1XCC | Genus

Total Genus 62

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	62
sequence length	219
structure length	219
Chain Sequence	b'GYHLGATFPNFTAKASGIDGDFELYKYIENSWAILFSHPNDFTPVCTTELAELGKMHEDFLKLNCKLIGFSCNSKESHDKWIEDIKYYGKLNKWEIPIVCDESRELANKLKIMDEQEKDITGLPLTCRCLFFISPEKKIKATVLYPATTGRNAHEILRVLKSLQLTYTTPVATPVNWNEGDKCCVIPTLQDDEISKHFKNEITKVEMPSKKKYLRFVNL'

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	Genome-scale protein expression and structural biology of Plasmodium falciparum and related Apicomplexan organisms. pubmed doi rcsb
molecule keywords	1-Cys peroxiredoxin
source organism	Plasmodium yoelii
molecule tags	Structural genomics, unknown function
total genus	62
structure length	219
sequence length	219
chains with identical sequence	B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date	2004-09-01

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00578	AhpC-TSA	AhpC/TSA family
A	PF10417	1-cysPrx_C	C-terminal domain of 1-Cys peroxiredoxin

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.30.1020.10	Alpha Beta	2-Layer Sandwich	Antioxidant, Horf6; Chain A, domain 2	Antioxidant, Horf6; Chain A, domain2	1xccA02
3.40.30.10	Alpha Beta	3-Layer(aba) Sandwich	Glutaredoxin	Glutaredoxin	1xccA01

5IMCA 4GQCA 2YN1A 4HEA2 5D9WA 2HLSA 5DVBA 3FYGA 4FYBA 1A0FA 1BG5A 4NPBA 2F3MA 3DD3A 2CVBA 2L6CA 1N8JA 3GKNA 3TUEA 3HA9A 3IXRA 4POBA 2HZFA 3RHCA 3H8QA 4MDCA 4ML1A 1GWCA 2LRNA 4L0WA 4GQFA 1I9DA 2K6VA 3ZREA 1T1VA 2CT6A 2HT9A 4KB3A 1M0UA 4AJ6A 5HR3A 3LYPA 4LL4B 4DSSB 1A8YA 1KTEA 1RK4A 2P31A 4DSSA 1X9WB 3KCMA 1MD4A 5ELGA 1Z6NA 2PVQA 1USBA 2LRCA 4HS1A 5ID2B 2GSSA 1LJRA 1NHYA 3FZ4A 5ID2A 3CSIA 3QMXA 5DJLA 3GTUB 1YEXA 5B6MA 4RUVA 3KXOA 3GTUA 4Z7XA 4OFTA 2C0GA 4NHWA 5J4UA 4YQVA 4ILFA 2F9SA 3KZQA 1AXDA 3DEXA 1GNWA 2H8LA 5IQYA 1V57A 2NTOA 3QAWA 1M2AA 1GULA 3QD9A 3QDNA 3LG6A 4ZL7A 3IA1A 2B6MA 1GTUA 1GUKA 4QL7A 4PUAA 1JZWA 5HQPA 3F6FA 2I9HA 2R37A 2H75A 3FR3A 4JR4A 2GVPA 2JZSA 2HRFA 5B7CA 4TVEA 4XRDA 5H5RA 3DVXA 3KIJA 3F9UA 4DEJA 2WZ9A 1HQOA 2HZEB 1K0NA 2PMTA 2JADA 2IMDA 3ERWA 2HZEA 4MZBA 3W8JA 1B9YC 3APOA 2CA8A 5HFKA 4ML6A 5IPHA 3CYNA 3UOMA 1ZMAA 2H1BA 5IO0A 2H70A 2KOKA 4O7HA 5D8IA 4JE1A 2C8UA 3TJJA 1SJIA 2YJ7A 4POLA 2WB9A 1XCCA 5JWOB 3NOFA 4PQ1A 5EY6A 2AJQB 3APQA 4IQ1A 1ERTA 4O5RA 3SBCA 2VLUA 3JCML 3GRXA 3UL3A 1SD9A 3TB2A 4BA7A 2WFCA 2WGRA 2GT5A 6GSSA 4EC0A 1T4YA 2PERA 3GYKA 1FO5A 2FA8A 1OC3A 5IO2A 1R5PA 4EUYA 5HR0A 1I5GA 1U3IA 2IMIA 4HJ2A 2DSAA 4ZBBA 4ZL8A 1KEBA 2P0GA 4P3YB 3TJFA 1S3CA 1XVWA 3TJKA 3HYPA 1X5EA 2NVLA 3ERFA 3F8UA 2E2MA 3C73A 3ZITA 1R7HA 1XOBA 3G7JA 2JU5A 5JCGA 2GQLA 1EP8A 4RI6A 2LRTA 4KCEA 4MF5A 6GSTA 3U6VA 2OADA 4FIWA 1M7TA 2H1DA 4J57E 3VPQA 1ZZYA 1KNGA 1K0MA 3D5JA 2JACA 3DMLA 2TRXA 5IM9A 3US3A 2DJ0A 1W4VA 3OR5A 5D73A 4F0CA 2YJHA 2BTOT 3IC4A 1EOGA 2IL3A 1K0BA 4K1FA 1OC9B 1GLQA 4GWRA 4F2IA 2HYXA 5HFIA 1OC9A 3HD5A 1UVZA 4MJBA 3A2WA 1AQVA 2VO4A 5A5KA 1GL8A 3DIEA 2REMA 1Z3EA 1GUHA 4ECJA 1BAYA 5L71A 2I4AA 2WJUA 3CTGA 5F05A 2VCVA 1F6MC 4EF0A 2ZUPA 2H6XA 1XBSA 1XOAA 3C71A 10GSA 1XWCA 1FOVA 2OE0A 4O32A 3HXSA 4NHZA 3L9SA 3L78A 2MBTA 3LSZA 4OWYA 4PGTA 4ZB6A 2H1AA 5JCWA 4JRRA 2YP6A 1S3AA 1MTCA 1Z7RA 5ECKB 3VWUA 2K8SA 17GSA 4J2FA 2LUSA 2FCHA 4KDXA 2L4CA 4X43A 5DDLA 4K6XA 2Z9SA 3PGTA 2HI7A 4PX1A 3W6GA 4K7OA 1A2MA 3D6IA 1M9AA 1TK8B 1V40A 5IMDA 2X99A 2VM1A 1RW1A 2XPDA 3GKMA 5H5SA 1A2JA 1W89A 5ECSA 1QQ2A 2WRTA 3EU4A 6GSYA 4I2UA 2V6KA 1PL1A 2RUEA 3K8NA 1TKDB 5DCHA 4IN0A 1ZOFA 2OJLA 3TKPA 1QUWA 3VK9A 4MPGA 3TRQA 5AISA 5A4UA 11GSA 1EP7A 2KLXA 4TR1B 2IJYA 14GSA 4XCSA 4TR1A 3PR8A 1GTAA 3F3QA 3LORA 4K7NA 1C72A 1RQMA 3H93A 2H0IA 5ECPB 4IKHA 1UC7A 2WULA 2G0FA 2FWFA 6GSXA 2C3NA 3HKRA 5DBQA 1OYJA 5B8AA 3TJBA 2CX4A 1UA5A 3EU3A 4IS0A 2GZZA 4WF5A 1THOA 4MPFA 4ECCA 4TRXA 4KNDA 3EVIA 4KE3A 2VL9A 13GSA 2YZHA 1R5AA 5J9BA 5IMVA 3MNGA 4EE0A 2RM6A 5G1LA 2MZCA 4KH7A 2AV4A 2DIYA 2VD0A 5H5QA 2IMEA 2QC7A 3D0ZA 2R5GA 2YOIA 3G9BA 1F37A 3L9VA 1DE1A 2AB6A 1VF3A 1EWXA 1YF1A 1YJ6A 2H0HA 4YQMA 4G9HA 2O85A 4Q5RA 1K0DA 1XXUA 3I9V2 5ABRA 1EOHA 2OA7A 1H4OA 2FA4A 4GSTA 1GTBA 2FGXA 1TDIA 1AIUA 4EXJA 2GSTA 3GMFA 4L8EA 1A2LA 1TJDA 3QFBC 3BJ5A 2MMAA 3LFLA 3IE3A 3IDVA 1G7EA 1TU7A 1VRSD 1U6TA 1PKWA 4MLYA 4HQZA 1IYHA 1YQ1A 1TOFA 1ACVA 1FW1A 3IR4A 3VFIA 4J56E 5F07A 4DVCA 2FY6A 1DSBA 3R2QA 4HUAA 2LQQA 2PPTA 2B5EA 3NZNA 3IAS2 3GNJA 1U3AA 5J3RA 2AHEA 1THXA 4GCIA 3TOUA 4KDUA 2VL3A 2B5YA 3QAGA 2NDOA 3APSA 3ME7A 4RQRA 3RPPA 4TR0A 4KSMA 2VLVA 2XC2A 1GSFA 2MMNA 4YAPA 3RPNA 5KEJA 18GSA 2MMOA 4PXOA 5ECHB 3F63A 4AGSA 4OO4A 2LV3A 3GKKA 5A4WA 4OFMA 4MCUA 2GSQA 3AY8A 2L59A 3O6TA 4QQ7A 3G7YA 2GZYA 1Q98A 2OE3A 5COHA 1E2YA 3HZ4A 3KP8A 3N5OA 2MYGA 3D22A 20GSA 4MZWA 4ECBA 3KM6A 2H0GA 1PMTA 4AJ7A 1O8XA 4LMWA 1IYIA 2ALBA 3EE2A 3TKRA 1N2AA 3EINA 5D93A 1J9BA 4ZB8A 2H30A 3M1GA 3IPZA 4MH2A 5DQYA 4Q5FA 2YV9A 4BPYA 2LJRA 6GSUA 2E7PA 3C8EA 1BJXA 4IP1A 3GIXA 4G19A 4I6XA 2NPBA 1Z5YE 4WETA 2FLSA 1TK0B 5G30A 19GSA 3VWWA 2CX3A 2H76A 2GQKA 4N10A 3TKSE 4BWSA 3QFAC 2LJAA 1SK0A 1GSSA 5A4VA 4WR5A 4JZQA 1HYUA 4F0BA 1NM3A 3V1WA 3D4TA 3MDKA 4F82A 3WGXA 4TR4A 2X64A 1J08A 2WDUA 1JZOA 2HSYA 2RM5A 4HI7A 3RDWA 3KH7A 3ERGA 3UBKA 4ID0A 4N11A 1EV4A 2KUCA 1BQ7A 3HDCA 1PL2A 4JEDA 1O8WA 5C00A 1B8XA 2LSTA 4KX4A 1DBYA 2H73A 4I2TA 4MMMA 1FB6A 3ZL5A 1EEMA 1AQWA 3C7MA 1PX6A 4IGJA 5KN2A 1MEKA 3GSSA 2YPMA 2H72A 1R4WA 5GSTA 1SJ6A 4ZBAA 3CSHA 5CRWA 5AIVA 2IIYA 1NSWA 3WT2A 1XZOA 3ZVJA 3FEUA 3H4KA 3FK8A 4IP6A 5ECRB 2R2JA 1X5DA 1M2BA 3DXBA 3DRNA 3E9JB 3IK7A 1JZDA 2IMKA 1XW6A 4N0VA 1SENA 4E8EA 3FW2A 3TDGA 1T4ZA 3EWLA 4PNGA 3CRTA 1XW9A 2R4VA 3GN3A 4NMUA 4OCEA 4WBRD 1ZCPA 2C80A 1AAZA 2E2GA 2DJ2A 2WCIA 1XWBA 5INYA 4KAEA 4TXOB 2ZCTA 3GX0A 4EL1A 4WEYA 2KP2A 3HVVA 3ED3A 4TXOA 2C1YA 5ECMB 1BX9A 1M2DA 3ZIVA 1GP1A 2K8VA 4OD7A 3EYTA 3FY7A 3M9KA 7GSSA 1OC8A 1GSEA 2DMLA 3LEFA 3CTFA 1T7PB 5KN3A 5CRDA 3F4TA 2H74A 5HFGA 5DJMA 1F9MA 3GL3A 4OMVA 1H75A 3KD0A 1ERVA 1GSUA 4TOPA 1X5CA 2O7KA 2C0FA 2IFQB 1Y25A 1NHOA 2K18A 2IFQA 4ISDA 3GURA 1FB0A 1G6YA 4GF0A 5F06A 1V58A 5DALB 4KUNA 5DALA 3F4RA 3IBHA 1G7OA 5ECLB 1VGLA 3Q19A 3KEBA 3H1NA 4PQIA 5CYYA 1DUGA 1XFLA 4JBBA 2IN3A 3DYRA 5G1KA 1AQXA 2IPAA 4DSRA 1A8LA 3Q74A 4K0NA 1SK2A 1EGRA 1U87A 4IELA 2FD3A 2B7JA 3KGKA 3DWVA 4ZB9A 2HRNA 1B48A 2FWEA 1GH2A 5G5FA 4NV5A 2A2SA 3HCZA 3UARA 4BVYA 2DJ3A 1CQGA 3CRUA 5CO3A 4NAXA 4HU7A 5JWQB 1URMA 2OE1A 2K9FA 4F9ZA 1R26A 1TW9A 4N0ZA 2OACA 4RQXA 3Q18A 3ME8A 9GSSA 2PUKC 1BYEA 3EMPA 4XRAA 1K0OA 4Q5NA 5F8BA 4WF4A 3BD2A 4PUFC 2V1MA 5KN0A 2LNSA 2BMXA 2M72A 3ZVJD 3HJMA 1ZYQB 4MJEA 1PA3A 1YKAA 2XHFA 4KGIA 5ECOB 2HNLA 5ECIB 5G2ZA 4FH8A 5KN1A 4KA0A 4TN8A 1GUMA 1V98A 2CVKA 1FVJA 3P2AA 2OBIA 2VOCA 3GH6A 2DJJA 1F3BA 1XVQA 2C0DA 3IOSA 3TRPA 2J23A 3HY2A 1K3YA 1Y6EA 2PU9C 2CZ2A 3A5WA 3HJPA 1LBKA 3BOAA 3IRAA 5LCZA 3VLNA 4D73B 3LGCA 4D73A 2YANA 2C0EA 1M9BA 3H79A 2GSRA 3LYKA 1GSDA 4V1Ap 2HE3A 2FNOA 2RLIA 1TK5B 4O92A 3VWVA 2ES7A 2L6DA 1B4QA 4JU5A 5GZZB 3M3MA 5DQSA 3GL5A 2N5BA 2DIZA 5JCUA 3S9FA 2RIIA 1V9WA 3CXGA 1TI3A 3EC3A 1O81A 1TRSA 3IHQA 1TTZA 1JLWA 3CMIA 4KSOA 5FWGA 1XWAA 5EVOA 1SYXA 2NBSA 2FWGA 2DMMA 2N5AA 4E8HA 3F3RA 3G7IA 2FHEA 4LL1B 4PQHA 3MWHA 4K8MA 1YZXA 3VURA 2B5XA 1QXHA 4ECIA 2O8VB 4IJIA 2AYTA 4WKWA 2YZUA 3ZZXA 4OCFA 3C1RA 1YDKA 2LEGA 3BBYA 2LJKA 2VLTA 1FAAA 4H86A 2P5QA 2LNTA 3TOTA 2B7KA 4POKA 2JZTA 1OE7A 2H6ZA 4CDOA 1XW5A 3GSTA 2GDRA 1O7UA 2TRCP 3E3EA 3RBTA 4LLRA 3ZIJA 4IJ3A 3TKQA 4PURA 1LU4A 1QK8A 4BVXA 4EDZA 5IOWA 3GX8A 5CREA 1K3LA 5IMZA 3DKSA 2H66A 3QR6A 3QOUA 1WE0A 4KDYA 3DVWA 4G10A 1AC1A 4CW9A 3FHKA 1YF0A 2F51A 4ZXGA 2J9HA 5CRHA 4IW9A 5CRGA 3GKXA 4ZL9A 3WT1A 2H6YA 2IWTA 2VIMA 4V2NA 3QCPA 5GSSA 2ON5A 2CAIA 2N5FA 1YKCA 1K0CA 1ILOA 4OFNA 4ACSA 1JLVA 3EMXA 3ZYWA 2JZRA 5D96A 4FYCA 1ZL9A 3VI5A 4V2LA 3NIVA 2E0QA 1S3DA 2YV7A 1TRVA 3HHVA 3A3TA 1HNAA 1V2AA 1PN9A 2L57A 2CQ9A 1OKDA 4MABA 2F8AA 1QMVA 2L5OA 3GH9A 2A2RA 1A23A 1Z7PA 2O87A 3KTBA 4IQAA 2HSHA 3M0FA 1TRUA 4GXZA 1T3BA 3U5RE 5B6NA 4POMA 3P7XA 4ZBDA 2H01A 2CAQA 2PN8A 2DLXA 2VL2A 3TGZA 3HVXA 3TKSA 3FZ9A 4HZ2A 5J41A 2CV4A 5IOXA 2HFDA 2GLRA 1AW9A 5E59A 5LD0A 1J0FA 3KTLA 4MJCA 1XWKA 4L5OA 4BL7A 1EEJA 1ON4A 3LJRA 1O6JA 4I97A 1VF4A 2X8HA 3MAKA 2DC5A 1X9MB 1F2EA 4EO3A 1WPIA 2CZ3A 2JSYA 2M80A 4MF7A 4GSSA 4TKYA 3FZ5A 5F0GA 2OKAA 2L4QA 2XPEA 5HR1A 3RAZA 1PQNA 2B3SA 1F3AA 3KH9A 1QFNA 3HJOA 2HXKA 2A4VA 2VCXA 2EIOA 1MDKA 2PBJA 3GV1A 3J7Yk 1GSQA 4YAVA 3TJGA 2GT6A 2VCWA 2VM2A 2V41A 2QGVA 3KMOA 2PWJA 1MDJA 3WGDA 1PRXA 4HDEA 3QAVA 3O76A 3D21A 5ENUA 5CP1A 3L4NA 2CVDA 1TP9A 2M46A 2D2ZA 1DE2A 5AGYA 3HZ8A 5IIZA 4EKZA 3TCOA 2H19A 5FT3A 4MA9A 3FRCA 2QSIA 1HNBA 2R3XA 5G31A 5IPGA 2C3TA 5D9XA 6GSWA 4HJMA 1EGOA 2LQOA 2H1GA 3UJ1A 5HR2A 1G0TA 3L0HA 2WS2A 5ELAA 5EL8A 1TI1A 1SJZA 4TR3A 3UVHA 4I8BA 4QL9A 1BEDA 1WIKA 1WOUA 2QKEA 1MD3A 2ZNMA 3ZFLA 5ECNB 2GS3A 1FHEA 3I43A 2VL2C 1SYRA 1EZKA 3TKSC 5J5NA 4X1UA 4N30A 3ZMKA 3QPMA 3UEMA 2BJXA 5D9TA 3UMAA 1ML6A 1SD8A 5CAXA 2B1KA 1ST9A 1JHBA 4IHUA 1HNCA 4TXVA 1GRXA 2FWHA 3UAPA 4AJ8A 4X0XA 1K3OA 1GSYA 1YEPA 2VCQA 3SWLA 2PVOC 4MF6A 4EVMA 1B4PA 1NW2A 2YWOA 4MH3A 1WJKA 4IVFA 1Q4JA 3M9JA 2I1UA 4YQUA 2DBCA 2KHPA 3FR9A 3F0IA 4ZILA 4XIHA 2YWIA 4K2DA 1FG4A 1Z6MA 3FKFA 3I69A 3BCIA 4L0UA 1A24A 4XS4B 4Q5QA 2JL4A 1XPVA 4XS4A 4NWYA 4CHSA 2GTUA 3I6AA 1OKTA 1SL2B 5C04A 1X9SB 6GSVA 1Z9HA 4NXIA 3D4MA 4G2EA 1VF1A 1AUCA 2VAFA 3RHBA 1K0AA 3VPTA 3MSZA 1SKWB 12GSA 1TRWA 1PSQA 1UN2A 1OAZA 1A0RP 4FYUA 1PD21 2H71A 3FZAA 4K9ZA 2C4JA 4K0GA 3IAM2 4XHMA 4HU9A 2YWNA 1T8EB 1SKRB 1SL1B 2IMFA 5DCGA 2YWMA 2LTKA 1WMJA 2RUFA 4ULXA 4GTUA 4WXTA 3KP9A 1PX7A 5AIXA 2MMZA 4GRFA 1SL0B 8GSSA 3BCKA 1ERWA 2I81A 1O85A 1YY7A 3P90A 1MDIA 5B8BA 3LXZA 3CBUA 1ABAA 1WWJA 2EC4A 3N9JA 1WRYA 3F6DA 4OO5A 3GUSA 3M8NA 3P8WA 2GQMA 2V32A 1WP0A 4JR6A 1ZYEA 4FO5A 4KW6A 1JFUA 1TU8A 1JZRA 2EIQA 5J9CA 4K7IA 2I3YA 4AF2A 3C1SA 4MK3A 3TRXA 2AUVA 3F4SA 5D9VA 3UVTA 2VCZA 2X8GA 4DSQA 2VD1A 3PH9A 3VWXA 3ZMLA 5EPFA 2JSZA 3PINA 1ERUA 3ZRDA 22GSA 4V2MA 3ZTLA 1M99A 3UIWA 2F8FA 5E4WA 2L5LA 2DJKA 4LMVA 4WBJA 1SKSB 4YH2A 3GFKA 4XTSA 4F03A 2OBKA 4GLTA 4MZCA 16GSA 4BWQA 3DGQA 2EIRA 5IMAA 2GZPA 2VUPA 2R6KA 3CSJA 3KJYA 1O73A 3HVSA 1FVKA 2XBQA 4GSNA 2MBSA 1EV9A 3WD6A 5G5EA 1VF2A 4XS6A 4WR4A 2X8CA 4HOJA 2C3QA 2DJ1A 5LNKe 5ECQB 1XWGA 5GAPD 1KBNA 2LS5A 4NV2A 2V6OA 3FR6A 2PGTA 4MP4A 3ZFBA 1GLPA 4TW5A 5DAKB 2VCTA 3GA4A 4EDYA 5DAKA 4XS1A 2KP1A 1OVNA 2XBIA 3WYWA 3LWAA 5FHIA 1HD2A 3Q6OA 1TXXA 2AAWA 4LA1A 1T00A 2V2GA 4ZIJA 5IMFA 4I5QA 1X0RA 3VI7A 1PKZA 2P5RA 3J7Yb 3WGEA 5GAND 3UBLA 3ZLPA 1SK1A 1GNEA 4IBPA 5AN1A 3A2XA 4V1Ag 2FUG2 3L9UA 2B1LA 4HZ4A 3IK9A 1CQHA 1OE8A 3LQ7A 5CNWA 3IV4A 1E6BA 5JWRB 4HQSA 3KMNA 3O3TA 3E0UA 4KCAA 2O89A 2YNXA 2GGTA 3ISOA 4MJAA 3W8SA 1PGTA 1GTIA 3LXTA 2TIRA 1U88A 2YCDA 3EURA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily

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chains in the Genus database with same CATH homology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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