1XOBA

Thioredoxin (reduced dithio form), nmr, 20 structures
Total Genus 33
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
33
sequence length
108
structure length
108
Chain Sequence
SDKIIHLTDDSFDTDVLKADGAILVDFWAEWCGPCKMIAPILDEIADEYQGKLTVAKLNIDQNPGTAPKYGIRGIPTLLLFKNGEVAATKVGALSKGQLKEFLDANLA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Electron transport
source organism Escherichia coli
publication title High-resolution solution structures of oxidized and reduced Escherichia coli thioredoxin.
pubmed doi rcsb
molecule keywords THIOREDOXIN
total genus 33
structure length 108
sequence length 108
ec nomenclature
pdb deposition date 1995-11-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1xobA00
2LRCA 2D2ZA 2YZHA 4CHSA 2CZ2A 3O6TA 4L8EA 1JLWA 2WRTA 2LJAA 3H4KA 1OC8A 1DE2A 4PXOA 5LNKe 2OBIA 1SD8A 1HNAA 4JEDA 2VCZA 2H6ZA 2K6VA 1A23A 2R6KA 4EO3A 5CRDA 3RDWA 3L4NA 5DCHA 5IO2A 2F8FA 3QD9A 2M46A 1BYEA 3LQ7A 1PKZA 1YF1A 2IFQA 3CSHA 2YWOA 4RI7A 4N10A 1JZRA 1VF4A 2PWJA 4D73B 1S3AA 3D6IA 1GTAA 2VCWA 1BEDA 5B8AA 5IIZA 1GNEA 4NHZA 2IMFA 4ZBBA 3D4TA 2KHPA 1TP9A 1Z7RA 4OCEA 1KBNA 1EZKA 2E7PA 3ME7A 1U87A 5IMFA 4ZIJA 2EC4A 3KZQA 5C00A 1R7HA 1SJZA 1TJDA 3ZIVA 3EC3A 3QMXA 3GKXA 4DSSA 4XCSA 3EU3A 2LTKA 2PBJA 5IO0A 3TDGA 2RIIA 3QOUA 3WGDA 2DJ1A 2H1BA 4KSMA 4ZB9A 3M0FA 3QAWA 4IJ3A 3D4MA 3ZVJD 2WCIA 3HD5A 2VLTA 3NOFA 4HQZA 2GS3A 1WPIA 2GSRA 1SJIA 5IOXA 2XPDA 3UEMA 1QMVA 1XFLA 2JU5A 3GHAA 1ST9A 1SL1B 2NTOA 1HNBA 2K8VA 3TRXA 3LSZA 2HZEB 3TKQA 1U3AA 1F37A 2H73A 3ZRDA 4EXJA 2OJLA 3GYKA 2L6CA 3A2WA 4MLYA 2LRTA 4IQ1A 1TDIA 3O76A 5KN3A 5G30A 1B4QA 2ZNMA 3F4RA 3D21A 3I9V2 3KH9A 4LMVA 1A8YA 4LL4B 3QR6A 5IMZA 3UVTA 1GSQA 2MMOA 4KNDA 2HSHA 1V9WA 1T00A 2IMEA 2H0HA 1QXHA 3G7IA 3CRUA 5DJMA 3ERWA 5ECIB 1PA3A 2C0GA 2K8SA 1Z6MA 3N5OA 4K0NA 3LYKA 1R5AA 3PH9A 1TW9A 2H30A 5DBQA 4IELA 1OC9B 1WWJA 3QAGA 3CRTA 1EGRA 2J23A 4POLA 2WFCA 3QDNA 3PGTA 1THOA 1TOFA 4AF2A 1K3LA 4K7IA 1O6JA 4BA7A 1GUKA 3LORA 2B5YA 5J5NA 1Z3EA 5EPFA 2NBSA 1PSQA 1JZDA 1YDKA 2M72A 3SBCA 3C73A 2VLVA 1XWAA 2YZUA 4OFTA 4MJBA 4POKA 4QQ7A 4WKWA 5KN1A 3UBLA 2KOKA 2GTUA 3TKSA 2MMAA 3VPQA 2VUPA 3KP8A 4J57E 4OO5A 3Q19A 3I43A 2FCHA 17GSA 6GSTA 3QCPA 4DSQA 2P5QA 4POBA 2ON7A 3JCML 1PL2A 2I81A 3BJ5A 2I9HA 1GSUA 3CSJA 4RUVA 3F4TA 1MDJA 1GSDA 3PINA 5DAKA 1YQ1A 1LU4A 4DVCA 2L4CA 4XRAA 5G1LA 3RPPA 3IOSA 4PUAA 3LXZA 5B6MA 3P90A 4V1Ag 2V1MA 3HY2A 1Q4JA 2GQMA 3U6VA 4TR1A 1Y25A 3GMFA 3RAZA 4ML1A 3FZ5A 3FYGA 4QL9A 4AGSA 1Z9HA 3D0ZA 5A4VA 2GVPA 4MZWA 3VWUA 4FIWA 5LD0A 5ID2A 4LL1B 1A0RP 4F03A 3GSTA 2ON5A 2H0IA 2JADA 2KP2A 3LGCA 1FVJA 4TXOA 5JCUA 2CA8A 1EP8A 2C8UA 2N5AA 4NWYA 1AQXA 4KDXA 4EF0A 3TKPA 2YWIA 1LJRA 4JR6A 3WD6A 3TOTA 3EWLA 9GSSA 2BTOT 4GF0A 1PQNA 3ZMLA 5ECQB 3G7JA 4YH2A 3ZITA 1NSWA 4NHWA 1SKRB 2H01A 8GSSA 1W4VA 1TK8B 5B6NA 4EE0A 2FA8A 4I2UA 3HJPA 1RQMA 4N0ZA 5AISA 2DLXA 3GX8A 3US3A 4JE1A 4Z7XA 1DUGA 1K0CA 2O87A 1URMA 3A5WA 3W6GA 2PERA 3L78A 22GSA 1G7EA 2HLSA 2MBSA 20GSA 2VL2C 5A4UA 4K1FA 1ZCPA 5F0GA 5FT3A 3GKKA 1F6MC 2CVBA 3P8WA 4RQRA 3PR8A 2QKEA 2IMKA 4XS4A 4AJ6A 3HVVA 4NXIA 5FWGA 4FO5A 2YPMA 3DWVA 2LQOA 3ZREA 4JBBA 3HYPA 2N5FA 4MK3A 3VURA 2IL3A 1C72A 3E3EA 3G9BA 4XTSA 3IC4A 4WR5A 2YNXA 19GSA 2WGRA 1OC3A 3ZMKA 1H4OA 2YWNA 2V32A 18GSA 2HE3A 1GUMA 4HUAA 1I9DA 2M80A 3DVWA 3WGEA 1UN2A 5KN0A 2H72A 4IN0A 2VD1A 1PMTA 1XW6A 3L9VA 2F9SA 2GGTA 4WBJA 1GLQA 1K0AA 2AV4A 1OKDA 5DJLA 4AJ7A 2X8HA 2O85A 1GULA 2B1KA 4KX4A 5HFGA 1FO5A 3LG6A 1G7OA 2CT6A 1O8WA 2HI7A 1OVNA 1VGLA 2YV7A 5ECHB 1XBSA 3FZAA 2H74A 2LV3A 4I8BA 1ZYQB 3GIXA 3F9UA 2DJKA 4HJMA 1XWBA 1EWXA 2FLSA 1QQ2A 5F07A 1TKDB 1K0DA 1AC1A 2NVLA 1WP0A 1FHEA 3ZLPA 3GKNA 1SK2A 1U3IA 5ID2B 1TK5B 2A2RA 5CP1A 2H6XA 3GUSA 4K7NA 2XC2A 3GA4A 1JHBA 1SL0B 4F0BA 1XWKA 1Y6EA 4QL7A 3ZL5A 4GSSA 4O5RA 1TU8A 1UA5A 1EV9A 1GTBA 2IMDA 4PGTA 4CDOA 3LYPA 2FY6A 5LCZA 2H0GA 1XW5A 3CSIA 4MDCA 6GSSA 1B9XC 2FD3A 2EIQA 1MTCA 2Z9SA 3IAS2 1JFUA 4GRFA 1WRYA 2GZPA 4G19A 4XRDA 5IPHA 3E9JB 2GSQA 5ECOB 2OE3A 1S3CA 2PVOC 4HU7A 4KDYA 3J7Yk 3D22A 3FKFA 1GTIA 4IS0A 1E2YA 1QFNA 1J08A 3HXSA 3UIWA 3TKSC 1M2AA 1N2AA 4Q5FA 2V6OA 1VF3A 2ZCTA 1X9MB 2R3XA 3LJRA 2PN8A 1R26A 2JL4A 5IMCA 5ECMB 1FB0A 1F3BA 4MF7A 3M3MA 5G1KA 3KTLA 1PN9A 4E8EA 1HYUA 4WF4A 1TRWA 2CX4A 2JZRA 1DSBA 3EMPA 10GSA 4PQIA 3VLNA 2JACA 1ZMAA 2GT5A 1AAZA 1ZOFA 2C4JA 4FYUA 5G5FA 1EV4A 3L9SA 5CO3A 3IE3A 3QFAC 2FWEA 3UL3A 3WYWA 4F2IA 4P3YB 4I5QA 2A4VA 4ZB6A 1ERTA 2FA4A 3HZ4A 2H1GA 5GZZB 2OACA 4ML6A 1CQHA 1A8LA 1J0FA 3H79A 2X64A 1KNGA 3E0UA 2FWFA 1FOVA 1V40A 3HVXA 2L5OA 2GQLA 4IP6A 1DBYA 2ZUPA 4MJCA 4TR4A 1SK1A 3MDKA 3EVIA 3W8JA 2LUSA 3TGZA 2VM1A 5B8BA 3IXRA 1S3DA 2LEGA 1PRXA 1U6TA 3GV1A 4WF5A 1K0BA 1VF2A 4EDYA 1FW1A 3APQA 1GL8A 1MDKA 4LMWA 4OMVA 2AYTA 5JCGA 3IK9A 5IQYA 3BBYA 5CREA 1Z6NA 4V2LA 4X0XA 4MMMA 1PD21 3U5RE 2PU9C 3FW2A 1WOUA 2VL3A 4WETA 4ILFA 4GSTA 4HOJA 4ZILA 1B9YC 3FR9A 2TRCP 4E8HA 3TOUA 4OO4A 5DDLA 4NAXA 4X1UA 1TI3A 3I6AA 3VK9A 3HVSA 1XZOA 3O3TA 2J9HA 3BCKA 3ERFA 4YQVA 5IMDA 3GTUA 5AIVA 3TRPA 1GSEA 3CBUA 3ZZXA 1M2BA 1K0NA 1X9SB 1MEKA 2BMXA 2VD0A 1ERWA 3APSA 2FUG2 3SWLA 2VLUA 1ZZYA 4AJ8A 5INYA 1HNCA 1GSSA 1SL2B 1IYIA 4PQHA 5CRHA 2OADA 1AXDA 2L5LA 1T1VA 2MMNA 1O73A 4GCIA 4EL1A 4GSNA 3UAPA 4CW9A 1UVZA 3QPMA 1SENA 3KMOA 1M2DA 4I6XA 3LXTA 3UJ1A 2X99A 2IFQB 4G10A 5H5SA 2RUFA 2YJHA 2HNLA 1YEXA 4HZ4A 2H1AA 2NDOA 14GSA 2WDUA 4JR4A 1V58A 1X9WB 3GX0A 2DJ0A 2YCDA 1MDIA 2FHEA 2PMTA 2LSTA 3VPTA 4HQSA 1TRVA 2LQQA 1T4YA 2P31A 4IBPA 3DVXA 3G7YA 2CV4A 3KGKA 2C3QA 3LEFA 4HJ2A 4L0UA 1YY7A 5EVOA 5G31A 4DSSB 3GH9A 3P2AA 4HU9A 3FHKA 5GSTA 3TKRA 4BL7A 1TU7A 3VWWA 1EEMA 1VRSD 1U88A 3IR4A 3EINA 3V1WA 2KP1A 3GFKA 3F8UA 2CAIA 3CMIA 5GAPD 3BOAA 4GWRA 1B48A 2FNOA 4FH8A 5DALA 3ED3A 2P0GA 1N8JA 1XPVA 1ABAA 1M9AA 2WZ9A 4KA0A 4F82A 2E0QA 2V6KA 3EYTA 5D9XA 1SYXA 4H86A 5H5RA 2X8CA 1F3AA 2A2SA 3WT2A 4IHUA 1XCCA 3MAKA 3NZNA 3MSZA 5D9WA 3NIVA 1ERVA 4DSRA 4NV5A 4O92A 1KEBA 5A5KA 1NM3A 4BPYA 4OCFA 2RM5A 1SD9A 2XHFA 2GSSA 5ECNB 3IAM2 3VI7A 3ME8A 1FG4A 5HQPA 5B7CA 3A2XA 4HEA2 3HCZA 2GZYA 1XWGA 4F9ZA 1XVWA 2HSYA 1ON4A 3KXOA 5ELGA 1GSYA 4X43A 1XVQA 1OAZA 3MNGA 3GSSA 1R5PA 4FYCA 1AIUA 2DMMA 4IKHA 2H75A 4G2EA 4KH7A 2LRNA 4Q5NA 5KN2A 2WS2A 1F2EA 4HS1A 1OE8A 2O8VB 1J9BA 2H71A 2O89A 2X8GA 3HZ8A 5CRGA 1V57A 2HYXA 2AB6A 3GN3A 5JWOB 4YQMA 1GWCA 4KE3A 6GSYA 2XPEA 5ABRA 1JLVA 1AW9A 1V98A 1XOAA 4KUNA 4TW5A 1IYHA 1G6YA 3EURA 3RBTA 2JZSA 3TKSE 1TRUA 1YJ6A 3TJGA 2VL9A 2MZCA 4K2DA 1GUHA 4F0CA 4PURA 3Q6OA 1TTZA 4K0GA 5HFKA 4ID0A 4YQUA 5F06A 1WMJA 4HZ2A 3F6DA 1O7UA 4OWYA 5IM9A 3HDCA 3HKRA 5D9TA 3C8EA 2MMZA 4ZL9A 3KP9A 4OD7A 5A4WA 2HZEA 5DAKB 2V41A 4IP1A 2PUKC 4IJIA 1O81A 3TJFA 2H66A 5ECKB 1NW2A 4MH3A 2MBTA 6GSWA 2REMA 4TR1B 5ECRB 4PNGA 1A0FA 5AIXA 2FWGA 3KIJA 4XS6A 3F4SA 1ZL9A 4I2TA 5HFIA 1K0OA 6GSXA 2IMIA 2H6YA 3CTGA 2PGTA 1AQWA 2DJ2A 5J3RA 1W89A 2YN1A 3UOMA 3Q74A 3RHCA 5J4UA 4MJAA 5D93A 3IRAA 1XXUA 2IWTA 1SKSB 3CTFA 2H8LA 3GH6A 1UC7A 1VF1A 3HJOA 1PX6A 2VM2A 4TR0A 5FHIA 3C1RA 2P5RA 1X5DA 3FZ4A 4TXOB 2FWHA 1JZOA 1OC9A 2GSTA 3GL5A 4MH2A 3GKMA 5HR2A 4O32A 5JWRB 7GSSA 2DC5A 2EIOA 1BJXA 1B4PA 2B6MA 2KUCA 4MF5A 4WR4A 5ECLB 3GRXA 1FAAA 1GSFA 2VCVA 2GQKA 4ECBA 1T4ZA 1EOHA 1HQOA 2ES7A 2HRFA 4RI6A 2XBQA 13GSA 2QGVA 1WJKA 4ZL7A 2B7KA 3DEXA 1EGOA 4XS1A 4PNFA 1BAYA 3IDVA 1WIKA 1SK0A 3L9UA 2IPAA 4J56E 2N5BA 2VL2A 1ILOA 1YF0A 5J41A 5DQSA 4ISDA 3DXBA 2OE1A 4TVEA 4ECIA 5JWQB 4TXVA 1RW1A 3FK8A 4O7HA 5ECPB 4BVXA 1GH2A 2CX3A 3J7Yb 3KH7A 4V1Ap 2G0FA 3DKSA 1BG5A 5DVBA 3W8SA 5H5QA 4ZL8A 5IMAA 5E4WA 2AJQB 1YKCA 5J9CA 4XS4B 4ZXGA 5HR3A 1XW9A 4MPGA 2PPTA 4ECCA 5EY6A 4WBRD 1M7TA 4V2NA 5IMVA 4EVMA 4MCUA 4WEYA 2ALBA 3TUEA 1THXA 3KM6A 3EMXA 3FR6A 2RM6A 2HRNA 3BCIA 3DYRA 2CAQA 3ZFLA 3HHVA 4K8MA 3ZYWA 2C3NA 1E6BA 3UARA 1TXXA 4N0VA 5CNWA 2OE0A 2C0FA 2R5GA 3MWHA 4N11A 5AN1A 3CYNA 2WULA 1FB6A 1A2LA 3WGXA 1GNWA 3VFIA 2OA7A 3K8NA 3L0HA 2YWMA 5GAND 3ZIJA 3UVHA 2C3TA 1SJ6A 4IQAA 1I5GA 4MJEA 3LWAA 2C80A 2BJXA 2HFDA 3QAVA 6GSUA 3DGQA 2DJJA 3QFBC 3F3RA 1AQVA 3M9KA 2CZ3A 2H70A 2G2QA 2V2GA 5E59A 1ZGNA 5CRWA 4HDEA 5EL8A 12GSA 4ZB8A 3OR5A 4IVFA 2R4VA 4MABA 3F0IA 4FYBA 3DRNA 1GP1A 1Q98A 4EC0A 5F05A 2IJYA 1TK0B 4MF6A 4YAVA 4GTUA 1EOGA 3A2VA 3Q18A 4JZQA 1Z5YE 1K0MA 1PX7A 4TKYA 3HJMA 1OE7A 4EKZA 2F8AA 2WJUA 4GQFA 5GSSA 2H76A 3DIEA 2YANA 5HR0A 3CXGA 4J2FA 1SU9A 5HR1A 1X5CA 5C04A 1QGVA 1EP7A 2JSYA 4YAPA 2C0EA 4L5OA 1PL1A 1ML6A 3FY7A 1K3YA 2AUVA 2XBIA 4TN8A 5L71A 5F8BA 2WB9A 4KB3A 2H1DA 3N9JA 2GZZA 4MZBA 3KMNA 4GXZA 4L5LA 4V2MA 4ECJA 4LLRA 4NMUA 2VCQA 2DSAA 3F3QA 2I4AA 5IOWA 1X0RA 4XHMA 1OYJA 4PQ1A 5D9VA 3TRQA 1T3BA 4MP4A 4K6XA 16GSA 5IPGA 4JU5A 2K18A 3IK7A 3IPZA 3GNJA 2VOCA 5ECSA 3FRCA 2B5EA 2VCTA 4KSOA 4GLTA 3C71A 4EDZA 4TOPA 3GL3A 3IA1A 2VO4A 1HD2A 2B3SA 3DD3A 5CAXA 2L6DA 2R37A 1MD4A 4XIHA 4TRXA 4N30A 2L4QA 1FVKA 3S9FA 2PVQA 3C7MA 3KEBA 1SYRA 2I3YA 2FGXA 2VAFA 2VIMA 5COHA 2B5XA 2GT6A 2DBCA 1WE0A 4LA1A 1NHYA 1A24A 3IHQA 5AGYA 1AUCA 1XOBA 2I1UA 3KCMA 4GQCA 4K7OA 1USBA 2E2MA 3I69A 4IW9A 3ZVJA 2QC7A 1ACVA 3TB2A 4Q5QA 1BQ7A 1TRSA 3DMLA 2B7JA 4RQXA 2LJRA 4BWSA 5G2ZA 2EIRA 3R2QA 1NHOA 4BVYA 2HT9A 4ZBAA 1QUWA 3A3TA 2TRXA 3F6FA 4BWQA 4Q5RA 5JCWA 4ULXA 4EUYA 1KTEA 5ENUA 3TCOA 4IGJA 3ERGA 4ACSA 4MZCA 3IBHA 2K9FA 1M99A 3UMAA 3AY8A 1H75A 3APOA 2LNTA 4KCAA 4D73A 2HZFA 3FZ9A 4KDUA 1F9MA 1YZXA 4JRRA 1X5EA 1T8EB 1LBKA 1O8XA 2CQ9A 3KJYA 2LNSA 2GLRA 3GTUB 1M9BA 11GSA 2YOIA 3LFLA 3ZTLA 1YEPA 2L59A 3ISOA 4K9ZA 3BD2A 2GDRA 2E2GA 1PGTA 3VWVA 2R2JA 2YJ7A 2HXKA 1GTUA 2JSZA 4WXTA 1JZWA 2TIRA 5DCGA 3RHBA 3H1NA 3C1SA 3ZFBA 5J9BA 2C0DA 1GRXA 3EU4A 5KEJA 4KGIA 5ELAA 1Z7PA 4KAEA 1K3OA 3FEUA 4HI7A 4NPBA 1QK8A 2MYGA 4POMA 4DEJA 3H8QA 3RPNA 3H93A 5DQYA 2CVKA 3F63A 4MA9A 1CQGA 2YP6A 4PX1A 1G6WA 2IIYA 4OFMA 3TJJA 2AHEA 2VCXA 5D8IA 1XWCA 4TR3A 3UBKA 2DMLA 2O7KA 2KLXA 4MPFA 2B1LA 2RLIA 1A2MA 1T7PB 4I97A 5CYYA 1DE1A 1G0TA 5D73A 3WT1A 2LJKA 2JZTA 3M8NA 1ZYEA 3EE2A 1O85A 2AAWA 1ERUA 5G5EA 1SKWB 1V2AA 2L57A 4KW6A 3TJBA 3KTBA 1XIYA 1TI1A 3D5JA 3KD0A 2YV9A 4L0WA 2DJ3A 2CVDA 5DALB 2F51A 2LKUA 3M9JA 4ZBDA 2F3MA 1MD3A 1B8XA 1YKAA 1RK4A 2OBKA 4PUFC 1M0UA 2RUEA 2DIZA 6GSVA 1OKTA 1A2JA 2IN3A 3VWXA 3VI5A 4NV2A 2DIYA 1EEJA 5D96A 3IV4A 2LS5A 2NPBA 2QSIA 4OFNA 1PKWA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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