The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
28
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sequence length |
111
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structure length |
108
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Chain Sequence |
ANLYFQSNAVVVYGADVICASCVNAPTSKDIYDWLQPLLKRKYPNISFKYTYIDITKDLTDHDLQFIERIEQDELFYPLITMNDEYVADGYIQTKQITRFIDQKLVNE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
The 2.1A crystal structure of hypothetical protein SA0798 from Staphylococcus aureus
rcsb |
| molecule keywords |
hypothetical protein SA0798
|
| source organism |
Staphylococcus aureus subsp. aureus n315
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| molecule tags |
Structural genomics, unknown function
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| total genus |
28
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| structure length |
108
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| sequence length |
111
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2004-09-16 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF07315 | DUF1462 | Protein of unknown function (DUF1462) |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | 3-Layer(aba) Sandwich | Glutaredoxin | Hypothetical protein sa0798. |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1XG8 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1S3R A; 2GTU A; 3MYD A; 4OO4 A; 1MD3 A; 2L57 A; 3IR4 A; 1F2E A; 4KH7 A; 1F9M A; 4XIH A; 3GST A; 1TU7 A; 4G0L A; 1SYR A; 4YAV A; 2FA4 A; 5DCH A; 5HR3 A; 1FAA A; 4EIP A; 3QCP A; 1SJI A; 3O76 A; 4IKH A; 2B6M A; 1WIK A; 3EVI A; 4POM A; 4PQI A; 1WPI A; 2PBJ A; 5ELA A; 2WB9 A; 3DIE A; 1ZL9 A; 3F0I A; 4MJB A; 5B6N A; 2RUF A; 2N5B A; 2G0F A; 2PVQ A; 4N11 A; 3ZLP A; 2JAC A; 3CQF A; 5ECR B; 4G0I A; 3GRX A; 12GS A; 3FYG A; 3GYK A; 4J2F A; 3L9S A; 2JU5 A; 3W8J A; 1RQM A; 1S3D A; 1X9S B; 2H8L A; 3TGZ A; 3HHV A; 5HFG A; 3TJK A; 1ERT A; 3H79 A; 4HDE A; 4KCE A; 5CO3 A; 4MF6 A; 1AC1 A; 3C71 A; 5G30 A; 4RQX A; 3FKF A; 5GAN D; 3DXB A; 2O7K A; 1O73 A; 1BX9 A; 4MMM A; 5ECI B; 5H5S A; 4LL4 B; 4BVX B; 3LGC A; 3IC4 A; 1K0D A; 4ECB A; 1T4Z A; 3M9J A; 1OAZ A; 2YNX A; 3K8N A; 1DE1 A; 3CSI A; 1A8Y A; 1GUH A; 3EE2 A; 4HI7 A; 2JZS A; 2X49 A; 4I5Q A; 5JWQ B; 1TRV A; 4K6X A; 4POB A; 1PMT A; 2C8U A; 4A5P A; 3H4K A; 1PQN A; 2YP6 A; 3DVX A; 3FMW A; 3TRX A; 4NHW A; 4N0V A; 2X8G A; 1EP7 A; 3FZ9 A; 3ME8 A; 1A0R P; 2AYT A; 1V57 A; 3HXS A; 3O3T A; 5FHI A; 1PN0 A; 3J7Y k; 5IOW A; 3IK7 A; 3KH9 A; 1PKW A; 4WBJ A; 5E59 A; 2JZR A; 1GTA A; 3Q6O A; 5KOX A; 1BED A; 3KCM A; 2C3Q A; 4KDU A; 1SK1 A; 3QR6 A; 1YDK A; 1QQ2 A; 1G6W A; 3P90 A; 2WZ9 A; 5J5N A; 2GDR A; 3RHB A; 4KB3 A; 1YF0 A; 3IC8 A; 1AIU A; 3ZRD A; 3QAV A; 3CBU A; 2H6X A; 3A2X A; 3LXZ A; 2YOI A; 1XWA A; 3CMI A; 2WFC A; 2GT6 A; 3MIX A; 5B7C A; 1N8J A; 5ECM B; 4G10 A; 1XVW A; 1K0N A; 2KHP A; 1PGT A; 2NBS A; 1WWJ A; 4OFM A; 2C0G A; 2GVP A; 3U5R E; 3GFK A; 6GSS A; 3D6I A; 5HR1 A; 3ZMK A; 3ZFL A; 1SJ6 A; 4GRF A; 5EPF A; 1GH2 A; 2IME A; 1OKD A; 2RUE A; 3HZ8 A; 5IQY A; 1X9M B; 13GS A; 2WCI A; 1OVN A; 4CY6 A; 3ZIJ A; 1Z9H A; 1TRW A; 1Q4J A; 1R26 A; 1MDI A; 3MSZ A; 1G6Y A; 3P2A A; 5AN1 A; 5DAL B; 2CX4 A; 3FEU A; 4TXO B; 1QFN A; 4Q5R A; 3GMF A; 4JZQ A; 3QAW A; 3ZVJ A; 4WXT A; 3VI5 A; 2LJK A; 2YWO A; 4YH2 A; 3TRP A; 2GZP A; 1WRY A; 2L4Q A; 2R0P A; 4KCA A; 1YY7 A; 4WR4 A; 4NPB A; 2VD1 A; 5CRH A; 2I1U A; 2WRT A; 1TP9 A; 4IP6 A; 2A2S A; 5D9T A; 3W6G A; 4RUV A; 1GLQ A; 2YPM A; 3C73 A; 1LBK A; 2LRC A; 1ACV A; 3VFI A; 1U87 A; 2XPE A; 2L59 A; 3FZ4 A; 4MJC A; 3DGQ A; 1XVQ A; 1G7E A; 3GX0 A; 1ZGN A; 2QA2 A; 5A4U A; 4MAB A; 2K8V A; 4XS4 B; 3DRN A; 1PN9 A; 4WEY A; 4PUF C; 3SWL A; 4EF0 A; 3OR5 A; 4ZBA A; 14GS A; 1YKA A; 2B1L A; 1SK2 A; 2PUK C; 3L0H A; 2QKE A; 4IVF A; 2LQO A; 2PU9 C; 3EPT A; 8GSS A; 1DBY A; 2HRA A; 1TOF A; 1Z5Y E; 1ZYP A; 2DKH A; 5D73 A; 3GX8 A; 3G7I A; 3QPM A; 1SL1 B; 1XIY A; 4ZIJ A; 4TRX A; 2IWT A; 19GS A; 3UOM A; 1TTZ A; 3KIJ A; 2NPB A; 4IS0 A; 3KM6 A; 4MCU A; 2HRK A; 2GSR A; 4I2T A; 1ZYQ B; 2YJ7 A; 2V2G A; 4O5Q A; 1UVZ A; 4PNG A; 1FOH A; 2MMN A; 2GZZ A; 3G7Y A; 1M2A A; 1EWX A; 1GP1 A; 1E2Y A; 2IN3 A; 4PXO A; 2HSH A; 4K7I A; 3D4M A; 5J41 A; 3EYT A; 1YQ1 A; 4XS4 A; 2H72 A; 2K6V A; 4O5R A; 2VOC A; 4O32 A; 1OC3 A; 4F9Z A; 5JCG A; 3CSJ A; 2HZF A; 1DSB A; 1SD8 A; 2FWH A; 2J23 A; 3AY8 A; 3WT1 A; 4AF2 A; 5ECO B; 2GT5 A; 3ZFB A; 3I69 A; 4K0G A; 3GKX A; 1EEM A; 2Z9S A; 3N5O A; 1PA3 A; 4MH2 A; 4N10 A; 4BL7 B; 1XW5 A; 1MEK A; 2EIQ A; 4KSO A; 1GRX A; 3F4R A; 4XCS A; 1M3I A; 1Z7P A; 3I43 A; 2EC4 A; 3M1G A; 1K3Y A; 1ERW A; 2PMT A; 3HA9 A; 2FWF A; 4GQF A; 1FVJ A; 2HSM A; 5IM9 A; 2JSZ A; 4OD7 A; 1GTI A; 1SL0 B; 5DVB A; 4ZBD A; 3HKR A; 2VO4 A; 3GH6 A; 2A2R A; 4V1A p; 3QMX A; 4AJ7 A; 2YV7 A; 3IRA A; 3UL3 A; 1A23 A; 3WGD A; 4ZIL A; 2IMF A; 2RII A; 2P5R A; 1JLV A; 5LD0 A; 1V9W A; 4EIQ A; 4PQ1 A; 3CRU A; 5EVO A; 2R0C A; 3H1N A; 1K3L A; 1GSQ A; 3GNJ A; 2YWN A; 3HZ4 A; 1XFL A; 1QGV A; 4Q5Q A; 1AW9 A; 2C0E A; 3IOS A; 2X8H A; 4WBR D; 1PKZ A; 3E0U A; 4K2D A; 2HRN A; 1JZD A; 4QL9 A; 2B3S A; 3MWH A; 3G7J A; 2C1Y A; 1PRX A; 1GTB A; 3HVX A; 4KA0 A; 4H86 A; 3IK9 A; 3F6D A; 3IA1 A; 3BBY A; 4BL7 A; 5ECQ B; 3C7M A; 3A2W A; 2DJ0 A; 4MJE A; 1KTE A; 4AJ8 A; 5ECH B; 2HT9 A; 2HFD A; 3GV1 A; 5AIV A; 4WF4 A; 2WJU A; 3ED3 A; 1MD4 A; 1X5E A; 2LRT A; 1VF4 A; 2H66 A; 3MAK A; 5ELG A; 5D9W A; 3PGT A; 5EL8 A; 5IMA A; 1F37 A; 3GA4 A; 2IJY A; 3KGK A; 4YQV A; 2VCQ A; 1SYX A; 10GS A; 3L9U A; 5C04 A; 5HFK A; 3NIV A; 4HOJ A; 1S3C A; 4ECC A; 1HNC A; 2BMX A; 1X5D A; 3QFA C; 2H1B A; 2H73 A; 4JU5 A; 4DVC A; 2GZY A; 2V41 A; 2VCW A; 1M2B A; 1T00 A; 4TVE A; 4GCI A; 1QXH A; 3VK9 A; 4MA9 A; 4JR6 A; 5DAK A; 3TKQ A; 5GST A; 5ECL B; 1QMV A; 2YWM A; 5IO2 A; 3CRT A; 2YCD A; 2EIO A; 4K2X A; 2R6K A; 1JFU A; 2CT6 A; 1XXU A; 2CAQ A; 2VL3 A; 1I9D A; 4MZB A; 2DLX A; 1YEX A; 1EGR A; 2A2P A; 4ZBB A; 2JZT A; 2GGT A; 4GF0 A; 2FGX A; 1NHO A; 2OAD A; 2MYG A; 4MJA A; 5L71 A; 1B9Y C; 4V2M A; 1ZYN A; 1PSQ A; 1YKC A; 1HQO A; 3UVH A; 2I81 A; 3ZML A; 5B8B A; 20GS A; 2AUV A; 1YZX A; 2DIY A; 2YZU A; 4GSS A; 3W8S A; 2ON5 A; 4G9H A; 1ABA A; 3PIN A; 2E0Q A; 2IIY A; 1E6B A; 3I9V 2; 1B4P A; 4NV2 A; 3D21 A; 3PPU A; 5ENU A; 1TXX A; 1GSY A; 3DML A; 5F8B A; 3CXG A; 1YJ6 A; 3GHA A; 5CAX A; 5AIS A; 1B9X C; 4JR4 A; 4Q5N A; 1QUW A; 2CX3 A; 3TKS A; 3FW2 A; 5G31 A; 1FOV A; 7GSS A; 1TJD A; 2VCT A; 1NSW A; 1FW1 A; 2IMK A; 5ABR A; 2X8C A; 1XBS A; 3C8E A; 3EIN A; 1UA5 A; 1YEP A; 1K0B A; 5JCW A; 1RK4 A; 3KTL A; 3NZN A; 3GUR A; 3ZYW A; 4ZB9 A; 3GH9 A; 3H93 A; 1AQX A; 2BTO T; 3WGE A; 1EOG A; 2LST A; 3QOU A; 3LSZ A; 4ACS A; 2VIM A; 3GKM A; 1SL2 B; 1BJX A; 4L0U A; 4YKF A; 2XBQ A; 2RM6 A; 3L9V A; 3ERF A; 1OE7 A; 2VAF A; 1TW9 A; 4MH3 A; 2B5E A; 5CRG A; 4FO5 A; 3UIW A; 2GQM A; 3QD9 A; 4YQM A; 1A0F A; 2HNL A; 1C72 A; 5G5F A; 2FWE A; 1MDK A; 1B8X A; 4DSR A; 5CYY A; 1PL2 A; 2YV9 A; 1QK8 A; 2F51 A; 5DQY A; 2H0I A; 1MDJ A; 5G1K A; 3J7Y b; 4LMW A; 3IDV A; 3RDW A; 2H1G A; 3I6A A; 5IPH A; 5GZZ B; 4OWY A; 2XC2 A; 3LXT A; 3DKS A; 1SKW B; 3UJ1 A; 4ULX A; 4O5U A; 3TRQ A; 5J9C A; 1T7P B; 3D4T A; 5KN3 A; 4V2N A; 5DDL A; 4TKY A; 3HD5 A; 4HQZ A; 2K18 A; 4FIW A; 1OC9 B; 1GUL A; 4K0N A; 4POK A; 2KP2 A; 3FR6 A; 5IIZ A; 1M99 A; 4I6X A; 4MPF A; 2OA7 A; 1WE0 A; 4FQU A; 4O7H A; 2VUP A; 2P0G A; 2AHE A; 3APO A; 4X0X A; 2X99 A; 4BA7 A; 1EP8 A; 4WR5 A; 1THX A; 1OYJ A; 1JHB A; 2G2Q A; 3ERW A; 1A2L A; 3F3Q A; 3VWX A; 3QDN A; 2V1M A; 3WGX A; 4ICY A; 1H75 A; 2L6C A; 4TR4 A; 4ZL7 A; 4G2E A; 4ZL9 A; 3A2V A; 4IN0 A; 4K7N A; 3KMO A; 3LYP A; 1Z7R A; 3RHC A; 2CVK A; 2H0H A; 5IO0 A; 1PD2 1; 2H71 A; 2LJA A; 2P5Q A; 4ZL8 A; 1AUC A; 4IJ3 A; 1VF1 A; 2GS3 A; 3IHQ A; 5D8I A; 2B7J A; 4YAP A; 3FZA A; 1DE2 A; 4J56 E; 4HQS A; 5D9X A; 1URM A; 4E8E A; 4I8B A; 4ZB6 A; 1OC9 A; 3WD6 A; 3F9U A; 3ZTL A; 2NVL A; 3LW9 A; 2LUS A; 4F03 A; 1T8E B; 3S9F A; 3VI7 A; 3UAP A; 1EGO A; 5G2Z A; 3DVW A; 3GUS A; 1VF2 A; 3A3T A; 2TIR A; 22GS A; 4ID0 A; 4NMU A; 3GL3 A; 5E4W A; 2H30 A; 4KND A; 2VL2 A; 5CRD A; 3CYN A; 2GLR A; 2VM2 A; 2VM1 A; 4POL A; 5CNW A; 5D96 A; 3HJM A; 1PX6 A; 3MNG A; 4F2I A; 3KXO A; 1BYE A; 2E2M A; 1KEB A; 1HNA A; 4YKG A; 1YF1 A; 5IMF A; 1XWC A; 4NV5 A; 1CQH A; 4TR1 B; 3FR9 A; 16GS A; 2DBC A; 17GS A; 2DKI A; 2H6Y A; 3WYW A; 5DJM A; 4F82 A; 4WET A; 2DJ1 A; 4K7O A; 3U6V A; 2PGT A; 2KUC A; 2FD3 A; 3QFB C; 3D0Z A; 2DJK A; 4WKW A; 3TKS E; 1KNG A; 2CA8 A; 4KX4 A; 2WS2 A; 2FWG A; 4EDY A; 1O81 A; 1GUM A; 5HFI A; 1IYI A; 4YQU A; 3TJG A; 2AV4 A; 2DSA A; 2ZNM A; 4MZC A; 3DYR A; 5JWO B; 1HD2 A; 1KBN A; 2A4V A; 1GNE A; 4EC0 A; 1ZCP A; 1GUK A; 2DMM A; 5J9B A; 1V40 A; 3QAG A; 3ZRE A; 1F3A A; 1JZW A; 1FVK A; 3UAR A; 1ERV A; 1HNB A; 1AQV A; 3D5J A; 1PL1 A; 3GKN A; 4MNN A; 3F6F A; 4HU9 A; 5IMD A; 2H76 A; 4ZB8 A; 2JL4 A; 4KUN A; 2ZUP A; 2IMI A; 4TR1 A; 1IYH A; 4NAX A; 1TI1 A; 4OCF A; 4HEA 2; 4L8E A; 4KDY A; 3DEX A; 2KOK A; 3EMX A; 2RM5 A; 4CDO A; 4GWR A; 4OFT A; 5KN2 A; 1AXD A; 3ZIV A; 3ME7 A; 5ID2 A; 3BJ5 A; 3DD3 A; 2B5Y A; 3HDC A; 4HJ2 A; 1EV9 A; 4D73 B; 2CVD A; 3GSS A; 2PN8 A; 2X4A A; 1U3I A; 4MF7 A; 4ML1 A; 4RI6 A; 4HU7 A; 3TOT A; 6GSW A; 4F0B A; 3BCK A; 4FYU A; 2H0G A; 2XHF A; 4XHM A; 5DAK B; 3ZZX A; 3VPT A; 2QC7 A; 6GST A; 4K5S A; 4Z2R A; 1VGL A; 2PVO C; 3F3R A; 4IQ1 A; 2V6O A; 1K0A A; 2GST A; 2H6Z A; 2VCX A; 1HYU A; 4IHU A; 2FCH A; 1XWK A; 4OO5 A; 5G5E A; 2LRN A; 4MK3 A; 2VL9 A; 4K5R A; 1XOA A; 4QL7 A; 1JZO A; 4BWS A; 4EO3 A; 2LS5 A; 4XS6 A; 2VL2 C; 1WOU A; 3GIX A; 1OC8 A; 3KEB A; 2XBI A; 1X0R A; 2DIZ A; 1SJZ A; 2NDO A; 4HZ4 A; 2AJQ B; 1V98 A; 4FYC A; 5COH A; 2WGR A; 1B48 A; 3IHG A; 4DEJ A; 1FHE A; 4D73 A; 5HQP A; 4IJI A; 5ECS A; 1B4Q A; 3CTF A; 3LQ7 A; 4XS1 A; 1GSS A; 2ZCT A; 4ECI A; 5ECN B; 4KSM A; 3IXR A; 4WF5 A; 2I9H A; 4BVY B; 1XW9 A; 5IMV A; 2V6K A; 2YN1 A; 3LFL A; 2CV4 A; 1ERU A; 2N5A A; 3FHK A; 1GSE A; 3GTU A; 1O7U A; 1TK8 B; 4L0W A; 3TB2 A; 1MTC A; 2HLS A; 2CZ3 A; 4HZ2 A; 5KN0 A; 2BJX A; 4LA1 A; 1NHY A; 3L4N A; 3TCO A; 2MMZ A; 4IQA A; 3IBH A; 1LJR A; 1FB6 A; 3LOR A; 3US3 A; 1T4Y A; 2C0D A; 4JRR A; 3LWA A; 3UMA A; 2O87 A; 1Q98 A; 4HS1 A; 4PQH A; 1F6M C; 1TRU A; 2IL3 A; 4RQR A; 2OKA A; 1R5A A; 2O8V B; 5IOX A; 3RPP A; 3G9B A; 1NW2 A; 1EOH A; 1X5C A; 4Q5F A; 1ST9 A; 2LTK A; 2EIR A; 2C4J A; 4OFN A; 2MBS A; 5CRE A; 2GSQ A; 4EKZ A; 3RBT A; 3HVN A; 1UN2 A; 4IBP A; 4Z2U A; 4TOP A; 4TR0 A; 4DSS B; 4LLR A; 2A4H A; 2IFQ A; 3F8U A; 1SKS B; 1TI3 A; 1GTU A; 3UEM A; 4BVY A; 2GSS A; 3DWV A; 3TUE A; 2V32 A; 3UBL A; 1GSF A; 3ISO A; 5B8A A; 3LJR A; 1G0T A; 1TK5 B; 4L5L A; 3HCZ A; 2L4C A; 2AB6 A; 3R3E A; 3LEF A; 4XRA A; 2P31 A; 2OE0 A; 2WDU A; 2DML A; 4RI7 A; 5GSS A; 2FA8 A; 5BRT A; 3M8N A; 3GKK A; 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