1XC3A

Structure of a putative fructokinase from bacillus subtilis
Total Genus 90
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
90
sequence length
295
structure length
295
Chain Sequence
AMLGGIEAGGTKFVCAVGREDGTIIDRIEFPTKMPDETIEKVIQYFSQFSLQAIGIGSFGPVDNDKTSQTYGTITATPKAGWRHYPFLQTVKNEMKIPVGFSTDVNAAALGEFLFGEAKGLDSCLYITIGTGIGAGAIVEGRLLQGLSHPEMGHIYIRRHPDDVYQGKCPYHGDCFEGLASGPAIEARWGKKAADLSDIAQVWELEGYYIAQALAQYILILAPKKIILGGGVMQQKQVFSYIYQYVPKIMNSYLDFSELSDDISDYIVPPRLGSNAGIIGTLVLAHQALQAEAAS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Structural studies of ROK fructokinase YdhR from Bacillus subtilis: insights into substrate binding and fructose specificity.
pubmed doi rcsb
source organism Bacillus subtilis
molecule tags Transferase
molecule keywords Putative fructokinase
total genus 90
structure length 295
sequence length 295
ec nomenclature ec 2.7.1.4: Fructokinase.
pdb deposition date 2004-08-31

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00480 ROK ROK family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1xc3A02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1xc3A01
2Q1NA 4ISEA 4FWRA 4BRGA 3O8MA 2IIRA 1C0GA 2P9PA 3GBTA 3A0IX 4IWVA 4PKGA 2A42A 3C7NB 3AY9A 5LY3A 4BG8A 5BR9A 4H5RA 4WQ4A 1MWMA 1NGGA 3CJ9A 2F9TA 1NGFA 4CZGA 4EHUA 4NO7A 2Q97A 3DAWA 4BC5A 1XC3A 4GNIA 3CJ1A 5BPNA 2P9SA 4H0PA 3FZLA 4B1UB 4BRNA 5AFUA 4I6MB 5I9EB 1X3MA 3UKUB 3VGKA 4BVOA 3CHWA 2QWRA 3VF2A 2AP1A 2E1ZA 2VWBA 3BF3A 3G25A 2CH5A 2QW9A 4J8FA 3ZETB 1GLBG 3EKUA 5CE3A 2BTFA 2NLXA 4AM7A 3A5MC 3SJHA 4JHDA 4A2BA 1HLUA 3VEWA 1WOQA 2IVPA 3KVGA 2A40A 3P4IA 1NM1A 4DCHA 4H5VA 4CZMA 2I7NA 3DWLA 4O5FA 4BREA 1HX1A 1GLFO 4FWOA 3R9PA 3C7NA 5AZJB 1J6ZA 1BUPA 1ZBSA 3CJCA 1MWKA 3O4WA 2E8AA 1WUAA 4O8KA 3VGMA 1CZAN 2E2OA 3MK6A 1V4TA 2H3GX 2CGKA 3QICA 5BN8A 2P9IB 3O1BA 2P9PB 2D4WA 4FWPA 1RDWX 2VYPA 5AQHA 1KAYA 3FFKB 5LJVA 5KQ8A 3QMLA 3FR0A 3WXLA 1Y64A 2GWKA 2E2NA 2HMPA 3SLCA 4BROA 5AZIA 3D2FA 4FWQA 3QFPA 4JNEA 2W40A 3ZETA 2ZF5O 2FF6A 2NZTA 4FPAA 2V7ZA 1SAZA 1U2VB 3WEEA 4JD2A 3UKRA 3KZBA 1U6ZA 1GLAG 2QWOA 2YHYA 5AQFA 2J4RA 3KHYA 4XH4A 3VGLA 3B8AX 1QQNA 3IMXA 5F1XA 3VEYA 4YDUC 3UKUA 1NGCA 2I7PA 4CD1A 5KPTA 3I8BA 2YJEA 1ATRA 4CBWA 3FZMA 3U8XA 2FXUA 4BR5A 1YXQA 2QM1A 4EIAA 3UB5A 1NGDA 4RWTA 3FZKA 2P9LA 4CZFA 1QZ6A 4QS7A 3VERA 3RSEA 4CBUA 5AQLA 5FPDA 3EL2A 1ATSA 1HKBA 3CIPA 3H6EA 3LM9A 4YDUA 3H3OB 4BR7A 1Z05A 2A5XA 1X3NA 1YUWA 1NBWA 1KAZA 5AQOA 1IG8A 1Z6RA 5FPMA 3A8YA 1XUPO 3GG4A 5AQQA 1QQMA 3HSCA 5JMVA 4FL9A 5AQNA 2ASMA 1ZXOA 3BEXA 5AR0A 3ZEUA 5ADXA 4KBOA 4QS8A 1NGBA 3CJAA 5EXWA 4MLHA 3MN9A 4DQ8A 1JCFA 5KPZA 3VF4A 4AM6A 3JXUA 5AQTA 1BDGA 3S41A 4WQ5C 3DJCA 1H1VA 4JN4A 1NLVA 2PBDA 4BRIA 3EO3A 3DXMB 3D2EB 4JAXA 4M7YA 1BG3A 3L6QA 4BC3A 3LDOA 2E1YA 4A61A 3MDQA 3M6GA 3GDQA 3H46O 1HKGA 3A5OC 2Q2RA 4WQ4C 4H0YB 4B1ZA 4WYBA 4DB3A 3FLCO 4DHYA 4B1YB 2E20A 1DGKN 3O08A 3VENA 2QWMA 2F9WA 3FE1A 5AZJA 4K43A 4B1VA 3DXMA 1BA0A 2GWJA 3ULEB 1K8KA 1TUYA 4CZIA 2V52B 2W41A 5JLHA 1GLLO 4BC4A 4H0VB 3LDLA 2FF3B 4FWLA 3HTVA 4JHDB 1HUXA 3AAQA 4ISFA 4E1JA 3O1WA 1SZ2A 3VPZA 3ZX0A 1TUUA 3EN9A 1DEJA 3UKRB 3ZEUB 4CZKA 2YHXA 4XH1A 1SQKA 5AQUA 3ATVA 1YVNA 3HZ6A 3F9MA 5AQXA 4MO5A 4BRMA 2E2PA 4B1WB 4EFHA 2ZGYA 5FPEA 4BRKA 3JS6A 2HOEA 2QWLA 4BR4A 1NGEA 2P9SB 1JCEA 1QZ5A 3MN5A 5AFUH 5AQPA 4FSVA 5ADXH 3HM8A 2Q0RA 2QWPA 4BRQA 5KQDA 4H0XB 1P8ZA 4BRFA 1TYQB 2FSKA 1GLDG 3WUHA 4FWMA 3RSEB 5BRDA 1TYQA 5EX5A 4H5TA 1X9JA 3UE5A 3LL3A 1S3XA 1ZC6A 1Q18A 3SMSA 4FWNA 4CD3A 2ASPA 3QDKA 2BUPA 2P9KB 2OANA 1MDUB 5AQRA 5LJWA 3HBTA 3BUZB 5F0XA 4FOEA 4BR9A 1BOTO 2D1KA 1NGAA 5AQJA 4H5WA 3AARA 4H0OA 3D2FB 4IJNA 1MA9B 4IJAA 3FZHA 4H03B 1U2VA 1D4XA 1YAGA 3MN7A 4NB4A 1EQYA 2P9KA 4HTLA 4L3QA 2YCHA 3LDNA 5KPRA 3CJ7A 2D0PA 2GELA 2HF4A 4I6MA 1ATNA 5BPLA 1GLCG 5AQWA 1BWFO 3WT0A 2D0OA 4CJ7A 3EKSA 4A2AA 3LDQA 1T6DA 3H1QA 4A62A 2WUSA 1RFQA 2GTDA 4CI6A 3SK3A 3J8AA 4LC9B 4Y0WA 5AQZA 2ZWHA 4PL8A 3FZFA 1G99A 2YI1A 4CZJA 4Z94A 2A6AA 5AQVA 5AQSA 4H5NA 3D2EA 4BR0A 2IVOA 4CZEA 4H0TB 3VESA 1HJOA 2EWSA 3EZWA 3VEVA 4K42A 3CQXA 2E88A 1C0FA 4BQZA 1S22A 3QB0A 4PL7A 1QQOA 3LM2A 3WQTA 1GLEG 2QXLA 2A3ZA 4IXCA 2NRHA 3HI0A 3BF1A 3WEEB 2P9NB 4FWKA 1T6CA 4WQ5A 4JD2B 2P9NA 4M63C 4BG9A 2FLOA 3TU5A 3U9ZA 3WXIA 1XQSC 2YJFA 5F2RA 3ID8A 2QWNA 4BQLA 3DXKB 3ENHA 3CJBA 4FPBA 3H45C 4F9OA 2ITMA 3M3ZA 3A5LC 3GE1A 4BC2A 2E2QA 5E26A 1K8KB 5EOYA 2P9IA 3VF6A 3I33A 3MCPA 3CETA 1NWKA 4BR2A 3R8EA 3BP8A 2P9LB 1NGJA 1V4SA 3LDPA 3MN6A 1NGHA 3WXKA 5EVZA 4RCHA 5JLFA 3U9DA 3M1FA 3A5NC 4CZLA 5E84A 4CBXA 3GL1A 1LOTB 4CZHA 4IO8A 3ZX2A 4HWIA 5BN9A 5EY4A 3CERA 1JCGA 5AQKA 4MLEA 2CGJA 2VCPA 3TPQA 2ASOA 3VEOA 3IUCA 3O80A 3QBWA 4FO0A 2Q36A 2V7YA 4XH5A 5AQYA 5B8HA 5TKYA 4ISGA 1QHAA 1NGIA 3O5BA 1KAXA 4BGAA 4EHTA 4BRLA 1BU6O 3ATUA 3VEXA 3VETA 1BA1A 1T44A 3OHRA 3QBXA 3MMVA 2A41A 4M7XA 1HKCA 2Q31A 3O6WA 3L4IA 3CQYA 5AQIA 4MO4A 2P9UB 2IVNA 4K25A 3H1VX 1HPMA 3W0LA 4BRDA 4PKIA 2GEMA 3VOVA 3CI5A 4BGBA 3IFRA 2UYTA 3R6MA 2QWQA 3WQUA 3ENOA 5BREA 2DPNA 5BRFA 3L0QA 1GLJO 2AA4A 2CGLA 1RGIA 2FSNA 4B1XB 4QS9A 3DXKA 3U4LA 2CH6A 2P9UA 2YHWA 2GUPA 4BRAA 3H3NO 5ELZA 2ZGZA 5FPNA 4B9QA 2FSJA 3QFUA 4FWSA 4IZ9A 1R59O 3WXJA 1ESVA 3SMPA 4C23A 4PKHA 2V51B 1IJJA 3IDHA 4BRCA 4GY2B 3D7EO 1BO5O 1KXPA 1NMDA 4BVPA 3VEZA 3FGUA 3AAPA 3ZX3A 1LCUA 5BPMA 1E4FT 5JICA 2KHOA 4XEIA 2PAVA 4BRHA 1DKGD 4BRPA 1OKJA 3ULEA 3C0BA 5AQMA 5AQGA 4RTFD 5AZIB 4K41A 2HF3A 3W3DA 5BRHA 2Q0UA 1E4GT 4FOIA 4EAHD 3GOIA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2Q1NA 4ISEA 2W42A 4YOTA 3O8MA 1C0TA 3CMEN 1JKHA 4CFBA 3A0IX 3OS2A 2A42A 3OYAA 3C7NB 3THWB 4JKDA 3T1YK 5GINA 4WQ4A 4BACA 3G4SN 2HMIA 1GOBA 2D0AA 4E1NA 4K8ZA 3CCRN 2Y1JA 5M1NA 2HVIA 5BPNA 3K59A 4FJHA 5AFUA 3KD5E 1X3MA 3UKUB 3CPWM 4BVOA 3NHGA 2F96A 2AJQA 2AP1A 3BF3A 3G25A 3PSIA 1S1XA 3ZETB 1WSHA 1JLAA 4W5TA 4DR6K 4AM7A 3O3FA 3CCUN 4A2BA 3QESA 1WOQA 1D8YA 4BWJA 3KVGA 1NM1A 4CFCA 4DCHA 4ILHA 5LMUK 3LDSA 4J2AA 4OKKA 4CJWA 3TSQA 2IS3A 1EKEA 5AZJB 1EWRA 3VMFB 3NGIA 3CJCA 2X78A 2DFEA 1WUAA 3R1XA 3VGMA 2E2OA 4O44A 2RN2A 1QSLA 5BN8A 2VYPA 1KAYA 4LFAK 3THWA 4CJEA 4Z4FA 3KK3A 4E0DA 2OZMA 4GKJK 2IAJA 3QEVA 1Y64A 2UUCK 2HMPA 5AZIA 4FWQA 1CXUA 4FJXA 4B3SK 3NF7A 2VG5A 4IO9L 2V7ZA 2ZE2A 3G10A 1BHLA 1EO1A 3K5NA 5GADP 1WAFA 4XH4A 1SKRA 4CD1A 3I8BA 4CCHA 4DR7K 4GVMA 1OH5A 5JS1A 4FM2A 3SUPA 4BR5A 2Z1GA 2Z1HA 4EIAA 4RWTA 4ILJA 4CZFA 1QZ6A 2XY8A 4KTZA 4LFBK 5FPDA 1VSIA 5FLXO 3LM9A 4YDUA 4BR7A 2PFUA 5MLCQ 4IG3A 4JLHA 2F4VK 1NBWA 3V9XA 3M8SA 3LZIA 2Z1JA 3TWHA 4KHYA 1IG8A 4HCCA 2OCEA 3RMBA 3HYFA 5AQQA 1QHTA 1QQMA 3T3FA 3DYAA 3M8RA 3ZEUA 3I56N 3LZJA 1VQMN 3I0SA 1DTTA 5IT9O 4LSNA 3EE8A 2Q3SA 4DQ8A 4O4GA 1S1UA 4AM6A 3JXUA 4DV1K 3MXMA 5AQTA 1BDGA 1HNVA 4M45A 3VN5A 1NMNA 3I0RA 3ISNC 3CF5L 2R7YA 3DJCA 3V6DA 4JN4A 1RT7A 2PBDA 4BRIA 1NKBA 2IC3A 1ZBFA 1ZYQA 4BC3A 4DQSA 2QEXN 4A61A 4RG8A 3MDQA 4MQ3A 4IEIA 4NCAA 1XWLA 3GDQA 3M6GA 4QOZB 4FK2A 4WQ4C 4FJGA 3FLCO 4B3MK 5C2FA 3VENA 2QWMA 2F9WA 3R3LA 2JLEA 4DTXA 4RW6A 1BA0A 4FLYA 3PIOL 3AVLA 4LF7K 1XI1A 4BC4A 4FWLA 3HTVA 3AAQA 1RDAA 2NNWA 3HVRA 3VPZA 3HP9A 1S1TA 3RMAA 3P5JA 1SQKA 5AQUA 4FK4A 3K2PA 3WNEA 4FJ5A 1YVNA 3HZ6A 1NG9A 3NE6A 1J9AA 4X64K 4CJRA 5FPEA 3QLHA 2P9SB 4DFKA 3MN5A 4BE0A 3HM8A 2Q0RA 4BRFA 1GLDG 2WBNA 4OPKA 4FWMA 3DOLA 4YFUA 3C95A 4YOVA 3LL3A 4OVLA 5AJ3K 3AA2A 1ZC6A 1XC9A 2D0CA 2KFZA 5CZ2A 3AGKA 3QDKA 2YNHA 2HHTA 2ZJPL 2OANA 5AQRA 4CGFA 3AVKA 3H08A 4CJ3A 3VQAA 3HBTA 5LJWA 3SJJA 3AO1A 5C2DA 4DF4A 1T8EA 4FOEA 1NGAA 4DR2K 4H5WA 4GKKK 3VQ8A 3HT3A 4IJAA 1C1CA 3L2VA 1D4XA 4E7HA 1HNZK 3PLAA 2KQ2A 3F5TA 4E7LA 1FK9A 2QI2A 4KHQA 3WT0A 1XHZA 2D0OA 3AVMA 1UAXA 5M1QA 4A59A 2WUSA 2G8FA 2GTDA 4CI6A 3IKMA 3SK3A 4HTUA 3SBTA 1WSGA 3VQ9A 3C6HA 4PL8A 2YI1A 3D2EA 4BR0A 4NCBA 4JI1K 4JI4K 3ZSYA 2HHXA 1K73O 4PL7A 3OYGA 4Q5VA 2RPIA 1GLEG 3DLGA 2A3ZA 4IXCA 1T6CA 1Y97A 4KHWA 4LY7A 4WQ5A 2HHSA 4ID1A 2RKIA 2QKKA 3NMUA 3WXIA 2YJFA 4BQLA 1F21A 2ITMA 2D5RA 3KLHA 4B8AB 1TK8A 3HL8A 4BC2A 2O8CA 5E26A 1K8KB 3V9SA 2UUAK 2P9IA 4NLBA 3R8EA 3HP6A 1NK5A 4BDPA 1QQCA 3VQ6A 4CFAA 1NGJA 1RT3A 3MN6A 1NGHA 3WXKA 3OYNA 3KD1E 5JLFA 4KHPK 2Z1IA 4FJMA 4CZLA 2E6MA 3L2UA 3ZX2A 3SUOA 3CERA 1JCGA 4OLAA 1S6PA 3AA5X 3EY1A 3ALYA 2GBZA 2HHHK 3DMJA 5KTQA 4BY9C 4FO0A 4DQIA 5AQYA 3DOKA 3LP2A 3TAMA 1KAXA 4BGAA 2HW3A 4EHTA 4BRLA 1TAUA 3QEWA 3L4QA 4CEOA 4CJPA 1A5VA 4M3TA 3SQ0A 3ATUA 3VEXA 2HBJA 3OHRA 2NRTA 4ZHRA 3O6WA 1IV0A 2UU9K 3L4IA 4I7FA 3HVTA 3T1HK 2P9UB 2IVNA 1IG9A 3CG7A 3KLEA 3LP1A 1J54A 3DLLL 4IEEA 4CJKA 3VOVA 1O13A 1RCHA 2JWKA 3S3NA 3HPOA 1YTAA 2VWKA 5M1KA 5DM7L 3SAFA 4IFYA 3MWTA 4W5OA 4FVMA 4N76A 5I42A 5C12A 4B1XB 1WAJA 3DXKA 4BRAA 1J5OA 3VA3A 1YJNN 1NJXA 3T19A 3QFUA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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