1XIYA

Crystal structure of plasmodium falciparum antioxidant protein (1-cys peroxiredoxin)
Total Genus 59
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
59
sequence length
180
structure length
171
Chain Sequence
MKENDLIPNVKVMIDVRNMNNNDFTSIDTHELFNNKKILLISLPGAFTPTSTKMIPGYEEEYDYFIKENNFDDIYCITNNDIYVLKSWFKSMDIKKIKYISDGNSSFTDSMNMLVDKSNFFMGMRPWRFVAIVENNILVKMFQEKDKQHNIQTDPYDISTVNNVKEFLKNN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Crystal structure of a novel Plasmodium falciparum 1-Cys peroxiredoxin.
pubmed doi rcsb
molecule keywords peroxiredoxin
molecule tags Oxidoreductase
source organism Plasmodium falciparum
total genus 59
structure length 171
sequence length 180
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2004-09-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF08534 Redoxin Redoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1xiyA00
1XBSA 4ZL7A 4TRXA 5A4VA 2HI7A 3BD2A 4IQAA 12GSA 3DKSA 5G5EA 1K0AA 3KZQA 2IL3A 1SK1A 3ZFLA 1O8WA 1QK8A 3GTUB 4J56E 4HS1A 2YV7A 3EWLA 2H1GA 5HFGA 1MD3A 4GSTA 1A2LA 3TJFA 2EC4A 1JLVA 1MDIA 3Q19A 2N5FA 2RUFA 1NSWA 2REMA 1GNWA 5FWGA 1VF2A 3GRXA 4I5QA 2WCIA 1T3BA 4NV2A 2YN1A 1KNGA 2JZSA 5G5FA 2K9FA 2FWFA 1C72A 5ENUA 1B48A 2XPEA 2VD0A 4ECBA 5CRWA 3IAM2 1SENA 4NWYA 2K8SA 2YV9A 3P8WA 4CHSA 3PH9A 3TRXA 1GSEA 2F8AA 3APQA 2JSZA 1EEJA 4OFMA 1NHOA 5ECMB 3R2QA 3L0HA 1AC1A 1X5DA 3HJOA 1M0UA 3TOTA 5AN1A 2IMDA 2DJ3A 4WETA 3AY8A 3APOA 1EEMA 2YJHA 4MJBA 2M72A 4PGTA 1J9BA 3ERWA 5ECQB 1WJKA 14GSA 4ECIA 2X8HA 4TR0A 2LNSA 3LQ7A 2LJRA 3NIVA 3QDNA 3H79A 1VRSD 4DVCA 2AHEA 5J3RA 3D22A 4MZCA 2FY6A 4ACSA 2G0FA 4TR1A 2PVQA 4IKHA 2F8FA 4N0VA 2C3NA 2GTUA 2C0DA 5LCZA 1U87A 3GKNA 3GH6A 4BL7A 1GNEA 2PN8A 2GQMA 3E9JB 1S3DA 3DXBA 3TOUA 3VWUA 1FO5A 3IHQA 1B4PA 1WWJA 1V9WA 3N5OA 2C3QA 2LV3A 1XWBA 4HI7A 1A24A 3C8EA 3IXRA 3RPPA 2GGTA 4ZXGA 1XVQA 2H0HA 5JCWA 1Q98A 4XCSA 1OKTA 1IYHA 2H30A 3GNJA 1WPIA 5IMDA 1GSUA 2X8CA 3GHAA 3CRTA 1FOVA 2FWHA 3W6GA 5ECKB 2QKEA 2HE3A 4I6XA 2M46A 3KEBA 2VO4A 2ALBA 3Q6OA 5H5RA 1XW5A 4MLYA 5D9WA 2YZHA 3ERGA 3N9JA 2Z9SA 2GSRA 4FYCA 2IFQA 3DEXA 1QFNA 4DSSB 4HU9A 4KCEA 3ZRDA 1T8EB 1TI1A 1G6WA 3EU4A 5IMZA 4MZBA 1O8XA 4AGSA 3TKSC 3C1RA 1PA3A 2K8VA 3TDGA 2IWTA 2CVKA 1RK4A 6GSYA 2VCWA 2PMTA 5IMCA 2RUEA 1SK0A 2HRFA 2V1MA 4MP4A 4O32A 1G6YA 2L5OA 1HNAA 4NPBA 3TKRA 4EUYA 3UARA 1SK2A 1Z7RA 1TP9A 1UVZA 1TOFA 2O85A 2C3TA 2IJYA 2YCDA 17GSA 2H1AA 2PBJA 5DQYA 1FB6A 3DRNA 3TRQA 2F9SA 4OCFA 1WIKA 2IN3A 4D73A 1WMJA 1O7UA 4EO3A 1G0TA 4GQCA 3CTFA 4GF0A 4NHWA 1GTIA 1PQNA 3MWHA 2GDRA 2B1LA 4WR5A 4LLRA 2IIYA 1X9WB 1Z9HA 4ZB8A 1PSQA 4TKYA 3Q18A 1QQ2A 4X43A 1PL2A 3GIXA 2YOIA 3HVXA 2DIYA 4IW9A 3E0UA 4Q5NA 3O6TA 4KE3A 2R2JA 4HJ2A 4HOJA 2YZUA 3IA1A 4V1Ap 2AUVA 3HZ4A 5G2ZA 2WZ9A 5JCGA 2VAFA 4KGIA 1G7EA 3LSZA 2ZCTA 1PD21 3CRUA 3FY7A 5KN2A 3KJYA 5IOXA 2C0FA 4IBPA 2P5QA 1AW9A 2AV4A 2HZEA 6GSSA 3KTLA 2FCHA 1OVNA 1XPVA 2AYTA 3ZL5A 2PU9C 1R5PA 5A5KA 1XWAA 1ERVA 3FYGA 3JCML 2H01A 6GSWA 1JZWA 3D21A 3US3A 1K0MA 4XS4A 2EIOA 1K3OA 3L9SA 3D4MA 2GSTA 1M2BA 1EOHA 2VLVA 4EXJA 4PURA 3TCOA 5G31A 5LNKe 4KNDA 5DVBA 2L6CA 1WOUA 3W8SA 2MMAA 4PNGA 2ZNMA 1GSFA 3DYRA 4PUAA 1TK0B 5ELGA 5D9VA 1WRYA 4OFNA 1SYRA 4EDYA 5DJLA 2F51A 3SWLA 3WT2A 2LJKA 4V1Ag 3EURA 5CAXA 4V2NA 1T7PB 3FKFA 4X0XA 1TK5B 1S3CA 2KUCA 1T1VA 1ZMAA 4OO4A 2IMFA 1GWCA 2C80A 3VURA 4HDEA 3L78A 1IYIA 4ISDA 3I9V2 1K0OA 6GSVA 2KOKA 3I69A 4K7OA 2PERA 4F0CA 5GSSA 5GZZB 2MMNA 4LL4B 4ID0A 5F05A 4I8BA 2PPTA 1YKAA 1TRUA 2HSYA 1A0FA 1XOAA 4L5LA 4KB3A 3HDCA 1K0NA 5ID2A 4XS6A 5G30A 3HHVA 1QMVA 4YAVA 3QAVA 1XW6A 1F9MA 4MJCA 1M99A 3PINA 1JZDA 4Q5RA 1EV4A 4EL1A 2GSQA 2H1DA 5D9XA 4GSNA 1ON4A 1O81A 3DMLA 5CNWA 2VCXA 4YQMA 2XC2A 1EP7A 1KBNA 4K2DA 2HSHA 11GSA 3LWAA 2C0GA 3WGEA 1WP0A 5DQSA 3ISOA 2FHEA 5HR3A 1OC8A 1QXHA 1SKWB 5JWOB 5ECNB 2X8GA 5F06A 3F9UA 5J9CA 5DDLA 4K1FA 2VOCA 1MDKA 3QCPA 2H73A 2H6XA 4Q5QA 5G1LA 22GSA 1DSBA 3M0FA 3TJKA 2QC7A 1SJ6A 1ST9A 5IMFA 2DBCA 5HR2A 2CV4A 2ON7A 3IE3A 5J5NA 2E2MA 2YWNA 4ZBDA 3UIWA 3IAS2 2F3MA 1U88A 4KCAA 3KMOA 2B3SA 7GSSA 4KUNA 5B6NA 3D5JA 4O5RA 4DSQA 3EC3A 3GL5A 4AJ6A 3DGQA 1TTZA 4N10A 1HNCA 5KEJA 2VCVA 4BPYA 4ZL9A 2YNXA 1SD8A 1A8LA 18GSA 3UMAA 2X64A 5B8AA 1OYJA 2IMIA 5B6MA 4TR1B 1OC9A 2VM2A 1URMA 4EC0A 2FWEA 4LMWA 2H76A 2FLSA 2MMOA 5CYYA 3ZREA 3VPQA 3FRCA 4ECCA 4EKZA 5AISA 3FW2A 4MA9A 2FUG2 2FNOA 1OAZA 1XIYA 4PNFA 2GZZA 2I3YA 1EWXA 4RQRA 4JEDA 5IMAA 1ILOA 1Z7PA 3M9KA 1XZOA 2VL3A 5D93A 2WDUA 3F0IA 1K3LA 3GURA 2PWJA 4HJMA 3ZVJD 2VCTA 5JWQB 4KSMA 4IELA 4J57E 2ZUPA 3TJGA 1YZXA 4PXOA 4CDOA 2KHPA 3WGXA 1YKCA 1K0DA 3KM6A 2DJKA 2QGVA 2WFCA 4PQIA 3F8UA 3DWVA 1HD2A 5HR1A 1GLQA 3EMPA 2TRCP 2YPMA 1N2AA 4E8HA 4KH7A 2IMEA 4BA7A 2LUSA 5ECOB 2QSIA 2NDOA 2IFQB 1PL1A 1W4VA 1HQOA 4F03A 2O8VB 3O76A 3HXSA 1H4OA 4BVXA 5IMVA 4RUVA 4KAEA 3PR8A 1ZZYA 4GWRA 5GSTA 3IC4A 3EU3A 1GTAA 5JCUA 2C8UA 3L9VA 5CO3A 3U6VA 2H0IA 3LYPA 1TU8A 4DSRA 3G7JA 4NV5A 1M7TA 1R26A 3F6DA 2DLXA 3ME8A 3UEMA 4CW9A 4KSOA 3IK7A 1XOBA 4G19A 1DBYA 4TXOA 2WB9A 4D73B 2OJLA 5KN1A 2BJXA 1X5CA 3CXGA 4YH2A 1B9XC 1LU4A 1TRSA 1FG4A 5JWRB 1BQ7A 3KD0A 4I2TA 3I43A 4JR6A 2TRXA 6GSUA 4NAXA 1FB0A 3GH9A 3F3RA 4RI6A 1TRVA 1XWCA 4IJIA 19GSA 3IR4A 3F63A 3HVSA 2A2RA 4V2MA 3J7Yk 2A4VA 5F07A 3GSSA 1OE8A 3H1NA 1AIUA 4MH3A 4YQUA 1YQ1A 3TGZA 1J0FA 5CP1A 4MJEA 1BAYA 1XVWA 2DJ0A 2NTOA 4N11A 2JU5A 1AXDA 2B6MA 1F3AA 1PMTA 4NHZA 1EOGA 2OACA 1ZCPA 2IMKA 3DVWA 1JZOA 4XRDA 4ML6A 2LSTA 4TR3A 1DE2A 2P5RA 1FVKA 2D2ZA 2C1YA 2MBTA 3TB2A 3HCZA 3FR9A 3KH9A 3TKSE 2BTOT 4F2IA 2V6KA 4POBA 1O85A 2WRTA 1GLPA 3CMIA 2RIIA 3UBLA 3ZLPA 3UJ1A 3UL3A 2LRCA 1VF3A 3TKPA 2E2GA 1M2AA 4JR4A 5FT3A 1V40A 3L9UA 5COHA 2PVOC 2H6YA 1LBKA 1SKSB 1HNBA 1THXA 6GSTA 2JADA 5HR0A 5ECPB 1B9YC 5IO2A 1BX9A 1LJRA 3CBUA 2ES7A 3VI5A 3TJBA 3ZMLA 1I9DA 4WXTA 9GSSA 1YY7A 4X1UA 1EP8A 4E8EA 2B5YA 2DC5A 4KDXA 5D8IA 3ZIVA 1YEXA 1JZRA 2I1UA 2L4QA 3KXOA 1TU7A 1FVJA 10GSA 5GAND 2WJUA 3LXZA 1ERTA 2OE3A 1VGLA 4IN0A 4MF5A 2VCQA 4FIWA 4XHMA 4KX4A 4AF2A 3RPNA 1GUKA 2H6ZA 1GUHA 3RDWA 1BEDA 1XWGA 1ZYEA 4K8MA 4G10A 3IDVA 1OKDA 3LJRA 4HZ2A 1ZL9A 5ID2B 1M9AA 2GZYA 2TIRA 1A2JA 4P3YB 2L59A 5IIZA 4PQHA 1TKDB 3CSHA 5DAKB 1T4ZA 5ELAA 1B4QA 4POLA 1KEBA 3GYKA 5ECLB 5D9TA 2HNLA 1EV9A 3BCKA 4TW5A 2C4JA 1GSSA 3APSA 2JZRA 1V58A 4LL1B 3ZYWA 3H8QA 5ECIB 2HYXA 2H71A 3M1GA 4GTUA 2VD1A 3GA4A 5LD0A 3CSIA 3ED3A 3FZ9A 1UA5A 3ZMKA 2NVLA 4GLTA 3KTBA 3LYKA 2RLIA 4XIHA 4K7IA 2DJJA 2P31A 3A2VA 4Z7XA 2L4CA 1FHEA 5HQPA 1E2YA 1TJDA 4K7NA 3UVHA 2DJ2A 3FK8A 3H4KA 2FGXA 2KLXA 2OBIA 3W8JA 1NHYA 1U3AA 2FWGA 2CQ9A 3GX0A 1TXXA 4HEA2 1GH2A 1GRXA 1AAZA 3A2XA 3UOMA 1EZKA 5EY6A 2V6OA 2HFDA 3ERFA 3D6IA 1OC3A 1TDIA 3C1SA 1XWKA 2YJ7A 3VLNA 2R6KA 4OFTA 3D0ZA 4EF0A 3QAWA 5DALA 2XBQA 3CSJA 1Z5YE 4QQ7A 1UC7A 3HJMA 4IJ3A 1QUWA 2H72A 1KTEA 3L4NA 4RI7A 3IBHA 1PKWA 1GSQA 4OCEA 2O89A 2GZPA 5E4WA 1QGVA 4TVEA 4HQZA 3A2WA 4JE1A 1N8JA 5EVOA 2WGRA 4O7HA 4POMA 3KMNA 3UVTA 3ME7A 2JSYA 1TW9A 1BYEA 2GT5A 1ACVA 4PUFC 4L0WA 5J9BA 1O73A 1GL8A 4IP6A 5KN0A 2DIZA 3P90A 1U6TA 3MDKA 3BCIA 1THOA 3KIJA 3QR6A 2E7PA 1SYXA 4HU7A 2R4VA 5G1KA 1PN9A 1YF0A 1ML6A 3GV1A 1S3AA 1JFUA 2OBKA 1YEPA 1ABAA 2LEGA 5INYA 2ON5A 3HZ8A 4KA0A 4MDCA 2RM6A 1ERUA 1V2AA 2M80A 3GUSA 1PX7A 4ZBBA 5F0GA 1W89A 1A23A 2FA4A 5IM9A 1PRXA 1CQHA 3ZVJA 1Z3EA 3P7XA 2GS3A 2OADA 4FYBA 3LG6A 3WD6A 2LJAA 4HZ4A 3RBTA 3HY2A 4F82A 1X0RA 3NZNA 4F9ZA 4NXIA 3S9FA 2LS5A 1TI3A 5DCHA 4MH2A 4WR4A 2PUKC 3FZ4A 4GQFA 5FHIA 2I81A 3J7Yb 4YAPA 2H74A 1YDKA 2GLRA 1R4WA 1R5AA 1GTBA 3M9JA 3CTGA 2R37A 3QD9A 3HVVA 4IHUA 4J2FA 2I4AA 4TXOB 3FZ5A 5IO0A 1XXUA 4I97A 1PX6A 5ECHB 3O3TA 3LGCA 4YQVA 1HYUA 3ZTLA 2IPAA 4K0NA 3VI7A 3RHBA 5B8BA 2LRNA 4PX1A 3F6FA 4DEJA 2P0GA 2GT6A 2I9HA 5H5SA 2YANA 3WGDA 4KDYA 4H86A 3TJJA 2YWIA 5A4UA 1VF4A 1VF1A 8GSSA 2KP1A 1H75A 4IGJA 2OKAA 4WBRD 1M2DA 2XHFA 3EINA 1J08A 5KN3A 3I6AA 3GTUA 1ZYQB 1YF1A 2LNTA 4QL9A 2GSSA 1T4YA 5B7CA 2MBSA 3HA9A 2OE1A 2H0GA 2VCZA 4BWQA 2CAIA 4TN8A 2JL4A 3V1WA 2CT6A 3RHCA 1U3IA 3RAZA 3VPTA 3FR6A 5J4UA 1K0CA 3FHKA 3QFBC 2E0QA 3IPZA 1X5EA 4XRAA 4ML1A 5ECRB 3HKRA 3IRAA 3DVXA 1A2MA 1EGOA 2XPDA 3GKKA 4BWSA 3TKQA 5DBQA 5EPFA 4ZIJA 1ZGNA 2B7KA 2L5LA 2J9HA 3FR3A 2N5BA 5D73A 4FH8A 4MCUA 2EIQA 1O6JA 2YP6A 3BBYA 2HRNA 4GXZA 3WT1A 2LTKA 2VL9A 2BMXA 4JU5A 1F37A 2CVDA 3D4TA 3DIEA 2K18A 1SL1B 4O92A 2K6VA 2H75A 2VL2A 3EVIA 2H66A 2YWOA 3A5WA 4KDUA 1EGRA 1E6BA 3FZAA 2GQKA 2JZTA 4PQ1A 1I5GA 2AB6A 1Y6EA 2EIRA 1NW2A 1R7HA 4ZB6A 1GSDA 3VK9A 1XW9A 3LXTA 2HZEB 3F3QA 3U5RE 1MDJA 1NM3A 4GRFA 1SU9A 4V2LA 1BJXA 2YWMA 5IQYA 3GMFA 2LKUA 1FW1A 4WEYA 1GP1A 4RQXA 1AQXA 4BVYA 4XS4B 2CA8A 2O87A 3VWXA 1DE1A 3TUEA 3WYWA 5CREA 3QAGA 3C71A 4AJ8A 4IS0A 3HD5A 2DSAA 5EL8A 4L8EA 4MF6A 2H8LA 3HYPA 3E3EA 2VUPA 1Q4JA 2X99A 1CQGA 2CZ2A 1MTCA 2L57A 2KP2A 3GL3A 1GUMA 3GX8A 4NMUA 4F0BA 4MZWA 5H5QA 2DMMA 3VWVA 1TK8B 3K8NA 2DMLA 4ZILA 3LFLA 3KGKA 4GCIA 4LA1A 1G7OA 2L6DA 4DSSA 3EMXA 3F4TA 4MJAA 3HJPA 1V98A 3GKMA 1DUGA 2HZFA 2CX4A 4LMVA 1X9MB 3BOAA 20GSA 3GSTA 3TRPA 4TOPA 3ZIJA 4MPGA 2LRTA 4JRRA 2OE0A 1F6MC 3IOSA 5AIXA 2A2SA 4K9ZA 2CZ3A 4JBBA 4AJ7A 1USBA 1K0BA 1RW1A 3CYNA 4TR4A 4L0UA 5CRGA 1T00A 1AQWA 3G9BA 3OR5A 5CRHA 5F8BA 4WF4A 2GVPA 2CAQA 2H70A 3EYTA 1ERWA 3GN3A 2B1KA 5DALB 3G7IA 2NBSA 1F3BA 1Z6NA 3QMXA 3ZITA 1SD9A 5GAPD 4GSSA 1GSYA 2G2QA 2J23A 1XFLA 2CVBA 5L71A 1MEKA 2WULA 2MYGA 4MK3A 1SJZA 2H1BA 1TRWA 3FEUA 2LQQA 3GFKA 4G9HA 4MMMA 1B8XA 1YJ6A 4IP1A 5DJMA 3VWWA 3QOUA 3UAPA 4Q5FA 1JHBA 1PGTA 4ZL8A 1MD4A 3KP9A 5HFIA 5IPGA 1GTUA 4POKA 3VFIA 1X9SB 2VLTA 2R3XA 4OWYA 2DJ1A 3F4SA 3IK9A 4QL7A 5A4WA 2VM1A 1OE7A 3GKXA 1Z6MA 5HFKA 4ZB9A 4K6XA 5ABRA 2PGTA 5IOWA 4G2EA 4ULXA 4OD7A 2FA8A 2RM5A 2H19A 4JZQA 5D96A 5ECSA 4IQ1A 5AGYA 6GSXA 1GULA 3Q74A 4EE0A 4N0ZA 5C04A 1FAAA 4FYUA 2LQOA 3A3TA 1BG5A 5AIVA 3H93A 4FO5A 1UN2A 1SJIA 3LORA 1ZOFA 2O7KA 3QPMA 2HXKA 3ZZXA 4OO5A 1JLWA 13GSA 5DCGA 4XTSA 3EE2A 2C0EA 4XS1A 4K0GA 2R5GA 2MZCA 1M9BA 4WBJA 3QFAC 1A8YA 2B5EA 2AAWA 2WS2A 2HLSA 4MABA 4ECJA 2VL2C 3BJ5A 4ZBAA 1AQVA 1PKZA 3UBKA 5DAKA 2FD3A 3KH7A 4MPFA 1OC9B 2B7JA 1RQMA 2B5XA 4TXVA 3G7YA 3LEFA 4OMVA 1K3YA 3IV4A 5C00A 3C7MA 3MAKA 5J41A 4ILFA 4I2UA 16GSA 3NOFA 4N30A 2NPBA 3KCMA 3M3MA 3MNGA 2AJQB 2XBIA 2JACA 4WKWA 4WF5A 3F4RA 3PGTA 3TKSA 4HQSA 5IPHA 3ZFBA 1SL0B 2MMZA 3M8NA 4EVMA 2N5AA 4KW6A 4IVFA 4HUAA 2HT9A 2CX3A 1A0RP 4MF7A 1SKRB 5CRDA 1Y25A 2V2GA 2VIMA 4EDZA 1V57A 3DD3A 2V32A 1F2EA 3P2AA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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