1XGTC

Structure for antibody hyhel-63 y33l mutant complexed with hen egg lysozyme
Total Genus 49
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
49
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDGNGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Immune system
source organism Mus musculus
publication title Magnitude of the hydrophobic effect at central versus peripheral sites in protein-protein interfaces
pubmed doi rcsb
molecule keywords antibody kappa light chain
total genus 49
structure length 129
sequence length 129
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2004-09-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
C PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1xgtC00
3WW5A 1NQIA 3ATNA 4NHTA 3ATOA 3EMSA 1LZYA 2EQLA 1IP5A 2Z37A 1BWIA 4W96A 4QY9A 4LT2A 3WVYA 5L9JA 4WL7A 3N9EA 194LA 1IP7A 1CNSA 1D0KA 1GE0A 1OUCA 3CT5A 3LZ2A 1G7LC 4XJDA 4NFVA 1LHHA 4XJIA 1B5UA 1IP3A 4WM5A 3TXHA 1NDMC 3W3EA 2H9KA 1D0LA 3QY4A 2WARA 1LZ9A 1LJFA 1MELL 3WU7A 3B72A 4NGKA 1LZEA 4G49A 4H1PA 1LZGA 4E3UA 2IHLA 3AB6A 4II8A 1LZ6A 1GBZA 1A2YC 1NHEA 3IJVA 4LZTA 1B7OA 2YBJA 3WXUA 8LYZA 3BKVA 3AGHA 1LSFA 3AW6A 2IFFY 1LSZA 2BPUA 5B07A 2D4JA 4CHXA 1OUHA 1LJGA 2CDSA 1GFHA 3A92A 3W6AA 4HV1A 4GN3A 1LMPA 3WUNA 3A3QA 1REXA 3A6CY 4NGJA 1YAOA 4NGVA 2LYOA 2MEGA 1IY4A 4L41A 2MECA 3A67Y 4XJHA 5LA8A 1LZ4A 4YM8A 1LSPA 4DDCA 1QTEA 4NIJA 1JEFA 3LYZA 5HNLA 1LMOA 1WQQA 1UICA 2MEDA 1AT6A 4N5RA 2A7DA 1LZRA 1B0DA 1WQNA 3TXBA 1FLYA 4WM3A 3LYMA 1RI8B 1B5WA 4NGLA 1EQ5A 3AJNA 3BKHA 3HBHA 2FYDA 1P2CC 1CKGA 4TX7A 4DD3A 4H9EA 2XTHA 1UCOA 4UWNA 1MLCE 3K3TA 1VDQA 1GE3A 5KXSA 5KXTA 3M3UA 1IY3A 2NWDX 3N9AA 4ETAA 3VWOA 2Z2EA 4FJRA 5F14A 3A6BY 4J7VA 1IIZA 5APEA 1GB9A 1LSBA 3TXFA 1LYSA 1YQVY 3AW7A 4HTKA 6LYTA 4TSBA 2XBSA 2AUBA 4B4IA 1GFGA 1CJ9A 4GCEA 2DQFC 1GFUA 4WM2A 3TXEA 1JJ1A 1F6SA 5I54A 5LYMA 1CKHA 2HU3A 1GAZA 1OP9B 1CKCA 1WQMA 4LT3A 3W6FA 4C3WA 1KIPC 5I4WA 2C8PA 1LJEA 5LA5A 3CT1A 1F6RA 2BQIA 3LZTA 3P66A 2H9JA 1IWYA 1GFKA 2HUBA 5I53A 5LYZA 4H91A 5LYTA 2Z18A 1A4VA 1DXJA 1YKYX 4C5FA 1YAMA 1GD6A 1LPIA 2F4GA 1HNLA 2Z39A 1GB5A 2C8OA 1GE1A 1RFPA 1LYOA 4U3XB 1JUGA 1FN5A 3MGWA 4ET8A 5LVGA 4NHQA 4MSTA 4B4EA 1F0WA 3HFMY 5E4PA 1BGIA 2EIZC 9LYZA 1GB6A 1UUZC 1OUIA 4TWSA 4NGIA 2DQEY 1LZBA 1FLQA 1CKDA 1AT5A 2CGIA 3WU9A 2CJLA 1AZFA 1HEPA 2BQCA 4GCFA 1GBOA 3TMWA 4KPMA 5HLLA 1ZVHL 1KIRC 4I0CA 5LVIA 1NF5A 2DQIY 5B59A 3WULA 4LYZA 5HMJA 4EOFA 5KXXA 3P4ZA 5KXRA 1J1PY 4B0DA 1TDYA 208LA 2A7FA 4WOAA 4O34A 5APFA 1B7PA 4XJFA 1LHIA 4DD0A 3A3RX 1UIAA 2BQDA 1IWTA 1XGUC 2HEDA 5DM9A 1LYZA 1D6PA 1RCMA 5D5CA 1UBZA 1TAYA 2LZTA 3W6DA 1IP6A 2VB1A 4WG7A 5IHGA 1HEWA 2G4PA 3A95A 3CB7A 5KXWA 1GEVA 1VDPA 1I56A 4NWEA 4RW2A 5KXYA 1OUJA 1UC0A 5KKJA 1C08C 2BQAA 4ANRA 4KL7A 2BQJA 3EXDA 4Z98A 207LA 4GCBA 3LN2A 4NHSA 5APDA 1KIQC 2BQOA 1FBIX 1GAYA 1LMTA 1V7TA 4G9SA 1LOZA 3TXIA 1GHLA 1H87A 2MEFA 3CSQA 4H92A 5AMYA 4WM4A 1B7LA 1RE2A 1D9UA 3B6LA 4QDNA 1GFEA 1BWJA 2HECA 4A7DA 1LJNA 2F30A 4NEBA 1GDWA 1BB4A 2BQGA 4BADA 1HSXA 2ZIJA 4LYTA 1YKZX 4GLVA 4MCKA 1ZMYL 4WLDA 4ET9A 4XENA 1I20A 4LYOA 4QGZA 2MEBA 4PHIA 1XSFA 5JENB 1UIHA 2G4QA 1NMMA 4ZEEA 4BAPA 1B5ZA 4XYYA 4D9ZA 1QSAA 2F4AA 132LA 1LJJA 1B5YA 1CJ7A 4Z41A 1YL1X 5DN4A 5HQ1A 1IORA 4ZFPA 5C6LA 3GXKA 1GB3A 1BB3A 1JJ0A 2W1YA 1LZ8A 2Y8PA 2B5ZA 2YVBA 4HPIA 1ZV5L 2W1XA 3EBAB 1WTMA 4WO6A 1LJ4A 5KXNA 2LYMA 4GCDA 4WG1A 5I4XA 4OOOA 1GFRA 1UIDA 3FE0A 4B4JA 2ZILA 5FSTA 1H6MA 4HP0A 4NY5A 3TXJA 1LMCA 3LHMA 3ULRA 3B0OA 3N9CA 4GN5C 3HBDA 1IP4A 1LMAA 4N1EI 3RW8A 1LMNA 2I26L 4HTNA 4M4OA 4H94A 4NGWA 1XGRC 2BQFA 133LA 1GEZA 3AZ7A 2F2NA 3CSZA 1GXV2 2YDGA 1DKJA 1HMLA 2GV0A 2RSCA 4DD9A 1LKRA 1LHLA 5F16A 3HBEX 1IWZA 4CJ2A 2DQGY 1XGTC 4YOPA 5ILFA 1JWRA 4N9RA 3OJPA 1WVVA 1GXXA 1WQOA 1IX0A 1GFAA 5I5QA 1GB8A 3GXRA 5LIOA 3P64A 1IWUA 1LZTA 1J1OY 1IOSA 1DI3A 1LHJA 1DI4A 1G7JC 1G7IC 1QTKA 1HEOA 4OWBA 1GFTA 1LSEA 4J0LA 1KXXA 3LYOA 1REYA 3P65A 4P2EA 3LYTA 5DN5A 2FBDA 1FKQA 1LJHA 1YANA 3FI7A 3T6UA 1C43A 1LJIA 4OWCA 3ZVQB 4BS7A 1DPXA 1SQ2L 1IC5Y 1PZYA 2BQMA 4DC4A 3CT0A 3W6EA 1TCYA 4KT3A 1IC4Y 2ZYPA 2W1MA 4DYGA 2FBBA 1IR7A 5KXLA 1BQLY 1C45A 1GF3A 1QUSA 2YBIA 4N0JA 2DQJY 1QSWA 1IC7Y 3AGIA 4HJZA 3WPLA 3WXTA 2Z19A 3F6ZA 1YIKA 1JKAA 1JKDA 1HFXA 4UWUA 4RLMA 6LYZA 1JSEA 2ZQ3A 1BWHA 1JPOA 2FYCA 5LVKA 1UACY 1LZAA 4LYBA 1NBYC 1C7PA 1EQ4A 1GE4A 2H5ZA 1B7QA 2HEAA 5A3EA 5T3FA 4YEOA 1OUAA 1I1ZA 3WYHA 1LJ3A 1QIOA 1G7HC 4FDYA 2HU1A 3B0KA 3WVXA 1Z55A 4CFPA 1D0MA 1GBYA 5DL9A 3TXDA 4BAFA 1TEWA 2HTXA 1XGQC 1GF7A 1HEQA 2DKVA 2CWIA 4PGJB 4PRQA 3W6CA 4CGEA 3ZEKA 154LA 4XN6A 2BQNA 1T6VL 4G4HA 1LZNA 4QEQA 5E9RA 1DI5A 3SP3A 5FCPA 5IDDA 5K7OA 4XJBA 4NGZA 1HERA 1OUEA 3D9AC 3AZ5A 1LZ5A 4LGKA 5II3A 1PS5A 4RW1A 5KKIA 3A8ZA 5HMVA 4B1AA 1B5XA 1INUA 1XEKA 2ZNXY 4H9IA 4IATA 4EMNA 1GBWA 4H9BA 4J1BA 1LZSA 4OWAA 3A91A 1QQYA 1GF9A 4XADA 1WTNA 1REZA 3A96A 4WL6A 134LA 2YBHA 2XJWA 1YL0X 1YROA 4WMGA 1V7SA 1EL1A 3A34A 1KXWA 2DQCY 2ZNWY 4HPEA 5IELA 4N1CC 5F9UA 1NBZC 2EKSC 5C6JA 4LT0A 4HV2A 1T3PA 4MR1A 4DDBA 3RZ4A 4ML7A 4XJGA 1GF4A 1GBSA 3A90A 5KY1A 2LZ2A 3IJUA 4YEMA 1YAQA 1CJ8A 4HJYA 1DQJC 2MEAA 1LJKA 4NG1A 1VDTA 2MEHA 3QE8A 1VEDA 5KXOA 4HJVA 4PPOA 5B06A 1B2KA 4W94A 1VAUA 1B7SA 1HF4A 1LSYA 2D91A 2EPEA 2LYZA 4TUNA 4KXIA 3TMXA 1LHKA 1RJCB 3TMVA 4YF2A 1LSGA 5LAGA 4IASA 1LSAA 4OWHA 1NDGC 4HTQA 1IR9A 4H90A 2BQLA 4G4CA 5L3IA 4OWEA 4RLNA 5FELA 2ZQ4A 1LKSA 2DQDY 1B9OA 1OUBA 1JKBA 1LHMA 1QDTA 1LMQA 4PJ2C 2Z38A 1HHLA 3AGGG 3WUMA 4H9AA 3B0IA 3M18B 4WLXA 4DD1A 4ETCA 1W6ZA 1HSWA 1C46A 1GE2A 2Z12A 3A93A 1BB6A 3CQLA 3G3BB 5FDJA 3D3DA 5D5FA 4R0FA 4TTDA 4OW1A 4J1AA 1DPWA 2BLYA 4LT1A 4B49A 5DLAA 1HFYA 5F9XA 1XGPC 1DZBX 2BQBA 5B1FA 1XEIA 4CFOA 4WLYA 4H9HA 5C6IA 1GPQC 3WU8A 5FEKA 1UIGA 1GF5A 1JTOL 1IWVA 1JTPL 1GF8A 2X0AA 2YBLA 2YBNA 1JKCA 1IOCA 4I8SA 5LAFA 1B7MA 5A3ZA 1IWXA 2W1LA 3AYQA 3IWRA 1WVUA 1UIEA 3OK0A 5KXPA 1NKHA 5LVJA 3E3DA 2D4KA 1FDLY 1BB5A 3TXKA 3W6BA 1AM7A 1IEEA 1LAAA 1IP2A 1VFBC 1YILA 3WL2A 4IJ4A 3WUAA 4NSGA 1F10A 4R6CA 3EO5A 1IP1A 4H8ZA 1LSDA 4X3BA 4DD2A 4YENA 4H9CA 3P68A 5KJ9A 1JHLA 4LFPA 4UWVA 5J7CA 1IOTA 3WH1A 2BLXA 4ETDA 4Z46A 1YKXX 153LA 4DD7A 3ZVQA 2HEEA 1IR8A 2MEEA 4NSIA 4LFXA 1GB7A 3RU5A 2G4NA 2LHMA 1BHZA 5KXKA 4GLAA 1IWWA 5FHWA 1LZ1A 4NHIA 4OOTA 3WPKA 4ETEA 1E8LA 1GWDA 1GF0A 1AKIA 3J6KA 1WQRA 1OUGA 3TMUA 5KXMA 1OQMA 2ZYCA 2DBTA 2XBRA 4LYMA 4NWHA 1GB2A 2MEIA 3WMKA 1IVMA 4N8ZA 4GCCA 4HSFA 5F81A 1FLWA 1LSCA 3T36A 1CJ6A 1VDSA 1XEJA 1LZCA 1ALCA 5L3HA 1JITA 1QDRA 1B7NA 1B7RA 1UIFA 1OUDA 1D6QA 4H8XA 4H8YA 4NGOA 4Z3MA 1GFJA 4WLTA 1HC0A 4WM1A 5HNCA 4DWXA 2DQHY 1IO5A 3G3AB 1DKKA 5KXZA 3QNGA 1XFPL 2YSSC 1W08A 1QUTA 1ZVYB 2ZWBA 1GBXA 3A94A 5B05A 1JISA 1YAPA 1LSNA 2D4IA 1LYYA 1JSFA 4DT3A 1EQEA 4M6DA 1HENA 5I4YA 1LTMA 4NSHA 3RNXA 5M1YA 5B1GA 4ETBA 4RDSA 3AZ6A 193LA 1HFZA 1BVKC 1FLUA 2HEFA 5APCA 2Z2FA 4AXTA 4G4BA 1LZDA 1SLYA 1GF6A 3J4GA 2YBMA 1BVXA 4LYCA 4TSCA 1VATA 4H9FA 1UA6Y 1JIYA 1GDXA 2Q0MX 1HMKA 1IOQA 1UIBA 2BAAA 1GB0A 1NWGA 4DDAA 5LINA 1LCNA 2I25L 2PC2A 3CSRA 135LA 1JTTL 1O23A 4H93A 2ZIKA 4NG8A 5LVHA 2I6ZA 1G7MC 1N4FA 1REMA 5ILCA 4PRUA 4WM6A 2D6BA 2N5ZA 1BB7A 3KAMA 1B5VA 1KXYA 2BQEA 5EBHA 2HEBA 2BQHA 1WQPA 3TXGA 1JJ3A 1LSMA 3AZ4A 4AGAA 5LXWA 1TBYA 3RT5X 7LYZA 1C10A 4NHPA 1FKVA 4NGYA 4NSJA 2BQKA 4GN4A 4WO9A 1GFVA 3WW6A 2DQAA 3WPJA 4ZIXA 1J1XY 1CKFA 1HEMA 1OUFA 1HELA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1NQIA 3ATNA 3ATOA 3EMSA 4QY9A 3SN6R 3WVYA 194LA 1GE0A 238LA 1G7LC 1D3JA 4WM5A 1L24A 1SWZA 2RAYX 3WU7A 3B72A 1LZEA 4G49A 4H1PA 3AB6A 1LZ6A 3WXUA 1A2YC 3IJVA 1B7OA 1L41A 3HU8A 3AGHA 1LSFA 5B07A 1LSZA 2D4JA 1LJGA 2CDSA 1GFHA 3W6AA 4HV1A 1P2LA 1REXA 3A6CY 1YAOA 2LYOA 1IY4A 4ARPA 3GUKA 156LA 262LA 5HNLA 4N5RA 2A7DA 1G0LA 4NGLA 1DYDA 1CKGA 4TX7A 1P6YA 4UWNA 1VDQA 255LA 3VWOA 3G3VA 3A6BY 5APEA 197LA 3TXFA 1LYSA 3AW7A 4HTKA 2XBSA 1GFGA 3W6FA 1GAZA 1QT4A 1WQMA 4C3WA 1KIPC 2CUUA 5LA5A 3P66A 1GFKA 5I53A 5LYZA 2Z18A 1C64A 1GD6A 1DYGA 2F4GA 4U3XB 1FN5A 4I7RA 5LVGA 1L72A 4B4EA 2EIZC 9LYZA 4NGIA 1C66A 1FLQA 1CKDA 1HEPA 4LDEA 5HLLA 123LA 1KIRC 4ARQA 4LYZA 1L08A 1KW7A 4EOFA 1J1PY 212LA 5APFA 1B7PA 4EKSA 3SB9A 1IWTA 2HEDA 1LYZA 1XJUA 3C80A 1P64A 1IP6A 5IHGA 1GEVA 4NWEA 1C6PA 235LA 1OUJA 1L29A 1C08C 1OVJA 4KL7A 2BQJA 4Z98A 130LA 4GCBA 4NHSA 3DN6A 160LA 113LA 3CDQA 1B7LA 3B6LA 1L52A 1LJNA 2F30A 4DQ5A 1CU2A 1CU6A 2BQGA 2ZIJA 4LYTA 1YKZX 4WLDA 5JENB 1UIHA 2G4QA 4BAPA 214LA 1QSAA 1B5YA 1CJ7A 1L76A 2O7AA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3WW5 A;  1NQI A;  3ATN A;  4NHT A;  3ATO A;  3EMS A;  1LZY A;  2EQL A;  1IP5 A;  2Z37 A;  1BWI A;  4W96 A;  4QY9 A;  4LT2 A;  3WVY A;  5L9J A;  4WL7 A;  3N9E A;  194L A;  1IP7 A;  1CNS A;  1D0K A;  1GE0 A;  1OUC A;  3CT5 A;  3LZ2 A;  1G7L C;  4XJD A;  4NFV A;  1LHH A;  4XJI A;  1B5U A;  1IP3 A;  4WM5 A;  3TXH A;  1NDM C;  3W3E A;  2H9K A;  1D0L A;  3QY4 A;  2WAR A;  1LZ9 A;  1LJF A;  1MEL L;  3WU7 A;  3B72 A;  4NGK A;  1LZE A;  4G49 A;  4H1P A;  1LZG A;  4E3U A;  2IHL A;  3AB6 A;  4II8 A;  1LZ6 A;  1GBZ A;  1A2Y C;  1NHE A;  3IJV A;  4LZT A;  1B7O A;  2YBJ A;  3WXU A;  8LYZ A;  3BKV A;  3AGH A;  1LSF A;  3AW6 A;  2IFF Y;  1LSZ A;  2BPU A;  5B07 A;  2D4J A;  4CHX A;  1OUH A;  1LJG A;  2CDS A;  1GFH A;  3A92 A;  3W6A A;  4HV1 A;  4GN3 A;  1LMP A;  3WUN A;  3A3Q A;  1REX A;  3A6C Y;  4NGJ A;  1YAO A;  4NGV A;  2LYO A;  2MEG A;  1IY4 A;  4L41 A;  2MEC A;  3A67 Y;  4XJH A;  5LA8 A;  1LZ4 A;  4YM8 A;  1LSP A;  4DDC A;  1QTE A;  4NIJ A;  1JEF A;  3LYZ A;  5HNL A;  1LMO A;  1WQQ A;  1UIC A;  2MED A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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