1WVJA

Exploring the glur2 ligand-binding core in complex with the bicyclic ampa analogue (s)-4-ahcp
Total Genus 86
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
86
sequence length
262
structure length
262
Chain Sequence
GANKTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGECG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Exploring the GluR2 ligand-binding core in complex with the bicyclical AMPA analogue (S)-4-AHCP
pubmed doi rcsb
molecule tags Membrane protein
source organism Rattus norvegicus
molecule keywords ionotropic glutamate receptor 2
total genus 86
structure length 262
sequence length 262
ec nomenclature
pdb deposition date 2004-12-15
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1wvjA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1wvjA02
1MPDA 4U4SA 3VVEA 4EDPA 3CRBA 3O66A 1TFDA 1OMPA 3U93A 3A09A 2NOOA 5AA2D 3GBAA 1FTLA 1ZIUA 2QS3A 2DE4A 4LQ5A 3N5LA 3SERA 5L9SA 4MH5A 2F7CA 1Y3PA 3K00A 1ZMGA 3O2AA 2Y7WA 1BIYA 4E0XA 4FAJA 3RTWB 4ZDMA 3LR1A 2O7UA 3FZVA 5ICQA 2UVHA 1DSNA 1MRPA 1EH3A 1M5EA 3JV9A 1NH7A 3T96B 1R1NA 4F3GA 3IX1A 2D3IA 3BBRA 3LBSA 3EPEA 4XKQA 3ILTB 3S4UA 1N7XA 1AIVA 1GV8A 4E0WA 1NMUA 4DXCA 3FVNA 3VE1B 1UTHB 3TCFA 5FTHA 1DTGA 2QS4A 4RK2A 4AB6A 4R9GA 1JW4A 3TTLA 4IO6A 3EHTA 4XTCQ 3FVOA 4LQ2A 1DOTA 3MJNA 4PP0A 3KN3A 5FHMA 3MW0A 3PD8A 1F9BA 1LSTA 1QVSA 2ZYKA 2H98A 3TQLA 4BDLA 1XS5A 5KCJA 3E4RA 3I6VA 5AE4A 2ZYMA 4RA1A 4YB5A 4IO4A 2HAVA 3IR1A 4IB2A 2QMWA 1B52A 3U72A 1SI0A 5CRYA 3QAXA 1A40A 1Y20A 1SVXB 4KQPA 1NNTA 3PMXA 4GFRA 3CSBA 2YLNA 3FATA 3T9VA 3UORA 3EN3A 4G77A 3MVWA 1LBBA 2REJA 3B7DA 1MDQA 2PYYA 3A3CA 3RQTA 4RK9A 3MZ9A 3G7WA 2F7AA 1P1NA 5I57A 1FQDA 4GWOA 4OETA 4ZEFA 4OEUA 3OO7A 4NWDA 1Y3QA 4P0IA 1TWYA 4OQOA 2IEEA 2ZYNA 4BDOA 1US4A 1OIBA 4LZ7A 2OK2A 5AA4A 5L9OA 1SW5A 5H8HA 3PGFA 1JETA 5CI5A 2YPNA 5ICTA 3GBBA 2NUVA 2DS9A 2ONRA 1N84A 3IJXB 4IGRA 2Y7KA 2R71A 1KWHA 1IXIA 2DVCA 4ECFA 4Q5TA 3RT8A 3K6WA 3DLNA 4AB5A 1PBPA 1IEJA 5CBSA 1Z7ME 5EHMA 5BUUA 2HZLA 4Z0IA 1JVXA 1LAFE 2DXRA 2OZZA 3HHGA 1LAGE 4H1XA 2OCUA 3MVYA 3FXUA 3H06B 1VR5A 1B40A 4OVJA 5JK4A 4K3FA 2D21A 4OXVA 4DZ1A 4GIZA 3PUYE 5F1QA 1B5HA 2XXYA 4F1VA 2FNCA 3PPQA 4M4GA 4F2QA 1P99A 3CFZA 1H45A 4QFOA 3RNNA 2X7PA 2XXHA 2I6EA 1XOCA 3K01A 4XKPA 5L9MA 2DE3A 3G3KA 3TTNA 2ZXTA 2I49A 3FJGA 4ZEDA 4MFIA 1WODA 1IQ7A 4N6PA 1FCKA 3H3GA 3KJTA 3EF7A 4F3SA 1N0TA 3KN7A 2UVJA 2DP8A 4NE4A 3D4GA 2QL3A 1OVTA 3BFUA 2V3QA 1CB6A 3VLWA 4FJPA 1MXUA 1ZTYA 2Z8DA 3QK6A 1FQCA 1SYIA 4QFKA 3A3UA 1D9VA 5KCJB 4F29A 1MG1A 2XXTA 3VLVA 2RCBA 3H6WA 4R75A 1BLFA 1YPNA 2DXYA 5B7DA 5CMMA 5FTIA 4GL0A 2PT1A 1ELJA 3K2DA 4HTGA 4EUOA 3EHUA 2O1LA 3IORA 4JSOA 2RKMA 1Y3NA 4G68C 1URGA 4MLVA 2M8CA 3VVDA 1SI1A 1B0HA 3Q29A 2Z8FA 1I6AA 3H6UA 3U1OA 1NH8A 1B32A 2DWIA 3OXNA 4PFWA 3VXCA 4I1DA 2I58A 2QRYA 1FW0A 5K2YA 4NF6A 5HM4B 4NWCA 4PE5B 3HCQA 4N13A 4Q0CA 3AXFA 3HSTA 5AA4B 5H8HB 3QXMA 3S9NC 3EHSA 4H0WA 1SDXA 1H3DA 1B05A 1ZU0A 5CMKA 2ZNSA 3PU5A 2GFEA 3C34A 2DWAA 3MVXA 5I58A 1D3KA 1MH3A 1POY1 4FATA 4U21A 1B5IA 2PVUA 1UIVA 3VLUA 1LBCA 3JZJA 2BJJX 2XX7A 2XD3A 3FIRA 4QRZA 4RXLA 4UACA 2VHAA 4RPNA 3USDA 3IOVA 3U94A 5KDTA 1J1NA 3O6HA 5F7VA 1NL5A 3U8QA 3MPKA 1R6ZA 4O3AA 3FD3A 1LLSA 4NMYA 4OYVA 2I0BA 3CFLA 1FQAA 3OEMA 4I62A 4U1OA 4R6KA 4U4XA 2G29A 3PPPA 2IA4A 3RT6B 3LC8A 3QIMA 3CG1A 3KSJA 4ISUA 4G8NA 1I69A 1QULA 3OOAA 4QF9A 4IO2A 4IO5A 3MBPA 4U23A 4ZEBA 3KG2A 2QPQA 4TLLB 4LA9A 4OWDA 3HV1A 5J1DA 2B3FA 4X1BA 4Q30B 1CE2A 3FXQA 3ZS6A 2PMSA 3TELA 1R9QA 3K1MA 1OLCA 4EQBA 1MY3A 1BKAA 3Q27A 4XKNA 4Q8RA 3Q25A 3G3GA 2HCAA 4OZ9A 3CG3A 4ZZEA 1SBPA 4G68A 2O1MA 1TXFA 4IGTA 2GHAA 4YU0A 2R9JA 4XKRA 1N04A 2HXWA 2O84X 1US5A 2R6GE 4H8IA 1JNFA 3SKPA 4X48A 5DVFA 2UVGA 3TPAA 4JWOA 1A8EA 4GLIA 1FTJA 4NF8A 1MY2A 2THIA 1B3HA 3TEPA 2F34A 3Q26A 4ZS9A 1I6BA 2ZNTA 2O69A 4U2RA 2REGA 4DXUA 4QFLA 2KLFA 2F7BA 3ONMA 4OESA 4YMBA 2AYSA 2F5XA 4PFUA 4RNSA 3K6XA 1RYXA 1Q35A 3UN6A 4ESXA 2VD3A 3PMWA 5DEXA 4XXUA 1B7UA 4PFTA 4QSCA 5I2NB 5I84A 3HPIA 3MAMA 2DE2A 3T93B 1WVJA 2OWSA 2YJPA 3C36A 5IKBA 3EQ1A 1O63A 1AH5A 2ABHA 3IB1A 1A55A 4U1ZA 1ZJLA 4NF6B 4QSDA 3V5AA 1QUIA 3Q28A 4I9DA 2O68A 1IXCA 3O6IA 3TODA 2ZNUA 4WXJA 2F6PA 3M3FA 4ELOA 1LB9A 3CR9A 1B7ZA 3PPOA 2GH9A 5ELVA 4I8CA 3LSXA 2DOJA 1II5A 4WKMA 5I58B 4P11A 1XVYA 3KN8A 4BDMA 1T0KA 3IOTA 5I56B 1VSOA 3D4CA 2DWJA 3VV5A 1QW0A 4IO3A 4EXLA 1FTMA 3GXAA 4ELRA 1PB9A 2G93A 1HSEA 3TTKA 2XX9A 2B65A 3ZKLA 5DVJA 1MS7A 4QFPA 4BLAA 4QHQA 3SEUA 2XXWA 4PFYA 4PETA 1B3FA 5KDTB 3VDFA 2V25A 1M5DA 1JW5A 3KOTA 1AMFA 3TYHA 2I4BA 1LB8A 3SDFA 3TFLA 4LZ5A 4R6YA 3TQWA 1SQYA 4ZZAA 1UTBA 2ALUA 2Y7PA 3E3KA 4LUBA 4G8HA 1FQBA 3ILUB 4R72A 4AQ4A 4NTLA 4G4PA 1XVXA 4NF4A 1R9LA 1MH4A 1ZBMA 3FVKA 4H6DA 4ZECA 3O28A 4X9TA 3H4ZA 4YKPA 2DSFA 3DP4A 4OFLA 1N3XA 3G3JA 4GD5A 3I5OA 1A8FA 4R2FA 3KGCA 3T9HB 2FYIA 3IB0A 4NEDA 4FEBA 3UGWA 2Q8JA 3GLBA 2Q89A 1JEVA 3CI8A 3CVGA 1JQFA 5HPQA 1JEUA 3G3HA 4G2ZA 2QS2A 4H5FA 4JSDA 3B6QA 3W9VA 1LAHE 3RN8A 4F3BA 5CMBA 4Z7EA 4NF5A 5A5XA 2DYXA 2A5TB 5K2XA 1OQGA 4G68B 5I59A 3OD7A 1P1UA 3KBRA 2QSXA 1IXHA 1PBQA 3OO6A 1EU8A 3H03A 3VVFA 3ECRA 1B3GA 3B6TA 4LONB 1LAXA 4NF8B 2NWJA 4HCYA 1QKAA 1GVCA 3SEXA 2ONSA 3JYRA 3MZBA 4F1YA 2QMXA 2ONKE 1S7YA 4YKJA 4BDNA 4U22A 2QS1A 3M8UA 4DXBA 3H7MA 2CMOA 2HQ0A 5TPAA 3ODBA 2DVZA 1MY1A 2RINA 3RTFB 5DEXB 5ITOA 3C33A 4QFNA 1A54A 3OSRA 3W15C 4FIMA 4EF1A 4JWXA 3QSLA 3T22A 4MF3A 2RF1A 3IL1B 4ONYA 1N3WA 5I2NA 5CM6A 5DTBA 4IY6A 1MQDA 1NNFA 3N6TA 1B4HA 1URSA 1LFHA 3QUFA 2V3UA 4OEVA 1Y1ZA 3S9EA 1YTVA 2B3BA 3K6VA 1BTJA 2AL4A 4JXIA 3OMBA 2XXXA 1PB7A 3PPRA 5TU0A 1VFDA 3LUYA 1RYOA 1A99A 2O7IA 4KR5A 2XD2A 5B70A 3FXRA 2I3WA 4YICA 3MZ1A 3G3FA 3I3VA 1B46A 3RUMA 3OEKA 4KYEA 1N7WA 2O6AA 2F8DA 3UIFA 3VFJA 4LZ8A 3FGSA 1USYH 4BDRA 5I56A 4KCDA 5TP9A 4KFQA 1Y9UA 4GRKA 1TFAA 1QUJA 4H5GA 1P1OA 2OJTA 4ZEKA 3N94A 3OO9A 3HO7A 1UTBB 4DCXA 4ZE8A 4YMAA 5JTYA 2HFBA 5H8SA 3KSXA 2Q88A 4YZZA 5CMCA 1MXWA 3LSLA 4H8JA 4RPOA 4LATA 4NF4B 5HBCA 4JBZA 1UIUA 4UA8A 2RC7A 1JVYA 1L5TA 3KFMA 4YB7A 3U92A 4ELQA 2H99A 1SW4A 3E13X 2XXPA 2F97A 2E0SA 3MVZA 3PUXE 5DT6A 1VFEA 2W7YA 4R74A 3UK4A 3V8XB 3RY3A 5H8QA 1MPBA 3DP8A 1XT8A 3FV1A 2PT2A 2X26A 4NF5B 1LCTA 2VGQA 4R2BA 3E9XA 4GXAA 2FA7A 5A5XB 5I59B 2NVUB 4F31B 1H76A 4JWYA 2I4CA 4FECA 1DPPA 4OERA 1MXXA 1B51A 3V83A 3C4MA 4FORA 2RC8A 1M5FA 4DLDA 2A5TA 3PMVA 3SEYA 3TCGA 4F3PA 1FQEA 5ITPA 1PDAA 5KZTA 3DELB 3MP6A 3P7IA 5DYHA 4EXKA 5FHOA 2I0CA 4HS7A 5H8NA 3OO8A 1QJMA 4KD5A 2Y84A 1MM6A 4YB6A 1ZLQA 5FHNA 4OTEA 5TPAB 3SESA 3TZAA 3WAEA 1PC3A 3FUZA 3OENA 1B7HA 3CSGA 2XXVA 1B2HA 1S9TA 5I2KA 2UYFA 4GF8A 4C1UA 4F39A 3TUSA 2F35A 2Z22A 2RCAA 3C32A 2DWHA 4BDQA 3R26A 1DTZA 2GRVA 3MWBA 1DPEA 1ATGA 1MXYA 4KI0E 4O3BA 1SYHA 5EHSA 3ZKKA 4TQUQ 3C31A 1B4ZA 3S9MC 1AOVA 1MXVA 1P1QA 3LSFB 2V93A 3K6UA 3FJMA 4RJZA 2ZYOA 2A5SA 1GR2A 4HW8A 4DDDA 4C0RA 3KJ7A 3FVGA 3PV0E 4F1UA 3T66A 3MQ9A 2V3TA 1FTOA 1MDP1 3SEWA 3MP8A 5IAIA 2E1SA 2F36A 3OSQA 1USYE 1Q1KA 1OVBA 4H67A 1M5CA 4ELPA 3SETA 4WEPA 4OFJA 4M1VA 4RY1A 1MQIA 4L17A 2WKYA 2Z8EA 1MQJA 2LAOA 4MLQA 2D5WA 3K1NA 2O51A 3FV2A 3TDJA 3VXBA 2DQVA 5TP9B 3IOUA 3K0VA 5LOMA 5EYFA 1B5JA 1IZ1A 1B3LA 3IK6B 3PUVE 3N6UA 3MPLA 5DVIA 2ANJA 4GQOA 2QJEA 4N07A 4MBPA 1N76A 4IO7A 4GVOA 5JTYB 5AA1A 3BKIB 3MC2A 3B6WA 1AL3A 1GGGA 1A7LA 2OBGA 3IB2A 1QKBA 3LSWA 3UA8A 3G3IA 3TKDA 1NNKA 3IAZA 1M5BA 3WAFA 3L6HA 4EF2A 3IOWA 5AA2B 3TCHA 1NFTA 2OLBA 1SW1A 1SW2A 4DE8A 2H5YA 2VD2A 3IJOB 1EZOA 4XIGQ 5H8QB 2F78A 3TTRA 4FEDA 3O9PA 3KEIA 3H6TA 2XXQA 1PB8A 2H4IA 2I48A 4ZEIA 4HCWA 2OWTA 2ZMBA 3THIA 2UVIA 5H8FA 2H25A 4F22A 1IITA 3TAJA 1YCJA 2Q9TA 4X1DA 3R6UA 4GL8A 1XHYA 4KYDA 3PUWE 3CFXA 1RKMA 4F2OA 2XXIA 1MQHA 3T9XB 1DMBA 2AL5A 1BP5A 3R7XA 4ZE9A 5H8NB 3C9HA 5L8DA 2P1SA 2Q2CA 1I6QA 4KHZE 4F19A 2VOZA 1OQHA 3MP1A 1HSJA 1NNPA 4TLMB 4LP2B 1D9YA 1URDA 3UP9A 1ZKBA 4QSEA 3W9WA 5I2KB 1YAEA 3RLFE 2Q2AA 1B0LA 3GZGA 4TOZA 2VP1A 1PEBA 4H65A 3BFTA 3O97A 1FQFA 4O3CA 2HAUA 4OFOA 3FASA 2GHBA 3C35A 4OMBA 4F18A 1P1WA 1B6HA 3M3KA 2F6GA 4ND9A 3FJ7A 3DM0A 4JB7A 4RYAA 1FTKA 3SEVA 5CBRA 4EQ9A 1Z7NE 2XXUA 4R73A 3L6GA 3F11A 1QUKA 1Y1MA 1UTHA 3KOSA 3O6GA 2HZKA 4DIGA 3QUJA 2RC9A 2I3VA 2AIXA 1LFIA 1B9JA 2NXOA 4KPTA 3HHFA 4G8MA 5BWJA 2PBWA 1LCFA 1B3EA 4POXA 2HEUA 4JDFA 1S50A 3OELA 3IO4A 1O64A 3QYTA 2Z23A 1B1HA 4C1TA 3TMGA 1B58A 5CC2A 2X7QA 4EQ7A 3DP6A 4YKKA 3V89B 4PQJA 1O7TA 1LGBC 1GTKA 4KCCA 4KYSA 3S2VA 1MY4A 2XHDA 3IO6A 4YAHX 1MPCA 4LVQA 1MY0A 1EZPA 2XX8A 5I57B 4OHNA 1XC1A 2Y7IA 3T9UA 1Y4TA 1B1XA 3PUZE 4R6HA 1MM7A 4GXSB 3ZSFA 1WDNA 2XXRA 2P0SA 3KZGA 3N26A 1IUDA 1Y4CA 2P2AA 1H43A 3M3LA 5ISUA 2CZLA 4FE8A 1POTA 3HN0A 3TTMA 4ESWA 1OLAA 1D4NA 3RPWA 1HSLA 4YKIA 3RGYA 2UYEA 1IXGA 2H9BA 3PD9A 1VE4A 5AA3A 5JEIA 1MXZA 4THIA 4P0GA 1JW1A 2ESNA 3K4UA 2UXAA 1EZ9A 3CIJA 4IY5A 1TT1A 1IIWA 4R9FA 1NKXA 5AA2A 3K1PA 1UQWA 3PPNA 4DCYA 3S9LC 2V84A 5M2VA 2PX1A 2Y7RA 1SD3A 5H8FB 1ANFA 3O29A 3H6VA 4WEDA 4OENA 1MQGA 1H44A 3K02A 1LFGA 4POWA 3MUQA 4GOTA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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