1XC3A

Structure of a putative fructokinase from bacillus subtilis
Total Genus 90
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
90
sequence length
295
structure length
295
Chain Sequence
AMLGGIEAGGTKFVCAVGREDGTIIDRIEFPTKMPDETIEKVIQYFSQFSLQAIGIGSFGPVDNDKTSQTYGTITATPKAGWRHYPFLQTVKNEMKIPVGFSTDVNAAALGEFLFGEAKGLDSCLYITIGTGIGAGAIVEGRLLQGLSHPEMGHIYIRRHPDDVYQGKCPYHGDCFEGLASGPAIEARWGKKAADLSDIAQVWELEGYYIAQALAQYILILAPKKIILGGGVMQQKQVFSYIYQYVPKIMNSYLDFSELSDDISDYIVPPRLGSNAGIIGTLVLAHQALQAEAAS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Putative fructokinase
publication title Structural studies of ROK fructokinase YdhR from Bacillus subtilis: insights into substrate binding and fructose specificity.
pubmed doi rcsb
source organism Bacillus subtilis
molecule tags Transferase
total genus 90
structure length 295
sequence length 295
ec nomenclature ec 2.7.1.4: Fructokinase.
pdb deposition date 2004-08-31

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00480 ROK ROK family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1xc3A02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1xc3A01
1GLLO 4BRKA 3CJBA 2Q97A 3KVGA 4FSVA 3HTVA 1BG3A 4IWVA 2GELA 3VENA 1NBWA 3BF1A 4EHTA 3L6QA 4H0YB 4XH4A 5AQUA 3WXJA 1BWFO 3MN5A 5AQQA 4WQ4A 3U4LA 3VGKA 3CERA 3O5BA 4EHUA 3S41A 2ZF5O 2Q0UA 1NGCA 2IIRA 2P9PB 3D7EO 3D2FB 3H45C 3U9ZA 3TPQA 3B8AX 3DXMB 2GWJA 3ENOA 4ISGA 4PL7A 4HWIA 3HZ6A 3RSEA 4BC5A 3U9DA 3D2EA 4FWQA 2QWRA 4MLHA 4B1ZA 1NM1A 2Q31A 3L4IA 2WUSA 4K25A 4MO4A 3ID8A 3QMLA 5BRHA 4PKGA 5KQ8A 2CGLA 4JD2B 5AFUH 4PKIA 3L0QA 4M7XA 3UKUB 4AM7A 3M3ZA 5AQGA 1T44A 2QWOA 4ISEA 4C23A 1SZ2A 1EQYA 2J4RA 1GLBG 4CZGA 2CH5A 2NLXA 3LDLA 3WXIA 2CGJA 2FF3B 4RCHA 5F2RA 4BR7A 1YXQA 5AZJA 3FZKA 3VF6A 1GLFO 2QWLA 4BGAA 3WEEA 4BRGA 4XEIA 3O4WA 2VCPA 2HF4A 5FPEA 1NLVA 1U6ZA 3AY9A 1QZ6A 4PKHA 4A61A 4BC2A 4BRAA 3P4IA 1SQKA 3WUHA 4CBWA 4CZKA 1WUAA 3ZEUA 5EY4A 2P9SA 2FSJA 4I6MA 5AQJA 1QHAA 2V7YA 3D2EB 3EN9A 4FWSA 4BRPA 3C7NB 5AQKA 1KAXA 5AQMA 1NGAA 3O80A 3O8MA 4H0XB 4LC9B 2YHYA 4BRDA 1NGFA 3EZWA 4IO8A 4B1XB 4BREA 2E88A 3VGMA 2F9WA 2UYTA 4H5TA 2IVNA 5E26A 2BUPA 1DEJA 3MN6A 1NGHA 3FR0A 2P9IB 1BA1A 3G25A 3MN7A 3QFUA 4H0VB 2GWKA 4NB4A 3LM2A 4BRNA 3FGUA 4B9QA 4WYBA 3UKUA 4M7YA 4FWNA 4H5NA 4FWRA 3SJHA 4CJ7A 1ATRA 2VWBA 2YJFA 5BPLA 3CJCA 1IJJA 1ATSA 4CZMA 2VYPA 1RDWX 4JN4A 4FWMA 1NMDA 3MDQA 1GLJO 5JICA 3DWLA 1QZ5A 5FPDA 2ZWHA 2H3GX 2E1YA 2P9NA 1TUUA 4QS9A 1YVNA 3ULEA 3U8XA 5AZJB 4WQ5A 5AQLA 5AFUA 2GUPA 2PAVA 2CGKA 4BRLA 3WEEB 5AZIA 4JAXA 2OANA 5JLFA 4CBUA 1BA0A 2FF6A 3TU5A 4ISFA 1YUWA 3MK6A 3LL3A 4BR0A 1GLEG 3VEVA 3BF3A 4BR9A 2AA4A 4YDUC 4Z94A 3R9PA 4BRCA 5AQVA 5FPNA 3GOIA 1V4TA 3F9MA 3AAPA 3ZEUB 3ENHA 1GLCG 2FSKA 2P9SB 4I6MB 3A5MC 4FOEA 1TYQA 3C7NA 3VEXA 1X9JA 5KPTA 3VESA 3FLCO 4GY2B 4CZJA 1J6ZA 5AQFA 1U2VA 3MN9A 2FLOA 3SK3A 4FO0A 4FPAA 1LCUA 1QQMA 3HSCA 2P9IA 3VEYA 4BG9A 3MCPA 1NGEA 5EOYA 4E1JA 2YHXA 1X3NA 4CZIA 3QDKA 2QWQA 2W40A 5AQNA 3DXKA 5AQIA 3HM8A 4CZLA 1CZAN 4FWPA 1K8KB 2DPNA 2QW9A 3FZLA 3M6GA 2Q2RA 1C0FA 2I7PA 3QB0A 4YDUA 4B1WB 4BRFA 4DHYA 3O1WA 4J8FA 1Q18A 4EAHD 1P8ZA 4A2BA 1ESVA 4FWOA 3H1VX 1WOQA 3MMVA 3CJAA 4IJAA 4IXCA 5ELZA 2HMPA 2P9NB 3CQYA 3ULEB 5LJWA 2PBDA 4BROA 4H0PA 3ZX3A 4BQLA 4MO5A 4JHDA 2NRHA 3J8AA 5AZIB 4BRMA 4BVPA 2E2PA 2ASOA 5BPNA 5BN8A 1DKGD 2E2QA 1BOTO 5BR9A 2QWNA 3EL2A 3QBXA 4BC3A 4K41A 5EVZA 3I33A 3EKUA 2QXLA 4BGBA 2P9LA 3QICA 5AQHA 4K42A 4RWTA 4DCHA 4AM6A 2YCHA 5AR0A 1YAGA 5BREA 4FOIA 3IDHA 4H03B 4CI6A 4B1VA 2Q0RA 3FFKB 4O8KA 1TYQB 3H6EA 3ZX2A 1NGIA 5ADXH 3HBTA 1U2VB 2Q36A 3LDOA 4GNIA 1IG8A 2V7ZA 3QFPA 2AP1A 3FZFA 1KAZA 5F0XA 3H3OB 3O08A 4RTFD 3UE5A 2D4WA 4M63C 1KAYA 3R8EA 1XUPO 3CQXA 2Q1NA 5BRDA 2E20A 1HUXA 3DXKB 1K8KA 2YJEA 2ZGYA 5JMVA 1Z05A 2NZTA 4BR4A 3A0IX 1OKJA 1E4FT 4A2AA 3LDQA 1BO5O 3CJ9A 2ASPA 3KZBA 3LM9A 2HOEA 2ASMA 3QBWA 3C0BA 3FE1A 4IZ9A 4DB3A 1HLUA 4BVOA 4JHDB 4K43A 1HX1A 2A40A 5EX5A 1NGDA 5CE3A 1GLDG 1V4SA 4A62A 3CJ1A 2GTDA 5AQSA 5AQXA 3WQUA 5AQTA 3IMXA 3WQTA 2A5XA 5FPMA 2E8AA 3HI0A 2P9LB 3GDQA 2E2OA 3W3DA 3LDPA 4XH5A 4BC4A 5AQPA 2QM1A 4IJNA 4QS7A 1NGBA 3H46O 3UB5A 5F1XA 2YHWA 3LDNA 1D4XA 1XQSC 3OHRA 3IUCA 3VPZA 4BG8A 3VEZA 1X3MA 4BRHA 2P9KA 1S3XA 5KQDA 1KXPA 4BQZA 2ZGZA 2D1KA 3AARA 3WT0A 1QQOA 1S22A 4B1UB 2D0PA 3BP8A 1ATNA 1BUPA 1Z6RA 4H0OA 4NO7A 1ZXOA 3JXUA 1HKBA 4Y0WA 4BR2A 3VGLA 2A42A 3IFRA 4H5VA 2I7NA 3GL1A 5AQRA 5KPZA 2F9TA 3GE1A 1ZBSA 3H1QA 3KHYA 5ADXA 4H5RA 1BU6O 1JCGA 3BUZB 3JS6A 4FWLA 2QWPA 3CETA 1HJOA 5BN9A 3UKRA 3VOVA 1RFQA 4FL9A 3DAWA 3CJ7A 3DJCA 1HKCA 5E84A 3O1BA 3VF4A 1MDUB 2KHOA 2P9UB 4KBOA 4CZHA 1LOTB 2GEMA 3ZETA 3VF2A 5AQWA 3VERA 3ATVA 1HPMA 1C0GA 2A41A 3CIPA 4CZEA 2W41A 1NGGA 5BRFA 1HKGA 1GLAG 5EXWA 4H5WA 4O5FA 1JCEA 3M1FA 1Y64A 1H1VA 2YI1A 3SLCA 2A6AA 3GBTA 1G99A 4PL8A 4BRQA 5JLHA 1ZC6A 4CD3A 2FXUA 3SMSA 5AQOA 4B1YB 4QS8A 1DGKN 2P9KB 2P9PA 4XH1A 2BTFA 2QWMA 1R59O 1MWKA 1RGIA 3D2FA 2HF3A 2V52B 1XC3A 4BRIA 3DXMA 1SAZA 2E1ZA 4MLEA 3FZHA 3I8BA 4HTLA 1NWKA 1E4GT 4CBXA 3WXKA 2IVPA 3EO3A 2D0OA 3O6WA 3RSEB 3SMPA 4WQ5C 4CD1A 4L3QA 3AAQA 4DQ8A 5AQYA 3CHWA 5TKYA 4EFHA 1JCFA 1MWMA 1T6DA 4FPBA 4WQ4C 3WXLA 3H3NO 3ZX0A 1BDGA 3A8YA 3A5OC 2EWSA 4CZFA 3VEWA 4FWKA 3A5NC 2A3ZA 4EIAA 3FZMA 3VEOA 1T6CA 3UKRB 4JD2A 2CH6A 5KPRA 3VETA 3BEXA 1NGJA 5LY3A 5AQZA 3ATUA 2IVOA 4F9OA 3W0LA 2P9UA 2FSNA 2ITMA 5B8HA 1TUYA 3A5LC 4H0TB 3EKSA 4BR5A 2E2NA 5BPMA 4JNEA 1MA9B 3ZETB 5LJVA 3GG4A 1QQNA 2V51B 3R6MA 5I9EB 3CI5A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4BRKA 3KVGA 4E7LA 2GV9A 1BG3A 1TAUA 1L3TA 3G4SN 2VWJA 4QCLA 3BF1A 4EHTA 1OH7A 3P39A 3L6QA 4H0YB 4M3YA 4WQ4A 3U4LA 4E7HA 2BDPA 3DLLL 1K9MO 1ASUA 4E19A 3D7EO 4JV5K 3U9ZA 2RE2A 2DFHA 1VQ9N 1WNSA 3VQ6A 3HZ6A 1WAFA 3RSEA 4BC5A 3U9DA 4X62K 3B6OA 1IG9A 3WXMB 4G9ZA 4ZTJA 2WUSA 3MWPA 1QHTA 3CYMA 3KTQA 4HCBA 4LF4K 4NXNK 1N33K 3O9SA 3C94A 3AVIA 2CGLA 5M1QA 2YV0X 3O3HA 2E6MA 4O0JA 5AFUH 4PKIA 4DTMA 1KVBA 4C1NI 3TABA 2OPRA 1S9EA 4UY8O 3UKUB 5GINA 2F4VK 1JL1A 4M3XA 4CGJA 4M3ZA 3TI0A 3CQ8A 4C23A 1SZ2A 4JKEA 3THWA 3OBYA 1EQYA 2J4RA 3TSPA 4LF7K 3T3FA 1REVA 2CH5A 2NLXA 2FF3B 4BR7A 1VSEA 1LAVA 3T7ZA 2QWLA 3SV4A 2F8TA 5FROA 4JS5A 3O4WA 1W9HA 3MEDA 1ZBIA 1U4BA 4W5TA 3AY9A 4A61A 1KVAA 4FVMA 3G10A 3ZEUA 2QKBA 2P9SA 1IKXA 4O5BA 3NE6A 1QQCA 3D2EB 4FWSA 2HBMA 4WFBL 3AVHA 1KAXA 3RMCA 1NGAA 4C8MA 4CK3A 3ZT2A 3VQAA 3WNFA 4CF0A 4DF8A 1N6QA 4W5QA 3THYB 1VQPN 3SCXA 3HXMA 4H5TA 2QK9A 2BUPA 1DEJA 4CEQA 3VN5A 2P9IB 1BA1A 4RW7A 3QNOA 4CGHA 4NB4A 3I0RA 2XY7A 3V9XA 3FGUA 5M1KA 4RW4A 1TK8A 4M7YA 4K8XA 4FWNA 4FWRA 3KLHA 4CJ7A 1OH5A 4CEFA 1ATRA 5BPLA 3CJCA 3P1GA 2KQ2A 1RT5A 4FW2A 3VA0A 3MDQA 4LF5K 5JICA 4Z4HA 2H3GX 1VSJA 3KD5E 5IT9O 5HRRA 2O8FB 3AVGA 3U8XA 3AA4A 5AZJB 5AQLA 4GKKK 5AZIA 1HJRA 5JLFA 2FF6A 1YUWA 2XY6A 4YOUA 1FKOA 4BR9A 3ZCMA 4YDUC 2O8EA 4FJMA 4FM2A 4FK0A 4OX9K 3GOIA 1V4TA 4OKEA 3AAPA 1WB9A 2HVHA 4FJ9A 3CCUN 1GLCG 4AHSA 4FOEA 1TYQA 5M1FA 1GOCA 1X9JA 4J2AA 4FLWA 1J6ZA 5AQFA 1ZBHA 2X6NA 4Q0BA 3T69A 2QXFA 4CF1A 2FLOA 3SK3A 2BH1A 2JWLA 1QQMA 3R1XA 4BG9A 4YOVA 2YHXA 3CPEA 1X3NA 4N41A 2W40A 3DXKA 1X9WA 2AJQA 3HM8A 4BACA 4FLUA 4CZLA 1ZBUA 1YF5L 2QW9A 3FZLA 4B9UA 2Q2RA 4CF8A 4BRFA 1TKTA 4J8FA 5CHIA 4FXDA 2OYQA 3AVJA 3RMDA 2HHXA 4FWOA 2ZJQL 5ELZA 1KLMA 4E3SA 4B9SA 4CEEA 2XO7A 3A2FA 5LJWA 4DQIA 1J9AA 4AHVA 3LWMA 1I94K 5JVHL 2FBTA 4IKFA 2E2QA 1SUQA 3EL2A 3QBXA 3CF5L 5M1NA 3VQBA 3SJJA 4O0IA 2O8DB 4CIEA 3I33A 5C2DA 4BGBA 2G8HA 4Z4FA 4K42A 1L3VA 1XI1A 2HBLA 4AM6A 2YCHA 4B3SK 5AR0A 4I9LA 5BREA 3F73A 3HK2A 2Q0RA 3FFKB 2VG5A 1VRTA 4BWJA 4KH4A 4EZ6A 3ZX2A 1YHQN 3OBWA 3L4QA 1KRPA 4OLBA 3AO1A 3M8QA 1IG8A 2V7ZA 5J2QA 2W6LA 2X74A 3NH2A 4FJ8A 2HMIA 4DTPA 2O8CB 1L3SA 2D4WA 4M63C 1KAYA 1TV6A 4CJQA 4E7KA 5BRDA 3HPGA 1RDAA 3CFRA 2YHAA 1M1KO 4JKBA 3NVMA 3OS2A 4CERA 3WNEA 4CW7B 2LSNA 4KHNA 3TANA 4JI3K 4JKCA 3KZBA 3LM9A 2HOEA 2XY5A 1IBMK 3V6DA 1N32K 1HX1A 2A40A 1FJGK 4IG3A 2I5JA 2GTDA 5SWMA 3U3YA 3O9QA 1YVUA 4KAZA 1BCOA 1VQMN 1HQUA 3KWIA 1IKWA 3NF7A 1BHLA 3MWTA 4CF2A 4XH5A 3OY9A 3KK1A 4CGIA 3K9KA 1VRUA 4JKGA 1T05A 3LDNA 1D4XA 4BG8A 1VSIA 1X3MA 2NUBA 1S3XA 3EZ5A 1VQ4N 2UXCK 4CCHA 3QEVA 3J7YP 3F5TA 4KB0A 3AARA 4FJHA 3WT0A 4KTZA 3J7AP 4CJPA 4F3OA 3MEEA 1Z6RA 1A5WA 4EZ9A 4HTUA 3SAFA 3LALA 3VGLA 1T03A 3PIPL 2HHUA 1BU6O 1SL2A 3JS6A 2UUCK 3CETA 4KHWA 4NYFA 5HBMA 5BN9A 1EP4A 2ZM6K 3SNNA 4YORA 1MDUB 2P9UB 1RTDA 2IOCA 4FZYA 2GEMA 3AVMA 3K57A 1HYVA 3L2WA 4B3OA 2WTUA 3ID6A 1C0TA 1GLAG 2D5RA 1XWLA 2HW3A 2RF2A 3LAKA 1H1VA 2YI1A 3SLCA 3I8DA 2F96A 3OYKA 3LP3A 4CD3A 1RT2A 1OVYA 4RG8A 5AQOA 4DU4A 1SKSA 3K2PA 1DGKN 2P9KB 3KK7A 2QWMA 1R59O 1RGIA 1XC3A 4BRIA 3DRRA 3I8BA 3EE8A 1T3VA 3WXKA 4M3WA 3EO3A 3RSEB 2D0OA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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