1WVVA

Crystal structure of chitinase c mutant e147q
Total Genus 74
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
74
sequence length
209
structure length
209
Chain Sequence
GGNNGFVVSEAQFNQMFPNRNAFYTYKGLTDALSAYPAFAKTGSDEVKKREAAAFLANVSHQTGGLFYIKEVNEANYPHYCDTTQSYGCPAGQAAYYGRGPIQLSWNFNYKAAGDALGINLLANPYLVEQDPAVAWKTGLWYWNSQNGPGTMTPHNAIVNNAGFGETIRSINGALECNGGNPAQVQSRINKFTQFTQILGTTTGPNLSC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase
molecule keywords chitinase C
publication title Structural Studies of a Two-domain Chitinase from Streptomyces griseus HUT6037
pubmed doi rcsb
source organism Streptomyces griseus
total genus 74
structure length 209
sequence length 209
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2004-12-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00182 Glyco_hydro_19 Chitinase class I
A PF02839 CBM_5_12 Carbohydrate binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1wvvA01
3.30.20.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Endochitinase; domain 2 Endochitinase, domain 2 1wvvA02
1IY3A 1VDQA 4LZTA 3BKHA 2F2NA 1GB5A 1VDSA 4NFVA 5KY1A 5ILFA 5IDDA 1IOQA 2D91A 1WQQA 3A3RX 5C6JA 2RSCA 2HECA 3QY4A 1XGUC 2YBLA 1BVXA 4NGKA 1DI4A 1LZRA 1IX0A 1LMCA 4NG8A 1GXV2 1LHMA 1BB6A 4BAFA 1GD6A 1TEWA 2BQCA 2MEAA 3WW5A 1J1XY 2G4NA 4H9IA 3AGIA 1VDPA 3LYOA 1UIBA 2DQEY 1F6SA 3A94A 1JEFA 1GF9A 1HELA 1TAYA 3AGHA 3K3TA 3LZ2A 3WU7A 5KXTA 5DN5A 4UWNA 4H92A 1IWWA 1JITA 3W6AA 1BHZA 2D4KA 1CKCA 5HNLA 4XJHA 1AT6A 1UIDA 5AMYA 5B07A 4OWCA 5FEKA 1LKSA 1RJCB 4QEQA 3WVXA 2EQLA 1IWZA 2Z2FA 4OOTA 5D5FA 1B7SA 3D9AC 6LYTA 1IWYA 1P2CC 2H9KA 1B7PA 4OW1A 1LMNA 1CKFA 4WLXA 4WM2A 4NGIA 2XJWA 3A90A 1OUBA 4WLYA 1JWRA 2F4AA 4NHQA 1IIZA 4PRUA 5KXSA 4LT0A 1WVVA 5KXOA 1DQJC 4OWAA 4RW2A 1GBSA 3CQLA 3WH1A 4KT3A 1LMAA 1IEEA 3TXBA 1UIHA 3TMVA 1REYA 1T3PA 1TBYA 4RW1A 1J1PY 3QNGA 1QTEA 3SP3A 193LA 1HSXA 2MEGA 9LYZA 1LSGA 1LJ3A 3AZ5A 4WO6A 2HEBA 1CKDA 1UIFA 4YM8A 4BS7A 1IP3A 2BQEA 1C10A 1GB8A 2CJLA 3EBAB 1JIYA 2A7DA 4N8ZA 5II3A 1IP4A 1JTOL 1LHHA 1RI8B 5LVIA 1EL1A 4XJGA 1LSNA 1LZ6A 4DD9A 2DQJY 2MEFA 1ALCA 1YL0X 4DD1A 4WO9A 1YKZX 1JJ3A 2D4JA 4U3XB 1IOCA 1JPOA 1YKYX 2YBJA 1UIEA 4LYCA 4D9ZA 5K7OA 2YVBA 4LT2A 1YANA 3A8ZA 1GPQC 4TTDA 4TWSA 4Z41A 2Z12A 1FKVA 1D6QA 1UIGA 1KXWA 3CSZA 1B5VA 5E9RA 1DPWA 1IP5A 1UACY 4N0JA 2LYOA 4ETEA 1NDGC 2CGIA 2HU3A 1LSDA 1W6ZA 2C8PA 5A3ZA 4ET8A 3TXIA 3ZEKA 1GFKA 1CKHA 4I0CA 3J6KA 4RLMA 1JKAA 2I6ZA 4LFXA 4DD7A 1IORA 1FKQA 1YAOA 4NSGA 5LYMA 4MR1A 5KXKA 3GXRA 1RE2A 4EMNA 1YIKA 1ZVYB 2FBDA 1WQPA 1QUTA 1QTKA 3ZVQA 1QDTA 1LZ1A 1CJ9A 1LYZA 1LMQA 1C46A 3OK0A 4HSFA 1NDMC 1LJIA 1AT5A 4Z46A 4IASA 1GBYA 4TUNA 1LSAA 1LZSA 5KXNA 2BLXA 1GWDA 1GF7A 4H9FA 3LZTA 3A34A 1B7QA 3TXJA 4XN6A 1FN5A 5B1GA 2F30A 5IELA 4TSBA 2Y8PA 4ZIXA 1HEOA 1LJEA 1LSBA 3TMWA 4LYZA 4II8A 1D0LA 5ILCA 1IR9A 1JISA 1B7MA 1BWJA 1JJ1A 4OWHA 3W6FA 4ETCA 5HLLA 1GAZA 4PHIA 3P68A 4LYBA 1XGPC 3HBDA 1HFYA 4HJVA 1GF4A 4LYTA 5I4YA 4J1BA 1GDWA 4DC4A 4DYGA 1JSEA 2YSSC 1B2KA 2XBSA 1FLUA 4NHIA 1OUJA 3BKVA 1D0KA 4WOAA 5I4XA 2LZ2A 3MGWA 5L9JA 4G4CA 4RLNA 1BB7A 4HPIA 4QGZA 4NHTA 4TX7A 3RU5A 1ZMYL 1UICA 4J7VA 4ML7A 4YEMA 4G9SA 3D3DA 4H9AA 4H8ZA 1VEDA 1C08C 1GB0A 4N1EI 5LYTA 2FYCA 4HJYA 4A7DA 3B0IA 1LYOA 1BVKC 1OP9B 3CSQA 4M6DA 1B7NA 5EBHA 5KXWA 153LA 3IWRA 4PJ2C 2BQJA 2ZNXY 3A92A 4AXTA 3N9CA 1AM7A 2BQFA 3AGGG 5D5CA 2VB1A 5B1FA 1OUCA 1MELL 1IR7A 4NSHA 1LZ8A 1YAPA 3ATNA 4R6CA 1EQEA 5APEA 3WL2A 1YAQA 4WM1A 1G7MC 2ZYCA 5HNCA 2F4GA 3LYTA 4YENA 5APCA 2DKVA 1HMKA 2IHLA 3RZ4A 4DD2A 1O23A 1WQNA 1LPIA 1DZBX 4ANRA 4CGEA 2BQMA 4TSCA 3A91A 4J1AA 1YQVY 4O34A 4YF2A 135LA 1NBZC 1JKCA 1WQMA 4OWEA 5KKIA 1KIRC 4HJZA 3WUAA 4WM3A 1NKHA 1IC7Y 1LHKA 4NG1A 1C43A 2LYMA 5T3FA 1DI3A 2BPUA 1OUFA 1LMPA 2I25L 5LIOA 1LTMA 4NHPA 3ATOA 1ZVHL 1B9OA 3F6ZA 4XADA 3A6CY 4H93A 5FDJA 4I8SA 1CJ8A 1HSWA 4CFPA 1YAMA 4KXIA 2YBIA 3AB6A 1YILA 4Z98A 5KXPA 5HMVA 4NY5A 1F6RA 1NWGA 2EKSC 3LYMA 2BQKA 2ZQ4A 1AZFA 1HERA 1NBYC 4NGJA 5KXRA 4DD0A 8LYZA 5KXLA 4WL6A 1WQOA 2BQDA 3WULA 4NSIA 4FJRA 1KIPC 1HEQA 1WTNA 1GEVA 1HNLA 1LZ4A 4GCCA 1GBWA 4H8YA 1WQRA 4IATA 1GBZA 3N9EA 1CKGA 5F9UA 1GFJA 2YBMA 2XTHA 1HC0A 3HBHA 1LJJA 207LA 4NGZA 4ETBA 5J7CA 2W1XA 4PPOA 1B5WA 1F10A 1LJ4A 2BQNA 3LN2A 4PGJB 3RNXA 5A3EA 4WM4A 1YKXX 4HTKA 3G3AB 4QDNA 5IHGA 3IJVA 5LVHA 2BQAA 1QIOA 5FSTA 3AZ7A 1NMMA 2A7FA 4GCBA 3T36A 4P2EA 6LYZA 133LA 2NWDX 3WVYA 1LZAA 3N9AA 2ZIKA 3CB7A 3EMSA 5LINA 1TDYA 4XYYA 3RT5X 3AW6A 4LYOA 4OWBA 4W96A 4WM5A 2HU1A 2DQIY 4B1AA 3WPJA 1FDLY 1GF0A 1C7PA 4N9RA 1YL1X 1DPXA 1EQ4A 3A95A 5LAGA 3WW6A 5F14A 5APDA 1BB4A 1G7JC 1I1ZA 1KXXA 3W6CA 4XJBA 5KXYA 1GF5A 1XEJA 4KPMA 5C6IA 2WARA 3E3DA 1GB3A 4B4EA 4NWHA 1E8LA 4UWVA 1C45A 1CNSA 1REMA 2YBHA 2Z2EA 1T6VL 3QE8A 4WG7A 4NSJA 1FLYA 1B5UA 3A93A 2CDSA 5HQ1A 3P64A 2LHMA 4B0DA 4H9CA 5L3IA 3WU8A 4H9BA 4J0LA 7LYZA 5FCPA 1LZEA 3ULRA 1KIQC 1H6MA 1UA6Y 2ZYPA 4GLAA 1QQYA 4DT3A 1HEMA 1LJHA 2PC2A 5I54A 1LJKA 2HEAA 2Z38A 2DQFC 1GE1A 2W1YA 4H91A 3A96A 4GN3A 1LSZA 194LA 4GN4A 4DWXA 1IR8A 1J1OY 2BQLA 2HUBA 5LVKA 1XGRC 3W6DA 4WLTA 1IVMA 1B5YA 2B5ZA 1BB5A 1LSEA 3M18B 4G49A 5KXZA 1B5ZA 2GV0A 1V7SA 1SQ2L 1HEWA 3B6LA 1GE2A 1WTMA 1A2YC 1QUSA 4HPEA 3IJUA 2MEIA 2H5ZA 1LOZA 4XJDA 3B0KA 4WL7A 1OQMA 4GN5C 3WMKA 1REXA 3HBEX 2CWIA 4UWUA 4DDBA 1H87A 2DQHY 1JTPL 1G7HC 1OUDA 4E3UA 1B5XA 1GFUA 4NHSA 2H9JA 4LFPA 1LSCA 1BGIA 2XBRA 4HTNA 208LA 3CSRA 3A6BY 3VWOA 1LHIA 1RCMA 1B0DA 1LZNA 2X0AA 3P4ZA 4HP0A 4C5FA 5C6LA 4IJ4A 5E4PA 3TXGA 4EOFA 2FBBA 2ZQ3A 4NGVA 5DN4A 4NGLA 4GCEA 1LZYA 1GXXA 4ZFPA 5DL9A 1IWTA 2FYDA 1JSFA 4HTQA 3P66A 1LJGA 1GFRA 4GLVA 1I56A 1GFEA 1XEIA 1GBXA 2LZTA 1OUEA 4PRQA 2BQGA 4YOPA 1QDRA 2DQAA 2Q0MX 1HHLA 1DKJA 3EXDA 2G4QA 4MSTA 4W94A 1HF4A 3W6EA 1HFXA 3A67Y 1VDTA 4H94A 3T6UA 4H1PA 4BADA 3AZ6A 4HV2A 5KXMA 1W08A 4FDYA 4DDAA 1XGQC 1JUGA 1TCYA 4H90A 1I20A 4ET9A 1IOSA 1CJ7A 2C8OA 3EO5A 3WUMA 5L3HA 1LSMA 1QSWA 1GE3A 1MLCE 1UC0A 1UBZA 3W3EA 1OUHA 3A3QA 4GCDA 4H8XA 4CFOA 1FLWA 3WPKA 1FBIX 5LVGA 1BB3A 1IOTA 2YDGA 2DQCY 1VAUA 1F0WA 2ZWBA 1D9UA 5KXXA 1UIAA 5M1YA 2EIZC 2IFFY 134LA 2Z18A 4X3BA 2G4PA 2MEEA 2W1MA 1LZGA 1IO5A 1IP6A 3M3UA 3WUNA 1LSFA 1GF8A 2BQIA 2Z39A 3TMXA 1LSYA 1LZTA 5FELA 2HTXA 1JHLA 1IP2A 1JKBA 5B06A 4CHXA 4XENA 1DI5A 4B49A 1XFPL 2MEHA 3RW8A 1NHEA 4C3WA 3CT1A 3TMUA 1LYSA 2MEBA 5APFA 1EQ5A 1HENA 1IC4Y 1LJFA 2AUBA 1GFHA 2ZIJA 1KXYA 5LAFA 3B72A 2YBNA 5HMJA 2D6BA 4WM6A 1HEPA 3J4GA 4GCFA 1LJNA 1WVUA 3OJPA 1INUA 1N4FA 4M4OA 1JKDA 1GF3A 2BQBA 5I53A 4B4JA 5F16A 1B7OA 1D6PA 1JTTL 2N5ZA 1IP1A 2HEEA 3CT5A 1GE0A 1QSAA 4LT3A 5F81A 5B05A 3CT0A 5LVJA 2W1LA 4OOOA 5LA8A 1IP7A 3GXKA 1LMOA 5DLAA 4L41A 5LYZA 1GFGA 1LZCA 1AKIA 154LA 5DM9A 1GB6A 4DD3A 2DQGY 2BQOA 4BAPA 1IWVA 3G3BB 3WXUA 1YROA 1GE4A 4NIJA 1NF5A 4XJIA 1D0MA 4ETDA 4ZEEA 4DDCA 2I26L 1A4VA 1DKKA 1Z55A 2Z37A 4N5RA 5B59A 1CJ6A 1LKRA 4H9EA 1OUIA 3TXKA 5I4WA 3FE0A 1XGTC 1B7LA 3TXHA 1IWXA 1VATA 4NEBA 5FHWA 1BQLY 1IY4A 1LCNA 1JJ0A 1HMLA 4LT1A 4NWEA 4WLDA 3TXEA 1REZA 1GB2A 5JENB 1GF6A 1GDXA 4MCKA 2BAAA 4B4IA 3AJNA 4Z3MA 3AZ4A 3AW7A 3WXTA 4NGWA 1VFBC 1GBOA 2ZNWY 1LMTA 3HFMY 4LYMA 1OUGA 4YEOA 3WYHA 2D4IA 5KJ9A 1XSFA 1G7LC 1IC5Y 2Z19A 4G4HA 1LZ5A 3AYQA 1UCOA 4N1CC 1RFPA 4R0FA 1HFZA 2DQDY 3KAMA 2EPEA 1LHJA 132LA 1UUZC 4KL7A 3WPLA 1OUAA 1BWIA 4G4BA 1LAAA 1PS5A 2BLYA 3B0OA 2MECA 3TXDA 1G7IC 2HEDA 1LZBA 1BWHA 5F9XA 1GB7A 3FI7A 3ZVQB 1LZDA 4H9HA 1GEZA 1V7TA 1PZYA 5I5QA 2DBTA 1GFVA 4RDSA 1SLYA 2MEDA 3WU9A 1DXJA 3LYZA 4CJ2A 5KKJA 1LZ9A 1NQIA 1B7RA 1XEKA 1GHLA 4LGKA 4XJFA 1LSPA 4QY9A 4ETAA 1ZV5L 5LXWA 1GFTA 2HEFA 4HV1A 2BQHA 1GFAA 2ZILA 1GB9A 2LYZA 3LHMA 1IWUA 3P65A 1GAYA 4NGOA 4WMGA 3W6BA 3TXFA 5LA5A 4WG1A 1LYYA 4NGYA 4AGAA 1FLQA 1LHLA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1C6FA 2F2NA 147LA 1GB5A 2D91A 168LA 3A3RX 5C6JA 1L69A 229LA 1LMCA 4NG8A 1JTMA 184LA 2BQCA 3AGIA 1VDPA 3CDQA 1L28A 1HELA 5KXTA 248LA 1L90A 3W6AA 1BHZA 4DQJA 1CKCA 4XJHA 251LA 5B07A 1P2CC 4OW1A 4WM2A 1CKFA 2XJWA 3A90A 4PRUA 1C6DA 5KXSA 1P7SA 2LZMA 3CQLA 215LA 257LA 1UIHA 3TMVA 3DN0A 1L47A 1T3PA 3C8QA 4I7LA 1LJ3A 4WO6A 2HEBA 1CKDA 256LA 4BS7A 2CJLA 4N8ZA 3HUKA 3SBAA 1JTOL 4OO9A 236LA 170LA 1CX7A 2DQJY 1YL0X 1IOCA 4D9ZA 4LT2A 1C64A 1DPWA 1OWZA 1G0GA 252LA 2CGIA 4ET8A 3ZEKA 3NY8A 3GXRA 1RE2A 1YIKA 1ZVYB 1WQPA 1QDTA 107LA 1LYZA 4HSFA 3DMZA 1LJIA 4IASA 137LA 103LA 1LSAA 4TUNA 1C63A 1GWDA 4H9FA 1C6IA 3HUQA 259LA 5IELA 3HTBA 4IAPA 4TSBA 1G0MA 1L49A 4II8A 2QARC 3L64A 1OVKA 1QUHA 3W6FA 1HFYA 3RZEA 1T6HA 4DYGA 3HH3A 1B2KA 4NHIA 1FLUA 1L23A 5L9JA 4HPIA 4NHTA 1K28A 4TX7A 1L48A 4ML7A 254LA 4H8ZA 112LA 5I14A 1BVKC 1CTWA 2RB2X 4M6DA 1B7NA 1L80A 157LA 3N9CA 5D5CA 235LA 4NSHA 3ATNA 4R6CA 5APEA 1G0KA 4WM1A 2F4GA 4YENA 2DKVA 104LA 2IHLA 1L17A 2OE4X 180LA 4HJZA 1NKHA 1LHKA 2LYMA 1C67A 1DI3A 1L30A 1OUFA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1IY3 A;  1VDQ A;  4LZT A;  3BKH A;  2F2N A;  1GB5 A;  1VDS A;  4NFV A;  5KY1 A;  5ILF A;  5IDD A;  1IOQ A;  2D91 A;  1WQQ A;  3A3R X;  5C6J A;  2RSC A;  2HEC A;  3QY4 A;  1XGU C;  2YBL A;  1BVX A;  4NGK A;  1DI4 A;  1LZR A;  1IX0 A;  1LMC A;  4NG8 A;  1GXV 2;  1LHM A;  1BB6 A;  4BAF A;  1GD6 A;  1TEW A;  2BQC A;  2MEA A;  3WW5 A;  1J1X Y;  2G4N A;  4H9I A;  3AGI A;  1VDP A;  3LYO A;  1UIB A;  2DQE Y;  1F6S A;  3A94 A;  1JEF A;  1GF9 A;  1HEL A;  1TAY A;  3AGH A;  3K3T A;  3LZ2 A;  3WU7 A;  5KXT A;  5DN5 A;  4UWN A;  4H92 A;  1IWW A;  1JIT A;  3W6A A;  1BHZ A;  2D4K A;  1CKC A;  5HNL A;  4XJH A;  1AT6 A;  1UID A;  5AMY A;  5B07 A;  4OWC A;  5FEK A;  1LKS A;  1RJC B;  4QEQ A;  3WVX A;  2EQL A;  1IWZ A;  2Z2F A;  4OOT A;  5D5F A;  1B7S A;  3D9A C;  6LYT A;  1IWY A;  1P2C C;  2H9K A;  1B7P A;  4OW1 A;  1LMN A;  1CKF A;  4WLX A;  4WM2 A;  4NGI A;  2XJW A;  3A90 A;  1OUB A;  4WLY A;  1JWR A;  2F4A A;  4NHQ A;  1IIZ A;  4PRU A;  5KXS A;  4LT0 A;  1WVV A;  5KXO A;  1DQJ C;  4OWA A;  4RW2 A;  1GBS A; 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 4XJI A;  1D0M A;  4ETD A;  4ZEE A;  4DDC A;  2I26 L;  1A4V A;  1DKK A;  1Z55 A;  2Z37 A;  4N5R A;  5B59 A;  1CJ6 A;  1LKR A;  4H9E A;  1OUI A;  3TXK A;  5I4W A;  3FE0 A;  1XGT C;  1B7L A;  3TXH A;  1IWX A;  1VAT A;  4NEB A;  5FHW A;  1BQL Y;  1IY4 A;  1LCN A;  1JJ0 A;  1HML A;  4LT1 A;  4NWE A;  4WLD A;  3TXE A;  1REZ A;  1GB2 A;  5JEN B;  1GF6 A;  1GDX A;  4MCK A;  2BAA A;  4B4I A;  3AJN A;  4Z3M A;  3AZ4 A;  3AW7 A;  3WXT A;  4NGW A;  1VFB C;  1GBO A;  2ZNW Y;  1LMT A;  3HFM Y;  4LYM A;  1OUG A;  4YEO A;  3WYH A;  2D4I A;  5KJ9 A;  1XSF A;  1G7L C;  1IC5 Y;  2Z19 A;  4G4H A;  1LZ5 A;  3AYQ A;  1UCO A;  4N1C C;  1RFP A;  4R0F A;  1HFZ A;  2DQD Y;  3KAM A;  2EPE A;  1LHJ A;  132L A;  1UUZ C;  4KL7 A;  3WPL A;  1OUA A;  1BWI A;  4G4B A;  1LAA A;  1PS5 A;  2BLY A;  3B0O A;  2MEC A;  3TXD A;  1G7I C;  2HED A;  1LZB A;  1BWH A;  5F9X A;  1GB7 A;  3FI7 A;  3ZVQ B;  1LZD A;  4H9H A;  1GEZ A;  1V7T A;  1PZY A;  5I5Q A;  2DBT A;  1GFV A;  4RDS A;  1SLY A;  2MED A;  3WU9 A;  1DXJ A;  3LYZ A;  4CJ2 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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