1X1OA

Crystal structure of project id tt0268 from thermus thermophilus hb8
Total Genus 98
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
98
sequence length
277
structure length
277
Chain Sequence
WQGGLEEALRAWLREDLGQGDLTSLLVVPEDLEGEAVILAKEGGVLAGLWVAERVFALADPRTAFTPLVAEGARVAEGTEVARVRGPLRGILAGERLALNLLQRLSGIATLTRAYVEALAGTKAQILDTRKTTPGLRALEKYAVRVGGGRNHRYGLFDGILLKENHVRAAGGVGEAVRRAKARAPHYLKVEVEVRSLEELEEALEAGADLILLDNFPLEALREAVRRVGGRVPLEASGNMTLERAKAAAEAGVDYVSVGALTHSAKALDLSLLVVRP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transferase
source organism Thermus thermophilus
publication title Crystal structure of project ID TT0268 from Thermus thermophilus HB8
rcsb
molecule keywords nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase
total genus 98
structure length 277
sequence length 277
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature ec 2.4.2.19: Nicotinate-nucleotide diphosphorylase (carboxylating).
pdb deposition date 2005-04-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01729 QRPTase_C Quinolinate phosphoribosyl transferase, C-terminal domain
A PF02749 QRPTase_N Quinolinate phosphoribosyl transferase, N-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1x1oA02
3.90.1170.20 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Aldehyde Oxidoreductase; domain 3 Quinolinate phosphoribosyl transferase, N-terminal domain 1x1oA01
4JIPA 2YSWA 3A9IA 1EWEA 3PSVA 1NVMA 3NPWA 1NEYA 5D33A 2OT0A 4UUIA 3I68A 3BGGA 3LCHA 4UMBA 4FHAA 3GDKA 2A1YA 1G69A 3HGJA 3OVPA 3S0CA 1HO4A 1FDYA 1W8SA 1QOPA 2RH9A 4O53A 5G4WA 1JCJA 1KTBA 1VC4A 4N9BA 1KTCA 1UB3A 3M44A 3NQ7A 1MEIA 3TJLA 1FBAA 2VFIA 1OFRA 1ZAJA 3LHVA 4XKYB 3OIXA 5E93A 3W22A 3N34A 2ZRZA 3MI3A 5CPMA 4UXDA 4HNNA 3G18A 5D32A 3E96A 5HUPA 3M41A 1KFBA 2C19A 2A4AA 1EP2A 4UTMA 1SO5A 3LXCA 5HWJA 1OX5A 3Q94A 5F1UA 4JTEA 3BG3A 3N9RA 4IMEA 4LRSA 2P1FA 4MLJA 2WNNA 2WSYA 3L0GA 5FF0A 4K8EA 3NM3A 3QRHA 2WSQA 3NL6A 3B0VC 4NJHA 1NFBA 2NXHA 3DI0A 5DBUA 4ALDA 2J24A 3EWUA 4X22A 3W9ZA 3QQ1A 5G2HA 1KFEA 2VOMA 2ZZ2A 3M0ZA 4ZQPA 5EKYA 2ZYFA 3W1AA 3G24A 3M5XA 3M5ZA 1B9BA 3LI1A 1BTMA 2QEZA 3W1QA 5CG7A 2ZZ1A 5D02A 1DKWA 3ABRA 1H7PA 3PC0A 2NWSA 2QCMA 1WA3A 1N7KA 1Q6QA 2QJGA 4UTIA 4DO6A 4A3UA 2GQ9A 3F4NA 2Z0IA 4DPPA 1SW3A 3L0KA 2JK2A 2ZA3A 2YFNA 3PSWA 1EUNA 1I2PA 4M7TA 4HIBA 1A5AA 2QCCA 4EVZA 1OFQA 5LGXA 3G0XA 3LCFA 3N2XA 1LLZA 4MJZA 3L21A 1DHPA 3U6WA 5BRBA 1XDLA 1H7XA 1I2QA 3NQDA 3TAOA 1FY6A 4FF7A 3NYZA 1J2WA 1I2RA 3M16A 4MFDA 3PM6A 4L4MA 4LWWA 4JEQA 3SR7A 2ZZ4A 3W2UA 5FEWA 4NJJA 1DV7A 1E51A 5BNKA 4NJIA 1I45A 2GQ8A 3UY7A 4AHPA 3GYEA 2Z6JA 3A5FA 3UZ5A 3THQA 4GUJA 5DCEA 1QOQA 4QM1A 1TSIA 2NUWA 4TR9A 3R12A 2Q8LA 5G2IA 1TPFA 2Y7GA 1VQTA 4DQWA 3CEUA 4E2DA 2ABBA 4UTTA 4PCFA 3C2FA 4MJMA 4M6QA 2VFHA 4BI6A 2LLEA 3KVMA 3PB0A 1VLWA 1WXJA 3QFEA 4MY8A 4IXHA 2A7RA 3HG2A 4IGHA 4CQAA 1JJKA 1NF0A 4FNRA 1OFOA 4JTKA 3GLCA 1M6JA 1BEUA 1KM6A 5H91A 2BZNA 3QM3A 2ZA1A 1KFKA 5F2MA 5K4ZA 1ZAHA 3ZWTA 2G5WA 1FCUA 4S2CA 1F7BA 2VFEA 1KV8A 2GVGA 2AGKA 4O1DA 3K30A 1TPWA 4FXSA 1B4KA 1VS1A 2RKXA 3S1XA 2R8WA 2ZQ0A 3TX9A 3NQCA 2W0UA 1DQWA 2E5CA 3W72A 2BLEA 1EIXA 3CM4A 4POCA 4TU1A 5HMSA 3TAKA 4FX6M 4U4MA 4DELA 5TIMA 1AL8A 3RNDA 1F05A 3H55A 4UNLA 1A5CA 3O6CA 1AW2A 5I3FA 2OT1A 1QCWA 3A23A 1PS9A 4NZFA 1JRBA 3C0JA 2XN0A 1SW7A 3B04A 1TV7A 3MBFA 3GDLA 3O16A 2Y70A 4IQLA 4ML9A 3CHVA 1M5WA 5IBXC 2VENA 5D05A 2QKFA 2O7QA 5EBUA 2FPTA 3W7EA 4KFPA 5D2VA 2DZXA 2V5LA 1LLWA 2A6NA 3ATZA 3L65A 5D38A 3B06A 3NQ6A 3TCEA 3HGRA 1XL9A 2H8XA 1H51A 4LOCA 4Z0JA 4K8HA 4OV9A 2QCLA 1F76A 4ZQRA 3TFCA 3TV8A 3NR0A 4ADTA 3UYCA 3M7WA 3P81A 1YTKA 5AHIA 2ISWA 3W23A 2Y63A 5C2XA 4FX8A 1JCYA 5K2ZA 3P5ZA 5FEZA 3HGSA 2ZRYA 4WQ6A 3TNOA 1FX6A 1X1OA 4BF9A 1T8XA 5TBOA 1TPDA 1P4CA 3WK1A 4PH6A 2E09A 4H4IA 3DH7A 3DGRA 4N4PA 2DZSA 3TFXA 5K3VA 3QPYA 3B4UA 1XDMA 3YPIA 1A50A 1U83A 2Y62A 4YXGA 5HR7A 1ADOA 3M5YA 2G97A 4M6PA 5G4EA 1QPQA 1LRTA 4CQ8A 2CLOA 3GDRA 1QO2A 1EX5A 3EKLA 3C2VA 3R8RA 2BTMA 4WY0A 3BARA 2V2CA 1LORA 3CIXA 1TTQA 4A22A 2TYSA 3LV5A 1JQVA 1LRQA 3BLIA 2QDGA 2AQWA 4MIMA 2Y85A 4CLMA 3MJYA 3HMJG 1P1XA 4N6FA 1O4UA 1J5TA 4GNJA 1JRCA 2NX1A 1FUYA 2PURA 4Z0SA 2XFWA 4MZ1A 5CSSA 3W7IA 5LHEA 1C8VA 1T0OA 1BWLA 1FWNA 2F7FA 3UWYA 3L5MA 2FB2A 5LNUA 3QW3A 5BW6A 3PUDA 5J5RA 2NZLA 3PBWA 3OEXA 5TQLA 1D3GA 4IPIA 1W1ZA 3S5NA 1T96A 5I3IA 3HF3A 3MP5A 1W37A 3PG8A 3CIWA 3VI2A 1OF8A 5CZTA 1DVJA 1NF7A 2BX7A 2RFGA 3HPSA 3STCA 1W5MA 1OHLA 4MFEA 1SPQA 1GG0A 3UWVA 3I7SA 3W71A 3GDMA 4A21A 4K38A 3LTSA 1CX9A 3G8EA 3N3MA 2H3DA 1IXNA 4FNTA 1K8YA 4CCDA 2FLIA 3A22A 3QZEA 4A2RA 4JS3A 2ZRWA 3SGZA 1ML1A 2CZEA 4RZ5A 1FWWA 1PVNA 5D2WA 2ZZ3A 5FESA 4IXXA 1VLIA 3UXDA 3WJXA 4A29A 5DLCA 1VH7A 3ANYA 2ATSA 3O6YX 3W7GA 3NAVA 2V81A 4AF0B 3BVJA 4JDYA 3W7CA 3UNDA 4MUZA 3IVSA 1C9DA 2J9YA 3EX1A 1M7PA 4O4WA 5EY5A 3PB2A 4AWSA 4O17A 4O28A 1OX6A 1ME9A 5AC6A 2V0TA 2NXIA 4M6VA 2CLEA 4DXVA 4QNWA 3DFNA 2E6YA 2TPSA 4JDBA 1FXQA 4HT3A 1OX4B 1YXDA 5D09A 1XFBA 3TROA 3I65A 3BG5A 3LTPA 5DY3A 3MYOA 4NNBA 4TX9A 4WXZA 4DBDA 4P2VA 3BG9A 5KZDA 3IEBA 3PUEA 5I3HA 4XWUA 3WK0A 4G1KA 2YCEA 3FKKA 7TIMA 3W7HA 3NQEA 4DF2A 5AHNA 1OFBA 3OA3A 4JGDA 5AC8A 1DL3A 2W6RA 3NPXA 3TC7A 3S1VA 3TUUA 1KM0A 4HSNA 3NG3A 1MEWA 1K8XA 4XTDA 3W83A 4BI7A 2HTMA 4GFSA 4LY8A 2PRHA 4QSHA 3MMTA 4JYEA 1YTDA 5CKSA 2BXVA 2JGQA 4O54A 5DY2A 4K7VA 1XUZA 4UFIA 2H3BA 4ZQMA 1PIIA 1GZGA 3P82A 4O1CA 2V2HA 4MZYA 3TK7A 1SUXA 3G1FA 4O52A 5E0KA 3MYPA 5LNRA 4ZMGA 3IRDA 1CI1A 4O4VA 1YPIA 1VR6A 1G7VA 3H54A 1FCQA 1ZNNA 1XBVA 3VNDA 4Z1AA 4LT9A 3N9SA 3BGJA 4E38A 1GTEA 4O8RA 2Y88A 1QAPA 4PEKA 4EIVA 5AHFA 2J9XA 1LOQA 2WJZA 3SI9A 4DPQA 3O06A 1FWSA 3LRLA 3QH2A 1GQNA 2OCZA 1FDJA 1TO3A 3PS7A 4ADUA 3W7RA 3L66A 3L9CA 3UPBA 1F6KA 2ISSA 2CLHA 2VC6A 1XXXA 4KFNA 2A85A 2XN1A 3FEMA 2VEPA 4NXSA 2V30A 4Q4KA 3C61A 4Z1DA 2QJIA 2HMCA 1XC4A 3STGA 1XBXA 4GBUA 3S1WA 5F4SA 4JTFA 1Q6OA 3TJXA 4LS0A 3A24A 1NAL1 4N9EA 3GKFA 3C2OA 4O19A 4QAIA 2UV8G 3W74A 1SR9A 1Q45A 3KVJA 3ZWSA 1TPB1 1YDNA 3NL2A 4UNKA 1G4SA 3UWWA 4UIOA 3EXSA 1LBMA 4JR5A 4O14A 3R89A 2DZVA 1LP6A 4QQ3A 5KTLA 4AWTA 3BLEA 5FF2A 1QWGA 1SQ7A 4UMCA 3UQNA 2Q3RA 3FIGA 4X2RA 4JNMA 4IPJA 2I14A 4UFLA 3TQKA 3UY8A 1YADA 3IV3A 2PRMA 5AB3A 5HNRA 3LXAA 3NQVA 3GK0A 1ICQA 3C4UA 5IM51 3MO7A 3HPXA 2DZWA 1AL7A 2CW6A 1QFEA 4MPQA 1UUOA 4FIQA 5CGQA 3VE9A 1GEQA 1IIHA 3IIPA 2TMDA 3HBLA 4Y96A 3NQAA 2NX3A 1TTPA 4LRTA 2QUTA 4K7YA 3NVTA 2FTPA 4K36A 2A21A 4XZ9A 3W70A 3LOTA 3DFOA 5HR6A 4AH7A 4LV4A 3EXTA 3NL3A 4IMFA 5AYXA 3LCXA 3G1HA 4HN4A 5AC7A 1I2OA 4UTUA 4UR8A 4OBTA 3BW3A 3G1AA 4JYFA 3NQ8A 3ABSA 4NVTA 1PCKA 4RX0A 4WUIA 3DENA 1OK4A 3EX4A 1UJPA 2QCNA 2X1RA 4O0ZA 5F2LA 5K9CA 3MP3A 3TKFA 1KM2A 1MXSA 3O1NA 1SSDA 3HQ1A 1AW1A 4JICA 1SZEA 2ZZ5A 3CU2A 3G3MA 4YLWA 1OFDA 3NA8A 4IOTA 4E2BA 1RQBA 1I8JA 4PA8A 3CWNA 3FYPA 1YYAA 5IBXA 1KBIA 3NZ1A 1DJNA 1R30A 3RLVA 3C2RA 2E6DA 4LTSA 5LSMA 1MSSA 3KOFA 4H6KA 2NV2A 5LKYA 5KZEA 4AEOA 4RK8A 1UUMA 3W1MA 3PVFA 5C6MA 3GNDA 3I6RA 3UWZA 5EA9A 5HULA 1W54A 3P8IA 1G4EA 5I3GA 1G4PA 1I4NA 4WOQA 3P5YA 4OHQA 4NT0A 3SY5A 3IIOA 1JULA 4IX2A 4WY0B 2QAFA 3MHUA 2GVJA 3DFTA 4FXRA 2QR6A 4AMAA 1PHWA 3UWQA 3MHGA 2B7NA 1GVRA 3DXIA 2GQAA 3TE9A 2C18A 5DN1A 3DU0A 5ABTA 3UWUA 1F2JA 3S9YA 4MY1A 2CLKA 3EWWA 2HSAA 4CNNA 3C8FA 4QNEA 3D0CA 1ONRA 3UXAA 5G5IA 1F6PA 1ZALA 2H8ZA 1OVDA 1IGSA 4BR1A 5D2TA 4LNYA 3TXVA 1NSJA 3PUOA 3O15A 2ZTJA 1R2TA 3LX9A 5D30A 3WFAA 3M47A 2ZFAA 3W88A 1ZAIA 3N2MA 4WY0F 3IGXA 3W84A 1WOAA 4LW7A 4LS2A 1SFJA 2JKEA 3W1PA 3TW7A 2FDSA 1GYLA 2VKZG 5G1YA 4JY8A 4HSOA 3R2GA 4O0KA 1KM3A 1H61A 4FB7A 1RQHA 3Q37A 2FPYA 3MWAA 4RZ4A 2HS8A 4JY9A 1GJPA 4LVDA 4NZJA 3HG4A 4C1KA 3ELFA 3G22A 3L5LA 4UTKA 2Q3OA 4O10A 3P62A 3B05A 2F84A 1RZMA 3L5AA 3RU6A 2ZRUA 2ZDRA 3W07A 1GWJA 3M9YA 1TRIA 4D2JA 2CFFA 4I7WA 3W73A 5BOOA 4HNUA 2YXGA 4RZ6A 3W7JA 5K4XA 4NNCA 1XBYA 4NJGA 5LNSA 3W2LA 1VYPX 3O6DA 4EF9A 3TDFA 3LI0A 1TPH1 1TB3A 1ALDA 1EPXA 5I3JA 2ZZ7A 3KVLA 4FNSA 5I3KA 3NQGA 1DOSA 3A21A 3P61A 5EMUA 3VE7A 3W85A 3TU9A 1AK5A 1QPNA 1YLVA 1JQXA 3ABQA 1X1ZA 2DP3A 4RV8A 4Z1BA 4O18A 1DQXA 2GJNA 4M19A 3LLFA 3HOJA 1TPUA 1KLZA 4IX0A 3P67A 5L9FA 4LC6A 1XUUA 3KRZA 2VEIA 3H53A 3N14A 3TSDA 3ZFHA 3F4WA 3C6CA 4UTWC 1HO1A 4JXCA 4JTTA 5KITA 3JRKA 5AYYA 4Q33A 1VGAA 1GVFA 1L2UA 2NV1A 5AHEA 4I9AA 1MZHA 3TSBA 2V2DA 3O8AA 5D04C 1H50A 1OYCA 2AAMA 1P0NA 1P5BA 3V75A 1JUBA 1HTIA 3MW7A 3CLMA 1TPC1 1KFCA 1Q3NA 2GJLA 4UCGA 4MVAA 5HUOA 4RLIA 3PG9A 1L6SA 4IMDA 2ZA2A 4Y9AA 2WPBA 1KA9F 3ZS4A 3OG3A 1EP3A 3AJXA 1TIMA 1LOLA 3GAYA 4O1AA 3E12A 3LRKA 1FXPA 1J4EA 1SO6A 2C0AA 4RKAA 3SGUA 3STEA 8TIMA 2X2GA 3VFLA 1Y0EA 4QIUA 3ZR4A 2OZ0A 4LVBA 4FX7A 3G1SA 3HO8A 1IIGA 4ZZ9A 1FWRA 3G3DA 1QO5A 1Z44A 2V5BA 2A7NA 2OMAA 3IGUA 1EB3A 4LV9A 4OE7A 1IXPA 3LHUA 3W7KA 3OVQA 1SZNA 3W76A 3W7NA 4HNTA 5EYWA 3QPZA 4PL2A 2JBMA 2Z1BA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 2BFG A;  1GQI A;  2QMJ A;  4KW2 A;  2POT A;  4XIA A;  3WBW A;  1UP0 A;  1OFQ A;  2JE8 A;  3PAO A;  4ZTY A;  3LCF A;  4UBP C;  3UG8 A;  4A6G A;  1EZ2 A;  4C91 A;  1WKE A;  2P5N A;  4MKV A;  3E5B A;  4GIS A;  3B8W A;  3TAO A;  3VIF A;  1SR0 A;  1I2R A;  3M16 A;  5LXX A;  4MFD A;  3MWC A;  3C2Y A;  1HP5 A;  1QT1 A;  2RDX A;  3DG3 A;  4YYC A;  2O0T A;  3B0Y A;  1FMA E;  1E51 A;  2Z1S A;  1I45 A;  3OZO A;  3OHM B;  3K4D A;  4AHP A;  3GD6 A;  3KTC A;  3A5F A;  3TN3 A;  1QXL A;  3THQ A;  5DCE A;  1QOQ A;  3PZI A;  2IXV A;  3KCL A;  2HNE A;  2C8N A;  3L4T A;  5I24 A;  4BY3 A;  3LPF A;  1TPF A;  4E2D A;  4MNM A;  1EJV C;  2GGJ A;  1H09 A;  1VEM A;  3RHG A;  4UQB A;  4UTT A;  3ARR A;  4UOQ A;  3EKG A;  4MJM A;  4BI6 A;  3ITC A;  1HNY A;  4ZFC A;  3PB0 A;  1JZ6 A;  1VLW A;  4J28 A;  4H04 A;  4RE2 A;  4W8A A;  4EPE C;  3BQ6 A;  3GBE A;  2XU2 A;  1OFO A;  3WDI A;  1W2V A;  2GWG A;  2FVK A;  1KFK A;  5K4Z A;  3A4A A;  1ZAH A;  4H8N A;  4PUJ A;  1V02 A;  3PNZ A;  4ICC X;  1FCU A;  1F7B A;  4GD0 A;  2NQ9 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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