1XC3A

Structure of a putative fructokinase from bacillus subtilis
Total Genus 90
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
90
sequence length
295
structure length
295
Chain Sequence
b'AMLGGIEAGGTKFVCAVGREDGTIIDRIEFPTKMPDETIEKVIQYFSQFSLQAIGIGSFGPVDNDKTSQTYGTITATPKAGWRHYPFLQTVKNEMKIPVGFSTDVNAAALGEFLFGEAKGLDSCLYITIGTGIGAGAIVEGRLLQGLSHPEMGHIYIRRHPDDVYQGKCPYHGDCFEGLASGPAIEARWGKKAADLSDIAQVWELEGYYIAQALAQYILILAPKKIILGGGVMQQKQVFSYIYQYVPKIMNSYLDFSELSDDISDYIVPPRLGSNAGIIGTLVLAHQALQAEAAS'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Putative fructokinase
publication title Structural studies of ROK fructokinase YdhR from Bacillus subtilis: insights into substrate binding and fructose specificity.
pubmed doi rcsb
source organism Bacillus subtilis
molecule tags Transferase
total genus 90
structure length 295
sequence length 295
ec nomenclature ec 2.7.1.4: Fructokinase.
pdb deposition date 2004-08-31

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00480 ROK ROK family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1xc3A02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1xc3A01
1ZC6A 3A0IX 4BR7A 3W0LA 3LDLA 1X9JA 3VF6A 2YI1A 2ZGZA 2E2PA 3HTVA 1ESVA 4BR0A 3R8EA 1DGKN 3ZX3A 4A62A 5JLHA 2A42A 4BGBA 1ZBSA 1RDWX 2A5XA 2FLOA 4PL8A 3CJ1A 4IWVA 4PL7A 3HSCA 2AA4A 2P9NB 4FPBA 3FZFA 5AQYA 3VPZA 4BGAA 4Z94A 5BN9A 2FXUA 4H5RA 2P9LB 4WQ5A 5BREA 4BRMA 1S3XA 5ADXA 4F9OA 2FF6A 2A6AA 2CH5A 3AAPA 2NRHA 1KAZA 3ENHA 3LDPA 4K42A 4CBUA 3VGMA 4A2AA 1K8KA 3C0BA 3FZLA 2GUPA 2V52B 4J8FA 3JS6A 3LM9A 5AQQA 4GY2B 3WQTA 1WUAA 3ZX0A 4BR9A 5BPLA 1HLUA 4YDUC 3SMSA 2A41A 3O4WA 2AP1A 4BRDA 4H5NA 1NWKA 4FWKA 1QQNA 3WXIA 3ZEUA 4B1ZA 4JHDB 5E84A 2J4RA 4BREA 3WXJA 3VF4A 5FPNA 4H0TB 4A2BA 3WEEA 3H45C 2E8AA 2YJEA 3LDQA 3VGLA 2Q0RA 2WUSA 1Z6RA 2V51B 3CJ9A 4BC5A 4FWMA 1QQMA 3ZETB 3A8YA 3M1FA 5E26A 5AQNA 3EZWA 3IDHA 5BRDA 4ISFA 3MN5A 4M7XA 1U2VA 4DQ8A 4FWPA 2V7ZA 5BN8A 4FOEA 5KQDA 3VENA 4H0OA 2E1YA 3UKUA 4CBXA 2QWNA 3R6MA 4BRCA 4ISGA 3D2FA 4CZLA 3S41A 2HF4A 5AR0A 4BRIA 4BG8A 2W41A 3QDKA 4RCHA 3SLCA 4CZJA 1Q18A 2D0PA 2FSKA 1GLFO 4H0VB 3O6WA 3G25A 3LL3A 4H5WA 4XH1A 5AQJA 5AZJA 1XC3A 5AQTA 5AQGA 3QBWA 4CZFA 3HI0A 4EIAA 3MN9A 3RSEB 1T44A 2I7PA 2P9UB 5AQWA 3DXMA 4BRLA 2VWBA 2P9SB 2CGKA 3CJBA 5AFUH 2UYTA 5F2RA 1BDGA 3BEXA 1HKCA 5I9EB 4CI6A 1TYQA 4CZGA 4FWQA 3FZMA 4FPAA 4WQ5C 3CI5A 5LY3A 4FWOA 5FPEA 2ITMA 3QMLA 2V7YA 3AAQA 4AM6A 3FE1A 3CQYA 3CJAA 4FSVA 4BC2A 3U9DA 1GLDG 4E1JA 4NO7A 5AQIA 4NB4A 3DWLA 2BTFA 3C7NB 4JN4A 1NGBA 1JCFA 3SMPA 1NMDA 3ULEA 5AZIA 3P4IA 4IO8A 1GLBG 1QZ6A 4CD3A 3F9MA 3AARA 1D4XA 4H5TA 4EHTA 1TUYA 2CGJA 4BRNA 4H0PA 4JD2A 3CETA 1QHAA 5AQMA 5JLFA 3VEXA 4A61A 3VERA 3ATVA 2E88A 3EKSA 1NGDA 3HZ6A 5BPMA 4L3QA 2FSNA 5LJWA 3MMVA 4O8KA 3MK6A 3QFPA 1BG3A 2GWJA 4WQ4A 2P9IB 3VOVA 4CJ7A 3HBTA 2NLXA 1KXPA 2D4WA 3SJHA 2GEMA 2OANA 3CERA 4PKGA 2P9KB 4H0XB 5KPZA 5EX5A 1GLJO 4BRFA 3FZHA 3AY9A 2FSJA 1BO5O 2E2QA 1GLAG 4BQLA 4IJNA 4BRQA 2HF3A 4FWLA 3VETA 3GE1A 4H03B 5AQZA 2EWSA 2FF3B 1X3NA 3VEYA 4HTLA 1GLLO 2ASOA 3ENOA 5EVZA 2HOEA 3GBTA 3JXUA 5AQLA 2IVOA 4H0YB 3VEOA 3U8XA 5KQ8A 4MLHA 2A3ZA 3O1WA 3IMXA 5AQSA 2IVNA 4B1VA 2D0OA 2P9LA 3GDQA 3TU5A 1LCUA 4CD1A 3SK3A 2ZGYA 4BR4A 1V4SA 3UKRB 3A5NC 3H1QA 3H3OB 4DCHA 2PBDA 2IVPA 3VESA 1ATSA 1Y64A 1NGFA 2QM1A 4DB3A 1BUPA 5CE3A 4I6MB 2I7NA 1BA0A 4BR2A 1NGCA 3FLCO 4Y0WA 4BG9A 2GELA 2YHYA 3O80A 3D2EB 4BVOA 3H3NO 1X3MA 4PKIA 2YHXA 3ATUA 4C23A 4JHDA 5AQFA 1NGIA 3UB5A 4HWIA 4IXCA 4XH5A 3O5BA 3QICA 3QB0A 1HUXA 2E2OA 1NGGA 2QWMA 3ZETA 1BU6O 1DKGD 5TKYA 3MN6A 1GLEG 1KAXA 3O1BA 4FOIA 3BUZB 4KBOA 3B8AX 2CGLA 1ZXOA 5KPRA 4XEIA 4BRHA 1MWMA 1V4TA 3U9ZA 4CZMA 4RWTA 2E20A 1QZ5A 4K43A 5JICA 4K41A 1ATRA 1E4FT 2IIRA 5AFUA 1MDUB 3QBXA 4MO4A 1U6ZA 4CZIA 4BRAA 1DEJA 4BROA 3DJCA 4ISEA 3D7EO 4WQ4C 1BOTO 2Q97A 3WXKA 4CZKA 5F0XA 5AQOA 4QS8A 3I8BA 2QWOA 5AQPA 1IJJA 4BR5A 1HPMA 3U4LA 2QWLA 2QXLA 1NGEA 1LOTB 4BRPA 2P9UA 2Q2RA 1NGHA 2YHWA 3FGUA 3GL1A 4FWRA 1YAGA 2Q36A 5KPTA 2P9SA 2QWPA 4RTFD 2P9PA 3BF1A 1XQSC 1HKBA 1KAYA 1K8KB 4DHYA 3H46O 5AQVA 3DXKA 3UE5A 2W40A 3ZX2A 1RFQA 1HX1A 2HMPA 2CH6A 3R9PA 1Z05A 3VEWA 2QW9A 4M63C 1YUWA 1NBWA 4O5FA 3W3DA 4B1WB 3FZKA 4BQZA 3ZEUB 4B1UB 3C7NA 5ADXH 3VGKA 5FPMA 2E1ZA 4PKHA 2Q31A 2DPNA 4AM7A 2A40A 3GOIA 1EQYA 4EAHD 4B9QA 5AQKA 3LDNA 3MDQA 3WEEB 2ASMA 5BRFA 2BUPA 3MN7A 3KVGA 3GG4A 3O08A 5LJVA 4IZ9A 5AQHA 2P9NA 1BWFO 4M7YA 3M6GA 3WQUA 1U2VB 1NLVA 3J8AA 1T6DA 1IG8A 4JNEA 4K25A 1MA9B 1NM1A 5AQXA 2P9IA 1C0GA 2D1KA 2Q0UA 3UKUB 1SQKA 3CHWA 3KZBA 5EY4A 2P9KA 1GLCG 4QS9A 3WT0A 2YCHA 3CIPA 1TUUA 4IJAA 3VEZA 3D2FB 1SZ2A 3HM8A 2VYPA 4FWSA 4CBWA 2PAVA 1J6ZA 2GTDA 2VCPA 5AQRA 3A5LC 3VEVA 5BR9A 3EN9A 3KHYA 5AZJB 1OKJA 2GWKA 5BPNA 1NGJA 3VF2A 3OHRA 3CJCA 4JAXA 3MCPA 4LC9B 1G99A 3WUHA 1R59O 2ASPA 1E4GT 2ZWHA 4BC4A 1MWKA 3DXMB 5EOYA 1HJOA 1T6CA 2F9TA 4FL9A 4FWNA 1HKGA 3EKUA 4BVPA 3UKRA 4YDUA 3CJ7A 1JCEA 3I33A 3M3ZA 1ATNA 5EXWA 5ELZA 3LDOA 3LM2A 4CZHA 3L0QA 4MLEA 3L4IA 4BRGA 1TYQB 3BF3A 1P8ZA 3FR0A 2F9WA 1BA1A 4I6MA 1QQOA 1H1VA 1YVNA 3IFRA 1RGIA 1XUPO 3L6QA 5JMVA 3H1VX 4WYBA 1CZAN 3D2EA 3EO3A 1WOQA 3A5MC 4H5VA 4MO5A 4XH4A 5FPDA 4BRKA 3DAWA 3A5OC 1SAZA 2QWRA 2E2NA 4EFHA 3ULEB 3TPQA 5AZIB 3CQXA 4B1XB 4BC3A 4FO0A 1JCGA 4CZEA 4GNIA 3BP8A 2H3GX 2P9PB 4JD2B 2NZTA 4EHUA 5BRHA 4B1YB 5AQUA 2QWQA 3H6EA 3WXLA 3ID8A 2ZF5O 5F1XA 3RSEA 3IUCA 2Q1NA 1S22A 1C0FA 3FFKB 3O8MA 1YXQA 3DXKB 3QFUA 1NGAA 2KHOA 5B8HA 3EL2A 4QS7A 2YJFA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5CYMA 3AA2A 3CD6N 1DTTA 2ZGZA 3HTVA 3TSPA 4JYAK 1VSKA 2A42A 3L2VA 2A5XA 3HM9A 4FLWA 1G15A 3LZJA 2HBMA 4PL8A 4QOZB 3RMCA 3HSCA 2AA4A 4BGAA 2D5RA 3TAEA 4A59A 3KWGA 4CF8A 2FXUA 3DMJA 4WQ5A 4BRMA 4CERA 3SAFA 4F9OA 3PX6A 4CJQA 4M45A 5E41A 2P5GA 3K2PA 2NRHA 3NAEA 4HHTA 1K8KA 3FZLA 4IBNA 4B8CA 3MAQA 3VQ4A 3V9UA 4KB0A 3TTCA 3ZSWA 4CEFA 2YX6A 4GY2B 4YOTA 2HB5A 2FBXA 1L3UA 5KRTA 1BISA 2VG5A 3OYFA 4B8AB 4YDUC 3HVTA 3AO2A 3O4WA 4BRDA 4CEOA 4H5NA 4Q5VA 3ZEUA 3WXIA 2HNDA 3AVLA 1R0AA 4IDKA 5FPNA 3WEEA 1RBRA 3LDQA 1J5OA 3TR8A 3M8PA 3Q7CA 5C25A 3PY8A 1Z6RA 1YHQN 1CZ9A 3G0ZA 4CJVA 1VQ5N 3P1GA 3VMFB 4CF2A 3EZWA 4IG0A 4ISFA 5T7BA 1U2VA 4FWPA 4YOVA 4FOEA 1FK9A 1HR0K 3ZSQA 4CBXA 1RT7A 4LD0A 3PIOL 3ZSXA 2KLAA 4ELTA 3D2FA 3CMAN 2HF4A 5AR0A 3T69A 4H4MA 3LP0A 3NBPA 3CCEN 2W41A 5JS1A 3SLCA 4CZJA 1Q18A 4H0VB 5AZJA 1BIUA 4A5BA 2OPQA 4K8XA 3QBWA 4R5PA 3FFIA 4PUOA 2YV0X 3HI0A 3MN9A 3R1XA 1T44A 2P9UB 4F8RA 2HBLA 3DYAA 4CHQA 4M3YA 4E89A 1JLCA 4C8LA 3LP3A 2P9SB 3T1AA 3OYLA 4DQIA 3CJBA 2OA8A 2UYTA 5F2RA 1BDGA 1XNQK 2KTQA 3CF5L 1TYQA 3FZMA 1CXQA 1NJIO 5LY3A 4B9LA 5FPEA 3HL8A 3FE1A 3T19A 3CJAA 3C7NB 4Z4HA 4GV9A 1NGBA 5A2QO 1JLEA 3HPOA 1GLBG 3AARA 3DLLL 4EHTA 2ZM6K 1JLFA 4BRNA 3VQCA 4E7LA 3C94A 1ZBIA 4H0PA 4I7FA 4BWMA 4IOAL 2OZSA 3E66A 3VEXA 1NK5A 3VERA 3ATVA 4JEPA 3EKSA 5TKWA 3SBGA 4C1NI 1WSJA 3J7AP 1NJZA 3KK2A 1HNWK 1HNIA 1BG3A 2GWJA 4WQ4A 2P9IB 5EU7A 3O4NA 1E3MA 3CERA 3CYMA 1XWLA 1FJGK 1GLJO 4BRFA 1VQMN 3ZT2A 4M42A 4BE1A 4EP4A 2DFHA 2HF3A 4CIEA 4H03B 1YIJN 4HVJA 4DSLA 4KV8A 5EVZA 2HOEA 3GBTA 1BQNA 2IVOA 1HYVA 3SNNA 4MLHA 1TV6A 1JKHA 3GDQA 2P9LA 1LCUA 4G1QA 3SK3A 4A57A 4LF6K 4BR4A 4H4OA 1T7PA 3UKRB 3H1QA 3LANA 3L2QA 4NCBA 1VAZA 4KFBA 4DTNA 4DFJA 2A1RA 4OKKA 5FROA 3K5NA 1OH8A 1NGFA 2QM1A 1BUPA 4W5NA 1BL3A 3M8QA 2I7NA 4FZYA 3LWMA 3I56N 4DR7K 4LF9K 4DS4A 2OPPA 2YHYA 3E9OA 5I3UA 1ZYQA 3EE9A 4BVOA 4W5RA 3H3NO 3MEEA 4HCBA 2YHXA 4C23A 1S9EA 4JHDA 1EO1A 1XI1A 4DG1A 4DMNA 4IXCA 4BE2A 3O5BA 3OYBA 5SWMA 4NXNK 3OS0A 3O3GA 3P38A 3P31A 3QB0A 2GX9A 2HNYA 1NGGA 1UA1A 3MECA 5C2DA 4FLUA 4FOIA 4YORA 3SI6A 4LF4K 1RCHA 4YFUA 4CGDA 2VG7A 1QZ5A 4FVMA 1IH7A 4K41A 3AVGA 2IIRA 3V81A 1CZBA 3QBXA 4N41A 3DRSA 4BROA 4JK8A 3DJCA 4DUYK 2Q97A 1VSLA 1OH5A 3SQ0A 4QS8A 2ZJQL 4CHOA 1HNXK 4OLBA 4YOXA 4CGGA 4DR6K 1WSEA 3TI0A 4CJ4A 3KKRA 3SAHA 2QWLA 4J2EA 2QXLA 1NGEA 4DTUA 1DLOA 4FK2A 1F21A 3FGUA 3GL1A 4FWRA 1BI4B 1KVCA 2QWPA 4O4GA 3AVBA 1HJRA 5K14A 1L3SA 1XQSC 2YKMA 1S6QA 3A2FA 4CFAA 2HSTA 3AVHA 4IOXA 3H46O 3QEPA 2O8BA 3UE5A 2W40A 1BCMA 4E19A 2QK9A 2CH6A 1VSDA 4FJHA 1YUWA 1NNEA 3J7ZO 3OBWA 3Q7BA 3ZT0A 5ADXH 4FJJA 4FJIA 3GOIA 2JWKA 3V6DA 3LDNA 3MDQA 3K5LA 3CC2N 3KVGA 4KH4A 3AA4A 3WNHA 3MXIA 3F2KA 4O0JA 3M6GA 4F2SA 3WQUA 2NRVA 1J53A 2GV9A 3DM2A 1L3TA 3HP9A 1NM1A 2D1KA 2WTUA 4ID1A 1SQKA 4DF4A 3VQPA 1KLNA 4DSFA 4Z4GA 1SZ2A 3HM8A 5CY4A 2G8VA 4FWSA 3NMUA 1NMNA 2PAVA 2OCEA 4I2QA 5BR9A 1C0MA 4CK2A 5BPNA 1L3VA 1RDBA 3ZCMA 3CJCA 4Z4EA 1JXBA 2HHHK 4DFPA 2PFUA 3E9LA 1D8YA 1RTIA 1R59O 3IRXA 2ASPA 4O8UA 1MWKA 1W0HA 3M5RA 3VQQA 5CHIA 1HJOA 2F9TA 1HNZK 1HKGA 3EKUA 4KAZA 2ZJRL 1QHTA 3CCVN 5M1FA 1JCEA 3I33A 5EXWA 5ELZA 5C2FA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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