The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
22
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sequence length |
57
|
structure length |
57
|
Chain Sequence |
LGLERDVSRAVELLERLQRSGELPPQKLQALQRVLQSRFCSAIREVYEQLYDTLDIT
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
A unified assembly mode revealed by the structures of tetrameric L27 domain complexes formed by mLin-2/mLin-7 and Patj/Pals1 scaffold proteins.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
lin 7 homolog b
|
| source organism |
Mus musculus
|
| molecule tags |
Transport protein
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| total genus |
22
|
| structure length |
57
|
| sequence length |
57
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| chains with identical sequence |
C
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2004-12-08 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Helix Hairpins | L27 domain |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1RSO B; 3B40 A; 1Y76 B; 1ZL8 B; 1Y74 B; 1VF6 A; 1VF6 C; 1Y76 A; 1ZL8 A; 1Y74 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2ZIN A; 5H5N A; 5LGT A; 4X20 A; 5AG2 A; 5LGN A; 1WJZ A; 2CTR A; 2WLM A; 4DUZ B; 1R6T A; 1ORQ C; 5E1A C; 3CRQ A; 2OT5 A; 3CRA A; 3SJA C; 2ZIM A; 2BE3 A; 3ABM C; 2ZT9 B; 1COW G; 4JI0 B; 1R1B A; 5L3F A; 2YXY A; 1H2L A; 4U7N A; 2YEV A; 1GN6 A; 3ZMS A; 1K92 A; 5A9G A; 1FXK A; 4IHJ B; 1FD9 A; 2AHY A; 3T1H B; 3OM3 B; 4LH6 A; 3HKC A; 3UKM A; 3UCS C; 2XAQ A; 2FYU H; 4X1K B; 5FNV A; 1MSD A; 3H1H H; 3CRR A; 1R3K C; 5JVD A; 2P7T C; 2JDI G; 2LGW A; 1VQN V; 1XOU A; 2GBO A; 3WG7 B; 1FAF A; 4CS4 A; 4LF7 O; 4UCU A; 5BR8 B; 1XNR O; 2Z5U A; 1BQZ A; 4I0X B; 3WFV A; 3ETE A; 2UXC O; 3ETQ A; 4LFB O; 3KG2 A; 1MMM A; 1S76 D; 3JAR B; 1ZTE A; 4MW3 A; 5KHG A; 1VQM V; 5KHH A; 1S77 D; 3VBB A; 4K0K B; 2ZM6 B; 1N8R W; 1D5N A; 4LP8 A; 4GKJ B; 4DV0 B; 2C2A A; 3RYH A; 1HNZ O; 1BZK A; 1SET A; 3JCU Z; 3KZI Z; 3RYH B; 4NXN B; 1RSO A; 1Q7Y W; 2EUL A; 2QM4 A; 1PKX A; 2DYR B; 3D36 A; 4DR1 B; 4LF8 O; 4NB5 A; 1NQT A; 4AI8 A; 4DV7 B; 1SZT A; 4X9Q A; 4LR3 A; 3TXQ A; 3K79 A; 2P90 A; 2V4D A; 2ZNJ A; 2CAZ C; 2DQ0 A; 3CE2 A; 3IC7 A; 4WBN A; 3CCS V; 4PA9 A; 3BVO A; 1VQ5 V; 2Q6A A; 4I7Z B; 4RQF A; 1ARO P; 2LFR A; 4PEL A; 3RVY A; 5GTI Z; 1PPJ H; 5LP6 B; 4JI8 O; 1OJH A; 2PGG A; 1NI8 A; 4FVM A; 2JIZ G; 4CS3 A; 1SQF A; 1SA0 A; 1YCI A; 3BCC H; 4WFG A; 3B8N A; 5LMU B; 1QVF U; 2Q68 A; 2ARH A; 4IYI A; 4JI3 O; 1YIT V; 4ZI7 A; 4BIU A; 3ABL B; 2OWO A; 4GUN A; 4GYC B; 4ZI7 B; 1DK1 A; 4O2A A; 4R7C A; 5EK0 A; 4LFA B; 1HNX O; 1VQ4 V; 2YIB A; 2YUA A; 4GX5 A; 4TQD A; 1JOY A; 5LHI A; 2B9Z A; 3U0Z A; 4TOI A; 3AK2 A; 1NU1 H; 4MW8 A; 4J7K A; 4DV6 B; 4U3F H; 2N05 A; 2OTL V; 1PM9 A; 2JRI A; 2LO1 A; 1GN4 A; 3ZRW A; 1HR0 O; 2UUB B; 3ZHQ A; 3ZRW B; 1CXZ B; 2KKW A; 1RM1 B; 5CB4 A; 2RN9 A; 4LF9 B; 1J95 A; 4FM1 A; 1N32 B; 4FFB B; 1K97 A; 2B5U A; 4CH4 A; 2BTQ A; 4TSF G; 3VQW A; 4H44 B; 4DV1 O; 2YIC A; 1KBH A; 2QTO A; 2DQ3 A; 5C8Y B; 2CGN A; 4J9Z B; 3CCQ V; 1R3L C; 2XT9 A; 1TGO A; 1ZUQ A; 4O4I B; 4R8C A; 2PZS A; 1US6 A; 4IL6 Z; 1WN7 A; 2HEP A; 2E3C A; 3FD9 A; 1SES A; 1R6N A; 3QO5 A; 1YEW A; 3CRM A; 4GCZ A; 5JWP A; 2P6J A; 1PP9 H; 5L3B A; 3N2K A; 4QGP A; 4JTD B; 2DMX A; 1PNK A; 3CSX A; 3DGE A; 2ZDI C; 1THZ A; 1GK9 A; 3F7Y C; 4JZ2 A; 4U7O A; 3G67 A; 1NKD A; 2IU0 A; 4YJ3 A; 4Q6G A; 2EIK C; 2VQF B; 2KG7 A; 2UUA B; 3IC9 A; 3K03 A; 3TK1 A; 3GWK C; 1JJ2 U; 5FPO A; 1SQP H; 3C3T A; 1W0J G; 3WB1 A; 3QO8 A; 1Z2G A; 4DR7 O; 2Q8V A; 3T2M A; 3M7M X; 4FFK A; 4FZ0 A; 2QM7 A; 3JAK A; 4ABM A; 4O4H A; 1E1R G; 3T1Y O; 4FJC C; 2UU9 B; 4NTX A; 4O4H B; 1AR1 B; 1L0L H; 2F93 B; 4LBE C; 2Q4P A; 3GB7 C; 3JD0 A; 2DW4 A; 3RN4 A; 1JJO A; 4W4L A; 4LFC O; 4YHH O; 1MSW D; 4LH7 A; 1WP7 A; 3SYA A; 1VF6 C; 1Y76 A; 1XNQ B; 4JI4 B; 4Q20 A; 1KMI Z; 1XI1 A; 5IYC O; 3ABK C; 4DR4 B; 3LSS A; 1Y74 A; 4DR6 O; 2P4V A; 3LNM B; 2OIE A; 2L35 A; 3F5W C; 4JI7 B; 3K3W A; 1MOF A; 3FFQ A; 4C7U A; 1P7B A; 2A9H A; 2H8P C; 4LF5 O; 4DK0 A; 4I9W A; 3ABT A; 1AJN A; 3RVZ A; 4Z2W A; 4YIP A; 4KUM A; 4FLX A; 4I50 B; 3U11 A; 2R9I A; 4PI0 A; 3JCZ A; 5EZY A; 2WLJ A; 3B40 A; 1VQ6 V; 4X65 O; 1XEQ A; 5EZY B; 1Q82 W; 2QE7 G; 3E8B A; 4ZBM A; 3LUT B; 5LHH A; 4MTX A; 2FTK A; 4O4L B; 4WF9 V; 5JH7 A; 3ZHR A; 1IBL O; 5D5Q A; 4RUE A; 1WP8 A; 4TUY A; 1M90 W; 2KQX A; 4DXW A; 4JYC A; 2EJ7 A; 1NT2 B; 4TUY B; 3ICX A; 1VMG A; 1ROP A; 4MSW C; 4PDR A; 1KKD A; 5BMV B; 5H2F Z; 4UCO A; 2A0L A; 1N33 O; 1IXB A; 2ZD9 A; 4TV9 B; 5J2U B; 3B8M A; 2F95 B; 4JYA O; 1I08 A; 3AG7 A; 5H9C A; 1ZL8 A; 4R50 A; 3CMA V; 3B77 A; 1XRE A; 3U10 A; 3ABU A; 1PD3 A; 1YXB A; 1H2S B; 1M5I A; 3C90 A; 1Q3E A; 1SQV H; 1YJN V; 4IGG A; 3CEI A; 3JAS B; 2QR4 A; 2Y48 A; 3JAM N; 4DR5 O; 2ZDI A; 4PHZ A; 1NTM H; 1XL4 A; 3CRC A; 3OUS A; 3Q4H B; 3OAA G; 1GN2 A; 3L72 H; 1AP6 A; 1KC8 W; 4N23 A; 1BSM A; 3HR0 A; 4HNA A; 2EIK B; 3DTU B; 1IZ3 A; 1PNL A; 1S5L Z; 3E89 A; 4HNA B; 2QEX V; 5KA5 A; 4UCR A; 2HVK C; 2F4V O; 1FXV A; 3ZMZ A; 4NXM O; 4D7T A; 4J11 A; 3BPZ A; 5HFM A; 4YY3 B; 2JEX A; 2FKX A; 1U97 A; 1XMO O; 5J2T A; 4E4E A; 1E1Q G; 4MTF A; 3CC2 V; 2N74 A; 5DED A; 5J2T B; 4P2Z A; 3CB2 A; 2BOC C; 2DYS C; 3LDE A; 5B66 Z; 1J5E B; 4KHP B; 4DV2 B; 5JJJ B; 2Q7H A; 2OYQ A; 3CCL V; 1VF6 A; 1OV9 A; 2D2C B; 3SJQ C; 3JD1 A; 4JV5 O; 1BT8 A; 1RPO A; 2EIJ B; 1VF5 B; 1MNG A; 1ENV A; 3QG5 A; 1G1X B; 3ML0 A; 2XHB A; 2JJ2 G; 1AVM A; 1FPO A; 1K8A W; 4ZIB A; 5EYP A; 4EFB A; 3THO A; 4OGQ B; 3SYC A; 4B3M O; 4X66 O; 1EZV H; 4B3T O; 3K9A A; 4ZOL B; 2A7W A; 1IBM O; 2ZE6 A; 2CTP A; 1KEC A; 5LA6 A; 4LWS B; 5B1N A; 3MD0 A; 3WU2 Z; 2OTJ V; 1H2N A; 1KQS U; 5CBH A; 5CA1 A; 5CBG A; 4MVM A; 1VQ8 V; 5H6R A; 4P30 A; 4WFB V; 1N36 B; 4K8Z A; 4CC6 A; 1BHA A; 4UCS A; 3JAL A; 3ZHV A; 5IY5 C; 2ZXW C; 3JAL B; 4MT8 A; 2DJV A; 2WLL B; 1M9N A; 4FLY A; 4DRX A; 4FLV A; 1K4D C; 4G28 B; 1M1K W; 4DRX B; 3IFX A; 4GX0 A; 1GM7 A; 4EEQ A; 4I4T B; 2ZE8 A; 1V54 C; 1M56 C; 1GN3 A; 4FPP A; 1XHZ A; 2JK5 C; 3X2Q C; 1NTZ H; 1R3J C; 2P06 A; 4UCT A; 1S0V A; 3D3I A; 3TGU H; 1GRJ A; 4IHJ A; 2RNB A; 2W6J G; 3HB3 B; 2Q7E A; 4G27 B; 2IJJ A; 4WCE V; 3L75 H; 3ZMV A; 1GH6 A; 1BS3 A; 1K33 A; 4AIL C; 4LF7 B; 2W0X A; 1XNR B; 1QVG U; 3JSL A; 4X1K A; 4LNU B; 2IU3 A; 1NVP D; 2UXC B; 3P30 A; 2WWW A; 4LFB B; 3B09 A; 1Q90 D; 4FLW A; 1P49 A; 3GVM A; 2WAM A; 2PUS A; 3VQX A; 1EN4 A; 3D8C A; 2MW2 B; 2RJZ A; 3IAY A; 2ZKO A; 1D5A A; 1GM8 A; 4XDL A; 3SPI A; 1Z5V A; 5KLV H; 5IJ0 B; 1NTK H; 1P84 F; 2GHY A; 4I0X A; 5JJN B; 2LP7 A; 1L1F A; 1HNZ B; 2O57 A; 3JAR A; 2WLN A; 4BWA A; 2GDS A; 2PI4 A; 1EZJ A; 4RWU A; 4LF8 B; 1NR7 A; 4FZ1 A; 1JMK C; 2R9A A; 3K5O A; 4DW0 A; 3KCY A; 4F4L A; 4X1Y B; 2XTA A; 3DSQ A; 5HFL A; 3KCX A; 4YIO A; 4FK5 C; 5CN0 A; 3OMA B; 1F4N A; 3OW2 U; 3RW0 A; 2ZIO A; 3R65 A; 4CH3 A; 2E76 B; 5FPR A; 3L74 H; 4L8J A; 2KB1 A; 3ZS8 C; 5F2V O; 4JI8 B; 5LXT A; 1Q6U A; 1G8M A; 1AI5 A; 3AG4 B; 3HKE B; 2DYS B; 3L9D A; 4QIW F; 1ZAU A; 4F6E A; 3JAW B; 2BSK B; 2DN9 A; 4J10 A; 5KHI A; 5LXT B; 2VWJ A; 4JI3 B; 5LBQ A; 1IBK O; 3DXR B; 4AQY B; 4BAY A; 1NR1 A; 2OCC C; 5DEC A; 1L8D A; 5IE9 A; 2HHH O; 2E74 B; 5LP6 A; 4QPK A; 1HNX B; 4PDL A; 1GM9 A; 3E2E A; 3JD3 A; 5GON B; 4DW1 A; 1GMG A; 4JI6 O; 2RCV A; 4RAI A; 4UB6 Z; 3H01 A; 4P9O A; 2JJ1 G; 1W0K G; 4FIP C; 2HKO A; 3BY6 A; 2V7Q G; 1JQ0 A; 1YTF D; 1IXM A; 5EC2 C; 1HR0 B; 1I0H A; 3H1I H; 4PI2 A; 2W6I G; 2Q73 A; 3B4S A; 1P7G A; 1L0N H; 5DN6 G; 3QTC A; 4MVO A; 3LSQ A; 2WLI B; 2HVJ C; 3BHP A; 3RBZ A; 1HDJ A; 3G6B A; 1F51 A; 4KL1 A; 2LFS A; 1WPB A; 1OCR C; 1B3Q A; 1Y66 A; 2YI8 A; 3FB7 C; 3SPC A; 4DV1 B; 3D3Q A; 4X89 A; 2RMK B; 2QWR B; 4MVU A; 5IY5 B; 2ZXW B; 4MVZ A; 2FML A; 3T4Z A; 3CPW U; 3ZX6 A; 2K9P A; 5LMN B; 4FFB A; 3CD6 V; 2RQ6 A; 1JFF A; 3AEI A; 2Q69 A; 5LMU O; 1TUE B; 4BIZ A; 5KUM A; 4Z1M G; 5L3E A; 2ITD C; 1JFF B; 1NJI W; 1ZLZ A; 4MS2 A; 2H3O A; 3ASN C; 3CYO A; 4UVA A; 5C8Y A; 1VF7 A; 1QHT A; 3CS5 A; 1RP3 B; 1V54 B; 5H6Q A; 1QR8 A; 1Y6X A; 1ZX3 A; 1M56 B; 2GTA A; 1FFX B; 1FJG O; 1LUW A; 3X2Q B; 1BMF G; 4O4I A; 4GZR B; 1MA1 A; 4BIO A; 4FLZ A; 4X8A A; 1HW7 A; 1AB3 A; 2F1M A; 2LW1 A; 1LR1 A; 4WFH A; 5IYD O; 4DV6 O; 2EZO A; 5IT9 N; 4BW5 A; 1YIJ V; 2Z0A A; 2YS8 A; 3APQ A; 3OMI B; 2WLK A; 4X64 O; 1P4R A; 4X1I B; 3A0R A; 2JGD B; 5J9P C; 2X6A A; 3FAV B; 2VQE O; 1EN6 A; 4DR7 B; 2Q9L A; 3I5D A; 3W7T A; 3ZED A; 1K4C C; 1Y4M A; 3T1Y B; 2GUZ A; 1AJP A; 3R66 A; 5KMG B; 4LCU C; 1EFR G; 4N21 A; 4WFF A; 2GUZ B; 1HWY A; 2PF4 E; 4LFC B; 1PNM A; 4YHH B; 2E75 B; 2UXN A; 2CGO A; 2VS0 A; 2YXL A; 2UUC O; 1DF5 A; 3P3N A; 3BAA A; 1OZ0 A; 1I7F A; 4DV3 O; 4CS2 A; 2WA4 A; 4TT3 G; 1W59 A; 3O9O A; 1Q43 A; 5A2Q N; 1M57 C; 4OX9 O; 2LQT A; 1OCZ C; 2KSD A; 2BCC H; 1SF9 A; 2HG5 C; 1XQ8 A; 3FB8 C; 3QF7 A; 5D5P A; 4DR6 B; 2XAS A; 4O4J B; 5IWA O; 3IJ4 A; 4DO2 A; 1KP3 A; 4IYH A; 2EIJ C; 4R6Z A; 2R9R B; 4IIJ B; 3K5N A; 2CTQ A; 2DE0 X; 4UV8 A; 3AK1 A; 2LJ2 A; 2NR5 A; 3OR7 C; 4LF6 B; 4D6T H; 1XL6 A; 4PDM A; 3K0G A; 2QDO A; 4LF5 B; 2OCC B; 1UFI A; 4QJF B; 3CCU V; 2IJK A; 3MHS C; 4OXS A; 1WA8 B; 4B7E A; 2XUM A; 5LL6 Y; 3H1J H; 4EFE A; 3SPG A; 1URF A; 3J81 N; 2EIL B; 1VEW A; 1QQC A; 2QM8 A; 1WB7 A; 1N34 O; 2WPD G; 2ODM A; 2IM9 A; 1B06 A; 1GKF A; 4X65 B; 2QA4 V; 4JI1 O; 4FM0 A; 2EIN C; 1UJW B; 5LYJ B; 3ZMU A; 1Q86 W; 1VQK V; 3I56 V; 3W7X A; 1AIL A; 3ZHU A; 2B1I A; 4I50 A; 1SQG A; 4JZG A; 4DR3 O; 1UPG A; 2OIG A; 1DTO A; 4EB6 B; 1IBL B; 3ZN0 A; 4LF4 O; 4MVS A; 1NH2 D; 4PA7 A; 1OCR B; 4DK1 A; 3TJT A; 4YXW G; 4I55 B; 3DC6 A; 2ITC C; 2N04 A; 3M99 B; 4JPR A; 1Q8I A; 2RDC A; 2QTS A; 4O4L A; 4TV8 B; 1PL0 A; 2EIM C; 1TA8 A; 1O9H A; 1N33 B; 1KYO F; 4JI7 O; 2HR3 A; 4J80 A; 4FLU A; 3LSU A; 4JYA B; 4X62 O; 1G4Y B; 2XOK G; 1YZB A; 1BQ0 A; 3CJH B; 1AR5 A; 2IJH A; 3ASN B; 5BMV A; 1S3J A; 2QWN B; 1H38 A; 4JAA A; 3FYI B; 4JTA B; 5B3S C; 3CME V; 4TV9 A; 5E79 Z; 5J2U A; 5K1X A; 3LDD A; 4PA4 A; 4PA6 A; 5CBF A; 3BEH A; 3CXC U; 4DR5 B; 1HNW O; 5IDJ A; 1JR9 A; 2XAJ A; 2Y69 C; 4DV5 O; 3RYF B; 5IJ9 A; 4I9Q A; 4UVB A; 4GKK O; 1SQX H; 1TUB B; 4DUY O; 4JF3 A; 5IJ9 B; 1KKC A; 4UUJ C; 2YIB D; 3JAT A; 3JD2 A; 2AZ0 A; 3B2E E; 3JAS A; 1FXK C; 4JYB A; 3JAT B; 4UV9 A; 2MK3 A; 3BRC A; 1SQQ H; 2IW5 A; 4B3R O; 3K08 A; 2F4V B; 4QE7 A; 2W0F C; 4NXM B; 1DLB A; 5GTH Z; 3Q4H A; 3UO2 A; 5JCO C; 5EBM C; 1JX9 A; 1I5Y A; 3CCV V; 1QLE C; 1XMO B; 1XMQ O; 5KHJ A; 1V9P A; 4QNH B; 4O2B B; 2UXD O; 2YDE A; 3RGB A; 4B3S O; 4ICG A; 2UXB O; 2FB5 A; 1ZSP A; 5B5E Z; 4JV5 B; 3UQ8 A; 3CX5 F; 2ZE7 A; 1XUQ A; 4JI2 O; 1H8H G; 4MTO A; 4H13 B; 4ZHQ B; 5KX5 B; 4WFA V; 3BFR A; 1M57 B; 3MDS A; 2WA3 A; 1OCZ B; 3N27 A; 1BL8 A; 1YTF B; 4B3M B; 4X66 B; 4B3T B; 3AG4 C; 3E35 A; 1IBM B; 5IYZ B; 1Q5O A; 3SPH A; 3OEE G; 5C93 A; 5EBW C; 1ZWI C; 4DR2 O; 3TCU A; 1S5J A; 1YSC A; 2VRZ A; 1DGS A; 1FS0 G; 2NNU A; 4ZOL A; 1XHX A; 3D36 C; 4GX1 A; 1QNM A; 3SYQ A; 4LWS A; 3E86 A; 3E22 A; 4U3J A; 1K3E A; 3M8A A; 5L3G A; 2X6B A; 2IH3 C; 2XAH A; 3E22 B; 3G71 V; 4U3J B; 1I94 O; 2ADP A; 4ASU G; 1KP2 A; 4F6R A; 2EIN B; 4CZZ A; 3RYC B; 3T1C A; 1KU9 A; 2ETN A; 4F6R B; 4DV4 O; 4KHP O; 5IYB O; 4HBN A; 5L3C A; 3UT5 A; 2R72 A; 1BGY H; 3UT5 B; 4YJ2 A; 2WLL A; 4FMT A; 4B08 A; 1V55 C; 4L87 A; 2GV9 A; 1YVW A; 2QKC A; 3UO3 A; 4YJ2 B; 3HKD B; 2YC0 A; 3SGI A; 3BAB A; 4Z1V A; 4JI5 O; 2E5L O; 2CH7 A; 3TET A; 3HPL C; 2V1D A; 3GWO A; 3IGA C; 4I4T A; 1G6U A; 1NZ6 A; 2EIM B; 1X4T A; 2CH7 B; 3WB2 A; 1M93 A; 1QCE A; 3N2G A; 4QE9 A; 3AG3 C; 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