1WRYA

Solution structure of the sh3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein
Total Genus 28
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
28
sequence length
121
structure length
121
Chain Sequence
GSSGSSGMVIRVYIASSSGSTAIKKKQQDVLGFLEANKIGFEEKDIAANEENRKWMRENVPENSRPATGYPLPPQIFNESQYRGDYDAFFEARENNAVYAFLGLTAPPGSKEAEVSGPSSG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein
publication title Solution structure of the SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein
rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Structural genomics, unknown function
total genus 28
structure length 121
sequence length 121
ec nomenclature
pdb deposition date 2004-10-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF04908 SH3BGR SH3-binding, glutamic acid-rich protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1wryA00
5AIXA 1V58A 4LMVA 2OADA 1LJRA 2KOKA 3UBLA 3DMLA 1JFUA 1TP9A 2CA8A 4PQ1A 2OBKA 3GIXA 2KUCA 3D4TA 1UN2A 1XW5A 5E59A 2H74A 1ILOA 3CSHA 2GZPA 1JZWA 1X5DA 1RK4A 1SL2B 5LNKe 4ISDA 4JBBA 3H79A 5IO0A 5FWGA 2CV4A 4WF4A 1TI3A 1AXDA 2L4CA 1IYIA 1HQOA 5GSTA 4G2EA 5JCUA 4P3YB 1AAZA 4TR4A 3Q74A 2TRXA 4NPBA 2H19A 3EU3A 5CP1A 2LV3A 3GUSA 4YQVA 4ACSA 4EKZA 3ME8A 10GSA 4QQ7A 5DJMA 1Z5YE 1M2DA 2PERA 3FZ5A 2REMA 2KHPA 2O8VB 4OO5A 4BWQA 4PXOA 3PH9A 1TRVA 5E4WA 1WPIA 2YZHA 4KAEA 3SWLA 3IE3A 3A5WA 1SKWB 1R5AA 5ID2B 3ZFLA 2C1YA 4EUYA 4I97A 1Y25A 1Z7PA 2V6OA 4OFMA 4IELA 3VI7A 3TKSE 3VI5A 3TKSC 2I9HA 3WT1A 2IMEA 1QGVA 2FWGA 1XWGA 1K0CA 2P0GA 1WWJA 3K8NA 3LWAA 1TRUA 1V57A 1TRWA 3GKNA 4G9HA 1TDIA 2EIRA 2N5AA 5DQYA 6GSXA 1SD9A 4K9ZA 4TN8A 4LL1B 2FA4A 3KM6A 1EEMA 4YAVA 2GS3A 2FA8A 2VIMA 3IDVA 3CXGA 3ZTLA 1R4WA 2LRTA 3TKQA 4TR1A 2DJ1A 3GX8A 3A2XA 1DE1A 3BBYA 3R2QA 1THXA 1FB6A 5A5KA 4ECJA 3TGZA 1A2LA 5KN1A 4BL7A 3IRAA 2TIRA 4DSSB 2DMLA 4IQAA 4LA1A 2DBCA 1TRSA 4JE1A 1XCCA 2IMFA 3FHKA 2IIYA 3LXTA 3C73A 1K0OA 5F06A 1G0TA 1GNEA 3OR5A 3QOUA 5INYA 5GAND 2M80A 1ACVA 5AN1A 1GWCA 1MEKA 4MH2A 2OA7A 3L9SA 2H73A 1WP0A 1FW1A 2HXKA 2MMZA 3GTUA 1K3OA 4HU7A 1IYHA 3HY2A 5IOWA 4K2DA 1R26A 3BD2A 2OACA 2B6MA 3L9UA 1EOGA 3APQA 4FYUA 3ZFBA 3EMXA 2AAWA 4TOPA 1YEXA 2H6ZA 4MJAA 3EYTA 5B8AA 4Z7XA 4N0ZA 4BVYA 4TXOA 4BVXA 2HFDA 3LJRA 5ECKB 2AV4A 2M72A 1M7TA 1T7PB 3G9BA 4MH3A 3WT2A 5B6MA 5AISA 1VF3A 2CT6A 2YZUA 1HD2A 3LXZA 4F82A 4NHWA 1UVZA 4HZ2A 17GSA 5ECSA 2AUVA 1XFLA 3GFKA 3HD5A 3KH9A 3M3MA 1M9BA 3IK9A 3TRPA 5D9VA 1HYUA 4EDZA 2OE0A 3DKSA 4K6XA 3W8JA 4MDCA 2H1GA 2DLXA 2PWJA 4X1UA 2DJ3A 5G5FA 11GSA 3ZITA 4HI7A 3A2WA 4EO3A 4L5LA 2H1AA 1GSQA 1XW6A 2GLRA 4NMUA 3LEFA 3KH7A 4ML6A 2C3QA 6GSVA 2G2QA 1F3BA 4Q5RA 2C3NA 4RI7A 2DJKA 3FZAA 1TI1A 5LD0A 4PNGA 1F9MA 2VL2A 3TB2A 4DEJA 4MF5A 2L5OA 1TU7A 1ERWA 4GLTA 19GSA 5G5EA 1GTAA 1Q4JA 2I1UA 1OKTA 1K3LA 3H4KA 4HS1A 1NHYA 3Q6OA 3LGCA 3IAM2 5KEJA 4JR4A 4IVFA 3RBTA 2DSAA 4IBPA 3LYPA 4K7OA 4IW9A 4HJMA 5D96A 2I3YA 3BCKA 2GSRA 2K6VA 4MZBA 4AJ7A 2C4JA 5A4VA 3VPQA 5DCHA 1ERTA 3W6GA 3F3QA 4ML1A 4PGTA 1QFNA 2OJLA 2O87A 5F05A 4K0NA 4PX1A 3DXBA 3WGXA 3WGEA 1CQGA 2F3MA 3CTFA 1DBYA 1GSEA 4QL7A 1OC9A 1M2AA 4XHMA 1FG4A 5A4WA 2B7JA 4MK3A 5B6NA 3QR6A 1NW2A 5IPGA 1GSSA 5IMDA 5IMCA 3MDKA 1JHBA 3LORA 1AQVA 4NWYA 1X9WB 1DSBA 4RUVA 4MF7A 2F8FA 3QAVA 1JZRA 2B1KA 5IPHA 3SBCA 3P90A 3Q18A 2OE1A 3D22A 4WXTA 1PSQA 9GSSA 1TKDB 1EZKA 2MBTA 3UEMA 5GSSA 4KSMA 2NBSA 2WJUA 2WRTA 18GSA 3NIVA 2I4AA 5D9XA 2GQKA 2HSHA 1YEPA 1WIKA 3FZ4A 2LQOA 2RM6A 1MDIA 3F4SA 2K8SA 3GV1A 3L9VA 2LRNA 4KDXA 2L57A 2GDRA 3LG6A 5IOXA 3LFLA 2FWHA 3WGDA 5F0GA 3GKXA 2FWEA 1EP8A 2B7KA 2F51A 6GSYA 4K0GA 1MDKA 1U6TA 1JLVA 3EINA 1GL8A 4IS0A 2RUFA 2MZCA 2R6KA 5J3RA 5HQPA 3M8NA 4XRDA 5HFIA 3I69A 1H75A 4BPYA 3QD9A 2HRFA 2FD3A 3IPZA 1Y6EA 5JCWA 5DBQA 2GZYA 1AQXA 4ZBDA 4TVEA 2LJAA 5ECMB 1A8YA 4IQ1A 4V2LA 2HT9A 2NVLA 2YANA 1USBA 3M9JA 3TJFA 1R5PA 4OD7A 5ECQB 4OO4A 5D93A 1ZOFA 1V98A 1A23A 1EWXA 2KP1A 1XZOA 1K0MA 3EURA 1S3CA 4PQHA 1MTCA 1J9BA 3F63A 3L0HA 2NPBA 4L0WA 3I43A 4G10A 2LRCA 4MF6A 2ES7A 3FKFA 3F0IA 2L5LA 4XS4B 1QK8A 1FAAA 3VWVA 1O6JA 4IN0A 4ZL8A 1GSDA 1GTUA 1WRYA 3IBHA 1XXUA 3LSZA 2YWNA 1W89A 2BJXA 2GGTA 3NOFA 4IHUA 5IMVA 1T4ZA 1TK5B 2JU5A 1G7EA 3RAZA 4JR6A 3QAWA 1PMTA 3VLNA 4GF0A 4FH8A 2E0QA 3MWHA 4OCEA 2JSYA 1XW9A 3HA9A 4O5RA 4IJ3A 1SJIA 2A2SA 4IGJA 2ZUPA 4AF2A 2VLUA 1U3IA 2XHFA 2VCVA 4EF0A 6GSWA 2CX3A 3GHAA 2B5YA 1EGOA 3PR8A 4GTUA 3CRTA 1V9WA 3DIEA 1GULA 1JLWA 2CX4A 4KDYA 3RHBA 3CMIA 3N9JA 4MJCA 3TOTA 2YNXA 5G30A 1B9YC 2F8AA 1VF2A 2XBIA 1J08A 5ID2A 5HFGA 2ZCTA 1EV9A 5G1KA 3GH9A 14GSA 2C8UA 3VWXA 4ZL9A 3HXSA 1OC3A 5ECHB 1Z6NA 1X5CA 1Z7RA 1YDKA 2JACA 3DEXA 1E2YA 4V2MA 2VAFA 2YN1A 2LSTA 3W8SA 5CO3A 2HSYA 4CHSA 3HYPA 1O8WA 4ILFA 4IJIA 5HR2A 3I6AA 1HNAA 3QFBC 4KE3A 3EU4A 2FHEA 1CQHA 5DALB 4NHZA 2WS2A 3QCPA 5H5RA 5J9CA 1F2EA 1F37A 2CVDA 2X8CA 3VPTA 4O7HA 1A2JA 2HLSA 5ECRB 3EVIA 2GQLA 1K0DA 5EL8A 1BQ7A 2H70A 4ZB9A 3O6TA 4HJ2A 4WR5A 4TW5A 4DSSA 1A24A 3FRCA 4WETA 1ZMAA 3G7JA 4I2UA 1JZOA 1PKWA 2YWMA 5A4UA 1T8EB 2AB6A 3F8UA 4KW6A 3DVXA 2WZ9A 1LBKA 4TR3A 3CSJA 3F4TA 5EVOA 5IMZA 1ZYQB 5HR1A 4HU9A 4GWRA 2B3SA 1A2MA 4K8MA 3QDNA 20GSA 2OBIA 1ZZYA 2YCDA 1YY7A 4EL1A 4WEYA 1T00A 3GL5A 3FR3A 2H66A 3ZMLA 2H76A 4KA0A 1SK1A 1FVKA 3QAGA 3C1SA 3H1NA 1B4PA 4GQCA 5ELAA 2PPTA 1GRXA 2VCZA 4ZB8A 1M99A 4PQIA 4HEA2 1GP1A 2IMIA 1SYXA 3J7Yk 3P2AA 3UBKA 1OYJA 3DRNA 3RDWA 2JSZA 3F9UA 5F8BA 2R4VA 1PKZA 1PD21 1ZYEA 4WBJA 1WE0A 4HOJA 4GSNA 1K0BA 4L0UA 4PURA 2LJKA 4K7NA 2K8VA 3GN3A 3HZ4A 4OMVA 4ZB6A 1F6MC 4KB3A 4ZXGA 2JZTA 3GSSA 5ELGA 2VM1A 2WCIA 3VFIA 1RQMA 4EDYA 1FO5A 1A0RP 2EIQA 3KMOA 3P7XA 4X43A 1PL2A 1NSWA 5DJLA 3V1WA 3KP9A 5HR0A 1TTZA 3VWWA 2VCWA 4ECBA 4FO5A 2CAQA 1XOBA 1ABAA 3LQ7A 1YZXA 4WKWA 2VD1A 2YP6A 2R37A 4N11A 1S3DA 5EPFA 2MYGA 2L4QA 4ZIJA 2NTOA 2FWFA 2DC5A 5DCGA 1UC7A 2VLTA 4LL4B 5J5NA 3ED3A 1MD3A 1YJ6A 3KIJA 2IFQA 4TKYA 2H1DA 1UA5A 4V1Ap 2HYXA 4MCUA 2OE3A 4AGSA 2P31A 3UL3A 3HDCA 2IMDA 4DVCA 1U88A 5IO2A 4RQRA 1MDJA 3FZ9A 2QGVA 2RIIA 4WF5A 2WB9A 1FVJA 1ZGNA 5D8IA 1B9XC 4Q5QA 1T4YA 4MPGA 3FYGA 1SL1B 1TJDA 2DJJA 1XBSA 1PA3A 1DE2A 3TKRA 2KLXA 4K1FA 3S9FA 2P5QA 4ZBAA 3ME7A 2X8HA 1B4QA 5DAKB 4GSTA 3EMPA 4TRXA 1QUWA 1AIUA 1Z9HA 2DIZA 1PL1A 2H1BA 4YAPA 3UJ1A 2GSQA 3BOAA 3ERWA 3O3TA 4D73B 3GL3A 2E7PA 1OC8A 3ZZXA 3GURA 2FY6A 3UOMA 4CW9A 1OAZA 2H30A 3US3A 2VM2A 1BX9A 1GTIA 1XWBA 5D9WA 2FNOA 2K18A 1SJ6A 4I6XA 2VL9A 2CQ9A 3HVSA 1OVNA 3GKMA 1I5GA 2X8GA 4HUAA 13GSA 2I81A 3KXOA 4HZ4A 2CZ3A 3IK7A 1SK0A 2R2JA 5CYYA 1KTEA 2X64A 4V1Ag 1N2AA 5KN3A 3FR9A 2H0IA 3CTGA 2DMMA 1M9AA 2V2GA 3TCOA 1SL0B 2QKEA 2GSSA 4E8EA 2PGTA 3GX0A 1T1VA 2FGXA 1KBNA 2N5FA 4POLA 4DSQA 2H71A 4YH2A 4EE0A 2PU9C 3TKSA 4XS1A 4H86A 3ZVJD 1XVQA 4GCIA 1BJXA 3QPMA 5ENUA 2BTOT 3ZVJA 1TW9A 2A2RA 1PGTA 4XS6A 4F2IA 3RPPA 4YQUA 3IXRA 3KJYA 4E8HA 3FW2A 1GUHA 5ECLB 3KCMA 5FT3A 2PVOC 1GSYA 4TR0A 1YF1A 3P8WA 1I9DA 4BA7A 1A0FA 1XVWA 5ECPB 3UAPA 4FIWA 2GVPA 1SYRA 3CYNA 4ZBBA 2B1LA 3RPNA 2FUG2 2HZEB 2CAIA 1J0FA 3ZMKA 3E9JB 3C1RA 3MNGA 4JZQA 2C3TA 3VK9A 2R5GA 2C0FA 1FHEA 2JZSA 2QC7A 3VWUA 1GUMA 5AIVA 3GNJA 2KP2A 1LU4A 2H75A 4MLYA 3H8QA 1GNWA 5EY6A 2E2GA 3HJPA 1X0RA 5J4UA 1TOFA 1O81A 1QQ2A 1K3YA 1AC1A 1SD8A 3HVXA 3KTLA 3JCML 5CRHA 2BMXA 1RW1A 3FEUA 3UARA 4IKHA 4PUAA 4OFNA 5JWOB 4ECIA 5ABRA 2VD0A 2VOCA 4TXVA 1ST9A 2WDUA 2VL2C 2MMAA 3VURA 4HQSA 3J7Yb 3DYRA 3F6DA 2O7KA 8GSSA 4BWSA 2WGRA 1KNGA 5IIZA 3E3EA 1PQNA 5DVBA 4EVMA 4MA9A 5CRGA 3TJGA 3APSA 4F0CA 4EXJA 1Q98A 1FB0A 2C0DA 3WYWA 1M2BA 2DIYA 5COHA 5ECIB 1SU9A 4DSRA 5CAXA 2J23A 4NV2A 3IOSA 1GUKA 1PX6A 2L6CA 2H0HA 3UIWA 4GRFA 3FK8A 1BG5A 2CZ2A 2EIOA 2DJ2A 1ON4A 2YOIA 1V40A 2G0FA 1ML6A 1XWKA 3IC4A 4J57E 4LMWA 1XWAA 4XTSA 1TK8B 3M0FA 1R7HA 2O85A 4X0XA 2D2ZA 1K0NA 2IWTA 3D21A 2GTUA 3ZIJA 2RLIA 5B7CA 3TUEA 2O89A 1EV4A 2B5XA 3N5OA 2HE3A 2YWOA 3HZ8A 5CRWA 4QL9A 4POMA 3A2VA 2OKAA 2VL3A 4HDEA 3GYKA 2HNLA 4OFTA 1DUGA 4N10A 1U3AA 4KDUA 3IA1A 3ZRDA 3TRXA 2H01A 3ISOA 4ID0A 3D0ZA 2HI7A 2H8LA 4L8EA 2V6KA 3C8EA 1H4OA 3GRXA 2AJQB 1X5EA 1N8JA 2V1MA 2C0EA 2LNSA 12GSA 3RHCA 5DALA 3D5JA 2GQMA 7GSSA 1T3BA 5G31A 1GSUA 1QXHA 1GTBA 4K7IA 2HZFA 2IMKA 5DDLA 2GZZA 5F07A 5H5SA 3FR6A 3IHQA 4POBA 3U5RE 4I2TA 2LEGA 2CVKA 5G1LA 2C80A 1YKCA 4ULXA 5JCGA 3F6FA 4XCSA 3CBUA 2ZNMA 5AGYA 1ZL9A 3LYKA 1AUCA 4ECCA 2PMTA 4J56E 4G19A 2JZRA 2YJ7A 4L5OA 4RQXA 1OKDA 4GSSA 1SENA 3FY7A 1XIYA 3ERFA 3HVVA 5JWQB 1O73A 4TR1B 3TOUA 3QFAC 4FYBA 5J41A 2DJ0A 1BEDA 2MBSA 4MP4A 5CRDA 4POKA 3HCZA 3BJ5A 1Z3EA 1GLQA 3KD0A 4WR4A 4F03A 2H6YA 5GZZB 2LJRA 1E6BA 2VCTA 3F4RA 2P5RA 2A4VA 2B5EA 1YKAA 4KX4A 3KMNA 4GQFA 2QSIA 2V41A 3U6VA 1X9MB 5H5QA 16GSA 3UMAA 1VF1A 3GMFA 2H72A 3E0UA 3HHVA 5LCZA 4O32A 3GA4A 1M0UA 4JEDA 4Q5NA 4PUFC 3HJMA 3GTUB 2YWIA 4GXZA 1VF4A 5C04A 4NAXA 3DWVA 3TJJA 1SK2A 4CDOA 2IPAA 3Q19A 4EC0A 2LNTA 2XBQA 5HR3A 2YV9A 2J9HA 2TRCP 2GT5A 5CREA 3NZNA 4AJ8A 2LUSA 2ON5A 4MZWA 1XWCA 1Z6MA 3PGTA 1OE7A 3ZREA 4TXOB 4XRAA 4IP1A 3C7MA 3A3TA 2H0GA 2NDOA 1ERVA 2CVBA 2F9SA 3KP8A 4KNDA 5CNWA 1WJKA 3TJKA 1URMA 2VCXA 2YJHA 3IAS2 2N5BA 1B8XA 1MD4A 2R3XA 3DGQA 2RM5A 3H93A 3WD6A 4N0VA 2E2MA 1NHOA 5IQYA 1SKRB 3ZLPA 1O85A 2LTKA 2PN8A 1EGRA 1EP7A 3BCIA 4FYCA 5ECNB 3GSTA 1PX7A 2WFCA 2VCQA 4WBRD 2ON7A 3D6IA 4HQZA 4I5QA 3HKRA 3TJBA 2PBJA 2IFQB 2YPMA 4KCAA 1S3AA 3EC3A 1AW9A 1X9SB 1ERUA 4N30A 3IR4A 1KEBA 3DVWA 3GH6A 3I9V2 3KZQA 1HNBA 3KEBA 2IN3A 3GKKA 1C72A 3ERGA 1G7OA 3ZL5A 5DAKA 1U87A 3AY8A 2Z9SA 3ZIVA 3ZYWA 4MJBA 22GSA 3TDGA 2K9FA 3DD3A 5DQSA 3KTBA 4MMMA 1VRSD 2JL4A 4D73A 6GSUA 1O8XA 1SKSB 2MMNA 1G6YA 1G6WA 3CSIA 2X99A 2XC2A 1WOUA 1PRXA 6GSSA 2YV7A 4KUNA 4KGIA 1F3AA 4KH7A 5IMAA 4V2NA 4XIHA 4JRRA 2L6DA 5C00A 3TRQA 1B48A 2IJYA 1ZCPA 3M9KA 1THOA 2VUPA 3HJOA 1HNCA 4O92A 4F0BA 2RUEA 3UVHA 4YQMA 4RI6A 5KN2A 3L78A 4MZCA 1BYEA 4F9ZA 6GSTA 3MAKA 3TKPA 1GSFA 2VO4A 3EWLA 3G7IA 4MABA 1SJZA 4OCFA 1OC9B 2PVQA 1BAYA 4NV5A 3M1GA 2PUKC 4KCEA 3CRUA 1O7UA 5B8BA 2L59A 2JADA 5D9TA 4OWYA 1TK0B 2LS5A 5HFKA 3IV4A 4NXIA 3PINA 5GAPD 2GSTA 5FHIA 2GT6A 1WMJA 4PNFA 4IP6A 3L4NA 1FOVA 4ZILA 1A8LA 3QMXA 3UVTA 4Q5FA 2EC4A 5D73A 1QMVA 2AYTA 3O76A 4I8BA 2XPEA 3KGKA 3D4MA 2LKUA 1VGLA 5L71A 3C71A 2XPDA 2HRNA 3G7YA 2IL3A 2HZEA 5IMFA 2ALBA 1GLPA 4KSOA 1OE8A 1EEJA 1V2AA 1W4VA 2VLVA 5IM9A 2M46A 3EE2A 4LLRA 2FLSA 1TU8A 2AHEA 1TXXA 2FCHA 4ZL7A 1AQWA 4JU5A 2LQQA 1JZDA 4MPFA 3F3RA 5JWRB 1EOHA 1YQ1A 1XOAA 2WULA 1NM3A 4J2FA 1PN9A 2V32A 1K0AA 1YF0A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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