1WIKA

Solution structure of the picot homology 2 domain of the mouse pkc-interacting cousin of thioredoxin protein
Total Genus 14
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
14
sequence length
109
structure length
109
Chain Sequence
GSSGSSGLKVLTNKASVMLFMKGNKQEAKCGFSKQILEILNSTGVEYETFDILEDEEVRQGLKTFSNWPTYPQLYVRGDLVGGLDIVKELKDNGELLPILKGESGPSSG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Electron transport
source organism Mus musculus
publication title Solution Structure of the PICOT homology 2 domain of the mouse PKC-interacting cousin of thioredoxin protein
rcsb
molecule keywords Thioredoxin-like protein 2
total genus 14
structure length 109
sequence length 109
ec nomenclature
pdb deposition date 2004-05-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00462 Glutaredoxin Glutaredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1wikA01
4IQAA 4HDEA 5H5SA 1OC8A 3J7Yb 5F0GA 2B1KA 4L0WA 5E59A 4IP6A 4V2MA 5J9CA 3LG6A 1SKSB 1F6MC 1A0FA 3WD6A 1VRSD 3HZ4A 2HSYA 2ES7A 3IAS2 3QOUA 1G6YA 3GTUB 3FKFA 4ISDA 5IMVA 1OYJA 2CQ9A 5KN0A 3O6TA 1ILOA 4I2TA 4IHUA 5G1KA 1X5DA 3LGCA 5EVOA 13GSA 1H75A 4DEJA 2IMIA 2YV7A 2OJLA 4OD7A 3R2QA 2JL4A 2CVBA 3Q19A 2K9FA 4NWYA 3LEFA 1B9XC 2D2ZA 3LYKA 2DMLA 5ECRB 1SL1B 1EZKA 1JFUA 2F8FA 4EXJA 2PMTA 3A2VA 4K6XA 5LD0A 5LNKe 1Z5YE 2FWGA 1WE0A 2YP6A 2EIRA 2LQQA 4DSRA 1EP8A 1T4YA 3KP9A 3LORA 3KXOA 3VWXA 5ECQB 4RI6A 4I97A 1Y6EA 1F3AA 2PUKC 5DDLA 3MSZA 1O8XA 3TKSA 1U88A 3ZZXA 4EKZA 5D9WA 1QFNA 2OKAA 4N0VA 3ZTLA 2C80A 2L5OA 3KZQA 1TI3A 2P31A 2H76A 3ZMKA 4CHSA 3VK9A 4L0UA 4MDCA 1WOUA 1DUGA 2HT9A 2F3MA 3NOFA 5DCGA 3M1GA 3APQA 3CYNA 3BD2A 2QKEA 4K8MA 4KE3A 1PMTA 3KGKA 4MJCA 4YAVA 6GSWA 2R3XA 3W6GA 1KEBA 3IHQA 4D73B 3BCIA 2OA7A 3EMPA 3C7MA 4F0CA 2PU9C 1Q4JA 3BOAA 1FOVA 4ZB9A 2L4CA 3DD3A 4JZQA 2VM2A 1U6TA 2V6KA 1G7EA 3KJYA 4XS1A 1Z3EA 1TRWA 5CRHA 1GUMA 4YQVA 4F9ZA 5B8BA 3WGXA 6GSSA 4ZXGA 3F3RA 1PX7A 4POMA 3TUEA 1EOGA 3TJKA 5EY6A 2I9HA 1F3BA 3ZFLA 5DQSA 2JSZA 2GSSA 4PGTA 4K9ZA 5ECPB 2WCIA 1XBSA 1B4QA 3QCPA 2R5GA 1T1VA 3PH9A 4BPYA 1EV9A 4HJ2A 1FB6A 1GLPA 1HNBA 2PWJA 3L78A 1XWAA 5F07A 5J5NA 3K8NA 2JZRA 3UVTA 3KMNA 1ERUA 2LUSA 4KH7A 4ECBA 3LYPA 1EGOA 3QD9A 2WGRA 2N5BA 4IN0A 3U6VA 2GZYA 3WYWA 5D96A 4MA9A 4WBJA 4OFNA 1TKDB 1GSQA 5IM9A 2L4QA 2H01A 1THXA 2A2RA 3KP8A 5CP1A 2B1LA 3GKMA 1BEDA 3IXRA 20GSA 2AJQB 4OFTA 4AF2A 1FW1A 2J23A 2DJ3A 1OC3A 4H86A 5D8IA 1YEXA 2WRTA 4KSMA 2EIOA 4XS6A 2PPTA 1Z9HA 1YEPA 1SKRB 1SYRA 1VGLA 3QDNA 2NTOA 2GZZA 1EP7A 4GWRA 1N2AA 3FRCA 1SK1A 1PL1A 2GT5A 5F06A 1LBKA 3H1NA 2NPBA 1IYIA 1JZDA 1DE2A 2VCTA 4IKHA 4PQIA 4MJEA 3SWLA 1ZGNA 2MBTA 3NIVA 3ZYWA 2REMA 3L0HA 4GQFA 3F4SA 1EOHA 2A4VA 6GSTA 2AV4A 3KH7A 4IQ1A 2VLTA 3VPTA 5ECOB 5J41A 2HFDA 2IIYA 1J0FA 4HZ4A 1JHBA 1SJIA 3BCKA 5DJLA 2C8UA 4KGIA 1GLQA 2AAWA 2KP2A 4TR3A 2F51A 5AIVA 2RM6A 5B8AA 5C04A 4HQZA 1ZCPA 1ZMAA 2H73A 4TXOA 2FY6A 3UIWA 5JWRB 2VIMA 2M72A 1HNCA 3FR6A 3HJOA 3OR5A 1ABAA 3HVSA 2LV3A 3GKXA 1LU4A 3GRXA 3ME8A 3IR4A 3EU4A 2YZUA 4ZBDA 1PD21 1NM3A 3DVXA 4BVYA 3IK9A 3M9KA 2LNSA 2DIZA 2XPEA 1QQ2A 3LWAA 1GULA 4GLTA 2VCZA 4PXOA 2XBQA 5C00A 1M2DA 1QGVA 2FWFA 4IBPA 2VD1A 4X1UA 1M9AA 4ZBAA 5DQYA 1EGRA 1PRXA 4GQCA 2NBSA 5G2ZA 1K0NA 5IQYA 3DRNA 2BTOT 1XOBA 4OO5A 3TRXA 3LQ7A 1SU9A 5HFKA 6GSVA 4KAEA 3A3TA 2EIQA 5HR0A 4MCUA 4ECIA 2MMOA 1FAAA 2QC7A 1ZOFA 3MAKA 2P5QA 4TN8A 1F9MA 2JZTA 1EEMA 4KCAA 4E8EA 4Q5NA 3PINA 3VURA 1WWJA 2GT6A 5DALB 1V57A 1N8JA 2K8SA 2VLVA 3D4MA 2NDOA 3FK8A 1A2JA 2HRFA 2O7KA 2OE0A 5IMCA 3KM6A 2GTUA 4KNDA 3CRTA 12GSA 1OKTA 4O5RA 4J57E 5ECMB 2X64A 4K7IA 2H0GA 4WF4A 4JU5A 1ACVA 4XRDA 3CSHA 1V9WA 3HZ8A 4DVCA 18GSA 3DYRA 3N9JA 2B5XA 4MH3A 2ON7A 1K0OA 4ZB8A 2WULA 3DEXA 4NXIA 3UARA 4MZBA 4YH2A 2PBJA 4LA1A 5H5QA 3MDKA 2WDUA 5DCHA 1O8WA 2YWIA 2KHPA 2JADA 1XCCA 2O85A 2YCDA 3CSJA 3IPZA 2DIYA 3RBTA 4HZ2A 2HNLA 3VI7A 4IJ3A 3KD0A 4G10A 3TKPA 3TOTA 1J9BA 3H79A 4I5QA 3D21A 4N10A 4HEA2 4P3YB 2MYGA 5JCGA 2LJRA 1SL2B 1F37A 3DXBA 4L8EA 1FVJA 2YZHA 3IA1A 1MTCA 4JEDA 1MD4A 2E2MA 4MJAA 1S3CA 2HE3A 1IYHA 2GSQA 4O92A 4KUNA 1O6JA 5ECNB 2MMAA 4TXOB 2GVPA 5KN1A 3G7YA 1A23A 4V1Ag 1F2EA 4KDUA 4YQUA 1Z6NA 2OE3A 5EPFA 1USBA 1ML6A 5D93A 2AUVA 3BBYA 4GSNA 2HZFA 4WETA 1U3AA 1GSEA 4MPGA 3GH9A 3ISOA 4N11A 3DWVA 1X5EA 2E2GA 2H72A 1OAZA 3IK7A 3EMXA 4TXVA 4TR4A 3ZL5A 3CRUA 3FW2A 3IC4A 3UOMA 3HVXA 3ZIVA 4POLA 1FG4A 2X99A 3F6FA 2IMDA 1ERWA 5KEJA 1Y25A 2GQKA 4FYCA 1BQ7A 2IWTA 1BAYA 4X43A 5INYA 1M7TA 3LXTA 2MMNA 2WZ9A 4DSQA 3ERWA 2GGTA 22GSA 3O76A 5A4WA 4WKWA 4ECJA 3E3EA 1U3IA 4ULXA 1X9WB 1X0RA 1T8EB 3TDGA 2L6CA 1YF1A 4XIHA 1GUHA 1FHEA 3AY8A 2GSRA 6GSYA 3HJPA 10GSA 2DJJA 1RK4A 4JE1A 1B8XA 4K1FA 3HY2A 2V2GA 1GRXA 2P5RA 1URMA 1KNGA 5HFGA 1G6WA 3C71A 2B7JA 3I69A 1O81A 2EC4A 2CAQA 4QL7A 3LJRA 3P8WA 1GP1A 4F03A 2V41A 3FY7A 4QQ7A 1HD2A 2CAIA 3HVVA 4OO4A 2IMFA 3KCMA 5IOXA 5IMDA 2ZNMA 2R37A 2YWOA 2JACA 2H66A 3QFAC 2NVLA 3RHBA 1C72A 1E6BA 3GL3A 1MD3A 4EDZA 3CTFA 1GSFA 4PURA 3GN3A 5FT3A 5E4WA 4CDOA 3ZREA 1GTBA 2DJKA 1XVWA 2C1YA 1B4PA 4TKYA 4ZIJA 2H0IA 3ME7A 4K7NA 1PA3A 4I2UA 5IOWA 5B7CA 1GUKA 3KTLA 2E0QA 2CZ3A 4ZBBA 1DBYA 2GS3A 2H71A 3ZRDA 1T3BA 4HJMA 3GMFA 2YPMA 3F9UA 2JZSA 3GUSA 5ID2A 1S3DA 5IPGA 2C0FA 2VCWA 2CV4A 3ZITA 3C73A 1H4OA 2CX4A 1YZXA 1O7UA 4XHMA 4TR0A 1R5AA 2B5EA 2YOIA 3G9BA 1AQWA 3TCOA 1Z7RA 1XW6A 4X0XA 4Q5QA 5COHA 1A2LA 4XTSA 4NHZA 4WR5A 5CREA 2VCXA 4MF7A 1AQXA 2WB9A 4I8BA 3GFKA 4LLRA 1TK0B 2TIRA 3HCZA 5HR1A 4EC0A 5D9XA 3UL3A 5CNWA 5A4VA 3HYPA 4WBRD 2RUFA 5D73A 3KEBA 1AAZA 4MLYA 1GH2A 2BJXA 5DALA 3BJ5A 2YJ7A 3WGDA 2LNTA 2AB6A 1BYEA 5H5RA 3M9JA 2V32A 4PQ1A 2PN8A 4AGSA 1TOFA 5ABRA 2IL3A 3JCML 3DGQA 5AISA 2LTKA 1PX6A 1TI1A 5EL8A 5G5EA 2VO4A 4WF5A 2HZEA 1NHYA 1MDKA 2IN3A 5DVBA 1R5PA 1J08A 3L9SA 2FWHA 2HRNA 3PGTA 3M3MA 2VM1A 4L5LA 4TVEA 1GNWA 4CW9A 5IO0A 4NV5A 1CQHA 1K0CA 4HQSA 3GA4A 1BX9A 5G5FA 1O85A 3CTGA 4EO3A 3TRPA 1GTIA 1XPVA 1VF1A 5B6MA 3UMAA 2L59A 5CO3A 1AW9A 2LJAA 2OE1A 5ECHB 1XXUA 2B3SA 4BWQA 11GSA 1GTUA 2FWEA 2HSHA 1Q98A 1M2AA 4PUFC 2MMZA 3KTBA 5GAPD 3GL5A 2CVDA 3TKQA 4KCEA 3GSTA 2H6XA 1NSWA 5GSSA 5CRGA 1WPIA 4AJ8A 6GSXA 3KH9A 1XOAA 2CT6A 2KOKA 4MZWA 3J7Yk 3FYGA 5ENUA 4BA7A 1SJ6A 3RHCA 3VWVA 4HOJA 3IRAA 1SD9A 2ON5A 3WT1A 4NV2A 1M9BA 1YF0A 2XBIA 5FHIA 3N5OA 2KP1A 2H1AA 3IV4A 4LMVA 1VF4A 3EVIA 3QMXA 2H74A 2IMEA 4MMMA 5ID2B 4ZL9A 2CZ2A 5DBQA 1QK8A 4FYBA 4JRRA 2XPDA 2YANA 1TRUA 4NPBA 3VFIA 3SBCA 5HR2A 1EEJA 5KN2A 1UC7A 4PNFA 3TJGA 1X9SB 3GURA 3F4RA 3M0FA 2H70A 2K6VA 1W4VA 1JZRA 1ZZYA 4MP4A 1UA5A 2X8HA 1SK2A 1XWBA 2VL2A 5IPHA 3RPNA 2O87A 3RDWA 1PQNA 4NHWA 3QFBC 1K3YA 19GSA 4IP1A 2N5FA 2XHFA 3TGZA 1GSSA 3G7JA 4O7HA 3H8QA 1W89A 2YV9A 4ZL8A 3C1SA 1I9DA 1YJ6A 1CQGA 1TW9A 2N5AA 1T00A 2VCVA 5G1LA 4TOPA 1EV4A 1HYUA 2B7KA 4IVFA 4MK3A 2H1DA 4EF0A 2LSTA 1LJRA 2HZEB 1Z7PA 3VWUA 4JBBA 5ECKB 3IDVA 2VUPA 2BMXA 1HQOA 4K7OA 4KDXA 4JR4A 2Z9SA 4XS4A 1AXDA 3EWLA 1OE7A 4Q5RA 1YQ1A 1U87A 2LQOA 3FR3A 4LL4B 2DMMA 2G2QA 3D6IA 3GHAA 1X5CA 2K8VA 3TJFA 5F8BA 3ED3A 3EURA 1Z6MA 1AC1A 3L4NA 2HYXA 1JZOA 5AN1A 1DE1A 3P90A 3EYTA 3VI5A 4IELA 2H1GA 2ZUPA 2HI7A 1TU7A 3RAZA 1BJXA 1TDIA 2L6DA 2B6MA 4Q5FA 2VD0A 1XWCA 2I3YA 16GSA 4PX1A 1R7HA 2WJUA 3IOSA 4EDYA 4GRFA 2J9HA 2MBSA 4ID0A 3ERGA 1K0DA 4V1Ap 3V1WA 3C8EA 5CYYA 2LRTA 4G9HA 2YWNA 1YKCA 1MDIA 2OBKA 3F0IA 4YQMA 4MH2A 2V6OA 2DBCA 4ILFA 1GNEA 2QSIA 4GXZA 3GIXA 5CRWA 4GSTA 2ZCTA 4EVMA 3F63A 3ZVJA 3LSZA 2M46A 2C3NA 5ECLB 2B5YA 3QPMA 4TRXA 3QR6A 1OC9A 4WXTA 3ZLPA 1PKWA 2X8GA 2GLRA 4RQXA 3HKRA 1VF2A 1MEKA 3UAPA 1ON4A 2DJ0A 1THOA 3MWHA 3U5RE 2C0DA 3EINA 4AJ7A 5ECSA 3Q18A 3LFLA 1TU8A 2WFCA 2IFQA 1V40A 3UEMA 5IIZA 3TKSC 2VAFA 5A4UA 4ACSA 4IS0A 3I6AA 4LMWA 1XWGA 5KN3A 1M2BA 1QXHA 5G30A 1GL8A 2LS5A 1SJZA 3A2WA 1SK0A 2H1BA 5J9BA 3TRQA 1YY7A 4MJBA 5FWGA 4JR6A 1X9MB 4FH8A 4MF6A 3W8SA 1GSUA 1R26A 2I4AA 3UJ1A 3WT2A 1B48A 4MZCA 4ZL7A 1M99A 2CA8A 3TKRA 2I81A 4IGJA 1GWCA 1V98A 1WP0A 3D22A 2OACA 1SD8A 4OFMA 3C1RA 3P7XA 8GSSA 4KSOA 3QAVA 1FB0A 3G7IA 5LCZA 2R2JA 2IMKA 1K3OA 3HA9A 4V2LA 14GSA 3FZ4A 4L5OA 4XS4B 2FA4A 2DSAA 2H75A 4V2NA 1PSQA 3ZMLA 4GF0A 7GSSA 4N30A 1NW2A 5JWOB 1HNAA 2CVKA 4K0NA 2H30A 3W8JA 3D0ZA 3IBHA 5AIXA 1PN9A 1JLWA 2DJ2A 3GYKA 3FZ9A 1WMJA 5DAKA 4F0BA 3FEUA 5B6NA 4F82A 3UBKA 4POKA 4RUVA 3GNJA 1RQMA 5ECIB 3NZNA 5J3RA 2WS2A 4TR1A 2OBIA 3ZVJD 1GTAA 2KLXA 4NAXA 2RM5A 3L9UA 1K0AA 3VLNA 5ELAA 1TRSA 5IO2A 1TTZA 4FO5A 1XIYA 2KUCA 4ZILA 1FVKA 2FD3A 4GTUA 1FO5A 1G0TA 1GSDA 4POBA 2MZCA 3IAM2 3GKNA 2M80A 2FLSA 1V58A 2GQLA 2E7PA 3F4TA 3KIJA 1T7PB 4ML6A 4KDYA 2C3QA 3FZAA 5GAND 1OC9B 3ZIJA 3LXZA 2GSTA 1PL2A 3ERFA 5IMFA 2R4VA 1JLVA 3TKSE 3Q74A 5HFIA 1ZL9A 4LL1B 3GH6A 3S9FA 3O3TA 4RQRA 1QMVA 2G0FA 1R4WA 1VF3A 1TJDA 3GV1A 2IFQB 2DC5A 3M8NA 4ZB6A 5IMZA 2JU5A 3DVWA 1K3LA 4OWYA 4BL7A 3RPPA 2YWMA 1TRVA 2FNOA 3GSSA 3A5WA 1O73A 1XFLA 2VOCA 3E9JB 1ERTA 2XC2A 4KW6A 3A2XA 2H0HA 5J4UA 4HI7A 6GSUA 1GSYA 2C0EA 4TW5A 2V1MA 1OE8A 3GX8A 1K0MA 4O32A 3ZFBA 2L57A 2CX3A 2TRXA 3DIEA 1A8LA 1AIUA 4BVXA 4DSSA 1E2YA 1SYXA 2H8LA 2O89A 1KBNA 1UN2A 4WEYA 2LKUA 1SL0B 5DJMA 1PKZA 2IPAA 1ERVA 4G19A 2FUG2 1AQVA 3CMIA 4OMVA 4PNGA 3EE2A 5D9VA 1QUWA 2AHEA 1MDJA 2VL9A 2VLUA 4E8HA 4J56E 4AJ6A 4MF5A 5HR3A 1TXXA 2FCHA 4WR4A 3I9V2 1NHOA 2H19A 4F2IA 4EL1A 3FR9A 5G31A 2H6ZA 3IE3A 3F8UA 2PVOC 5A5KA 4Z7XA 2P0GA 5GZZB 4IJIA 2DLXA 2DJ1A 4J2FA 5DAKB 1A0RP 1V2AA 3HJMA 1WIKA 4MABA 3PR8A 3TJJA 2H6YA 2LRCA 1OKDA 3I43A 1TK8B 2HLSA 4I6XA 1UVZA 3F3QA 1G7OA 1SKWB 4IW9A 4HUAA 4TR1B 3APOA 3GTUA 5F05A 3HD5A 2PERA 3CXGA 2LRNA 2C3TA 2FHEA 4BWSA 1TK5B 2VL2C 2LEGA 3UVHA 3P2AA 2ALBA 4HU7A 3EU3A 2JSYA 5ELGA 4ECCA 3GKKA 4RI7A 3EC3A 4PQHA 4GSSA 2QGVA 2A2SA 2RLIA 2PGTA 4GCIA 2RIIA 1TP9A 1PGTA 2GZPA 2IJYA 5JCUA 4N0ZA 4NMUA 1YDKA 4XCSA 3APSA 3US3A 3D4TA 3CBUA 3TOUA 2YJHA 1KTEA 1ZYQB 2YN1A 2FA8A 9GSSA 3H4KA 3FZ5A 1I5GA 1BG5A 4KX4A 1SENA 4XRAA 3GX0A 3QAWA 3DKSA 1DSBA 4YAPA 1XW5A 3MNGA 2AYTA 2YNXA 1B9YC 1JZWA 1XW9A 2R6KA 2O8VB 4EUYA 2X8CA 4KA0A 2GDRA 4HS1A 3TB2A 2VL3A 2L5LA 3KMOA 4ML1A 2C0GA 5IMAA 4K0GA 2GQMA 1XWKA 3HHVA 2HXKA 3F6DA 2C4JA 1EWXA 1XZOA 4FYUA 3VPQA 3CSIA 3QAGA 1ZYEA 4G2EA 1A2MA 4FIWA 17GSA 1RW1A 4K2DA 1M0UA 1S3AA 5L71A 3HXSA 5HQPA 4DSSB 4QL9A 5CAXA 3FHKA 3H93A 3VWWA 2RUEA 4PUAA 1A24A 1ST9A 1WRYA 2FGXA 2TRCP 5JWQB 2F8AA 1AUCA 2VCQA 2OADA 3UBLA 4D73A 1T4ZA 3WGEA 4HU9A 1A8YA 3DMLA 5AGYA 2LJKA 3TJBA 4MPFA 4EE0A 4OCFA 1YKAA 4OCEA 1OVNA 3Q6OA 1K0BA 2PVQA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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