1X5CA

The solution structure of the second thioredoxin-like domain of human protein disulfide-isomerase
Total Genus 18
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
18
sequence length
121
structure length
121
Chain Sequence
b'GSSGSSGPVKVLVGKNFEDVAFDEKKNVFVEFYAPWCGHCKQLAPIWDKLGETYKDHENIVIAKMDSTANEVEAVKVHSFPTLKFFPASADRTVIDYNGERTLDGFKKFLESGGQSGPSSG'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Protein disulfide-isomerase
publication title The solution structure of the second thioredoxin-like domain of human Protein disulfide-isomerase
rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Isomerase
total genus 18
structure length 121
sequence length 121
ec nomenclature ec 5.3.4.1: Protein disulfide-isomerase.
pdb deposition date 2005-05-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1x5cA01
4BA7A 1R7HA 3LGCA 2MMOA 4KDXA 3F4TA 4OCFA 3F9UA 2H30A 5CAXA 2YNXA 2HT9A 1VF1A 4TXOB 2OE0A 3HCZA 3HKRA 2VCXA 2WRTA 3DVWA 2MBSA 3KMNA 4LL4B 4ZL7A 2YPMA 4K0NA 4OFTA 1JLWA 1V9WA 2P0GA 1XFLA 1A0RP 3IAS2 3L9UA 1OC3A 4I2UA 4TR1B 1G0TA 2VLTA 2BTOT 2P5RA 1GL8A 3HJOA 1G6YA 2JL4A 3KTBA 2H74A 3DEXA 5LNKe 1HYUA 2YJHA 5J5NA 2JSYA 2CZ3A 4RUVA 3IC4A 1YY7A 2P5QA 3ZFBA 2M72A 3GX0A 3ME7A 2PGTA 3BCIA 1HQOA 2IMEA 1B8XA 1SKWB 1GWCA 3QAWA 3VPQA 1GRXA 2JZTA 1PA3A 3QD9A 3KP9A 3TCOA 3GN3A 6GSVA 3LJRA 4FYBA 4BL7A 4BVXA 3DD3A 1XCCA 2GZPA 4Q5NA 3FHKA 5F07A 2QGVA 5H5SA 1SL1B 1EGRA 2FHEA 1BQ7A 3IR4A 4ILFA 1Z9HA 5DAKB 2HI7A 5DVBA 1SL2B 3IV4A 3UARA 4GQFA 4PQHA 5EVOA 1F3BA 5G2ZA 3HJPA 1NM3A 3F6DA 3GUSA 3MAKA 1SL0B 3VFIA 2TIRA 1X5DA 3Q19A 3D5JA 3EYTA 3L9VA 1Z3EA 2VLUA 1ERVA 4WBRD 3TRPA 2O7KA 2IWTA 3ZITA 5FWGA 5ECSA 4NMUA 5IMCA 1X9MB 2L6CA 5D9WA 5L71A 3CSJA 1ZZYA 4GRFA 2DMMA 4KB3A 3TKSE 2P31A 1XWKA 4PNFA 3QAVA 4WEYA 2MMAA 2V6OA 5ID2A 2HE3A 3I6AA 1Z6MA 5JWQB 5DCGA 1S3AA 2CX4A 2I1UA 1K0DA 4CW9A 2K6VA 1WMJA 1TKDB 1GSFA 2V6KA 3QFBC 2LQOA 5CYYA 2PVOC 4NV5A 1K0AA 3EC3A 1W4VA 1Y6EA 2FCHA 3M3MA 4V1Ag 1ZCPA 3AY8A 2C80A 4F2IA 3DXBA 2MZCA 1URMA 1FVKA 2C0EA 4AF2A 4DSRA 1E6BA 1X0RA 5HR2A 4MH2A 4ZL8A 2AB6A 1K0NA 4L5OA 3KH7A 5KN2A 5DJMA 5IOXA 4QL7A 5GAND 4ECCA 3TJBA 1JZOA 2I3YA 4IJ3A 3TB2A 3HD5A 1SKSB 2VO4A 16GSA 4XTSA 2LTKA 3VPTA 2EIOA 4XHMA 4ISDA 5ECRB 5D73A 1X9WB 3M0FA 1AIUA 5JWRB 2H76A 4JR4A 5G1LA 3LWAA 1ABAA 4MZBA 4O92A 1GSEA 5IPGA 2YP6A 2YWNA 1LBKA 2AJQB 5J4UA 1JZWA 3ZYWA 4V2NA 3DMLA 3U5RE 4RQXA 4XRAA 2GTUA 2O89A 1TRWA 2H0HA 2O8VB 2C3TA 4IP6A 1A8YA 4AJ6A 5C04A 4YQMA 4CDOA 5B8BA 1Z7RA 1UC7A 1WJKA 1XWAA 2L4CA 4CHSA 1GUHA 4TXOA 4G2EA 3UJ1A 5CRWA 3H1NA 4MF6A 4TR4A 1MD3A 5ABRA 1PKWA 2GS3A 2L6DA 2B7KA 2LJRA 1PGTA 3Q18A 2C3NA 4OD7A 4MH3A 3TGZA 3FZ5A 5CO3A 3L0HA 4KGIA 4D73B 3GSTA 2RIIA 1USBA 1HNBA 3QAGA 2KOKA 3IA1A 4FO5A 2LRNA 4NV2A 4TR1A 4TRXA 1DBYA 1SYXA 2C0DA 1QMVA 1XOAA 1XIYA 4MJBA 2VD1A 3UL3A 2REMA 3GIXA 2GSTA 4ZIJA 1GSQA 1DSBA 2NTOA 3E9JB 1EWXA 4G19A 4EXJA 2YZUA 3ZRDA 3I43A 3DGQA 1T1VA 1AQVA 1V58A 14GSA 4MPFA 3LXTA 2QKEA 20GSA 3QCPA 3TDGA 3O6TA 2D2ZA 2DJ1A 4KSMA 2DJ2A 2C8UA 4JRRA 3TKRA 5A4WA 3M1GA 1EP8A 1GTUA 5JWOB 1V2AA 4V2MA 2FA4A 2R5GA 3IK9A 1PX6A 3GRXA 1TTZA 5IOWA 2VCZA 1GTAA 4GTUA 1ACVA 2H6YA 4WKWA 3EU3A 5HFKA 5DAKA 2AAWA 4YQUA 1GSUA 3HA9A 2RM5A 3IK7A 1TRVA 5IO0A 1F2EA 2R3XA 2F9SA 5ECMB 6GSXA 3ZVJA 2B5XA 2VM2A 1ERTA 5F0GA 1FB0A 4MDCA 4BWQA 3OR5A 1A2MA 4EC0A 3UIWA 2YCDA 4IW9A 4TW5A 3QMXA 3TOTA 1HNAA 3P7XA 2F51A 4KA0A 1U87A 2CX3A 4MABA 1DUGA 1TI1A 1O8WA 2B3SA 3N5OA 3DYRA 4TR3A 4MA9A 1SENA 2V32A 3KH9A 1LU4A 4HQSA 1G7EA 5IMFA 1PMTA 2I9HA 4MZWA 3VK9A 1RQMA 4ZBAA 4KSOA 2XPDA 3KIJA 1RW1A 4K2DA 5D9XA 1AQXA 4PNGA 2H0IA 3WT2A 3EE2A 1S3DA 4HI7A 4XCSA 2GZZA 4NPBA 1QFNA 2E2GA 2IPAA 2VOCA 4ZXGA 4BWSA 3F3QA 2V1MA 4HS1A 3TKPA 2V2GA 1VF4A 5IIZA 3APOA 2HZEA 1GSDA 2YWOA 4I5QA 5DJLA 2B5YA 5CP1A 4MJCA 4ECBA 4GSTA 4I97A 1HNCA 3RAZA 5J41A 1TU7A 1TK8B 1KEBA 3IPZA 1B48A 1FB6A 5D9VA 5IQYA 1TRUA 3ERFA 1O73A 1OYJA 5INYA 5LD0A 4HU7A 5ECNB 5G5FA 1XWCA 1T8EB 3WT1A 2DLXA 4F9ZA 2WS2A 5DALB 1QK8A 3LFLA 3TJJA 2EC4A 2OBIA 1M2DA 3TKSC 4ZB8A 2YV7A 1NW2A 3GKNA 1GH2A 6GSWA 1M7TA 1S3CA 2PMTA 2FWHA 4V1Ap 2AYTA 4KNDA 3A3TA 4KW6A 2N5AA 3FR3A 3O3TA 5ECQB 4OFMA 1T00A 1FG4A 4AJ8A 2AHEA 2X8GA 2DJ3A 5GSTA 3US3A 1VF3A 3A5WA 1OAZA 1MD4A 2CAIA 2OBKA 4KX4A 4LMWA 4GF0A 2CAQA 3APQA 3EMXA 22GSA 5IO2A 1EEMA 4O7HA 4J56E 2FLSA 4HU9A 4P3YB 4KDUA 3L78A 4EO3A 4HZ4A 3I9V2 4XRDA 5HR1A 1M9BA 3LG6A 5E59A 4I8BA 1SJ6A 3FEUA 1MTCA 1OE7A 3VWWA 3J7Yk 1ZGNA 3R2QA 3FKFA 4K0GA 4MJEA 2XHFA 3G7IA 3QDNA 3KD0A 4G9HA 1I9DA 1N8JA 2VL2C 11GSA 3BOAA 3CXGA 1X5EA 1KBNA 4MJAA 4I2TA 2GLRA 2IFQA 3ZIJA 1OC9A 3VWUA 1K0MA 4RI7A 3BCKA 1KNGA 4XS4A 4KUNA 3GH6A 3KGKA 4BVYA 18GSA 5G5EA 3PINA 4YQVA 1VGLA 3GL3A 4K7NA 1PX7A 3RPPA 4E8EA 4L0UA 2CV4A 5JCWA 4I6XA 4XS6A 4NHZA 2YWMA 2CA8A 2FNOA 3P90A 2GQKA 3ZFLA 3VWXA 1ON4A 3LQ7A 2H1GA 3FW2A 1T4YA 2H75A 2OJLA 1Q4JA 5CRGA 2HNLA 4K9ZA 2F8FA 3GHAA 3MSZA 4POBA 3TUEA 4Z7XA 3GFKA 3G9BA 2LRTA 4F82A 1XW9A 4PUAA 4JZQA 2OE1A 2WULA 3C73A 3TJGA 8GSSA 4IVFA 3GKKA 1OC8A 2WDUA 1QGVA 4MPGA 2IIYA 5KN3A 2AUVA 1EEJA 6GSYA 1GP1A 3GA4A 3C8EA 1ILOA 4TKYA 3PGTA 1XWGA 1SYRA 4ZILA 19GSA 4JBBA 5C00A 1K0CA 2VCQA 4XS1A 4YAVA 3C1RA 2LQQA 3HY2A 2E7PA 2JZRA 4LMVA 2PBJA 2R2JA 1BEDA 2X99A 3FR6A 3FRCA 2H6ZA 2HRNA 2PERA 2I4AA 1K0BA 4MMMA 3PR8A 2M80A 1T3BA 1FAAA 5ECPB 1K3YA 2PUKC 3V1WA 2F8AA 5CREA 2RUEA 5DQSA 1M9AA 5DQYA 1FW1A 1MEKA 1J0FA 2F3MA 2DJKA 1SKRB 4WR4A 1OKTA 1B4PA 1ZOFA 2FUG2 3RHCA 4F0CA 2YV9A 3BJ5A 4MF7A 2X8HA 3TJFA 1GULA 2JZSA 1Y25A 1TP9A 2E0QA 2R6KA 3ERWA 3S9FA 3TRXA 3E3EA 4GWRA 4K8MA 1F6MC 1YZXA 1J08A 2C0FA 3QOUA 3UBKA 4HQZA 2HSYA 4HOJA 4N11A 1O7UA 3GL5A 2ZNMA 3FK8A 1K0OA 3M8NA 1PL1A 1UVZA 3F4RA 1UA5A 3HJMA 2MYGA 5J9CA 2RUFA 4IN0A 4YH2A 5GZZB 1PKZA 2ALBA 3MDKA 4F0BA 1BG5A 2DMLA 4YAPA 5H5QA 2GSQA 3MNGA 4TVEA 2CT6A 3C71A 4EKZA 3IXRA 4FYUA 2GDRA 2PN8A 1GSSA 4MLYA 3FR9A 1WWJA 1AXDA 1A8LA 1SD8A 4G10A 3NZNA 3UMAA 1A24A 3TJKA 4TXVA 3MWHA 2HYXA 2ON7A 1TK5B 2A2SA 4RQRA 2KLXA 4H86A 2VL9A 5G30A 2LJAA 2DSAA 2GT5A 1UN2A 3DIEA 5EL8A 5DCHA 3DRNA 4EL1A 1O8XA 3W8SA 2GZYA 1EP7A 4PURA 3VURA 4WETA 4MCUA 3RDWA 3EVIA 3GX8A 4J2FA 2PPTA 1OKDA 3GSSA 1ERWA 2IN3A 2FWGA 1G7OA 1GLPA 5AISA 4EDYA 4ZB6A 2H66A 5JCGA 1YJ6A 3ED3A 2C0GA 2LRCA 5HR3A 4GQCA 4ZBDA 3UAPA 2WJUA 3GTUB 2LSTA 4ACSA 2VL3A 1Z6NA 4TN8A 4TR0A 2L57A 3SWLA 1YQ1A 4K6XA 2B5EA 3LYKA 3H4KA 1GLQA 4POMA 5ECHB 3ZMKA 1XZOA 2K8SA 2DJJA 2OACA 3FY7A 4IKHA 3HHVA 3VWVA 3DWVA 1SJZA 1O6JA 3G7YA 1MDIA 1MDKA 1H75A 3L9SA 3O76A 1QQ2A 1WP0A 2L5LA 2YJ7A 1EZKA 3HXSA 3ZLPA 1FHEA 2MBTA 2LNTA 1N2AA 1R26A 1XW6A 1M99A 2WCIA 1GNWA 5AIVA 2OADA 2JU5A 6GSSA 2DBCA 1TW9A 5HR0A 2XPEA 2H01A 1B9YC 13GSA 5B6MA 10GSA 3BBYA 2GT6A 2K8VA 2YANA 1E2YA 3UVHA 1VF2A 3TKQA 3GV1A 2YOIA 1W89A 2FY6A 4F03A 3UVTA 4BPYA 3GKMA 2CVKA 3D0ZA 5GAPD 2EIQA 2H0GA 1TXXA 3APSA 2HXKA 5D9TA 3WGXA 1PQNA 2VCVA 2GVPA 4NAXA 3CBUA 3G7JA 3UEMA 5CRHA 4NHWA 4EDZA 2PVQA 4TOPA 2PU9C 1ERUA 3LYPA 2MMNA 3H79A 1F3AA 4WF4A 4J57E 4MZCA 1X9SB 4HUAA 5A4VA 5G1KA 3EMPA 3FYGA 3CTFA 1V98A 1AUCA 5IMAA 2QSIA 4POKA 5B8AA 1A23A 3FZ4A 2IJYA 4X1UA 4WBJA 3HVVA 2OA7A 1IYHA 3L4NA 1U88A 5A4UA 2K9FA 3KJYA 4O32A 2CZ2A 2ZUPA 5EY6A 4GSSA 3CMIA 2LV3A 4XIHA 1T7PB 1EV4A 2B7JA 4PXOA 1DE2A 2X64A 4N0VA 1QUWA 3ZL5A 1TDIA 2ON5A 2O85A 5KN1A 4GCIA 5GSSA 7GSSA 5B7CA 4AJ7A 1CQGA 1C72A 4DSQA 1OVNA 4MP4A 1XW5A 4HDEA 1XWBA 3KMOA 3Q6OA 2VL2A 2KUCA 2OKAA 3UBLA 5EPFA 2KP2A 3H93A 4HJ2A 5G31A 3IBHA 4KCAA 3ZZXA 2O87A 4POLA 2FWEA 1YDKA 1T4ZA 1R4WA 3JCML 2L59A 4LA1A 2DIZA 2M46A 2KP1A 2LJKA 1WRYA 1DE1A 2H73A 1J9BA 5KEJA 2HZFA 3NOFA 5COHA 1V57A 4IBPA 12GSA 4ML6A 3CRTA 1ST9A 3F4SA 5F05A 3WD6A 1TRSA 5ENUA 2GGTA 1GUMA 3N9JA 4D73A 1CQHA 2VD0A 3QPMA 4GSNA 2Z9SA 4FIWA 4PGTA 3D4MA 3HYPA 4ZB9A 4GXZA 3RPNA 3ISOA 1FOVA 5IPHA 2HRFA 2HSHA 4IGJA 5AGYA 3ZIVA 1O81A 5AN1A 5J9BA 3HVXA 6GSUA 4ID0A 1SU9A 1MDJA 2VIMA 3D21A 1U6TA 3ERGA 3GTUA 2RM6A 3IHQA 5HQPA 3QR6A 2LUSA 4PQIA 5B6NA 3A2VA 2DJ0A 1YKCA 5FT3A 4LL1B 2IL3A 1BX9A 3D22A 2YWIA 1LJRA 4DSSB 3C7MA 1Q98A 1GNEA 1YEXA 3K8NA 3LORA 1A0FA 1BYEA 2K18A 4OCEA 3IE3A 1A2JA 2HFDA 3W8JA 3FZAA 2WB9A 1IYIA 2WGRA 2B1LA 3KCMA 3ZREA 5ECOB 4KH7A 2GQMA 5IMDA 3ZVJD 4NXIA 3EWLA 4K7IA 4OO4A 1GUKA 4JEDA 5F8BA 3RBTA 1WPIA 3KP8A 2NPBA 2XBIA 4N30A 2GSSA 1ZL9A 1NHOA 1SK1A 4PX1A 4PUFC 5IMVA 5LCZA 2A4VA 1A2LA 1SD9A 1KTEA 4X43A 2NVLA 4DVCA 3H8QA 4OFNA 3W6GA 4N0ZA 1NSWA 4KDYA 3IDVA 4AGSA 1NHYA 2GQLA 3IAM2 1V40A 2N5FA 3Q74A 1GTBA 5H5RA 1ZYEA 5ECIB 4JU5A 3DVXA 1O85A 1EOGA 3F0IA 4Q5FA 5AIXA 3GYKA 2LEGA 1F9MA 1R5PA 2HZEB 9GSSA 2NDOA 4EF0A 3FZ9A 3A2WA 1PL2A 4JE1A 2E2MA 3C1SA 3GURA 2NBSA 3KTLA 2B6MA 4QL9A 1R5AA 2IMKA 1BAYA 3VI5A 3UOMA 2CVBA 1TK0B 2H1DA 4IQAA 4EUYA 4QQ7A 2JSZA 3U6VA 1HD2A 3WGDA 3LSZA 4HEA2 4WF5A 2G0FA 3F6FA 3HZ8A 4IJIA 5FHIA 1PD21 4PQ1A 5JCUA 4WR5A 2FA8A 4EE0A 3GH9A 3ME8A 1I5GA 1TJDA 1WOUA 1B4QA 5DALA 5F06A 3P2AA 1M2AA 2H70A 4Q5QA 3LEFA 1B9XC 1EV9A 5HFIA 3P8WA 4KE3A 5ECLB 3ZMLA 4JR6A 2JACA 3GKXA 2R37A 1EGOA 2VCWA 1PN9A 2FD3A 2R4VA 1BJXA 1QXHA 5DBQA 6GSTA 1VRSD 3IOSA 2J9HA 2XBQA 5D93A 3GNJA 4K1FA 4KCEA 3HVSA 5E4WA 2VAFA 4FYCA 2IMDA 5KN0A 2C1YA 2H72A 2VM1A 2H1BA 3E0UA 2CQ9A 4ECJA 1THXA 5D8IA 2L5OA 1M2BA 2JADA 1U3AA 1GTIA 3DKSA 1TOFA 2A2RA 2C4JA 2X8CA 2IFQB 1OC9B 2J23A 3EURA 3KM6A 5ELAA 3M9JA 2TRCP 4ULXA 3HDCA 3BD2A 3VLNA 2L4QA 1FVJA 4XS4B 2WZ9A 2HLSA 3RHBA 1SK2A 1XBSA 3F63A 2B1KA 1JZRA 1WE0A 1ZYQB 2AV4A 3WYWA 17GSA 3IRAA 1H4OA 3F8UA 1G6WA 5A5KA 2I81A 4V2LA 3CSIA 3QFAC 2H6XA 4KAEA 2WFCA 5D96A 1F37A 2N5BA 4IS0A 3J7Yb 3D4TA 5IM9A 4ML1A 3LXZA 2YN1A 3M9KA 5DDLA 2G2QA 1SJIA 2LNSA 3I69A 1FO5A 3SBCA 1YKAA 3NIVA 4IHUA 1XPVA 1WIKA 4DSSA 4HZ2A 4NWYA 1SK0A 4OMVA 4X0XA 2H1AA 4IQ1A 1U3IA 3ZTLA 1ML6A 2H19A 5ID2B 2CVDA 4EVMA 2H8LA 4L5LA 4ZL9A 4E8HA 5ECKB 2DIYA 1JZDA 3PH9A 3TOUA 1M0UA 1THOA 5IMZA 3KZQA 3KEBA 5ELGA 3TRQA 4RI6A 4K7OA 1YEPA 1OE8A 4L8EA 2ZCTA 4MF5A 3CRUA 3CTGA 1TI3A 3CYNA 3TKSA 2RLIA 3VI7A 2OE3A 3HZ4A 1PRXA 1X5CA 2LS5A 2VUPA 3A2XA 2MMZA 2FGXA 2YZHA 3F3RA 2IMFA 2DC5A 1ZMAA 1AAZA 4IELA 1Z5YE 1JLVA 2XC2A 1RK4A 3WGEA 2EIRA 4O5RA 1YF0A 4MK3A 2BMXA 1XVQA 4DEJA 2VCTA 2C3QA 1YF1A 3CSHA 2LKUA 5J3RA 4OO5A 5HFGA 2KHPA 1XOBA 4OWYA 4L0WA 2GSRA 5CRDA 4ZBBA 4GLTA 1JHBA 1AW9A 3KXOA 1K3LA 4IP1A 2TRXA 4FH8A 3EINA 2ES7A 2VLVA 1JFUA 1PSQA 4ECIA 4LLRA 3D6IA 2PWJA 1TU8A 2V41A 2IMIA 2FWFA 4WXTA 3GMFA 1AQWA 1EOHA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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