1WVJA

Exploring the glur2 ligand-binding core in complex with the bicyclic ampa analogue (s)-4-ahcp
Total Genus 86
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
86
sequence length
262
structure length
262
Chain Sequence
b'GANKTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGECG'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Exploring the GluR2 ligand-binding core in complex with the bicyclical AMPA analogue (S)-4-AHCP
pubmed doi rcsb
molecule keywords ionotropic glutamate receptor 2
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Membrane protein
total genus 86
structure length 262
sequence length 262
ec nomenclature
pdb deposition date 2004-12-15
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1wvjA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1wvjA02
3W15C 1POY1 4KCDA 5DEXA 3LSXA 2R71A 1B1XA 1VFEA 3LBSA 4EQBA 2Z8FA 4GXAA 3TELA 3U93A 1I6QA 4OMBA 1D4NA 4F1VA 1D3KA 3EQ1A 1GVCA 1P1WA 3IOTA 3PGFA 5A5XB 1OLAA 3HV1A 3EF7A 4F29A 4R6KA 2X7PA 4XKQA 3U8QA 5IAIA 1HSJA 5EYFA 3RTFB 1MY2A 4MFIA 4ELRA 1XVXA 4F2QA 2THIA 4O3CA 4O3AA 2Z8DA 1TFAA 4I62A 2DVZA 1IEJA 3KOTA 1JEVA 2QS1A 5BWJA 2P1SA 5AA3A 1PB7A 3IAZA 4ZECA 1SW5A 1ELJA 5ITPA 4YKIA 2DWHA 1MPDA 2RINA 2OCUA 4LZ8A 3T9UA 1B4ZA 3N6TA 5TP9B 2UYEA 1MXZA 3C35A 4ZEKA 4HCYA 4IY5A 1TT1A 4FE8A 2ONKE 2F6GA 1EZOA 1B7HA 1FCKA 2GH9A 5CBRA 5FHNA 2OBGA 4KR5A 1ZKBA 3G7WA 4ND9A 3H3GA 4OETA 3TKDA 3K1PA 3LC8A 2I0CA 2F97A 2B3FA 3M3KA 4G8HA 1P1UA 1UTHA 4QFNA 2I4BA 1XOCA 5L9OA 3RPWA 3MW0A 3OELA 4YKKA 1VE4A 3H6UA 3FXRA 4HTGA 4FECA 2Y7IA 3N94A 1SQYA 4MF3A 4OWDA 1QKBA 4MLQA 4FAJA 1URSA 3JYRA 1B3EA 4GVOA 5CMCA 1N0TA 2HXWA 1B1HA 5ICTA 4ELQA 4H0WA 2B3BA 2DP8A 2DE4A 2QS4A 3TTLA 3SETA 3OD7A 2DWJA 1AIVA 1AOVA 5H8SA 1PBQA 3FASA 1EZ9A 4GQOA 5I57A 5H8HB 3H6WA 3U92A 2E1SA 3TCHA 4HW8A 2A5TA 1B3HA 3QUJA 4OFJA 1DOTA 4F22A 1BKAA 1Z7NE 3LUYA 1N3WA 2ZMBA 3H4ZA 3L6HA 2PX1A 5AE4A 1Y1MA 2RCAA 1ZTYA 5KZTA 5ICQA 3IJOB 3D4GA 2QPQA 4ZEDA 4Q30B 3CVGA 4PE5B 3O66A 3DP8A 1MQGA 3OO9A 4F1YA 2HQ0A 3GBBA 3QUFA 2FNCA 2ZNSA 1VFDA 5FHMA 5I58B 1N3XA 2OJTA 3UGWA 3C4MA 3QAXA 3OO8A 1FTOA 5DTBA 4DCXA 1DTZA 3FVGA 4OTEA 3RLFE 5I2NA 3Q29A 4G2ZA 4DLDA 1IXHA 5A5XA 1O63A 3CRBA 2F6PA 1MDP1 1TFDA 2ZYMA 1JW1A 1B5HA 2NOOA 2VOZA 4TOZA 3K0VA 1BP5A 1QULA 4GOTA 4ZZAA 3LR1A 3QIMA 2CZLA 1YTVA 3CR9A 1MY3A 3VXBA 4OYVA 4OXVA 4PETA 3Q28A 1S50A 3A3UA 4RA1A 2YPNA 3PUXE 3R7XA 2H9BA 1OQGA 2NUVA 2V3TA 4Q0CA 2WKYA 3VXCA 1JW4A 3O97A 3P7IA 1AMFA 3K2DA 3B6QA 4JDFA 3M3FA 3MVYA 4F31B 3H03A 2V93A 3OEMA 3N6UA 4DE8A 4U4SA 2CMOA 4GF8A 2Y7RA 1RYOA 4N6PA 2UVJA 3WAEA 1NH7A 1POTA 2ESNA 2DVCA 4BDMA 3O28A 1H45A 1XT8A 2I3WA 1RKMA 5ITOA 4ZDMA 4XTCQ 4FATA 5EHSA 2REGA 4N13A 4X48A 4NF5B 2O69A 3S4UA 4YAHX 3G3IA 3FJGA 3TCFA 1S9TA 5CMBA 5H8NA 1IQ7A 3JZJA 1QKAA 4WEDA 5TPAA 2ZNTA 1H3DA 4EXLA 3TAJA 3FXUA 4YMAA 3QK6A 3G3FA 2D21A 3CG1A 4UA8A 1ANFA 5I2KB 4THIA 3RUMA 4M1VA 4P0GA 1UTHB 1OLCA 3IOUA 4G8MA 5CRYA 1II5A 1Y3NA 2O6AA 4BDNA 3H6TA 2AYSA 1PB8A 3PPRA 4XKRA 4QFKA 2UVGA 3BFTA 3SESA 5H8HA 3TTNA 4Q8RA 1B58A 1LAHE 4MH5A 2UVHA 3PPQA 3MJNA 5JK4A 5CMKA 2XXVA 4XKPA 2HEUA 4KI0E 3B7DA 2V3UA 3RN8A 5AA2B 4WXJA 4DXUA 1JETA 5H8FB 2QL3A 1FTMA 3MP8A 1YPNA 1LSTA 2UYFA 2F35A 2DS9A 4NF4B 4PQJA 1A54A 5I58A 3N5LA 3TEPA 2HCAA 3E9XA 5B70A 1A40A 4IO5A 1A7LA 3FXQA 3M3LA 1SW4A 3W9WA 5IKBA 3LSFB 2FYIA 1FTLA 1ZBMA 3C32A 2VHAA 1B3LA 3K00A 2VD3A 2B65A 2H98A 4GWOA 3E13X 2QSXA 1PEBA 3G3HA 3KG2A 1P99A 3PD8A 3S2VA 1M5FA 5I2NB 3TODA 1N84A 4RK2A 1R9LA 2F7CA 3R26A 1LB8A 1BIYA 4R6YA 5CM6A 2F78A 4YU0A 1FTJA 3Q27A 2I48A 3VE1B 1MY0A 5K2YA 4OFLA 4FEDA 4AB5A 3RT8A 1B40A 3S9MC 2XX8A 1B3FA 3USDA 3RY3A 4IB2A 2E0SA 3C36A 1MDQA 5JTYA 2I58A 4DDDA 3HPIA 3PD9A 1B5JA 2HAVA 3THIA 4BDOA 1IZ1A 5CBSA 4AB6A 4H5FA 1Y1ZA 1USYH 4O3BA 1MPBA 3MC2A 4QFLA 4R73A 4H8IA 4R74A 3LSLA 4DXBA 1F9BA 3BKIB 2ONRA 3C9HA 1SI1A 1HSEA 2AL5A 2XD2A 1LFIA 1VSOA 4IO4A 1OVTA 3RGYA 4H65A 4OEUA 3DLNA 5CC2A 1B0LA 4OESA 2F34A 3MPKA 4F39A 2XXPA 3TMGA 1OQHA 1GGGA 1A99A 2DYXA 2H4IA 3A09A 2XXIA 4EF2A 3ODBA 4NF5A 3O6IA 3OEKA 3CI8A 3MZBA 3FVOA 4JWYA 3DM0A 2QS3A 1QW0A 1MY4A 4R75A 3UP9A 1Z7ME 1UTBB 4I1DA 4PFUA 3SEUA 1B3GA 5I59A 1QVSA 1MXWA 1SBPA 4ONYA 5I2KA 3O6GA 1QJMA 5AA1A 4JWXA 3PMVA 5H8NB 1SDXA 3MZ9A 4IGRA 3I6VA 5TPAB 3G3JA 2KLFA 3O6HA 4P11A 2HAUA 4JBZA 3MZ1A 3R6UA 2OWTA 3MVWA 3DELB 4M4GA 2Q88A 3K02A 4QF9A 5F7VA 4C1TA 2NVUB 4IO6A 5CI5A 1B0HA 2O68A 1R1NA 3SDFA 4OERA 2QJEA 4FJPA 2Z8EA 3D4CA 1SW2A 1MH3A 4OHNA 4KD5A 3KBRA 5AA2A 1N7WA 3CSBA 4LATA 2W7YA 3PMWA 3FV1A 5H8FA 4EDPA 1FQBA 3VFJA 2NXOA 3CFXA 4L17A 1I69A 2PYYA 2HFBA 1B7ZA 4NF4A 4HCWA 4H67A 4ZE9A 3T93B 4ELPA 3PV0E 1Y9UA 1YAEA 4ZEFA 2V3QA 3DP6A 3IB2A 3C33A 3EHTA 4G68B 3MUQA 1SVXB 4R9GA 3ZS6A 1MQJA 3B6WA 2A5SA 1MG1A 4X1DA 1Y3QA 4NEDA 3ZKLA 2XX9A 1B6HA 1NNKA 2ALUA 4P0IA 3FIRA 1MM7A 3UIFA 3W9VA 4DZ1A 1A8FA 1MY1A 4OQOA 1B52A 4F1UA 1LFHA 3T22A 1FQEA 3RNNA 3K6XA 2O7IA 4Q5TA 1OVBA 4LA9A 3FUZA 3ILTB 4RYAA 1BTJA 1O7TA 2G93A 3S9EA 1OIBA 4JSDA 5L9MA 1YCJA 4ZE8A 1FW0A 3E4RA 4KFQA 2QMWA 3OSQA 1TWYA 1JW5A 1SI0A 4OEVA 2XXXA 4AQ4A 4GL0A 1LAFE 3OOAA 2XXYA 1LBCA 1MS7A 4X9TA 1NFTA 1ZMGA 2PBWA 1DPPA 1O64A 1LAXA 3SEWA 2PT2A 1IXGA 4POXA 4YICA 3U1OA 3K1MA 2H5YA 3I5OA 5F1QA 3K6WA 2X7QA 5JTYB 2YLNA 3KN3A 2OZZA 3PUYE 4KQPA 4IGTA 2ZYKA 2RC9A 3ZSFA 4LZ7A 3BFUA 1AL3A 3KGCA 3MWBA 3QSLA 4FIMA 2G29A 3PUZE 3VVDA 1B32A 1WODA 1JQFA 4NF8B 1H76A 2O7UA 1IXIA 1US4A 4OZ9A 4QFOA 1DMBA 3V8XB 1UTBA 4BDRA 1B2HA 4E0WA 3O29A 4GXSB 3FVKA 3KJ7A 2XXRA 5H8QB 4C1UA 2GRVA 2Q2AA 4U4XA 1JNFA 3K6UA 4NMYA 1NMUA 2H25A 2XXQA 5I59B 4YMBA 2GHBA 1Y20A 3FATA 1P1QA 3U72A 4QHQA 1MPCA 3T9XB 1OMPA 3MP1A 2XXWA 4QSDA 3IR1A 1Y4CA 3ILUB 4ESXA 4IO7A 4U1OA 1CB6A 3OO7A 3HN0A 4ZS9A 4F3SA 4GL8A 3TTMA 4N07A 4G8NA 5DVFA 1A8EA 1NNPA 4LONB 3RTWB 4LVQA 4HS7A 4GFRA 4GIZA 3VVEA 3ECRA 4PFYA 5FTIA 3MVZA 1B5IA 4KCCA 1LLSA 2YJPA 3FVNA 4KYDA 1ZU0A 2RF1A 4G68A 1IIWA 1H44A 3AXFA 2OK2A 4G68C 3TYHA 4NTLA 2O51A 5DVIA 4LP2B 4YKJA 2DE2A 1PC3A 2P2AA 4IO3A 3ONMA 2UXAA 1SD3A 1IUDA 3C31A 4LQ2A 2Y7KA 4YB6A 1Q1KA 1P1NA 3G3GA 2ABHA 3PPOA 3MAMA 4GLIA 2QS2A 3T66A 3VDFA 1UQWA 3CFLA 3F11A 1XS5A 3CIJA 3IB0A 1NL5A 4I9DA 3UORA 3OO6A 2R6GE 4I8CA 1Y3PA 1FQFA 3QXMA 3KN8A 3IL1B 2DXYA 3IO6A 2LAOA 3TTKA 1GR2A 4NWCA 4RXLA 3VVFA 3UA8A 4YZZA 4EQ7A 5BUUA 4RPOA 3TCGA 4U2RA 3KEIA 3WAFA 4NE4A 4EQ9A 2Q9TA 3E3KA 4BLAA 1FQAA 3EHSA 1MQDA 2F36A 3S9LC 1MQHA 4U21A 4QRZA 4TLLB 4U23A 4TQUQ 2DSFA 1Q35A 1JVXA 1JVYA 5AA2D 1H43A 2OWSA 3SEVA 1A55A 4WEPA 5I56B 2UVIA 3PUWE 2X26A 4X1BA 3IB1A 3LSWA 4F18A 2XD3A 3OSRA 4NF6B 2Q89A 4YB5A 4OVJA 4XXUA 2PMSA 2VD2A 4GRKA 4LUBA 2XXUA 1FQCA 5ELVA 4NF8A 1MXYA 4BDLA 5AA4B 3RT6B 4JSOA 1VR5A 1N76A 3VLWA 1N04A 1B9JA 3O9PA 2H99A 4DCYA 2RC8A 5H8QA 5KDTB 2D5WA 1NH8A 2F8DA 5J1DA 3FZVA 1LBBA 4ECFA 1T0KA 4UACA 3K1NA 3I3VA 4NWDA 3OMBA 1ZLQA 2DWIA 5DVJA 4EXKA 1UIVA 1MXUA 2GHAA 1LCFA 3VLUA 3CSGA 5FHOA 2HZKA 3M8UA 1LGBC 4EF1A 1I6AA 3K01A 2R9JA 2P0SA 3VLVA 4OENA 2Y7WA 3OENA 1Y4TA 3IK6B 1WVJA 3A3CA 1EU8A 2ZYOA 3FV2A 4RY1A 4FEBA 3H06B 1AH5A 3QYTA 3U94A 4JWOA 3EHUA 1MM6A 1PDAA 3IOVA 1PB9A 1S7YA 2IEEA 4F3BA 3T96B 3B6TA 1GV8A 4DIGA 4Z0IA 3ZKKA 2Z23A 3TDJA 1M5DA 4R72A 2O84X 2FA7A 3DP4A 4G4PA 5EHMA 4YKPA 1USYE 3GXAA 1CE2A 4EUOA 3SERA 1MH4A 3HO7A 3JV9A 3TPAA 3K6VA 4QFPA 1ZIUA 3SEYA 1US5A 4ZZEA 4DXCA 2AL4A 3RQTA 4H1XA 4C0RA 3PPPA 1B46A 2XHDA 3PMXA 5TU0A 2GFEA 5KCJB 3MP6A 5HM4B 2IA4A 1B7UA 3MQ9A 4LZ5A 2Z22A 2BJJX 4QSEA 3SKPA 2PT1A 3IX1A 3Q26A 4KHZE 2F7AA 1JEUA 4R2FA 4RJZA 3G3KA 4G77A 2Y84A 3KFMA 4RNSA 3FGSA 4JB7A 4F3PA 2REJA 3PPNA 1LAGE 2VGQA 3T9HB 4H6DA 1EH3A 3EN3A 1D9YA 4E0XA 1R9QA 2PVUA 4K3FA 3FJ7A 1TXFA 3H7MA 1DTGA 4ELOA 1GTKA 1N7XA 1ZJLA 1M5BA 4H8JA 5LOMA 3GZGA 1FQDA 1URDA 3KN7A 3VV5A 3UN6A 4XKNA 2DXRA 3IORA 3KJTA 4R9FA 1BLFA 2V84A 3IOWA 1PBPA 4U1ZA 2O1LA 3N26A 5DEXB 3Q25A 5M2VA 2DOJA 5CMMA 1RYXA 3TTRA 4R2BA 4KYSA 3HSTA 1QUKA 4TLMB 1LB9A 3KSJA 1MXVA 4LQ5A 3FJMA 2ZXTA 1IITA 4YB7A 5I56A 1WDNA 2DE3A 4OFOA 2DQVA 3TQLA 1L5TA 1MXXA 1XVYA 3C34A 3HCQA 1J1NA 4F19A 4ISUA 4NF6A 5L9SA 4RPNA 1LFGA 5I84A 1B05A 1HSLA 3IO4A 4ZEBA 1QUJA 2M8CA 1SYHA 5ISUA 4JXIA 4MBPA 3FD3A 1M5CA 3V83A 5B7DA 5AA4A 1MQIA 2D3IA 1NNFA 3S9NC 1SYIA 2VP1A 1KWHA 4QSCA 2F5XA 2NWJA 2QMXA 2HZLA 2AIXA 4WKMA 5KDTA 5L8DA 1QUIA 3CFZA 5TP9A 1M5EA 2I4CA 3TZAA 4PP0A 3HHFA 1D9VA 3O2AA 3TFLA 2DWAA 2I3VA 4GD5A 3V5AA 3V89B 2ZNUA 1B4HA 2RKMA 3SEXA 4F3GA 1DPEA 2V25A 4RK9A 1ATGA 2Q2CA 3BBRA 4MLVA 2ANJA 5HPQA 3TUSA 2Y7PA 2RC7A 2XX7A 2XXTA 1P1OA 1FTKA 2F7BA 4ZEIA 3K4UA 1XHYA 4R6HA 5DYHA 4ESWA 3IJXB 3UK4A 4H5GA 3KSXA 1LCTA 2Q8JA 2ONSA 4IO2A 1XC1A 4Z7EA 1SW1A 1NKXA 2O1MA 5HBCA 5DT6A 2OLBA 2XXHA 2I0BA 3GBAA 4U22A 4POWA 3KOSA 3EPEA 2I49A 3OXNA 1I6BA 2QRYA 3KZGA 4BDQA 4PFWA 4IY6A 2ZYNA 5KCJA 2RCBA 1MRPA 3L6GA 3T9VA 1UIUA 3MVXA 4F2OA 3TQWA 1NNTA 1DSNA 4KYEA 3MBPA 1URGA 3PU5A 5I57B 1IXCA 5JEIA 3MPLA 1B51A 4FORA 1R6ZA 2A5TB 5FTHA 2I6EA 3PUVE 3H6VA 1EZPA 3GLBA 3HHGA 3CG3A 4PFTA 4KPTA 4XIGQ 5K2XA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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