1XC3A

Structure of a putative fructokinase from bacillus subtilis
Total Genus 90
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
90
sequence length
295
structure length
295
Chain Sequence
AMLGGIEAGGTKFVCAVGREDGTIIDRIEFPTKMPDETIEKVIQYFSQFSLQAIGIGSFGPVDNDKTSQTYGTITATPKAGWRHYPFLQTVKNEMKIPVGFSTDVNAAALGEFLFGEAKGLDSCLYITIGTGIGAGAIVEGRLLQGLSHPEMGHIYIRRHPDDVYQGKCPYHGDCFEGLASGPAIEARWGKKAADLSDIAQVWELEGYYIAQALAQYILILAPKKIILGGGVMQQKQVFSYIYQYVPKIMNSYLDFSELSDDISDYIVPPRLGSNAGIIGTLVLAHQALQAEAAS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Structural studies of ROK fructokinase YdhR from Bacillus subtilis: insights into substrate binding and fructose specificity.
pubmed doi rcsb
source organism Bacillus subtilis
molecule tags Transferase
molecule keywords Putative fructokinase
total genus 90
structure length 295
sequence length 295
ec nomenclature ec 2.7.1.4: Fructokinase.
pdb deposition date 2004-08-31

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00480 ROK ROK family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1xc3A02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1xc3A01
3R8EA 2VCPA 2F9WA 5E84A 4CZLA 2HMPA 1GLAG 2P9NA 4QS9A 3QFPA 1Y64A 2Q36A 3ATVA 3ZX3A 2D0PA 1CZAN 2NRHA 2ZGZA 3DXKA 3C7NB 4CD1A 3A8YA 4FSVA 4M63C 4MLHA 3CHWA 3H3OB 3TU5A 3L6QA 1HJOA 2E20A 2Q0UA 2CH6A 3BP8A 3P4IA 3WEEA 1U2VA 2GEMA 1J6ZA 4EHUA 4YDUA 1BA1A 4B1YB 2IVPA 4XH4A 2PAVA 5KPTA 5AQKA 4J8FA 1GLBG 1T44A 4I6MA 2WUSA 4JHDB 3FZFA 4BRDA 3QICA 5KQDA 2D1KA 3LDPA 1NGCA 3O1WA 1GLEG 3LDNA 4BG9A 5BN8A 4HTLA 3U4LA 1MDUB 3VGKA 3VGLA 3D2FA 5AQIA 3CJBA 4BR2A 4B1XB 2QWPA 1EQYA 2E8AA 1ATSA 2E1ZA 1WUAA 1RDWX 4M7XA 3WQUA 3D2FB 3C7NA 4H5RA 3MN5A 4KBOA 2GTDA 4A2AA 3FR0A 4M7YA 3DXKB 1C0FA 5EY4A 3LM2A 3ULEA 3UE5A 3CJAA 4H5NA 3IMXA 4YDUC 1HKGA 2QWOA 2IIRA 3FFKB 3C0BA 3FGUA 2J4RA 5TKYA 4QS7A 1HX1A 4H03B 3SMPA 2FLOA 4NO7A 2ZF5O 4CBUA 2E1YA 4EIAA 2FSJA 3DAWA 3GG4A 2IVOA 5AQFA 4FWNA 3QBXA 3U9DA 5CE3A 1DEJA 1BO5O 4AM7A 2E2QA 2E2NA 5F1XA 2P9SA 2A5XA 3ZEUA 2Q2RA 4H0YB 5EXWA 5ELZA 2NZTA 1HPMA 4FWSA 3L4IA 3DXMB 2W41A 3IDHA 4K43A 3UKRB 3HTVA 3ZEUB 1X3NA 2VWBA 3UKUA 3VETA 4BRPA 2V7YA 3A5MC 3LL3A 4FWMA 3SLCA 3W3DA 4CZFA 3CQYA 3EKSA 3O1BA 2A6AA 4A61A 4BVPA 2YJEA 3ZX2A 3BF3A 5LY3A 3A0IX 3MK6A 4MLEA 5AQOA 3HI0A 5FPMA 4B1WB 3O8MA 3GL1A 3G25A 4NB4A 2P9LA 1RFQA 3SJHA 1Z6RA 2YI1A 4XH5A 3J8AA 5AZIB 5AQMA 4CBXA 3CJ9A 4H0XB 4H5VA 1C0GA 1KXPA 2Q31A 2YJFA 4FWKA 1U6ZA 2W40A 3M6GA 5BPMA 3F9MA 5AFUH 1YXQA 5AZIA 3IFRA 3U8XA 3ENOA 3A5NC 1NLVA 5AQLA 1ATNA 4FWQA 4F9OA 4CZGA 4RWTA 3W0LA 3VPZA 1MA9B 3KVGA 2D0OA 3B8AX 4B1ZA 3LDLA 4C23A 3OHRA 1GLFO 1TUUA 4BVOA 2OANA 3ID8A 4K25A 3R6MA 2CGLA 2QWRA 3KHYA 1YVNA 4K42A 3UKRA 5B8HA 3VEOA 1IJJA 2V52B 4BRIA 4BR5A 2UYTA 4BC2A 1JCFA 4BG8A 4I6MB 3U9ZA 5BREA 4BRKA 1S3XA 1S22A 4BC5A 4BQZA 1D4XA 1QQMA 3EZWA 3O4WA 2AA4A 4IXCA 1GLJO 3CIPA 3R9PA 4E1JA 2QWNA 4FWLA 2FF6A 1QZ6A 4BRCA 5BN9A 3ULEB 1XUPO 3CI5A 3VESA 2CGJA 1YUWA 4DHYA 5BRDA 5AQNA 4WQ5A 1LOTB 3UKUB 2H3GX 5AQUA 2FXUA 1NGJA 4QS8A 3CJ7A 4B9QA 5KPZA 5AQXA 4BGBA 1K8KA 4IO8A 2PBDA 5AQRA 3VENA 3D2EA 1ESVA 3M1FA 3JS6A 4BROA 5AFUA 2P9SB 1QQNA 1Z05A 1DGKN 1XC3A 2CGKA 5AQTA 2Q97A 4ISEA 5BRHA 1LCUA 2E2PA 4JD2B 5BPNA 1GLLO 2BUPA 1RGIA 3WXLA 1HKBA 1NGGA 4FL9A 4BC3A 2YHYA 3H3NO 1NGEA 3H46O 5E26A 5AQPA 4H0OA 1R59O 3A5OC 4DQ8A 1TUYA 1X9JA 4PL8A 3QB0A 3VEZA 5FPEA 1JCGA 5FPDA 5LJVA 2VYPA 2HF3A 3VF4A 3AARA 2A42A 4FO0A 4JN4A 3VEVA 3GE1A 2YHXA 3VF2A 4GNIA 5BR9A 1MWKA 5BPLA 4FOIA 1NGFA 3ZETA 3WEEB 1HKCA 5BRFA 3VGMA 3H1QA 4DCHA 1IG8A 3WT0A 4BRHA 4GY2B 3GDQA 1QQOA 3TPQA 3FZHA 3H1VX 4XEIA 4JAXA 3DWLA 3WQTA 4BRFA 3RSEB 3S41A 3AAQA 1HLUA 5F2RA 4WYBA 4BR0A 1T6DA 3M3ZA 5FPNA 4XH1A 2A3ZA 5AQSA 1X3MA 3CETA 1NMDA 4PKGA 3EO3A 1NGAA 1GLDG 2QM1A 2YCHA 3HSCA 1KAXA 4PL7A 1SAZA 5LJWA 3VEYA 2E2OA 3O08A 1QZ5A 3LDOA 2ZWHA 3RSEA 3VEXA 3A5LC 5AZJA 2GWJA 4O5FA 2KHOA 2P9LB 3O6WA 4CZKA 4FPAA 1P8ZA 2HOEA 1BOTO 1GLCG 2GUPA 2P9IA 4MO4A 3EL2A 3QFUA 4FPBA 1Q18A 3CJ1A 4H0TB 4LC9B 4CBWA 1V4SA 1H1VA 2ASPA 4CZEA 3QBWA 5AQYA 3DXMA 4IJAA 3MCPA 4WQ4A 3O5BA 2P9KA 3BUZB 4HWIA 5JMVA 5ADXH 1ZXOA 2GELA 4BR4A 4H5WA 2QWQA 3I33A 3WXIA 2P9KB 2QWMA 3MDQA 4CZJA 4H5TA 2FF3B 2BTFA 3CQXA 4DB3A 4CJ7A 5KQ8A 3FZLA 3WXKA 3HM8A 3O80A 3MMVA 3EN9A 3MN7A 2EWSA 3L0QA 1NM1A 3D2EB 4CI6A 2ASMA 1K8KB 2Q0RA 2P9PB 3ZETB 4BRLA 1BA0A 1KAYA 4BRAA 1HUXA 3BF1A 3SK3A 5AQJA 2FSKA 1V4TA 5I9EB 5AR0A 4IJNA 3FZMA 4IWVA 4EAHD 3I8BA 4MO5A 2IVNA 4BRQA 4B1VA 4H0VB 2Q1NA 2P9IB 4JHDA 3UB5A 2AP1A 1JCEA 3GBTA 5EX5A 1SQKA 1ZC6A 2CH5A 3SMSA 4CD3A 5AQVA 3VOVA 2QW9A 5AQHA 3WXJA 1TYQA 3D7EO 1BUPA 4IZ9A 2NLXA 4AM6A 4FWPA 3GOIA 2FSNA 4WQ4C 1TYQB 2E88A 3IUCA 1OKJA 4EHTA 2ITMA 2V51B 1XQSC 4CZHA 3WUHA 2A40A 4Z94A 3VERA 3AAPA 4FWOA 5KPRA 3FZKA 1E4FT 3MN9A 3H6EA 4PKIA 4B1UB 1BG3A 4FOEA 4BREA 1QHAA 4CZIA 1U2VB 3JXUA 4CZMA 3H45C 3HZ6A 4BR7A 2P9PA 4L3QA 2QWLA 4O8KA 1NGDA 5EVZA 5AQWA 2D4WA 2ASOA 3CJCA 5AZJB 2P9NB 1ATRA 1BU6O 3FE1A 4FWRA 2A41A 1YAGA 3QMLA 3VEWA 2ZGYA 1MWMA 4BR9A 4BRGA 3HBTA 5AQQA 1NGHA 4H0PA 1T6CA 4ISGA 4RTFD 2I7PA 4ISFA 3ATUA 3MN6A 1NWKA 5JLHA 1NBWA 4BRNA 3VF6A 4BGAA 5JICA 4JNEA 4Y0WA 5JLFA 3EKUA 4RCHA 4BQLA 2QXLA 2P9UB 5EOYA 1NGIA 3CERA 1E4GT 1SZ2A 2GWKA 4A2BA 3QDKA 4BC4A 5AQGA 1WOQA 1NGBA 2P9UA 2YHWA 3DJCA 3LM9A 1KAZA 2DPNA 2V7ZA 5ADXA 4PKHA 3KZBA 4JD2A 2I7NA 4K41A 4BRMA 3ZX0A 3BEXA 1BWFO 1BDGA 4A62A 3FLCO 5AQZA 1G99A 4EFHA 3LDQA 2F9TA 1DKGD 1ZBSA 3ENHA 2HF4A 3AY9A 5F0XA 4WQ5C
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4KB1A 2Y1IA 3V9WA 3LZIA 4FVUA 1QQCA 2W6LA 5CYQA 3TARA 3QEVA 3C7NB 3DXKA 1SKSA 3AVBA 3LALA 4MLHA 3CHWA 4CHOA 4LF8K 4KHQA 3L6QA 4CJ5A 2E20A 2Q0UA 3DLLL 4YDUA 1RT6A 1L3SA 4BWMA 2NRZA 1GOAA 1IBMK 4B1YB 5J1EA 1HNVA 5AQKA 3D45A 4A57A 3THWB 4OVLA 1T44A 4JV5K 4J2EA 1X9MA 1KD1O 2XY7A 4CIGA 4JHDB 3FZFA 3CCVN 4FLTA 1NGCA 3ZT0A 3SPYA 5BN8A 5D3GA 4DV4K 5AQIA 5LL6Z 4BR2A 1KRPA 4B1XB 2QWPA 4OGCA 1WNSA 3R3LA 4JI4K 4H5RA 4KBOA 3MN5A 4C8KA 2GTDA 1JLAA 3CYMA 4GV6A 1YTUA 4JKEA 1C0FA 2NRVA 3ITHA 4WFNL 4Z4CA 2HNZA 3J7AP 3IMXA 5HP1A 5JS1A 2Q3SA 1QVFM 3FGUA 3C0BA 4MDBA 3F5TA 4X64K 3SMPA 2FLOA 4KH5A 4EZ6A 4EIAA 1XNQK 3GG4A 3PX6A 4L8RB 4FWNA 3QBXA 3U9DA 3VQAA 5CE3A 5KGXA 4E3SA 1NJWA 2E2NA 2HBMA 3TAQA 1VQ4N 1JLCA 2KFNA 2UXCK 4JKHA 1HPMA 3RVCA 4FWSA 5JS2A 3DXMB 2W41A 4OO1J 5DM6L 3UKRB 3HTVA 1WAFA 3A5MC 3LL3A 4ILGB 1L3UA 3EKSA 4O55A 3T1YK 2KKZA 3NGZA 3ZX2A 3P83D 2QK9A 3J7YP 1VSDA 4Q0BA 5LY3A 4LF9K 5FPMA 4O0IA 2O4IA 3GL1A 3VTIA 1QSYA 2LSNA 1Z6RA 4XH5A 3AVJA 5AQMA 5AZIB 4CBXA 4H0XB 4DFPA 4H5VA 1C0GA 1KXPA 4JYAK 3M6GA 3F9MA 4F8RA 1RNHA 1LAVA 1UA1A 2RPIA 5AZIA 4CEDA 3VA0A 2HHHK 3U8XA 3HPGA 4O8UA 1HYZA 1ILYA 1JLFA 2O8FB 4B9SA 2NRXA 2RHKA 3VPZA 1MA9B 3B8AX 4W5TA 2OANA 5C0YA 4K25A 3R6MA 2CGLA 3SPZA 4DV1K 1VSKA 4CJLA 1XHZA 1D5AA 1IG9A 2X6NA 4OLBA 3CC2N 4I6MB 3VQCA 1KCFA 3PLAA 2IDOA 2HVHA 4BRKA 5LMUK 1S22A 3SV3A 4DUYK 3DLKA 4NLBA 4BQZA 3K9JA 4DKWA 3O9QA 1RTIA 4E89A 4FZZA 4OX9K 4B3OA 4C8MA 4LFBK 3VQ9A 3WNHA 4CESA 3HSTB 4CW7B 1KFDA 1QZ6A 2FBVA 4K0KK 3ULEB 3CPWM 4JI7K 4Z4FA 5J2QA 4CFBA 1HNIA 4JS4A 3VMFB 3S3OA 2UXDK 2H3GX 3NF9A 2FXUA 4E0DA 5KRSA 3HP6A 3WNFA 1NKBA 4DSIA 3VENA 3HK2A 5GIOA 4A5AA 5AFUA 2P9SB 2CGKA 4QAGA 3TTDA 2Q97A 4ISEA 5BRHA 1LCUA 3VQDA 4FJHA 2BUPA 1NGGA 4FL9A 4FJLA 2YHYA 3H3NO 3H46O 5E26A 3DLGA 3KD5E 4KHYA 2NNWA 4AF1A 3A5OC 1X9JA 4CGFA 4CCHA 4JK9A 1Q82O 2HF3A 3VF4A 3QEIA 2D0CA 4RG8A 5HRNA 4GNIA 2QEXN 1VRUA 2HVIA 3VGMA 3KK1A 3H1QA 4GVMA 1IG8A 3SYZA 2GX9A 1QQOA 3FZHA 3C6HA 3H1VX 4CFCA 3ZSWA 3L2RA 1VQKN 4CE9A 4JAXA 3WQTA 3SBTA 1BI4B 3RSEB 3AAQA 3TSUA 4E7JA 2GBZA 3OBYA 4LSLA 3HO1A 1VHXA 4YOYA 3NH1A 2A3ZA 5AQSA 3DLRA 1NMDA 2QM1A 4PL7A 4JKCA 5LJWA 3VEYA 3NF6A 1NJIO 4YY3K 3AVCA 3T69A 3LWLA 4F3OA 2HOEA 4RW6A 5HBMA 3CMEN 4MO4A 2P9IA 4OPJA 2XHBA 3EL2A 2HHWA 5IT9O 4BY9C 1HYVA 1Q18A 2O8CA 1RT1A 4FM0A 4FJJA 4JKGB 3U3GA 4DR6K 4A59A 1H1VA 4CJ3A 4FCYA 3V9UA 1J5EK 5KTQA 4IJAA 3BUZB 4IBNA 3QEXA 4DTUA 1IKYA 5ADXH 1ZXOA 2GELA 3OA9A 4H5WA 1L3VA 2D5RA 4IDKA 4DB3A 3CQXA 1IKXA 3FZLA 1N34K 4U7BA 1KTQA 3L0QA 4LD0A 1JLQA 3CCLN 1Q9YA 2P9PB 4BRLA 2F4VK 2G8VA 1U04A 3SK3A 1VQ7N 3DLEA 4KTWA 5AR0A 1E3MA 1D9DA 4Z0UA 4IOXA 1QSLA 2VQFK 4FLZA 4DQQA 1TK0A 2OPRA 3K5OA 3LPTA 1ZC6A 5AQVA 2KLAA 1W7AA 2QW9A 4RW4A 3NHGA 1QE1A 4FWPA 4B9UA 2B6AA 4JKDA 4WQ4C 1LWFA 1Q9XA 4C8OA 1RBUA 3AO4A 1UA0A 4FWOA 3OYMA 3HXMA 5KPRA 3KLEA 1HPZA 3MN9A 2ZD1A 3CCUN 3PV8A 3MX5A 3V4IA 1QHAA 4JKGA 1VQ5N 2VQEK 3AGRA 1U2VB 3LWMA 4CZMA 3OJSA 4WF9L 3V1OA 4GVEA 3AO1A 4FJ5A 1XHXA 3QERA 2D4WA 3CJCA 5HOOA 5AZJB 4AILC 4M45A 2P9NB 1ATRA 2A41A 4DF4A 1D9FA 1RCHA 2YHAA 1RTDA 1NGHA 3O4NA 4ISGA 4RTFD 3HM9A 3VF6A 4JNEA 3KTQA 4I2PA 3FFIA 3ALYA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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