJHA 4MPFA 3DVXA 3CRUA 1ZOFA 1KNGA 2ALBA 4PNFA 4EC0A 4LMWA 3ZREA 5ID2A 2LSTA 2LNSA 4MP4A 1K0BA 3D22A 5IMAA 1VF1A 4POBA 1GL8A 2I4AA 3CSJA 2C8UA 2GVPA 1I9DA 3EU4A 3HHVA 4EUYA 4IQ1A 5IPGA 2L6CA 3RPPA 1SJZA 1XWCA 1K0NA 3G9BA 1B9YC 3D4TA 11GSA 4KDUA 4GQCA 1AXDA 1XWGA 2O7KA 1HNAA 1X0RA 5B6NA 5IM9A 4N10A 4TOPA 4JR4A 1ST9A 5CRDA 1TRWA 1PMTA 4POKA 4K0NA 2AAWA 2MBTA 1B4PA 1VGLA 1K3LA 4OCEA 2CAQA 1OC3A 3ZMKA 1X9MB 4CW9A 2LJRA 4PQHA 2O87A 2GDRA 4LL1B 1PD21 1O8XA 1G7EA 4HI7A 4G9HA 3GNJA 1JHBA 1G6YA 1TI3A 4WR4A 2DMMA 3M9JA 1AUCA 1FVJA 4KB3A 1SL2B 1SK2A 2H6XA 4PURA 5F0GA 3D0ZA 2L57A 2YZUA 4Q5FA 4F9ZA 2GTUA 1OKDA 5ECHB 3G7IA 4RUVA 1XVQA 4HJMA 2DBCA 1WIKA 1FG4A 1GSDA 1OKTA 2GSRA 3F8UA 3EVIA 1MDIA 4XCSA 2PUKC 3GURA 2KP1A 2P31A 1TP9A 2K6VA 4AJ6A 5HQPA 3GKKA 3ME7A 7GSSA 3D5JA 4NV2A 5ECNB 5ECOB 5FT3A 3FR6A 4JR6A 4TR0A 1JFUA 1SKWB 2I81A 3E0UA 4RI7A 3TB2A 1SL1B 1MD3A 1VF3A 1SJIA 3IC4A 4BVXA 1GUHA 2AJQB 4GQFA 4ZL7A 2G0FA 1GSUA 4IP1A 4HQZA 4K8MA 2LJAA 2C3NA 4PX1A 4I97A 2GQKA 4V1Ap 3ED3A 1Z7PA 2C1YA 4DSRA 2A2SA 3GN3A 3LSZA 1EEJA 3O76A 1XFLA 4MABA 1PKZA 2CX4A 5HFGA 1A24A 1TRUA 3FEUA 2R4VA 1Z6NA 3JCML 4G10A 1SL0B 4LLRA 2QSIA 3TKSA 4XTSA 3I69A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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