1XC3A

Structure of a putative fructokinase from bacillus subtilis
Total Genus 90
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
90
sequence length
295
structure length
295
Chain Sequence
b'AMLGGIEAGGTKFVCAVGREDGTIIDRIEFPTKMPDETIEKVIQYFSQFSLQAIGIGSFGPVDNDKTSQTYGTITATPKAGWRHYPFLQTVKNEMKIPVGFSTDVNAAALGEFLFGEAKGLDSCLYITIGTGIGAGAIVEGRLLQGLSHPEMGHIYIRRHPDDVYQGKCPYHGDCFEGLASGPAIEARWGKKAADLSDIAQVWELEGYYIAQALAQYILILAPKKIILGGGVMQQKQVFSYIYQYVPKIMNSYLDFSELSDDISDYIVPPRLGSNAGIIGTLVLAHQALQAEAAS'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural studies of ROK fructokinase YdhR from Bacillus subtilis: insights into substrate binding and fructose specificity.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Putative fructokinase
source organism Bacillus subtilis
molecule tags Transferase
total genus 90
structure length 295
sequence length 295
ec nomenclature ec 2.7.1.4: Fructokinase.
pdb deposition date 2004-08-31

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00480 ROK ROK family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1xc3A02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1xc3A01
3IDHA 3O1WA 3QBWA 3R8EA 1GLBG 1HKBA 1DKGD 3G25A 2GTDA 4CD1A 3F9MA 5AQHA 3VPZA 2ZWHA 1YXQA 4BGBA 2YHYA 2GUPA 1ZXOA 1BU6O 1HKCA 4BRQA 3L6QA 2FSJA 4J8FA 1C0GA 1E4FT 3HSCA 3I8BA 3BUZB 5AQVA 3GL1A 1ATNA 2QXLA 3WXLA 3ENOA 4FOIA 1P8ZA 1SQKA 3W3DA 4MLEA 1U2VB 4B1UB 4MLHA 3IFRA 4H03B 4CZIA 2P9UA 1IG8A 5BPNA 2I7PA 4DCHA 3UKRB 3ULEA 4BRHA 3ULEB 3U4LA 3GE1A 5AQRA 4IO8A 3WXKA 4A62A 4BR9A 1ZBSA 4BVPA 4H5TA 1Z05A 1HJOA 4WQ4A 3MK6A 1XQSC 1QQMA 4K41A 4BRDA 4CZLA 4B1VA 1QZ6A 1BOTO 1HX1A 3ZX3A 5AQPA 3VERA 3H6EA 2A42A 3WXIA 4AM7A 3M3ZA 3UE5A 2NRHA 2UYTA 4NB4A 4K25A 5KPTA 2GWJA 4BRKA 4DB3A 3VF4A 1GLEG 2CGJA 3HI0A 3KVGA 4CZGA 3SJHA 1V4TA 3CJ9A 4BGAA 2E88A 3CIPA 5BRFA 3ZEUA 3ZX0A 3ZEUB 3O8MA 3LDOA 5JLFA 2P9SA 2P9SB 4K43A 1KAYA 2Q31A 3MCPA 4DQ8A 4FWMA 1GLAG 4H0XB 1YVNA 2V52B 4FL9A 1U6ZA 5LY3A 4A61A 3O80A 2Q97A 2V51B 1NMDA 3KHYA 2J4RA 1BWFO 3M1FA 5AQMA 3AAPA 3BP8A 4YDUA 3TU5A 5ADXH 4CZEA 4Z94A 3D2EB 4BC5A 4B9QA 2FF6A 3DAWA 1BDGA 3UB5A 3FZMA 4HWIA 2E1YA 2YCHA 4EIAA 5ELZA 5AZIA 5AZIB 5JMVA 1IJJA 3SK3A 3VF2A 4MO4A 5AR0A 5BRDA 3FZKA 4BR4A 3WXJA 4QS7A 3CERA 3VEXA 4KBOA 5KQDA 3MDQA 3L4IA 5BPMA 1OKJA 1DGKN 4GNIA 4XH1A 5AQUA 1D4XA 4H0TB 3IUCA 4BG9A 4EAHD 4FWKA 5BRHA 4IJAA 2Q36A 4BC2A 4BRGA 3ATVA 3EO3A 2P9NA 1JCGA 2P9NB 2Q0UA 4BC4A 5KPRA 3M6GA 4PKIA 1WUAA 4H5NA 1BG3A 3FE1A 4I6MB 4BRIA 4BROA 3JXUA 4CZKA 1HLUA 4BC3A 3CETA 3O6WA 3O4WA 3ID8A 3H3OB 4FSVA 3FLCO 2QWOA 2ITMA 1G99A 4F9OA 3B8AX 1K8KA 1EQYA 1K8KB 4CBUA 2CH5A 2E2PA 3AAQA 1Y64A 3MN6A 2DPNA 1HKGA 1U2VA 2E1ZA 4PL7A 4RTFD 3VGLA 4IWVA 4FWNA 4WQ5C 3RSEB 1S3XA 1WOQA 2D0OA 3JS6A 3UKRA 1DEJA 5EXWA 2D1KA 4BRLA 3CJ7A 4PL8A 2IIRA 5E84A 1X9JA 4BRCA 1JCFA 4FWLA 3VF6A 1E4GT 2E20A 3O08A 3UKUA 3UKUB 5FPDA 4O5FA 3ZETA 3ZETB 3LM2A 1NWKA 3MN5A 4IJNA 3SMSA 3WUHA 3ENHA 3H3NO 3CJAA 1ESVA 3WT0A 4FWSA 2E8AA 4H0OA 3A5MC 3A5OC 4B1XB 5F1XA 4B1YB 2YJFA 3WQTA 2QM1A 3ZX2A 5FPMA 4L3QA 4FOEA 1LCUA 2AA4A 5AQQA 4XEIA 1NM1A 3C7NA 1SAZA 3C7NB 3FZHA 3L0QA 3VOVA 3EL2A 4H5VA 1NGFA 3OHRA 2GEMA 3WQUA 2QWNA 1NGDA 5AQKA 5JICA 3EN9A 4CBWA 2A5XA 3J8AA 4BRMA 2E2QA 2D4WA 2QWPA 1NGIA 2W41A 3AARA 4ISGA 1ATRA 4IXCA 4BR2A 2OANA 5KPZA 3AY9A 1MA9B 1ZC6A 4JD2A 3R6MA 4JD2B 4MO5A 5AFUA 1NGHA 1TUYA 2ZF5O 2Q0RA 4E1JA 5ADXA 1T44A 2GELA 3A8YA 3VEVA 2V7ZA 2ZGZA 4IZ9A 2VYPA 3EZWA 2AP1A 5AQWA 1X3NA 3DJCA 3D2FA 3D2FB 4GY2B 3VEOA 5EY4A 3VGMA 2QWRA 5AFUH 2BTFA 3DWLA 1HPMA 2D0PA 2QW9A 3D7EO 3D2EA 3QFPA 5AQLA 3U9DA 4BG8A 4CZFA 2ZGYA 1HUXA 3CI5A 2Q1NA 4B1WB 2KHOA 4CI6A 1QHAA 3DXKB 2GWKA 3A5LC 3CHWA 4BR5A 2P9KB 1C0FA 1XUPO 4ISFA 1MWMA 4BR7A 5AQJA 1T6DA 5F0XA 1LOTB 4H0PA 4PKGA 5AQYA 5CE3A 3VEZA 2QWLA 3FZFA 1MDUB 2F9WA 2VWBA 4FWQA 3TPQA 1S22A 2NLXA 1BA0A 2CGKA 4BQLA 1KXPA 4CZJA 5BN9A 4BRNA 1ATSA 1RGIA 5EVZA 2I7NA 1BUPA 5EOYA 4I6MA 2QWMA 4JN4A 2NZTA 3HM8A 3U9ZA 2H3GX 3MN7A 1GLDG 4H0VB 2EWSA 5AQIA 1J6ZA 5AQXA 3HBTA 2PAVA 3O5BA 3IMXA 5BPLA 3QMLA 1NGBA 3VEYA 2P9PB 3CJCA 1GLLO 2Q2RA 3WEEB 5AQTA 4XH4A 2FXUA 3GG4A 3HZ6A 1GLFO 4FWRA 4FPAA 5LJWA 1H1VA 5I9EB 3U8XA 5AQOA 4WQ5A 2A6AA 3FFKB 4BR0A 2IVNA 3RSEA 4CZMA 1NGEA 1JCEA 2YHXA 3VGKA 3H45C 3VETA 4CBXA 1MWKA 3W0LA 1TUUA 1XC3A 5F2RA 4JNEA 3FR0A 3LDQA 3FGUA 3LDPA 4RWTA 1NLVA 5FPEA 3BF1A 3CJBA 4FO0A 5TKYA 1BO5O 2PBDA 4FWOA 4AM6A 4BRFA 2P9UB 3O1BA 4BVOA 4FWPA 4BRAA 3MMVA 1NGCA 1TYQA 1Z6RA 1TYQB 3QBXA 4CZHA 2P9IA 2P9IB 4EFHA 1KAXA 4RCHA 2VCPA 2CH6A 3S41A 5LJVA 2P9LA 2P9LB 3CQYA 3A5NC 4WQ4C 3CQXA 4PKHA 3ATUA 4B1ZA 5BR9A 1QQOA 2YI1A 1BA1A 4JHDA 4JHDB 3VENA 1GLCG 3DXMA 3DXMB 3QFUA 4A2AA 3H1VX 5AQSA 2WUSA 1YUWA 1YAGA 4CD3A 5AZJA 4FPBA 4LC9B 5AZJB 4BRPA 4Y0WA 1T6CA 3QDKA 4O8KA 2V7YA 3CJ1A 4HTLA 3HTVA 4BQZA 4EHTA 5EX5A 4CJ7A 3FZLA 3LM9A 3GBTA 5AQZA 5AQNA 2FLOA 4H5RA 1RDWX 1Q18A 1V4SA 3A0IX 3VEWA 1R59O 1QQNA 2A3ZA 1SZ2A 3LL3A 4ISEA 2FSNA 3VESA 5B8HA 3GDQA 3P4IA 1NGGA 5KQ8A 1RFQA 2HF3A 4H0YB 4NO7A 1X3MA 1CZAN 3DXKA 3LDNA 1QZ5A 2P9KA 2FSKA 4DHYA 2BUPA 2ASOA 4QS8A 2IVOA 4QS9A 4WYBA 2HMPA 3QICA 5E26A 4EHUA 4YDUC 2E2NA 4M7XA 3BEXA 1NBWA 4A2BA 2FF3B 4BREA 2A40A 3EKSA 1KAZA 2YHWA 3R9PA 1GLJO 2HOEA 3C0BA 4C23A 5BN8A 4M7YA 3MN9A 5FPNA 5AQGA 3I33A 3SLCA 3KZBA 2QWQA 2ASMA 2HF4A 3H1QA 4H5WA 3GOIA 3LDLA 1NGJA 4XH5A 2W40A 3BF3A 3H46O 4JAXA 2A41A 2IVPA 2P9PA 3SMPA 5BREA 5AQFA 5JLHA 2ASPA 3WEEA 2F9TA 4M63C 3EKUA 1NGAA 2E2OA 2YJEA 4K42A 3QB0A 2CGLA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3R8EA 1GLBG 1HKBA 3ZSWA 1DKGD 2GTDA 4CD1A 3F9MA 5MLCQ 1FK9A 2YHYA 1WSJA 3I56N 1BU6O 3AGRA 1HKCA 2XY6A 5AQVA 3GL1A 1ATNA 2QXLA 4LSNA 4DSKA 2WONA 4MLEA 4B1UB 1HYVA 1VSLA 2HHHK 3NF8A 1IG8A 4B08A 3EY1A 2I7PA 1LWFA 4WF9L 4BRHA 3U4LA 2HHVA 3GE1A 5AQRA 4CJVA 3CQ8A 4IO8A 3OYBA 4NCBA 3OYMA 1IO2A 1Z05A 3MCAB 4WQ4A 3L8BA 2Z1HA 1XQSC 2E6MA 1BI4B 1QQMA 2HHWA 1BQMA 4BRDA 3PIPL 4BE2A 1KD1O 3O3FA 1E3MA 5J2MA 1Q9YA 3ZSVA 4FK4A 3HOSA 3T1YK 1S1UA 1WAJA 2A42A 2WC9A 2NRHA 2UYTA 4NB4A 3ITHA 1RT6A 3VF4A 1GLEG 3THYA 3HI0A 1K6YA 3PO5A 1V4TA 1Y97A 4XIUA 4M3UA 5K14A 3ZX0A 1G15A 5C42A 1TL1A 2GX9A 2F8SA 4WFAL 4K43A 5KGXA 1VQKN 1TAUA 3LP1A 2Q31A 3MCPA 4J2DA 4KO0A 1YVNA 2V52B 3ASMA 4FL9A 4NXNK 4FLUA 1CXUA 3PLAA 5LY3A 2QI2A 3O80A 3NF7A 3TAMA 4I2PA 1U4BA 2O8DA 1TK5A 3OYFA 4ILHA 4DQSA 3AAPA 4OPAA 4AHCA 5ADXH 3IAYA 1S1TA 1HMVA 2WFBA 3D2EB 4B9QA 4KHNA 3DAWA 3MEEA 4CHNA 1S5JA 2YCHA 4EIAA 3E01A 5JMVA 3CFRA 4ELTA 3S9HA 3SK3A 1NKCA 4LF5K 4MO4A 1NJYA 3FZKA 3LPUA 5TKWA 3VEXA 4PHTX 1VSMA 1U04A 3MDQA 1JXEA 3CC2N 2KKZA 4ZHRA 1VSDA 2ZQBA 4EAHD 5BRHA 4IJAA 4E1MA 4PQUA 2Q36A 3ATVA 5CZ2A 1JCGA 1N5YA 1VQ4N 1WUAA 5FROA 4H5NA 3FE1A 4WCEL 1BL3A 4BRIA 1OH8A 4DSFA 4GV3A 3VQDA 2UUCK 4CZKA 5JVHL 3O6WA 1J5OA 3ULDA 3ZT1A 5GAHP 3FLCO 2QWOA 4AHUA 3SQ4A 4ILJA 1OH6A 1QSSA 3B8AX 1EQYA 3AGKA 4FVMA 4CBUA 4DV6K 3E9PA 2E1ZA 4C8NA 1N8RO 3LALA 4RTFD 3V6DA 4IWVA 4DTOA 1S3XA 3JS6A 3LPTA 1DEJA 5EXWA 2D1KA 4K0KK 5SWMA 3CJ7A 3K5LA 1FXXA 1S72N 4BRCA 4FWLA 4JKDA 1IKVA 1RBTA 4OX9K 1HJRA 2QTDA 3ZSQA 2QKBA 2NRTA 4KTQA 1Q81O 3K57A 4W5QA 1NKEA 3J7YP 1S9GA 1NWKA 4IJNA 3WUHA 4IEEA 4IOXA 3NGZA 3LZIA 3M8QA 4DUZK 1ESVA 4CECA 3CF5L 4H0OA 2E8AA 5C15A 4B1XB 4FJ5A 4KTWA 4B1YB 4FLVA 2QM1A 1C0MA 4B3OA 1CLQA 2UUBK 3C7NA 3C7NB 4CJUA 4DS5A 3EL2A 3WXMB 1WBDA 3OHRA 3ZT2A 4CW7B 2XHBA 1QVFM 2GV9A 1RT3A 4DV1K 1W97L 3HXMA 1YVUA 3TTCA 4GVMA 1FJGK 1WB9A 3CMAN 1RCHA 4LF9K 1ATRA 1IKYA 5C25A 3R6MA 5DMRA 1VQ6N 4PA1A 4LFBK 2KTQA 2ZF5O 4E1JA 4W5TA 3A8YA 2HHTA 2F4VK 4KKOA 3EZWA 2UXDK 1X3NA 3OYIA 4GY2B 2NRWA 4X66K 2QWRA 2D0PA 3CPEA 3D7EO 3KLIA 1WN7A 3QFPA 4JKCA 4M41A 4CEEA 4DUYK 3SI6A 2YX6A 1QHAA 5DK5A 2XRIA 4OO1J 2KW4A 4HHTA 1KCFA 3KJVA 3OY9A 1VQNN 1MWMA 1W9HA 5F0XA 1T6DA 1LOTB 1LAVA 4RW4A 4G9ZA 1Q82O 4DFJA 4M3YA 4NCAA 2F9WA 4CEFA 1S22A 5KI6A 1K73O 4FJJA 3ZSXA 2VG5A 3KLEA 1QSYA 2I7NA 5EOYA 4CGHA 4MFBA 3HM8A 5M1KA 2H3GX 3MN7A 1J6ZA 3HYFA 1NOYA 5C2FA 1NGBA 1GLLO 4W5OA 2QXFA 5CY4A 5AQTA 3O3HA 3LZJA 4B3TK 3GG4A 1ITGA 4JLHA 5LJWA 3NDKA 4BE0A 4CEOA 2DFFA 1LW2A 3DLKA 3FFKB 3RSEA 3CCRN 4Y1DA 1YJ9N 2PY5A 3LDPA 3G0ZA 5FPEA 3MXMA 3CJBA 1YIJN 4X62K 1NJWA 2PBDA 4AM6A 2NRRA 4BRAA 3TAEA 3MMVA 3VA3A 3JYTA 1SUQA 4W5RA 4CJ3A 1TYQA 1TYQB 4CZHA 4IBNA 2P9IA 2P9IB 2QEXN 4U7BA 1KAXA 1P90A 1NJXA 4IG3A 3C94A 4O0JA 2EHGA 3AVHA 3CQXA 3N4QA 4PKHA 4R79A 4GV9A 3QEWA 1EKEA 3ATUA 3OYCA 3K5OA 4JYAK 4NLCA 3DXMA 3ZSOA 3DXMB 3OS0A 2WUSA 1SL2A 3LP0A 1VSJA 4B3RK 3AV9A 4FW1A 2YKNA 4F3OA 1VQ9N 4CD3A 5AZJA 3P1GA 5AZJB 4CHOA 1XNQK 3SV4A 2G8WA 4FLWA 4O8KA 2V7YA 3CJ1A 4GMJB 4DQQA 4M45A 1LV5A 3NF6A 5E41A 2Z1JA 3U3GA 5AQNA 5CYMA 2FLOA 4HCBA 1V4SA 3HVTA 1QQNA 2A3ZA 1C1AA 1IV0A 3E9OA 5B8HA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 1RT1 A;  3NGI A;  1GLC G;  1QQC A;  3F73 A;  5KTQ A;  1YUW A;  3K9J A;  4PUO A;  4DS4 A;  4FM2 A;  4B9T A;  3HST B;  1DT9 A;  3CCL N;  3R3L A;  1JLE A;  4BQZ A;  2BGG A;  4EHT A;  2KQ2 A;  2NNW A;  4N5S A;  4KHU A;  3CFP A;  3OBW A;  2ETJ A;  3PX6 A;  4FJ8 A;  4JV5 K;  3C6T A;  4IG0 A;  3CFO A;  1HNZ K;  3CCS N;  4H0Y B;  4IDK A;  3VA0 A;  4RG8 A;  3DXK A;  3AVN A;  1NJZ A;  1QZ5 A;  1Q8I A;  2FSK A;  2BUP A;  2ASO A;  2IVO A;  3KKS A;  4DTN A;  2KFZ A;  4PY5 A;  4O55 A;  1BCO A;  3BEX A;  4AH9 A;  4A2B A;  4C1N K;  2FF3 B;  4BRE A;  2A40 A;  2HBM A;  3ENB A;  1KAZ A;  3DRP A;  4M7Y A;  5AQG A;  5CZ1 A;  2QK9 A;  1S6Q A;  3KZB A;  3CD6 N;  3GOI A;  4DR7 K;  2W40 A;  3HPO A;  1KFS A;  1IKW A;  1XHZ A;  2Z1I A;  5H1S Q;  4W5N A;  2F96 A;  1TKD A;  3PX0 A;  5AQF A;  5JLH A;  1TAQ A;  3EE8 A;  2NUB A;  1RDA A;  3BZC A;  4HVJ A;  4Z0U A;  1KRP A;  2CGL A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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