The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
55
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sequence length |
142
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structure length |
142
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Chain Sequence |
SLSSKDKDTVKALWGKIADKAEEIGSDALSRMLAVYPQTKTYFSHWKDLSPGSAPVNKHGKTIMGGIVDAVASIDDLNAGLLALSELHAFTLRVDPANFKILSHCILVLLAVKFPKDFTPEVHISYDKFFSALARALAEKYR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Oxygen storage/transport
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| molecule keywords |
Hemoglobin alpha-1 chain
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| publication title |
Met-Perch Hemoglobin at 1.9A
rcsb |
| total genus |
55
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| structure length |
142
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| sequence length |
142
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| chains with identical sequence |
C
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2004-10-11 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1JDO A; 1MLO A; 1X3K A; 2BKM A; 3O89 A; 2FRK X; 4HRT B; 1RSE A; 2QU0 B; 2AA1 B; 1SWM A; 2GKM A; 2YRS A; 1VXF A; 2HBD A; 4B4Y A; 4G51 B; 1A0Z A; 3UH6 A; 1Y4V A; 2V1E A; 2ZSX A; 1RQ4 B; 2R1H B; 4M4A A; 5ILE A; 3UHT A; 3ZJJ A; 2DN3 B; 2D2M B; 2LH7 A; 3GDJ B; 4MBN A; 1MLL A; 3TM9 A; 1J7Y A; 2GTL B; 3MJP B; 3WI8 A; 3WCW A; 1FN3 B; 2QFK A; 1Y45 A; 1Y4G B; 1NS6 A; 3AQ6 A; 3E5O A; 1NIH B; 2Z6N A; 2CMM A; 1UFP A; 2FAM A; 5ILM A; 3UHZ A; 1MBA A; 2PEG B; 6HBI A; 3OO4 B; 1J3Z A; 1MYJ A; 2QRW A; 1HDA B; 2ZLU B; 3AT6 A; 1OJ6 A; 3UHX A; 4MQH B; 4DC8 A; 3UHK A; 4NZI A; 4L7Y A; 2ZSN A; 2HCO B; 5EE4 D; 2LH3 A; 3WCU B; 3D1K B; 1DLW A; 3WR1 A; 1YEN A; 1HCO A; 1SHR A; 2EKU A; 2HHB B; 2VM0 A; 3UHI A; 1HGB A; 2EF2 A; 1VXD A; 3OK5 A; 4YU3 B; 2ZSZ A; 5E29 B; 5HU6 A; 3BCQ B; 1MGN A; 1HRM A; 1Y09 A; 1HAB A; 1VXE A; 3PI9 A; 1Y8H A; 4O4T A; 1MLH A; 2DXM A; 1I3D A; 1O1K B; 3UHE A; 4U8U D; 2D2N D; 1UT0 A; 1Y83 B; 2ZFB B; 3SZK B; 1LH7 A; 2EB8 A; 3QJE A; 2FAL A; 2ZFO C; 4UZV A; 1OR4 A; 3D1A A; 1LFL A; 1GBV A; 1A00 B; 1JL7 A; 1XXT A; 3PIA A; 1HGC B; 2H35 B; 2OHA A; 1C7D B; 1GDI A; 1C40 A; 5EOH A; 3D17 A; 3ZJQ A; 4F6I A; 1NZ2 A; 1XZU B; 4XS0 B; 1MLU A; 3GKV B; 1BZ6 A; 3RGK A; 3WFT A; 1AJH A; 3G4Q A; 1A01 B; 1Y5K B; 3HHB A; 5ILP A; 4NK2 A; 2MHB A; 3R5I A; 2QLS A; 3KMF C; 4F6J A; 2ZSR A; 3WCP A; 2G3H A; 4KMW A; 1J40 A; 2Z85 A; 1U7R A; 4O2G A; 1KD2 B; 3NMM B; 1YZI A; 1Y4F B; 3DUT B; 5CN4 A; 1Y5J B; 1Y0D A; 1NEJ A; 1YHR A; 1XZV B; 1ECO A; 1O1O A; 2D5Z A; 1CH7 A; 1UIW B; 4U8U A; 1BIJ A; 5EYJ A; 1Y4P B; 3S65 A; 3S66 B; 2XKH A; 3M38 A; 2H8F A; 2SPO A; 3E55 A; 1Y5F B; 2ZSY A; 1J52 A; 3VRE A; 4MQC A; 5EUI B; 3EDB A; 3ARJ A; 1BZZ B; 1Y7G A; 1C7B B; 1IWH A; 2OH9 A; 3SDH A; 2DN2 A; 4F6G A; 1ABW B; 2R80 A; 2W72 B; 1A6G A; 4F4O A; 1YMC A; 1NS9 B; 3ARL A; 3WFX A; 5E83 B; 2VYZ A; 2ZLV A; 3ONZ B; 4UUR A; 2BW9 M; 2BNL A; 3WCT A; 2VEB A; 4MQI A; 3BJ2 B; 1CMY B; 5M3S A; 1HV4 B; 2HHE A; 1ABY B; 2ZS0 C; 1S5X B; 1A6K A; 4ZVA A; 1BVD A; 1XZ5 B; 1LJW A; 1CLS A; 3FH9 A; 3EU1 A; 3ARK A; 1CP5 A; 1HDB A; 1Y7C B; 1EBC A; 1DXV B; 1YEU B; 4PQ6 A; 3OZV A; 1SDK A; 1FDH G; 3HRW A; 2AUP A; 1YE2 B; 4NI0 B; 1HSY A; 3CY5 A; 3K8B A; 4H0B A; 1MBC A; 2HBF B; 3A59 B; 2ZLT B; 2MGC A; 1GCV A; 1JW8 A; 1Y85 B; 1Y46 A; 4M4B B; 1DXD A; 1RQA B; 1YOG A; 1FAW B; 2ZS1 D; 4YU4 B; 3PI3 A; 1CH1 A; 3K3U A; 3W4U A; 2HBG A; 5B84 A; 2MGD A; 5JDO C; 4ODC A; 5CN9 A; 1UVX A; 1YCA A; 3G4U A; 1EW6 A; 5EV5 A; 3PI1 A; 5HAV A; 1ASH A; 1S56 A; 1CQX A; 1A0U A; 2G11 A; 4VHB A; 1Y01 B; 2RI4 B; 2VYW A; 1Y4Q B; 1Y0T A; 3A0G A; 4WCH D; 1QSH B; 1YMA A; 3NG6 B; 3IC0 B; 4F6D A; 1IRC A; 1CG5 B; 4PQC A; 1Y8I B; 3GKT A; 3LQD B; 5E6E B; 3UHD A; 1GZX B; 3DHT B; 2B7H A; 1UC3 A; 2HZ1 A; 2MYD A; 2HBS A; 1MYG A; 2ZLX B; 1B0B A; 1YGF A; 1OBM A; 2W6X A; 4MQG A; 2NX0 A; 1YEO A; 1YDZ B; 3EOK A; 1IT3 A; 1JL6 A; 1HGA A; 1RVW B; 1YGD B; 1YH9 A; 1XZ7 A; 1J7W A; 4MBA A; 1EBT A; 4MAX A; 4DWU A; 5HY8 A; 1X46 A; 1HBB A; 1NQP B; 2QSP B; 3LR7 A; 5MBN A; 1F65 A; 3UI0 A; 1H97 A; 1HDS B; 2ZS1 A; 3UHG A; 1LFQ A; 5CNE A; 1COH A; 1YHE B; 4JAC A; 2HBE A; 1MWC A; 1V4W A; 1V75 A; 2GDM A; 1XZ4 B; 4HRR A; 1K1K B; 2OIF A; 1Y4R B; 3IC2 B; 1FSX A; 1F63 A; 1DUK A; 1NAZ A; 1NPG A; 108M A; 2ZSP A; 1J7S B; 1A9W E; 2ZSS A; 4G1B A; 3PI8 B; 1RPS A; 1Y22 A; 1QPW B; 2H8D B; 1HBH A; 3OJ1 A; 3MJU B; 1BBB B; 2G12 A; 2HZ3 A; 1G09 B; 3ZOL A; 1A3N A; 1NWN A; 2D2M D; 4OOD A; 1THB B; 3MYM A; 3WTG B; 3DR9 A; 1OUU A; 3BJ3 A; 4FWX A; 2G0V A; 3AQ9 A; 1FHJ B; 3OGB A; 3ODQ B; 2GTL D; 1S6A A; 1XZ2 A; 2V1I A; 2MBW A; 1O1P A; 4N7P B; 1DXU A; 1O1N B; 3PT8 A; 3OO5 B; 3PEL A; 5AB8 A; 5SW7 A; 3HEO A; 2AV3 A; 2O5O X; 1NXF A; 1MWB A; 1DWS A; 1V4U B; 1AZI A; 1B86 A; 5C6E B; 5JOM A; 2VLY A; 3UGY A; 1AJ9 B; 1MDN A; 3FS4 A; 2VYY A; 3WCU D; 1CBL A; 3UHS A; 3D4X A; 1CG8 A; 1SDL A; 3KUN A; 1LFT B; 1QI8 A; 2XKG A; 3E5I A; 1O1I B; 2HHD B; 4HRT A; 1NZ3 A; 1CQ2 A; 1R1Y B; 1Y4B B; 1YHU B; 2QU0 A; 3P5Q B; 4ZVB A; 1VXB A; 3VAU A; 4O35 A; 1SI4 B; 1YVQ B; 2O5S X; 1CP0 A; 1YIH A; 1MYZ A; 1RQ4 A; 2R1H A; 1RTX A; 1DXT B; 2LHB A; 1O1M B; 2FRF A; 3M3A A; 1HBA B; 2ZST A; 4OF9 A; 2EKT A; 3ZJP A; 2ZFO B; 2RAO B; 2ZWJ A; 3QM6 A; 1A3O A; 1Y0A A; 5CMV A; 1OUT B; 1BZR A; 3MJP A; 6HBW B; 3RJN B; 1X9F A; 2O5M X; 1MLM A; 4ROM A; 1Y4G A; 3CIU A; 1NIH A; 5B85 A; 2PEG A; 3OO4 A; 3V2V A; 1HDA A; 2QFN A; 2ZLU A; 2HBC B; 4MQH A; 2YRS B; 1YOH A; 1S61 A; 1Y0C A; 2D5X B; 3D7O A; 3KUO A; 3HYU B; 2ZLW B; 5C6Y A; 4M4A B; 1Y2Z A; 3QZZ A; 1TU9 A; 3PT7 B; 1JZM A; 1LFZ B; 101M A; 3UHU A; 3V2Z A; 5MBA A; 4WJG 1; 2HHB A; 2W6V B; 1QXD B; 2HZ2 A; 105M A; 2LH2 A; 3BJ1 B; 7HBI A; 2BLI A; 5AZQ A; 1MOH A; 5CHQ A; 1HBR A; 1BZ0 B; 3LB4 A; 4XDI A; 3BCQ A; 1Y45 B; 3BOM B; 1NS6 B; 1V4X B; 2Z6N B; 3QJD B; 2R4X A; 1Z8U B; 2OLP A; 3VRF B; 1HAC A; 1O1K A; 4F69 A; 1MNK A; 3MN0 A; 1J3Z B; 1YHU C; 2ZFB A; 3SZK A; 1MCY A; 4KMV A; 3AT6 B; 1WVP A; 3WCV C; 1NGK A; 1SPE A; 1JP9 A; 2R4Z A; 2VEE A; 1A00 A; 1ITH A; 4X0L A; 1HGC A; 1J3F A; 3ZJO A; 4L7Y B; 1BAB B; 2H35 A; 5JDO D; 1D8U A; 1C7D A; 3WR1 B; 1YEN B; 1MOD A; 2W6Y A; 1HCO B; 1HHO B; 1Y35 B; 1OFK A; 1XZU A; 1MLJ A; 1A4F A; 1HGB B; 4NK1 A; 106M A; 1BZ1 B; 1YEV B; 3GKV A; 5KDQ B; 1FDH A; 4QAU A; 1Y5K A; 3GQG B; 1Y8H B; 3ZJI A; 1UVY A; 1DLY A; 2O5T X; 2ZS0 B; 1DXC A; 2MGG A; 1MBO A; 1IDR A; 2MGH A; 3SDN A; 4NI1 B; 5JGG B; 3A5G A; 3QJE B; 4TWV A; 1KD2 A; 3HEN A; 3GOU A; 1LFL B; 3NMM A; 1GBV B; 2MYB A; 1Y4F A; 1XXT B; 3PIA B; 3DUT A; 1VXC A; 3B75 B; 1YCB A; 3ZOM A; 3G46 A; 1X9F C; 1MTI A; 3NML A; 3HEP A; 2XYK A; 3QJB B; 2DHB B; 2G0X A; 1UIW A; 1YEQ B; 3MVC A; 110M A; 1DKE A; 1G08 B; 4C0N A; 3WCW C; 2G10 A; 3G4V A; 3R5I B; 1LH6 A; 2D2N A; 4LPI A; 1T1N B; 4H2L B; 1BZZ A; 2FRI X; 5D1V A; 1MOB A; 1MLK A; 3UHB A; 1ABW A; 2MGI A; 2W72 A; 1NS9 A; 4GZG A; 2SPL A; 1MNJ A; 3QQR A; 1J41 B; 3ONZ A; 1O1O B; 2QSS B; 102M A; 3OZW A; 1WMU A; 2D60 A; 4IRO B; 3TM3 A; 1CMY A; 1LFV A; 1HBI A; 2G0S A; 1A9W A; 109M A; 1AJG A; 1IBE B; 4MQC B; 1Y7D A; 2GRF A; 1XQ5 A; 1XYE B; 5CNF A; 2AUO A; 1YFF B; 1Y7G B; 4F6B A; 1M9P B; 2WTG A; 1Y8W B; 1YE2 A; 3M3B A; 1S0H A; 4NI0 A; 1SPG A; 4HSX A; 1O1L B; 4NS2 A; 1GBU A; 2HBF A; 3A59 A; 2W6W A; 2ZLT A; 1LFY A; 2V1H A; 1TES A; 2IG3 A; 1GCW A; 3WCT B; 4M4B A; 4MQI B; 1R1X B; 3ASE A; 1RQA A; 2G0R A; 3MBA A; 2HHE B; 1JZK A; 1V5H A; 4YU4 A; 4H07 A; 4ILZ A; 2MGM A; 4L2M A; 1LJW B; 1MWD A; 3UBV A; 3EU1 B; 1L2K A; 1HDB B; 4N8T A; 4O1T A; 3ZJS A; 1LA6 B; 3GQR B; 2BK9 A; 1GDL A; 2G14 A; 1N9H A; 1S5Y B; 1MLQ A; 1MBI A; 3AT5 B; 5KKK A; 2RI4 A; 1JEB A; 2OH8 A; 3A9M A; 3DHR A; 1Y31 B; 1QSH A; 3NG6 A; 4HHB A; 1YOI A; 3IC0 A; 1RQ3 A; 3WHM B; 1VRE A; 2GRH A; 1Y8I A; 5E6E A; 3LQD A; 2O5B X; 4U8U C; 1MTJ A; 1IRD B; 2DN1 B; 2XKI A; 4DWT A; 2ZLX A; 2MGK A; 2BWH A; 3IA3 B; 5D5R A; 3G52 A; 2V1J A; 3MKB A; 3ECZ A; 1YDZ A; 3ZJH A; 1MBS A; 3HF4 B; 4ODC B; 1MYT A; 1ECD A; 2MYC A; 3LB2 A; 1NPF A; 2QSP A; 5AZR A; 2GNW A; 1A0U B; 3ZJL A; 4N7N B; 1HDS A; 3ORD A; 5CNC A; 3UBC A; 1YIE B; 2VRY A; 4MXK A; 1YHE A; 1LUE A; 1GVH A; 4MQJ B; 1G0B B; 3QM7 A; 3WCT C; 1XCH A; 1PBX B; 1XZ4 A; 4F68 A; 4FC3 B; 1Y4R A; 4JYQ A; 3HXN B; 2LH5 A; 3S48 C; 4MQG B; 3NL7 A; 1W92 A; 1YEO B; 1F5O A; 1J7S A; 1MZ0 A; 1G0A A; 1CO9 A; 4TYX A; 1CO8 A; 1HGA B; 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4SDH A; 1Y8K B; 2Z8A A; 2BMM A; 3GYS B; 1JY7 B; 1CH5 A; 1FN3 A; 1MYF A; 3OVU C; 4ESA B; 1J3Y B; 1O1J B; 2HBC A; 3KMF A; 1DM1 A; 3G4R A; 2D5X A; 3LHB A; 3HYU A; 1YIH B; 2ZLW A; 3WFW A; 3QM5 A; 3PT7 A; 1LFZ A; 2ZSQ A; 2ZS0 D; 1MBN A; 4F6F A; 1MLR A; 2FRJ X; 2W6V A; 2HBD B; 1QXD A; 3AQ7 A; 1A0Z B; 3BJ1 A; 2VLX A; 2O5Q X; 1A3O B; 1Y0A B; 1Y4V B; 1S69 A; 2HCO A; 2V1G A; 3WCU A; 1M6M A; 3D1K A; 2KSC A; 1X9F B; 1BZ0 A; 1DO4 A; 4ROM B; 1HJT A; 3BOM A; 3CIU B; 3QM8 A; 1V4X A; 2R50 A; 2GRZ A; 1OFJ A; 2G0Z A; 1VXG A; 5IKS A; 3QJD A; 1BIN A; 4YU3 A; 1J7Y B; 3VRF A; 5E29 A; 3WCW B; 1MOA A; 3AG0 A; 3UHY A; 4FWZ A; 3A2G A; 2D6C A; 5HBI A; 3HC9 A; 2ZT0 A; 1Y0C B; 2LH6 A; 3D7O B; 3UH3 A; 1BAB A; 1Y2Z B; 1Y83 A; 3IXF A; 1HHO A; 1Y35 A; 3PI4 A; 3UHN A; 1BZ1 A; 3UHW A; 1YEV A; 1HBR B; 5KDQ A; 1SHR B; 2C0K A; 3M39 A; 4XS0 A; 3GQG A; 3ECL A; 1NZ4 A; 1HAC B; 4WJG A; 2ZS0 A; 5HU6 B; 1A01 A; 4PNJ A; 4NI1 A; 5JGG A; 1Y09 B; 1HAB B; 3RJ6 A; 1FSL A; 104M A; 1FCS A; 3PI9 B; 2DXM B; 4X0L B; 3B75 A; 3S1I A; 2E2Y A; 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