The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
62
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sequence length |
221
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structure length |
221
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Chain Sequence |
b'NVDFDSESPRKPEIQNEIIDLHNSLRRSVNPTASNMLKMEWYPEAAANAERWAYRCIESHSSRDSRVIGGIKCGENIYMATYPAKWTDIIHAWHGEYKDFKYGVGAVPSDAVIGHYTQIVWYKSYRAGCAAAYCPSSKYSYFYVCQYCPAGNIIGKTATPYKSGPPCGDCPSDCDNGLCTNPCTRENEFTNCDSLVQKSSCQDNYMKSKCPASCFCQNKII'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Crystal structure of a CRISP family Ca2+ -channel blocker derived from snake venom.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Triflin
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| molecule tags |
Toxin
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| total genus |
62
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| structure length |
221
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| sequence length |
221
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2004-12-24 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00188 | CAP | Cysteine-rich secretory protein family |
| A | PF08562 | Crisp | Crisp |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Arc Repressor Mutant, subunit A | Crisp domain | ||
| Alpha Beta | 3-Layer(aba) Sandwich | Pathogenesis-related Protein p14a | CAP |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2GIZ A; 2DDA A; 5ETE A; 3MZ8 A; 2VZN A; 3S6S A; 4NUO A; 4LY5 A; 4NUI A; 1RC9 A; 1CFE A; 3U3U C; 1SMB A; 4NUN A; 1WVR A; 2DDB A; 3Q2U A; 4TPV A; 4AIW A; 4NUK A; 2A05 A; 1U53 A; 1XX5 A; 1QNX A; 4P27 A; 3U3L C; 2CQ7 A; 3U3N C; 1XTA A; 4D53 A; 4G2U A; 3S6U A; 3NT8 A; 5JYS A; 3S6V A; 3Q2R A; 2EPF A; 4IFA A; 4H0A A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3E0J B; 1P2F A; 2MH2 A; 1GT0 C; 5F0C A; 2ZXH A; 2M2E A; 1UHS A; 2LFB A; 4LIT A; 4GYI A; 1YX3 A; 4E7Z A; 2UXN A; 1LE8 A; 2CV2 A; 2HWV A; 1FWZ A; 4M9S A; 5E8G A; 1VFC A; 2PJR A; 1F5T A; 4A3C J; 3K4C A; 3RPQ A; 2P7C B; 1S7A A; 1ZTR A; 2AXL A; 3OYM A; 5J6X A; 2HDD A; 1OLT A; 2EZK A; 4OMY A; 1MBK A; 1OR7 A; 1R00 A; 1Y1V J; 1UST A; 2JSC A; 2OU2 A; 2QKL B; 3COA C; 3T8T A; 1X2N A; 2QSG X; 1XDS A; 2JA8 J; 1XGN A; 1TQI A; 4JYK A; 3MQ0 A; 4BAY A; 3KYC B; 1EH7 A; 2KIS A; 1RC9 A; 5KNL A; 2E1O A; 3G3Z A; 5F64 A; 2EFW A; 3VYT B; 2XRL A; 4CH7 A; 2CUF A; 2FNA A; 3GZN B; 1VZ0 A; 2XRN A; 2LF8 A; 4E4H A; 4BDY A; 3D5L A; 1AWC A; 1D5V A; 3F21 A; 2J5P A; 3TOB A; 1YW8 A; 3K4L A; 3IH4 A; 3BOQ A; 4A0Z A; 4BXU A; 2NVX J; 5GPA A; 4XOP A; 4XIC A; 3LAJ A; 2X6O A; 2V1D A; 3QOP A; 4M3B A; 3G4S I; 4R79 A; 2E2I J; 1P4X A; 1HQC A; 1IC8 A; 3MEX A; 4H4K C; 4XRS A; 3BQZ A; 2OQG A; 1CFE A; 1E2X A; 4UVC A; 4IRI A; 2EFQ A; 3JR9 A; 5EEG A; 3BCB A; 4G7O F; 2CQK A; 5GAD J; 3QYF A; 1O3T A; 3B6A A; 1JT6 A; 4A0Y A; 3WTT C; 3HUG B; 3LSP A; 1IGN A; 3RJP A; 1K78 A; 5LRR A; 2UWM A; 3RPU A; 2L2O A; 1UJ8 A; 3CLO A; 4NC7 A; 3T0Y A; 4BE1 A; 3PNY A; 4A3F J; 2M8E A; 3ABL H; 1J0R A; 3RKY A; 1XGS A; 4U87 A; 1X2M A; 2WTE A; 2B9S A; 5L3E A; 4Q4Z F; 2W57 A; 2K9S A; 2WBM A; 1P92 A; 1Z67 A; 2WV1 A; 1U8R A; 2MLK A; 2VE9 A; 1Z1D A; 2AQF A; 2PMU A; 2XGE A; 5JLW A; 1X1P A; 3VDX A; 2VXD A; 2LD5 A; 1VI0 A; 2O61 A; 4D9J A; 3GBG A; 3QU3 A; 1TW3 A; 4FTH A; 5FGM A; 3VEP A; 3MFK A; 1Z91 A; 2XPV A; 2WAD A; 1UEL B; 1MKM A; 2OAZ A; 2Y31 A; 2HOA A; 2ZFU A; 4IL6 C; 3KYL A; 2MGQ A; 3K4M A; 4NB5 A; 2NVY J; 1W5C C; 1LUJ B; 2D1H A; 2WAF A; 3CMY A; 5D8L B; 1S5L C; 1LKX A; 3GFM A; 4DZP A; 6PAX A; 2VKE A; 2FQ3 A; 2XSJ C; 3FXK A; 5LGN A; 2L4A A; 1QVT A; 2M4K A; 2E7X A; 1BW5 A; 4TPV A; 1MH3 A; 2A05 A; 2EV0 A; 2V9P A; 4YEL A; 2H1L A; 4B47 A; 1RKT A; 4I0B A; 1FOY A; 2BY3 A; 1TTY A; 3JRI A; 1WI3 A; 4ANJ A; 4M74 A; 5EGO B; 2Y75 A; 4L0Z B; 2GBY A; 2HGC A; 5FKK A; 2BYV E; 2HQN A; 2L9V A; 1W7P B; 3FKI J; 1D0Z A; 1RNL A; 3HTS B; 3QRF F; 2R5Z B; 5KCM A; 5C4X J; 2DI3 A; 2FBI A; 2KP6 A; 4XLE A; 1YS6 A; 5GPC A; 2E7W A; 4V2F A; 1VQ9 I; 1JE8 A; 5D6F A; 2Z99 A; 4BL0 B; 4Q5S F; 2L4M A; 2M7A A; 3CC2 I; 1I3A A; 4J01 A; 3GTG J; 1JT0 A; 1WJB A; 1P4W A; 5ICC A; 4LIU A; 1TWA J; 3H9J A; 1GV5 A; 4N4O B; 2AO9 A; 3BG5 A; 3CC4 I; 4ABZ A; 2IP2 A; 3BG7 A; 2A69 F; 3KLO A; 1OIS A; 2NS8 A; 1IRX A; 5LHH A; 2HR3 A; 2RAE A; 1MH4 A; 3HRS A; 2VQL A; 4LG3 A; 3EUK L; 4C3J J; 2IA1 A; 4ITV A; 3W6J B; 5F27 A; 2OJE D; 4RM3 A; 1W5S A; 1F43 A; 1E3P A; 1QNX A; 1MMD A; 2DXI A; 3CCE I; 1BOA A; 1A6Q A; 2XF6 A; 1S29 A; 4RAG A; 2LOO A; 4KUM A; 5LBQ A; 4LD5 A; 3T5X A; 4CZZ A; 3H9Q A; 2IGO A; 1LDK B; 3KLN A; 3J7Z I; 4RGX A; 2KL4 A; 4F3Q A; 1RUO A; 5J8C A; 3LSH A; 4FIS A; 3DPL C; 2VOO A; 2CS3 A; 2G9W A; 3M1E A; 1GXQ A; 5J3L A; 4CA0 A; 1JUS A; 4Y33 A; 5LLQ A; 1XDU A; 3ZN1 A; 2VJJ A; 4DW6 A; 1ETV A; 2Y0S N; 3Q0U A; 1YQA A; 4UNO A; 1WJD A; 4EEF G; 1VTN C; 2KQR A; 1FP2 A; 2IAI A; 2XPW A; 3OS0 A; 5EZG A; 3NRV A; 1YFH A; 1R7J A; 4OWR B; 2XAS A; 3ZRG A; 1G3T A; 5BS6 A; 1X1A A; 4XID A; 2Z33 A; 3F23 A; 2DU9 A; 2PN6 A; 3TBI A; 1KGS A; 2M87 A; 3S3O A; 2BVL A; 2O03 A; 3BDD A; 5CJ9 A; 1K6Y A; 1O3R A; 3OYE A; 5GTH C; 1T0F A; 2NYX A; 5DS9 A; 1F4K A; 3U3U C; 4LLL A; 2F5V A; 2KDO A; 1UB9 A; 2E19 A; 4DBR A; 3OYL A; 3FDY A; 2R93 J; 3MKZ A; 2MAB A; 2HVS A; 3ABU A; 3KE2 A; 1LVK A; 1G59 A; 3ZR8 X; 1T33 A; 1IV6 A; 4QWQ A; 5DUI A; 2GXG A; 3ELK A; 3H0D A; 1K4T A; 5F6F A; 3WGI A; 2ZJR F; 2JN6 A; 3KIO A; 1BC8 C; 3MZ8 A; 1OCC H; 5J4V A; 3T1B A; 1QBJ A; 1MSF C; 1B9M A; 3L2V A; 2VJI A; 1B59 A; 3HRM A; 1A6I A; 2LBF A; 2D5V A; 1JI8 A; 3WTU C; 1RZ4 A; 4XRS G; 2DYR H; 5H20 A; 1A36 A; 3A2K A; 2DOE A; 1FP1 D; 4D7M A; 1TL8 A; 5EZH A; 4X6A J; 2VI6 A; 3OWT A; 4WCG A; 3V8K A; 1RKW A; 3ONQ A; 5ED4 A; 2OUM A; 2KKO A; 4E7L A; 3RI4 A; 4I02 A; 1JKR C; 1MD0 A; 1HA8 A; 1HSJ A; 4IZZ A; 1R4M B; 5GP9 A; 4JX6 A; 3PNT A; 1BM9 A; 3FIS A; 1WGX A; 4NBQ A; 2H6C A; 4IHY A; 3ZMV A; 2VOP A; 1NTC A; 1XPX A; 5JFR A; 3JCU C; 1FTT A; 4DJA A; 4A3L J; 2F4I A; 3TO6 A; 3OSF A; 3U2R A; 2KDZ A; 4I0A A; 3L2C A; 3GX4 X; 3PL8 A; 4WXH A; 3OL3 A; 2EBI A; 5K7H A; 4CDG A; 1EH8 A; 3LFU A; 5CLS A; 1IXR C; 1XSX A; 3ZPL A; 1I1S A; 2FUG 2; 1HXD A; 1Q1H A; 2ZKZ A; 4P9U A; 3DU6 A; 1QZY A; 3HOW J; 5IP7 J; 3S6S A; 3FXU A; 3K9T A; 1YJN I; 1GVD A; 1IO2 A; 3F8N A; 1BI3 A; 2STT A; 3I59 B; 2DOA A; 1ETW A; 5F1J A; 1B6A A; 2IS1 A; 4ZTJ A; 4ENN A; 3ZMT A; 2WAE A; 2QSF X; 3V8L A; 2R7V A; 2KT0 A; 1ETK A; 3B02 A; 5FKN A; 2W84 A; 5KAF C; 4NHJ A; 1U5T B; 1YIT I; 3VYR B; 3ECH A; 4C3I J; 3F8M A; 2V26 A; 1SC7 A; 4KIT B; 4L9N A; 2X48 A; 2QBY B; 1LJ9 A; 4AYB N; 2LF7 A; 2FNP A; 4BGD A; 4EM1 A; 1O3Q A; 2OQR A; 1HF0 A; 2ZME C; 4LOC A; 2QCO A; 1K4S A; 3DBL B; 2M3A A; 3R61 A; 2MA3 A; 1MBF A; 4BQO A; 1RUN A; 3NWT A; 3LSK A; 2LDU A; 2NNN A; 3C2G A; 1WZ2 A; 5ICE A; 4OU0 A; 3HYI A; 5ICF A; 4DZJ A; 2FEZ A; 1TP4 A; 4HEA 2; 1WJ5 A; 4MQV A; 3Q5F A; 1OMI A; 4IHV A; 3QOD A; 4ZYH A; 3VPR A; 3PIP F; 4P1W A; 2VQC A; 4CXF A; 1OQY A; 4LFU A; 3CCV I; 2FJ1 A; 1BIA A; 2K85 A; 2BXY A; 1P7J A; 2H8R A; 1IF1 A; 2HI3 A; 2X1E A; 1H8A C; 1LVA A; 3SEQ A; 5J1R A; 3TO9 A; 4OOI A; 3TP0 A; 4ENM A; 3E1S A; 1DPU A; 2W85 A; 2L02 A; 4NC8 A; 1ERD A; 3GEZ A; 3K0L A; 4AD9 A; 4BXX J; 2O5R A; 3GZ5 A; 1UG0 A; 3E6M A; 3B6C A; 2RDP A; 3ABM H; 4G94 A; 2XGX A; 1KU3 A; 1OR7 C; 3PO2 J; 4ZTF A; 3K1P A; 2JA7 J; 4NNJ A; 1VQ8 I; 1LQ1 A; 1V4R A; 3HKZ A; 5HDK A; 4RB1 A; 1R22 A; 2CW0 F; 3E6D A; 1USS A; 3O6B B; 2V6E A; 2M4G A; 2GAU A; 4ESB A; 2KIU A; 1AA7 A; 4MQ9 F; 1SFU A; 2FOW A; 1SD7 A; 3JW4 A; 4G6D A; 3DKW A; 4RDU A; 5IOY A; 2KJB A; 3F3X A; 1HW2 A; 2BHY A; 3OIQ A; 1J9I A; 2HDW A; 3GCM A; 2LNB A; 1ZRF A; 5J4Y A; 4XR6 A; 5ERI A; 3SHF A; 4U0V A; 3H3U A; 3OYA A; 2EZI A; 1ETX A; 2V9K A; 1UZC A; 2K7L A; 4I76 A; 5DD8 A; 3SQN A; 1ODD A; 3U1D A; 1U9O A; 1IUF A; 3U1K A; 4B44 A; 4AWX B; 4KJZ A; 2W25 A; 5B66 C; 2GZW A; 2LY9 A; 3DBH B; 1T56 A; 3W2W A; 1TBX A; 3O8G A; 5FD6 A; 3KFW X; 3M07 A; 3W6K B; 2COB A; 2DMU A; 2XF7 A; 3I54 A; 1DGW Y; 3RPU D; 2QZ8 A; 1JTY A; 4DGW B; 2OCC H; 2ZO4 A; 2IBD A; 1FEX A; 2CG4 A; 4OIR F; 1IRZ A; 2HDC A; 3ULQ B; 2VT2 A; 1MNM C; 5E3M A; 3D1N I; 4FET A; 1RES A; 1BOB A; 4JK1 X; 2FU4 A; 2DQR A; 1ZAO A; 1QGP A; 2GQQ A; 4HST A; 4M6X A; 2GLO A; 3HG9 A; 1QA6 A; 4EJO A; 1YIJ I; 3G2B A; 4U88 A; 2JPB A; 1P4A A; 4BH9 A; 2IA0 A; 4TV7 A; 2PG4 A; 2VC1 A; 5E1Z B; 4KN4 X; 2HVR A; 2XSD C; 2Y30 A; 5IP9 J; 5KAI C; 4IOC F; 3C2H A; 2FX0 A; 1R23 A; 3RKX A; 1K61 A; 2BOL A; 2FSW A; 4EJW A; 2DDB A; 3BR0 A; 3LA2 A; 3E7L A; 4HV5 A; 3VOD A; 5C4J J; 3JRD A; 3DKY A; 4AVP A; 1BW6 A; 1WH5 A; 3TW7 A; 1FJL A; 5H2F C; 1ULY A; 2X1D A; 4E7H A; 3WTY C; 1R5G A; 2EIN H; 4DIQ A; 1I39 A; 2DAO A; 2F2E A; 3LA7 A; 1HKT A; 2VBZ A; 5CPR B; 4RGS A; 2ELK A; 2DA5 A; 2I8D A; 3EUH A; 3R60 A; 4LLN A; 2OZ6 A; 5LGU A; 3ZP5 A; 1PP7 U; 4PJM A; 5DM6 F; 2VUM J; 2LY2 A; 2LY1 A; 5F0F A; 1IXS B; 5CQE A; 4ASN A; 3S3N A; 1KA8 A; 3AL0 B; 1ZG1 A; 2DJN A; 4ZDP A; 3QPH A; 2MH9 A; 4Y3O A; 5BPD A; 3Q3S A; 1G4D A; 3GTL J; 4HSR A; 4XSZ F; 5CVI A; 2XAG A; 2E34 A; 1IJW C; 5KK1 A; 2V1U A; 1XSD A; 1QU3 A; 2BV6 A; 1XMX A; 2LH9 A; 1IV8 A; 4RBO A; 1SAX A; 2IW5 A; 3WE3 A; 1X1C A; 2QQA A; 2VJ5 A; 4RB0 A; 2X0L A; 3GTO J; 3HBL A; 1SAU A; 2L7F P; 1ZRC A; 3GXO A; 1ZLJ A; 2R5Y B; 1T38 A; 2DFF A; 3CUQ A; 3PM1 A; 1YE9 A; 4B8X A; 1MSE C; 2R7O A; 4HDU A; 1KU9 A; 4CHU A; 3HRT A; 3ZMS A; 4NQW B; 3P9K A; 2EH3 A; 1NHA A; 2HZT A; 2ESN A; 4G9Y A; 3OYH A; 3Q9V A; 3CDH A; 3EPZ A; 4G6T B; 1UFM A; 4BXF A; 3DEW A; 3D0S A; 4IRG A; 1YJW I; 1R71 A; 3BJA A; 2K9Q A; 3P7N A; 5EJC A; 1Z05 A; 5B3S H; 3OV8 A; 3J7A O; 3FBI B; 2EQR A; 4PZJ A; 4A5N A; 1T08 B; 1D8J A; 1Z7L A; 3VYU B; 3K1N A; 2F5E A; 2B63 J; 3QPL A; 3H3V K; 3S32 A; 3A01 A; 2YR2 A; 4PCQ A; 3QPS A; 2IGN A; 3K70 C; 3A03 A; 5D5W B; 4QPO A; 1LE8 B; 2Y9Y A; 2Q2E B; 1UMQ A; 4Z2Y A; 1G2H A; 3EUA A; 4ZH4 F; 1BI0 A; 2ZNY A; 3S17 J; 2TRT A; 3KET A; 3K69 A; 3AG2 H; 5E1X A; 5ETE A; 4UUV A; 2K9N A; 4J19 A; 3DPT A; 2Y9Z A; 2ELJ A; 1OCR H; 4KIG A; 4LY5 A; 3PQK A; 1POG A; 2VPL A; 4XLF A; 2ECC A; 2GXB A; 2RN7 A; 1HW1 A; 4LK0 F; 3CD6 I; 2ZSH B; 2WAQ A; 3OOU A; 1VQM I; 3SXY A; 4QIW N; 5DCM B; 4HBL A; 4RB3 C; 4U0Y A; 4E7S A; 1OYY A; 2LKX A; 5IYD J; 1NG6 A; 1PDN C; 3HOU J; 4I2O A; 1XGO A; 3NAU A; 1XN7 A; 1VQ6 I; 1ORK A; 1T0F C; 3B73 A; 3WE2 A; 2VKD A; 3AG4 H; 1VQK I; 1IUY A; 1GHC A; 3BJ6 A; 2R92 J; 1F36 A; 2DDA A; 3BR5 A; 1E17 A; 1KYZ A; 1MNE A; 2OTJ I; 2FE3 A; 1FYK A; 1SFE A; 4FHT A; 3OYD A; 1GDT A; 2KRF A; 3MWM A; 1YX5 A; 2IS4 A; 1HCR A; 3N05 A; 1FPQ A; 4BS9 A; 5HNF A; 2FBK A; 2W7N A; 5HS8 A; 5ICG A; 1T8I A; 2HPM A; 5J1Y A; 3SDB A; 4JP0 A; 1PUE E; 4Y15 A; 3H35 A; 1BBY A; 2K40 A; 1TLH B; 2W1O A; 4A3E J; 1JXS A; 4GRI A; 3WGG A; 5JVG F; 2F5D A; 3F6V A; 3RKW A; 4I09 A; 4I99 C; 5EYR A; 4PJ0 C; 4F55 A; 2VJ4 A; 3GTM J; 3RQ4 A; 2QSH X; 1JTX A; 4M9Z A; 2M0M A; 3PSF A; 1FZP B; 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