1Y0EA

Crystal structure of putative mannac-6-p epimerase from staphylococcus aureus (strain n315)
Total Genus 75
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
75
sequence length
222
structure length
222
Chain Sequence
AMLPHGLIVSCQALPDEPLHSSFIMSKMALAAYEGGAVGIRANTKEDILAIKETVDLPVIGIVKRDYDHSDVFITATSKEVDELIESQCEVIALDATLQQRPKETLDELVSYIRTHAPNVEIMADIATVEEAKNAARLGFDYIGTTLHGYTSYTQGQLLYQNDFQFLKDVLQSVDAKVIAEGNVITPDMYKRVMDLGVHCSVVGGAITRPKEITKRFVQVME
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of putative ManNAc-6-P epimerase from Staphylococcus aureus (strain N315)
rcsb
molecule keywords Putative N-acetylmannosamine-6-phosphate 2-epimerase
molecule tags Isomerase
source organism Staphylococcus aureus subsp. aureus
total genus 75
structure length 222
sequence length 222
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 5.1.3.9: N-acylglucosamine-6-phosphate 2-epimerase.
pdb deposition date 2004-11-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF04131 NanE Putative N-acetylmannosamine-6-phosphate epimerase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1y0eA00
4QNWA 4A2RA 2DZXA 4HIBA 3W2UA 1GVSA 2NWRA 1L6SA 1ICQA 1YTEA 4DO5A 3B03A 3I68A 2C3ZA 1LOSA 2QKFA 2X30A 4FNSA 4AHPA 4RKAA 2OT1A 3NYZA 3Q37A 5BMWA 1VQTA 2Q8LA 3TROA 1KA9F 2W6RA 3GNDA 1DVJA 1SO4A 3ABRA 3NZRA 3PUOA 3NQCA 2QUUA 5HINA 1QWGA 1JCXA 3BO9A 3LCLA 1NAL1 3LCHA 1GEQA 3O07A 3QZEA 3B0UX 4Z1BA 2ZRVA 4FNTA 5KZMA 4BF9A 3FA5A 5F1VA 4M6VA 3IEBA 2NUXA 3PBWA 1QNVA 1UUOA 1QO5A 3W2KA 3TJXA 1XXXA 1VYSX 4PH6A 4DF1A 5G1TA 4MKNA 1LLWA 4JTSA 3DENA 4GUGA 4MYAA 1QPNA 2VFHA 2A7RA 2FQIA 3LTSA 4MLRA 3PULA 5E1QA 4NNCA 1TPB1 2ZZ1A 1LBFA 4JNMA 1W5MA 2ZRYA 3BGJA 3EX4A 5KTLA 3O06A 3NQVA 3P74A 3CM4A 3W2NA 3R8RA 1OFDA 5E93A 3GXPA 2HS8A 1LCOA 4NT0A 4O10A 3BG3A 3UXDA 1UUMA 1ME7A 5CG7A 3WJYA 1KTCA 4OQVA 2Y7EA 1OFPA 5LGZA 2ZA3A 1HFBA 2GUUA 1HG3A 4OV9A 2WJZA 2ZYFA 5HNRA 1SPQA 1WOBA 3D0CA 1G4EA 4TO8A 3NQ8A 4UTWC 4UNLA 3H54A 4Z1CA 4RXGA 1FXPA 6ALDA 3LTPA 2YFOA 1YDVA 4DO6A 1FCQA 4IX2A 2YPIA 3TUUA 4JEQA 1O5XA 3NA8A 4BI6A 3LLFA 4TIMA 3E49A 4ZMGA 1JQXA 2CZEA 2V5LA 1JRCA 1SW0A 3EKZA 2RKXA 5G1YA 1VH7A 1O94A 2WNQA 4HNNA 2DP3A 1DORA 3PVFA 1QMLA 5HWNA 2H8ZA 3L5MA 3GAKA 3NQMA 3G0UA 3MBDA 1YXCA 2O7QA 4UFLA 3ELFA 3N73A 2TRSA 3INPA 4L4MA 5HJLA 5AHIA 1J4EA 3QMRA 4HT3A 4C1LA 3HGRA 4PTNA 2FIQA 3LCGA 4U4MA 4RZ4A 4S2BA 3QEZA 4PCFA 3N2XA 1VZWA 4EOUA 1VLWA 5CZ0A 3M41A 4IWWA 1EP1A 4AXKA 4R7JA 1DQWA 1U83A 1IIHA 2YR1A 1H5YA 4LOCA 1OK6A 2W79A 3MMTA 2NX3A 3UWVA 4N4PA 3W1QA 4TX9A 5I3JA 4LS1A 3S1VA 5HUPA 1H1ZA 1G7UA 4WOQA 2QCCA 1MO0A 4PEKA 1DQXA 4AWSA 3GYEA 1P5BA 4O15A 3TV8A 5K4XA 4LWWA 2I1OA 3W2MA 2QR6A 3NQAA 5BW6A 4IQLA 3MHFA 5EYWA 4AWTA 3AJXA 4GFSA 2PRHA 3W7DA 2NX1A 2B0MA 1JQVA 3PB0A 4UFHA 1BTMA 3FJ6A 1OK4A 4XKYA 5D33A 5U7SA 1KBIA 2TSYA 1H7OA 4FX8A 4QSHA 1LLZA 3JS3A 1KFJA 1QDSA 2YW3A 2CLHA 3SGUA 3NQFA 5U4NA 2KZHA 2V8ZA 1GYLA 3PUEA 2P0OA 1ML1A 3QRHA 3SZ8A 3BG5A 4BWLA 2GQAA 5LSMA 4O1AA 3G8RA 3EX6A 1G67A 2F84A 1EWDA 1TTQA 2YDAA 4O4VA 1F73A 2QUTA 1ONRA 1A5BA 3M5ZA 4XKYB 4AAJA 3LI1A 3W6YA 3GKAA 2Y6ZA 4AWUA 1PCWA 3P67A 3IIOA 1XDLA 1OYCA 3UWYA 4HPXA 5FEWA 4UTLA 3CTLA 1KLYA 1TPVA 4RV8A 1PHQA 2DZWA 3DFTA 1BWLA 3FS2A 1DBTA 1Q45A 1I2PA 3P5ZA 4O1CA 2WPBA 1TPEA 2DZUA 1WQ5A 2OZ0A 3G18A 1PS9A 2F7FA 1ZALA 2TPSA 4I7VA 3DFPA 3N9RA 3LHWA 2EPHA 3M9YA 3HPXA 3G1FA 3W7QA 2OT0A 4QM1A 5DY3A 4O13A 3P5YA 1X8FA 3TFXA 3TFCA 3N9SA 2QCLA 2ZZ7A 1KBJA 1SO3A 2H8XA 1JCMP 2NXIA 4UMAA 4PA8A 5SWUA 3ABQA 3OIXA 1ZAIA 1PL9A 1J5TA 3SGZA 1YPFA 2E5CA 3W88A 5AOUA 3L5AA 3PR2A 2E6DA 1IIGA 4JD4A 1DJNA 3KX6A 2X2GA 3TAOA 1LROA 4NZFA 3QFEA 3W9ZA 2J27A 4JR5A 2CLIA 3GK0A 4RJEA 3GZ3A 4WXZA 1OFRA 5FEZA 3T55A 2OMAA 4FX6M 1WOAA 1YYAA 1MEIA 2PURA 3NGJA 5LNVA 1K7FA 3W23A 2J24A 2PE4A 1C9DA 2VFGA 3PB2A 2RDWA 3OHIA 3LDVA 4GWEA 3TKFA 4YWIA 1B9BA 4UFJA 3NQEA 5AC7A 1KFLA 1JVNA 2FB2A 2TYSA 2Z6IA 3G1SA 5FEPA 3CQ0A 1EUNA 1Z42A 3QMSA 4IXHA 4O18A 1JUBA 4FNQA 4OV4A 5AYZA 5CSSA 4KFOA 2FLIA 2P10A 3P8JA 1RZMA 3C56A 3UXAA 2ATMA 1W1ZA 2BLEA 3EWZA 1OX6A 2C0AA 5TQLA 3QM3A 4N2YA 3H53A 4UC5A 3NPXA 4I9AA 3DU0A 3G3DA 4KFPA 4WY0F 3QYQA 2BSLA 1TPUA 1TRDA 3KOFA 1H7WA 3CEPA 1TMHA 3EB2A 1TREA 4O28A 2A5HA 5FF2A 3A5VA 5FI8A 3LBMA 3M1ZA 4WY0A 1ALDA 1YTKA 2WOQA 2H3DA 3PM6A 3USBA 4JTIA 2C19A 2CLKA 3YPIA 3S8HA 4Z08A 2X1RA 1H51A 4O11A 1TTPA 4ADUA 4UR7A 1Z48A 2J9ZA 3W7MA 1K7EA 1LZOA 2Z6JA 1YDOA 4LS0A 4YCPA 4NUWA 4I7WA 4IMCA 3C8FA 2JBMA 2NXGA 4PL1A 4UTIA 3EKLA 4NXSA 3MO7A 1J2WA 3PBYA 3TR2A 3NZ1A 4GUIA 4WY0B 1LRTA 1TTJA 3VNDA 1XM3A 1W5QA 1MXSA 4ZQRA 2Y7GA 1AMKA 3W2JA 3ZWSA 2CU0A 1ZCOA 4NJIA 3THAA 4JTTA 1W8SA 1XUUA 5F4XA 1PHWA 4ZQOA 3W7NA 4IX0A 3EWXA 3GDMA 3LB0A 5AYXA 1HTIA 3W75A 1UJPA 4WXYA 1ICSA 1XDMA 1Q6RA 4RK8A 3TW7A 3UNDA 3GDTA 2ZFAA 4NNAA 1LBLA 4UTHA 4A22A 2ZTJA 3HPSA 4JICA 3LBCA 5D37A 3TMLA 1SQ7A 2CFFA 3R89A 2AAMA 1QOPA 3N2MA 1VCVA 4JTEA 4LY8A 3ANYA 1JCNA 5HUOA 3BLFA 5AB3A 2PRLA 1TIMA 4MIMA 1YLVA 3OG3A 3BW4A 4JTUA 4WOZA 2HMCA 5HR6A 1HUVA 3HBLA 3TX9A 1S5WA 2C18A 2ZZ2A 4LS2A 1LRNA 4WX2A 5I3IA 2XN2A 3HB9A 3TH6A 5DCDA 2A7PA 4RCXA 2OCZA 2R14A 3LRLA 5CKSA 4ICNA 4WZHA 2ISWA 1FUYA 2JKPA 1TV7A 5HWMA 3BG9A 2G95A 1E51A 3TA6A 5F2MA 3S1WA 1JR1A 2V0TA 4CNNA 4LV9A 3LTYA 5FF4A 3MYOA 4L4LA 4LRTA 4Q4KA 5AHFA 5G4EA 4RR4A 4AHQA 3MI2A 2NZLA 1WYIA 3SSJA 3EXTA 4K39A 3WJXA 3FEMA 3W1AA 1SU5A 4Y96A 4YXGA 1ICPA 3NPUA 4FXSA 1FDYA 2GVGA 5GVJA 2OX1A 3W3OA 2ALDA 3TC6A 3FFSA 2VEPA 1QR7A 3LHUA 1QPOA 3W71A 4O16A 2VELA 1YXDA 3QF0A 4JTJA 3C61A 4N9BA 2BX7A 2WNZA 3HGOA 3NG3A 4O14A 2RFGA 1MEWA 1HO4A 3UWZA 4R34A 3EWYA 3T44A 3EEGA 4MUZA 5C2XA 5AHEA 1T96A 1G4PA 3M5YA 3IRDA 1GG1A 3MI3A 4U28A 4BK9A 1NF0A 2VFDA 5LNUA 1QPQA 3IVSA 4Q33A 1KM4A 1GVFA 1KM3A 5EMUA 3TXVA 4A3UA 4OGZA 4JTHA 1TPFA 3PBUA 1WDWA 1L6YA 3P60A 3W22A 3A22A 3UWQA 4TMBA 1HO1A 3LLDA 1MZHA 4AMAA 3DHFA 1P1XA 4JTFA 5J5DA 2CZDA 4CCEA 4UTJA 4RXFA 1T99A 2WKJA 2C1HA 5K3VA 2B7OA 3QW4B 1ME8A 3EX3A 3S0CA 1OFBA 1KM2A 1OFQA 5AN7A 3IGUA 3DHDA 4Q32A 3RLVA 4MY8A 1SZGA 3MYPA 3W7PA 1TSIA 4D2JA 1LBMA 3UD6A 1TYGA 2ZQ0A 1FWRA 3S42A 3LCWA 3W73A 1DV7A 1DL3A 3R12A 3OVRA 1W5PA 1YDNA 3G1XA 4KKXA 1SZEA 2DORA 1TJRA 4MY9A 2VFEA 1F5ZA 2Z1BA 3WK1A 3W84A 1H61A 4GC4A 1H60A 2YGYA 2JGQA 4GXMA 4N9DA 4QNEA 1ZFJA 5AHMA 3O8AA 2GOUA 2DZVA 2ABBA 5TBOA 1JJKA 4Y9AA 2QCDA 3C52A 3WJZA 3S1XA 1ME9A 4IGHA 1BKSA 2DZTA 5F4SA 4OE7A 3NPVA 4OU1A 1V5XA 4N4QA 3NO5A 4KWWA 1XBZA 3IIPA 4O4WA 4MJMA 2E5BA 4UFIA 5J5RA 1GPWA 4UTTA 4NX5A 3W7OA 3L65A 1GG0A 4LNYA 1TPWA 2AQWA 1KTBA 3E96A 5K2ZA 1DOSA 4MYXA 2OJPA 4N6EA 1XI3A 2QCDB 4S1FA 3GIYA 3G1VA 1N7KA 3KFTA 1F7BA 3JR2A 3FKRA 4Y6GA 1QFEA 3NM3A 2QCMA 1U5JA 2RDTA 4FHAA 2PC4A 4S2CA 3NPWA 3G22A 3G3MA 3K30A 2EHHA 1RQBA 3O05A 4CCDA 1B3OA 2FPYA 2JK2A 3CB8A 1VC4A 3HF3A 5CPLA 5KITA 4ZL1A 3TSBA 3EX1A 1LORA 4NQ1A 2J9XA 1W3NA 1FQ0A 4MZ8A 1I4NA 1OYBA 3B4UA 5D09A 2RDUA 3IVTA 2NUYA 2V2DA 3W1TA 2Y7FA 4TMCA 2A21A 3SECA 4GRSA 3W1MA 3SR7A 2A1YA 4UTKA 3QC3A 3W7HA 5IBXC 2GVLA 1M6JA 3TXZA 3P7YA 4XBKA 1VJIA 3G0XA 2Y85A 1QCWA 2IQTA 3FJLA 4FEZA 5CZTA 2HSAA 1C29A 2QAPA 4DXVA 4YCOA 3DFSA 2ZBTA 2VEMA 3TK7A 2QUVA 3CU2A 4AVFA 1Z41A 1DKWA 1XCFA 3LRKA 3F1QA 3GXTA 3W85A 1FWTA 4J9JA 4Y90A 4R33A 5AYYA 3KXQA 3DBPA 3C2OA 4LV4A 1TO3A 5L9FA 1H63A 4NJGA 1IXQA 3B06A 4P61A 4JIPA 2A0NA 1R47A 4POCA 3GKFA 4JXCA 2C14A 1KFBA 2QJHA 3I7RA 3HG3A 5D04C 4GJ1A 1OYAA 4M5PA 2FJKA 4JS3A 2CLOA 2E09A 1TCDA 1FCUA 2ZRWA 3S5ZA 4CQ8A 2X1UA 4FB7A 3M6YA 2FPVA 4BI5A 4UFMA 1PCKA 3V1PA 3G1DA 4NXKA 4K6AA 3G1YA 1DJQA 5C5YA 1TQXA 5ABTA 1GTEA 4JDBA 3O1NA 2X16A 3L9CA 3N34A 4LTSA 4ORIA 5D03A 4HPJA 4E2DA 3HGJA 4JTGA 5FESA 2C13A 4DELA 1LP6A 4HNVA 4OBTA 4G1KA 1FX6A 3KVLA 2NV1A 2E6YA 3QW3A 3KRZA 5CPNA 4LVAA 1RQEA 5LKYA 2FB3A 2ABAA 1FWSA 4W9TA 1ZAHA 1G6CA 1NF7A 4DF0A 3ZR4A 1NSJA 1Q3NA 7TIMA 4DBEA 3M5XA 4ZQMA 1H7NA 1L9WA 3HJZA 3IIXA 4E0CA 1ADOA 1UCWA 3STGA 1GOXA 1UB3A 1A5AA 5DBUA 1N8FA 3FIGA 1F6KA 2QCEA 3UZJA 2RHGA 3SFKA 3MP4A 3M16A 1FXQA 3IGSA 1JRBA 1GZGA 3DFNA 3VFLA 3NQGA 4YLWA 1XBVA 3BV4A 5G2WA 3TNOA 3PG9A 2VENA 3WK3A 4HSNA 1Y0EA 1IXOA 4P2VA 3S9YA 4XWUA 3CPRA 3I7QA 1AG1O 1O4UA 5EBUA 3EWUA 4MFDA 3F03K 1GVOA 4UR8A 3S5NA 3G1AA 1S5TA 2VFFA 3U2OA 2QAFA 5LNRA 3NOEA 2BWGA 1CI1A 5CZJA 3RF9A 1X6UA 1WAUA 1MEHA 4NX0A 4QAIA 1T8XA 1H7RA 3CIWA 4X3ZA 3OBKA 1EB3A 4B5NA 3CT7A 4NNBA 3T7VA 4TU1A 2V81A 1EIXA 3B04A 1EUAA 2XN1A 1RVGA 4LC6A 4PC8A 1P4CA 5G5IA 5C6MA 4K7VA 5FF7A 3W7GA 2NV2A 4RLIA 4PL2A 1AW5A 2NWSA 4XTIA 3CC1A 3W86A 4TR9A 1AW2A 4KWVA 4ML9A 3U8GA 2A6LA 3ATYA 4H6KA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3R1Z A;  4DWS C;  4A2R A;  1GVS A;  2R1P A;  3WMB A;  1YTE A;  4DO5 A;  3CLW A;  5M03 A;  1HL9 A;  4FNS A;  1KA9 F;  2W6R A;  1VF8 A;  3SM0 A;  2IKH A;  3WLI A;  3LCH A;  1QNQ A;  1GEQ A;  4F79 A;  2XZ7 A;  2ZX9 A;  5KZM A;  4GO8 A;  1J0H A;  1GVI A;  1Q5M A;  5CH9 A;  3OOQ A;  1T6M A;  3NGF A;  3SSZ A;  1QO5 A;  4DF1 A;  4JTS A;  4GUG A;  2A7R A;  3GVV A;  1R3T A;  3OZO A;  5GNZ A;  1C8X A;  1RP9 A;  3VGD A;  1REQ B;  1TPB 1;  2UZ9 A;  5DX7 A;  1LBF A;  3BGJ A;  1M04 A;  3EX4 A;  1V02 A;  2PBO A;  3NQV A;  2DZA A;  1I0D A;  3GSM A;  3R8R A;  1DTN A;  1OFD A;  3CL7 A;  4WR3 A;  3GH5 A;  4KWS A;  5E93 A;  3BG3 A;  3GC2 A;  3UXD A;  4FOK A;  2QPX A;  1LL7 A;  4OQV A;  1W3J A;  3SCT A;  1OFP A;  2OSY A;  5AVN A;  3WQ5 A;  5HNR A;  1E40 A;  2OOD A;  1WOB A;  1UP2 A;  1UZD A;  3EPO A;  3AJ7 A;  4H9X A;  5DQP A;  1ZBW A;  3H54 A;  4Z1C A;  3T8L A;  4HU8 A;  2WMJ A;  4HK5 A;  4W4Q A;  4JHO A;  2XFR A;  5A94 A;  1ZZM A;  1FCQ A;  4RE4 A;  4DO6 A;  4IX2 A;  4JEQ A;  5C9W A;  4B5T A;  4B5V A;  5J8L A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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