1XIYA

Crystal structure of plasmodium falciparum antioxidant protein (1-cys peroxiredoxin)
Total Genus 59
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
59
sequence length
180
structure length
171
Chain Sequence
MKENDLIPNVKVMIDVRNMNNNDFTSIDTHELFNNKKILLISLPGAFTPTSTKMIPGYEEEYDYFIKENNFDDIYCITNNDIYVLKSWFKSMDIKKIKYISDGNSSFTDSMNMLVDKSNFFMGMRPWRFVAIVENNILVKMFQEKDKQHNIQTDPYDISTVNNVKEFLKNN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
source organism Plasmodium falciparum
publication title Crystal structure of a novel Plasmodium falciparum 1-Cys peroxiredoxin.
pubmed doi rcsb
molecule keywords peroxiredoxin
total genus 59
structure length 171
sequence length 180
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2004-09-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF08534 Redoxin Redoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1xiyA00
5J9BA 3LSZA 3GKMA 1M9BA 2GZYA 3HZ8A 1S3CA 5IMVA 1K3OA 2GDRA 3WYWA 1VF1A 5D96A 1KBNA 2CVDA 2YWIA 4MJCA 3F0IA 1Z7PA 3D5JA 4WXTA 3LGCA 2AAWA 4IHUA 4V2LA 3U6VA 5D8IA 4L0UA 3R2QA 2OE1A 2LSTA 1F3AA 2JL4A 2OBKA 22GSA 3HD5A 3CSHA 4DEJA 3WT2A 3CYNA 1YQ1A 2FWFA 5AN1A 3TKRA 3NOFA 2HRNA 1SD9A 1GL8A 2VOCA 2FA4A 4ZB6A 2PWJA 1PMTA 1Z6MA 4F0BA 1ABAA 1NM3A 3FYGA 3M3MA 4IS0A 3ZFLA 3LYPA 17GSA 5B6NA 4K7OA 4NV2A 1HNAA 1G7EA 4G9HA 2HNLA 1O81A 2JSZA 3C1SA 3ZVJD 1GUHA 3M0FA 3GL5A 1SJZA 4PGTA 1OKTA 2V2GA 3FY7A 5IMZA 1LBKA 1O8XA 1IYHA 2K8SA 5LD0A 5A4VA 4HI7A 1ML6A 5KN3A 1GULA 6GSYA 2D2ZA 4D73A 1U3AA 8GSSA 2VM1A 5FHIA 1V58A 1GLQA 2WS2A 3EMPA 2NBSA 3VPTA 1E6BA 3MAKA 3P90A 1OC3A 1PX7A 1R5PA 3EINA 4HJ2A 4HS1A 2MMNA 3GFKA 5DVBA 2YNXA 2X99A 2PU9C 3ERGA 5IO2A 3GL3A 2LNSA 3RHBA 3RAZA 3SBCA 5C04A 2DMMA 4L5OA 4ZL9A 4FO5A 2ZCTA 2LTKA 2HYXA 18GSA 1LJRA 2KP2A 2DJ1A 2H6XA 1ZYEA 4N0VA 1EOHA 2E2GA 5KN2A 4XS1A 1SD8A 4YAPA 2F51A 2P5QA 1THXA 2PN8A 4GCIA 4WF5A 2XHFA 2PERA 1EGRA 2XPDA 4BA7A 3WD6A 3VWXA 3I43A 4L0WA 3N9JA 1GH2A 5IMFA 2MYGA 4DSSB 2IN3A 1ON4A 1DBYA 4KNDA 4XS4A 4OO4A 4I6XA 2AV4A 1WWJA 2O89A 4IW9A 3TRPA 4MZBA 1A24A 4OFNA 4MMMA 3S9FA 3ZITA 2H1GA 3DKSA 2QKEA 4ILFA 2LV3A 2R37A 5DALA 1SL2B 1ZOFA 2H8LA 1ZGNA 4N30A 2PPTA 4O32A 2IMKA 3KGKA 3FZ9A 1MTCA 2CVKA 4BL7A 4EXJA 4GRFA 4V2NA 1PSQA 2CVBA 4GLTA 4PNFA 1GNWA 5IIZA 2WJUA 4QQ7A 5ID2B 1FB6A 2M72A 3VWWA 3LEFA 1MDIA 2FHEA 1FVJA 5J9CA 4L5LA 4N10A 1UVZA 2LRNA 2GQLA 5ECKB 2H0GA 1AUCA 4F2IA 2IMDA 3HYPA 1RQMA 4F82A 3TKQA 2WRTA 1K3YA 2LQQA 5DAKB 2ZUPA 1JLVA 2YN1A 1EGOA 4RI6A 2JZRA 2BTOT 3GHAA 1OKDA 2H66A 1XOBA 3M1GA 6GSTA 4HU7A 2GSTA 1R7HA 3F9UA 2H70A 3HZ4A 2H01A 4OCFA 3FRCA 2H30A 2K8VA 5ECQB 2N5BA 3GTUA 2VCXA 2H74A 5DDLA 2GZPA 5IMAA 1YY7A 2EC4A 3MWHA 1YZXA 2V41A 2DJ2A 1G7OA 2GSSA 2MBSA 2DLXA 3TDGA 3IXRA 2DJ0A 1KNGA 4KAEA 3Q6OA 4EKZA 2QC7A 3APOA 1R4WA 3EWLA 3GN3A 3HXSA 3IAM2 2HLSA 2C3QA 1ZCPA 1KEBA 1DE1A 2NDOA 1SU9A 1T1VA 1XWKA 3DXBA 4RQRA 3L4NA 4RUVA 3F4RA 1R5AA 2VLUA 2ALBA 2WZ9A 1TP9A 1FAAA 3VURA 1JHBA 2IPAA 1DE2A 2GTUA 4JEDA 2AJQB 1M2DA 5GSTA 1K0AA 3EURA 3IPZA 3DYRA 3UMAA 2OA7A 4IQAA 2B1KA 4MJEA 2GGTA 2P5RA 2WDUA 3HJPA 3UVHA 1PL1A 3GKNA 1XW6A 1GUMA 4ZL8A 3CSIA 5HR1A 2YANA 1VF3A 3K8NA 10GSA 3C71A 2KHPA 4Q5NA 2WB9A 3UARA 5G1LA 3FZAA 2I4AA 1QGVA 2F9SA 1EV4A 1PKZA 4MP4A 3TKPA 5GAPD 2HXKA 2L5LA 1B8XA 3TJFA 3MNGA 2B5YA 4EL1A 4MA9A 4RQXA 2OADA 1Y25A 3ZIJA 3DD3A 1W4VA 4MLYA 3QD9A 1O8WA 4HZ4A 1USBA 3IV4A 3E0UA 1SKRB 5ELAA 3TJGA 4K8MA 2B5XA 2N5FA 4EE0A 1U6TA 1QXHA 2H6ZA 1O73A 3A2WA 5ECPB 2YV9A 2V32A 4XTSA 1Z5YE 3FHKA 2L59A 4MZCA 3F63A 3D4TA 3CRTA 3QCPA 2CX3A 2JU5A 1BAYA 3MDKA 2O8VB 4ZBAA 1GSEA 4NWYA 6GSWA 2F8FA 4TXOB 1WE0A 1T4ZA 2FWEA 1A0FA 3TKSE 4GTUA 1XPVA 4OCEA 2B7KA 4OFTA 2LKUA 2R2JA 2PVOC 3I69A 4MF5A 2G0FA 6GSXA 1U87A 4TR4A 5COHA 4EF0A 5J4UA 3W6GA 1NW2A 3U5RE 1FW1A 3BD2A 5JWOB 4TR3A 3APQA 2GT6A 3FR6A 5DJLA 1OE7A 3EU4A 3F3RA 1SK1A 1TK5B 2ZNMA 3ME8A 2LRCA 2IFQB 2OBIA 1GSDA 2K18A 4KE3A 4X0XA 1Z9HA 2DIZA 4K7NA 2H19A 2NTOA 3TJKA 2H71A 2L6DA 1LU4A 1WRYA 3IOSA 5FWGA 4MZWA 3EU3A 2I1UA 4L8EA 5ECRB 2C3TA 3E3EA 2VCWA 1GTBA 1EZKA 3F3QA 4JZQA 2B5EA 3KH7A 2IL3A 4XS6A 5C00A 3HJOA 4TOPA 2VIMA 4TRXA 3EMXA 1VRSD 1QFNA 1F3BA 5ECNB 1N8JA 2WFCA 3I6AA 5IOWA 2O7KA 2V6OA 3VPQA 1M2BA 5IM9A 1K3LA 2FNOA 3QAWA 1X5DA 1A23A 2OE0A 5EPFA 3EYTA 1PQNA 4DSQA 1THOA 2C3NA 5IMCA 3ZMLA 4EC0A 2H75A 3FW2A 3UBKA 4XIHA 3FK8A 2ES7A 3GUSA 1PRXA 1YKAA 2RM6A 1J9BA 1SL0B 4DVCA 4WF4A 4J56E 5G30A 2MZCA 5KEJA 2VCZA 4FH8A 2YJ7A 4OMVA 2CV4A 4LA1A 2RUEA 4NAXA 4GSTA 1SJ6A 1XWAA 4OFMA 1OC8A 3GKXA 4PQ1A 1B9YC 4GQCA 1U88A 1S3AA 3V1WA 4ZILA 1WJKA 1TI3A 5B6MA 4FYBA 3DEXA 3TRQA 2H1AA 3J7Yb 1HD2A 3DMLA 1SYRA 3FR9A 2VLVA 2R3XA 4KCAA 1AC1A 5HR2A 3L9UA 1A2JA 1ST9A 2L6CA 4KH7A 16GSA 4ZL7A 1B4QA 1AQWA 3GYKA 4OWYA 1DSBA 4MPFA 5JCWA 4POKA 1TW9A 1GTAA 12GSA 4HJMA 5HFKA 2QGVA 3PGTA 4GWRA 4QL7A 4PXOA 2YZUA 3RPNA 1M0UA 4V1Ag 3ED3A 3ZZXA 2P31A 2PBJA 1SKWB 5AIXA 2YZHA 3DRNA 5KN1A 4KGIA 1K0MA 3LFLA 4DSRA 4NV5A 3DWVA 14GSA 1YDKA 3UBLA 4FYCA 5A4WA 3D4MA 4JR4A 2C80A 2HRFA 1X9MB 1TRWA 1V57A 5ELGA 3FKFA 4WR5A 3JCML 3VI7A 5HR0A 1MD4A 3UAPA 2ON5A 1S3DA 5ECLB 2IJYA 1O7UA 2L5OA 2VL2A 4KSOA 1Y6EA 2VL3A 4D73B 1JZOA 2X8GA 3EE2A 1IYIA 3US3A 3HHVA 5J5NA 5D9TA 1GRXA 2DBCA 5D93A 3ZVJA 3TRXA 5IQYA 3KMNA 4MF6A 3KP8A 5HFIA 2XBIA 1ZMAA 1N2AA 2DJ3A 3GNJA 1XOAA 3LYKA 2FUG2 2G2QA 3HVSA 3FR3A 4POMA 5GAND 4KX4A 1XVWA 3VFIA 4TW5A 4TN8A 3OR5A 4X43A 5DJMA 1SJIA 3UL3A 5EVOA 1AQVA 3LJRA 3PH9A 2GLRA 2PUKC 4QL9A 3KJYA 2FGXA 4WETA 2M46A 3A2XA 4OD7A 5DQSA 3GV1A 2C4JA 2XBQA 3ZRDA 1T3BA 1NHOA 1A8LA 1XWBA 1O6JA 4HDEA 4J2FA 4XS4B 3GX0A 1V2AA 1PA3A 5JWRB 3WGXA 4K6XA 1B4PA 4ZIJA 4MDCA 1WP0A 1BQ7A 4JR6A 5AIVA 2K6VA 3VK9A 1YEPA 2H0HA 4V1Ap 4HZ2A 4ZB9A 4EDZA 5F05A 4LL1B 5DALB 2YJHA 2R4VA 2LRTA 1TXXA 1O85A 3FZ4A 2E2MA 2V1MA 1GP1A 3HA9A 5H5RA 9GSSA 2C0GA 3BOAA 4PUFC 2J9HA 4BVYA 3GRXA 2CA8A 4YAVA 2KP1A 4TR1A 2OE3A 4YQUA 2MBTA 2GS3A 4I2UA 2GQMA 4O7HA 3TGZA 2AUVA 1TDIA 2HZEA 2C0EA 3VWVA 4I8BA 1TI1A 1AXDA 5G5EA 2ON7A 7GSSA 1XBSA 2YWMA 5J41A 1G0TA 4K9ZA 2LQOA 1M7TA 3H8QA 1MDJA 3J7Yk 3IK9A 2R6KA 1M99A 4IP6A 3BBYA 4PNGA 3GSSA 3O76A 3GTUB 1MD3A 3HVXA 2TRXA 1XZOA 1XIYA 2K9FA 4LMVA 3F8UA 1PL2A 4Q5RA 3A5WA 4G2EA 3KTLA 1GSSA 2LJKA 5G1KA 3QDNA 1TRVA 1FO5A 3KCMA 2OACA 3GA4A 2TRCP 1TK0B 2F3MA 2IMEA 3LXZA 4JBBA 4ECBA 2O87A 1TKDB 1FB0A 4ZB8A 3N5OA 1XVQA 2DMLA 1Z7RA 3BCKA 3HDCA 1GNEA 3KEBA 3Q19A 3CTFA 2B1LA 5AISA 3ZREA 1ERTA 2JACA 2AB6A 3WGEA 4E8HA 3WT1A 4MJBA 1VF2A 5B8AA 5L71A 3C73A 4HOJA 1BJXA 2X8CA 3TKSA 2FWGA 2YP6A 3G7JA 1OC9A 1EV9A 1QQ2A 2KOKA 2RUFA 3DVWA 3QAGA 1BEDA 2XC2A 4GSNA 1NHYA 4MJAA 2B7JA 1Q98A 3GH9A 5F07A 3QFBC 1ZZYA 5ABRA 2L4QA 2GSQA 2FWHA 4HQZA 2HSHA 4MH3A 5DCHA 3H4KA 2IWTA 2BMXA 2C0DA 1FVKA 4JU5A 3W8JA 2EIOA 4F03A 2REMA 2VCTA 1TOFA 3C1RA 3ZLPA 2X64A 4LL4B 2JSYA 5LNKe 3HJMA 1H75A 4F0CA 3IHQA 1OE8A 3PINA 2WULA 5EY6A 2EIRA 1ILOA 4BPYA 3NIVA 1T8EB 5ECSA 1G6YA 4MPGA 3ZFBA 1H4OA 1YF1A 4BWSA 4K2DA 3CMIA 1TU8A 2KUCA 2I9HA 4KB3A 2H72A 3CSJA 4HQSA 1E2YA 1R26A 5KN0A 5JCUA 1JLWA 3H1NA 3SWLA 1K0NA 4IJ3A 3TOTA 13GSA 2VLTA 3BJ5A 3IC4A 3KIJA 4I2TA 5ENUA 1XWCA 3RHCA 6GSSA 3W8SA 4POLA 1JZDA 1UC7A 5INYA 4EVMA 1HNBA 4IVFA 3M9KA 5D9WA 3CXGA 4KW6A 1B48A 3HY2A 5H5QA 4F9ZA 5IPGA 3TCOA 1MDKA 5DBQA 4I5QA 3LG6A 3L9VA 1XW5A 4I97A 1HNCA 3WGDA 1K0CA 2H76A 4G10A 4CW9A 2VCQA 2E7PA 4IQ1A 1OYJA 1BYEA 1X5EA 3P2AA 2CZ2A 3GKKA 20GSA 1VF4A 11GSA 4ZBDA 2N5AA 3IAS2 1GWCA 1V40A 3O3TA 2LNTA 3D0ZA 4PURA 1HYUA 3EVIA 4GQFA 3DGQA 5ECOB 2H1BA 2I3YA 1CQHA 1YJ6A 5AGYA 4G19A 4KUNA 4FIWA 5HQPA 5F06A 4NMUA 3O6TA 1WOUA 5D9XA 1BX9A 4YH2A 1EP8A 3TOUA 3P8WA 4GXZA 3ME7A 3IA1A 3F6FA 5B8BA 1XXUA 1T7PB 1Z3EA 3RBTA 4TR0A 2LS5A 2VM2A 5CO3A 2X8HA 1URMA 4MABA 4Z7XA 2VAFA 1BG5A 3MSZA 3TKSC 1TK8B 3F4TA 2MMOA 1UA5A 3QFAC 3DVXA 3ERWA 2IMIA 4IGJA 2PVQA 2FLSA 1X5CA 4ECJA 2LEGA 1ZYQB 2KLXA 1WPIA 4IELA 2L4CA 2V6KA 2JADA 5G2ZA 3G7YA 2H1DA 1TRSA 3UJ1A 1YKCA 2JZSA 3KM6A 3APSA 2BJXA 2A2RA 1GTIA 5E59A 1Q4JA 2A4VA 2H6YA 3VWUA 4H86A 1PGTA 2MMZA 4KDXA 3IBHA 1FHEA 3KD0A 5LCZA 2HFDA 3IRAA 4OO5A 1X9WB 1KTEA 4TXVA 4RI7A 2IMFA 2F8AA 4BVXA 2GT5A 1SKSB 5B7CA 1MEKA 5IO0A 1ERVA 5J3RA 4DSSA 4K0GA 1TTZA 2VCVA 4HUAA 3VI5A 2I81A 5F0GA 5F8BA 1J08A 4PUAA 2OJLA 1YEXA 2H73A 3QPMA 4MCUA 3D22A 3G9BA 3M8NA 3NZNA 3D21A 2YPMA 6GSUA 3L0HA 1AW9A 1ACVA 4MF7A 3DIEA 3GMFA 4WKWA 4X1UA 3HVVA 3CRUA 3UVTA 3UOMA 5A5KA 4NXIA 4JRRA 3VLNA 4FYUA 3L9SA 5CRGA 1RW1A 5ID2A 5CNWA 4PQIA 3ERFA 2TIRA 1JFUA 1I9DA 1PD21 2DJJA 1GLPA 4XRAA 3GH6A 1PKWA 1ERWA 2CAIA 4IP1A 1EWXA 4XCSA 6GSVA 5DAKA 3TJJA 3ZTLA 1J0FA 4WBJA 2HI7A 1T00A 1GUKA 2QSIA 1M2AA 4IN0A 1V9WA 1SYXA 2GQKA 1VGLA 5DQYA 3C8EA 4AJ6A 3QOUA 3QAVA 2B3SA 1K0BA 1TRUA 2O85A 2IIYA 2CT6A 2FY6A 2YWNA 4HEA2 2NPBA 4E8EA 2NVLA 4N11A 3RPPA 2OKAA 2FD3A 5ECHB 3ZIVA 4XRDA 3C7MA 5CAXA 4LMWA 2MMAA 4HU9A 4AGSA 2H0IA 2RIIA 2DSAA 1OAZA 3LQ7A 1SL1B 1OVNA 4ZBBA 2YWOA 3P7XA 4N0ZA 1SENA 3ZYWA 2RM5A 4O5RA 4XHMA 2FCHA 1U3IA 4GSSA 1JZRA 2AHEA 4AJ7A 3ZMKA 1AAZA 1SK2A 4K7IA 4JE1A 2Z9SA 2CX4A 3IE3A 4J57E 1QUWA 4ECIA 1QMVA 3TUEA 3IK7A 4Q5FA 1GSFA 3KXOA 5JCGA 2CAQA 3KMOA 3A3TA 1F9MA 1SK0A 1GSQA 4ISDA 1X9SB 4EO3A 5D73A 3HKRA 5D9VA 1QK8A 3L78A 2LJRA 2HT9A 3QR6A 4PQHA 3UEMA 2A2SA 3I9V2 3H93A 3KH9A 3D6IA 4NHZA 1WMJA 2C0FA 3F4SA 3CTGA 2M80A 1TJDA 4NPBA 4ULXA 3G7IA 2YOIA 1A0RP 1XCCA 2P0GA 2GZZA 2DC5A 1EOGA 1RK4A 4TVEA 4IBPA 1I5GA 5H5SA 4AF2A 1JZWA 4V2MA 3LORA 1M9AA 4ML1A 1GSYA 1X0RA 5IPHA 1ERUA 4K0NA 2VL2C 4TR1B 4IKHA 2EIQA 3F6DA 3PR8A 3GSTA 5GSSA 2HZEB 5G31A 3EC3A 2C1YA 2VD0A 2E0QA 3RDWA 4WBRD 3ZL5A 1DUGA 2CZ3A 4TKYA 4TXOA 1G6WA 4GF0A 1AIUA 4MH2A 3Q74A 1EEJA 3KP9A 1PX6A 2DJKA 1F6MC 3ISOA 5FT3A 5EL8A 1C72A 5G5FA 5CRHA 1K0DA 5CREA 3E9JB 4KSMA 5ECMB 1GTUA 3GURA 1V98A 2XPEA 5GZZB 1AQXA 1A2MA 2VL9A 19GSA 4O92A 3IR4A 2J23A 1UN2A 3TB2A 1F2EA 5IMDA 3H79A 1W89A 4NHWA 4KDYA 5CRDA 1PN9A 4CHSA 2IFQA 4ML6A 5IOXA 2GSRA 3TJBA 2C8UA 3CBUA 1YF0A 4POBA 3A2VA 4ACSA 4P3YB 2DIYA 5CYYA 3Q18A 4BWQA 5CRWA 1OC9B 3HCZA 1WIKA 4WR4A 2PGTA 1F37A 5HFGA 1CQGA 4WEYA 1GSUA 3UIWA 5ECIB 3LWAA 4YQVA 5A4UA 2WGRA 4K1FA 4KA0A 2FA8A 2LJAA 2R5GA 1B9XC 1NSWA 4IJIA 4KCEA 2B6MA 4EDYA 4Q5QA 2JZTA 4ZXGA 2YV7A 4YQMA 3FZ5A 3KZQA 2CQ9A 1A8YA 5JWQB 1Z6NA 2GVPA 1A2LA 3AY8A 1FOVA 4KDUA 2YCDA 3FEUA 2LUSA 3IDVA 4LLRA 2HE3A 3BCIA 2VD1A 3QMXA 5CP1A 1ZL9A 1K0OA 3LXTA 5HR3A 4CDOA 3GIXA 2HSYA 1XWGA 2VO4A 1XFLA 5E4WA 3KTBA 1EP7A 2L57A 2WCIA 1HQOA 3GX8A 1T4YA 1TU7A 2AYTA 4MK3A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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