1WVUA

Crystal structure of chitinase c from streptomyces griseus hut6037
Total Genus 74
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
74
sequence length
209
structure length
209
Chain Sequence
GGNNGFVVSEAQFNQMFPNRNAFYTYKGLTDALSAYPAFAKTGSDEVKKREAAAFLANVSHETGGLFYIKEVNEANYPHYCDTTQSYGCPAGQAAYYGRGPIQLSWNFNYKAAGDALGINLLANPYLVEQDPAVAWKTGLWYWNSQNGPGTMTPHNAIVNNAGFGETIRSINGALECNGGNPAQVQSRINKFTQFTQILGTTTGPNLSC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase
molecule keywords chitinase C
publication title Structural Studies of a Two-domain Chitinase from Streptomyces griseus HUT6037
pubmed doi rcsb
source organism Streptomyces griseus
total genus 74
structure length 209
sequence length 209
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2004-12-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00182 Glyco_hydro_19 Chitinase class I
A PF02839 CBM_5_12 Carbohydrate binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1wvuA01
3.30.20.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Endochitinase; domain 2 Endochitinase, domain 2 1wvuA02
1OUGA 4HTQA 4J1AA 4CJ2A 4BAFA 1YKXX 5J7CA 4H9EA 4GCFA 5KXTA 1SLYA 5ILCA 1REYA 3A6BY 4PGJB 2HUBA 1LMQA 3A93A 4NGZA 5KY1A 5HNLA 4WOAA 1LZ9A 3RW8A 2VB1A 3WXUA 1IR7A 1GBWA 2ZIKA 4G49A 4GCEA 4II8A 3ULRA 4OW1A 1NDMC 3HBHA 3W6EA 5E9RA 1FN5A 1B7RA 1GD6A 2BQBA 1NBYC 1GB6A 1HEWA 4DD7A 2BQFA 2FBDA 1JTPL 3ATNA 3TXGA 4XJBA 4NGJA 1EQ5A 4H8YA 1IC7Y 1DPWA 2HU3A 4WMGA 5DLAA 1OUHA 3A3RX 2F2NA 2NWDX 4FDYA 5LIOA 3RNXA 1B2KA 1REMA 1IWYA 4A7DA 2LYZA 2XBSA 3E3DA 4WL6A 7LYZA 4NGKA 3WU8A 1JIYA 4X3BA 3P66A 4DT3A 4WM6A 1AT5A 1LMCA 4HPIA 1LJ3A 2BQDA 2DQIY 2ZYPA 4HPEA 1IR9A 2GV0A 5FDJA 3AB6A 4LFPA 1WVUA 5LAGA 3T36A 1JKBA 1ZMYL 2YBMA 4CFOA 5LYMA 3WW5A 1EL1A 2XTHA 4XJIA 1GE3A 1HELA 4B0DA 1UIHA 3WYHA 1FLQA 5C6LA 2LYOA 3W6CA 1GF4A 1IWWA 4BADA 3IJUA 3TXIA 1LSDA 3QE8A 4QGZA 1HMKA 4PHIA 1FKQA 4I0CA 4W96A 4R6CA 1B0DA 1XGTC 1KIQC 1YANA 4HSFA 1WQMA 3SP3A 5B05A 1HHLA 4H94A 2Z19A 3TXBA 5KXRA 1UACY 3BKHA 1IORA 5APEA 4DWXA 3EBAB 5IDDA 1I1ZA 1OUAA 1BWIA 2I25L 4YOPA 4KL7A 1GBZA 3EXDA 5LVGA 1H6MA 1B5WA 1GFRA 1GF3A 1LHIA 1LZGA 4LZTA 2CGIA 1NKHA 1LSMA 4M4OA 1LZCA 5B59A 3WUNA 1E8LA 1AKIA 1LZDA 2BQJA 1D0MA 3A96A 4PPOA 4WM5A 5KJ9A 1JUGA 1VATA 1KIRC 3A34A 1YAMA 3EMSA 2D4JA 1LZRA 1IWTA 3WVXA 5IELA 135LA 1VDQA 1OUEA 4H9FA 4Z41A 1WTMA 5M1YA 1UIFA 4LYCA 3WXTA 1JTTL 3WMKA 1LHJA 2YDGA 134LA 1B9OA 3AYQA 5LA8A 4XJGA 133LA 2CWIA 2YBLA 4TUNA 1OUBA 1LZSA 5KXWA 4N1CC 4NHIA 4UWUA 1LYOA 5LAFA 1D0LA 1GFKA 2Z38A 2PC2A 5B06A 1HFZA 1TDYA 1B5ZA 1VAUA 2X0AA 2C8PA 4GCBA 4BS7A 5K7OA 1INUA 2ZQ4A 1P2CC 2ZNXY 5KKJA 1LYZA 1UC0A 2MEBA 132LA 2EIZC 2BQIA 3GXRA 3LYTA 5DN4A 1LCNA 5FSTA 1BB7A 1GFHA 1O23A 4OWEA 4UWNA 4C5FA 4ET8A 4H91A 4CGEA 2MEIA 3CT5A 1QTEA 4AXTA 193LA 5I4XA 5ILFA 5HQ1A 1MLCE 1WQOA 1GF9A 5AMYA 3BKVA 4G4CA 1WQNA 3J6KA 2HEDA 4ET9A 4NEBA 4GCDA 2MEHA 5APFA 2XBRA 1ALCA 2LHMA 4NG1A 3WU9A 1C43A 3AZ5A 3AGIA 4ETCA 207LA 1LZ1A 3TXHA 3HBEX 3B0KA 4D9ZA 4NGWA 1GBSA 1UIBA 4DD2A 5DM9A 5HMVA 3WPKA 1LJIA 1LJGA 1B5VA 1G7MC 1DI4A 1RJCB 2F4GA 4UWVA 3WULA 4P2EA 3G3BB 2W1XA 4GCCA 1B7QA 1CKCA 1HSWA 2Z18A 4N9RA 4NWEA 1KXWA 1XEJA 1CJ9A 8LYZA 2LZTA 4HV1A 1A4VA 4CFPA 2BQKA 3TXJA 1YL0X 4EMNA 3HBDA 1QSWA 1HNLA 1F10A 3AGHA 1OUIA 4PRUA 5KXPA 4NHQA 1G7HC 5F9XA 3LN2A 1GE1A 4H9IA 1FKVA 2HECA 3FE0A 4WLTA 3WPJA 3QNGA 5C6IA 1VFBC 1GBOA 4M6DA 1LAAA 3P68A 4EOFA 2ZWBA 4NGVA 1B7OA 1LZ8A 5DN5A 1C7PA 1IEEA 4I8SA 1FDLY 1FLUA 4KXIA 4RLNA 1DXJA 4TSBA 1EQEA 1LJFA 4H9AA 5JENB 1FLYA 2BQHA 5LVIA 4QY9A 1LZ6A 2EPEA 4DC4A 1GE0A 1V7SA 1UUZC 2D91A 4WLDA 3OJPA 4N5RA 5KXNA 3GXKA 1YIKA 4LYMA 2AUBA 1VDSA 4LYTA 1JSFA 2BLXA 2MEAA 3MGWA 4WM1A 5B1FA 1WQPA 1DI5A 2LYMA 1JITA 5EBHA 3AJNA 1BVKC 3N9EA 3B0IA 1CNSA 1T3PA 4NGYA 4E3UA 1HFYA 1GFVA 2BQLA 1UBZA 4H90A 4GN5C 5HLLA 1CJ6A 3WL2A 3W6DA 1LSEA 1HFXA 1LMPA 1WTNA 1YAQA 1Z55A 4H9BA 5I5QA 2DBTA 1GAYA 5L3HA 1AZFA 1JEFA 4B4EA 1IWZA 2Q0MX 3D9AC 3KAMA 5F81A 1D6PA 1LZNA 1KXXA 1I20A 4IJ4A 4DDCA 9LYZA 1LSFA 1LKSA 4KPMA 1BB4A 1HSXA 1LYSA 2BQMA 1AT6A 2G4QA 2ZNWY 3M3UA 3TMVA 1B7SA 3CSRA 5KXSA 2I26L 5KXYA 4AGAA 2BQNA 4XADA 4BAPA 1OQMA 4J7VA 2BQEA 1LHMA 3TXFA 1IOTA 4O34A 1YQVY 3A90A 1GBXA 3CSQA 1JJ1A 1LZ5A 4DD1A 1RE2A 4NIJA 3CB7A 2H9KA 1IP1A 4B4JA 2YBNA 1DKKA 1GB8A 3ZVQA 2BLYA 5A3ZA 3AW7A 1BHZA 1NQIA 3AZ4A 4KT3A 4B4IA 1XGUC 2MEGA 1LHKA 1LJKA 4OOOA 1LJ4A 1LMTA 3LHMA 4H8XA 2IFFY 4WLXA 4YEOA 3J4GA 5A3EA 1QIOA 1C08C 4DD9A 2ZQ3A 1GF7A 1AM7A 1F6SA 1GFJA 1HEPA 1IC4Y 1LJNA 1LSBA 4H9HA 1UCOA 1WQRA 2YSSC 4MR1A 1IIZA 1TEWA 1LSGA 4LFXA 5II3A 4NSJA 1HEMA 4ZEEA 4WM2A 4RW2A 1LYYA 1LSCA 1IO5A 4HJZA 4GLVA 2DQHY 3ZVQB 5I4WA 1XEIA 5LXWA 1GPQC 1IOSA 1B7PA 1JWRA 1OUCA 1HEQA 4H8ZA 4IATA 5LYZA 4N1EI 3W6FA 153LA 1GEVA 2MEFA 4PJ2C 4RDSA 1UIGA 3K3TA 1NMMA 5L3IA 4TTDA 3VWOA 1IP5A 3FI7A 1LZYA 5LVJA 3WU7A 5B07A 1NBZC 5HMJA 2EKSC 4LYOA 2I6ZA 1IVMA 3RT5X 1BVXA 1SQ2L 4J0LA 4U3XB 4NGOA 5D5CA 1NDGC 1RCMA 1GB5A 1QDTA 1W08A 3T6UA 2D6BA 4H93A 1JSEA 2F30A 5LYTA 3WUAA 3N9CA 1IP2A 1T6VL 1KIPC 4NHSA 1C46A 1QDRA 4OWCA 3W3EA 3WVYA 1TAYA 1JHLA 2DQEY 1IWXA 5FEKA 2DQFC 1LZEA 1LSYA 2FBBA 4Z98A 2BAAA 3A3QA 4H9CA 4QDNA 4YF2A 4GN3A 4MSTA 1IR8A 1J1XY 3CQLA 4XJFA 1IOCA 1LJEA 1LHLA 4LYBA 1WQQA 2EQLA 4CHXA 3W6BA 5L9JA 5FHWA 3ZEKA 3A8ZA 3A94A 3G3AB 1GEZA 2ZILA 3CSZA 2MEEA 5APCA 1B5YA 1CKHA 1GFEA 3B72A 2B5ZA 4DDBA 4XYYA 4R0FA 1UIAA 3LYOA 1YROA 1C10A 2F4AA 3P64A 4TWSA 1HEOA 4WG1A 4H92A 5KXKA 3A92A 3WPLA 4LYZA 3WH1A 4L41A 1F0WA 5T3FA 2BQAA 208LA 1XGQC 4ML7A 1LJHA 4RW1A 1GF5A 2W1YA 1FLWA 2DQDY 1PZYA 4LT3A 1BB6A 1GHLA 1YAOA 3D3DA 4HTNA 4G4HA 1C45A 1YKZX 2D4KA 3AW6A 1YL1X 4LT0A 4N0JA 4NG8A 1G7IC 1VDPA 3AGGG 1B5UA 1A2YC 1EQ4A 1LZ4A 4ETBA 1GFGA 4H1PA 3A91A 1MELL 2A7DA 1GDWA 4XENA 2HU1A 2YBJA 1WVVA 1HF4A 4NGIA 4XJDA 3TMWA 3TXEA 2WARA 4Z3MA 2BQGA 5I53A 1TBYA 2HEBA 5F14A 1YILA 4NHPA 1IX0A 1TCYA 4WL7A 2W1LA 2HTXA 1GE2A 1JJ0A 3TMUA 4YEMA 2YBHA 1H87A 2Z37A 2DQJY 1BGIA 1B7NA 2H9JA 1N4FA 3B6LA 3F6ZA 2MEDA 1GB2A 4PRQA 4HV2A 1LMNA 3EO5A 1LSZA 2BPUA 1GB9A 2Z39A 1DI3A 1GFAA 2Z2FA 3WW6A 1YAPA 1VEDA 3P65A 4G9SA 4GN4A 4J1BA 3LZTA 4ETDA 4YM8A 2ZYCA 2A7FA 2XJWA 2DQGY 1UIEA 5D5FA 1JKDA 1B7MA 4NGLA 1GWDA 1DKJA 1GF0A 4NHTA 4RLMA 5LVKA 1D0KA 1LSAA 2N5ZA 4ZIXA 5IHGA 2H5ZA 4ANRA 1GXV2 1G7JC 1GFTA 3CT0A 1BB5A 1V7TA 2G4NA 4XN6A 3OK0A 2BQCA 5LVHA 2Y8PA 1XSFA 5LA5A 1IWVA 1NHEA 1QSAA 1LMOA 1CKDA 5I54A 5KXMA 4YENA 1GXXA 1JTOL 1BWJA 3M18B 5DL9A 4HTKA 4HP0A 3RU5A 1G7LC 2CDSA 2ZIJA 1ZVYB 2FYCA 4XJHA 1LPIA 4DD0A 4QEQA 2D4IA 1J1OY 3A95A 4WM3A 1YKYX 1LMAA 1D6QA 4HJYA 5FCPA 6LYTA 1OUFA 1GFUA 1HMLA 2BQOA 2DKVA 4ZFPA 3A6CY 1HERA 4NY5A 5KXLA 1JJ3A 4IASA 4NFVA 4Z46A 1LOZA 1GF6A 1LZBA 3CT1A 1UIDA 1DQJC 1PS5A 1XEKA 1HC0A 1HENA 1LSNA 1CJ7A 194LA 1REZA 5F16A 2DQAA 1DPXA 1CKFA 1VDTA 154LA 3IJVA 1XGRC 1GDXA 3ATOA 1UA6Y 1GAZA 3QY4A 1JPOA 4NSIA 4B49A 1LHHA 1GB7A 1GF8A 1J1PY 1KXYA 1LTMA 2W1MA 5KXXA 1B5XA 1QUTA 4NSGA 3B0OA 2HEEA 4LT1A 1IP6A 4OWAA 4LT2A 4DD3A 3A67Y 4WM4A 5APDA 1FBIX 4DYGA 4LGKA 1IY3A 4TX7A 1F6RA 5HNCA 1BQLY 4G4BA 1OUJA 5E4PA 4OWBA 3TMXA 1OUDA 2FYDA 1JKAA 2DQCY 1QQYA 1XFPL 5KXOA 4FJRA 1ZV5L 2YVBA 3P4ZA 2C8OA 1IP4A 1NF5A 1LSPA 1IC5Y 1QTKA 2Z12A 1JISA 5I4YA 1DZBX 4N8ZA 1IY4A 5KXZA 4WO6A 1GBYA 5LINA 5FELA 4OOTA 1IWUA 4ETEA 1LZAA 1XGPC 5KKIA 4HJVA 1RFPA 1IP7A 3IWRA 4WO9A 5B1GA 3W6AA 3RZ4A 4WLYA 4DDAA 1LZTA 1GB0A 1B7LA 1GB3A 4NWHA 3LYMA 3TXKA 2MECA 1CJ8A 4B1AA 1BB3A 1CKGA 2Z2EA 3N9AA 1NWGA 2HEFA 1QUSA 2G4PA 3HFMY 4OWHA 4NSHA 1OP9B 1W6ZA 3TXDA 1ZVHL 1RI8B 3WUMA 4GLAA 1LKRA 2IHLA 5C6JA 1LJJA 1IP3A 2RSCA 1D9UA 2HEAA 3LZ2A 4ETAA 4WG7A 6LYZA 3LYZA 5F9UA 2LZ2A 4C3WA 4MCKA 3AZ6A 4W94A 1JKCA 1GE4A 2YBIA 1IOQA 1BWHA 2CJLA 1I56A 1UICA 4TSCA 3AZ7A 1REXA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1OUGA 4HTQA 4CJ2A 3F8VA 1QS9A 5KXTA 3HT8A 5HNLA 4II8A 1T97A 1NDMC 5E9RA 130LA 2CUUA 1GD6A 2OTYX 1L36A 1NBYC 3C8RA 1G0MA 2BQFA 1L91A 3TXGA 3ATNA 1EQ5A 1DPWA 212LA 3E3DA 7LYZA 4NGKA 3WU8A 3P66A 4DT3A 1LGXA 4WM6A 4HPIA 4HPEA 2GV0A 1WTHA 1ZMYL 3WW5A 1EL1A 4LDEA 4XJIA 4B0DA 3WYHA 3W6CA 4DKLA 4QGZA 1HMKA 4LZMA 1FKQA 1KW5A 1OYUA 3ODUA 1HHLA 245LA 102LA 1IORA 1I6SA 1OUAA 4PJZA 2I25L 4YOPA 125LA 2B70A 1LZGA 1LZCA 1AKIA 1LZDA 216LA 5KJ9A 1JUGA 1P36A 3WVXA 5IELA 1EPYA 3HUAA 134LA 5LA8A 2CWIA 4N1CC 4NHIA 5LAFA 1GFKA 237LA 4YXAC 1HFZA 2X0AA 2C8PA 4BS7A 1INUA 1C6TA 1L98A 1LYZA 3LYTA 5DN4A 1L39A 1BB7A 3HH3A 1LGWA 4H91A 162LA 3CT5A 1QTEA 1L12A 193LA 4EPFA 1D3MA 5AMYA 3BKVA 4ET9A 4NEBA 4OO9A 181LA 1NHBA 131LA 1LZ1A 207LA 256LA 1GBSA 173LA 5HMVA 1D2WA 1RJCB 4UWVA 1CV3A 2B6WA 3WULA 4GCCA 1HSWA 4N9RA 4NWEA 129LA 4EXMA 3HTFA 4EMNA 3HBDA 1OWZA 246LA 4PRUA 4NHQA 1G7HC 1L24A 1GE1A 209LA 1FKVA 4WLTA 1GBOA 4M6DA 1C66A 3P68A 4EOFA 1B7OA 1C6NA 1C7PA 4I8SA 1FDLY 4RLNA 1DXJA 1C6HA 5JENB 5LVIA 4DC4A 3GXKA 1YIKA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1OUG A;  4HTQ A;  4J1A A;  4CJ2 A;  4BAF A;  1YKX X;  5J7C A;  4H9E A;  4GCF A;  5KXT A;  1SLY A;  5ILC A;  1REY A;  3A6B Y;  4PGJ B;  2HUB A;  1LMQ A;  3A93 A;  4NGZ A;  5KY1 A;  5HNL A;  4WOA A;  1LZ9 A;  3RW8 A;  2VB1 A;  3WXU A;  1IR7 A;  1GBW A;  2ZIK A;  4G49 A;  4GCE A;  4II8 A;  3ULR A;  4OW1 A;  1NDM C;  3HBH A;  3W6E A;  5E9R A;  1FN5 A;  1B7R A;  1GD6 A;  2BQB A;  1NBY C;  1GB6 A;  1HEW A;  4DD7 A;  2BQF A;  2FBD A;  1JTP L;  3ATN A;  3TXG A;  4XJB A;  4NGJ A;  1EQ5 A;  4H8Y A;  1IC7 Y;  1DPW A;  2HU3 A;  4WMG A;  5DLA A;  1OUH A;  3A3R X;  2F2N A;  2NWD X;  4FDY A;  5LIO A;  3RNX A;  1B2K A;  1REM A;  1IWY A;  4A7D A;  2LYZ A;  2XBS A;  3E3D A;  4WL6 A;  7LYZ A;  4NGK A;  3WU8 A;  1JIY A;  4X3B A;  3P66 A;  4DT3 A;  4WM6 A;  1AT5 A;  1LMC A;  4HPI A;  1LJ3 A;  2BQD A;  2DQI Y;  2ZYP A;  4HPE A;  1IR9 A;  2GV0 A;  5FDJ A;  3AB6 A;  4LFP A;  1WVU A;  5LAG A;  3T36 A;  1JKB A;  1ZMY L;  2YBM A;  4CFO A;  5LYM A;  3WW5 A;  1EL1 A;  2XTH A;  4XJI A;  1GE3 A;  1HEL A;  4B0D A;  1UIH A; 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 1YAP A;  1VED A;  3P65 A;  4G9S A;  4GN4 A;  4J1B A;  3LZT A;  4ETD A;  4YM8 A;  2ZYC A;  2A7F A;  2XJW A;  2DQG Y;  1UIE A;  5D5F A;  1JKD A;  1B7M A;  4NGL A;  1GWD A;  1DKJ A;  1GF0 A;  4NHT A;  4RLM A;  5LVK A;  1D0K A;  1LSA A;  2N5Z A;  4ZIX A;  5IHG A;  2H5Z A;  4ANR A;  1GXV 2;  1G7J C;  1GFT A;  3CT0 A;  1BB5 A;  1V7T A;  2G4N A;  4XN6 A;  3OK0 A;  2BQC A;  5LVH A;  2Y8P A;  1XSF A;  5LA5 A;  1IWV A;  1NHE A;  1QSA A;  1LMO A;  1CKD A;  5I54 A;  5KXM A;  4YEN A;  1GXX A;  1JTO L;  1BWJ A;  3M18 B;  5DL9 A;  4HTK A;  4HP0 A;  3RU5 A;  1G7L C;  2CDS A;  2ZIJ A;  1ZVY B;  2FYC A;  4XJH A;  1LPI A;  4DD0 A;  4QEQ A;  2D4I A;  1J1O Y;  3A95 A;  4WM3 A;  1YKY X;  1LMA A;  1D6Q A;  4HJY A;  5FCP A;  6LYT A;  1OUF A;  1GFU A;  1HML A;  2BQO A;  2DKV A;  4ZFP A;  3A6C Y;  1HER A;  4NY5 A;  5KXL A;  1JJ3 A;  4IAS A;  4NFV A;  4Z46 A;  1LOZ A;  1GF6 A;  1LZB A;  3CT1 A;  1UID A;  1DQJ C;  1PS5 A;  1XEK A;  1HC0 A;  1HEN A;  1LSN A;  1CJ7 A;  194L A;  1REZ A;  5F16 A;  2DQA A;  1DPX A;  1CKF A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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