1XOBA

Thioredoxin (reduced dithio form), nmr, 20 structures
Total Genus 33
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
33
sequence length
108
structure length
108
Chain Sequence
b'SDKIIHLTDDSFDTDVLKADGAILVDFWAEWCGPCKMIAPILDEIADEYQGKLTVAKLNIDQNPGTAPKYGIRGIPTLLLFKNGEVAATKVGALSKGQLKEFLDANLA'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title High-resolution solution structures of oxidized and reduced Escherichia coli thioredoxin.
pubmed doi rcsb
molecule keywords THIOREDOXIN
source organism Escherichia coli
molecule tags Electron transport
total genus 33
structure length 108
sequence length 108
ec nomenclature
pdb deposition date 1995-11-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1xobA00
3ZTLA 2IIYA 5HR0A 1F2EA 5H5SA 3UVTA 2XBIA 5J41A 5GAPD 1GSSA 1PQNA 2WGRA 2FWHA 2VCQA 3WT1A 1A2LA 4BWQA 1XWBA 4HQZA 5KEJA 3HJPA 2YV7A 22GSA 1YY7A 3DRNA 17GSA 3HVVA 2OJLA 2CZ2A 2H74A 4TKYA 1PA3A 1A24A 1W89A 4JRRA 2H73A 4DSSA 3JCML 2B7KA 2DSAA 2GQLA 3LJRA 1SYXA 1GSUA 4F03A 4GSTA 4OO5A 3APSA 3OR5A 1A0FA 4WBRD 3M8NA 4OFMA 2C4JA 2KP1A 4LL1B 3EMPA 5IM9A 2QC7A 5HR1A 3W8JA 1OE8A 3QAWA 4FIWA 2YZHA 2R6KA 1YQ1A 2XBQA 3C71A 1MD4A 3CSJA 4I6XA 3GL5A 1EV9A 4MH2A 4PNFA 3GKKA 2GT6A 4KGIA 3UMAA 1YJ6A 3SWLA 1OKDA 2LNTA 3KGKA 2L5OA 1O73A 3EC3A 2F9SA 1FVJA 3I69A 1WP0A 4I97A 3VWWA 3KXOA 1TK0B 4NHWA 1LBKA 4XHMA 2XPEA 3U5RE 3MNGA 5JWQB 3VFIA 2OE3A 3L9SA 1HNCA 5IO0A 3WD6A 3C1SA 4F2IA 1IYHA 4TOPA 4ECJA 1JZDA 1TRWA 4HU7A 2RIIA 4YAVA 1QXHA 2L6CA 3O6TA 5HFGA 1X9WB 3A2WA 1VF2A 4RI6A 4L8EA 2LNSA 2BTOT 3RPNA 4G19A 4NXIA 2WJUA 2A2RA 4MJEA 1VF4A 4HQSA 4WR4A 3IRAA 4CW9A 1E2YA 1GH2A 2C3QA 3QDNA 5KN2A 4KCAA 4AF2A 2LJAA 3W6GA 4L0WA 3N9JA 1UN2A 2MMNA 3DVWA 3GURA 1EEMA 4KB3A 2V1MA 1EP7A 2MBTA 2I3YA 2WDUA 2VCZA 3M9KA 1X5CA 5HR3A 2GGTA 3VURA 4F0CA 1S3DA 4NV5A 4K7OA 5COHA 5IQYA 1Z9HA 3VPTA 2X99A 2PERA 4PNGA 3ZIVA 5DAKA 1FO5A 2H0HA 1FHEA 2R2JA 2LRTA 3HCZA 5DCGA 1NSWA 2FD3A 1WMJA 4NAXA 4PQIA 2AYTA 4FYCA 4XS6A 2REMA 1VF1A 1G6WA 2O8VB 4BVYA 2IPAA 1EV4A 1AQVA 2DLXA 5ECHB 2GLRA 4L0UA 2DMMA 4DEJA 3F8UA 2H70A 4JZQA 3WGEA 3KTBA 2M80A 1SL1B 2IMKA 2K6VA 4MCUA 3F9UA 4IQ1A 5AIVA 3IR4A 5B8AA 2AUVA 5A5KA 4NMUA 4ZB8A 3RPPA 1A0RP 2PU9C 3ERFA 3H79A 4KNDA 3DKSA 2ON7A 5GZZB 5IMFA 1XPVA 3ME7A 1OYJA 2GSRA 5IO2A 4DSQA 3TOUA 3TKPA 4ZXGA 4GCIA 3F6FA 4HI7A 3AY8A 5DAKB 1URMA 4GSNA 4NWYA 3LEFA 2ES7A 4FYUA 3A3TA 3KH9A 4LLRA 4BA7A 5F07A 1GSEA 2VCVA 4K0GA 3TCOA 4YH2A 3G7YA 1FG4A 4ZL7A 2HXKA 2DJ1A 3KMNA 3CYNA 4H86A 5J5NA 2PN8A 3SBCA 1JLWA 4EKZA 4TR4A 1Z7RA 3LYKA 3VPQA 4WR5A 3H8QA 4KX4A 1R4WA 1JZOA 1GLPA 1YZXA 3RDWA 1MEKA 4PUAA 4YQVA 2LRCA 2LSTA 5DCHA 3GKXA 1EGOA 2DJKA 1WOUA 1TU8A 1W4VA 5ECSA 2OE0A 4PURA 5CRHA 3ZZXA 3P90A 4WXTA 1LJRA 2VUPA 2YWOA 1B8XA 2FA4A 1AAZA 1WPIA 3FR3A 4IP1A 2MMOA 5DALA 3M9JA 2JZSA 4JBBA 1THOA 4IKHA 1EWXA 4MF5A 4IJ3A 4LL4B 5HQPA 3M0FA 2CVKA 2YJHA 2AB6A 3FR6A 1GWCA 1Q98A 2F8FA 3CBUA 1TI3A 1T4ZA 4IELA 3PH9A 3IE3A 1Q4JA 4IHUA 3L78A 2DJ2A 2C80A 1DUGA 5GSSA 6GSVA 3GMFA 1E6BA 4LMWA 1U87A 3IBHA 5HFKA 2FY6A 2HZEB 5D9XA 1S3AA 2GVPA 2GS3A 1SL2B 4N10A 2GZYA 2IMEA 2PPTA 2I1UA 2FNOA 1R5AA 2QKEA 4XRAA 3UARA 3RAZA 3UBLA 2WS2A 1V58A 14GSA 4MP4A 3HZ8A 2H01A 2NTOA 5D9VA 2YPMA 3Q19A 2KOKA 2AAWA 5H5RA 3QCPA 2WRTA 4GLTA 2E2GA 3CMIA 2LJKA 3A2XA 4HU9A 2O89A 3HYPA 5LD0A 3KZQA 1JFUA 3P7XA 1DE1A 2RM6A 2MBSA 2YV9A 2H76A 3CTGA 4IQAA 3D22A 1SK2A 3D4TA 1BYEA 2AJQB 2B1KA 4F82A 11GSA 4XS1A 4HZ4A 3VI5A 1QFNA 1U3IA 3QFBC 1ZYQB 3LQ7A 2B5YA 1EOHA 3GUSA 5JCGA 1M2DA 2NVLA 5CAXA 4HJ2A 1TU7A 4O92A 1ZCPA 5ECQB 4ZILA 3ERGA 4V2NA 4L5OA 2JZRA 2TRCP 5H5QA 5ABRA 2V6KA 1UVZA 4G9HA 1UA5A 2XC2A 4N11A 2H75A 5C00A 4Q5QA 1KBNA 2FGXA 4FO5A 18GSA 1O8XA 3WGDA 5IPHA 1T4YA 2AV4A 1GNWA 3HVXA 3TJGA 4MPGA 1XFLA 5IMDA 4BWSA 1SKWB 2YWMA 4IW9A 2H66A 4GXZA 3ZIJA 1GTUA 1K0CA 2X64A 3MAKA 1XBSA 2VCXA 3KM6A 1AIUA 3GIXA 5ELAA 3ZYWA 1T00A 2V6OA 3LSZA 4WEYA 5JCWA 5IIZA 5G5FA 3UIWA 3L0HA 4ID0A 4ISDA 2YWIA 3IHQA 3UEMA 5A4UA 2EIQA 1GNEA 5G31A 4ZB6A 4K1FA 1WE0A 4AJ6A 5LCZA 5B6NA 3WT2A 1B48A 6GSYA 3EU4A 8GSSA 3ZITA 1KNGA 1XW9A 2PVQA 1R5PA 1SYRA 2F8AA 1K0DA 4ZBDA 5J9CA 2C0DA 2B3SA 3D4MA 5AISA 2CT6A 5F06A 1GUKA 2CAQA 2VD1A 3PGTA 4IN0A 5EL8A 1TW9A 1JZWA 3IOSA 4NV2A 1H75A 4JE1A 4WF5A 6GSWA 2L4QA 4AGSA 5G1LA 1MDJA 2ZNMA 2J23A 1FAAA 1PX7A 20GSA 1OKTA 3N5OA 5CNWA 4HS1A 3W8SA 3RHCA 4QQ7A 3H4KA 2OBKA 3FZAA 3TKRA 2I9HA 3GYKA 1EGRA 3ZVJD 5ECLB 2WULA 4L5LA 2RLIA 2H30A 1OC8A 1A23A 5G1KA 1MDIA 3F63A 3NZNA 1FOVA 3TRXA 1T1VA 3D6IA 2NPBA 2I81A 3QR6A 3ZL5A 5G5EA 2P5RA 2CV4A 5D8IA 4DSSB 5EPFA 5E4WA 1TI1A 1GL8A 4DSRA 3KTLA 2GQKA 5IOWA 5D73A 1PX6A 4D73A 3G9BA 1ML6A 1AXDA 1C72A 3IA1A 1MTCA 4QL9A 3TRQA 4NPBA 2KLXA 3F4TA 1B9YC 4GRFA 1M99A 2M46A 5IMZA 1GLQA 2AHEA 2VL2C 1FVKA 3LFLA 3DGQA 5IMAA 2B1LA 1SK1A 2N5FA 2GT5A 4TR1A 5DJLA 3EINA 1SU9A 3F0IA 1SL0B 3HDCA 1HQOA 1X5EA 1ST9A 3QAVA 3F4SA 4RQRA 3ED3A 2C0EA 4P3YB 3IPZA 1TK8B 1RW1A 1GP1A 3KH7A 3F6DA 3R2QA 1EZKA 1O6JA 1YEXA 1UC7A 4FYBA 4JEDA 1TP9A 2M72A 4D73B 1TRUA 3KP8A 2PWJA 3DWVA 3CTFA 3FK8A 2LKUA 2VL2A 3TKSE 2G2QA 4YQUA 4EE0A 4MH3A 5IOXA 4J2FA 3UOMA 1CQHA 1G7OA 2L57A 4EUYA 3BBYA 1AUCA 3ZFBA 3KP9A 2D2ZA 5GAND 1QUWA 1Z6MA 1WRYA 4GSSA 4OMVA 2H71A 2YCDA 1GULA 2L6DA 3O3TA 5ELGA 2N5AA 4PQHA 5KN0A 4XS4A 4O5RA 4I2UA 1K3LA 2P31A 5DQSA 4AJ8A 5D9TA 1AQWA 4N0ZA 2I4AA 4CHSA 2B5EA 1XWCA 2FUG2 3EMXA 2HE3A 3VLNA 3P2AA 1XXUA 2A4VA 1OC3A 5JWRB 4OFTA 2C3TA 3HZ4A 2E0QA 3UBKA 3MSZA 2LJRA 3E0UA 4POKA 1G7EA 5FHIA 2HT9A 2K9FA 3EURA 1PKWA 2ALBA 1AW9A 4JR6A 1ZMAA 4OFNA 1SJZA 4EVMA 3DIEA 1X0RA 3IK9A 3FZ4A 4RI7A 3IDVA 5CP1A 2PBJA 3DXBA 3V1WA 3CXGA 2C1YA 2VLVA 3ZRDA 4ML1A 2DIYA 2R4VA 1GTAA 4TW5A 2E7PA 5JWOB 3GX0A 4K9ZA 4NHZA 4TVEA 1G6YA 4WETA 5KN3A 2J9HA 3TJJA 2VAFA 1GSDA 1PN9A 1G0TA 3GSTA 2YP6A 2CX4A 2H72A 4V1Ap 4BVXA 2LRNA 4PX1A 1B4PA 2V32A 4XS4B 1BX9A 1ZGNA 1T8EB 2O85A 2VCTA 3TRPA 1OVNA 3CRTA 5IPGA 3GV1A 3KD0A 4F9ZA 2PUKC 5L71A 3LXZA 3G7IA 2DC5A 3D21A 2H0IA 4G2EA 4KA0A 1SKRB 3IC4A 3HHVA 2HZFA 4EC0A 3F3QA 2ON5A 2IMFA 4OWYA 1OAZA 1ERUA 3I6AA 4KDYA 5ECMB 3GKNA 3U6VA 1X9SB 4TR3A 5A4WA 3QFAC 4O7HA 1QMVA 4TR0A 5JCUA 2PMTA 2O7KA 5DBQA 1A2JA 1GSQA 2YOIA 4EDZA 6GSUA 2FWFA 3QMXA 2LV3A 3ZMKA 2FCHA 3TOTA 5ECPB 3GHAA 2HSHA 1S3CA 2IL3A 5CREA 4MF6A 1PRXA 1Y25A 2KP2A 1NW2A 3I9V2 4N30A 2R5GA 2A2SA 1K0MA 4V2LA 1PGTA 3ME8A 1TKDB 5ID2A 4POLA 1FB0A 3QD9A 1VF3A 1HD2A 3EVIA 16GSA 2X8CA 4ZBAA 3GN3A 4TXOA 1NHOA 5IMVA 5DALB 3TGZA 5ECRB 3F3RA 3EU3A 1Z5YE 2YN1A 2IMIA 1KTEA 2WFCA 3E3EA 2L59A 1K0BA 1M0UA 4KW6A 2EIRA 1MD3A 2MZCA 3GTUA 4IBPA 3RHBA 2V2GA 1XCCA 3D0ZA 2VL3A 4IJIA 3EWLA 2V41A 2VM2A 1K0AA 4ECCA 2FWEA 1N8JA 13GSA 2K18A 1ZOFA 1MDKA 1HYUA 3BCKA 1VGLA 1K0OA 2GQMA 2NBSA 4MJBA 3DD3A 5ECNB 2H1GA 2VLUA 1J9BA 1TRSA 2C0GA 5D9WA 2CX3A 3A5WA 4OO4A 3APOA 2QSIA 2H6ZA 5J3RA 1F3AA 4I2TA 3UVHA 2DJ3A 4TXOB 4V1Ag 2H6YA 2C3NA 2WCIA 4MZCA 5B8BA 3C73A 1U3AA 2X8HA 4KH7A 4Q5NA 4EO3A 4MLYA 2HLSA 2DJ0A 1F37A 3GTUB 1JZRA 3HKRA 4G10A 1THXA 1M9BA 1GUHA 2LQQA 5D96A 10GSA 3DEXA 5ECOB 2PVOC 5J4UA 1ERTA 6GSSA 3L9VA 2ZCTA 4WBJA 4HOJA 2VLTA 5E59A 1V9WA 1QK8A 4MPFA 5CO3A 2YJ7A 3M3MA 4EL1A 1EP8A 2DBCA 1GTIA 1V98A 3GA4A 1NM3A 1WIKA 2GSSA 4EF0A 1BJXA 3FRCA 1XZOA 1OE7A 4MDCA 3HY2A 4KDXA 3S9FA 1QGVA 1SD9A 4HEA2 1BEDA 5F0GA 4BPYA 2IN3A 3TB2A 1J08A 1ABAA 3RBTA 1KEBA 3GFKA 2KHPA 4OCEA 5G2ZA 2CA8A 3TJFA 3GX8A 1U6TA 5ENUA 2LUSA 1H4OA 2B7JA 3CSHA 4K7NA 2FWGA 2OBIA 1OC9A 4IVFA 2JADA 4DVCA 3US3A 1T3BA 2F3MA 3QPMA 1ZYEA 3VWUA 3J7Yk 3NIVA 3J7Yb 1BQ7A 4PGTA 4ECBA 1EEJA 2E2MA 1GTBA 5B7CA 4ZIJA 1GUMA 3KMOA 3ZFLA 2OADA 3P8WA 4ZL8A 2TIRA 1IYIA 4GF0A 2EC4A 5B6MA 2IWTA 3ERWA 1ZZYA 1CQGA 2K8SA 1F3BA 2WB9A 1Z7PA 1R7HA 2OACA 1O85A 3KJYA 5J9BA 1XW6A 6GSTA 4YAPA 5HR2A 4XIHA 1Z6NA 1K3OA 3E9JB 2K8VA 3FY7A 1F9MA 3FYGA 5INYA 3BD2A 4MABA 1O8WA 4YQMA 4Z7XA 1OC9B 4MK3A 2MMZA 1GRXA 1YF1A 4ZL9A 3VWXA 2YNXA 2GDRA 4XCSA 2KUCA 2P5QA 1U88A 1I9DA 2EIOA 2XPDA 4ILFA 3LYPA 3IAS2 1A8LA 5C04A 3WYWA 3HA9A 1V57A 5DJMA 2VL9A 2JSYA 2C0FA 4GQCA 1V40A 5F05A 4GQFA 1B9XC 1TTZA 1R26A 2BJXA 4PXOA 2LTKA 1TDIA 2VCWA 3NOFA 1XIYA 2R37A 3Q74A 4GWRA 9GSSA 1TJDA 1X5DA 4ZBBA 1GSFA 3LXTA 2YANA 1JLVA 1BAYA 5CRDA 3C1RA 2TRXA 1ILOA 3MWHA 2FLSA 3APQA 1T7PB 3O76A 2HRNA 2JL4A 4E8EA 1B4QA 2H1AA 3ZVJA 2L4CA 2B6MA 4MA9A 1O81A 2PGTA 4ULXA 2F51A 1HNBA 1Y6EA 1HNAA 4F0BA 2H1DA 4TR1B 1XVWA 3LG6A 1XWAA 2GZZA 4MMMA 1RQMA 2DJJA 5ECKB 2NDOA 1YDKA 2HFDA 2JSZA 4RUVA 2LQOA 3Q18A 4WKWA 1ON4A 4KCEA 2GTUA 4FH8A 5DDLA 2JACA 4HJMA 4EXJA 1TK5B 2ZUPA 4X1UA 1LU4A 4X43A 4TRXA 3VWVA 1NHYA 1USBA 4V2MA 2YZUA 4ECIA 2H1BA 5F8BA 1M2BA 4KAEA 3LORA 2FHEA 3PR8A 4MZBA 3I43A 3LWAA 3LGCA 4KDUA 3ZMLA 3GSSA 2DIZA 1X9MB 2GSTA 2FA8A 1BG5A 5G30A 2WZ9A 3DVXA 1A2MA 1XWGA 4POMA 1QQ2A 1XW5A 3DMLA 5CYYA 4KSMA 4MJCA 3M1GA 3TJBA 3A2VA 1WJKA 1AQXA 1ERVA 4POBA 1PL1A 2IJYA 1Z3EA 5AGYA 1SKSB 3GL3A 4K8MA 4GTUA 1DBYA 3FEUA 4HUAA 4LA1A 3Q6OA 2JZTA 1RK4A 3CSIA 2CZ3A 3FW2A 1FW1A 1PKZA 2IFQA 2IMDA 4MF7A 1SENA 3KEBA 3TKSC 1SK0A 3GH9A 2CQ9A 2BMXA 3BJ5A 2VO4A 3K8NA 4O32A 1SJIA 4ZB9A 5DVBA 2L5LA 1SD8A 4RQXA 2HZEA 4Q5FA 5FT3A 1AC1A 3WGXA 1DE2A 2OKAA 5IMCA 3TJKA 4QL7A 3VI7A 3HJOA 3FHKA 4JU5A 3HJMA 2LEGA 2VOCA 4TN8A 2P0GA 1TOFA 1XOBA 2DMLA 1O7UA 6GSXA 1TRVA 4ML6A 2OA7A 2G0FA 3TKQA 2VIMA 1J0FA 1TXXA 4JR4A 4KUNA 1ACVA 5CRWA 3KIJA 3IK7A 2H0GA 2HNLA 1XVQA 5LNKe 3PINA 12GSA 4KSOA 3HD5A 3TKSA 4KE3A 3H93A 1I5GA 4OD7A 1YF0A 2R3XA 3H1NA 5FWGA 3UAPA 3GNJA 3HVSA 3MDKA 2IFQB 1PL2A 4WF4A 2MMAA 4EDYA 3FZ5A 4MZWA 1VRSD 1N2AA 4PQ1A 2MYGA 1PMTA 3C8EA 3IAM2 4LMVA 2Z9SA 4IS0A 3G7JA 5ECIB 5KN1A 3FKFA 5A4VA 4X0XA 2OE1A 5DQYA 2CAIA 5HFIA 2JU5A 4HZ2A 4CDOA 2N5BA 1GSYA 2X8GA 3CRUA 3GRXA 3UJ1A 1M2AA 2RUFA 3L4NA 2HSYA 2H8LA 5D93A 2VD0A 3IV4A 3ISOA 3TUEA 1ERWA 3FZ9A 1SJ6A 1V2AA 5GSTA 1DSBA 1PSQA 2HYXA 3TDGA 5AIXA 2GZPA 1K0NA 4N0VA 2VM1A 3D5JA 2CVBA 4I8BA 1JHBA 4J56E 2HRFA 1ZL9A 3BOAA 2H6XA 2H19A 1M7TA 1YKAA 4K7IA 2LS5A 1A8YA 2RM5A 2QGVA 3IXRA 4ACSA 3BCIA 3KCMA 4I5QA 1M9AA 4XTSA 5EVOA 4E8HA 5ID2B 4PUFC 4K0NA 1YKCA 3EE2A 2GSQA 4HDEA 3HXSA 4TXVA 5EY6A 2YWNA 2CVDA 4AJ7A 1F6MC 19GSA 2C8UA 1XOAA 7GSSA 4Q5RA 2B5XA 3DYRA 1PD21 3F4RA 1YEPA 1WWJA 1XWKA 3EYTA 4K6XA 1EOGA 5CRGA 1FB6A 3C7MA 4OCFA 3VK9A 4MJAA 2XHFA 3L9UA 3QAGA 3GKMA 2O87A 3FR9A 3ZLPA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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