The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
62
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sequence length |
153
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structure length |
153
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Chain Sequence |
GLSDGEWQQVLNVWGKVEADIAGHGQEVLIRLFTGHPETLEKFDKFKHLKTEAEMKASEDLKKHGTVVLTALGGILKKKGHHEAELKPLAQSHATKHKIPIKYLEFISDAIIHVLHSKHPGDFGADAQGAMTKALELFRNDIAAKYKELGFQG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Oxygen transport
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| molecule keywords |
MYOGLOBIN
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| publication title |
A myoglobin variant with a polar substitution in a conserved hydrophobic cluster in the heme binding pocket.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Equus caballus
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| total genus |
62
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| structure length |
153
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| sequence length |
153
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 1997-09-24 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1HDA B; 1O1L A; 3WFW A; 5JDO F; 1ECA A; 1X3K A; 1C7D A; 5B84 A; 4NZI A; 1MBO A; 3PI2 A; 1Z8U B; 3OZW A; 1DUK A; 1ABY A; 1XCH A; 1LTW A; 1BVD A; 1YMB A; 1MNH A; 108M A; 1LHT A; 4O1T A; 1DWT A; 3ECX A; 1S5Y A; 3UHS A; 1SHR A; 1HGA B; 4G1B A; 2ZT0 A; 1Y85 A; 2FAM A; 1NQP A; 2G0Z A; 2VEB A; 3S48 C; 4KMV A; 2EF2 A; 2HZ1 A; 1BAB B; 3WCV B; 2MGB A; 2G14 A; 3PIA A; 3U3E A; 5HLQ A; 1FCS A; 4ROM B; 4MQG B; 2VLX A; 3DHT A; 1YFF B; 1HBB A; 1Y8K A; 1V4W A; 3FS4 A; 2CMM A; 1YIE A; 3EDA A; 4NXC A; 4TYX A; 3NL7 B; 3RJN B; 3E5I A; 2DN2 B; 1MTI A; 1HGB B; 1LFT A; 2VYW A; 2O58 X; 1FN3 A; 3QM9 A; 3WTG B; 1BUW A; 1HRM A; 2W6X A; 1YMC A; 1A00 A; 5ILE A; 1JZL A; 1PBX B; 3UBV A; 1O1J A; 4O2G A; 1BZZ B; 5C6Y A; 1JF3 A; 1X9F D; 1MYG A; 4MBN A; 3GQP A; 1FDH A; 3ARK A; 4MQK A; 1NEJ A; 4F6B A; 1F5O A; 4X0L A; 1S0H B; 2PGH A; 1Y7D A; 1QI8 B; 1C7B A; 2ZFB A; 5KKK A; 1UIW A; 2H8D A; 1GZX B; 1R1X B; 1T1N B; 1MLO A; 1CG5 A; 111M A; 5SW7 A; 1A0Z B; 1LHS A; 4N7N A; 1M6M A; 1B86 B; 1DXU A; 3IC2 A; 5EYJ A; 1YIH A; 3BJ3 A; 3GYS A; 3HXN A; 2HHE B; 2W6V B; 1WVP A; 5CN9 A; 3WCP B; 1YEO A; 1Y2Z A; 2KSC A; 1RQA B; 2HBC B; 3G46 A; 3ZJJ A; 1V9Q A; 3PI3 A; 4O35 A; 4F6J A; 101M A; 106M A; 4MXK A; 3MJP A; 3ODQ B; 3ZHW A; 4JAC A; 1XXT B; 1HBR A; 2EB9 A; 1RQ4 B; 1S5X B; 1Y31 A; 1HGC A; 2XKH A; 3G52 A; 4H0B A; 1UVY A; 1MLN A; 1LFL A; 4WJG A; 2QU0 A; 2QSP B; 2MB5 A; 1GBV A; 1Y0T B; 2AV0 A; 1XZV A; 3WCT A; 3PI9 B; 2XYK A; 2H35 B; 3A59 A; 2HBD B; 4IRO B; 3ZJN A; 1AJ9 A; 5AZR A; 5E6E B; 3WCV C; 1KFR A; 4N8T A; 1XZ4 B; 5F0B A; 1CLS A; 1UFJ A; 1QXD A; 2AA1 B; 1GDI A; 1YEN B; 1Y7Z B; 1SDL B; 1HBG A; 2ZLW B; 1LFY A; 2VYY A; 1BIJ A; 1NXF A; 3HF4 B; 1LJW A; 3AT5 A; 1DWR A; 4AVE A; 1O1N A; 1Y5F A; 4XS0 B; 3KUO A; 1KD2 B; 3PT7 B; 5EQM A; 1MLH A; 3FH9 A; 1BZ0 A; 4NK2 A; 1Y5K B; 3OZU A; 5JDO D; 1YHU D; 1L2K A; 3GDJ B; 1CH5 A; 1NZ4 A; 3A0G B; 1JZM A; 2V1I A; 3UHQ A; 2WTH A; 4U8U D; 3ONZ A; 1YEV B; 4MQH B; 1BJE A; 4U8U B; 3UH3 A; 2DXM B; 3QM8 A; 4HRT A; 1JEB A; 1IBE B; 2GTL A; 2LH5 A; 2EVK A; 1A0U B; 3KUN A; 1MWB A; 2MGK A; 4MQJ A; 1MKO B; 1HJT A; 1G09 B; 1XYE A; 3UGZ A; 1MLQ A; 1LH5 A; 1K0Y A; 1GLI A; 4MQC A; 3MBA A; 2QSS A; 3TM9 A; 105M A; 1LFZ B; 4YU4 A; 3HYU B; 1DO1 A; 2ZT3 A; 2Z6N A; 3ZJI A; 4PQB A; 3EOK B; 3EU1 B; 3TLD A; 3VRE A; 3WFU A; 3ZJL A; 2ZS0 B; 1MOC A; 3IC0 B; 1XZ7 B; 1A01 A; 1CMY B; 2GNW A; 1YEQ B; 3WCU B; 1YG5 B; 1TU9 A; 1X9F A; 2FAL A; 2RAO B; 3S66 B; 3D4X B; 1SWM A; 1BZR A; 5AZQ A; 3M3A A; 3BJ2 B; 3G4W A; 1J3Y B; 2OLP A; 1HBA B; 1QI8 A; 4ZVA A; 2SPO A; 4MXL A; 1O1K B; 3D7O A; 1J7S A; 1S6A A; 1R1X A; 3ARL A; 2O5T X; 1NPF A; 1H97 A; 3CY5 A; 1NIH B; 4ILZ A; 5D1V A; 2DC3 A; 5EE4 C; 1JP9 A; 2V1H A; 1LUE A; 1NS6 A; 6HBW B; 1Y4P A; 2ZSS A; 2MGD A; 1LH2 A; 3UHG A; 1YVT A; 2ZT2 A; 1FAW B; 1FSX A; 2XKI A; 1J41 A; 2GLN A; 1EMY A; 1YDZ A; 1HV4 A; 1A6K A; 3E55 A; 5CHQ A; 2MYA A; 3QJB B; 2H8F A; 3AQ5 A; 3W4U A; 1X46 A; 1XQ5 B; 1OR6 A; 3GQR A; 1RQ3 A; 3ODQ A; 1MBA A; 2B7H B; 2HHD B; 1NS9 A; 3UHZ A; 3HRW A; 2AUO A; 2R80 A; 1D8U A; 3B75 B; 1HAC B; 4MBA A; 4F68 A; 2Z6T A; 4KN3 A; 1A9W E; 3SZK A; 5CNF A; 1MLK A; 3S1I A; 3QJC A; 1HCO A; 1MBC A; 1DXT A; 1IOP A; 1YEU A; 2IN4 A; 1WMU A; 1MYI A; 1V4X A; 1MYF A; 5E83 A; 1XY0 B; 4O4Z A; 1C7C A; 1DUO A; 2SPL A; 3R0G A; 1CIK A; 5E29 A; 3LQD A; 2MGH A; 1DTM A; 1HDS A; 3RJ6 A; 1YZI A; 3ZJQ A; 1MLS A; 2V1K A; 3PI8 B; 3UHC A; 1UX9 A; 1JF4 A; 4H07 A; 4YU3 B; 3VRG B; 3QZX A; 1LA6 B; 1W92 A; 4C44 A; 3K9Z A; 1DTI A; 2D2M D; 1V4U B; 5HLU A; 1SI4 A; 1JY7 B; 3BOM A; 4HSW A; 1RTX A; 1CH3 A; 2DN1 A; 1GDJ A; 1HAB B; 1JP6 A; 1YHU A; 1U7R A; 5AB8 A; 3PT8 B; 1DLY A; 4XDI A; 3PEL B; 4FC3 A; 3QJE A; 2O5O X; 3UHT A; 1BBB B; 1DLW A; 3DUT A; 4HRR B; 2MGL A; 1V75 A; 1CQ2 A; 1Y0A A; 3BCQ B; 4WCH D; 1VRE A; 2QRW A; 2W72 A; 1G9V B; 2LH2 A; 2D6C A; 3GLN A; 1ABW B; 5CNB A; 2ZST A; 4ZVB A; 1UC3 A; 4UUR A; 3O7N A; 2RI4 A; 2ZT1 A; 1A6M A; 1Y5J A; 3ZH0 A; 1CG8 A; 1SPG B; 2HZ2 A; 2D60 B; 2MHB B; 2WTG A; 3G4Q A; 2G11 A; 3EOK A; 1IT2 A; 2HBS B; 4M4B B; 3NFE B; 3WI8 A; 1Y4V A; 1Y83 A; 1Y4B B; 5EET A; 5HY8 A; 2LH1 A; 1IWH B; 1Y35 B; 3KMF A; 3DHR A; 1CMY A; 3HEN A; 1Y01 B; 3P5Q B; 1V5H A; 3AQ7 A; 3UHY A; 1BZP A; 2MYD A; 1G08 B; 3LR7 A; 2HBE B; 1A3N A; 1GCV A; 3LB4 A; 1YVQ B; 1SDK B; 1MYZ A; 2QFK A; 1MBN A; 2ZFO D; 3HHB A; 4LPI A; 1LFV A; 2XKG A; 6HBI A; 2ZLX A; 1Y8H B; 3CIU B; 1NIH A; 4HBI A; 1ITH A; 2D5Z A; 1CP5 A; 1RVW B; 1Y0D B; 1J3Z A; 2R4X A; 1JW8 A; 4FH6 A; 4ESA A; 1MNO A; 2NSR A; 3MKB B; 1OUT B; 1AZI A; 3OO4 A; 2QMB B; 1OUU B; 2ZS1 C; 1DO3 A; 3LR9 A; 3WCV D; 4DC7 A; 1DWS A; 1XZU B; 1BZ1 A; 1Y8I A; 1O1P A; 1COH A; 2ZLT B; 5D5R A; 3UHE A; 4G51 A; 3G4R A; 4TWU A; 4NI0 B; 4H2L B; 3BJ1 B; 5KER B; 3DR9 A; 1YOI A; 1M6C A; 1JP8 A; 2D5X B; 4N7P A; 4BJA A; 1MLM A; 1SPE A; 4HHB A; 1A4F B; 3A9M A; 1LH7 A; 2HBF B; 3D17 A; 1YHR B; 3GKT A; 4F6D A; 2M6Z B; 1O16 A; 1C40 B; 1UX8 A; 2G0X A; 1JL7 A; 2GNV A; 1QSI B; 3UHR A; 2ZSO A; 2C0K A; 1RPS A; 1S56 A; 1J7W A; 4F6G A; 4NI1 A; 1JDO A; 1HDB B; 3VRG A; 4ROL B; 3LHB A; 1RSE A; 1Y7G B; 2MGI A; 3D1A B; 3ZOL A; 2D2M A; 1Y4F A; 2O5L X; 3NML A; 1YGF A; 1YE0 A; 1LH1 A; 4PNJ A; 1F5P A; 1Y45 B; 2BK9 A; 1AJG A; 3QJD B; 1QXE A; 3UGY A; 1NWN A; 3AT6 B; 1YE2 B; 1Y4Q A; 4ODC B; 1M9P B; 5KDQ A; 3MVC A; 1R1Y A; 3QM6 A; 1MLF A; 3S65 A; 1YHE A; 1A3O B; 1FHJ B; 1Y0C A; 3A5G A; 2ZT4 A; 1UVX A; 1CH7 A; 3D1K B; 103M A; 1VXH A; 2QLS A; 1EBT A; 3G53 A; 2MYB A; 1J7Y A; 1VXB A; 3OK5 A; 2ZSY A; 3WCT C; 4HSX A; 1G0A B; 1Y46 B; 2DN3 B; 4MQI B; 1QSH B; 1Y4G B; 1OBM A; 2ZLU A; 3VRF B; 2FRJ X; 4B3W A; 1Y0W B; 1Y8W A; 1Y7C B; 5EE4 D; 3E5O A; 5HU6 B; 3ZJO A; 3G4U A; 3AG0 A; 1XZ2 A; 5C6E B; 1O1O B; 4MPM A; 3WHM B; 1NZ2 A; 3QM7 A; 2ZFO A; 5CN8 A; 1CQX A; 3GOU B; 1HDA A; 1MYM A; 2D2N B; 1DKE B; 1WLA A; 2AUR A; 1VXE A; 5B85 A; 2MGM A; 2MGF A; 5MBN A; 5EUI B; 4MAX A; 1RVW A; 1IRD B; 3M39 A; 1VWT B; 2GRZ A; 3GQG B; 2LH7 A; 3WR1 B; 3QM5 A; 2GTL C; 3PI4 A; 3HEO A; 2BKM A; 1XZ5 B; 4DC8 A; 2R4W A; 1HGA A; 2BWH A; 2OIF A; 4M4A B; 3MJU B; 1RTE A; 3QZZ A; 1BAB A; 3WCV A; 4OOD A; 3R5I B; 2MYC A; 1LFQ B; 4KJT A; 2ZWJ A; 4ROM A; 4MQG A; 1GDK A; 4NI0 A; 4F69 A; 3SDN A; 1YFF A; 1DXV B; 2R1H B; 1GVH A; 2D5X A; 4L2M A; 5CMV A; 1YH9 B; 2HCO B; 1CO9 A; 2R4Z A; 3NL7 A; 1GBU B; 1FLP A; 1X9F C; 2DN2 A; 1J40 B; 2PEG B; 1HGB A; 2DHB B; 5JOM A; 1PMB A; 1MLR A; 3UHN A; 3WTG A; 3TM3 A; 1HBS B; 1THB B; 1O1I B; 3RGK A; 4AVD A; 110M A; 2ZS0 D; 3GKV B; 1PBX A; 1BZZ A; 3WCU D; 1LH6 A; 5F2A A; 1DXD A; 2V1F A; 3ZJH A; 1NWI A; 3D1A A; 2HHB B; 1YCA A; 5EV5 A; 1HHO B; 4N7O B; 2VLZ A; 1G0B B; 3K8B B; 2YRS B; 1S0H A; 2VYZ A; 1ECN A; 1HBH B; 1MBS A; 2HBG A; 1GZX A; 3M3B A; 1Y09 B; 1GCW B; 1T1N A; 4UZV A; 5JGG B; 5HBI A; 1A0Z A; 3NMM B; 1MYH A; 1Y4R B; 1B86 A; 2NRM A; 2HHE A; 2W6V A; 1O1L B; 1N9X A; 2LH3 A; 1FHJ A; 2V1G A; 3WCP A; 2D2N C; 1CH9 A; 1C7D B; 3S1J A; 1RQA A; 2HBC A; 2R4Y A; 1IT3 A; 1OJ6 A; 1XXT A; 1ABY B; 1RQ4 A; 2VRY A; 2BLI A; 1S5X A; 2VM0 A; 4PQC A; 1Y22 B; 2VEE A; 1BIN A; 2LHB A; 1MCY A; 1S5Y B; 4VHB A; 1VXC A; 1SHR B; 1Y85 B; 2QSP A; 1NQP B; 2BMM A; 3HEP A; 1Y0T A; 2G0V A; 3PI9 A; 1YOH A; 2H35 A; 2HBD A; 3WHM A; 4IRO A; 3PIA B; 5E6E A; 102M A; 1O1M B; 1YMA A; 1XZ4 A; 3DHT B; 1HBB B; 1Y8K B; 2AA1 A; 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1MZ0 A; 1O1K A; 1GBV B; 2G3H A; 3G4V A; 1XZV B; 3WCT B; 2BLH A; 3A59 B; 4SDH A; 6HBW A; 1HLB A; 1AJ9 B; 2EKT A; 4N8T B; 2MGJ A; 2EKU A; 1N9H A; 2NSS A; 3OVU C; 3AQ9 A; 1CLS B; 1FAW A; 1QXD B; 107M A; 3QJB A; 1LFY B; 5MBA A; 1XQ5 A; 5M3S A; 3G4Y A; 1BIJ B; 1CP0 A; 2B7H A; 1LJW B; 2HHD A; 5CN5 A; 3AT5 B; 1VXG A; 1O1N B; 5CN6 A; 1Y5F B; 2ZSR A; 1Y22 A; 3ZOM A; 1MOB A; 3WFX A; 3B75 A; 1HAC A; 3FH9 B; 1BZ0 B; 5CNE A; 2FRK X; 1KR7 A; 3ZJM A; 3ONZ B; 2GKN A; 3AQ8 A; 2GTL D; 1O1M A; 4HRT B; 1JEB B; 1OR4 A; 1UT0 A; 1YCB A; 1XY0 A; 2GTL B; 2D2M C; 2OHB A; 1DO7 A; 4MQJ B; 1XYE B; 2ZS1 A; 1CH1 A; 1DXC A; 1K0Y B; 1B0B A; 2MYE A; 1GLI B; 1MTK A; 7HBI A; 4MQC B; 3PI8 A; 2QSS B; 1ASH A; 4YU3 A; 1LA6 A; 2EVP A; 4YU4 B; 5CNG A; 2Z6N B; 1V4U A; 1JY7 A; 3VRE B; 1A6G A; 1MLG A; 3OO5 B; 1HAB A; 1CIO A; 2AV3 A; 1A01 B; 1U7S A; 3A5B A; 3PT8 A; 3PEL A; 1X9F B; 1BBB A; 4HRR A; 5CND A; 3PI1 A; 3BCQ A; 1G9V A; 3UH5 A; 3ASE A; 2G10 A; 1ABW A; 3D7O B; 1J7S B; 3CY5 B; 1NS6 B; 1Y4P B; 3UHU A; 1SPG A; 4DWT A; 3EDB A; 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