1WRYA

Solution structure of the sh3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein
Total Genus 28
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
28
sequence length
121
structure length
121
Chain Sequence
b'GSSGSSGMVIRVYIASSSGSTAIKKKQQDVLGFLEANKIGFEEKDIAANEENRKWMRENVPENSRPATGYPLPPQIFNESQYRGDYDAFFEARENNAVYAFLGLTAPPGSKEAEVSGPSSG'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Solution structure of the SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein
rcsb
molecule keywords SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein
source organism Homo sapiens
molecule tags Structural genomics, unknown function
total genus 28
structure length 121
sequence length 121
ec nomenclature
pdb deposition date 2004-10-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF04908 SH3BGR SH3-binding, glutamic acid-rich protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1wryA00
1GSUA 1SK2A 3ERFA 3VI5A 4Q5FA 2VAFA 3WGDA 1GSFA 2LJAA 2IPAA 3HJMA 3MNGA 4POKA 3QAGA 4KUNA 6GSUA 1G7EA 3HZ8A 3L78A 2OADA 3TKSE 2H6YA 2DMLA 1A0RP 1AIUA 1SJZA 4KW6A 2HSYA 3IOSA 4F0BA 2VLTA 2MMAA 1O7UA 1X0RA 1GTBA 3GHAA 2PUKC 4PNFA 9GSSA 2H74A 1SD9A 2ALBA 1V98A 3QCPA 2JZTA 4ZBDA 5CAXA 1U3AA 5KN1A 5ECSA 4KDXA 1SYRA 5DAKB 5CRWA 1CQGA 3KEBA 3HYPA 3CXGA 2DIYA 5H5SA 2L59A 1B4QA 4KDUA 5IIZA 1MDIA 2HSHA 3GX8A 1OE7A 4WXTA 3CTGA 1JZDA 4O5RA 3FK8A 1PQNA 2YOIA 1TK0B 5B7CA 1R5PA 1ZOFA 2IFQA 3GKMA 1K0NA 1MDKA 3VURA 5EL8A 1ERTA 2XBQA 3KIJA 4F2IA 3HDCA 5IO0A 2LTKA 5DCGA 3MSZA 1SL1B 4ZBAA 5IMAA 2A2RA 3ZTLA 4O7HA 2C0EA 4OFMA 3F3RA 5IOWA 5IPGA 2WFCA 3L9VA 2HZEB 2VIMA 2JACA 4ZILA 2GDRA 3VWWA 2O89A 3CRTA 2WB9A 8GSSA 3FZ5A 3WT1A 1AC1A 4I2TA 4KSOA 3ZL5A 2XC2A 2B3SA 2VD1A 1AQVA 3KTLA 1N8JA 4XHMA 1M9BA 3N9JA 3D4TA 3RDWA 1XCCA 5HFKA 3BJ5A 1JLWA 1SK1A 5H5RA 4TR3A 2H70A 4CDOA 3G7YA 3KJYA 1SL2B 4MZCA 3D4MA 3DYRA 3C8EA 4HZ4A 3RBTA 3I9V2 4OD7A 3LORA 1Z5YE 2GSRA 3UMAA 5J3RA 1A2MA 4PQIA 18GSA 3QFBC 1AAZA 1MDJA 1S3DA 1NW2A 3TJFA 4ILFA 1XBSA 1EEMA 4XIHA 3DVXA 3Q18A 3TDGA 1GTAA 4PUFC 4ID0A 2CZ2A 2LJKA 3F9UA 2NTOA 4YQUA 3UVTA 4GCIA 2H0IA 1M0UA 4GLTA 3CBUA 1F37A 2B1KA 4KA0A 1GUMA 2MYGA 4MH3A 1DE1A 3LWAA 4HJMA 3LG6A 4NHWA 5LD0A 2VM1A 3TKSA 4IJ3A 3C1SA 4OO4A 1H75A 5JWRB 3EVIA 1VF2A 3IE3A 5A4UA 5DAKA 5IMZA 2X99A 5IOXA 3WGEA 3GSSA 1EGRA 5D8IA 1K0OA 3MWHA 1R4WA 5ECQB 1ST9A 4AF2A 1EOGA 2C8UA 4L0WA 3KZQA 1TJDA 2HI7A 2HRNA 3FYGA 3Q19A 1TK5B 5HR2A 3KTBA 2PERA 4NAXA 1DE2A 1OE8A 1A8YA 1Z9HA 3GKNA 2V2GA 2L4QA 2FHEA 4V1Ap 4HQSA 2OKAA 3EU4A 5GZZB 5IO2A 1PD21 4WEYA 2HE3A 3W8JA 3ED3A 4G10A 5HR0A 7GSSA 5D9WA 2FWGA 1X9SB 1Y6EA 3VK9A 5KEJA 2OA7A 4OCFA 3IRAA 4XS1A 4GQCA 2X8GA 1TKDB 1BAYA 4AGSA 5D9VA 4V2NA 3BD2A 4K7IA 1F9MA 1QUWA 5HFGA 1TRUA 2CA8A 4MH2A 5D93A 2AYTA 3DD3A 1FVJA 2C3QA 1EV4A 3O3TA 5CYYA 4KX4A 5B6NA 4IW9A 2C0DA 2DJ2A 3NOFA 3FHKA 1U3IA 2C0FA 1M7TA 2FWHA 3ISOA 1MD3A 2H30A 4MLYA 3FZAA 1YZXA 2R3XA 3EMPA 6GSXA 4JBBA 1PA3A 3QDNA 2LRCA 2V6KA 2Z9SA 5KN0A 3M9JA 1U87A 1Z6NA 2E2MA 3RHCA 4TOPA 1TP9A 3ZYWA 5IQYA 5DALB 2GS3A 2H1DA 1B9YC 3GH6A 2ZUPA 2K6VA 3LYKA 5ECNB 4TXOB 4O32A 3L9UA 4IGJA 2NBSA 4ZB9A 3J7Yb 2PN8A 4GTUA 3DEXA 3U6VA 2RM6A 4O92A 2GGTA 4WR5A 5ENUA 1UVZA 2CZ3A 2LQQA 2P5RA 4LMVA 1O8WA 4MDCA 2YV9A 1V40A 3TRPA 2I3YA 2M80A 1QMVA 4YH2A 3M0FA 3VLNA 2N5FA 4GQFA 3VI7A 1ZMAA 1QGVA 4MPGA 1WWJA 3BBYA 4GF0A 1XOAA 3C73A 1HNCA 1HNAA 3KH7A 4V1Ag 1VF1A 1E6BA 2RUFA 2DIZA 4E8EA 3HJOA 1TRWA 2IJYA 3ZLPA 2KP2A 5ID2B 4TR0A 1XWCA 2MBTA 1XVWA 2AHEA 3KXOA 1FHEA 2C3NA 3ME8A 1PL2A 2YWIA 4IHUA 3D22A 2ES7A 4FO5A 4OFTA 3FZ4A 4HU7A 1SK0A 2IIYA 2H76A 2I1UA 3RAZA 4HOJA 5A4WA 2VO4A 2IL3A 2FD3A 3DIEA 2R4VA 4FYCA 3VPTA 1DBYA 2IMDA 3TJBA 3IK7A 4AJ8A 2DC5A 3QD9A 1XXUA 3HZ4A 2VD0A 3HD5A 5ECOB 3EYTA 3LXTA 4IP6A 2PGTA 4K9ZA 1USBA 4QQ7A 2OE0A 2B6MA 5F05A 2A2SA 2V41A 3HXSA 5JWQB 2CAQA 3UBLA 5C00A 4KDYA 2IWTA 4AJ6A 2C80A 3FR9A 2DSAA 3IDVA 4POLA 1T00A 3NZNA 1ERWA 5IMCA 4JEDA 3APSA 1G6WA 3GURA 4WF4A 2VCZA 2IMEA 1WJKA 5CNWA 1T4ZA 2GT5A 2R37A 11GSA 2WULA 4KCEA 5DALA 5DVBA 4KE3A 2VLUA 3C1RA 4FYUA 4PX1A 4NMUA 4TXOA 1F3AA 1GTUA 4MABA 5CP1A 3IA1A 2WCIA 3ZVJA 1SJ6A 2YPMA 2AAWA 3ZFLA 3CSJA 1QQ2A 1K3LA 5EVOA 4IELA 4E8HA 1U6TA 5ELGA 2REMA 4D73B 2LNSA 3FEUA 2CVDA 4K0GA 1OVNA 3QMXA 2JL4A 3KH9A 2WGRA 1HQOA 1RQMA 1G6YA 1HYUA 5A4VA 5F07A 2IMIA 5G2ZA 2P31A 2FCHA 4DEJA 4MJCA 3IR4A 3GKXA 2PMTA 3M8NA 3MDKA 4RQRA 2GSQA 4I5QA 1EWXA 2ON5A 2H0HA 2R6KA 2CT6A 4Q5RA 1W4VA 5ID2A 1DSBA 2ZNMA 3QAWA 2H73A 4HI7A 1SJIA 4MA9A 3P2AA 3M1GA 2GQKA 2NPBA 1OKTA 1AUCA 2OBIA 5EY6A 2PPTA 3HY2A 3GUSA 2GSSA 2VL2C 2DBCA 1X9MB 4L0UA 3CSIA 4RI6A 3LGCA 1LBKA 2HFDA 1ABAA 5DBQA 1JZRA 1O6JA 3I69A 3J7Yk 5DJLA 1SKRB 4KB3A 3ZFBA 1NHOA 1VRSD 2YWOA 3H79A 1A23A 2PVOC 4JZQA 1J08A 2J9HA 2YZHA 4PURA 3O6TA 3ZIJA 2XHFA 2DJJA 13GSA 1XWKA 3LQ7A 2F8AA 2G2QA 2O7KA 4EXJA 5CRGA 2OBKA 3GL3A 4L5OA 3F0IA 4N0VA 3ZMLA 2HXKA 2B5YA 5DJMA 1B48A 3EMXA 2MBSA 4EF0A 16GSA 3EC3A 4GSTA 1XW5A 2GVPA 4L5LA 3DRNA 4OWYA 3UARA 1TRVA 2QSIA 2JU5A 2YJHA 1PKZA 3I6AA 1TDIA 1JFUA 6GSYA 5JCGA 1N2AA 4GWRA 3IC4A 1XOBA 2RLIA 3IPZA 4ULXA 2GTUA 5KN2A 2VCQA 3FW2A 1G0TA 1NHYA 2F3MA 1UN2A 3TRXA 3KMNA 4AJ7A 4XRDA 1I5GA 1S3CA 1UA5A 2LKUA 5IMFA 5J41A 4BL7A 1AQXA 2DJ0A 4TR4A 4D73A 3F63A 1PRXA 2C3TA 4MJAA 4IQ1A 2LUSA 4ML6A 1M2AA 1OKDA 3RPNA 3KD0A 1GP1A 3APOA 4WBRD 3HKRA 2MMOA 5INYA 3ERGA 1YJ6A 2V32A 3WT2A 1TW9A 4ECCA 1GWCA 2O8VB 1FW1A 1BEDA 3EINA 1W89A 1GUHA 3TJGA 3ZITA 1T3BA 2H72A 4ECJA 4TN8A 2PVQA 3I43A 5ECIB 2C1YA 5G1KA 4JR6A 2GSTA 2MMZA 4IP1A 1V58A 2HZFA 2KLXA 2F8FA 3A2VA 1BJXA 4HDEA 4FYBA 4YQVA 3HHVA 5J9CA 1ML6A 2FY6A 3UJ1A 5DCHA 2F9SA 4RQXA 3M3MA 2RUEA 4FIWA 1SD8A 4ZB6A 4IJIA 2EIQA 4ZL9A 4IQAA 3CYNA 1MTCA 4JU5A 2N5AA 1SENA 4X1UA 5F0GA 3FR6A 5IPHA 5DQYA 1KEBA 4YAVA 3U5RE 4MK3A 3KP9A 3F8UA 3K8NA 5GAND 2H8LA 3TRQA 2VOCA 2YNXA 1NSWA 4MF6A 2H71A 1BYEA 5AN1A 1Y25A 2XPDA 1X5CA 2KP1A 1EP8A 2H01A 4N0ZA 1OYJA 3GYKA 3EU3A 4F0CA 3LSZA 4TR1A 1EGOA 1OC9B 2LNTA 1GLPA 1PMTA 3A5WA 4ACSA 3VWXA 3R2QA 2H19A 3D6IA 1JZOA 3IAS2 2FLSA 2OACA 2RIIA 1K0BA 1F2EA 3G7JA 1K0MA 4CW9A 1M9AA 2GT6A 1F3BA 5EPFA 1U88A 2FUG2 4L8EA 4HEA2 2FA4A 4PQHA 1JLVA 2BMXA 5IM9A 2K8VA 2P5QA 2OJLA 2NVLA 2I4AA 1QFNA 3TKRA 1MEKA 5IMDA 5HFIA 2K9FA 3GRXA 2FA8A 2R5GA 5HQPA 1YKCA 1O73A 1XWGA 12GSA 2P0GA 1XPVA 4F03A 2VUPA 2B7KA 2VCVA 2KHPA 2G0FA 3HA9A 4EL1A 4ZB8A 2YANA 5KN3A 4XRAA 1YF0A 1YQ1A 1AQWA 5GSSA 1ZGNA 1GSEA 4MJEA 4BVYA 2E0QA 2R2JA 4LMWA 2I9HA 3UL3A 1K0CA 3GL5A 2E2GA 4KCAA 5ECPB 5C04A 1Z6MA 5LNKe 1CQHA 2GQLA 4JR4A 3GSTA 1X5EA 2DLXA 3GTUB 1SYXA 3F3QA 3DXBA 3TOTA 4I8BA 2DMMA 3VPQA 1QXHA 4KH7A 2H1AA 2HLSA 1V2AA 4FH8A 2H6ZA 2EIRA 5D96A 2JZRA 2JZSA 2VCXA 3ZMKA 5ECKB 1GSYA 1K3OA 1TU8A 3D0ZA 4K6XA 3GH9A 1URMA 2HNLA 2M72A 1T1VA 2KUCA 4GXZA 3UAPA 1SKWB 3IHQA 1XIYA 1OC9A 4KSMA 1PX7A 3KCMA 2GZYA 4NV2A 4N10A 2QC7A 1RK4A 3BCKA 1YF1A 3E3EA 3ZVJD 4KGIA 1Z7PA 3TOUA 4K2DA 1T7PB 4BPYA 1THXA 2YV7A 3TB2A 2WRTA 2B7JA 3JCML 4XS4B 3GKKA 3KMOA 4V2LA 4I6XA 2B1LA 4PUAA 5H5QA 5GAPD 1VF3A 1KNGA 3HVSA 4DSQA 3TUEA 3IAM2 2YP6A 4HJ2A 4ZIJA 1ZCPA 4NPBA 1TRSA 3W6GA 4RUVA 1XWBA 2VL3A 6GSSA 1FVKA 1B8XA 2DJ1A 4DSSB 5HR3A 1S3AA 2YWMA 2LJRA 2WZ9A 3HVXA 5D9TA 5L71A 4KAEA 1HNBA 2VL2A 1X9WB 1BX9A 3TKPA 5A5KA 1ACVA 3QAVA 4YQMA 3P8WA 4ZL7A 3GFKA 3FY7A 2H1BA 3LYPA 1ILOA 3KGKA 5ECMB 3F4SA 4XTSA 2F51A 2V1MA 2AV4A 2N5BA 2H1GA 3P90A 4XS6A 5DQSA 4K7NA 3IBHA 3GN3A 5FHIA 2EIOA 3IK9A 5ELAA 4EKZA 5B8BA 2A4VA 1G7OA 5F06A 3WD6A 2WS2A 1EV9A 4MF7A 3GTUA 5D73A 10GSA 2ZCTA 5CO3A 4NV5A 5JWOB 3VWVA 1NM3A 4ECIA 3IXRA 2JSZA 3DMLA 4I97A 2AUVA 2X8HA 3D21A 2TIRA 4Q5QA 4TKYA 3GNJA 3CSHA 5DDLA 2YCDA 1EOHA 3V1WA 1GULA 3Q6OA 4EO3A 3UEMA 5CRHA 2DJ3A 4I2UA 4NWYA 3RHBA 1F6MC 2WJUA 2FWEA 3H93A 2CQ9A 4PGTA 4V2MA 3DGQA 2CV4A 1KTEA 1H4OA 20GSA 5ECLB 3IV4A 3O76A 3TKQA 2M46A 1GL8A 1XW6A 3FRCA 1AW9A 2CVKA 2L5LA 2K18A 2LQOA 5B6MA 2XBIA 1SKSB 4XS4A 2GLRA 3F6DA 3PR8A 1SL0B 2VCWA 1AXDA 1IYIA 2XPEA 4K1FA 1PKWA 1FB0A 4IBPA 5ECRB 3NIVA 4KNDA 2AJQB 1TOFA 1GUKA 3FZ9A 2AB6A 2TRXA 4DSSA 2FWFA 1QK8A 4Q5NA 2BTOT 1M2DA 3S9FA 5G31A 4IKHA 5CREA 1A24A 2H66A 4LL4B 19GSA 1TU7A 1PGTA 1THOA 5AIXA 4K7OA 1R5AA 1LU4A 3ZZXA 2L6DA 3WYWA 3TJJA 6GSWA 2K8SA 1V9WA 3LXZA 4ZBBA 4TR1B 2L4CA 3LEFA 1RW1A 1K0DA 1EP7A 2YZUA 1WOUA 4QL7A 1J9BA 2FGXA 4IN0A 1XVQA 5FWGA 3H4KA 4EC0A 1FG4A 3KM6A 1TI3A 2GZPA 1FAAA 5J5NA 4WR4A 3F6FA 3BCIA 4P3YB 4LA1A 2YJ7A 4JRRA 4BVXA 3LJRA 3VFIA 1BQ7A 4WBJA 1EEJA 4J56E 1O81A 5AGYA 2IMFA 5G30A 1WIKA 2O85A 4BWQA 4TXVA 1GNEA 4EE0A 1JZWA 1M2BA 3Q74A 1PL1A 4F9ZA 1E2YA 2C0GA 2GZZA 3UBKA 4MPFA 4TVEA 3N5OA 3QPMA 5E4WA 4YAPA 1TI1A 1X5DA 5HR1A 4NHZA 1XWAA 3P7XA 1BG5A 1WP0A 2V6OA 2CVBA 1FO5A 3UOMA 3C7MA 3ERWA 2CAIA 1ON4A 3DKSA 4MJBA 3L4NA 2GQMA 2TRCP 3BOAA 1ZZYA 1OC3A 1YEXA 3FKFA 14GSA 1R26A 2C4JA 4G19A 5FT3A 4OO5A 3QFAC 1DUGA 6GSTA 3KP8A 22GSA 3A2WA 1VF4A 1B9XC 3SBCA 1B4PA 5LCZA 3LFLA 1OC8A 2B5EA 3E9JB 5J4UA 1T4YA 1TTZA 2HYXA 4MZWA 3L9SA 4X43A 3EWLA 3SWLA 1Q4JA 4BA7A 2CX4A 2HZEA 3G9BA 3ZREA 3H8QA 4OMVA 3A2XA 4WKWA 4EVMA 3M9KA 2OE1A 4J2FA 2HT9A 1GLQA 2H6XA 3TKSC 4K8MA 4QL9A 4OCEA 1Q98A 5JCWA 5COHA 4EDYA 1A2JA 4H86A 4ISDA 3PINA 4POMA 4J57E 3F4TA 1ZL9A 4LL1B 4X0XA 1PSQA 3CRUA 3PH9A 4N30A 2FNOA 4G2EA 3F4RA 3GIXA 3UIWA 4DVCA 1O85A 5ECHB 3TGZA 6GSVA 3ZRDA 5F8BA 2L5OA 4ECBA 2IMKA 2ON7A 1YY7A 4BWSA 4MCUA 1OAZA 2D2ZA 17GSA 2EC4A 4K0NA 1YDKA 4NXIA 1ERUA 1K0AA 1WE0A 4MF5A 1XW9A 4XCSA 4IVFA 2E7PA 3TJKA 3H1NA 4HZ2A 1WMJA 2VLVA 3QR6A 2L6CA 2H0GA 3E0UA 1T8EB 1I9DA 4IS0A 4PXOA 1YKAA 3HCZA 4Z7XA 5J9BA 1XZOA 4DSRA 4F82A 2HRFA 1UC7A 2I81A 3HJPA 5ABRA 2QKEA 2LS5A 3VWUA 1C72A 3D5JA 1MD4A 4HUAA 1V57A 4PQ1A 1A0FA 2VL9A 3ZIVA 1ZYQB 2VM2A 2LEGA 4ML1A 1PN9A 5G5EA 3A3TA 3EURA 1Z7RA 4HQZA 3GV1A 2VCTA 1GTIA 1GSSA 4WETA 3TCOA 1FB6A 4WF5A 1LJRA 1R7HA 1GH2A 3EE2A 4HS1A 5CRDA 3CTFA 4MP4A 3GMFA 4LLRA 5GSTA 5G5FA 1A8LA 3AY8A 4TW5A 2PWJA 2LSTA 5B8AA 2LRTA 2BJXA 3GX0A 1GSDA 4MZBA 4GRFA 5IMVA 1IYHA 3APQA 1SU9A 2WDUA 3DVWA 3W8SA 3QOUA 1KBNA 3RPPA 3US3A 3G7IA 2JSYA 2IN3A 5JCUA 1PX6A 4GSNA 4OFNA 2B5XA 2QGVA 3GA4A 2RM5A 4POBA 4G9HA 1WRYA 3OR5A 1TK8B 1TXXA 2MZCA 4ZXGA 1A2LA 2LRNA 4GSSA 1M99A 5AIVA 1ERVA 2IFQB 2PU9C 1FOVA 2H75A 2X64A 4MMMA 4TRXA 3MAKA 2MMNA 2PBJA 2L57A 5D9XA 3UVHA 1YEPA 1ZYEA 4HU9A 1HD2A 2X8CA 4EDZA 3L0HA 2O87A 3FR3A 1VGLA 1GRXA 2JADA 4RI7A 4EUYA 2LV3A 1WPIA 4JE1A 5E59A 2CX3A 2NDOA 3DWVA 4CHSA 5G1LA 3WGXA 3C71A 1JHBA 4ZL8A 4PNGA 2OE3A 3ME7A 1GNWA 4N11A 2YN1A 2J23A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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