The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
62
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sequence length |
221
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structure length |
221
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Chain Sequence |
NVDFDSESPRKPEIQNEIIDLHNSLRRSVNPTASNMLKMEWYPEAAANAERWAYRCIESHSSRDSRVIGGIKCGENIYMATYPAKWTDIIHAWHGEYKDFKYGVGAVPSDAVIGHYTQIVWYKSYRAGCAAAYCPSSKYSYFYVCQYCPAGNIIGKTATPYKSGPPCGDCPSDCDNGLCTNPCTRENEFTNCDSLVQKSSCQDNYMKSKCPASCFCQNKII
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Toxin
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| publication title |
Crystal structure of a CRISP family Ca2+ -channel blocker derived from snake venom.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Triflin
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| total genus |
62
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| structure length |
221
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| sequence length |
221
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2004-12-24 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00188 | CAP | Cysteine-rich secretory protein family |
| A | PF08562 | Crisp | Crisp |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Arc Repressor Mutant, subunit A | Crisp domain | ||
| Alpha Beta | 3-Layer(aba) Sandwich | Pathogenesis-related Protein p14a | CAP |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 5JYS A; 2CQ7 A; 3U3U C; 2GIZ A; 4NUN A; 3S6V A; 3Q2U A; 3MZ8 A; 3S6S A; 1CFE A; 3U3L C; 2EPF A; 3Q2R A; 4TPV A; 1XX5 A; 4IFA A; 2DDA A; 4H0A A; 4P27 A; 1U53 A; 5ETE A; 1WVR A; 4AIW A; 4NUO A; 1XTA A; 2VZN A; 3U3N C; 4LY5 A; 2DDB A; 3S6U A; 3NT8 A; 2A05 A; 4D53 A; 1SMB A; 4NUI A; 1RC9 A; 4G2U A; 4NUK A; 1QNX A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2HGC A; 1ON1 A; 1B9N A; 3AG4 H; 5IP7 J; 4XMY A; 3VYT B; 3HOY J; 2QEN A; 3AG3 H; 1SFX A; 2D2W A; 3MZ8 A; 2XIG A; 1HXD A; 2R5Z A; 2MG4 A; 1S3J A; 3JTH A; 2VPR A; 3GFL A; 2HU9 A; 2ZC2 A; 1YS6 A; 1VTN C; 5CVI A; 3JCU C; 3I4M J; 1ZGW A; 2QSG X; 4HRI A; 2CG4 A; 2EWN A; 2DA2 A; 2MC3 A; 1TQI A; 2WAD A; 3K9T A; 3V8L A; 3OYE A; 4RB1 A; 2JMW A; 1SFO J; 2GBY A; 4ZYD A; 3K0L A; 3Q9S A; 1JJ6 C; 2W4S A; 3OYJ A; 4XLA A; 2DQL A; 2LSO A; 3CJT B; 3DF8 A; 5CPR B; 1ENH A; 3QP6 A; 4UB6 C; 5GPA A; 3ZQL A; 1HF0 A; 2HOE A; 3F8B A; 2IS1 A; 1JJ8 C; 3BR6 A; 2IBD A; 2X6X A; 3E97 A; 3LA2 A; 4BQO A; 4CDG A; 2VE9 A; 5GAE J; 3DPL C; 2E60 A; 1F1Z A; 2AQE A; 2GOM A; 4R79 A; 2FML A; 4A3B J; 4HEA 2; 1H8A C; 3OL3 A; 3S2W A; 1NK3 P; 3PNT A; 4OAZ A; 1DDN A; 4AIW A; 1FP2 A; 2DW4 A; 1BI2 A; 3G1M A; 2FBK A; 1MNE A; 1BN5 A; 3JSP A; 2QVO A; 1K78 A; 1MBJ A; 1OR7 C; 3B73 A; 1FIP A; 4L5I A; 2EV6 A; 4YRV A; 4F92 B; 1PVE A; 5GTI C; 2OBP A; 2H8W A; 5F04 A; 2CUJ A; 1G3S A; 3VYS B; 2CJJ A; 3E6C C; 3A4C A; 2ZME B; 1GDT A; 2LK2 A; 3JRH A; 3TOB A; 1T8I A; 3ZN1 A; 3GX4 X; 1W7P A; 1NG6 A; 1YW9 A; 4Y4R A; 4XLN F; 3IRQ A; 3D1N I; 1ZQ3 P; 1FP1 D; 1MJA A; 4B48 A; 2QF7 A; 2KFD A; 1Z67 A; 2O03 A; 2YPR A; 4AU7 A; 5J8C A; 1FOW A; 1R1U A; 3IHU A; 1ZR2 A; 3GFI A; 4XRS G; 2DU9 A; 3SHF A; 1Q1H A; 1MJ9 A; 3ABM H; 3MD2 A; 4CCO A; 1X1D A; 2OC6 A; 4KJZ A; 1D1C A; 4GRI A; 1HLV A; 1IF1 A; 1GVJ A; 5TRD A; 5GTH C; 4IHX A; 2VPL A; 5FLV A; 2EPF A; 2WB1 N; 2JA5 J; 2X1C A; 3BTI A; 3FXM A; 2FNP A; 5CYV A; 3OIQ A; 2HZD A; 2W85 A; 4QLC U; 1K4T A; 2WA0 A; 3WGH A; 5FRN A; 1W5T A; 4NUO A; 3WE2 A; 3A01 A; 1R4N B; 2KQR A; 2LMD A; 3MWM A; 2BW3 B; 3BG6 A; 4KMF A; 5DD4 A; 1UHM A; 3OYD A; 4NUK A; 2A69 F; 1FTZ A; 2LDU A; 1YJW I; 1B1B A; 2V1X A; 1TQP A; 5E17 F; 2A6T A; 3ZMD A; 3MZH A; 4N0B A; 4PK4 A; 1TW3 A; 2JZY A; 3J80 Z; 1EH8 A; 3GYH X; 1Z21 A; 1DGR M; 2A61 A; 3V7S A; 2Y69 H; 4AD9 A; 3HYI A; 5GAD J; 1ITY A; 3KZZ A; 3LSG A; 4G6D A; 5HDG A; 3T0Y A; 2KKO A; 4OMY A; 3L00 A; 4GGG A; 1OMI A; 4KIS A; 1DPU A; 4F7Z A; 2P5V A; 2H27 A; 4ON0 A; 1HKT A; 1FY7 A; 3FIW A; 3NWS A; 2LC2 A; 1XS9 A; 2EFN A; 1LQ1 A; 1T2K A; 1SC7 A; 1EKE A; 2X6W A; 1XC5 A; 2BY1 A; 1RKW A; 2JA2 A; 5JFR A; 4LMY A; 4RBO A; 3DKY A; 3UR3 C; 1XPX A; 2X0L A; 4U0Y A; 1YO5 C; 2BOL A; 1A6Q A; 1YJN I; 2BXZ A; 4IRI A; 4RM2 A; 4BKX A; 2VQG A; 2EK5 A; 1WJA A; 2KLO A; 3IWF A; 2KRF A; 4HPQ A; 1OFC X; 1RET A; 3FZV A; 2OTL I; 3H0G J; 3V8J A; 3H1C A; 1T56 A; 2IGN A; 3ZQF A; 4DZJ A; 3ERM A; 3ZP5 A; 1GT0 C; 2K9S A; 2Y2Z A; 4HX4 A; 2Z33 A; 1W1W E; 4CGZ A; 1JKO C; 2VKE A; 2W00 A; 2X51 A; 5M3M J; 2NS0 A; 3L2R A; 2DT5 A; 1JGG A; 1TNS A; 1OYY A; 3P9K A; 5LGN A; 3WTS C; 3I53 A; 2I10 A; 4IVN A; 2RDP A; 3BR2 A; 4HYE A; 2IS6 A; 3QYB A; 3DP7 A; 1A6I A; 1UHS A; 4U87 A; 3KX2 A; 3LSM A; 4P96 A; 1FX7 A; 3OYF A; 2W1O A; 1XTA A; 2H6B A; 4MFD A; 1FOY A; 3HKZ A; 2MGQ A; 4D53 A; 2KP6 A; 4HBL A; 4EGY A; 2D1V A; 3O6B B; 3FHN A; 4XOR A; 1OCP A; 2L9S A; 1HDD C; 2M7A A; 2VJ5 A; 4BGD A; 1FT9 A; 3JRF A; 1W5C C; 1MMG A; 4C3I J; 3CO7 C; 2O9L A; 2HYF A; 3G4S I; 2R7U A; 3Q0V A; 4LD5 A; 1H89 C; 5FFX A; 4L18 B; 4ZDO A; 1BR1 A; 3ZQG A; 3VWB A; 5E1W A; 2DDA A; 3DTI A; 4PZJ A; 3OYI A; 4PUS A; 4IQ4 A; 1D5Y A; 3E0J B; 3R0A A; 1MBG A; 3LWF A; 4FCY A; 2VON A; 3HOU J; 1GV5 A; 4NC8 A; 3BG3 A; 2X1E A; 3C1D A; 2W25 A; 1VZ0 A; 1W36 D; 3S16 J; 1J5Y A; 3OYM A; 3WOD F; 4B1R A; 3K4L A; 3I56 I; 2N8G A; 3DU5 A; 1MBE A; 3S6V A; 5AIP A; 4Q48 A; 2WAQ N; 2DK8 A; 2BGC A; 4BH9 A; 3RYR A; 5DUI A; 3H35 A; 4LJZ F; 3S17 J; 2RQP A; 1V3F A; 5JLW A; 4PGG A; 3WU2 C; 3ELK A; 2E2I J; 5B66 C; 3OYN A; 2VAS A; 1N75 A; 3KP3 A; 2VBY A; 3GWZ A; 5FKM A; 3F8N A; 3TO7 A; 3CCQ I; 4G6T B; 5DD8 A; 4EJW A; 3OYK A; 3B6A A; 5F1J A; 2J5P A; 5LBQ A; 1MSE C; 2HZT A; 2E1N A; 3HIF A; 4A5M A; 1O7F A; 4IEJ A; 2GQQ A; 3OMY A; 1XGM A; 4M73 A; 5BS6 A; 2H09 A; 4HST A; 1T98 A; 3ABT A; 4A3J J; 3FIS A; 2ESH A; 2WWY A; 3E6B A; 2WY7 Q; 4N4N B; 1B6A A; 1WKM A; 2KJB A; 4HX8 A; 5FJ8 J; 3BG5 A; 2W7N A; 2KPM A; 2CQN A; 3VYR B; 3BG7 A; 4UV9 A; 2IA2 A; 3CES A; 3E7L A; 3MQ0 A; 3OIP A; 1E2X A; 1K83 J; 1S29 A; 5J1U A; 1VFC A; 3HHH A; 1QRY A; 3SEQ A; 4RDU A; 1XDS A; 2FBI A; 2BHZ A; 5EZH A; 1VQ6 I; 4JX5 A; 3GTQ J; 4A3I J; 1BM9 A; 2OA4 A; 2RC4 A; 4BAY A; 3KP7 A; 1HW2 A; 3H5A A; 3M7G A; 3Q3S A; 4I6Z A; 3OYL A; 1A35 A; 1JXS A; 5M5Y J; 3LOC A; 4Q5S F; 4BEH B; 1VQ9 I; 4JX6 A; 3E1S A; 2WB1 A; 1R5H A; 5H6Q A; 5A2Q K; 2IVM A; 2CQK A; 4M3B A; 3LA7 A; 1MW7 A; 1P7J A; 4HDV A; 3RIR A; 1BOB A; 5LHH A; 4NC7 A; 1X1B A; 3J81 K; 2BZT A; 2WV1 A; 3DQV C; 1UEL B; 5BNG A; 4P5O A; 1VQ8 I; 1YRN A; 2X1D A; 2Y9Z A; 3K10 A; 4P9F A; 1LEA A; 2LH9 A; 3KIO A; 2VN2 A; 2H94 A; 5M5W J; 3GZ5 A; 3ESW B; 4MLO A; 3GZ6 A; 1PUF A; 1XN7 A; 3DV8 A; 1D3Y A; 3ZR8 X; 2VT2 A; 4BXU A; 2XGD A; 3RDI A; 5J8F A; 1RUO A; 4A3E J; 3A0B C; 3ECO A; 1S6L A; 5EEA A; 3VSK A; 3I71 A; 3NAU A; 3HPG A; 5GAG J; 2LFB A; 3EDP A; 1BJZ A; 3O3K A; 2PMZ N; 4DJA A; 5L3G A; 4B8X A; 4F91 B; 4L0Y B; 1Z77 A; 3BOQ A; 2JPB A; 2XPW A; 3MN2 A; 2OQG A; 5B5E C; 1O3T A; 4E7H A; 4EJU A; 3BT9 A; 2R7X A; 3DEW A; 3PNV A; 4O6J A; 4F93 B; 2XB5 A; 4DGW B; 4X6A J; 4EM2 A; 3C18 A; 2EIJ H; 3QYE A; 3FKJ A; 4XSX F; 4HX7 A; 5LEJ A; 5LEK A; 3OS1 A; 3ZMZ A; 3S3O A; 3BY6 A; 4X1E A; 3ONQ A; 3A1Y A; 3HSF A; 1MMS A; 1XCV A; 4GXO A; 5BQT A; 3C2B A; 2V26 A; 3G2B A; 2DYS H; 3OYC A; 3IWZ A; 5JHF A; 1Y56 A; 2RNJ A; 3WTW C; 1POG A; 1Z3X A; 3FMQ A; 2XC7 A; 1AA7 A; 2HKO A; 3PFY A; 4AIK A; 1ZHF A; 4Y7N J; 4RAG A; 4E7K A; 4C2U A; 2Z16 A; 1KU7 A; 1WWX A; 4MO7 A; 3HOW J; 4Y33 A; 2M30 A; 4O5V A; 5C4X J; 4J01 A; 4UXN A; 3H9Q A; 2V6E A; 1WJ5 A; 4Y17 A; 3HG9 A; 3D5S C; 1V55 H; 4M9Z A; 1ORK A; 2B9S A; 1BW6 A; 1S7O A; 2EIK H; 4JYK A; 2ISY A; 4V19 K; 1GXQ A; 1NHA A; 4AC0 A; 1YOV B; 1IXS B; 3WHC A; 1E0E A; 3HUG A; 3KFW X; 2CFO A; 3FXJ A; 2DMN A; 4XOT A; 4MTE A; 3MZY A; 3JRE A; 1XG1 A; 1LDD A; 3J7Z I; 1LFP A; 4M6Y A; 5L3E A; 2YS9 A; 4M72 A; 5IYB J; 3UKG A; 2FQ4 A; 2CO5 A; 3V7R A; 1Z9C A; 3N4M A; 5ILS A; 2XV4 S; 3BR1 A; 3BZK A; 2DA3 A; 3ZPL A; 1HCR A; 4R8H A; 1MH4 A; 3HXL A; 2ETH A; 3DEU A; 2XUB A; 2R7S A; 4WXC A; 5F27 A; 2L9V A; 3SDG A; 3U21 A; 4BQN A; 3LQQ A; 3VEP A; 1D1A A; 2FE3 A; 3ZQQ A; 3DCF A; 1G3T A; 2F5F A; 3BQY A; 4LIV A; 2XRN A; 1EJ9 A; 4GFB A; 3LSJ A; 2F5V A; 2XF5 A; 4ZC3 A; 5HLH A; 2VJ4 A; 2Y0M A; 1ZYR F; 1Z1D A; 4GDF A; 1U6G A; 2PEX A; 3P7N A; 1DP7 P; 4G9Y A; 2WAE A; 3ROU A; 3PUB A; 4B3A A; 2WAQ A; 4G7H F; 3HRM A; 3FBI B; 2PX9 A; 3RQ4 A; 5DTD A; 5ED4 A; 5DEQ A; 4BE1 A; 1MMN A; 1VQM I; 2Z99 A; 3G6E I; 4IHS A; 1LDJ A; 1R00 A; 1K6Y A; 3TO6 A; 4E7Z A; 1ZGJ A; 4M9S A; 2KIM A; 5D6F A; 2HS5 A; 1ETQ A; 1LEB A; 3HHG A; 1JHH A; 2KRH A; 4MQ9 F; 3LAP A; 3CCS I; 1P4W A; 1UHW A; 5KVR A; 5TGT A; 3M1E A; 2PBI A; 2L02 A; 2NVT J; 3F8F A; 3HOS A; 4MEX F; 2EZL A; 3BPX A; 3CTA A; 1G4D A; 3NEU A; 3I55 I; 1KU9 A; 4JOM A; 1BC8 C; 1MNM C; 3KP4 A; 2LNB A; 1O3S A; 1HKS A; 3FXO A; 2O5R A; 2LTP A; 1M1E B; 4C9Y A; 1XMA A; 4H4K C; 1S9H A; 2CQX A; 4D9J A; 2NAZ A; 1OCO H; 4IOA F; 1JKQ C; 4CHU A; 3PL8 A; 2OJE D; 3E3V A; 4RGX A; 1BBY A; 4DIQ A; 3IV5 A; 4NB5 A; 3QPL A; 4AWX B; 3E6M A; 2JRT A; 5D4S A; 3A2K A; 1OCR H; 4OIQ F; 1K79 A; 4U88 A; 1CGP A; 4MNU A; 4EJT A; 5HLT A; 4XQF A; 4P55 A; 5DCM B; 1GV2 A; 2K9L A; 3K1M A; 3F23 A; 2MSY A; 4MEY F; 1IO2 A; 3F21 A; 1QU3 A; 4AIJ A; 4LLL A; 3CO6 C; 2QGU A; 3RCO A; 2VC0 A; 4XIC A; 3FF5 A; 4ESJ A; 5FO5 A; 3CZ6 A; 3CLQ A; 3IH4 A; 3DEE A; 3OOU A; 4HNV A; 5KAI C; 3GTP J; 4M9X A; 4A3K J; 3KEQ A; 4BU2 A; 1B8I B; 1ETK A; 2QZ8 A; 3I59 A; 4IJA A; 5E3M A; 2E35 A; 1LVK A; 4FT8 A; 2DMP A; 4CCM A; 1I1G A; 3HOZ J; 2DTZ A; 4KA4 A; 4XRM A; 3OR2 C; 4QPQ A; 1MD0 A; 1KU3 A; 3E5X A; 3I9V 2; 2Z5U A; 1Y0N A; 3TMO A; 3AKZ A; 1FSE A; 1MND A; 1HA8 A; 3VOD A; 1Z05 A; 3CMY A; 2R7T A; 2HQR A; 4WCG A; 2A5Y B; 3BCA A; 5FRO A; 1BW5 A; 2ZBK A; 3IKV A; 5L3D A; 4J19 A; 2PJR B; 3W2A A; 4R1H A; 1UG2 A; 2XHK A; 2EA2 A; 2VKV A; 3CF2 A; 2P0W A; 1SEU A; 5IY5 H; 4IHT A; 4XKC A; 4HF1 A; 1T08 B; 2M7B A; 4HG2 A; 4XLP F; 4BAC A; 1PYV A; 1QZY A; 5DCF A; 1FYM A; 4UY8 I; 2BY2 A; 6PAX A; 1XGS A; 1QVT A; 2EZH A; 4L9N A; 4YII A; 4E70 A; 5EZG A; 1F36 A; 2VQL A; 3C3W A; 3BR0 A; 3HKZ N; 2CU7 A; 5LFA A; 2C6Y A; 4EAT A; 3Q0W A; 2X85 A; 1UZC A; 1LE8 B; 1TZL A; 2NOG A; 3QPS A; 1L3L A; 2L3D A; 5J47 A; 2ZXI A; 4MFE A; 1RUN A; 1WI9 A; 1SAU A; 1BI3 A; 3GXO A; 2VL8 A; 3GEZ A; 2XAG A; 3VB2 A; 3IRR A; 1WJC A; 1H9G A; 3O2P E; 4HW0 A; 2WBM A; 1TW2 A; 2W82 A; 5HS7 A; 3OV8 A; 1YIO A; 4M3E A; 4HF0 A; 2XGE A; 2YU9 J; 3K69 A; 4BJ6 C; 1KON A; 4DZP A; 2B0L A; 2XF6 A; 2ZSI B; 4IHW A; 2EB7 A; 5FLX Z; 3ZMV A; 2AQF A; 4PJN A; 1R5I D; 3BTL A; 3K70 C; 4B4C A; 1KA8 A; 3B6C A; 3LST A; 2JA7 J; 2LR8 A; 1J7K A; 1YQA A; 3SDB A; 5HOO A; 3JRC A; 2M5W A; 2VT3 A; 3S3M A; 2L01 A; 2HVS A; 5D8L B; 2Y31 A; 3CCE I; 2MBF A; 4D0P A; 4BYY A; 2CWE A; 2ADU A; 3FXK A; 3GFM A; 3RQI A; 1SD7 A; 3KPH A; 3REO A; 2E2H J; 5FKL A; 2K3P A; 3CUQ B; 2BV6 A; 4M6X A; 4C2M J; 4DBQ A; 5FD6 A; 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