1XC3A

Structure of a putative fructokinase from bacillus subtilis
Total Genus 90
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
90
sequence length
295
structure length
295
Chain Sequence
AMLGGIEAGGTKFVCAVGREDGTIIDRIEFPTKMPDETIEKVIQYFSQFSLQAIGIGSFGPVDNDKTSQTYGTITATPKAGWRHYPFLQTVKNEMKIPVGFSTDVNAAALGEFLFGEAKGLDSCLYITIGTGIGAGAIVEGRLLQGLSHPEMGHIYIRRHPDDVYQGKCPYHGDCFEGLASGPAIEARWGKKAADLSDIAQVWELEGYYIAQALAQYILILAPKKIILGGGVMQQKQVFSYIYQYVPKIMNSYLDFSELSDDISDYIVPPRLGSNAGIIGTLVLAHQALQAEAAS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural studies of ROK fructokinase YdhR from Bacillus subtilis: insights into substrate binding and fructose specificity.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Putative fructokinase
molecule tags Transferase
source organism Bacillus subtilis
total genus 90
structure length 295
sequence length 295
ec nomenclature ec 2.7.1.4: Fructokinase.
pdb deposition date 2004-08-31

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00480 ROK ROK family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1xc3A02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1xc3A01
2KHOA 4FWPA 2GWKA 4FWNA 4H5TA 3RSEA 1NGFA 4PKGA 4DHYA 5AQIA 1ZC6A 3VF6A 4ISEA 3O6WA 3FZLA 4WQ4C 3H3OB 4JAXA 5FPDA 2P9IB 1NLVA 4K25A 4BRNA 2QWPA 1KAYA 5B8HA 1NM1A 3O08A 1HPMA 3VF4A 2QWNA 3LM2A 1ATRA 3D7EO 2J4RA 2VCPA 4ISFA 4C23A 2P9UA 3SK3A 1U2VA 4CZJA 4I6MA 4ISGA 2P9NA 5BREA 2Q0RA 5E84A 3EL2A 4IWVA 1CZAN 4CZIA 3ENOA 1OKJA 1BDGA 5AQNA 2P9KA 2ASPA 2HMPA 2FSJA 4BG9A 1S22A 5BN8A 3CHWA 3FGUA 4BREA 2F9TA 3O4WA 3I8BA 5BRHA 4JHDA 1Q18A 2FSKA 2QWLA 4CZLA 5ADXH 4FWOA 2QWQA 5AQOA 4O5FA 5AQJA 4B1XB 2D0OA 4H03B 3VETA 3HM8A 4M63C 3M1FA 2YHWA 3EKUA 5AFUH 1P8ZA 3R9PA 4M7XA 2ZF5O 3FZMA 5EOYA 3D2FB 4FO0A 2GEMA 1K8KA 1IJJA 3FR0A 2A40A 3WXKA 3EKSA 4BG8A 4CZMA 4NB4A 4JNEA 4B1UB 4BC3A 3B8AX 3ZX0A 4BR4A 3DXKA 3TPQA 4FL9A 1SQKA 4BGAA 3QICA 4FPAA 3KZBA 3QFUA 2VYPA 3UE5A 3ZETB 3HZ6A 1QQNA 3OHRA 4XH1A 2IVPA 1GLJO 1HKCA 3ID8A 5AQYA 4GY2B 2ZWHA 3AY9A 5ADXA 3CJAA 5BRDA 1QZ6A 3IFRA 3DXMA 3VEOA 3GE1A 3ZEUA 1TUYA 2I7PA 3UKRA 4H5RA 3ATVA 3U4LA 5AQRA 4CD3A 1EQYA 3M3ZA 3UB5A 2CH6A 2BTFA 3QBWA 5AFUA 2V7YA 3W0LA 5AQHA 4FWKA 1XUPO 4FPBA 2GTDA 2IVOA 4B1ZA 1HLUA 4A2AA 3WQTA 4BC4A 1C0FA 3CJCA 3L4IA 3WEEB 3LDOA 4A61A 1ESVA 1KXPA 1HUXA 4BR7A 3JS6A 1TYQB 2Q2RA 3L6QA 3D2EB 4FSVA 3JXUA 4QS7A 2YJFA 1GLLO 2HF3A 4RTFD 1NMDA 3QBXA 3A0IX 3H6EA 1GLFO 1MWMA 1RGIA 2ASMA 5EXWA 3VEXA 3SMPA 5AQSA 1BA0A 4BVPA 5JICA 1R59O 2UYTA 2GUPA 4AM7A 5AZJA 2D4WA 2OANA 4BVOA 3VEWA 1XC3A 1RDWX 2FLOA 4FWMA 1GLAG 3DWLA 5AQMA 3MMVA 4FWLA 5ELZA 4KBOA 4H0PA 2FF6A 3LDQA 3GOIA 3CETA 1GLBG 3LM9A 2P9IA 4EHUA 3C0BA 3A5MC 2A5XA 4DQ8A 5AQXA 4A2BA 4BROA 1QHAA 2GWJA 3VF2A 2NLXA 1JCEA 1V4SA 1X3MA 3R8EA 3CJ1A 3H3NO 4B1VA 5TKYA 4IO8A 4WQ5A 5JLFA 1LCUA 3VEZA 1Y64A 2I7NA 3HBTA 1T44A 4H0TB 4H0OA 1E4GT 3MN7A 4JD2B 2V51B 2HOEA 3EN9A 3VENA 3MK6A 3WT0A 1BUPA 4B1WB 4J8FA 3KVGA 5AQWA 3IDHA 1JCGA 4Y0WA 3HI0A 4IJAA 4CD1A 4H0XB 2F9WA 2P9SB 3IUCA 2E2NA 2E1YA 1NGEA 3J8AA 4Z94A 3WQUA 4M7YA 3VGMA 5FPEA 5LJVA 3L0QA 5BRFA 2P9NB 3HSCA 4FWQA 4E1JA 2D0PA 3CQXA 4IXCA 3UKUB 3GBTA 4CZGA 4BRKA 4FOIA 3WUHA 3D2FA 5I9EB 1V4TA 4BC2A 4XH5A 3C7NB 4AM6A 1MWKA 5AQTA 1T6CA 5AQZA 4BRIA 4CBXA 3O80A 2P9PB 4DB3A 2YHXA 3BP8A 3MN5A 2CGKA 4FWSA 4BGBA 3U9ZA 4O8KA 3FFKB 2E2PA 2Q97A 4JN4A 2H3GX 5FPMA 3GG4A 1IG8A 4EFHA 2QWMA 3AAQA 1Z05A 3F9MA 3VGKA 2Q1NA 3QMLA 1K8KB 4XH4A 1WOQA 1NGHA 3BEXA 1DGKN 4GNIA 5F1XA 5AQVA 1YXQA 4RCHA 4BRDA 1BA1A 3KHYA 1D4XA 4PL7A 3MN9A 1BWFO 4K41A 4MO4A 5EVZA 3U9DA 4BRLA 1ZXOA 1U6ZA 5E26A 3O1WA 3G25A 3FE1A 3O1BA 1ATSA 3VGLA 3WEEA 2EWSA 3SMSA 4WQ4A 3CI5A 1KAXA 3LDPA 3DXMB 1TYQA 4L3QA 3D2EA 4CZKA 1T6DA 4MLHA 3FZFA 4B1YB 1BO5O 1G99A 4EIAA 4BQLA 4EHTA 2E20A 2A6AA 3BF3A 5AQGA 3O8MA 1J6ZA 3M6GA 3MN6A 1GLCG 4NO7A 4BRQA 3ULEB 1NWKA 5BPNA 4QS9A 4CZEA 2NRHA 5AZIB 4BRFA 5FPNA 1YAGA 4BR0A 2E88A 2Q0UA 2P9LB 3EZWA 2E8AA 2A41A 4BR9A 1TUUA 2E2QA 4A62A 5AQLA 2PBDA 2Q31A 2CGJA 5F2RA 3AARA 1S3XA 2PAVA 3H46O 3LL3A 4BRCA 3ZX2A 1GLDG 2ZGZA 3BUZB 3VOVA 3LDNA 4CI6A 3CERA 4HTLA 1XQSC 2FSNA 2E1ZA 4MLEA 5LJWA 1WUAA 4EAHD 2ASOA 2CGLA 3H1QA 3DAWA 1HKGA 5KPZA 2AP1A 3VEYA 2IVNA 3RSEB 1MDUB 2WUSA 3W3DA 3ZX3A 4JD2A 4QS8A 5AQKA 1RFQA 4BRAA 1YVNA 1JCFA 3LDLA 5AR0A 4BRMA 4CZHA 1QZ5A 4IJNA 5BPMA 2CH5A 1HJOA 2NZTA 3ATUA 1Z6RA 3VEVA 2P9SA 1ZBSA 1BOTO 2V52B 2FF3B 1DKGD 1NGDA 4MO5A 3QDKA 5KPTA 2W40A 2P9UB 1U2VB 3MDQA 4BR5A 3CQYA 3R6MA 4BRHA 4I6MB 1NBWA 3DJCA 3IMXA 1NGIA 3TU5A 2HF4A 1MA9B 3CJBA 3UKUA 4YDUC 1C0GA 2P9KB 2YI1A 3C7NA 1SZ2A 3EO3A 3WXIA 1QQOA 5KQ8A 3GL1A 2P9PA 1BU6O 5F0XA 4BRGA 5AQQA 1E4FT 4JHDB 5BN9A 2W41A 4PKIA 5CE3A 3CJ7A 4CBWA 1NGAA 1GLEG 1ATNA 3A5OC 3A5NC 3SJHA 2YHYA 4DCHA 2DPNA 4H5NA 5KPRA 1NGGA 3MCPA 5EY4A 1KAZA 3SLCA 3ZETA 3GDQA 4WQ5C 1HX1A 1LOTB 2VWBA 2QW9A 4WYBA 5JMVA 3AAPA 4XEIA 2A42A 2YCHA 4HWIA 4PL8A 2BUPA 2E2OA 3VPZA 5LY3A 4CZFA 4IZ9A 1NGCA 2V7ZA 2D1KA 3P4IA 3WXJA 1YUWA 2AA4A 3DXKB 3CIPA 3WXLA 3H45C 3QB0A 3H1VX 5AQUA 3BF1A 4BR2A 4FOEA 3CJ9A 3VERA 3ZEUB 3O5BA 4H0VB 3QFPA 3UKRB 2QXLA 4B9QA 1SAZA 2QWOA 5EX5A 4F9OA 4FWRA 4H5VA 5KQDA 3S41A 2FXUA 5AQPA 1X3NA 3A5LC 4BC5A 3ULEA 3FZKA 4RWTA 3VESA 5AZIA 2IIRA 4PKHA 2GELA 1NGJA 2ZGYA 4H0YB 3U8XA 3I33A 2P9LA 4LC9B 3FLCO 5AQFA 4CBUA 1QQMA 2QM1A 5BPLA 1DEJA 5BR9A 2ITMA 1HKBA 5JLHA 4K43A 4CJ7A 1H1VA 1X9JA 2QWRA 2YJEA 3HTVA 1BG3A 4K42A 5AZJB 3FZHA 2Q36A 3A8YA 4BQZA 4H5WA 4BRPA 2A3ZA 1NGBA 3ENHA 4YDUA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3NH0A 4H5TA 4DQQA 3RSEA 3EY1A 1JLGA 3O6WA 3SQ1A 4WQ4C 2ZE2A 4JAXA 3OYNA 4LSNA 1KAYA 3VF4A 2RHKA 4FVUA 1NOYA 4F3OA 2J4RA 3AO2A 1BL3A 2P9UA 2O8DB 2HB5A 1U2VA 3JSMA 2F7TA 2O8CA 4IWVA 4CZIA 3L2RA 1OKJA 3ZSOA 2P9KA 2YHAA 5DK5A 5KRSA 3S3NA 1S1WA 1C0TA 1XC9A 1ASVA 1KLMA 4DF4A 2GX9A 4E7IA 4PA1A 1YT3A 3HSTB 3VQ7A 4CGHA 1F21A 5AQOA 1EO1A 5CYMA 4O5FA 5AQJA 4DR3K 1JLCA 1B9FA 3VETA 5C2DA 3M1FA 4OX9K 2GV9A 5AFUH 4B3SK 4CHPA 2GEMA 3O3HA 1VQ9N 5GINA 4FK0A 3CC7N 1RBUA 3NE6A 3EKSA 4WFBL 4NB4A 4B1UB 1XI1A 2QK9A 1VQNN 3ZX0A 3TPQA 4CJVA 1XMQK 3K5MA 3QIOA 2PFUA 2OZMA 3HZ6A 1QQNA 5AQYA 4O55A 4CIEA 1GLJO 1YTUA 4QAGA 5ADXA 3CJAA 5HLFA 1O13A 3DXMA 1N5YA 4CFDA 3ZEUA 4JI0K 4IG3A 3UKRA 1NK6A 3ATVA 5AQRA 2IOCA 3Q7CA 3M3ZA 3VQ4A 3QBWA 3PIPL 2IGIA 2B6AA 1XUPO 4FPBA 2GTDA 3K57A 2IVOA 3O9RA 1N34K 3EE8A 1KVAA 3WQTA 4A2AA 1C0FA 3WEEB 1JL2A 3LDOA 4A61A 1HUXA 4BR7A 3JS6A 2HHUA 1Q86O 1BCMA 4WE1A 2KFZA 4QS7A 2A1SA 4CE9A 3OYMA 2QEXN 2F8SA 4JKDA 4DWIA 2ASMA 5AQSA 5JICA 2UYTA 4AM7A 4OKJA 1FK9A 3SV3A 2OANA 4DSJA 2HHQA 3AVMA 1YI2N 1JLFA 3LALA 1GLAG 4MDAA 2NUBA 4N41A 3L2VA 5DM6L 3OJSA 3LDQA 1S1VA 4B9VA 3LM9A 4FM1A 3C0BA 4OJRA 2A5XA 4B3OA 4OVLA 5AQXA 4A2BA 3U6FA 3VF2A 1QVGM 5C25A 1V4SA 2D0AA 1LW0A 3OYIA 3AVNA 4FJ8A 3T1YK 3OVNA 4JK8A 3R8EA 5J1EA 4YOVA 5TKYA 2P51A 5JLFA 2KKZA 3PSIA 4H0TB 4JD2B 3ZT0A 4CJWA 2HOEA 3EN9A 2HHVA 4UQGA 3MK6A 3V9UA 4FJNA 4Y0WA 2X6SA 3HI0A 3CC4N 1OVQA 5E41A 2P9SB 3M8PA 1NK5A 5SWMA 3V4IA 3WQUA 4M7YA 3KLIA 3L0QA 1L3VA 2HHTA 4KHUA 2W42A 1SUQA 1V4TA 2UUCK 4BWJA 4BE0A 1YF5L 3MXIA 3AVKA 2P9PB 4HUFA 2EHGA 3VQ6A 2E2PA 3OTOK 4JN4A 2H3GX 3VQCA 1VQ5N 5FPMA 4FLYA 1IKWA 2QWMA 2NRZA 2PZSA 3RTVA 2AJQA 3TTCA 4GVMA 1BQMA 3V6DA 5JS2A 4GNIA 4RCHA 3LPTA 3IAYA 2F8TA 1NG9A 3R1XA 4O0IA 3SPYA 3TAEA 3AVBA 4MO4A 3ID6A 3U9DA 3O1WA 4CHZA 2ITGA 4DQRA 3G25A 4KREA 1N36K 4Z4IA 1ATSA 4N47A 3NF8A 4JEPA 1KAXA 3DXMB 4YY3K 1TYQA 4N56A 4B1YB 1G99A 5I3UA 3CCMN 3TSUA 3SBTA 4Z4FA 2QI2A 4PQUA 1GLCG 4A57A 1TGOA 1ZBIA 3ULEB 1NWKA 1KFDA 4QS9A 1VQ8N 1T05A 1VQ7N 1JLQA 2O8EA 1D5AA 5C12A 4AHSA 1JXBA 1D9DA 1MU2A 2EX3A 3HVRA 3VQ9A 4E1NA 1L3SA 2KZZA 4AHCA 4DTSA 2E2QA 4DQPA 5AQLA 2Q31A 5KTQA 4DSLA 5KI6A 3EEQA 4M42A 3V9XA 1GLDG 4F3TA 4CJLA 1NJXA 3VOVA 4EP5A 1ZBHA 1KSPA 4ELUA 3E9LA 1K9MO 1XQSC 1UOCA 1WUAA 3KK3A 3M5RA 1VQLN 4CF2A 2HBKA 2G8FA 1WBDA 3CYMA 2VG7A 1HNVA 4O0JA 3RRGA 2XY6A 5AQKA 4HUEA 3AVCA 4CECA 5AR0A 4LY7A 4FVMA 3NGYA 1W9HA 1S9EA 4LF5K 3SBGA 2WTUA 4KH6A 1ZBSA 1BOTO 2V52B 3N4PA 1OH5A 3SAGA 4BR5A 3OYKA 3R6MA 4I6MB 2A1RA 1NGIA 1LAWA 3TU5A 2HF4A 4I9LA 1FXXA 3FFIA 4DUZK 4JI7K 3C7NA 3T19A 1QQOA 3HJFA 3AO4A 1E4FT 4E7HA 3RMBA 3PY8A 5GADP 3CJ7A 3KLEA 1GLEG 3CMAN 2KQ2A 3O4QA 1KQSM 1WNSA 2DPNA 4CFBA 3M8RA 3TAFA 5KPRA 1WSHA 1RBRA 1FKOA 4CGFA 1NJZA 1FJGK 4F2SA 4WQ5C 1LOTB 4IFVA 2FBVA 4WYBA 2VWJA 3P5JA 2YKMA 1DT9A 2YCHA 4PL8A 1RDBA 1NOZA 1Q82O 4IZ9A 3B6OA 3WNHA 1SKWA 3P4IA 1YUWA 3DXKB 2ZQBA 1Q8IA 2ZD1A 2OZSA 4CHOA 3JAMO 2VG5A 4DTRA 4B08A 4ILHA 3H45C 4RW6A 3PSFA 3H1VX 3BF1A 4BR2A 4FOEA 3D0PA 4JI6K 4H0VB 4CGDA 4KKOA 5HL7L 3AVJA 2QWOA 4AQYK 4DTNA 4M3TA 3NCIA 2XRIA 4H4OA 4JKGB 3HRGA 5GAGP 3S41A 2FXUA 1ZYQA 3A5LC 4BC5A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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